Result of FASTA (omim) for
pF1KB8486
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8486, 855 aa
1>>>pF1KB8486 855 - 855 aa - 855 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2896+/-0.000506; mu= 16.5983+/- 0.031
mean_var=184.3462+/-37.104, 0's: 0 Z-trim(114.2): 553 B-trim: 49 in 1/57
Lambda= 0.094462
statistics sampled from 23266 (23947) to 23266 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.635), E-opt: 0.2 (0.281), width: 16
Scan time: 9.770
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_068813 (OMIM: 606797) suppressor of tumorigenic ( 855) 6038 837.0 0
NP_001275930 (OMIM: 206200,609862) transmembrane p ( 802) 949 143.4 4e-33
NP_705837 (OMIM: 206200,609862) transmembrane prot ( 811) 949 143.4 4e-33
XP_011526284 (OMIM: 610477) PREDICTED: transmembra ( 562) 810 124.2 1.6e-27
XP_011526282 (OMIM: 610477) PREDICTED: transmembra ( 690) 810 124.4 1.8e-27
NP_892018 (OMIM: 610477) transmembrane protease se (1059) 810 124.6 2.4e-27
XP_011526280 (OMIM: 610477) PREDICTED: transmembra (1093) 810 124.6 2.4e-27
NP_002763 (OMIM: 226200,606635) enteropeptidase pr (1019) 753 116.8 5.1e-25
XP_011527961 (OMIM: 226200,606635) PREDICTED: ente (1034) 753 116.8 5.1e-25
XP_011527960 (OMIM: 226200,606635) PREDICTED: ente (1037) 753 116.8 5.1e-25
XP_011527959 (OMIM: 226200,606635) PREDICTED: ente (1049) 753 116.8 5.2e-25
XP_011527957 (OMIM: 226200,606635) PREDICTED: ente (1064) 753 116.8 5.2e-25
XP_011527958 (OMIM: 226200,606635) PREDICTED: ente (1064) 753 116.8 5.2e-25
XP_011527956 (OMIM: 226200,606635) PREDICTED: ente (1064) 753 116.8 5.2e-25
XP_011528035 (OMIM: 602060) PREDICTED: transmembra ( 384) 717 111.3 8.5e-24
XP_005261100 (OMIM: 602060) PREDICTED: transmembra ( 452) 717 111.4 9.4e-24
NP_005647 (OMIM: 602060) transmembrane protease se ( 492) 717 111.5 9.9e-24
XP_011528033 (OMIM: 602060) PREDICTED: transmembra ( 492) 717 111.5 9.9e-24
NP_001128571 (OMIM: 602060) transmembrane protease ( 529) 717 111.5 1e-23
NP_001193718 (OMIM: 610050) transmembrane protease ( 532) 703 109.6 3.9e-23
NP_001231924 (OMIM: 610050) transmembrane protease ( 563) 703 109.7 4e-23
NP_001070731 (OMIM: 610050) transmembrane protease ( 567) 703 109.7 4e-23
NP_001275679 (OMIM: 606751) transmembrane protease ( 413) 695 108.4 7.1e-23
NP_001275680 (OMIM: 606751) transmembrane protease ( 448) 695 108.4 7.5e-23
NP_110397 (OMIM: 606751) transmembrane protease se ( 457) 695 108.4 7.5e-23
XP_006714272 (OMIM: 217030,610984,612923,615439) P ( 590) 689 107.8 1.5e-22
XP_016882221 (OMIM: 142440) PREDICTED: serine prot ( 393) 674 105.5 5e-22
XP_005258895 (OMIM: 142440) PREDICTED: serine prot ( 417) 674 105.5 5.2e-22
XP_016882220 (OMIM: 142440) PREDICTED: serine prot ( 417) 674 105.5 5.2e-22
NP_892028 (OMIM: 142440) serine protease hepsin pr ( 417) 674 105.5 5.2e-22
XP_006723244 (OMIM: 142440) PREDICTED: serine prot ( 417) 674 105.5 5.2e-22
