Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8508
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8508, 866 aa
1>>>pF1KB8508 866 - 866 aa - 866 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.4771+/-0.00123; mu= -2.3263+/- 0.073
mean_var=297.2410+/-60.987, 0's: 0 Z-trim(110.4): 60 B-trim: 120 in 1/50
Lambda= 0.074391
statistics sampled from 11571 (11619) to 11571 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.692), E-opt: 0.2 (0.357), width: 16
Scan time: 4.650
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3787.1 FGA gene_id:2243|Hs108|chr4 ( 866) 5919 649.7 6.3e-186
CCDS47152.1 FGA gene_id:2243|Hs108|chr4 ( 644) 4275 473.2 6.5e-133
CCDS47153.1 FGG gene_id:2266|Hs108|chr4 ( 437) 705 89.9 1e-17
CCDS3788.1 FGG gene_id:2266|Hs108|chr4 ( 453) 705 89.9 1.1e-17
CCDS6004.1 FGL1 gene_id:2267|Hs108|chr8 ( 312) 684 87.6 3.8e-17
CCDS5591.1 FGL2 gene_id:10875|Hs108|chr7 ( 439) 580 76.5 1.1e-13
CCDS6937.1 FIBCD1 gene_id:84929|Hs108|chr9 ( 461) 536 71.8 3.2e-12
CCDS11208.1 MFAP4 gene_id:4239|Hs108|chr17 ( 255) 501 67.9 2.7e-11
CCDS56023.1 MFAP4 gene_id:4239|Hs108|chr17 ( 279) 501 67.9 2.9e-11
>>CCDS3787.1 FGA gene_id:2243|Hs108|chr4 (866 aa)
initn: 5919 init1: 5919 opt: 5919 Z-score: 3451.4 bits: 649.7 E(32554): 6.3e-186
Smith-Waterman score: 5919; 100.0% identity (100.0% similar) in 866 aa overlap (1-866:1-866)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MFSMRIVCLVLSVVGTAWTADSGEGDFLAEGGGVRGPRVVERHQSACKDSDWPFCSDEDW
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CCDS37 MFSMRIVCLVLSVVGTAWTADSGEGDFLAEGGGVRGPRVVERHQSACKDSDWPFCSDEDW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 NYKCPSGCRMKGLIDEVNQDFTNRINKLKNSLFEYQKNNKDSHSLTTNIMEILRGDFSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 NYKCPSGCRMKGLIDEVNQDFTNRINKLKNSLFEYQKNNKDSHSLTTNIMEILRGDFSSA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 NNRDNTYNRVSEDLRSRIEVLKRKVIEKVQHIQLLQKNVRAQLVDMKRLEVDIDIKIRSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 NNRDNTYNRVSEDLRSRIEVLKRKVIEKVQHIQLLQKNVRAQLVDMKRLEVDIDIKIRSC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 RGSCSRALAREVDLKDYEDQQKQLEQVIAKDLLPSRDRQHLPLIKMKPVPDLVPGNFKSQ
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CCDS37 RGSCSRALAREVDLKDYEDQQKQLEQVIAKDLLPSRDRQHLPLIKMKPVPDLVPGNFKSQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LQKVPPEWKALTDMPQMRMELERPGGNEITRGGSTSYGTGSETESPRNPSSAGSWNSGSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 LQKVPPEWKALTDMPQMRMELERPGGNEITRGGSTSYGTGSETESPRNPSSAGSWNSGSS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 GPGSTGNRNPGSSGTGGTATWKPGSSGPGSTGSWNSGSSGTGSTGNQNPGSPRPGSTGTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 GPGSTGNRNPGSSGTGGTATWKPGSSGPGSTGSWNSGSSGTGSTGNQNPGSPRPGSTGTW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 NPGSSERGSAGHWTSESSVSGSTGQWHSESGSFRPDSPGSGNARPNNPDWGTFEEVSGNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 