Result of FASTA (ccds) for pF1KB8481
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8481, 916 aa
  1>>>pF1KB8481 916 - 916 aa - 916 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.7439+/-0.00151; mu= -25.9268+/- 0.092
 mean_var=653.7012+/-132.614, 0's: 0 Z-trim(111.9): 129  B-trim: 0 in 0/55
 Lambda= 0.050163
 statistics sampled from 12638 (12752) to 12638 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.675), E-opt: 0.2 (0.392), width:  16
 Scan time:  5.570

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS6046.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8            ( 916) 5713 429.4 1.5e-119
CCDS47831.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8           ( 540) 3338 257.4 5.3e-68
CCDS13858.1 NEFH gene_id:4744|Hs108|chr22          (1020) 1709 139.7 2.7e-32
CCDS7545.1 INA gene_id:9118|Hs108|chr10            ( 499) 1365 114.6 4.8e-25
CCDS75712.1 NEFL gene_id:4747|Hs108|chr8           ( 543) 1316 111.0   6e-24
CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10            ( 466) 1142 98.4 3.3e-20
CCDS33383.1 DES gene_id:1674|Hs108|chr2            ( 470) 1074 93.5   1e-18
CCDS8783.1 PRPH gene_id:5630|Hs108|chr12           ( 470) 1060 92.5   2e-18
CCDS11491.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17          ( 432) 1024 89.8 1.2e-17
CCDS45708.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17          ( 431) 1019 89.5 1.5e-17
CCDS59296.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17          ( 438) 1019 89.5 1.5e-17
CCDS58234.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12          ( 511)  760 70.8 7.4e-12
CCDS8841.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12           ( 483)  753 70.3   1e-11


>>CCDS6046.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8                 (916 aa)
 initn: 5713 init1: 5713 opt: 5713  Z-score: 2259.9  bits: 429.4 E(32554): 1.5e-119
Smith-Waterman score: 5713; 99.9% identity (99.9% similar) in 916 aa overlap (1-916:1-916)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MSYTLDSLGNPSAYRRVTETRSSFSRVSGSPSSGFRSQSWSRGSPSTVSSSYKRSMLAPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MSYTLDSLGNPSAYRRVTETRSSFSRVSGSPSSGFRSQSWSRGSPSTVSSSYKRSMLAPR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 LAYSSAMLSSAESSLDFSQSSSLLNGGSGPGGDYKLSRSNEKEQLQGLNDRFAGYIEKVH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LAYSSAMLSSAESSLDFSQSSSLLNGGSGPGGDYKLSRSNEKEQLQGLNDRFAGYIEKVH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 YLEQQNKEIEAEIQALRQKQASHAQLGDAYDQEIRELRATLEMVNHEKAQVQLDSDHLEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 YLEQQNKEIEAEIQALRQKQASHAQLGDAYDQEIRELRATLEMVNHEKAQVQLDSDHLEE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 DIHRLKERFEEEARLRDDTEAAIRALRKDIEEASLVKVELDKKVQSLQDEVAFLRSNHEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 DIHRLKERFEEEARLRDDTEAAIRALRKDIEEASLVKVELDKKVQSLQDEVAFLRSNHEE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 EVADLLAQIQASHITVERKDYLKTDISTALKEIRSQLESHSDQNMHQAEEWFKCRYAKLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 EVADLLAQIQASHITVERKDYLKTDISTALKEIRSQLESHSDQNMHQAEEWFKCRYAKLT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 EAAEQNKEAIRSAKEEIAEYRRQLQSKSIELESVRGTKESLERQLSDIEERHNHDLSSYQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 EAAEQNKEAIRSAKEEIAEYRRQLQSKSIELESVRGTKESLERQLSDIEERHNHDLSSYQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 DTIQQLENELRGTKWEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIAAYRKLLEGEETRFSTFAGSIT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 DTIQQLENELRGTKWEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIAAYRKLLEGEETRFSTFAGSIT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB8 GPLYTHRPPITISSKIQKTKVEAPKLKVQHKFVEEIIEETKVEDEKSEMEEALTAITEEL
       :::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 GPLYTHRPPITISSKIQKPKVEAPKLKVQHKFVEEIIEETKVEDEKSEMEEALTAITEEL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB8 AVSMKEEKKEAAEEKEEEPEAEEEEVAAKKSPVKATAPEVKEEEGEKEEEEGQEEEEEED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 AVSMKEEKKEAAEEKEEEPEAEEEEVAAKKSPVKATAPEVKEEEGEKEEEEGQEEEEEED
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB8 EGAKSDQAEEGGSEKEGSSEKEEGEQEEGETEAEAEGEEAEAKEEKKVEEKSEEVATKEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 EGAKSDQAEEGGSEKEGSSEKEEGEQEEGETEAEAEGEEAEAKEEKKVEEKSEEVATKEE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB8 LVADAKVEKPEKAKSPVPKSPVEEKGKSPVPKSPVEEKGKSPVPKSPVEEKGKSPVPKSP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LVADAKVEKPEKAKSPVPKSPVEEKGKSPVPKSPVEEKGKSPVPKSPVEEKGKSPVPKSP
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB8 VEEKGKSPVSKSPVEEKAKSPVPKSPVEEAKSKAEVGKGEQKEEEEKEVKEAPKEEKVEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 VEEKGKSPVSKSPVEEKAKSPVPKSPVEEAKSKAEVGKGEQKEEEEKEVKEAPKEEKVEK
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB8 KEEKPKDVPEKKKAESPVKEEAVAEVVTITKSVKVHLEKETKEEGKPLQQEKEKEKAGGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 KEEKPKDVPEKKKAESPVKEEAVAEVVTITKSVKVHLEKETKEEGKPLQQEKEKEKAGGE
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB8 GGSEEEGSDKGAKGSRKEDIAVNGEVEGKEEVEQETKEKGSGREEEKGVVTNGLDLSPAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 GGSEEEGSDKGAKGSRKEDIAVNGEVEGKEEVEQETKEKGSGREEEKGVVTNGLDLSPAD
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB8 EKKGGDKSEEKVVVTKTVEKITSEGGDGATKYITKSVTVTQKVEEHEETFEEKLVSTKKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 EKKGGDKSEEKVVVTKTVEKITSEGGDGATKYITKSVTVTQKVEEHEETFEEKLVSTKKV
              850       860       870       880       890       900