NP_002142 (OMIM: 142440) serine protease hepsin pr ( 417) 674 105.5 5.2e-22
XP_011530198 (OMIM: 610399) PREDICTED: transmembra ( 345) 661 103.6 1.6e-21
NP_054777 (OMIM: 610399) transmembrane protease se ( 423) 661 103.8 1.8e-21
XP_016863673 (OMIM: 229000,612423) PREDICTED: plas ( 436) 654 102.8 3.5e-21
NP_001305325 (OMIM: 229000,612423) plasma kallikre ( 436) 654 102.8 3.5e-21
NP_000883 (OMIM: 229000,612423) plasma kallikrein ( 638) 654 103.1 4.4e-21
XP_011530232 (OMIM: 229000,612423) PREDICTED: plas ( 649) 654 103.1 4.5e-21
XP_016863670 (OMIM: 229000,612423) PREDICTED: plas ( 649) 654 103.1 4.5e-21
XP_016862359 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 668) 627 99.4 5.8e-20
NP_001870 (OMIM: 257920,600521) mannan-binding lec ( 699) 627 99.4 6e-20
XP_011511292 (OMIM: 257920,600521) PREDICTED: mann ( 706) 627 99.4 6e-20
NP_000119 (OMIM: 264900,612416) coagulation factor ( 625) 625 99.1 6.8e-20
NP_000124 (OMIM: 122700,300746,300807,306900) coag ( 461) 623 98.6 6.8e-20
XP_005262880 (OMIM: 264900,612416) PREDICTED: coag ( 536) 616 97.8 1.4e-19
XP_006714200 (OMIM: 264900,612416) PREDICTED: coag ( 610) 616 97.8 1.6e-19
XP_005262878 (OMIM: 264900,612416) PREDICTED: coag ( 626) 616 97.9 1.6e-19
NP_001300842 (OMIM: 122700,300746,300807,306900) c ( 423) 605 96.1 3.5e-19
XP_005255530 (OMIM: 609343) PREDICTED: brain-speci ( 317) 603 95.7 3.6e-19
NP_071402 (OMIM: 609343) brain-specific serine pro ( 317) 603 95.7 3.6e-19
>>NP_068813 (OMIM: 606797) suppressor of tumorigenicity (855 aa)
initn: 6038 init1: 6038 opt: 6038 Z-score: 4463.5 bits: 837.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6038; 100.0% identity (100.0% similar) in 855 aa overlap (1-855:1-855)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MGSDRARKGGGGPKDFGAGLKYNSRHEKVNGLEEGVEFLPVNNVKKVEKHGPGRWVVLAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 MGSDRARKGGGGPKDFGAGLKYNSRHEKVNGLEEGVEFLPVNNVKKVEKHGPGRWVVLAA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 VLIGLLLVLLGIGFLVWHLQYRDVRVQKVFNGYMRITNENFVDAYENSNSTEFVSLASKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 VLIGLLLVLLGIGFLVWHLQYRDVRVQKVFNGYMRITNENFVDAYENSNSTEFVSLASKV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 KDALKLLYSGVPFLGPYHKESAVTAFSEGSVIAYYWSEFSIPQHLVEEAERVMAEERVVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 KDALKLLYSGVPFLGPYHKESAVTAFSEGSVIAYYWSEFSIPQHLVEEAERVMAEERVVM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 LPPRARSLKSFVVTSVVAFPTDSKTVQRTQDNSCSFGLHARGVELMRFTTPGFPDSPYPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 LPPRARSLKSFVVTSVVAFPTDSKTVQRTQDNSCSFGLHARGVELMRFTTPGFPDSPYPA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 HARCQWALRGDADSVLSLTFRSFDLASCDERGSDLVTVYNTLSPMEPHALVQLCGTYPPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 