Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8476
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8476, 846 aa
1>>>pF1KB8476 846 - 846 aa - 846 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1775+/-0.00132; mu= -2.9905+/- 0.077
mean_var=295.0000+/-66.500, 0's: 0 Z-trim(109.6): 612 B-trim: 293 in 1/49
Lambda= 0.074673
statistics sampled from 10256 (10991) to 10256 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.677), E-opt: 0.2 (0.338), width: 16
Scan time: 3.810
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS58707.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2 ( 873) 1935 223.2 1.5e-57
CCDS1803.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2 ( 894) 1902 219.7 1.8e-56
CCDS42564.1 MAP4K1 gene_id:11184|Hs108|chr19 ( 821) 1689 196.7 1.4e-49
CCDS59385.1 MAP4K1 gene_id:11184|Hs108|chr19 ( 833) 1689 196.7 1.4e-49
CCDS81582.1 MAP4K2 gene_id:5871|Hs108|chr11 ( 812) 1561 182.9 1.9e-45
CCDS8082.1 MAP4K2 gene_id:5871|Hs108|chr11 ( 820) 1561 182.9 1.9e-45
CCDS2549.1 STK25 gene_id:10494|Hs108|chr2 ( 426) 899 111.4 3.4e-24
CCDS32001.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 431) 867 107.9 3.8e-23
CCDS14631.1 STK26 gene_id:51765|Hs108|chrX ( 416) 865 107.7 4.3e-23
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CCDS54674.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1276) 874 109.1 5.1e-23
CCDS54677.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1297) 874 109.1 5.2e-23
CCDS54678.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1305) 874 109.1 5.2e-23
CCDS54675.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1323) 874 109.1 5.3e-23
CCDS54676.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1331) 874 109.1 5.3e-23
CCDS54679.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1352) 874 109.1 5.4e-23
CCDS46956.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1360) 874 109.1 5.4e-23
CCDS47900.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8 ( 491) 863 107.6 5.6e-23
CCDS9488.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 443) 861 107.3 6.1e-23
CCDS82487.1 MAP4K4 gene_id:9448|Hs108|chr2 (1165) 870 108.6 6.5e-23
CCDS56130.1 MAP4K4 gene_id:9448|Hs108|chr2 (1239) 870 108.6 6.8e-23
CCDS59108.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8 ( 519) 861 107.4 6.8e-23
CCDS74546.1 MAP4K4 gene_id:9448|Hs108|chr2 (1273) 870 108.6 6.9e-23
CCDS34290.1 STK10 gene_id:6793|Hs108|chr5 ( 968) 863 107.8 9.5e-23
CCDS13341.1 STK4 gene_id:6789|Hs108|chr20 ( 487) 855 106.7 1e-22
CCDS45589.1 MINK1 gene_id:50488|Hs108|chr17 (1303) 864 108.0 1.1e-22
CCDS45590.1 MINK1 gene_id:50488|Hs108|chr17 (1312) 864 108.0 1.1e-22
CCDS45588.1 MINK1 gene_id:50488|Hs108|chr17 (1332) 864 108.0 1.1e-22
CCDS76334.1 SLK gene_id:9748|Hs108|chr10 (1204) 776 98.5 7.4e-20
CCDS7553.1 SLK gene_id:9748|Hs108|chr10 (1235) 776 98.5 7.5e-20
CCDS8250.1 PAK1 gene_id:5058|Hs108|chr11 ( 545) 708 90.9 6.5e-18
