Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8475
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8475, 883 aa
1>>>pF1KB8475 883 - 883 aa - 883 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0157+/-0.00104; mu= 17.9120+/- 0.063
mean_var=89.6697+/-17.149, 0's: 0 Z-trim(105.7): 110 B-trim: 20 in 1/49
Lambda= 0.135441
statistics sampled from 8464 (8583) to 8464 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.626), E-opt: 0.2 (0.264), width: 16
Scan time: 4.420
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3220.1 ECT2 gene_id:1894|Hs108|chr3 ( 883) 5798 1143.8 0
CCDS58860.1 ECT2 gene_id:1894|Hs108|chr3 ( 914) 5416 1069.2 0
CCDS46919.1 TOPBP1 gene_id:11073|Hs108|chr3 (1522) 462 101.3 1.4e-20
CCDS78296.1 ARHGEF10 gene_id:9639|Hs108|chr8 (1368) 412 91.5 1.1e-17
CCDS78297.1 ARHGEF10 gene_id:9639|Hs108|chr8 (1306) 406 90.3 2.5e-17
CCDS34794.1 ARHGEF10 gene_id:9639|Hs108|chr8 (1344) 406 90.3 2.5e-17
CCDS43508.1 ECT2L gene_id:345930|Hs108|chr6 ( 904) 387 86.5 2.4e-16
CCDS81679.1 FGD4 gene_id:121512|Hs108|chr12 ( 673) 364 81.9 4.3e-15
CCDS8221.1 ARHGEF17 gene_id:9828|Hs108|chr11 (2063) 370 83.4 4.7e-15
CCDS8727.1 FGD4 gene_id:121512|Hs108|chr12 ( 766) 364 81.9 4.7e-15
CCDS76544.1 FGD4 gene_id:121512|Hs108|chr12 ( 851) 364 82.0 5.2e-15
CCDS76545.1 FGD4 gene_id:121512|Hs108|chr12 ( 878) 364 82.0 5.3e-15
CCDS30617.1 ARHGEF10L gene_id:55160|Hs108|chr1 (1240) 363 81.9 8e-15
CCDS182.1 ARHGEF10L gene_id:55160|Hs108|chr1 (1279) 363 81.9 8.2e-15
CCDS31878.1 FGD6 gene_id:55785|Hs108|chr12 (1430) 356 80.5 2.3e-14
CCDS69619.1 FGD3 gene_id:89846|Hs108|chr9 ( 724) 331 75.5 4e-13
CCDS43849.1 FGD3 gene_id:89846|Hs108|chr9 ( 725) 331 75.5 4e-13
CCDS4829.1 FGD2 gene_id:221472|Hs108|chr6 ( 655) 327 74.7 6.3e-13
CCDS14359.1 FGD1 gene_id:2245|Hs108|chrX ( 961) 327 74.8 8.6e-13
CCDS54060.1 ABR gene_id:29|Hs108|chr17 ( 813) 302 69.8 2.2e-11
CCDS11000.1 ABR gene_id:29|Hs108|chr17 ( 822) 302 69.8 2.2e-11
CCDS10999.1 ABR gene_id:29|Hs108|chr17 ( 859) 302 69.9 2.3e-11
CCDS33022.2 PLEKHG2 gene_id:64857|Hs108|chr19 (1386) 301 69.8 3.9e-11
>>CCDS3220.1 ECT2 gene_id:1894|Hs108|chr3 (883 aa)
initn: 5798 init1: 5798 opt: 5798 Z-score: 6121.3 bits: 1143.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5798; 100.0% identity (100.0% similar) in 883 aa overlap (1-883:1-883)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAENSVLTSTTGRTSLADSSIFDSKVTEISKENLLIGSTSYVEEEMPQIETRVILVQEAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MAENSVLTSTTGRTSLADSSIFDSKVTEISKENLLIGSTSYVEEEMPQIETRVILVQEAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KQEELIKALKDIKVGFVKMESVEEFEGLDSPEFENVFVVTDFQDSVFNDLYKADCRVIGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KQEELIKALKDIKVGFVKMESVEEFEGLDSPEFENVFVVTDFQDSVFNDLYKADCRVIGP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 PVVLNCSQKGEPLPFSCRPLYCTSMMNLVLCFTGFRKKEELVRLVTLVHHMGGVIRKDFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PVVLNCSQKGEPLPFSCRPLYCTSMMNLVLCFTGFRKKEELVRLVTLVHHMGGVIRKDFN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 SKVTHLVANCTQGEKFRVAVSLGTPIMKPEWIYKAWERRNEQDFYAAVDDFRNEFKVPPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SKVTHLVANCTQGEKFRVAVSLGTPIMKPEWIYKAWERRNEQDFYAAVDDFRNEFKVPPF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 