FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8564, 911 aa
1>>>pF1KB8564 911 - 911 aa - 911 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.7812+/-0.000448; mu= -13.9891+/- 0.028
mean_var=422.0366+/-81.255, 0's: 0 Z-trim(122.2): 137 B-trim: 0 in 0/61
Lambda= 0.062431
statistics sampled from 39771 (39920) to 39771 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.767), E-opt: 0.2 (0.468), width: 16
Scan time: 15.740
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_068767 (OMIM: 600347) brevican core protein iso ( 911) 6320 584.2 9.5e-166
XP_011508168 (OMIM: 600347) PREDICTED: brevican co ( 911) 6320 584.2 9.5e-166
XP_016857536 (OMIM: 600347) PREDICTED: brevican co ( 956) 6320 584.3 9.8e-166
NP_940819 (OMIM: 600347) brevican core protein iso ( 671) 4342 406.0 3.2e-112
NP_001126 (OMIM: 155760,165800,608361,612813) aggr (2431) 1257 128.5 3.9e-28
XP_011519616 (OMIM: 155760,165800,608361,612813) P (2492) 1257 128.5 4e-28
XP_016877476 (OMIM: 155760,165800,608361,612813) P (2515) 1257 128.5 4e-28
XP_011519615 (OMIM: 155760,165800,608361,612813) P (2530) 1257 128.5 4e-28
NP_037359 (OMIM: 155760,165800,608361,612813) aggr (2530) 1257 128.5 4e-28
XP_016877474 (OMIM: 155760,165800,608361,612813) P (2553) 1257 128.5 4.1e-28
XP_016877475 (OMIM: 155760,165800,608361,612813) P (2553) 1257 128.5 4.1e-28
XP_006720482 (OMIM: 155760,165800,608361,612813) P (2568) 1257 128.5 4.1e-28
NP_004377 (OMIM: 600826) neurocan core protein pre (1321) 1144 118.2 2.8e-25
NP_001119808 (OMIM: 118661,143200) versican core p ( 655) 1092 113.3 4.1e-24
NP_001157570 (OMIM: 118661,143200) versican core p (1642) 1103 114.5 4.3e-24
NP_004376 (OMIM: 118661,143200) versican core prot (3396) 1103 114.7 7.6e-24
NP_001157569 (OMIM: 118661,143200) versican core p (2409) 1093 113.7 1.1e-23
XP_016864543 (OMIM: 115435) PREDICTED: hyaluronan ( 353) 807 87.4 1.3e-16
XP_016864542 (OMIM: 115435) PREDICTED: hyaluronan ( 353) 807 87.4 1.3e-16
NP_001875 (OMIM: 115435) hyaluronan and proteoglyc ( 354) 804 87.1 1.6e-16
XP_016864541 (OMIM: 115435) PREDICTED: hyaluronan ( 354) 804 87.1 1.6e-16
XP_016864540 (OMIM: 115435) PREDICTED: hyaluronan ( 354) 804 87.1 1.6e-16
XP_011541470 (OMIM: 115435) PREDICTED: hyaluronan ( 354) 804 87.1 1.6e-16
XP_011523845 (OMIM: 612264) PREDICTED: C-type mann (1156) 382 49.5 0.00011
NP_006030 (OMIM: 612264) C-type mannose receptor 2 (1479) 382 49.6 0.00014
XP_011518934 (OMIM: 609964) PREDICTED: C-type lect ( 215) 338 45.0 0.00047
NP_525126 (OMIM: 609964) C-type lectin domain fami ( 215) 338 45.0 0.00047
NP_001193948 (OMIM: 151445) low affinity immunoglo ( 320) 339 45.2 0.0006
NP_001207429 (OMIM: 151445) low affinity immunoglo ( 321) 339 45.2 0.0006
XP_005272519 (OMIM: 151445) PREDICTED: low affinit ( 321) 339 45.2 0.0006
NP_001993 (OMIM: 151445) low affinity immunoglobul ( 321) 339 45.2 0.0006
NP_569057 (OMIM: 607621) collectin-12 [Homo sapien ( 742) 332 44.8 0.0018
