Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8492
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8492, 858 aa
1>>>pF1KB8492 858 - 858 aa - 858 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7330+/-0.00108; mu= 17.9861+/- 0.065
mean_var=66.5766+/-13.542, 0's: 0 Z-trim(103.1): 43 B-trim: 128 in 1/46
Lambda= 0.157186
statistics sampled from 7214 (7246) to 7214 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.582), E-opt: 0.2 (0.223), width: 16
Scan time: 3.930
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12117.1 EEF2 gene_id:1938|Hs108|chr19 ( 858) 5711 1304.7 0
CCDS45707.1 EFTUD2 gene_id:9343|Hs108|chr17 ( 937) 1738 403.8 7.4e-112
CCDS59295.1 EFTUD2 gene_id:9343|Hs108|chr17 ( 962) 1738 403.8 7.6e-112
CCDS11489.1 EFTUD2 gene_id:9343|Hs108|chr17 ( 972) 1738 403.8 7.7e-112
CCDS42070.1 EFL1 gene_id:79631|Hs108|chr15 (1069) 440 109.4 3.4e-23
CCDS42071.1 EFL1 gene_id:79631|Hs108|chr15 (1120) 440 109.4 3.5e-23
>>CCDS12117.1 EEF2 gene_id:1938|Hs108|chr19 (858 aa)
initn: 5711 init1: 5711 opt: 5711 Z-score: 6991.5 bits: 1304.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5711; 100.0% identity (100.0% similar) in 858 aa overlap (1-858:1-858)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTR
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CCDS12 MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGAGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSKDGAGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 IVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EGQLGPAERAKKVEDMMKKLWGDRYFDPANGKFSKSATSPEGKKLPRTFCQLILDPIFKV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 FDAIMNFKKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FDAIMNFKKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 PVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 VSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 KTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 SGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 RLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 ILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 IIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 MFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDNSSRPSQVVAETRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDNSSRPSQVVAETRK
790 800 810 820 830 840
850
pF1KB8 RKGLKEGIPALDNFLDKL
::::::::::::::::::
CCDS12 RKGLKEGIPALDNFLDKL
850
>>CCDS45707.1 EFTUD2 gene_id:9343|Hs108|chr17 (937 aa)
initn: 2117 init1: 637 opt: 1738 Z-score: 2121.6 bits: 403.8 E(32554): 7.4e-112
Smith-Waterman score: 2153; 39.2% identity (69.6% similar) in 873 aa overlap (4-856:79-919)
10 20 30
pF1KB8 MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKS
. .: . .::.. :::... .:. :::.
CCDS45 EDTQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLADLMDNSELIRNVTLCGHLHHGKT
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 TLTDSLVCKAGIIASARAGETR-FTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQS
..: :. .. : . .:: :::: . :::: ... . ..
CCDS45 CFVDCLIEQTHPEIRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVGIKSTPVTVV----------LPDT
110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 KDGAGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIK
: : ..:.:..:.::::.::.::::.::..::... .: . :: ..:: ....:. ::.
CCDS45 K-GKSYLFNIMDTPGHVNFSDEVTAGLRISDGVVLFIDAAEGVMLNTERLIKHAVQERLA
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 PVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTV
.. .::.:: .:::.: : . : ...::..:: .:: :. : :....:.::.:
CCDS45 VTVCINKIDRLILELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLISMYSTDE-----NLILSPLLGNV
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 GFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGQLGPAERAKKVEDMMKKLWGDRYFDPANGK
:.:. .. ::: .::..:. : :... : ::. :::: ::.: . :
CCDS45 CFSSSQYSICFTLGSFAKIYADTF-----GDINYQEFAKR-------LWGDIYFNPKTRK
280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 FSKSATSPEGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFKKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEG
:.:.: . .. :.: ..::.:..:.. ... . ...: :.: .:. .
CCDS45 FTKKAPTSSSQ---RSFVEFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHLTKEELKLNI
330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 KPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKG
.:::. : .... ....: . :.::: .. : . : : : :.. . ....::: :
CCDS45 RPLLRLVCKKFFGEFTGFVDMCVQHIPSPKVGAKPKIEHTYTGGVDSDLGEAMSDCDPDG
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 PLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTIL
::: . .:: :.: .:.:::::.:: . .: :...: ::: .:: . . : .
