FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8522, 879 aa
1>>>pF1KB8522 879 - 879 aa - 879 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3003+/-0.00129; mu= 21.0898+/- 0.077
mean_var=72.8889+/-14.443, 0's: 0 Z-trim(101.0): 51 B-trim: 102 in 2/47
Lambda= 0.150225
statistics sampled from 6380 (6424) to 6380 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.532), E-opt: 0.2 (0.192), width: 16
Scan time: 1.730
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS5600.1 GRM3 gene_id:2913|Hs109|chr7 ( 879) 5921 1293.7 0
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CCDS87515.1 GRM3 gene_id:2913|Hs109|chr7 ( 537) 2897 638.1 1.3e-182
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CCDS47696.1 GRM8 gene_id:2918|Hs109|chr7 ( 908) 2550 563.1 8.3e-160
CCDS4787.1 GRM4 gene_id:2914|Hs109|chr6 ( 912) 2499 552.0 1.8e-156
CCDS43042.1 GRM7 gene_id:2917|Hs109|chr3 ( 915) 2494 550.9 3.8e-156
CCDS8283.1 GRM5 gene_id:2915|Hs109|chr11 (1180) 2352 520.2 8.5e-147
CCDS44694.1 GRM5 gene_id:2915|Hs109|chr11 (1212) 2352 520.3 8.7e-147
CCDS47497.1 GRM1 gene_id:2911|Hs109|chr6 ( 906) 2277 503.9 5.4e-142
CCDS64548.1 GRM1 gene_id:2911|Hs109|chr6 ( 908) 2277 503.9 5.4e-142
CCDS5209.1 GRM1 gene_id:2911|Hs109|chr6 (1194) 2277 504.0 6.7e-142
CCDS4442.1 GRM6 gene_id:2916|Hs109|chr5 ( 877) 2174 481.6 2.8e-135
CCDS59011.1 GRM4 gene_id:2914|Hs109|chr6 ( 743) 2031 450.5 5.2e-126
CCDS59010.1 GRM4 gene_id:2914|Hs109|chr6 ( 779) 2031 450.6 5.4e-126
CCDS59012.1 GRM4 gene_id:2914|Hs109|chr6 ( 796) 1371 307.5 6.3e-83
CCDS75432.1 GRM4 gene_id:2914|Hs109|chr6 ( 865) 1371 307.5 6.7e-83
CCDS30556.1 TAS1R3 gene_id:83756|Hs109|chr1 ( 852) 839 192.2 3.4e-48
CCDS187.1 TAS1R2 gene_id:80834|Hs109|chr1 ( 839) 801 184.0 1e-45
CCDS3010.1 CASR gene_id:846|Hs109|chr3 (1078) 724 167.4 1.3e-40
CCDS54632.1 CASR gene_id:846|Hs109|chr3 (1088) 695 161.1 1e-38
CCDS81.1 TAS1R1 gene_id:80835|Hs109|chr1 ( 841) 606 141.7 5.3e-33
CCDS5112.1 GPRC6A gene_id:222545|Hs109|chr6 ( 926) 558 131.4 7.8e-30
CCDS69184.1 GPRC6A gene_id:222545|Hs109|chr6 ( 855) 540 127.4 1.1e-28
CCDS69185.1 GPRC6A gene_id:222545|Hs109|chr6 ( 751) 453 108.5 4.7e-23
>>CCDS5600.1 GRM3 gene_id:2913|Hs109|chr7 (879 aa)
initn: 5921 init1: 5921 opt: 5921 Z-score: 6931.4 bits: 1293.7 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 5921; 100.0% identity (100.0% similar) in 879 aa overlap (1-879:1-879)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MKMLTRLQVLTLALFSKGFLLSLGDHNFLRREIKIEGDLVLGGLFPINEKGTGTEECGRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MKMLTRLQVLTLALFSKGFLLSLGDHNFLRREIKIEGDLVLGGLFPINEKGTGTEECGRI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 NEDRGIQRLEAMLFAIDEINKDDYLLPGVKLGVHILDTCSRDTYALEQSLEFVRASLTKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 NEDRGIQRLEAMLFAIDEINKDDYLLPGVKLGVHILDTCSRDTYALEQSLEFVRASLTKV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 DEAEYMCPDGSYAIQENIPLLIAGVIGGSYSSVSIQVANLLRLFQIPQISYASTSAKLSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DEAEYMCPDGSYAIQENIPLLIAGVIGGSYSSVSIQVANLLRLFQIPQISYASTSAKLSD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 