              910      
pF1KB8 EKVTSHAIVKEVTQSD
       ::::::::::::::::
CCDS60 EKVTSHAIVKEVTQSD
              910      

>>CCDS47831.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8                (540 aa)
 initn: 3338 init1: 3338 opt: 3338  Z-score: 1334.3  bits: 257.4 E(32554): 5.3e-68
Smith-Waterman score: 3338; 99.8% identity (99.8% similar) in 540 aa overlap (377-916:1-540)

        350       360       370       380       390       400      
pF1KB8 DIEERHNHDLSSYQDTIQQLENELRGTKWEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIAAYRKLLE
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47                               MARHLREYQDLLNVKMALDIEIAAYRKLLE
                                             10        20        30

        410       420       430       440       450       460      
pF1KB8 GEETRFSTFAGSITGPLYTHRPPITISSKIQKTKVEAPKLKVQHKFVEEIIEETKVEDEK
       :::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GEETRFSTFAGSITGPLYTHRPPITISSKIQKPKVEAPKLKVQHKFVEEIIEETKVEDEK
               40        50        60        70        80        90

        470       480       490       500       510       520      
pF1KB8 SEMEEALTAITEELAVSMKEEKKEAAEEKEEEPEAEEEEVAAKKSPVKATAPEVKEEEGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SEMEEALTAITEELAVSMKEEKKEAAEEKEEEPEAEEEEVAAKKSPVKATAPEVKEEEGE
              100       110       120       130       140       150

        530       540       550       560       570       580      
pF1KB8 KEEEEGQEEEEEEDEGAKSDQAEEGGSEKEGSSEKEEGEQEEGETEAEAEGEEAEAKEEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KEEEEGQEEEEEEDEGAKSDQAEEGGSEKEGSSEKEEGEQEEGETEAEAEGEEAEAKEEK
              160       170       180       190       200       210

        590       600       610       620       630       640      
pF1KB8 KVEEKSEEVATKEELVADAKVEKPEKAKSPVPKSPVEEKGKSPVPKSPVEEKGKSPVPKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KVEEKSEEVATKEELVADAKVEKPEKAKSPVPKSPVEEKGKSPVPKSPVEEKGKSPVPKS
              220       230       240       250       260       270

        650       660       670       680       690       700      
pF1KB8 PVEEKGKSPVPKSPVEEKGKSPVSKSPVEEKAKSPVPKSPVEEAKSKAEVGKGEQKEEEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PVEEKGKSPVPKSPVEEKGKSPVSKSPVEEKAKSPVPKSPVEEAKSKAEVGKGEQKEEEE
              280       290       300       310       320       330

        710       720       730       740       750       760      
pF1KB8 KEVKEAPKEEKVEKKEEKPKDVPEKKKAESPVKEEAVAEVVTITKSVKVHLEKETKEEGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KEVKEAPKEEKVEKKEEKPKDVPEKKKAESPVKEEAVAEVVTITKSVKVHLEKETKEEGK
              340       350       360       370       380       390

        770       780       790       800       810       820      
pF1KB8 PLQQEKEKEKAGGEGGSEEEGSDKGAKGSRKEDIAVNGEVEGKEEVEQETKEKGSGREEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PLQQEKEKEKAGGEGGSEEEGSDKGAKGSRKEDIAVNGEVEGKEEVEQETKEKGSGREEE
              400       410       420       430       440       450