NPGSSERGSAGHWTSESSVSGSTGQWHSESGSFRPDSPGSGNARPNNPDWGTFEEVSGNV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 SPGTRREYHTEKLVTSKGDKELRTGKEKVTSGSTTTTRRSCSKTVTKTVIGPDGHKEVTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SPGTRREYHTEKLVTSKGDKELRTGKEKVTSGSTTTTRRSCSKTVTKTVIGPDGHKEVTK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 EVVTSEDGSDCPEAMDLGTLSGIGTLDGFRHRHPDEAAFFDTASTGKTFPGFFSPMLGEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 EVVTSEDGSDCPEAMDLGTLSGIGTLDGFRHRHPDEAAFFDTASTGKTFPGFFSPMLGEF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 VSETESRGSESGIFTNTKESSSHHPGIAEFPSRGKSSSYSKQFTSSTSYNRGDSTFESKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 VSETESRGSESGIFTNTKESSSHHPGIAEFPSRGKSSSYSKQFTSSTSYNRGDSTFESKS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 YKMADEAGSEADHEGTHSTKRGHAKSRPVRDCDDVLQTHPSGTQSGIFNIKLPGSSKIFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 YKMADEAGSEADHEGTHSTKRGHAKSRPVRDCDDVLQTHPSGTQSGIFNIKLPGSSKIFS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 VYCDQETSLGGWLLIQQRMDGSLNFNRTWQDYKRGFGSLNDEGEGEFWLGNDYLHLLTQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 VYCDQETSLGGWLLIQQRMDGSLNFNRTWQDYKRGFGSLNDEGEGEFWLGNDYLHLLTQR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 GSVLRVELEDWAGNEAYAEYHFRVGSEAEGYALQVSSYEGTAGDALIEGSVEEGAEYTSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 GSVLRVELEDWAGNEAYAEYHFRVGSEAEGYALQVSSYEGTAGDALIEGSVEEGAEYTSH
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 NNMQFSTFDRDADQWEENCAEVYGGGWWYNNCQAANLNGIYYPGGSYDPRNNSPYEIENG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 NNMQFSTFDRDADQWEENCAEVYGGGWWYNNCQAANLNGIYYPGGSYDPRNNSPYEIENG
790 800 810 820 830 840
850 860
pF1KB8 VVWVSFRGADYSLRAVRMKIRPLVTQ
::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 VVWVSFRGADYSLRAVRMKIRPLVTQ
850 860
>>CCDS47152.1 FGA gene_id:2243|Hs108|chr4 (644 aa)
initn: 4269 init1: 4269 opt: 4275 Z-score: 2499.7 bits: 473.2 E(32554): 6.5e-133
Smith-Waterman score: 4275; 98.3% identity (98.6% similar) in 645 aa overlap (1-645:1-641)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MFSMRIVCLVLSVVGTAWTADSGEGDFLAEGGGVRGPRVVERHQSACKDSDWPFCSDEDW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MFSMRIVCLVLSVVGTAWTADSGEGDFLAEGGGVRGPRVVERHQSACKDSDWPFCSDEDW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 NYKCPSGCRMKGLIDEVNQDFTNRINKLKNSLFEYQKNNKDSHSLTTNIMEILRGDFSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NYKCPSGCRMKGLIDEVNQDFTNRINKLKNSLFEYQKNNKDSHSLTTNIMEILRGDFSSA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 NNRDNTYNRVSEDLRSRIEVLKRKVIEKVQHIQLLQKNVRAQLVDMKRLEVDIDIKIRSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NNRDNTYNRVSEDLRSRIEVLKRKVIEKVQHIQLLQKNVRAQLVDMKRLEVDIDIKIRSC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 