KSRYDYFARTVPPDFYQAKAMAEILRFFNWTYVSTVASEGDYGETGIEAFEQEARLRNIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KSRYDYFARTVPPDFYQAKAMAEILRFFNWTYVSTVASEGDYGETGIEAFEQEARLRNIC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 IATAEKVGRSNIRKSYDSVIRELLQKPNARVVVLFMRSDDSRELIAAASRANASFTWVAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 IATAEKVGRSNIRKSYDSVIRELLQKPNARVVVLFMRSDDSRELIAAASRANASFTWVAS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 DGWGAQESIIKGSEHVAYGAITLELASQPVRQFDRYFQSLNPYNNHRNPWFRDFWEQKFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DGWGAQESIIKGSEHVAYGAITLELASQPVRQFDRYFQSLNPYNNHRNPWFRDFWEQKFQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 CSLQNKRNHRRVCDKHLAIDSSNYEQESKIMFVVNAVYAMAHALHKMQRTLCPNTTKLCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 CSLQNKRNHRRVCDKHLAIDSSNYEQESKIMFVVNAVYAMAHALHKMQRTLCPNTTKLCD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 AMKILDGKKLYKDYLLKINFTAPFNPNKDADSIVKFDTFGDGMGRYNVFNFQNVGGKYSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 AMKILDGKKLYKDYLLKINFTAPFNPNKDADSIVKFDTFGDGMGRYNVFNFQNVGGKYSY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 LKVGHWAETLSLDVNSIHWSRNSVPTSQCSDPCAPNEMKNMQPGDVCCWICIPCEPYEYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LKVGHWAETLSLDVNSIHWSRNSVPTSQCSDPCAPNEMKNMQPGDVCCWICIPCEPYEYL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 ADEFTCMDCGSGQWPTADLTGCYDLPEDYIRWEDAWAIGPVTIACLGFMCTCMVVTVFIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ADEFTCMDCGSGQWPTADLTGCYDLPEDYIRWEDAWAIGPVTIACLGFMCTCMVVTVFIK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 HNNTPLVKASGRELCYILLFGVGLSYCMTFFFIAKPSPVICALRRLGLGSSFAICYSALL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 HNNTPLVKASGRELCYILLFGVGLSYCMTFFFIAKPSPVICALRRLGLGSSFAICYSALL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 TKTNCIARIFDGVKNGAQRPKFISPSSQVFICLGLILVQIVMVSVWLILEAPGTRRYTLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 TKTNCIARIFDGVKNGAQRPKFISPSSQVFICLGLILVQIVMVSVWLILEAPGTRRYTLA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 EKRETVILKCNVKDSSMLISLTYDVILVILCTVYAFKTRKCPENFNEAKFIGFTMYTTCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 EKRETVILKCNVKDSSMLISLTYDVILVILCTVYAFKTRKCPENFNEAKFIGFTMYTTCI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 IWLAFLPIFYVTSSDYRVQTTTMCISVSLSGFVVLGCLFAPKVHIILFQPQKNVVTHRLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 IWLAFLPIFYVTSSDYRVQTTTMCISVSLSGFVVLGCLFAPKVHIILFQPQKNVVTHRLH
790 800 810 820 830 840
850 860 870
pF1KB8 LNRFSVSGTGTTYSQSSASTYVPTVCNGREVLDSTTSSL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LNRFSVSGTGTTYSQSSASTYVPTVCNGREVLDSTTSSL
850 860 870
>>CCDS2834.1 GRM2 gene_id:2912|Hs109|chr3 (872 aa)
initn: 3844 init1: 1795 opt: 4116 Z-score: 4817.2 bits: 902.5 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 4116; 68.7% identity (87.9% similar) in 857 aa overlap (30-879:23-872)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MKMLTRLQVLTLALFSKGFLLSLGDHNFLRREIKIEGDLVLGGLFPINEKGTGTEECGRI
.. . .:::::::::::...:: .:.:: .