HARCQWALRGDADSVLSLTFRSFDLASCDERGSDLVTVYNTLSPMEPHALVQLCGTYPPS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 YNLTFHSSQNVLLITLITNTERRHPGFEATFFQLPRMSSCGGRLRKAQGTFNSPYYPGHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 YNLTFHSSQNVLLITLITNTERRHPGFEATFFQLPRMSSCGGRLRKAQGTFNSPYYPGHY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 PPNIDCTWNIEVPNNQHVKVRFKFFYLLEPGVPAGTCPKDYVEINGEKYCGERSQFVVTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 PPNIDCTWNIEVPNNQHVKVRFKFFYLLEPGVPAGTCPKDYVEINGEKYCGERSQFVVTS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 NSNKITVRFHSDQSYTDTGFLAEYLSYDSSDPCPGQFTCRTGRCIRKELRCDGWADCTDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 NSNKITVRFHSDQSYTDTGFLAEYLSYDSSDPCPGQFTCRTGRCIRKELRCDGWADCTDH
430 440 450 460 470 480
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pF1KB8 SDELNCSCDAGHQFTCKNKFCKPLFWVCDSVNDCGDNSDEQGCSCPAQTFRCSNGKCLSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 SDELNCSCDAGHQFTCKNKFCKPLFWVCDSVNDCGDNSDEQGCSCPAQTFRCSNGKCLSK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 SQQCNGKDDCGDGSDEASCPKVNVVTCTKHTYRCLNGLCLSKGNPECDGKEDCSDGSDEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 SQQCNGKDDCGDGSDEASCPKVNVVTCTKHTYRCLNGLCLSKGNPECDGKEDCSDGSDEK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 DCDCGLRSFTRQARVVGGTDADEGEWPWQVSLHALGQGHICGASLISPNWLVSAAHCYID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 DCDCGLRSFTRQARVVGGTDADEGEWPWQVSLHALGQGHICGASLISPNWLVSAAHCYID
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 DRGFRYSDPTQWTAFLGLHDQSQRSAPGVQERRLKRIISHPFFNDFTFDYDIALLELEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 DRGFRYSDPTQWTAFLGLHDQSQRSAPGVQERRLKRIISHPFFNDFTFDYDIALLELEKP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 AEYSSMVRPICLPDASHVFPAGKAIWVTGWGHTQYGGTGALILQKGEIRVINQTTCENLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 AEYSSMVRPICLPDASHVFPAGKAIWVTGWGHTQYGGTGALILQKGEIRVINQTTCENLL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 PQQITPRMMCVGFLSGGVDSCQGDSGGPLSSVEADGRIFQAGVVSWGDGCAQRNKPGVYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 PQQITPRMMCVGFLSGGVDSCQGDSGGPLSSVEADGRIFQAGVVSWGDGCAQRNKPGVYT
790 800 810 820 830 840
850
pF1KB8 RLPLFRDWIKENTGV
:::::::::::::::
NP_068 RLPLFRDWIKENTGV
850
>>NP_001275930 (OMIM: 206200,609862) transmembrane prote (802 aa)
initn: 1117 init1: 541 opt: 949 Z-score: 715.7 bits: 143.4 E(85289): 4e-33
Smith-Waterman score: 1487; 32.4% identity (59.7% similar) in 833 aa overlap (46-851:35-799)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 FGAGLKYNSRHEKVNGLEEGVEFLPVNNVKKVEKHGPGRWVVLAAVLIGLLLVLLGIGFL
: . .: : : : ..: :::: . : :
NP_001 EAPQVAGGQGDGGDGEEAEPEGMFKACEDSKRKARGYLRLVPLFVLLA--LLVLASAGVL
10 20 30 40 50 60
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pF1KB8 VWH-LQYR-DVRVQKVFNGYMRITNENFVDAYENSNSTEFVSLASKVKDALKLLYSGVPF
.:. : :. .: :..:..: .:. :..: . .:. : : ..:.. :: : ...