CCDS45 PLMCHTTKMYSTDDGVQFHAFGRVLSGTIHAGQPVKVLGENYTLEDEEDSQICTVGRLWI
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500
pF1KB8 MMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTF---EHAHNMRVMKFSVSPVVRVAV
..:: .. :: :: : . :::: .:::.::: :.:. .: .::... :...::
CCDS45 SVARYHIEVNRVPAGNWVLIEGVDQPIVKTATITEPRGNEEAQIFRPLKFNTTSVIKIAV
500 510 520 530 540 550
510 520 530 540 550 560
pF1KB8 EAKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIP
: ::..:::...::... :: : . .::::::.: :.:::.:. ..::.. .. :
CCDS45 EPVNPSELPKMLDGLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKMYSEID
560 570 580 590 600 610
570 580 590 600 610 620
pF1KB8 IKKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELK
:: .::::.. ::: : :.. :....:::.:.. : :.:. ::::::.. :. . :
CCDS45 IKVADPVVTFCETVVETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLEKGLAEDIENEVVQITWNRK
620 630 640 650 660 670
630 640 650 660 670 680
pF1KB8 QRARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQY----LNEIKDSVVAGFQW
. .... ::.::. ::.:: ::::.::::::.: : . :. .:::.: ::::
CCDS45 KLGEFFQTKYDWDLLAARSIWAFGPDATGPNILVDDTLPSEVDKALLGSVKDSIVQGFQW
680 690 700 710 720 730
690 700 710 720 730 740
pF1KB8 ATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIY
.:.:: ::.: .:.:.: . :... . .::::::::::::: .:.. : : :::::: :
CCDS45 GTREGPLCDELIRNVKFKILDAVVAQEPLHRGGGQIIPTARRVVYSAFLMATPRLMEPYY
740 750 760 770 780 790
750 760 770 780 790 800
pF1KB8 LVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTG
.::.: : . :...: :: :.:::: ... . :.:....::..:. .:::: .:::..:
CCDS45 FVEVQAPADCVSAVYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLRTHTQ
800 810 820 830 840 850
810 820 830 840 850
pF1KB8 GQAFPQCVFDHWQILPGDPFDNSS--RP----------SQVVAETRKRKGLKEGIPALDN
:::: :: ::::.::::.:.: :: . . .::.::::.: . ....
CCDS45 GQAFSLSVFHHWQIVPGDPLDKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDV-SISK
860 870 880 890 900 910
pF1KB8 FLDKL
:.:
CCDS45 FFDDPMLLELAKQDVVLNYPM
920 930
>>CCDS59295.1 EFTUD2 gene_id:9343|Hs108|chr17 (962 aa)
initn: 2101 init1: 637 opt: 1738 Z-score: 2121.5 bits: 403.8 E(32554): 7.6e-112
Smith-Waterman score: 2118; 39.0% identity (69.0% similar) in 872 aa overlap (4-856:114-944)
10 20 30
pF1KB8 MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKS
. .: . .::.. :::... .:. :::.
CCDS59 EDTQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLADLMDNSELIRNVTLCGHLHHGKT
90 100 110 120 130 140
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 TLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQSK
: . . .:: :::: . :::: ... . ..:
CCDS59 HPE---------IRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVGIKSTPVTVV----------LPDTK
150 160 170 180
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 DGAGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKP
: ..:.:..:.::::.::.::::.::..::... .: . :: ..:: ....:. ::.
CCDS59 -GKSYLFNIMDTPGHVNFSDEVTAGLRISDGVVLFIDAAEGVMLNTERLIKHAVQERLAV
190 200 210 220 230 240
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 VLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTVG
.. .::.:: .:::.: : . : ...::..:: .:: :. : :....:.::.:
CCDS59 TVCINKIDRLILELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLISMYSTDE-----NLILSPLLGNVC
250 260 270 280 290
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 FGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGQLGPAERAKKVEDMMKKLWGDRYFDPANGKF
:.:. .. ::: .::..:. : :... : ::. :::: ::.: . ::
CCDS59 FSSSQYSICFTLGSFAKIYADTF-----GDINYQEFAKR-------LWGDIYFNPKTRKF
300 310 320 330 340
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 SKSATSPEGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFKKEETAKLIEKLDIKLDSEDKDKEGK
.:.: . .. :.: ..::.:..:.. ... . ...: :.: .:. . .
CCDS59 TKKAPTSSSQ---RSFVEFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHLTKEELKLNIR
350 360 370 380 390 400
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 PLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIKSCDPKGP
:::. : .... ....: . :.::: .. : . : : : :.. . ....::: ::
CCDS59 PLLRLVCKKFFGEFTGFVDMCVQHIPSPKVGAKPKIEHTYTGGVDSDLGEAMSDCDPDGP
410 420 430 440 450 460
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 LMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGLVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTILM
:: . .:: :.: .:.:::::.:: . .: :...: ::: .:: . . : .
CCDS59 LMCHTTKMYSTDDGVQFHAFGRVLSGTIHAGQPVKVLGENYTLEDEEDSQICTVGRLWIS
470 480 490 500 510 520
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 MGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTF---EHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVE
..:: .. :: :: : . :::: .:::.::: :.:. .: .::... :...:::
CCDS59 VARYHIEVNRVPAGNWVLIEGVDQPIVKTATITEPRGNEEAQIFRPLKFNTTSVIKIAVE
530 540 550 560 570 580
520 530 540 550 560 570
pF1KB8 AKNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPI
::..:::...::... :: : . .::::::.: :.:::.:. ..::.. .. : :
CCDS59 PVNPSELPKMLDGLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKMYSEIDI
590 600 610 620 630 640
580 590 600 610 620 630
pF1KB8 KKSDPVVSYRETVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKQ
: .::::.. ::: : :.. :....:::.:.. : :.:. ::::::.. :. . :.
CCDS59 KVADPVVTFCETVVETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLEKGLAEDIENEVVQITWNRKK
650 660 670 680 690 700
640 650 660 670 680
pF1KB8 RARYLAEKYEWDVAEARKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQY----LNEIKDSVVAGFQWA
.... ::.::. ::.:: ::::.::::::.: : . :. .:::.: ::::.
CCDS59 LGEFFQTKYDWDLLAARSIWAFGPDATGPNILVDDTLPSEVDKALLGSVKDSIVQGFQWG
710 720 730 740 750 760
690 700 710 720 730 740
pF1KB8 TKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHADAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYL
:.:: ::.: .:.:.: . :... . .::::::::::::: .:.. : : :::::: :.
CCDS59 TREGPLCDELIRNVKFKILDAVVAQEPLHRGGGQIIPTARRVVYSAFLMATPRLMEPYYF
770 780 790 800 810 820
750 760 770 780 790 800
pF1KB8 VEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGG
::.: : . :...: :: :.:::: ... . :.:....::..:. .:::: .:::..: :
CCDS59 VEVQAPADCVSAVYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLRTHTQG
830 840 850 860 870 880
810 820 830 840 850
pF1KB8 QAFPQCVFDHWQILPGDPFDNSS--RP----------SQVVAETRKRKGLKEGIPALDNF
::: :: ::::.::::.:.: :: . . .::.::::.: . ....:
CCDS59 QAFSLSVFHHWQIVPGDPLDKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDV-SISKF
890 900 910 920 930 940
pF1KB8 LDKL
.:
CCDS59 FDDPMLLELAKQDVVLNYPM
950 960
>>CCDS11489.1 EFTUD2 gene_id:9343|Hs108|chr17 (972 aa)
initn: 2117 init1: 637 opt: 1738 Z-score: 2121.4 bits: 403.8 E(32554): 7.7e-112
Smith-Waterman score: 2153; 39.2% identity (69.6% similar) in 873 aa overlap (4-856:114-954)
10 20 30
pF1KB8 MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKS
. .: . .::.. :::... .:. :::.
CCDS11 EDTQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLADLMDNSELIRNVTLCGHLHHGKT
90 100 110 120 130 140
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 TLTDSLVCKAGIIASARAGETR-FTDTRKDEQERCITIKSTAISLFYELSENDLNFIKQS
..: :. .. : . .:: :::: . :::: ... . ..
CCDS11 CFVDCLIEQTHPEIRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVGIKSTPVTVV----------LPDT
150 160 170 180 190
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 KDGAGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIK
: : ..:.:..:.::::.::.::::.::..::... .: . :: ..:: ....:. ::.
CCDS11 K-GKSYLFNIMDTPGHVNFSDEVTAGLRISDGVVLFIDAAEGVMLNTERLIKHAVQERLA
200 210 220 230 240 250
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 PVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIISTYGEGESGPMGNIMIDPVLGTV
.. .::.:: .:::.: : . : ...::..:: .:: :. : :....:.::.:
CCDS11 VTVCINKIDRLILELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLISMYSTDE-----NLILSPLLGNV
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CCDS11 CFSSSQYSICFTLGSFAKIYADTF-----GDINYQEFAKR-------LWGDIYFNPKTRK
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:.:.: . .. :.: ..::.:..:.. ... . ...: :.: .:. .
CCDS11 FTKKAPTSSSQ---RSFVEFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHLTKEELKLNI
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CCDS11 RPLLRLVCKKFFGEFTGFVDMCVQHIPSPKVGAKPKIEHTYTGGVDSDLGEAMSDCDPDG
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CCDS11 PLMCHTTKMYSTDDGVQFHAFGRVLSGTIHAGQPVKVLGENYTLEDEEDSQICTVGRLWI
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CCDS11 SVARYHIEVNRVPAGNWVLIEGVDQPIVKTATITEPRGNEEAQIFRPLKFNTTSVIKIAV
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CCDS11 IKVADPVVTFCETVVETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLEKGLAEDIENEVVQITWNRK
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.::.: : . :...: :: :.:::: ... . :.:....::..:. .:::: .:::..:
CCDS11 FVEVQAPADCVSAVYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLRTHTQ
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:.:
CCDS11 FFDDPMLLELAKQDVVLNYPM
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530 540 550 560 570 580
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CCDS42 G-DQAKGKK-P-LFVQLILENIWSLYDAVLKKDKDKIDKIVTSLGLKIGAREARHSDPKV
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590 600 610
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CCDS42 GPMCEEPLMGVCFVLEKWDLSKFEEQGASDLAKEGQEENETCSGGNENQELQDGCSEAFE
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pF1KB8 VEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGG
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CCDS42 CDIMATGDVLGRVYAVLSKREGRVLQEEMKEGTDMFIIKAVLPVAESFGFADEIRKRTSG
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CCDS42 LASPQLVFSHWEIIPSDPFWVPTTEEEYLHFGEKADSENQARKYMNAVRKRKGLYVEEKI
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CCDS42 VEHAEKQRTLSKNK
1110 1120
858 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 16:28:55 2016 done: Sat Nov 5 16:28:55 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]