QDCILSFLGFSDEEKTNMEEMTEMQGGKYLPLGDERCTHLVVEENIVKDLPFEPSKKLYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QDCILSFLGFSDEEKTNMEEMTEMQGGKYLPLGDERCTHLVVEENIVKDLPFEPSKKLYV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 VKQEWFWGSIQMDARAGETMYLYEKANTPELKKSVSMLSLNTPNSNRKRRRLKETLAQLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VKQEWFWGSIQMDARAGETMYLYEKANTPELKKSVSMLSLNTPNSNRKRRRLKETLAQLS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 RETDVSPFPPRKRPSAEHSLSIGSLLDISNTPESSINYGDTPKSCTKSSKSSTPVPSKQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RETDVSPFPPRKRPSAEHSLSIGSLLDISNTPESSINYGDTPKSCTKSSKSSTPVPSKQS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 ARWQVAKELYQTESNYVNILATIIQLFQVPLEEEGQRGGPILAPEEIKTIFGSIPDIFDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ARWQVAKELYQTESNYVNILATIIQLFQVPLEEEGQRGGPILAPEEIKTIFGSIPDIFDV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 HTKIKDDLEDLIVNWDESKSIGDIFLKYSKDLVKTYPPFVNFFEMSKETIIKCEKQKPRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HTKIKDDLEDLIVNWDESKSIGDIFLKYSKDLVKTYPPFVNFFEMSKETIIKCEKQKPRF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 HAFLKINQAKPECGRQSLVELLIRPVQRLPSVALLLNDLKKHTADENPDKSTLEKAIGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HAFLKINQAKPECGRQSLVELLIRPVQRLPSVALLLNDLKKHTADENPDKSTLEKAIGSL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 KEVMTHINEDKRKTEAQKQIFDVVYEVDGCPANLLSSHRSLVQRVETISLGEHPCDRGEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KEVMTHINEDKRKTEAQKQIFDVVYEVDGCPANLLSSHRSLVQRVETISLGEHPCDRGEQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 VTLFLFNDCLEIARKRHKVIGTFRSPHGQTRPPASLKHIHLMPLSQIKKVLDIRETEDCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VTLFLFNDCLEIARKRHKVIGTFRSPHGQTRPPASLKHIHLMPLSQIKKVLDIRETEDCH
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 NAFALLVRPPTEQANVLLSFQMTSDELPKENWLKMLCRHVANTICKADAENLIYTADPES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NAFALLVRPPTEQANVLLSFQMTSDELPKENWLKMLCRHVANTICKADAENLIYTADPES
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 FEVNTKDMDSTLSRASRAIKKTSKKVTRAFSFSKTPKRALRRALMTSHGSVEGRSPSSND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FEVNTKDMDSTLSRASRAIKKTSKKVTRAFSFSKTPKRALRRALMTSHGSVEGRSPSSND
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880
pF1KB8 KHVMSRLSSTSSLAGIPSPSLVSLPSFFERRSHTLSRSTTHLI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KHVMSRLSSTSSLAGIPSPSLVSLPSFFERRSHTLSRSTTHLI
850 860 870 880
>>CCDS58860.1 ECT2 gene_id:1894|Hs108|chr3 (914 aa)
initn: 5389 init1: 5389 opt: 5416 Z-score: 5717.6 bits: 1069.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5726; 96.6% identity (96.6% similar) in 914 aa overlap (1-883:1-914)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAENSVLTSTTGRTSLADSSIFDSKVTEISKENLLIGSTSYVEEEMPQIETRVILVQEAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MAENSVLTSTTGRTSLADSSIFDSKVTEISKENLLIGSTSYVEEEMPQIETRVILVQEAG
10 20 30 40 50 60
70 80
pF1KB8 KQEELIKALK-------------------------------DIKVGFVKMESVEEFEGLD
:::::::::: :::::::::::::::::::
CCDS58 KQEELIKALKTIKIMEVPVIKIKESCPGKSDEKLIKSVINMDIKVGFVKMESVEEFEGLD
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 SPEFENVFVVTDFQDSVFNDLYKADCRVIGPPVVLNCSQKGEPLPFSCRPLYCTSMMNLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SPEFENVFVVTDFQDSVFNDLYKADCRVIGPPVVLNCSQKGEPLPFSCRPLYCTSMMNLV