NP_001 LWYFLGYKAEVMVSQVYSGSLRVLNRHFSQDLTRRESSAFRSETAKAQKMLKELITSTR-
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180
pF1KB8 LGPYHKESAVTAFSEGSVIAYYWSEFSIPQH--LVEEAERVMA---EERVVMLPPRA---
:: :.. :.: .:.:: . ..: ..::.: :. : :.: :: . . :
NP_001 LGTYYNSSSVYSFGEGPLTCFFWFILQIPEHRRLMLSPEVVQALLVEELLSTVNSSAAVP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 -RSLKSFVVTSVVAFPTDSKTVQRTQDN-SC-SFGLHARGVELMRFTTPGFPDSPYPAHA
:. ..: . .. : . ... .: .. ..: ...:. : :
NP_001 YRAEYEVDPEGLVILEASVKDIAALNSTLGCYRYSYVGQG-QVLRLKGPDHLASS-----
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 RCQWALRGDADSVLSLTFRSFDLASCDERGSDLVTVYNTLSPMEPHALVQL--CGTYPPS
: : :.: : .:.: .. . :: : .: ...:.. .:.: . .... :. :
NP_001 -CLWHLQGPKDLMLKLRLE-WTLAECRDR----LAMYDVAGPLEKRLITSVYGCSRQEPV
240 250 260 270 280
310 320 330 340 350
pF1KB8 YNLTFHSSQNVLLITLITNTERRHPGF----EATFFQLPRMS-SCGGRLRKAQGTFNSPY
.. .: .. .. . . . : . . :: ... . .:: .::....::
NP_001 VEVL--ASGAIMAVVWKKGLHSYYDPFVLSVQPVVFQACEVNLTLDNRL-DSQGVLSTPY
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 YPGHYPPNIDCTWNIEVPN-NQHVKVRFKFFYLLEPGVPAGTCPKDYVEINGEKYCGER-
.:..: :. :.:.. ::. . . . : . : . : . :.... :: :
NP_001 FPSYYSPQTHCSWHLTVPSLDYGLALWFDAYALRRQKYDL-PCTQGQWTIQNRRLCGLRI
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460
pF1KB8 ----SQFVVTSNSNKITVRFHSDQSYTDTGFLAEYLSYDSSDPCPGQFTCRTGRCIRKEL
.. . . . ::. : :. : : : ..: :..::::::.: : .
NP_001 LQPYAERIPVVATAGITINFTSQISLTGPGVRVHYGLYNQSDPCPGEFLCSV--------
410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KB8 RCDGWADCTDHSDELNCSCDAGHQFTCKNKFCKPLFWVCDSVNDCGDNSDEQGCSCPAQT
: .: : .::.:.:: .. ::..: : : :
NP_001 ----------------------------NGLCVP---ACDGVKDCPNGLDERNCVCRA-T
460 470 480
530 540 550 560 570 580
pF1KB8 FRCS-NGKCLSKSQQCNGKDDCGDGSDEASCPKVNVVTCTKHTYRCLNGLCLSKGNPECD
:.:. .. :.: . :.:. :: .:::: .: . : : :..: . :..: ::.::
NP_001 FQCKEDSTCISLPKVCDGQPDCLNGSDEEQCQE--GVPCGTFTFQCEDRSCVKKPNPQCD
490 500 510 520 530 540
590 600 610 620 630 640
pF1KB8 GKEDCSDGSDEKDCDCGLRSFTRQARVVGGTDADEGEWPWQVSLHALGQGHICGASLISP
:. :: :::::. :::::.. . .:.:::. ..:::::::.::.. :. ::::..::.
NP_001 GRPDCRDGSDEEHCDCGLQGPS--SRIVGGAVSSEGEWPWQASLQVRGR-HICGGALIAD
550 560 570 580 590 600
650 660 670 680 690 700
pF1KB8 NWLVSAAHCYIDDRGFRYSDPTQWTAFLGLHDQSQRSAPGVQERRLKRIISHPFFNDFTF
:...::::. .: ... . ::.::: :..: :: ...:.. ::. .. .
NP_001 RWVITAAHCFQED---SMASTVLWTVFLGKVWQNSR-WPGEVSFKVSRLLLHPYHEEDSH
610 620 630 640 650
710 720 730 740 750 760
pF1KB8 DYDIALLELEKPAEYSSMVRPICLPDASHVFPAGKAIWVTGWGHTQYGGTGALILQKGEI
:::.:::.:..:. :. :::.::: :: : : :.:::: . :: . ::: ..
NP_001 DYDVALLQLDHPVVRSAAVRPVCLPARSHFFEPGLHCWITGWGALREGGPISNALQKVDV
660 670 680 690 700 710
770 780 790 800 810 820
pF1KB8 RVINQTTCENLLPQQITPRMMCVGFLSGGVDSCQGDSGGPLSSVEADGRIFQAGVVSWGD
..: : : .. :.::::.:.:. .: :.::::::::: .:: : ::.::::
NP_001 QLIPQDLCSEVYRYQVTPRMLCAGYRKGKKDACQGDSGGPLVCKALSGRWFLAGLVSWGL
720 730 740 750 760 770
830 840 850
pF1KB8 GCAQRNKPGVYTRLPLFRDWIKENTGV
::.. : :::::. .::..