        830       840       850       860       870       880      
pF1KB8 KGVVTNGLDLSPADEKKGGDKSEEKVVVTKTVEKITSEGGDGATKYITKSVTVTQKVEEH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KGVVTNGLDLSPADEKKGGDKSEEKVVVTKTVEKITSEGGDGATKYITKSVTVTQKVEEH
              460       470       480       490       500       510

        890       900       910      
pF1KB8 EETFEEKLVSTKKVEKVTSHAIVKEVTQSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EETFEEKLVSTKKVEKVTSHAIVKEVTQSD
              520       530       540

>>CCDS13858.1 NEFH gene_id:4744|Hs108|chr22               (1020 aa)
 initn: 799 init1: 799 opt: 1709  Z-score: 693.2  bits: 139.7 E(32554): 2.7e-32
Smith-Waterman score: 1779; 42.7% identity (66.4% similar) in 920 aa overlap (25-856:37-930)

                     10        20        30        40        50    
pF1KB8       MSYTLDSLGNPSAYRRVTETRSSFSRVSGSPSSGFRSQSWSRGSPSTVSSSYKR
                                     .: ... ::::  .::.: : :.::.: .:
CCDS13 ADALLGAPFAPLHGGGSLHYALARKGGAGGTRSAAGSSSGF--HSWTRTSVSSVSASPSR
         10        20        30        40          50        60    

           60        70        80        90       100       110    
pF1KB8 SMLAPRLAYSSAMLSSAESSLDFSQSSSLLNGGSGPGGDYKLSRSNEKEQLQGLNDRFAG
               . .:  .:. .:::     .: ::  :       ::: ::::::.:::::::
CCDS13 --------FRGAGAASSTDSLD-----TLSNGPEGCMVAVATSRS-EKEQLQALNDRFAG
                   70             80        90        100       110

          120       130       140       150       160       170    
pF1KB8 YIEKVHYLEQQNKEIEAEIQALRQKQASHAQLGDAYDQEIRELRATLEMVNHEKAQVQLD
       ::.::. :: .:. .:.:  ::::.::... .:. :..:.::.:...  ..  ..:..:.
CCDS13 YIDKVRQLEAHNRSLEGEAAALRQQQAGRSAMGELYEREVREMRGAVLRLGAARGQLRLE
              120       130       140       150       160       170

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pF1KB8 SDHLEEDIHRLKERFEEEARLRDDTEAAIRALRKDIEEASLVKVELDKKVQSLQDEVAFL
       ..:: ::: ....:...::: :...::: ::: .  .::  ..:.:.::.:.::.: ..:
CCDS13 QEHLLEDIAHVRQRLDDEARQREEAEAAARALARFAQEAEAARVDLQKKAQALQEECGYL
              180       190       200       210       220       230

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pF1KB8 RSNHEEEVADLLAQIQAS-----HITVERKDYLKTDISTALKEIRSQLESHSDQNMHQAE
       : .:.:::..::.:::.:     .. .: .: :: :...::.:::.:::.:. :.  :.:
CCDS13 RRHHQEEVGELLGQIQGSGAAQAQMQAETRDALKCDVTSALREIRAQLEGHAVQSTLQSE
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pF1KB8 EWFKCRYAKLTEAAEQNKEAIRSAKEEIAEYRRQLQSKSIELESVRGTKESLERQLSDIE
       :::. :  .:.:::. : .:.:::.:::.:::::::... :::....::.::::: :..:
CCDS13 EWFRVRLDRLSEAAKVNTDAMRSAQEEITEYRRQLQARTTELEALKSTKDSLERQRSELE
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pF1KB8 ERHNHDLSSYQDTIQQLENELRGTKWEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIAAYRKLLEGEE
       .::. :..:::..::::. :::.:::::: .:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DRHQADIASYQEAIQQLDAELRNTKWEMAAQLREYQDLLNVKMALDIEIAAYRKLLEGEE
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pF1KB8 TRFSTFAGSITGPLYTHRPPI-TISSKIQKTKVEAPKLKVQHK------FVEEIIEETKV
        :..   : :   :    : : ..:..: :.: :  :.:: .:      .:::  :::.:
CCDS13 CRIGF--GPIPFSLPEGLPKIPSVSTHI-KVKSEE-KIKVVEKSEKETVIVEEQTEETQV
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pF1KB8 EDEKSEMEEALTAITEE--LAVSMKEEKKEAAEEKEEEPEAEEEEVAAK--KSPVKATAP
        .: .: ::   :  ::     . .::. :..::. . : :::     :  :::::  : 
CCDS13 TEEVTEEEEK-EAKEEEGKEEEGGEEEEAEGGEEETKSPPAEEAASPEKEAKSPVKEEAK
        470        480       490       500       510       520     