NP_001138371 (OMIM: 604672,607948,609423,614371) C ( 243) 317 43.2 0.0019
XP_005272529 (OMIM: 604672,607948,609423,614371) P ( 266) 317 43.2 0.002
NP_001138365 (OMIM: 604672,607948,609423,614371) C ( 268) 317 43.2 0.0021
NP_001138367 (OMIM: 604672,607948,609423,614371) C ( 312) 317 43.2 0.0023
NP_001138366 (OMIM: 604672,607948,609423,614371) C ( 360) 317 43.3 0.0026
NP_001138368 (OMIM: 604672,607948,609423,614371) C ( 380) 317 43.3 0.0027
NP_066978 (OMIM: 604672,607948,609423,614371) CD20 ( 404) 317 43.3 0.0029
NP_002429 (OMIM: 153618) macrophage mannose recept (1456) 333 45.1 0.0029
XP_011524043 (OMIM: 607621) PREDICTED: collectin-1 ( 725) 321 43.9 0.0035
NP_001316999 (OMIM: 605999) C-type lectin domain f ( 289) 309 42.5 0.0036
NP_006335 (OMIM: 605999) C-type lectin domain fami ( 292) 309 42.5 0.0036
NP_878910 (OMIM: 605999) C-type lectin domain fami ( 316) 309 42.5 0.0039
XP_011521916 (OMIM: 605999) PREDICTED: C-type lect ( 319) 309 42.5 0.0039
XP_011521915 (OMIM: 605999) PREDICTED: C-type lect ( 319) 309 42.5 0.0039
NP_001191047 (OMIM: 616838) C-type lectin domain f ( 378) 309 42.6 0.0045
XP_016882280 (OMIM: 616838) PREDICTED: C-type lect ( 243) 303 41.9 0.0046
NP_001138369 (OMIM: 604672,607948,609423,614371) C ( 398) 307 42.4 0.0053
XP_016882279 (OMIM: 616838) PREDICTED: C-type lect ( 293) 303 42.0 0.0053
>>NP_068767 (OMIM: 600347) brevican core protein isoform (911 aa)
initn: 6320 init1: 6320 opt: 6320 Z-score: 3096.7 bits: 584.2 E(85289): 9.5e-166
Smith-Waterman score: 6320; 99.9% identity (100.0% similar) in 911 aa overlap (1-911:1-911)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAQLFLPLLAALVLAQAPAALADVLEGDSSEDRAFRVRIAGDAPLQGVLGGALTIPCHVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 MAQLFLPLLAALVLAQAPAALADVLEGDSSEDRAFRVRIAGDAPLQGVLGGALTIPCHVH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 YLRPPPSRRAVLGSPRVKWTFLSRGREAEVLVARGVRVKVNEAYRFRVALPAYPASLTDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 YLRPPPSRRAVLGSPRVKWTFLSRGREAEVLVARGVRVKVNEAYRFRVALPAYPASLTDV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 SLALSELRPNDSGIYRCEVQHGIDDSSDAVEVKVKGVVFLYREGSARYAFSFSGAQEACA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 SLALSELRPNDSGIYRCEVQHGIDDSSDAVEVKVKGVVFLYREGSARYAFSFSGAQEACA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 RIGAHIATPEQLYAAYLGGYEQCDAGWLSDQTVRYPIQTPREACYGDMDGFPGVRNYGVV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 DPDDLYDVYCYAEDLNGELFLGDPPEKLTLEEARAYCQERGAEIATTGQLYAAWDGGLDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 DPDDLYDVYCYAEDLNGELFLGDPPEKLTLEEARAYCQERGAEIATTGQLYAAWDGGLDH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 CSPGWLADGSVRYPIVTPSQRCGGGLPGVKTLFLFPNQTGFPNKHSRFNVYCFRDSAQPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 CSPGWLADGSVRYPIVTPSQRCGGGLPGVKTLFLFPNQTGFPNKHSRFNVYCFRDSAQPS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 AIPEASNPASNPASDGLEAIVTVTETLEELQLPQEATESESRGAIYSIPIMEDGGGGSST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 AIPEASNPASNPASDGLEAIVTVTETLEELQLPQEATESESRGAIYSIPIMEDGGGGSST