NP_001 GCGRPNYFGVYTRITGVISWIQQVVT
780 790 800
>>NP_705837 (OMIM: 206200,609862) transmembrane protease (811 aa)
initn: 1117 init1: 541 opt: 949 Z-score: 715.6 bits: 143.4 E(85289): 4e-33
Smith-Waterman score: 1487; 32.4% identity (59.7% similar) in 833 aa overlap (46-851:44-808)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 FGAGLKYNSRHEKVNGLEEGVEFLPVNNVKKVEKHGPGRWVVLAAVLIGLLLVLLGIGFL
: . .: : : : ..: :::: . : :
NP_705 EAPQVAGGQGDGGDGEEAEPEGMFKACEDSKRKARGYLRLVPLFVLLA--LLVLASAGVL
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KB8 VWH-LQYR-DVRVQKVFNGYMRITNENFVDAYENSNSTEFVSLASKVKDALKLLYSGVPF
.:. : :. .: :..:..: .:. :..: . .:. : : ..:.. :: : ...
NP_705 LWYFLGYKAEVMVSQVYSGSLRVLNRHFSQDLTRRESSAFRSETAKAQKMLKELITSTR-
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180
pF1KB8 LGPYHKESAVTAFSEGSVIAYYWSEFSIPQH--LVEEAERVMA---EERVVMLPPRA---
:: :.. :.: .:.:: . ..: ..::.: :. : :.: :: . . :
NP_705 LGTYYNSSSVYSFGEGPLTCFFWFILQIPEHRRLMLSPEVVQALLVEELLSTVNSSAAVP
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 -RSLKSFVVTSVVAFPTDSKTVQRTQDN-SC-SFGLHARGVELMRFTTPGFPDSPYPAHA
:. ..: . .. : . ... .: .. ..: ...:. : :
NP_705 YRAEYEVDPEGLVILEASVKDIAALNSTLGCYRYSYVGQG-QVLRLKGPDHLASS-----
200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 RCQWALRGDADSVLSLTFRSFDLASCDERGSDLVTVYNTLSPMEPHALVQL--CGTYPPS
: : :.: : .:.: .. . :: : .: ...:.. .:.: . .... :. :
NP_705 -CLWHLQGPKDLMLKLRLE-WTLAECRDR----LAMYDVAGPLEKRLITSVYGCSRQEPV
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KB8 YNLTFHSSQNVLLITLITNTERRHPGF----EATFFQLPRMS-SCGGRLRKAQGTFNSPY
.. .: .. .. . . . : . . :: ... . .:: .::....::
NP_705 VEVL--ASGAIMAVVWKKGLHSYYDPFVLSVQPVVFQACEVNLTLDNRL-DSQGVLSTPY
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 YPGHYPPNIDCTWNIEVPN-NQHVKVRFKFFYLLEPGVPAGTCPKDYVEINGEKYCGER-
.:..: :. :.:.. ::. . . . : . : . : . :.... :: :
NP_705 FPSYYSPQTHCSWHLTVPSLDYGLALWFDAYALRRQKYDL-PCTQGQWTIQNRRLCGLRI
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KB8 ----SQFVVTSNSNKITVRFHSDQSYTDTGFLAEYLSYDSSDPCPGQFTCRTGRCIRKEL
.. . . . ::. : :. : : : ..: :..::::::.: : .
NP_705 LQPYAERIPVVATAGITINFTSQISLTGPGVRVHYGLYNQSDPCPGEFLCSV--------
420 430 440 450 460
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pF1KB8 RCDGWADCTDHSDELNCSCDAGHQFTCKNKFCKPLFWVCDSVNDCGDNSDEQGCSCPAQT
: .: : .::.:.:: .. ::..: : : :
NP_705 ----------------------------NGLCVP---ACDGVKDCPNGLDERNCVCRA-T
470 480 490
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pF1KB8 FRCS-NGKCLSKSQQCNGKDDCGDGSDEASCPKVNVVTCTKHTYRCLNGLCLSKGNPECD
:.:. .. :.: . :.:. :: .:::: .: . : : :..: . :..: ::.::
NP_705 FQCKEDSTCISLPKVCDGQPDCLNGSDEEQCQE--GVPCGTFTFQCEDRSCVKKPNPQCD
500 510 520 530 540 550
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pF1KB8 GKEDCSDGSDEKDCDCGLRSFTRQARVVGGTDADEGEWPWQVSLHALGQGHICGASLISP
:. :: :::::. :::::.. . .:.:::. ..:::::::.::.. :. ::::..::.