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pF1KB8 EVKEEEGEKEEEEGQEEEEEEDEGAKSDQAEEGGSEKEGSS-EKEEGE------------
          : .. ..::  .  : .  : :::   ::. :  :..: ::::..            
CCDS13 SPAEAKSPEKEEAKSPAEVKSPEKAKSPAKEEAKSPPEAKSPEKEEAKSPAEVKSPEKAK
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pF1KB8 ---QEEGETEAEAEGEEAEAKEEKKVEEKSEEVA---TKEELVADAKVEKPEKAKSPV--
          .::... :::.. : .::   : : ::   :   .:::  . :.:..:::::::.  
CCDS13 SPAKEEAKSPAEAKSPE-KAKSPVKEEAKSPAEAKSPVKEEAKSPAEVKSPEKAKSPTKE
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pF1KB8 ----P---KSPVEEKGKSPVP-KSPVE------EKGKSPV------P---KSPVEEKGKS
           :   ::: .:..:::   ::::.      ::.::::      :   ::::.:..::
CCDS13 EAKSPEKAKSPEKEEAKSPEKAKSPVKAEAKSPEKAKSPVKAEAKSPEKAKSPVKEEAKS
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pF1KB8 PVP-KSPVEEKGKSPV-SKSPVEEKAKSPVP-KSPVEEAKSKAEVGKGEQKEE----EEK
       :   ::::.:..:::  .::::.:.::.:   ::::.:  .. : .:. .: .    .  
CCDS13 PEKAKSPVKEEAKSPEKAKSPVKEEAKTPEKAKSPVKEEAKSPEKAKSPEKAKTLDVKSP
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pF1KB8 EVKEAPKEE------KVEKKEEKP--KDVPEKKKAESPVKEEAVAEVVTITKSVKVHLEK
       :.:   :::      :  .: ..:  ..:   .::.::.::.: :    : :  : ....
CCDS13 EAKTPAKEEARSPADKFPEKAKSPVKEEVKSPEKAKSPLKEDAKAPEKEIPK--KEEVKS
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pF1KB8 ETKEEGKPLQ-------QEKEKEKAGGEGGSEEEGSDKGAKGSRKEDIAVNGEVEGKEE-
        .::: :: .       .. :.::: .   .::. ..:  .. .::  : . .:: :.: 
CCDS13 PVKEEEKPQEVKVKEPPKKAEEEKAPATPKTEEKKDSKKEEAPKKE--APKPKVEEKKEP
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pF1KB8 -VEQETKEKGSGREEE---KGVVTNGLDLSPAD-EKKGGDKSEEKVVVTKTVEKITSEGG
        ::.  . :  ...::   :  : .    .::  : :   : .::. :.:          
CCDS13 AVEKPKESKVEAKKEEAEDKKKVPTPEKEAPAKVEVKEDAKPKEKTEVAKKEPDDAKAKE
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pF1KB8 DGATKYITKSVTVTQKVEEHEETFEEKLVSTKKVEKVTSHAIVKEVTQSD          
                                                                   
CCDS13 PSKPAEKKEAAPEKKDTKEEKAKKPEEKPKTEAKAKEDDKTLSKEPSKPKAEKAEKSSST
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>>CCDS7545.1 INA gene_id:9118|Hs108|chr10                 (499 aa)
 initn: 1358 init1: 676 opt: 1365  Z-score: 563.1  bits: 114.6 E(32554): 4.8e-25
Smith-Waterman score: 1365; 48.3% identity (75.9% similar) in 497 aa overlap (8-494:9-491)

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pF1KB8  MSYTLDSLGNPSAYRRVTETRSSFS-RVSGSPSSG-FRSQSWSRGSPSTVSSSYKRSML
               : . :.::.:    : .: :.::. ..: ::::: ::.. .. ..  . : :
CCDS75 MSFGSEHYLCSSSSYRKVFGDGSRLSARLSGAGGAGGFRSQSLSRSNVASSAACSSASSL
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB8 APRLAYSSAMLSSAESSLDFSQSSSLLNGGSGPGGDYKLSRSNEKEQLQGLNDRFAGYIE
       .  :::       : ..::.::...  :       .::. :.:::::::::::::: .::
CCDS75 GLGLAYRRP---PASDGLDLSQAAARTN-------EYKIIRTNEKEQLQGLNDRFAVFIE
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pF1KB8 KVHYLEQQNKEIEAEIQALRQKQASHAQLGDAYDQEIRELRATLEMVNHEKAQVQLDSDH
       ::: :: ::. .:::. ::::..:  ...:. ...:.:.::: :: ..  ..:. :. : 
CCDS75 KVHQLETQNRALEAELAALRQRHAEPSRVGELFQRELRDLRAQLEEASSARSQALLERDG
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pF1KB8 LEEDIHRLKERFEEEARLRDDTEAAIRALRKDIEEASLVKVELDKKVQSLQDEVAFLRSN
       : :...::. : :::.: :. .: :..: ..:.. :.:....:.:::.:: ::.::.:. 
CCDS75 LAEEVQRLRARCEEESRGREGAERALKAQQRDVDGATLARLDLEKKVESLLDELAFVRQV
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pF1KB8 HEEEVADLLAQIQASHITVERKDYL--KTDISTALKEIRSQLESHSDQNMHQAEEWFKCR
       :.::::.::: .:::  .. . :    : :...::.:::.: :: . .:...::::.: .
CCDS75 HDEEVAELLATLQASSQAAAEVDVTVAKPDLTSALREIRAQYESLAAKNLQSAEEWYKSK
              240       250       260       270       280       290