RGSCSRALAREVDLKDYEDQQKQLEQVIAKDLLPSRDRQHLPLIKMKPVPDLVPGNFKSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RGSCSRALAREVDLKDYEDQQKQLEQVIAKDLLPSRDRQHLPLIKMKPVPDLVPGNFKSQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LQKVPPEWKALTDMPQMRMELERPGGNEITRGGSTSYGTGSETESPRNPSSAGSWNSGSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LQKVPPEWKALTDMPQMRMELERPGGNEITRGGSTSYGTGSETESPRNPSSAGSWNSGSS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 GPGSTGNRNPGSSGTGGTATWKPGSSGPGSTGSWNSGSSGTGSTGNQNPGSPRPGSTGTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GPGSTGNRNPGSSGTGGTATWKPGSSGPGSTGSWNSGSSGTGSTGNQNPGSPRPGSTGTW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 NPGSSERGSAGHWTSESSVSGSTGQWHSESGSFRPDSPGSGNARPNNPDWGTFEEVSGNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NPGSSERGSAGHWTSESSVSGSTGQWHSESGSFRPDSPGSGNARPNNPDWGTFEEVSGNV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 SPGTRREYHTEKLVTSKGDKELRTGKEKVTSGSTTTTRRSCSKTVTKTVIGPDGHKEVTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SPGTRREYHTEKLVTSKGDKELRTGKEKVTSGSTTTTRRSCSKTVTKTVIGPDGHKEVTK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 EVVTSEDGSDCPEAMDLGTLSGIGTLDGFRHRHPDEAAFFDTASTGKTFPGFFSPMLGEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EVVTSEDGSDCPEAMDLGTLSGIGTLDGFRHRHPDEAAFFDTASTGKTFPGFFSPMLGEF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 VSETESRGSESGIFTNTKESSSHHPGIAEFPSRGKSSSYSKQFTSSTSYNRGDSTFESKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VSETESRGSESGIFTNTKESSSHHPGIAEFPSRGKSSSYSKQFTSSTSYNRGDSTFESKS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 YKMADEAGSEADHEGTHSTKRGHAKSRPVRDCDDVLQTHPSGTQSGIFNIKLPGSSKIFS
:::::::::::::::::::::::::::::: ..: : : :
CCDS47 YKMADEAGSEADHEGTHSTKRGHAKSRPVRG----IHTSPLGKPSLSP
610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 VYCDQETSLGGWLLIQQRMDGSLNFNRTWQDYKRGFGSLNDEGEGEFWLGNDYLHLLTQR
>>CCDS47153.1 FGG gene_id:2266|Hs108|chr4 (437 aa)
initn: 697 init1: 266 opt: 705 Z-score: 431.4 bits: 89.9 E(32554): 1e-17
Smith-Waterman score: 705; 42.6% identity (71.9% similar) in 242 aa overlap (630-863:177-415)
600 610 620 630 640 650
pF1KB8 SYKMADEAGSEADHEGTHSTKRGHAKSRPVRDCDDVLQTHPSGTQSGIFNIKLPGSSKIF
.::.:. .. .. :::.. :: ... :
CCDS47 IVNLKEKVAQLEAQCQEPCKDTVQIHDITGKDCQDI--ANKGAKQSGLYFIKPLKANQQF
150 160 170 180 190 200
660 670 680 690 700 710
pF1KB8 SVYCDQETSLGGWLLIQQRMDGSLNFNRTWQDYKRGFGSLNDEGEGEFWLGNDYLHLLTQ
:::. . : .:: ..:.:.:::..:...: .::.::: :. : ::::::. .::..
CCDS47 LVYCEIDGSGNGWTVFQKRLDGSVDFKKNWIQYKEGFGHLSPTGTTEFWLGNEKIHLIST
210 220 230 240 250 260
720 730 740 750 760 770
pF1KB8 RGSV---LRVELEDWAGNEAYAEY-HFRVGSEAEGYALQVSSYEG-TAGDALIE---GSV
.... :::::::: : . :.: :.:: ::. : : . . : ::::. :.
CCDS47 QSAIPYALRVELEDWNGRTSTADYAMFKVGPEADKYRLTYAYFAGGDAGDAFDGFDFGDD
270 280 290 300 310 320
780 790 800 810 820 830
pF1KB8 EEGAEYTSHNNMQFSTFDRDADQWEENCAEVYGGGWWYNNCQAANLNGIYYPGGSYDPRN
.::::.:::::.: : :..: :::: :.:::.:.:.:..:::.:: ::.:. .
CCDS47 PSDKFFTSHNGMQFSTWDNDNDKFEGNCAEQDGSGWWMNKCHAGHLNGVYYQGGTYS-KA
330 340 350 360 370 380
840 850 860
pF1KB8 NSPYEIENGVVWVSFRGADYSLRAVRMKIRPLVTQ
..: .::..:.... ::.. . ::: :.