NP_705 GRPDCRDGSDEEHCDCGLQGPS--SRIVGGAVSSEGEWPWQASLQVRGR-HICGGALIAD
560 570 580 590 600
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pF1KB8 NWLVSAAHCYIDDRGFRYSDPTQWTAFLGLHDQSQRSAPGVQERRLKRIISHPFFNDFTF
:...::::. .: ... . ::.::: :..: :: ...:.. ::. .. .
NP_705 RWVITAAHCFQED---SMASTVLWTVFLGKVWQNSR-WPGEVSFKVSRLLLHPYHEEDSH
610 620 630 640 650 660
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pF1KB8 DYDIALLELEKPAEYSSMVRPICLPDASHVFPAGKAIWVTGWGHTQYGGTGALILQKGEI
:::.:::.:..:. :. :::.::: :: : : :.:::: . :: . ::: ..
NP_705 DYDVALLQLDHPVVRSAAVRPVCLPARSHFFEPGLHCWITGWGALREGGPISNALQKVDV
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pF1KB8 RVINQTTCENLLPQQITPRMMCVGFLSGGVDSCQGDSGGPLSSVEADGRIFQAGVVSWGD
..: : : .. :.::::.:.:. .: :.::::::::: .:: : ::.::::
NP_705 QLIPQDLCSEVYRYQVTPRMLCAGYRKGKKDACQGDSGGPLVCKALSGRWFLAGLVSWGL
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pF1KB8 GCAQRNKPGVYTRLPLFRDWIKENTGV
::.. : :::::. .::..
NP_705 GCGRPNYFGVYTRITGVISWIQQVVT
790 800 810
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initn: 1282 init1: 570 opt: 810 Z-score: 614.9 bits: 124.2 E(85289): 1.6e-27
Smith-Waterman score: 825; 49.2% identity (70.8% similar) in 250 aa overlap (603-852:319-559)
580 590 600 610 620 630
pF1KB8 RCLNGLCLSKGNPECDGKEDCSDGSDEKDCDCGLRSFTRQARVVGGTDADEGEWPWQVSL
:::: . . .:.:::. : .:::::::::
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. : ::: :.. ::.:::::. : :.:: ::.:::: : .: : : .
XP_011 WLRRREHRCGAVLVAERWLLSAAHCF-D----VYGDPKQWAAFLGTPFLS--GAEG-QLE
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pF1KB8 RLKRIISHPFFNDFTFDYDIALLELEKPAEYSSMVRPICLPDASHVFPAGKAIWVTGWGH
:. :: .:::.: .:.:::.::::: :.. : .:::::::. . : : .::::
XP_011 RVARIYKHPFYNLYTLDYDVALLELAGPVRRSRLVRPICLPEPAPRPPDGTRCVITGWGS
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.. ::. : :::. .:.... ::. . : ::. ::.:.:: .::::::.::.::::.
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: .:: .::.::: ::.. . ::::::. : :: ..
XP_011 EPSGRWVLTGVTSWGYGCGRPHFPGVYTRVAAVRGWIGQHIQE
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>--
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:::.... ::.::::: : .. : : :: . .. :. :.:.. :
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.:::. . .:.: :: : ..: ::.:.::: : ::::::::::::. :: : ..
XP_011 PELLQKASVGIIDQKTCSVLYNFSLTDRMICAGFLEGKVDSCQGDSGGPLACEEAPGVFY
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::.:::: :::: .:::::::. .. :: :
XP_011 LAGIVSWGIGCAQVKKPGVYTRITRLKGWILEIMSSQPLPMSPPSTTRMLATTSPRTTAG
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270 280 290 300 310 320
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initn: 1165 init1: 570 opt: 810 Z-score: 614.0 bits: 124.4 E(85289): 1.8e-27
Smith-Waterman score: 825; 49.2% identity (70.8% similar) in 250 aa overlap (603-852:447-687)
580 590 600 610 620 630
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:::: . . .:.:::. : .:::::::::
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pF1KB8 HALGQGHICGASLISPNWLVSAAHCYIDDRGFRYSDPTQWTAFLGLHDQSQRSAPGVQER
. : ::: :.. ::.:::::. : :.:: ::.:::: : .: : : .