CCDS28 MGSLLALLALLLLWGAVAEGPAKKVLTLEGDLVLGGLFPVHQKGGPAEDCGPV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB8 NEDRGIQRLEAMLFAIDEINKDDYLLPGVKLGVHILDTCSRDTYALEQSLEFVRASLTK-
:: ::::::::::::.:.::.: .:::::.::.::::.::.::.::::.:.::::::..
CCDS28 NEHRGIQRLEAMLFALDRINRDPHLLPGVRLGAHILDSCSKDTHALEQALDFVRASLSRG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 VDEAEYMCPDGSYAIQENIPLLIAGVIGGSYSSVSIQVANLLRLFQIPQISYASTSAKLS
.: ....::::::: . . : :.::::::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 ADGSRHICPDGSYATHGDAPTAITGVIGGSYSDVSIQVANLLRLFQIPQISYASTSAKLS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 DKSRYDYFARTVPPDFYQAKAMAEILRFFNWTYVSTVASEGDYGETGIEAFEQEARLRNI
::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::: :::
CCDS28 DKSRYDYFARTVPPDFFQAKAMAEILRFFNWTYVSTVASEGDYGETGIEAFELEARARNI
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 CIATAEKVGRSNIRKSYDSVIRELLQKPNARVVVLFMRSDDSRELIAAASRANASFTWVA
:.::.:::::. : ....:.: :::::.:::.::: ::.:.:::.::..: ::::::::
CCDS28 CVATSEKVGRAMSRAAFEGVVRALLQKPSARVAVLFTRSEDARELLAASQRLNASFTWVA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 SDGWGAQESIIKGSEHVAYGAITLELASQPVRQFDRYFQSLNPYNNHRNPWFRDFWEQKF
:::::: ::.. ::: .: ::::.:::: :. .: :::::.:.:: ::::::.::::.:
CCDS28 SDGWGALESVVAGSEGAAEGAITIELASYPISDFASYFQSLDPWNNSRNPWFREFWEQRF
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 QCSLQNKRNHRRVCDKHLAIDSSNYEQESKIMFVVNAVYAMAHALHKMQRTLCPNTTKLC
.::.. .: : : .. . .:::::::::::::::::::::.:.:.::::::.::
CCDS28 RCSFR-----QRDCAAH-SLRAVPFEQESKIMFVVNAVYAMAHALHNMHRALCPNTTRLC
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 DAMKILDGKKLYKDYLLKINFTAPFNPNKDADSIVKFDTFGDGMGRYNVFNFQNVG-GKY
:::. ..:..::::..:...: ::: : :. . :.:: ::::.::::.:.. .: :.:
CCDS28 DAMRPVNGRRLYKDFVLNVKFDAPFRPA-DTHNEVRFDRFGDGIGRYNIFTYLRAGSGRY
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 SYLKVGHWAETLSLDVNSIHWSRNS---VPTSQCSDPCAPNEMKNMQPGDVCCWICIPCE
: :::.::: :.::.. : :. : .:.:.::.:: ::.:..:::.::::.::::.
CCDS28 RYQKVGYWAEGLTLDTSLIPWASPSAGPLPASRCSEPCLQNEVKSVQPGEVCCWLCIPCQ
470 480 490 500 510 520
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pF1KB8 PYEYLADEFTCMDCGSGQWPTADLTGCYDLPEDYIRWEDAWAIGPVTIACLGFMCTCMVV
:::: ::::: ::: : ::.:.::::..::..:::: ::::.::::::::: . : .:.