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pF1KB8 YAKLTEAAEQNKEAIRSAKEEIAEYRRQLQSKSIELESVRGTKESLERQLSDIEERHNHD
       .:.:.: : .. ::::...::: :::::::...::.:..::..::::::. ..::::. .
CCDS75 FANLNEQAARSTEAIRASREEIHEYRRQLQARTIEIEGLRGANESLERQILELEERHSAE
              300       310       320       330       340       350

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pF1KB8 LSSYQDTIQQLENELRGTKWEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIAAYRKLLEGEETRFSTF
       ...:::.: ::::.::.:: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: 
CCDS75 VAGYQDSIGQLENDLRNTKSEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIAAYRKLLEGEETRFSTS
              360       370       380       390       400       410

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pF1KB8 AGSITG--PLYTHR---PPITISSKIQKTKVEAPKLKVQHKFVEEIIEETKVEDEK-SEM
       . ::.:  :: .     ::  .:.    .:: .  :.....  ::  : .:: ..: :..
CCDS75 GLSISGLNPLPNPSYLLPPRILSATT--SKVSSTGLSLKKEEEEE--EASKVASKKTSQI
              420       430         440       450         460      

     470       480       490       500       510       520         
pF1KB8 EEALTAITEELAVSMKEEKKEAAEEKEEEPEAEEEEVAAKKSPVKATAPEVKEEEGEKEE
        :..  : :: ..: :. .:   ::                                   
CCDS75 GESFEEILEETVISTKKTEKSNIEETTISSQKI                           
        470       480       490                                    

>>CCDS75712.1 NEFL gene_id:4747|Hs108|chr8                (543 aa)
 initn: 1509 init1: 659 opt: 1316  Z-score: 543.4  bits: 111.0 E(32554): 6e-24
Smith-Waterman score: 1341; 44.0% identity (72.3% similar) in 563 aa overlap (2-562:3-543)

                10        20         30        40        50        
pF1KB8  MSYTLDSLGNPSAYRRVTET-RSSFSRVSGSPSSGFRSQSWSRGSPSTVSSSYKRSMLA
         :.. .   . :  :: .:: :  .: : .. :.. ::   : ..: . : : .::. .
CCDS75 MSSFSYEPYYSTSYKRRYVETPRVHISSVRSGYSTA-RSAYSSYSAPVSSSLSVRRSYSS
               10        20        30         40        50         

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pF1KB8 PRLAYSSAMLSSAESSLDFSQSSSLLNGGSGPGGDYKLSRSNEKEQLQGLNDRFAGYIEK
            :.... : :. ::.:: ... :       : :  :..:: ::: ::::::..::.
CCDS75 S----SGSLMPSLEN-LDLSQVAAISN-------DLKSIRTQEKAQLQDLNDRFASFIER
      60            70         80               90       100       

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pF1KB8 VHYLEQQNKEIEAEIQALRQKQASHAQLGDAYDQEIRELRATLEMVNHEKAQVQLDSDHL
       :: :::::: .:::. .::::..  ...   :.::::.:: . : ...::  .: . . :
CCDS75 VHELEQQNKVLEAELLVLRQKHSEPSRFRALYEQEIRDLRLAAEDATNEKQALQGEREGL
       110       120       130       140       150       160       

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pF1KB8 EEDIHRLKERFEEEARLRDDTEAAIRALRKDIEEASLVKVELDKKVQSLQDEVAFLRSNH
       :: .. :. :.:::.  :.:.:. .   ::  .::.:...::.:...::.::..::.. :
CCDS75 EETLRNLQARYEEEVLSREDAEGRLMEARKGADEAALARAELEKRIDSLMDEISFLKKVH
       170       180       190       200       210       220       

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pF1KB8 EEEVADLLAQIQASHITVERKDYLKTDISTALKEIRSQLESHSDQNMHQAEEWFKCRYAK
       :::.:.: :::: ..:.::  :  : :.:.:::.::.: :. . .::..:::::: :.. 
CCDS75 EEEIAELQAQIQYAQISVEM-DVTKPDLSAALKDIRAQYEKLAAKNMQNAEEWFKSRFTV
       230       240        250       260       270       280      