CCDS63200.1 STK25 gene_id:10494|Hs108|chr2 ( 349) 697 89.6 1.1e-17
CCDS10054.1 PAK6 gene_id:56924|Hs108|chr15 ( 681) 700 90.1 1.4e-17
CCDS56024.1 TAOK1 gene_id:57551|Hs108|chr17 ( 853) 698 90.0 1.9e-17
CCDS9188.1 TAOK3 gene_id:51347|Hs108|chr12 ( 898) 698 90.0 2e-17
CCDS48168.1 STK26 gene_id:51765|Hs108|chrX ( 339) 687 88.5 2.2e-17
CCDS32601.1 TAOK1 gene_id:57551|Hs108|chr17 (1001) 698 90.0 2.2e-17
CCDS14554.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX ( 544) 691 89.1 2.3e-17
CCDS48153.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX ( 559) 691 89.1 2.4e-17
CCDS48152.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX ( 565) 691 89.1 2.4e-17
CCDS48151.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX ( 580) 691 89.1 2.4e-17
CCDS44687.1 PAK1 gene_id:5058|Hs108|chr11 ( 553) 681 88.0 4.9e-17
CCDS3321.1 PAK2 gene_id:5062|Hs108|chr3 ( 524) 678 87.7 5.9e-17
CCDS10662.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16 (1049) 685 88.6 6e-17
CCDS58448.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16 (1122) 685 88.7 6.3e-17
CCDS10663.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16 (1235) 685 88.7 6.7e-17
CCDS63199.1 STK25 gene_id:10494|Hs108|chr2 ( 332) 668 86.4 8.8e-17
CCDS13107.1 PAK5 gene_id:57144|Hs108|chr20 ( 719) 655 85.3 4.2e-16
CCDS33019.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19 ( 438) 643 83.8 7.1e-16
CCDS12528.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19 ( 591) 643 83.9 8.9e-16
>>CCDS58707.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2 (873 aa)
initn: 3874 init1: 1620 opt: 1935 Z-score: 1146.7 bits: 223.2 E(32554): 1.5e-57
Smith-Waterman score: 3954; 67.5% identity (83.6% similar) in 879 aa overlap (5-846:1-873)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MEAPLRPAADILRRNPQQDYELVQRVGSGTYGDVYKARNVHTGELAAVKIIKLEPGDDFS
. :. :. :::::.:.::.::.::::::::::::::.::::::.:.::::::.::.
CCDS58 MNPGFDLSRRNPQEDFELIQRIGSGTYGDVYKARNVNTGELAAIKVIKLEPGEDFA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 LIQQEIFMVKECKHCNIVAYFGSYLSREKLWICMEYCGGGSLQDIYHVTGPLSELQIAYV
..::::.:.:.::: :::::::::: :.:::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VVQQEIIMMKDCKHPNIVAYFGSYLRRDKLWICMEFCGGGSLQDIYHVTGPLSELQIAYV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 CRETLQGLAYLHTKGKMHRDIKGANILLTDHGDVKLADFGVAAKITATIAKRKSFIGTPY
::::::: :::.:::::::::::::::::.: ::::::::.:.::::::::::::::::
CCDS58 SRETLQGLYYLHSKGKMHRDIKGANILLTDNGHVKLADFGVSAQITATIAKRKSFIGTPY
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 WMAPEVAAVEKNGGYNQLCDIWAVGITAIELGELQPPMFDLHPMRALFLMSKSNFQPPKL
::::::::::..::::::::.::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS58 WMAPEVAAVERKGGYNQLCDLWAVGITAIELAELQPPMFDLHPMRALFLMTKSNFQPPKL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 KDKTKWSSTFHNFVKIALTKNPKKRPTAERLLTHTFVAQPGLSRALAVELLDKVNNPDNH
::: :::..::.:::.:::::::::::::.:: : ::.: :.:.::.:::::::::: :
CCDS58 KDKMKWSNSFHHFVKMALTKNPKKRPTAEKLLQHPFVTQH-LTRSLAIELLDKVNNPD-H