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 LCFTGFRKKEELVRLVTLVHHMGGVIRKDFNSKVTHLVANCTQGEKFRVAVSLGTPIMKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LCFTGFRKKEELVRLVTLVHHMGGVIRKDFNSKVTHLVANCTQGEKFRVAVSLGTPIMKP
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 EWIYKAWERRNEQDFYAAVDDFRNEFKVPPFQDCILSFLGFSDEEKTNMEEMTEMQGGKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EWIYKAWERRNEQDFYAAVDDFRNEFKVPPFQDCILSFLGFSDEEKTNMEEMTEMQGGKY
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 LPLGDERCTHLVVEENIVKDLPFEPSKKLYVVKQEWFWGSIQMDARAGETMYLYEKANTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LPLGDERCTHLVVEENIVKDLPFEPSKKLYVVKQEWFWGSIQMDARAGETMYLYEKANTP
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 ELKKSVSMLSLNTPNSNRKRRRLKETLAQLSRETDVSPFPPRKRPSAEHSLSIGSLLDIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ELKKSVSMLSLNTPNSNRKRRRLKETLAQLSRETDVSPFPPRKRPSAEHSLSIGSLLDIS
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 NTPESSINYGDTPKSCTKSSKSSTPVPSKQSARWQVAKELYQTESNYVNILATIIQLFQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NTPESSINYGDTPKSCTKSSKSSTPVPSKQSARWQVAKELYQTESNYVNILATIIQLFQV
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 PLEEEGQRGGPILAPEEIKTIFGSIPDIFDVHTKIKDDLEDLIVNWDESKSIGDIFLKYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PLEEEGQRGGPILAPEEIKTIFGSIPDIFDVHTKIKDDLEDLIVNWDESKSIGDIFLKYS
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KB8 KDLVKTYPPFVNFFEMSKETIIKCEKQKPRFHAFLKINQAKPECGRQSLVELLIRPVQRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KDLVKTYPPFVNFFEMSKETIIKCEKQKPRFHAFLKINQAKPECGRQSLVELLIRPVQRL
550 560 570 580 590 600
570 580 590 600 610 620
pF1KB8 PSVALLLNDLKKHTADENPDKSTLEKAIGSLKEVMTHINEDKRKTEAQKQIFDVVYEVDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PSVALLLNDLKKHTADENPDKSTLEKAIGSLKEVMTHINEDKRKTEAQKQIFDVVYEVDG
610 620 630 640 650 660
630 640 650 660 670 680
pF1KB8 CPANLLSSHRSLVQRVETISLGEHPCDRGEQVTLFLFNDCLEIARKRHKVIGTFRSPHGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 CPANLLSSHRSLVQRVETISLGEHPCDRGEQVTLFLFNDCLEIARKRHKVIGTFRSPHGQ
670 680 690 700 710 720
690 700 710 720 730 740
pF1KB8 TRPPASLKHIHLMPLSQIKKVLDIRETEDCHNAFALLVRPPTEQANVLLSFQMTSDELPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TRPPASLKHIHLMPLSQIKKVLDIRETEDCHNAFALLVRPPTEQANVLLSFQMTSDELPK
730 740 750 760 770 780
750 760 770 780 790 800
pF1KB8 ENWLKMLCRHVANTICKADAENLIYTADPESFEVNTKDMDSTLSRASRAIKKTSKKVTRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ENWLKMLCRHVANTICKADAENLIYTADPESFEVNTKDMDSTLSRASRAIKKTSKKVTRA
790 800 810 820 830 840
810 820 830 840 850 860
pF1KB8 FSFSKTPKRALRRALMTSHGSVEGRSPSSNDKHVMSRLSSTSSLAGIPSPSLVSLPSFFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FSFSKTPKRALRRALMTSHGSVEGRSPSSNDKHVMSRLSSTSSLAGIPSPSLVSLPSFFE
850 860 870 880 890 900
870 880
pF1KB8 RRSHTLSRSTTHLI
::::::::::::::
CCDS58 RRSHTLSRSTTHLI
910
>>CCDS46919.1 TOPBP1 gene_id:11073|Hs108|chr3 (1522 aa)
initn: 393 init1: 249 opt: 462 Z-score: 482.8 bits: 101.3 E(32554): 1.4e-20
Smith-Waterman score: 462; 30.3% identity (60.7% similar) in 300 aa overlap (53-345:11-301)
30 40 50 60 70 80
pF1KB8 DSKVTEISKENLLIGSTSYVEEEMPQIETRVILVQEAGKQEELIKALKDIKV--GFVKME
: ... . ... ..:::..:: . ..