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 PEDPAEAPRTLLEFETQSMVPPTGFSEEEGKALEEEEKYEDEEEKEEEEEEEEVEDEALW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 PEDPAEAPRTLLEFETQSMVPPTGFSEEEGKALEEEEKYEDEEEKEEEEEEEEVEDEALW
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pF1KB8 AWPSELSSPGPEASLPTEPAAQEKSLSQAPARAVLQPGASPLPDGESEASRPPRVHGPPT
:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 AWPSELSSPGPEASLPTEPAAQEESLSQAPARAVLQPGASPLPDGESEASRPPRVHGPPT
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550 560 570 580 590 600
pF1KB8 ETLPTPRERNLASPSPSTLVEAREVGEATGGPELSGVPRGESEETGSSEGAPSLLPATRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 ETLPTPRERNLASPSPSTLVEAREVGEATGGPELSGVPRGESEETGSSEGAPSLLPATRA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 PEGTRELEAPSEDNSGRTAPAGTSVQAQPVLPTDSASRGGVAVVPASGDCVPSPCHNGGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 PEGTRELEAPSEDNSGRTAPAGTSVQAQPVLPTDSASRGGVAVVPASGDCVPSPCHNGGT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 CLEEEEGVRCLCLPGYGGDLCDVGLRFCNPGWDAFQGACYKHFSTRRSWEEAETQCRMYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 CLEEEEGVRCLCLPGYGGDLCDVGLRFCNPGWDAFQGACYKHFSTRRSWEEAETQCRMYG
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730 740 750 760 770 780
pF1KB8 AHLASISTPEEQDFINNRYREYQWIGLNDRTIEGDFLWSDGVPLLYENWNPGQPDSYFLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 AHLASISTPEEQDFINNRYREYQWIGLNDRTIEGDFLWSDGVPLLYENWNPGQPDSYFLS
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pF1KB8 GENCVVMVWHDQGQWSDVPCNYHLSYTCKMGLVSCGPPPELPLAQVFGRPRLRYEVDTVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 GENCVVMVWHDQGQWSDVPCNYHLSYTCKMGLVSCGPPPELPLAQVFGRPRLRYEVDTVL
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pF1KB8 RYRCREGLAQRNLPLIRCQENGRWEAPQISCVPRRPARALHPEEDPEGRQGRLLGRWKAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 RYRCREGLAQRNLPLIRCQENGRWEAPQISCVPRRPARALHPEEDPEGRQGRLLGRWKAL
850 860 870 880 890 900
910
pF1KB8 LIPPSSPMPGP
:::::::::::
NP_068 LIPPSSPMPGP
910
>>XP_011508168 (OMIM: 600347) PREDICTED: brevican core p (911 aa)
initn: 6320 init1: 6320 opt: 6320 Z-score: 3096.7 bits: 584.2 E(85289): 9.5e-166
Smith-Waterman score: 6320; 99.9% identity (100.0% similar) in 911 aa overlap (1-911:1-911)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAQLFLPLLAALVLAQAPAALADVLEGDSSEDRAFRVRIAGDAPLQGVLGGALTIPCHVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB8 YLRPPPSRRAVLGSPRVKWTFLSRGREAEVLVARGVRVKVNEAYRFRVALPAYPASLTDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YLRPPPSRRAVLGSPRVKWTFLSRGREAEVLVARGVRVKVNEAYRFRVALPAYPASLTDV
70 80 90 100 110 120
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pF1KB8 SLALSELRPNDSGIYRCEVQHGIDDSSDAVEVKVKGVVFLYREGSARYAFSFSGAQEACA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB8 RIGAHIATPEQLYAAYLGGYEQCDAGWLSDQTVRYPIQTPREACYGDMDGFPGVRNYGVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RIGAHIATPEQLYAAYLGGYEQCDAGWLSDQTVRYPIQTPREACYGDMDGFPGVRNYGVV