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pF1KB8 LTEAAEQNKEAIRSAKEEIAEYRRQLQSKSIELESVRGTKESLERQLSDIEERHNHDLSS
       :::.: .: .:.:.::.:..: :: :..:..:.:. :: .:.::.::...:...: :.:.
CCDS75 LTESAAKNTDAVRAAKDEVSESRRLLKAKTLEIEACRGMNEALEKQLQELEDKQNADISA
        290       300       310       320       330       340      

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pF1KB8 YQDTIQQLENELRGTKWEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIAAYRKLLEGEETRFS-TFAG
       .::::..:::::: :: ::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::.: : .:
CCDS75 MQDTINKLENELRTTKSEMARYLKEYQDLLNVKMALDIEIAAYRKLLEGEETRLSFTSVG
        350       360       370       380       390       400      

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pF1KB8 SITGPLYTHRPPITISSKIQKTKVEAPKLKVQHKFVEEIIEETKVEDEKSEMEEALTAIT
       :::.  :..   .   :     .. .  :   ..:       ..:..:. :.::.. :  
CCDS75 SITSG-YSQSSQVFGRSAYGGLQT-SSYLMSTRSFPSYY--TSHVQEEQIEVEETIEAAK
        410        420        430       440         450       460  

       480       490       500       510       520       530       
pF1KB8 EELAVSMKEEKKEAAEEKEEEPEAEEEEVAAKKSPVKATAPEVKEEEGEKEEEEGQEEEE
        : : .    . :: ::.... ::::::.: ..  .:  . :.::::   : :::.: .:
CCDS75 AEEAKDEPPSEGEAEEEEKDKEEAEEEEAAEEEEAAKEESEEAKEEEEGGEGEEGEETKE
            470       480       490       500       510       520  

       540       550       560       570       580       590       
pF1KB8 EEDEGAKSDQAEEGGSEKEGSSEKEEGEQEEGETEAEAEGEEAEAKEEKKVEEKSEEVAT
        :.:  :     ::..:......:.                                   
CCDS75 AEEEEKKV----EGAGEEQAAKKKD                                   
            530           540                                      

>>CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10                 (466 aa)
 initn: 1053 init1: 562 opt: 1142  Z-score: 476.3  bits: 98.4 E(32554): 3.3e-20
Smith-Waterman score: 1142; 46.4% identity (78.9% similar) in 407 aa overlap (12-413:9-412)

               10        20        30         40           50      
pF1KB8 MSYTLDSLGNPSAYRRVTETRSSFSRVSGSPSSGFRS-QSWSRGS---PSTVSSSYKRSM
                  :.:::.    .. :: :.: :    : ...: ::   :::  : :  : 
CCDS71    MSTRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSSRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSP
                  10        20        30        40        50       

         60         70        80        90       100       110     
pF1KB8 LAPRLAYSSAM-LSSAESSLDFSQSSSLLNGGSGPGGDYKLSRSNEKEQLQGLNDRFAGY
        .   . :::. : :.  .. . :.:  .. ... . ..: .:.::: .:: ::::::.:
CCDS71 GGVYATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTRTNEKVELQELNDRFANY
        60        70        80        90       100       110       

         120       130       140       150       160       170     
pF1KB8 IEKVHYLEQQNKEIEAEIQALRQKQASHAQLGDAYDQEIRELRATLEMVNHEKAQVQLDS
       :.::..:::::: . ::.. :. .  :  .::: :..:.::::  .......::.:... 
CCDS71 IDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKS--RLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVER
       120       130       140         150       160       170     

         180       190       200       210       220       230     
pF1KB8 DHLEEDIHRLKERFEEEARLRDDTEAAIRALRKDIEEASLVKVELDKKVQSLQDEVAFLR
       :.: ::: ::.:...::   :...: .....:.:...:::....:..::.:::.:.:::.
CCDS71 DNLAEDIMRLREKLQEEMLQREEAENTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLK
         180       190       200       210       220       230     

         240       250       260       270       280       290     
pF1KB8 SNHEEEVADLLAQIQASHITVERKDYLKTDISTALKEIRSQLESHSDQNMHQAEEWFKCR
       . ::::. .: :::: .:. ..  :  : :...::...:.: :: . .:...::::.: .
CCDS71 KLHEEEIQELQAQIQEQHVQIDV-DVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSK
         240       250        260       270       280       290    

         300       310       320       330       340       350     
pF1KB8 YAKLTEAAEQNKEAIRSAKEEIAEYRRQLQSKSIELESVRGTKESLERQLSDIEERHNHD
       .: :.:::..:..:.:.::.: .:::::.:: . :.....::.::::::. ..::    .
CCDS71 FADLSEAANRNNDALRQAKQESTEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVE
          300       310       320       330       340       350    

         360       370       380       390       400       410     
pF1KB8 LSSYQDTIQQLENELRGTKWEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIAAYRKLLEGEETRFSTF
        ..::::: .:..:... : ::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:.:  
CCDS71 AANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISLP
          360       370       380       390       400       410    