CCDS28 PYEYRLDEFTCADCGLGYWPNASLTGCFELPQEYIRWGDAWAVGPVTIACLGALATLFVL
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KB8 TVFIKHNNTPLVKASGRELCYILLFGVGLSYCMTFFFIAKPSPVICALRRLGLGSSFAIC
::..:: ::.::::::::::::: :: : :::::.:::::: ..:.:::::::..:..:
CCDS28 GVFVRHNATPVVKASGRELCYILLGGVFLCYCMTFIFIAKPSTAVCTLRRLGLGTAFSVC
590 600 610 620 630 640
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pF1KB8 YSALLTKTNCIARIFDGVKNGAQRPKFISPSSQVFICLGLILVQIVMVSVWLILEAPGTR
::::::::: ::::: :...:::::.::::.::: :::.:: :...: .::..:::::
CCDS28 YSALLTKTNRIARIFGGAREGAQRPRFISPASQVAICLALISGQLLIVVAWLVVEAPGTG
650 660 670 680 690 700
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pF1KB8 RYTLAEKRETVILKCNVKDSSMLISLTYDVILVILCTVYAFKTRKCPENFNEAKFIGFTM
. : :.::.: :.:: .:.::: ::.:.:.:. :::.::::::::::::::::::::::
CCDS28 KETAPERREVVTLRCNHRDASMLGSLAYNVLLIALCTLYAFKTRKCPENFNEAKFIGFTM
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pF1KB8 YTTCIIWLAFLPIFYVTSSDYRVQTTTMCISVSLSGFVVLGCLFAPKVHIILFQPQKNVV
:::::::::::::::::::::::::::::.:::::: ::::::::::.::::::::::::
CCDS28 YTTCIIWLAFLPIFYVTSSDYRVQTTTMCVSVSLSGSVVLGCLFAPKLHIILFQPQKNVV
770 780 790 800 810 820
840 850 860 870
pF1KB8 THRLHLNRFSVSGT--GTTYSQSSASTYVPTVCNGREVLDSTTSSL
.:: .::. ... ... .:.:.: .::::::::::.:::::::
CCDS28 SHRAPTSRFGSAAARASSSLGQGSGSQFVPTVCNGREVVDSTTSSL
830 840 850 860 870
>>CCDS87515.1 GRM3 gene_id:2913|Hs109|chr7 (537 aa)
initn: 2897 init1: 2897 opt: 2897 Z-score: 3392.4 bits: 638.1 E(33420): 1.3e-182
Smith-Waterman score: 2897; 100.0% identity (100.0% similar) in 441 aa overlap (1-441:1-441)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MKMLTRLQVLTLALFSKGFLLSLGDHNFLRREIKIEGDLVLGGLFPINEKGTGTEECGRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 MKMLTRLQVLTLALFSKGFLLSLGDHNFLRREIKIEGDLVLGGLFPINEKGTGTEECGRI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 NEDRGIQRLEAMLFAIDEINKDDYLLPGVKLGVHILDTCSRDTYALEQSLEFVRASLTKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 NEDRGIQRLEAMLFAIDEINKDDYLLPGVKLGVHILDTCSRDTYALEQSLEFVRASLTKV
70 80 90 100 110 120
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pF1KB8 DEAEYMCPDGSYAIQENIPLLIAGVIGGSYSSVSIQVANLLRLFQIPQISYASTSAKLSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 DEAEYMCPDGSYAIQENIPLLIAGVIGGSYSSVSIQVANLLRLFQIPQISYASTSAKLSD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 KSRYDYFARTVPPDFYQAKAMAEILRFFNWTYVSTVASEGDYGETGIEAFEQEARLRNIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 KSRYDYFARTVPPDFYQAKAMAEILRFFNWTYVSTVASEGDYGETGIEAFEQEARLRNIC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 IATAEKVGRSNIRKSYDSVIRELLQKPNARVVVLFMRSDDSRELIAAASRANASFTWVAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 IATAEKVGRSNIRKSYDSVIRELLQKPNARVVVLFMRSDDSRELIAAASRANASFTWVAS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 DGWGAQESIIKGSEHVAYGAITLELASQPVRQFDRYFQSLNPYNNHRNPWFRDFWEQKFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 