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 AHYTEADDDDFEPHAIIRHTIRSTNRNARAERTASEINFDKLQFEPPLRKETEARDEMGL
. : . :::: :: . . : :.::.::.: :.: :::.: ...:.:::::::: . :. :
CCDS58 STYHDFDDDDPEPLVAVPHRIHSTSRNVREEKTRSEITFGQVKFDPPLRKETEPHHELDL
300 310 320 330 340 350
370 380 390
pF1KB8 SSDPNFMLQWNPFVDGAN-----------------------------TGKSTSKRAIPPP
. . . : . :. ::: . .:: : ::::
CCDS58 QLEYGQGHQGGYFL-GANKSLLKSVEEELHQRGHVAHLEDDEGDDDESKHSTLKAKIPPP
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440
pF1KB8 LPPKPRISSYPEDNFPDE-EKASTIKHCPDSESRA-PQILRRQSSPSCGPVAETSSIGNG
:::::. :.. : :. .:::.:: : : : :. . . : : . ..:::
CCDS58 LPPKPKSIFIPQEMHSTEDENQGTIKRCPMSGSPAKPSQVPPRPPPPRLPPHKPVALGNG
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 DGISKLMSENTEGSAQAPQLPR-----KKDKRDFPKPAINGLPPTPKVLMGACFSKVFDG
. .: .: . : . : .:.:.: ::: ::::::::: :::::::::.:
CCDS58 MSSFQLNGERDGSLCQQQNEHRGTNLSRKEKKDVPKPISNGLPPTPKVHMGACFSKVFNG
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KB8 CPLKINCATSWIHPDTKDQYIIFGTEDGIYTLNLNELHEATMEQLFPRKCTWLYVINNTL
:::::.::.:::.:::.:::.:::.:.::::::::::::..:::::::.::::::.:: :
CCDS58 CPLKIHCASSWINPDTRDQYLIFGAEEGIYTLNLNELHETSMEQLFPRRCTWLYVMNNCL
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
pF1KB8 MSLSEGKTFQLYSHNLIALFEHAKK-PGLAAHIQTHRFPDRILPRKFALTTKIPDTKGCH
.:.: ::. ::::::: .::..:.. : . : .:..:::::::::....:::.:: :.
CCDS58 LSIS-GKASQLYSHNLPGLFDYARQMQKLPVAIPAHKLPDRILPRKFSVSAKIPETKWCQ
600 610 620 630 640 650
630 640 650 660 670 680
pF1KB8 KCCIVRNPYTGHKYLCGALQSGIVLLQWYEPMQKFMLIKHFDFPLPSPLNVFEMLVIPEQ
:::.::::::::::::::::..::::.: :::::::::::.:::.: :: .:::::.:::
CCDS58 KCCVVRNPYTGHKYLCGALQTSIVLLEWVEPMQKFMLIKHIDFPIPCPLRMFEMLVVPEQ
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690 700 710 720 730 740
pF1KB8 EYPMVCVAISKGTESNQVVQFETINLNSASSWFTEIGAGSQQLDSIHVTQLERDTVLVCL
:::.:::..:.: . ::::.:::.: ::.:::::: . . : . :::::::::.::::
CCDS58 EYPLVCVGVSRGRDFNQVVRFETVNPNSTSSWFTE--SDTPQTNVTHVTQLERDTILVCL
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750 760 770 780 790 800
pF1KB8 DKFVKIVNLQGKLKSSKKLASELSFDFRIESVVCLQDSVLAFWKHGMQGKSFKSDEVTQE
: .:::::::.::::.::.:::.:::.:::.:::::::::::::::::.::.:.:::::
CCDS58 DCCIKIVNLQGRLKSSRKLSSELTFDFQIESIVCLQDSVLAFWKHGMQGRSFRSNEVTQE
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810 820 830 840
pF1KB8 ISDETRVFRLLGSDRVVVLESRPTENPTAHSNLYILAGHENSY
::: ::.:::::::::::::::::.::::.:::::::::::::
CCDS58 ISDSTRIFRLLGSDRVVVLESRPTDNPTANSNLYILAGHENSY
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>>CCDS1803.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2 (894 aa)
initn: 3870 init1: 1620 opt: 1902 Z-score: 1127.3 bits: 219.7 E(32554): 1.8e-56
Smith-Waterman score: 3799; 65.8% identity (81.7% similar) in 879 aa overlap (5-826:1-874)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MEAPLRPAADILRRNPQQDYELVQRVGSGTYGDVYKARNVHTGELAAVKIIKLEPGDDFS
. :. :. :::::.:.::.::.::::::::::::::.::::::.:.::::::.::.