CCDS46 MSRNDKEPFFVKFLKSSDNSKCFFKALESIKEFQSEEYLQ
10 20 30 40
90 100 110 120 130
pF1KB8 SVEEFEGLDSPEFENVFVVTD-FQDSVFNDLYKADCRVIGPPVVLNCSQKGEPLPFSCRP
. : :.: : . . . : :. ::. : : ::..:: ::. : .. . .: . .:
CCDS46 IITEEEALKIKENDRSLYICDPFSGVVFDHLKKLGCRIVGPQVVIFCMHHQRCVPRAEHP
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KB8 LYCTSMMNLVL-CFTGFRKKEELVRLVTLVHHMGGVIRKDFNSKVTHLVANCTQGEKFRV
.: : .... : . ..:.: :. :. ::: . .:.: .::::.:. . ..:. :
CCDS46 VYNMVMSDVTISCTSLEKEKREEVH--KYVQMMGGRVYRDLNVSVTHLIAGEVGSKKYLV
110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB8 AVSLGTPIMKPEWIYKAWERRNEQDFYAAVDDFRNEFKVPPFQDCILSFLGFSDEEKTNM
:..: ::. : :: ::. .:. . .: ..:: : : ::. :. .. ..
CCDS46 AANLKKPILLPSWIKTLWEKSQEKKITRYTDINMEDFKCPIFLGCIICVTGLCGLDRKEV
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 EEMTEMQGGKYL-PLGDERCTHLVVEENIVKDLPFEPSKK--LYVVKQEWFWGSIQMDAR
...: .::.:. : ..::::.:.: : .: .:. .. : .::. ::.
CCDS46 QQLTVKHGGQYMGQLKMNECTHLIVQEP--KGQKYECAKRWNVHCVTTQWFFDSIEKGFC
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KB8 AGETMYLYEKANTPELKKSVSMLSLNTPNSNRKRRRLKETLAQLSRETDVSPFPPRKRPS
:..: : :: : .: . .::.:
CCDS46 QDESIYKTEP--RPEAK---TMPNSSTPTSQINTIDSRTLSDVSNISNINASCVSESICN
280 290 300 310 320 330
>>CCDS78296.1 ARHGEF10 gene_id:9639|Hs108|chr8 (1368 aa)
initn: 160 init1: 160 opt: 412 Z-score: 430.7 bits: 91.5 E(32554): 1.1e-17
Smith-Waterman score: 412; 27.4% identity (56.5% similar) in 347 aa overlap (405-736:401-733)
380 390 400 410 420 430
pF1KB8 SAEHSLSIGSLLDISNTPESSINYGDTPKSCTKSSKSSTPVP----SKQSARWQVAKELY
: . ::.: ..: .: . .
CCDS78 GRSFIRTKSLIAQDHRSSLEEEQNLFIDVDCKHPEAILTPMPEGLSQQQVVRRYILGSVV
380 390 400 410 420 430
440 450 460 470 480 490
pF1KB8 QTESNYVNILATIIQLFQVPLEEEGQRGGPILAPEEIKTIFGSIPDIFDVHTKIKDDLED
..:.:::. : :.. .. :: : . .:. ...::.: . .:.. :. .. : .
CCDS78 DSEKNYVDALKRILEQYEKPLSEMEPK---VLSERKLKTVFYRVKEILQCHSLFQIALAS
440 450 460 470 480
500 510 520 530 540
pF1KB8 LIVNWDESKSIGDIFL-KYSKDLV-KTYPPFVNFFEMSKETIIKCEKQKPRFHAFLKINQ
. .:: . :::.:. ..::..: .: .:: : . .. : :: : ::: ..
CCDS78 RVSEWDSVEMIGDVFVASFSKSMVLDAYSEYVNNFSTAVAVLKKTCATKPAFLEFLKEQE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 AKPECGRQSLVELLIRPVQRLPSVALLLNDLKKHTADENPDKSTLEKAIGSLKEVMTHIN
:.:. : .: :...:.::.:. :::.:. :.:. .::. :. :. :. . ..:
CCDS78 ASPD--RTTLYSLMMKPIQRFPQFILLLQDMLKNTSKGHPDRLPLQMALTELETLAEKLN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 EDKRKTEAQKQIFDVVYEVDGCPAN-LLSS-HRSLVQRVETISLGEHPCDRGEQVT----
: :: .. . .. ... .. : :::: : :.. . : . :::: :
CCDS78 ERKRDADQRCEVKQIAKAINERYLNKLLSSGSRYLIRSDDMIETVYN--DRGEIVKTKER
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KB8 -LFLFNDCLEIARKRHKVIGTFRSPHGQTRPPASLKHIHL--MPLSQIKKVLDIRETEDC
.:..:: : : . : ..: .: ... .::... . .