CCDS47 STPNGYDNGIIWATWKTRWYSMKKTTMKIIPFNRLTIGEGQQHHLGGAKQAGDV
390 400 410 420 430
>>CCDS3788.1 FGG gene_id:2266|Hs108|chr4 (453 aa)
initn: 697 init1: 266 opt: 705 Z-score: 431.1 bits: 89.9 E(32554): 1.1e-17
Smith-Waterman score: 705; 42.6% identity (71.9% similar) in 242 aa overlap (630-863:177-415)
600 610 620 630 640 650
pF1KB8 SYKMADEAGSEADHEGTHSTKRGHAKSRPVRDCDDVLQTHPSGTQSGIFNIKLPGSSKIF
.::.:. .. .. :::.. :: ... :
CCDS37 IVNLKEKVAQLEAQCQEPCKDTVQIHDITGKDCQDI--ANKGAKQSGLYFIKPLKANQQF
150 160 170 180 190 200
660 670 680 690 700 710
pF1KB8 SVYCDQETSLGGWLLIQQRMDGSLNFNRTWQDYKRGFGSLNDEGEGEFWLGNDYLHLLTQ
:::. . : .:: ..:.:.:::..:...: .::.::: :. : ::::::. .::..
CCDS37 LVYCEIDGSGNGWTVFQKRLDGSVDFKKNWIQYKEGFGHLSPTGTTEFWLGNEKIHLIST
210 220 230 240 250 260
720 730 740 750 760 770
pF1KB8 RGSV---LRVELEDWAGNEAYAEY-HFRVGSEAEGYALQVSSYEG-TAGDALIE---GSV
.... :::::::: : . :.: :.:: ::. : : . . : ::::. :.
CCDS37 QSAIPYALRVELEDWNGRTSTADYAMFKVGPEADKYRLTYAYFAGGDAGDAFDGFDFGDD
270 280 290 300 310 320
780 790 800 810 820 830
pF1KB8 EEGAEYTSHNNMQFSTFDRDADQWEENCAEVYGGGWWYNNCQAANLNGIYYPGGSYDPRN
.::::.:::::.: : :..: :::: :.:::.:.:.:..:::.:: ::.:. .
CCDS37 PSDKFFTSHNGMQFSTWDNDNDKFEGNCAEQDGSGWWMNKCHAGHLNGVYYQGGTYS-KA
330 340 350 360 370 380
840 850 860
pF1KB8 NSPYEIENGVVWVSFRGADYSLRAVRMKIRPLVTQ
..: .::..:.... ::.. . ::: :.
CCDS37 STPNGYDNGIIWATWKTRWYSMKKTTMKIIPFNRLTIGEGQQHHLGGAKQVRPEHPAETE
390 400 410 420 430 440
CCDS37 YDSLYPEDDL
450
>>CCDS6004.1 FGL1 gene_id:2267|Hs108|chr8 (312 aa)
initn: 630 init1: 297 opt: 684 Z-score: 421.2 bits: 87.6 E(32554): 3.8e-17
Smith-Waterman score: 685; 44.1% identity (70.1% similar) in 254 aa overlap (614-862:65-304)
590 600 610 620 630 640
pF1KB8 TSSTSYNRGDSTFESKSYKMADEAGSEADHEGTHSTKRGHAKSRPVRDCDDVLQTHPSGT
.: ..: ...: ::..... .:
CCDS60 AQVRLLETRVKQQQVKIKQLLQENEVQFLDKGDENTVIDLGSKRQYADCSEIFN---DGY
40 50 60 70 80 90
650 660 670 680 690 700
pF1KB8 Q-SGIFNIKLPGSSKIFSVYCDQETSLGGWLLIQQRMDGSLNFNRTWQDYKRGFGSLNDE
. ::...:: : ::::::. .. ::: .::.: ::: :::: :.::. :::.. ..
CCDS60 KLSGFYKIKPLQSPAEFSVYCDM-SDGGGWTVIQRRSDGSENFNRGWKDYENGFGNFVQK
100 110 120 130 140 150
710 720 730 740 750 760
pF1KB8 GEGEFWLGNDYLHLLT-QRGSVLRVELEDWAGNEAYAEY-HFRVGSEAEGYALQVSSYEG
.::.:::: ::.:: :. .:...: :. : ::.: .:.::.: . : :... : :
CCDS60 -HGEYWLGNKNLHFLTTQEDYTLKIDLADFEKNSRYAQYKNFKVGDEKNFYELNIGEYSG
160 170 180 190 200
770 780 790 800 810 820
pF1KB8 TAGDALIEGSVEEGAEYTSHNNMQFSTFDRDADQWEENCAEVYGGGWWYNNCQAANLNGI
::::.: . : ..::. :.:::.::: :..: :::: .:::.: :..:::::.