CCDS18 MNPGFDLSRRNPQEDFELIQRIGSGTYGDVYKARNVNTGELAAIKVIKLEPGEDFA
10 20 30 40 50
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pF1KB8 LIQQEIFMVKECKHCNIVAYFGSYLSREKLWICMEYCGGGSLQDIYHVTGPLSELQIAYV
..::::.:.:.::: :::::::::: :.:::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS18 VVQQEIIMMKDCKHPNIVAYFGSYLRRDKLWICMEFCGGGSLQDIYHVTGPLSELQIAYV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 CRETLQGLAYLHTKGKMHRDIKGANILLTDHGDVKLADFGVAAKITATIAKRKSFIGTPY
::::::: :::.:::::::::::::::::.: ::::::::.:.::::::::::::::::
CCDS18 SRETLQGLYYLHSKGKMHRDIKGANILLTDNGHVKLADFGVSAQITATIAKRKSFIGTPY
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 WMAPEVAAVEKNGGYNQLCDIWAVGITAIELGELQPPMFDLHPMRALFLMSKSNFQPPKL
::::::::::..::::::::.::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS18 WMAPEVAAVERKGGYNQLCDLWAVGITAIELAELQPPMFDLHPMRALFLMTKSNFQPPKL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 KDKTKWSSTFHNFVKIALTKNPKKRPTAERLLTHTFVAQPGLSRALAVELLDKVNNPDNH
::: :::..::.:::.:::::::::::::.:: : ::.: :.:.::.:::::::::: :
CCDS18 KDKMKWSNSFHHFVKMALTKNPKKRPTAEKLLQHPFVTQH-LTRSLAIELLDKVNNPD-H
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KB8 AHYTEADDDDFEPHAIIRHTIRSTNRNARAERTASEINFDKLQFEPPLRKETEARDEM--
. : . :::: :: . . : :.::.::.: :.: :::.: ...:.:::::::: . :.
CCDS18 STYHDFDDDDPEPLVAVPHRIHSTSRNVREEKTRSEITFGQVKFDPPLRKETEPHHELPD
300 310 320 330 340 350
360 370
pF1KB8 --GL--SSDP-------NFMLQ-------WNPFVDGAN----------------------
:. ::. :. :: . . :::
CCDS18 SDGFLDSSEEIYYTARSNLDLQLEYGQGHQGGYFLGANKSLLKSVEEELHQRGHVAHLED
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420
pF1KB8 -------TGKSTSKRAIPPPLPPKPRISSYPEDNFPDE-EKASTIKHCPDSESRA-PQIL
. .:: : :::::::::. :.. : :. .:::.:: : : : :. .
CCDS18 DEGDDDESKHSTLKAKIPPPLPPKPKSIFIPQEMHSTEDENQGTIKRCPMSGSPAKPSQV
420 430 440 450 460 470
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 RRQSSPSCGPVAETSSIGNGDGISKLMSENTEGSAQAPQLPR-----KKDKRDFPKPAIN
. : : . ..::: . .: .: . : . : .:.:.: ::: :
CCDS18 PPRPPPPRLPPHKPVALGNGMSSFQLNGERDGSLCQQQNEHRGTNLSRKEKKDVPKPISN
480 490 500 510 520 530
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 GLPPTPKVLMGACFSKVFDGCPLKINCATSWIHPDTKDQYIIFGTEDGIYTLNLNELHEA
:::::::: :::::::::.::::::.::.:::.:::.:::.:::.:.::::::::::::.
CCDS18 GLPPTPKVHMGACFSKVFNGCPLKIHCASSWINPDTRDQYLIFGAEEGIYTLNLNELHET
540 550 560 570 580 590
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 TMEQLFPRKCTWLYVINNTLMSLSEGKTFQLYSHNLIALFEHAKK-PGLAAHIQTHRFPD
.:::::::.::::::.:: :.:.: ::. ::::::: .::..:.. : . : .:..::
CCDS18 SMEQLFPRRCTWLYVMNNCLLSIS-GKASQLYSHNLPGLFDYARQMQKLPVAIPAHKLPD
600 610 620 630 640 650
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 RILPRKFALTTKIPDTKGCHKCCIVRNPYTGHKYLCGALQSGIVLLQWYEPMQKFMLIKH
:::::::....:::.:: :.:::.::::::::::::::::..::::.: :::::::::::
CCDS18 RILPRKFSVSAKIPETKWCQKCCVVRNPYTGHKYLCGALQTSIVLLEWVEPMQKFMLIKH
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670 680 690 700 710 720
pF1KB8 FDFPLPSPLNVFEMLVIPEQEYPMVCVAISKGTESNQVVQFETINLNSASSWFTEIGAGS
.:::.: :: .:::::.::::::.:::..:.: . ::::.:::.: ::.:::::: . .