CCDS78 RVFMLNDVLMCATVSSR-------PSHDSRVMSSQRYLLKWSVPLGHVDAIEYGSSAGTG
670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB8 HNAFALLVRPPTEQANVLLSFQMTSDELPKENWLKMLCRHVANTICKADAENLIYTADPE
... : :.:: : :
CCDS78 EHSRHLAVHPPESLAVVANAKPNKVYMGPGQLYQDLQNLLHDLNVIGQITQLIGNLKGNY
720 730 740 750 760 770
>>CCDS78297.1 ARHGEF10 gene_id:9639|Hs108|chr8 (1306 aa)
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Smith-Waterman score: 406; 27.6% identity (56.3% similar) in 348 aa overlap (405-736:338-671)
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..:.:::. : :.. .. :: : . .:. ...::.: . .:.. :. .. : .
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370 380 390 400 410 420
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:.:. : .: :...:.::.:. :::.:. :.:. .::. :. :. :. . ..
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:: :: .. . .. ... .. : :::: : :.. . : . :::: :
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... : :.:: : :
CCDS78 GEHSRHLAVHPPESLAVVANAKPNKVYMGPGQLYQDLQNLLHDLNVIGQITQLIGNLKGN
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CCDS34 GRSFIRTKSLIAQDHRSSLEEEQNLFIDVDCKHPEAILTPMPEGLSQQQVVRRYILGSVV
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CCDS34 DSEKNYVDALKRILEQYEKPLSEMEPK---VLSERKLKTVFYRVKEILQCHSLFQIALAS
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CCDS34 RVSEWDSVEMIGDVFVASFSKSMVLDAYSEYVNNFSTAVAVLKKTCATKPAFLEFLKQEQ
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:.:. : .: :...:.::.:. :::.:. :.:. .::. :. :. :. . ..
CCDS34 EASPD--RTTLYSLMMKPIQRFPQFILLLQDMLKNTSKGHPDRLPLQMALTELETLAEKL
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pF1KB8 NEDKRKTEAQKQIFDVVYEVDGCPAN-LLSS-HRSLVQRVETISLGEHPCDRGEQVT---
:: :: .. . .. ... .. : :::: : :.. . : . :::: :
CCDS34 NERKRDADQRCEVKQIAKAINERYLNKLLSSGSRYLIRSDDMIETVYN--DRGEIVKTKE
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pF1KB8 --LFLFNDCLEIARKRHKVIGTFRSPHGQTRPPASLKHIHL--MPLSQIKKVLDIRETED
.:..:: : : . : ..: .: ... .::... . .
CCDS34 RRVFMLNDVLMCATVSSR-------PSHDSRVMSSQRYLLKWSVPLGHVDAIEYGSSAGT
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... : :.:: : :
CCDS34 GEHSRHLAVHPPESLAVVANAKPNKVYMGPGQLYQDLQNLLHDLNVIGQITQLIGNLKGN
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CCDS43 VEDNSWDTKSRLSKNDLNFEALINLERILQKDSAEKRARVVRELLQSERKYVQILEIVRD
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CCDS43 VYVAPLKAALSSNRAILSAANIQIIFCDILQILSLNRQFLDNLRDRLQEWGPAHCVGEIV
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CCDS43 TKFGSQL-NTYTNFFNNYPVILKTIEKCREMIPAFRTFLKRHDKTIVTKMLSLPELLLYP
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.:. :: .. :: :. :.. : :: ..:. .:.. :.. . .. :.
CCDS43 SRRFEEYLNLLYAVRLHTPAEHVDRGDLTTAIDQIKKYKGYIDQMKQNITMKDHLSDIQR
710 720 730 740 750 760
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. :::. : .: :. ::. .. : ::. :.. .:::::: : ..
CCDS43 IIWGCPT-LSEVNRYLI-RVQDVAQ-LHCCDEEISFSLRLYEHIHDLSLFLFNDALLVSS
770 780 790 800 810 820
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. :: ..: .: .. . : . : .. . .: ... .::: : . : .