XP_011 WLRRREHRCGAVLVAERWLLSAAHCF-D----VYGDPKQWAAFLGTPFLS--GAEG-QLE
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:. :: .:::.: .:.:::.::::: :.. : .:::::::. . : : .::::
XP_011 RVARIYKHPFYNLYTLDYDVALLELAGPVRRSRLVRPICLPEPAPRPPDGTRCVITGWGS
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.. ::. : :::. .:.... ::. . : ::. ::.:.:: .::::::.::.::::.
XP_011 VREGGSMARQLQKAAVRLLSEQTCRRFYPVQISSRMLCAGFPQGGVDSCSGDAGGPLACR
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XP_011 EPSGRWVLTGVTSWGYGCGRPHFPGVYTRVAAVRGWIGQHIQE
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XP_011 PESPVVSTPTKSMQALSTVPLDWVTVPKLQECGARPAMEKPTRVVGGFGAASGEVPWQVS
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XP_011 LKE-GSRHFCGATVVGDRWLLSAAHC------FNHTKVEQVRAHLGTASLLGLGGSPVKI
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:: : .. ::.:::: :::: .:::::::. .. :: :
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330 340 350 360 370 380
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390 400 410 420 430 440
>--
initn: 298 init1: 262 opt: 306 Z-score: 242.8 bits: 55.7 E(85289): 8.8e-07
Smith-Waterman score: 306; 62.1% identity (80.3% similar) in 66 aa overlap (788-853:1-66)
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pF1KB8 TGALILQKGEIRVINQTTCENLLPQQITPRMMCVGFLSGGVDSCQGDSGGPLSSVEADGR
:.:.:.:.: :::::::::::: : .::
XP_011 MVCAGYLDGKVDSCQGDSGGPLVCEEPSGR
10 20 30
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pF1KB8 IFQAGVVSWGDGCAQRNKPGVYTRLPLFRDWIKENTGV
.: ::.:::: :::. .::::.:. .:::: : :
XP_011 FFLAGIVSWGIGCAEARRPGVYARVTRLRDWILEATTKASMPLAPTMAPAPAAPSTAWPT
40 50 60 70 80 90
XP_011 SPESPVVSTPTKSMQALSTVPLDWVTVPKLQECGARPAMEKPTRVVGGFGAASGEVPWQV
100 110 120 130 140 150
>>NP_892018 (OMIM: 610477) transmembrane protease serine (1059 aa)
initn: 1723 init1: 570 opt: 810 Z-score: 612.0 bits: 124.6 E(85289): 2.4e-27
Smith-Waterman score: 907; 46.3% identity (73.3% similar) in 270 aa overlap (586-853:173-435)
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pF1KB8 EASCPKVNVVTCTKHTYRCLNGLCLSKGNPECDGKEDCSDGSDEKDCDCGLRSFTRQA-R
::: .::::::::: :.:::. :.: :
NP_892 PLAERDFKSGRCPGNSFSCGNSQCVTKVNPECDDQEDCSDGSDEAHCECGLQPAWRMAGR
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.::: .:. ::.:::.::. .. :.:::..:. ::::::::. . ..:::.:.:
NP_892 IVGGMEASPGEFPWQASLRE-NKEHFCGAAIINARWLVSAAHCFNE-----FQDPTKWVA
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..: : : :. . .. :..::..: : :.:.:.::: .: .. ..:.:::
NP_892 YVGATYLSGSEASTVRAQVVQ-IVKHPLYNADTADFDVAVLELTSPLPFGRHIQPVCLPA
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pF1KB8 ASHVFPAGKAIWVTGWGHTQYGG-TGALILQKGEIRVINQTTCENLLPQQITPRMMCVGF
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NP_892 ATHIFPPSKKCLISGWGYLKEDFLVKPEVLQKATVELLDQALCASLYGHSLTDRMVCAGY
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pF1KB8 LSGGVDSCQGDSGGPLSSVEADGRIFQAGVVSWGDGCAQRNKPGVYTRLPLFRDWIKENT
:.: :::::::::::: : .::.: ::.:::: :::. .::::.:. .:::: : :
NP_892 LDGKVDSCQGDSGGPLVCEEPSGRFFLAGIVSWGIGCAEARRPGVYARVTRLRDWILEAT
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pF1KB8 GV
NP_892 TKASMPLAPTMAPAPAAPSTAWPTSPESPVVSTPTKSMQALSTVPLDWVTVPKLQECGAR
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Smith-Waterman score: 825; 49.2% identity (70.8% similar) in 250 aa overlap (603-852:816-1056)
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pF1KB8 RCLNGLCLSKGNPECDGKEDCSDGSDEKDCDCGLRSFTRQARVVGGTDADEGEWPWQVSL
:::: . . .:.:::. : .:::::::::
NP_892 NSTLSAVSTTARGQTPFPDAPEATTHTQLPDCGL-APAALTRIVGGSAAGRGEWPWQVSL
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. : ::: :.. ::.:::::. : :.:: ::.:::: : .: : : .