CCDS18 IDFPIPCPLRMFEMLVVPEQEYPLVCVGVSRGRDFNQVVRFETVNPNSTSSWFTE--SDT
720 730 740 750 760 770
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 QQLDSIHVTQLERDTVLVCLDKFVKIVNLQGKLKSSKKLASELSFDFRIESVVCLQDSVL
: . :::::::::.::::: .:::::::.::::.::.:::.:::.:::.::::::::
CCDS18 PQTNVTHVTQLERDTILVCLDCCIKIVNLQGRLKSSRKLSSELTFDFQIESIVCLQDSVL
780 790 800 810 820 830
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 AFWKHGMQGKSFKSDEVTQEISDETRVFRLLGSDRVVVLESRPTENPTAHSNLYILAGHE
:::::::::.::.:.:::::::: ::.::::::::::::::::
CCDS18 AFWKHGMQGRSFRSNEVTQEISDSTRIFRLLGSDRVVVLESRPTDNPTANSNLYILAGHE
840 850 860 870 880 890
pF1KB8 NSY
CCDS18 NSY
>>CCDS42564.1 MAP4K1 gene_id:11184|Hs108|chr19 (821 aa)
initn: 2421 init1: 1446 opt: 1689 Z-score: 1003.8 bits: 196.7 E(32554): 1.4e-49
Smith-Waterman score: 2551; 47.6% identity (74.6% similar) in 844 aa overlap (10-838:7-819)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MEAPLRPAADILRRNPQQDYELVQRVGSGTYGDVYKARNVHTGELAAVKIIKLEPGDDFS
::. :.:.. :.:.::.:.::::.:.:::. .:.:.:.:..:.:: :: :
CCDS42 MDVVDPDIFNRDPRDHYDLLQRLGGGTYGEVFKARDKVSGDLVALKMVKMEPDDDVS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 LIQQEIFMVKECKHCNIVAYFGSYLSREKLWICMEYCGGGSLQDIYHVTGPLSELQIAYV
.:.::...: :.: ::::: :::: .:::::::.::.:::::::.::: ::::::.::
CCDS42 TLQKEILILKTCRHANIVAYHGSYLWLQKLWICMEFCGAGSLQDIYQVTGSLSELQISYV
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CCDS59 --RKETRAGNPIAHISPHRLLARKNMVSTKIQDTKGCRACCVAEGASSGGPFLCGALETS
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pF1KB8 IVLLQWYEPMQKFMLIKHFDFPLPSPLNVFEMLVIPEQEYPMVCVAISKGTESNQVVQFE
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CCDS81 NLYILTGHQSTY
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CCDS80 SLQQEITILRECRHPNVVAYIGSYLRNDRLWICMEFCGGGSLQEIYHATGPLEERQIAYV
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pF1KB8 WMAPEVAAVEKNGGYNQLCDIWAVGITAIELGELQPPMFDLHPMRALFLMSKSNFQPPKL
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CCDS80 WMAPEVAAVERKGGYNELCDVWALGITAIELGELQPPLFHLHPMRALMLMSKSSFQPPKL
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pF1KB8 KDKTKWSSTFHNFVKIALTKNPKKRPTAERLLTHTFVAQPGLSRALAVELLDKVNNPDNH
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CCDS80 RDKTRWTQNFHHFLKLALTKNPKKRPTAEKLLQHPFTTQQ-LPRALLTQLLDKASDP--H
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CCDS80 YEPLQKFLLLKNFSSPLPSPAGMLEPLVLDGKELPQVCVG-AEGPEGPGCRVLFHVLPLE
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pF1KB8 SASSWFTEIGAGSQQLDSIHVTQLERDTVLVCLDKFVKIVNLQGKLKSSKKLASELSFDF
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CCDS80 AGLTPDILIPPEGIPGSAQQVIQVDRDTILVSFERCVRIVNMQGE--PTATLAPELTFDF
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pF1KB8 RIESVVCLQDSVLAFWKHGMQGKSFKSDEVTQEISDETRVFRLLGSDRVVVLESRPTENP