         420       430       440       450       460       470     
pF1KB8 AGSITGPLYTHRPPITISSKIQKTKVEAPKLKVQHKFVEEIIEETKVEDEKSEMEEALTA
                                                                   
CCDS71 LPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHDDLE        
          420       430       440       450       460              

>>CCDS33383.1 DES gene_id:1674|Hs108|chr2                 (470 aa)
 initn: 1065 init1: 542 opt: 1074  Z-score: 449.6  bits: 93.5 E(32554): 1e-18
Smith-Waterman score: 1075; 38.8% identity (73.1% similar) in 469 aa overlap (12-465:6-468)

               10        20        30         40           50      
pF1KB8 MSYTLDSLGNPSAYRRVTETRSSFSRVSGSP-SSGFRSQSWSR---GSPSTVSSSYKRSM
                  :. .::.  : .:. . : : .: . :  . :   :: .. ::  .: .
CCDS33       MSQAYSSSQRVSSYRRTFGGAPGFPLGSPLSSPVFPRAGFGSKGSSSSVTSRVY
                     10        20        30        40        50    

         60        70         80        90                 100     
pF1KB8 LAPRLAYSSAMLSSAESS-LDFSQSSSLLNGGSGPGGDYKL----------SRSNEKEQL
        . : . ... :.: ..: :  ... :  . :.:   :..:          .:.::: .:
CCDS33 QVSRTSGGAGGLGSLRASRLGTTRTPS--SYGAGELLDFSLADAVNQEFLTTRTNEKVEL
           60        70        80          90       100       110  

         110       120       130       140       150       160     
pF1KB8 QGLNDRFAGYIEKVHYLEQQNKEIEAEIQALRQKQASHAQLGDAYDQEIRELRATLEMVN
       : ::::::.:::::..:::::  . ::.. :. .. .  .... :..:.::::  .:...
CCDS33 QELNDRFANYIEKVRFLEQQNAALAAEVNRLKGREPT--RVAELYEEELRELRRQVEVLT
            120       130       140         150       160       170

         170       180       190       200       210       220     
pF1KB8 HEKAQVQLDSDHLEEDIHRLKERFEEEARLRDDTEAAIRALRKDIEEASLVKVELDKKVQ
       ...:.:... :.: .:..::: ...:: .:....:  . :.: :.. :.:....:.....
CCDS33 NQRARVDVERDNLLDDLQRLKAKLQEEIQLKEEAENNLAAFRADVDAATLARIDLERRIE
              180       190       200       210       220       230

         230       240       250       260       270       280     
pF1KB8 SLQDEVAFLRSNHEEEVADLLAQIQASHITVERKDYLKTDISTALKEIRSQLESHSDQNM
       ::..:.:::.. ::::. .: ::.: ... ::  :. : :...::..::.: :. . .:.
CCDS33 SLNEEIAFLKKVHEEEIRELQAQLQEQQVQVEM-DMSKPDLTAALRDIRAQYETIAAKNI
              240       250       260        270       280         

         290       300       310       320       330       340     
pF1KB8 HQAEEWFKCRYAKLTEAAEQNKEAIRSAKEEIAEYRRQLQSKSIELESVRGTKESLERQL
        .::::.: . . ::.::..:..:.:.::.:. :::.:.:: . :.....::..:: ::.
CCDS33 SEAEEWYKSKVSDLTQAANKNNDALRQAKQEMMEYRHQIQSYTCEIDALKGTNDSLMRQM
     290       300       310       320       330       340         

         350       360       370       380       390       400     
pF1KB8 SDIEERHNHDLSSYQDTIQQLENELRGTKWEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIAAYRKLL
        ..:.:   . :.:::.: .::.:.:  : ::::::::::::::::::::.:::.:::::
CCDS33 RELEDRFASEASGYQDNIARLEEEIRHLKDEMARHLREYQDLLNVKMALDVEIATYRKLL
     350       360       370       380       390       400         

         410       420       430       440       450       460     
pF1KB8 EGEETRFSTFAGSITGPLYTHRPPITISSKIQKTKVEAPKLKVQHKFVEEIIEETKVEDE
       ::::.:..    . ..  . .  :   .:...  :.   :  .. .  : . : :. . :
CCDS33 EGEESRINLPIQTYSALNFRETSPEQRGSEVHTKKTVMIKT-IETRDGEVVSEATQQQHE
     410       420       430       440       450        460        

         470       480       490       500       510       520     
pF1KB8 KSEMEEALTAITEELAVSMKEEKKEAAEEKEEEPEAEEEEVAAKKSPVKATAPEVKEEEG
                                                                   
CCDS33 VL                                                          
      470                                                          

>>CCDS8783.1 PRPH gene_id:5630|Hs108|chr12                (470 aa)
 initn: 1121 init1: 554 opt: 1060  Z-score: 444.1  bits: 92.5 E(32554): 2e-18
Smith-Waterman score: 1076; 43.1% identity (72.1% similar) in 469 aa overlap (12-472:15-465)