NP_892 WLRRREHRCGAVLVAERWLLSAAHCF-D----VYGDPKQWAAFLGTPFLS--GAEG-QLE
850 860 870 880 890
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:. :: .:::.: .:.:::.::::: :.. : .:::::::. . : : .::::
NP_892 RVARIYKHPFYNLYTLDYDVALLELAGPVRRSRLVRPICLPEPAPRPPDGTRCVITGWGS
900 910 920 930 940 950
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pF1KB8 TQYGGTGALILQKGEIRVINQTTCENLLPQQITPRMMCVGFLSGGVDSCQGDSGGPLSSV
.. ::. : :::. .:.... ::. . : ::. ::.:.:: .::::::.::.::::.
NP_892 VREGGSMARQLQKAAVRLLSEQTCRRFYPVQISSRMLCAGFPQGGVDSCSGDAGGPLACR
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pF1KB8 EADGRIFQAGVVSWGDGCAQRNKPGVYTRLPLFRDWIKENTGV
: .:: .::.::: ::.. . ::::::. : :: ..
NP_892 EPSGRWVLTGVTSWGYGCGRPHFPGVYTRVAAVRGWIGQHIQE
1020 1030 1040 1050
>--
initn: 742 init1: 361 opt: 752 Z-score: 569.3 bits: 116.7 E(85289): 5.7e-25
Smith-Waterman score: 752; 45.0% identity (68.9% similar) in 251 aa overlap (603-851:491-733)
580 590 600 610 620 630
pF1KB8 RCLNGLCLSKGNPECDGKEDCSDGSDEKDCDCGLR-SFTRQARVVGGTDADEGEWPWQVS
.:: : .. . .::::: : :: :::::
NP_892 PESPVVSTPTKSMQALSTVPLDWVTVPKLQECGARPAMEKPTRVVGGFGAASGEVPWQVS
470 480 490 500 510 520
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pF1KB8 LHALGQGHICGASLISPNWLVSAAHCYIDDRGFRYSDPTQWTAFLGLHDQSQRSAPGVQE
:. :. :.:::.... ::.::::: : .. : : :: . .. :.
NP_892 LKE-GSRHFCGATVVGDRWLLSAAHC------FNHTKVEQVRAHLGTASLLGLGGSPVKI
530 540 550 560 570
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pF1KB8 RRLKRIISHPFFNDFTFDYDIALLELEKPAEYSSMVRPICLPDASHVFPAGKAIWVTGWG
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NP_892 G-LRRVVLHPLYNPGILDFDLAVLELASPLAFNKYIQPVCLPLAIQKFPVGRKCMISGWG
580 590 600 610 620 630
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pF1KB8 HTQYGG-TGALILQKGEIRVINQTTCENLLPQQITPRMMCVGFLSGGVDSCQGDSGGPLS
.:: :. : .:::. . .:.: :: : ..: ::.:.::: : ::::::::::::.
NP_892 NTQEGNATKPELLQKASVGIIDQKTCSVLYNFSLTDRMICAGFLEGKVDSCQGDSGGPLA
640 650 660 670 680 690
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pF1KB8 SVEADGRIFQAGVVSWGDGCAQRNKPGVYTRLPLFRDWIKENTGV
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NP_892 CEEAPGVFYLAGIVSWGIGCAQVKKPGVYTRITRLKGWILEIMSSQPLPMSPPSTTRMLA
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