DGWGAQESIIKGSEHVAYGAITLELASQPVRQFDRYFQSLNPYNNHRNPWFRDFWEQKFQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 CSLQNKRNHRRVCDKHLAIDSSNYEQESKIMFVVNAVYAMAHALHKMQRTLCPNTTKLCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS87 CSLQNKRNHRRVCDKHLAIDSSNYEQESKIMFVVNAVYAMAHALHKMQRTLCPNTTKLCD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 AMKILDGKKLYKDYLLKINFTAPFNPNKDADSIVKFDTFGDGMGRYNVFNFQNVGGKYSY
:::::::::::::::::::::
CCDS87 AMKILDGKKLYKDYLLKINFTGADDNHVHLCQPEWLCGLGLFVCTQGSHHPVSTPEECCH
430 440 450 460 470 480
>>CCDS5794.1 GRM8 gene_id:2918|Hs109|chr7 (908 aa)
initn: 1535 init1: 681 opt: 2550 Z-score: 2982.7 bits: 563.1 E(33420): 8.3e-160
Smith-Waterman score: 2550; 47.6% identity (75.0% similar) in 821 aa overlap (33-834:40-849)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MLTRLQVLTLALFSKGFLLSLGDHNFLRREIKIEGDLVLGGLFPINEKGTGTEECGRINE
:...::..::::::.. :: ::....
CCDS57 SCPCFFLLTAKFYWILTMMQRTHSQEYAHSIRVDGDIILGGLFPVHAKGERGVPCGELKK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 DRGIQRLEAMLFAIDEINKDDYLLPGVKLGVHILDTCSRDTYALEQSLEFVRASLTKVDE
..::.::::::.:::.:::: :: .. :::.:::::::::::::::: ::.: . : :
CCDS57 EKGIHRLEAMLYAIDQINKDPDLLSNITLGVRILDTCSRDTYALEQSLTFVQALIEK-DA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 AEYMCPDGSYAIQENIPLLIAGVIGGSYSSVSIQVANLLRLFQIPQISYASTSAKLSDKS
.. : .:. : . : :.::::.. :::::.:::.::::.:::::::::. .:::..
CCDS57 SDVKCANGDPPIFTK-PDKISGVIGAAASSVSIMVANILRLFKIPQISYASTAPELSDNT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 RYDYFARTVPPDFYQAKAMAEILRFFNWTYVSTVASEGDYGETGIEAFEQEAR-LRNICI
:::.:.:.:::: :::.::..:. ..:.::::.::::.:::.:.::: : .: . ..::
CCDS57 RYDFFSRVVPPDSYQAQAMVDIVTALGWNYVSTLASEGNYGESGVEAFTQISREIGGVCI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB8 ATAEKVGRSNIRKSYDSVIRELLQKPNARVVVLFMRSDDSRELIAAASRANAS--FTWVA
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CCDS57 AQSQKIPREPRPGEFEKIIKRLLETPNARAVIMFANEDDIRRILEAAKKLNQSGHFLWIG
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CCDS47 TNTRNPWFPEFWQHRFQCRLPGHLLENPNFKRICTGNESLEE-NYVQDSKMGFVINAIYA
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CCDS47 GDAPGRYDIMNLQYTEANRYDYVHVGTWHEGVLNIDDYKIQMNKSGVVRSVCSEPCLKGQ
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CCDS47 IKVIRKGEVSCCWICTACKENEYVQDEFTCKACDLGWWPNADLTGCEPIPVRYLEWSNIE
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CCDS47 TTTSCYLQRLLVGLSSAMCYSALVTKTNRIARILAGSKKKICTRKPRFMSAWAQVIIASI
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CCDS47 AFKTRNVPANFNEAKYIAFTMYTTCIIWLAFVPIYF--GSNYKIITT--CFAVSLSVTVA
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CCDS47 LGCMFTPKMYIIIAKPERNVRSAFTTSDVVRMHVGDGKLPCRSNTFLNIFRRKKAGAGNA
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879 residues in 1 query sequences
18921897 residues in 33420 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]