                  10        20        30         40        50      
pF1KB8    MSYTLDSLGNPSAYRRVTETRSSFSRVSGSPSSGFR-SQSWSRGSPSTVSSSYKRSM
                     ..:::.     :.:  . : ::. : :.:   :: :  ::    :.
CCDS87 MSHHPSGLRAGFSSTSYRRTFGPPPSLSPGAFSYSSSSRFSSSRLLGSASPSSSVRLGSF
               10        20        30        40        50        60

         60        70        80        90       100       110      
pF1KB8 LAPRLAYSSAMLSSAESSLDFSQSSSLLNGGSGPGGDYKLSRSNEKEQLQGLNDRFAGYI
        .:: : ..:.:      ::::.. .:       . ..  .:::::..:: ::::::..:
CCDS87 RSPR-AGAGALLRLPSERLDFSMAEAL-------NQEFLATRSNEKQELQELNDRFANFI
                70        80               90       100       110  

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pF1KB8 EKVHYLEQQNKEIEAEI-QALRQKQASHAQLGDAYDQEIRELRATLEMVNHEKAQVQLDS
       :::..:::::  ...:. ::  :. :   ::    .::.::::  ::....:. .::.. 
CCDS87 EKVRFLEQQNAALRGELSQARGQEPARADQLC---QQELRELRRELELLGRERDRVQVER
            120       130       140          150       160         

         180       190       200       210       220       230     
pF1KB8 DHLEEDIHRLKERFEEEARLRDDTEAAIRALRKDIEEASLVKVELDKKVQSLQDEVAFLR
       : : ::.  ::.:.:::.: :.:.:  .  .:::...:.: ..::..:..::.::. ::.
CCDS87 DGLAEDLAALKQRLEEETRKREDAEHNLVLFRKDVDDATLSRLELERKIESLMDEIEFLK
     170       180       190       200       210       220         

         240       250        260       270       280       290    
pF1KB8 SNHEEEVADLLAQIQASHIT-VERKDYLKTDISTALKEIRSQLESHSDQNMHQAEEWFKC
       . ::::. :: ........  :: .  .: ....::..::.: :: . .:...::::.: 
CCDS87 KLHEEELRDLQVSVESQQVQQVEVEATVKPELTAALRDIRAQYESIAAKNLQEAEEWYKS
     230       240       250       260       270       280         

          300       310       320       330       340       350    
pF1KB8 RYAKLTEAAEQNKEAIRSAKEEIAEYRRQLQSKSIELESVRGTKESLERQLSDIEERHNH
       .:: :..::..:.::.:.::.:. : :::.:: . :....:::.:.: ::: ..::.   
CCDS87 KYADLSDAANRNHEALRQAKQEMNESRRQIQSLTCEVDGLRGTNEALLRQLRELEEQFAL
     290       300       310       320       330       340         

          360       370       380       390       400       410    
pF1KB8 DLSSYQDTIQQLENELRGTKWEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIAAYRKLLEGEETRFS-
       . ..::    .::.:::  : ::::::::::.:::::::::::::.:::::::::.:.: 
CCDS87 EAGGYQAGAARLEEELRQLKEEMARHLREYQELLNVKMALDIEIATYRKLLEGEESRISV
     350       360       370       380       390       400         

               420       430       440       450       460         
pF1KB8 ---TFAG-SITGPLYTHRPPITISSKIQKTKVEAPKLKVQHKFVEEIIEETKVEDEKSEM
          .::. .:   .   .::    :.  :: .    .:. .    :.. :.. : ..::.
CCDS87 PVHSFASLNIKTTVPEVEPPQDSHSR--KTVL----IKTIETRNGEVVTESQKE-QRSEL
     410       420       430             440       450        460  

     470       480       490       500       510       520         
pF1KB8 EEALTAITEELAVSMKEEKKEAAEEKEEEPEAEEEEVAAKKSPVKATAPEVKEEEGEKEE
       ...                                                         
CCDS87 DKSSAHSY                                                    
            470                                                    

>>CCDS11491.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17               (432 aa)
 initn: 875 init1: 572 opt: 1024  Z-score: 430.6  bits: 89.8 E(32554): 1.2e-17
Smith-Waterman score: 1032; 43.7% identity (73.7% similar) in 414 aa overlap (57-463:31-427)

         30        40        50        60         70        80     
pF1KB8 VSGSPSSGFRSQSWSRGSPSTVSSSYKRSMLAPRLAYSSA-MLSSAESSLDFSQSSSLLN
                                     :.:    : : :     . .::: ...: :
CCDS11 MERRRITSAARRSYVSSGEMMVGGLAPGRRLGPGTRLSLARMPPPLPTRVDFSLAGAL-N
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