CCDS43 R-----GTSHTPFERTSK-TTYQFIASVALHRLL-IENIPDSKYVKNAFIL--QGP--KY
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. . . .. .: : ::..: . ... :
CCDS43 KWICATEIEDD---KFLWLSVLRNAIKSSMEK
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800 810 820 830 840 850
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:: . .:. . ::::. : . ..: : .:. :. . : . . .. :.:.. ..
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: . :: .: . ...::::.: .::.: .. .. : . .:.. .. . .:
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: :: : :..... ::. : .... :... . ..:. . . :. :::::
CCDS81 NSAIRKMENLKKLLEI-YEMLGEEEDIVNPSNELIKEGQILKLAARNTSAQERY-LFLFN
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. : . ...:.
CCDS81 NMLLYCVPKFSLVGSKFTVRTRVGIDGMKIVETQNEEYPHTFQVSGKERTLELQASSAQD
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pF1KB8 ETDVSPFPPRKRPSAEHSLSIGSLLDISNTPESSINYGDTPKSCTKSSKSSTPVPSKQSA
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CCDS82 LNLHSGEVPAPVPVDMPCLPLAAPPSAEAKPPEAARPADEPTPASKC--CSKP---QVDM
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: .:: : .::..::. : :..: .. ::.. ... . : . :: .::.... :
CCDS82 RKHVAMTLLDTEQSYVESLRTLMQGYMQPLKQ--PENSVLCDPSLVDEIFDQIPELLEHH
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.. .... . .: ....: .... .::: ::. : ... : .:... .. .:
CCDS82 EQFLEQVRHCMQTWHAQQKVGALLVQSFSKDVLVNIYSAYIDNFLNAKDAVRVAKEARPA
1130 1140 1150 1160 1170 1180
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: ::. .. . . .:.: .:.:.::::.: ::..:: ::: ...::. : .: .
CCDS82 FLKFLE-QSMRENKEKQALSDLMIKPVQRIPRYELLVKDLLKHTPEDHPDHPLLLEAQRN
1190 1200 1210 1220 1230 1240
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.:.: .::. :..: .. :. :... .: . : .... .:. ..: .
CCDS82 IKQVAERINKGVRSAEEAERHARVLQEIEAHIEGMEDLQAPLRRFLRQEMVIEVKAIGGK
1250 1260 1270 1280 1290 1300
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:: .::::.: . : :.. :. : . : : .:.
CCDS82 K-DR----SLFLFTDLI--------VCTTLKRKSGSLRRSS-------MSLYTAASVI--
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: . . .: . : :.:... . .:. .:: : . : . .. .:
CCDS82 ----DTASKYKMLWKLPLEDADII---KGASQATNRENIQKAISRLDEDLTTLGQMSKL-
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pF1KB8 YTADPESFEVNTKDMDSTLSRASRAIKKT-SKKVTRAFSFSKTPKRALRRALMTSHGSVE
::. ...:..: : :... :.: . ...: : .
CCDS82 ----SESLGFPHQSLDDALRDLSAAMHRDLSEKQALCYALSFPPTKLELCATRPEGTDSY
1400 1410 1420 1430 1440
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CCDS82 IFEFPHPDARLGFEQAFDEAKRKLASSKSCLDPEFLKAIPIMKTRSGMQFSCAAPTLNSC
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CCDS87 SSYRTPGIGPVLPLEERGAETETKVQERENGESPLELEQLDQHHEMKETNEQKLHKIANE
160 170 180 190 200 210
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CCDS87 LLLTERAYVNRLDLLDQVFYCKLLEEANRGS--FPAEMVNKIFSNISSINAFHSKFLLPE
220 230 240 250 260 270
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CCDS87 LEKRMQEWETTPRIGDILQKLAP-FLKMYGEYVKGFDNAMELVKNMTERIPQFKSVVEEI
280 290 300 310 320 330
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CCDS87 NSAIRKMENLKKLLEI-YEMLGEEEDIVNPSNELIKEGQILKLAARNTSAQERY-LFLFN
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pF1KB8 DCLEIARKRHKVIGTFRSPHGQTRPPASLKHIHLMPLSQIKKVLDIRETEDCHNAFALLV
. : . ...:.
CCDS87 NMLLYCVPKFSLVGSKFTVRTRVGIDGMKIVETQNEEYPHTFQVSGKERTLELQASSAQD
450 460 470 480 490 500
883 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]