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CCDS80 PIETVVCLQDSVLAFWSHGMQGRSLDTNEVTQEITDETRIFRVLGAHRDIILESIPTDNP
750 760 770 780 790 800
840
pF1KB8 TAHSNLYILAGHENSY
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CCDS80 EAHSNLYILTGHQSTY
810 820
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10 20 30 40 50
pF1KB8 MEAPLRPAADILRR-NPQQDYELVQRVGSGTYGDVYKARNVHTGELAAVKIIKLEPGDD-
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CCDS25 IEDIQQEITVLSQCDSPYITRYFGSYLKSTKLWIIMEYLGGGSALDLLK-PGPLEETYIA
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pF1KB8 YVCRETLQGLAYLHTKGKMHRDIKGANILLTDHGDVKLADFGVAAKITATIAKRKSFIGT
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CCDS25 TILREILKGLDYLHSERKIHRDIKAANVLLSEQGDVKLADFGVAGQLTDTQIKRNTFVGT
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CCDS25 PFWMAPEVI---KQSAYDFKADIWSLGITAIELAKGEPPNSDLHPMRVLFLIPKNS--PP
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pF1KB8 KLKDKTKWSSTFHNFVKIALTKNPKKRPTAERLLTHTFVAQPGLSRALAVELLDKVN--N
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CCDS25 TLEGQH--SKPFKEFVEACLNKDPRFRPTAKELLKHKFITRYTKKTSFLTELIDRYKRWK
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pF1KB8 PDNHAHYTEADDDDFEPHAIIRHTIRSTNRNARAERTASEINFDKLQFEPPLRKETEARD
..:.. . ..:.:.. .:
CCDS25 SEGHGEESSSEDSDIDGEAEDGEQGPIWTFPPTIRPSPHSKLHKGTALHSSQKPAEPVKR
300 310 320 330 340 350
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10 20 30 40 50
pF1KB8 MEAPLRPAADILRRNPQQDYELVQRVGSGTYGDVYKARNVHTGELAAVKIIKLEPG
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CCDS32 MAHSPVQSGLPGMQNLKADPEELFTKLEKIGKGSFGEVFKGIDNRTQKVVAIKIIDLEEA
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60 70 80 90 100 110
pF1KB8 DD-FSLIQQEIFMVKECKHCNIVAYFGSYLSREKLWICMEYCGGGSLQDIYHVTGPLSEL
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CCDS32 EDEIEDIQQEITVLSQCDSPYVTKYYGSYLKDTKLWIIMEYLGGGSALDLLE-PGPLDET
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pF1KB8 QIAYVCRETLQGLAYLHTKGKMHRDIKGANILLTDHGDVKLADFGVAAKITATIAKRKSF
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CCDS32 QIATILREILKGLDYLHSEKKIHRDIKAANVLLSEHGEVKLADFGVAGQLTDTQIKRNTF
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pF1KB8 IGTPYWMAPEVAAVEKNGGYNQLCDIWAVGITAIELGELQPPMFDLHPMRALFLMSKSNF
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CCDS32 VGTPFWMAPEVI---KQSAYDSKADIWSLGITAIELARGEPPHSELHPMKVLFLIPKNN-
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pF1KB8 QPPKLKDKTKWSSTFHNFVKIALTKNPKKRPTAERLLTHTFVAQPGLSRALAVELLDKVN
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CCDS32 -PPTLEGN--YSKPLKEFVEACLNKEPSFRPTAKELLKHKFILRNAKKTSYLTELIDRYK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 NPDNHAHYTEADDDDFEPHAIIRHTIRSTNRNARAERTASEINFDKLQFEPPLRKETEAR
. . .....:
CCDS32 RWKAEQSHDDSSSEDSDAETDGQASGGSDSGDWIFTIREKDPKNLENGALQPSDLDRNKM
300 310 320 330 340 350