CCDS60 TAGDSLAGNFHPEVQWWASHQRMKFSTWDRDHDNYEGNCAEEDQSGWWFNRCHSANLNGV
210 220 230 240 250 260
830 840 850 860
pF1KB8 YYPGGSYDPRNNSPY--EIENGVVWVSFRGADYSLRAVRMKIRPLVTQ
:: : :: . .::.:: ...: :::..: :::::
CCDS60 YYSG---------PYTAKTDNGIVWYTWHGWWYSLKSVVMKIRPNDFIPNVI
270 280 290 300 310
>>CCDS5591.1 FGL2 gene_id:10875|Hs108|chr7 (439 aa)
initn: 461 init1: 217 opt: 580 Z-score: 358.8 bits: 76.5 E(32554): 1.1e-13
Smith-Waterman score: 580; 39.0% identity (62.5% similar) in 259 aa overlap (612-862:188-434)
590 600 610 620 630
pF1KB8 QFTSSTSYNRGDSTFESKSYKMADEAGSEADHEGTHSTKRGHAKSRPV-----RDCDDVL
: . .. .. . .:::: .::.:
CCDS55 LEKLNLVNMNNIENYVDSKVANLTFVVNSLDGKCSKCPSQEQIQSRPVQHLIYKDCSDYY
160 170 180 190 200 210
640 650 660 670 680 690
pF1KB8 QTHPSGTQSGIFNIKLPGSSKIFSVYCDQETSLGGWLLIQQRMDGSLNFNRTWQDYKRGF
.... . . ... : ::::.:: ::: ..: :.::: ::.::::::: ::
CCDS55 AIGKRSSET--YRVTPDPKNSSFEVYCDMETMGGGWTVLQARLDGSTNFTRTWQDYKAGF
220 230 240 250 260 270
700 710 720 730 740 750
pF1KB8 GSLNDEGEGEFWLGNDYLHLLTQ-RGSVLRVELEDWAGNEAYAEY-HFRVGSEAEGYALQ
:.: . ::::::: .::::. . .::..:::. : : :: : .: :..: : :.
CCDS55 GNL----RREFWLGNDKIHLLTKSKEMILRIDLEDFNGVELYALYDQFYVANEFLKYRLH
280 290 300 310 320 330
760 770 780 790 800 810
pF1KB8 VSSYEGTAGDALIEGSVEEGAEYTSHNNMQFSTFDRDADQWEE-NCAEVYGGGWWYNNCQ
:..:.::::::: . .. .:. :.: :.: :.. ::. :..:::.. :
CCDS55 VGNYNGTAGDAL------RFNKHYNHDLKFFTTPDKDNDRYPSGNCGLYYSSGWWFDACL
340 350 360 370 380
820 830 840 850 860
pF1KB8 AANLNGIYYPGGSYDPRNNSPYEIENGVVWVSFRGADYSLRAVRMKIRPLVTQ
.::::: :: ::. . :: . : :.. ..: :::
CCDS55 SANLNGKYYHQKYRGVRNGIFWGTWPGVSEAHPGGYKSSFKEAKMMIRPKHFKP
390 400 410 420 430
>>CCDS6937.1 FIBCD1 gene_id:84929|Hs108|chr9 (461 aa)
initn: 585 init1: 172 opt: 536 Z-score: 333.0 bits: 71.8 E(32554): 3.2e-12
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600 610 620 630 640
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:: : ::: ::: ::: :: :. :..
CCDS69 ILDALQRDRGLGRPRNKADLQRAPARGTRPRGCATGSRP-RDCLDVLL---SGQQDDGVY
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CCDS69 SVFPTHYPAGFQVYCDMRTDGGGWTVFQRREDGSVNFFRGWDAYRDGFGRLT----GEHW
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CCDS69 LGLKRIHALTTQAAYELHVDLEDFENGTAYARYGSFGVGLFSVDPEEDGYPLTVADYSGT
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:::.:.. :..:.:.: :::.:. :.::: : :.::: ::...:::: :
CCDS69 AGDSLLK-----------HSGMRFTTKDRDSDHSENNCAAFYRGAWWYRNCHTSNLNGQY
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:. .. : .:: : :. : .:::. .:::::.