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CCDS14 MAHSPVAVQVPGMQNNIADPEELFTKLERIGKGSFGEVFKGIDNRTQQVVAIKIIDLEEA
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pF1KB8 DD-FSLIQQEIFMVKECKHCNIVAYFGSYLSREKLWICMEYCGGGSLQDIYHVTGPLSEL
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CCDS14 EDEIEDIQQEITVLSQCDSSYVTKYYGSYLKGSKLWIIMEYLGGGSALDLLRA-GPFDEF
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pF1KB8 QIAYVCRETLQGLAYLHTKGKMHRDIKGANILLTDHGDVKLADFGVAAKITATIAKRKSF
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CCDS14 QIATMLKEILKGLDYLHSEKKIHRDIKAANVLLSEQGDVKLADFGVAGQLTDTQIKRNTF
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pF1KB8 IGTPYWMAPEVAAVEKNGGYNQLCDIWAVGITAIELGELQPPMFDLHPMRALFLMSKSNF
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CCDS14 VGTPFWMAPEVI---QQSAYDSKADIWSLGITAIELAKGEPPNSDMHPMRVLFLIPKNN-
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pF1KB8 QPPKL-KDKTKWSSTFHNFVKIALTKNPKKRPTAERLLTHTFVAQPGLSRALAVELLDKV
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CCDS14 -PPTLVGDFTK---SFKEFIDACLNKDPSFRPTAKELLKHKFIVKNSKKTSYLTELIDRF
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pF1KB8 NNPDNHAHYTEADDDDFEPHAIIRHTIRSTNRNARAERTASEINFDKLQFEPPLRKETEA
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CCDS14 KRWKAEGHSDDESDSEGSDSESTSRENNTHPEWSFTTVRKKPDPKKVQNGAEQDLVQTLS
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pF1KB8 MEAPLRPAADILRRNPQQDYELVQRVGSGTYGDVYKARNVHTGELAAVKIIKLEP
:.: .:::. ::.::::.:::.:.:.::.:::.:.. .
CCDS54 MASDSPARSLDEIDLSALRDPAGIFELVELVGNGTYGQVYKGRHVKTGQLAAIKVMDVT-
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pF1KB8 GDDFSLIQQEIFMVKE-CKHCNIVAYFGSYLSR------EKLWICMEYCGGGSLQDIYHV
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CCDS54 GDEEEEIKQEINMLKKYSHHRNIATYYGAFIKKNPPGMDDQLWLVMEFCGAGSVTDLIKN
60 70 80 90 100 110
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pF1KB8 T--GPLSELQIAYVCRETLQGLAYLHTKGKMHRDIKGANILLTDHGDVKLADFGVAAKIT
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CCDS54 TKGNTLKEEWIAYICREILRGLSHLHQHKVIHRDIKGQNVLLTENAEVKLVDFGVSAQLD
120 130 140 150 160 170
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CCDS54 RTVGRRNTFIGTPYWMAPEVIACDENPDATYDFKSDLWSLGITAIEMAEGAPPLCDMHPM
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pF1KB8 RALFLMSKSNFQPPKLKDKTKWSSTFHNFVKIALTKNPKKRPTAERLLTHTFVA-QPGLS
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CCDS54 RALFLIPRN--PAPRLKSK-KWSKKFQSFIESCLVKNHSQRPATEQLMKHPFIRDQPN-E
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CCDS54 RQVRIQLKDHIDRTKKKRGEKDETEYEYSGSEEEEEENDSGEPSSILNLPGESTLRRDFL
300 310 320 330 340 350
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:.. :: . . :.: :.. : . ..
CCDS54 RLQLANKERSEA-LRRQQLEQQQRENEEHKRQLLAERQKRIEEQKEQRRRLEEQQRREKE
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]