CCDS69 LRGA------HASY--ADGVEWSSWTGWQYSLKFSEMKIRPVREDR
430 440 450 460
>>CCDS11208.1 MFAP4 gene_id:4239|Hs108|chr17 (255 aa)
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Smith-Waterman score: 548; 40.4% identity (63.9% similar) in 255 aa overlap (621-861:26-253)
600 610 620 630 640
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:: : : :. ::::. . .: ::
CCDS11 MKALLALPLLLLLSTPPCAPQVSGIRGDALERFCLQQPL-DCDDI---YAQGYQS
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pF1KB8 -GIFNIKLPGSSKIFSVYCDQETSLGGWLLIQQRMDGSLNFNRTWQDYKRGFGSLNDEGE
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CCDS11 DGVYLIYPSGPSVPVPVFCDMTTEGGKWTVFQKRFNGSVSFFRGWNDYKLGFG----RAD
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pF1KB8 GEFWLGNDYLHLLTQRGSV-LRVELEDWAGNEAYAEY-HFR-----VGSEAEGYALQVSS
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CCDS11 GEYWLGLQNMHLLTLKQKYELRVDLEDFENNTAYAKYADFSISPNAVSAEEDGYTLFVAG
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pF1KB8 YE-GTAGDALIEGSVEEGAEYTSHNNMQFSTFDRDADQWEENCAEVYGGGWWYNNCQAAN
.: : :::.: . :....::::::: : . .::: . .:..:. .:. ::
CCDS11 FEDGGAGDSL-----------SYHSGQKFSTFDRDQDLFVQNCAALSSGAFWFRSCHFAN
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pF1KB8 LNGIYYPGGSYDPRNNSPYEIENGVVWVSFRGADYSLRAVRMKIRPLVTQ
::: .: :::. ::. :....: :::. ..::::
CCDS11 LNG-FYLGGSH-------LSYANGINWAQWKGFYYSLKRTEMKIRRA
220 230 240 250
>>CCDS56023.1 MFAP4 gene_id:4239|Hs108|chr17 (279 aa)
initn: 524 init1: 178 opt: 501 Z-score: 315.8 bits: 67.9 E(32554): 2.9e-11
Smith-Waterman score: 548; 40.4% identity (63.9% similar) in 255 aa overlap (621-861:50-277)
600 610 620 630 640
pF1KB8 RGDSTFESKSYKMADEAGSEADHEGTHSTKRGHAKSR-----PVRDCDDVLQTHPSGTQS
:: : : :. ::::. . .: ::
CCDS56 QGVLLKLALLALPLLLLLSTPPCAPQVSGIRGDALERFCLQQPL-DCDDI---YAQGYQS
20 30 40 50 60 70
650 660 670 680 690 700
pF1KB8 -GIFNIKLPGSSKIFSVYCDQETSLGGWLLIQQRMDGSLNFNRTWQDYKRGFGSLNDEGE
:.. : : : :.::. : : : ..:.:..::..: : :.::: ::: ...
CCDS56 DGVYLIYPSGPSVPVPVFCDMTTEGGKWTVFQKRFNGSVSFFRGWNDYKLGFG----RAD
80 90 100 110 120 130
710 720 730 740 750
pF1KB8 GEFWLGNDYLHLLTQRGSV-LRVELEDWAGNEAYAEY-HFR-----VGSEAEGYALQVSS
::.::: . .:::: . . :::.:::. .: :::.: : :..: .::.: :..
CCDS56 GEYWLGLQNMHLLTLKQKYELRVDLEDFENNTAYAKYADFSISPNAVSAEEDGYTLFVAG
140 150 160 170 180 190
760 770 780 790 800 810
pF1KB8 YE-GTAGDALIEGSVEEGAEYTSHNNMQFSTFDRDADQWEENCAEVYGGGWWYNNCQAAN
.: : :::.: . :....::::::: : . .::: . .:..:. .:. ::
CCDS56 FEDGGAGDSL-----------SYHSGQKFSTFDRDQDLFVQNCAALSSGAFWFRSCHFAN
200 210 220 230 240
820 830 840 850 860
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CCDS56 LNG-FYLGGSH-------LSYANGINWAQWKGFYYSLKRTEMKIRRA
250 260 270
866 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]