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pF1KB8 DPDDLYDVYCYAEDLNGELFLGDPPEKLTLEEARAYCQERGAEIATTGQLYAAWDGGLDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DPDDLYDVYCYAEDLNGELFLGDPPEKLTLEEARAYCQERGAEIATTGQLYAAWDGGLDH
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pF1KB8 CSPGWLADGSVRYPIVTPSQRCGGGLPGVKTLFLFPNQTGFPNKHSRFNVYCFRDSAQPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CSPGWLADGSVRYPIVTPSQRCGGGLPGVKTLFLFPNQTGFPNKHSRFNVYCFRDSAQPS
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pF1KB8 AIPEASNPASNPASDGLEAIVTVTETLEELQLPQEATESESRGAIYSIPIMEDGGGGSST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AIPEASNPASNPASDGLEAIVTVTETLEELQLPQEATESESRGAIYSIPIMEDGGGGSST
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pF1KB8 PEDPAEAPRTLLEFETQSMVPPTGFSEEEGKALEEEEKYEDEEEKEEEEEEEEVEDEALW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PEDPAEAPRTLLEFETQSMVPPTGFSEEEGKALEEEEKYEDEEEKEEEEEEEEVEDEALW
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pF1KB8 AWPSELSSPGPEASLPTEPAAQEKSLSQAPARAVLQPGASPLPDGESEASRPPRVHGPPT
:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AWPSELSSPGPEASLPTEPAAQEESLSQAPARAVLQPGASPLPDGESEASRPPRVHGPPT
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pF1KB8 ETLPTPRERNLASPSPSTLVEAREVGEATGGPELSGVPRGESEETGSSEGAPSLLPATRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ETLPTPRERNLASPSPSTLVEAREVGEATGGPELSGVPRGESEETGSSEGAPSLLPATRA
550 560 570 580 590 600
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pF1KB8 PEGTRELEAPSEDNSGRTAPAGTSVQAQPVLPTDSASRGGVAVVPASGDCVPSPCHNGGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PEGTRELEAPSEDNSGRTAPAGTSVQAQPVLPTDSASRGGVAVVPASGDCVPSPCHNGGT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 CLEEEEGVRCLCLPGYGGDLCDVGLRFCNPGWDAFQGACYKHFSTRRSWEEAETQCRMYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CLEEEEGVRCLCLPGYGGDLCDVGLRFCNPGWDAFQGACYKHFSTRRSWEEAETQCRMYG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 AHLASISTPEEQDFINNRYREYQWIGLNDRTIEGDFLWSDGVPLLYENWNPGQPDSYFLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AHLASISTPEEQDFINNRYREYQWIGLNDRTIEGDFLWSDGVPLLYENWNPGQPDSYFLS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 GENCVVMVWHDQGQWSDVPCNYHLSYTCKMGLVSCGPPPELPLAQVFGRPRLRYEVDTVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GENCVVMVWHDQGQWSDVPCNYHLSYTCKMGLVSCGPPPELPLAQVFGRPRLRYEVDTVL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 RYRCREGLAQRNLPLIRCQENGRWEAPQISCVPRRPARALHPEEDPEGRQGRLLGRWKAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RYRCREGLAQRNLPLIRCQENGRWEAPQISCVPRRPARALHPEEDPEGRQGRLLGRWKAL
850 860 870 880 890 900
910
pF1KB8 LIPPSSPMPGP
:::::::::::
XP_011 LIPPSSPMPGP
910
>>XP_016857536 (OMIM: 600347) PREDICTED: brevican core p (956 aa)
initn: 6320 init1: 6320 opt: 6320 Z-score: 3096.4 bits: 584.3 E(85289): 9.8e-166
Smith-Waterman score: 6320; 99.9% identity (100.0% similar) in 911 aa overlap (1-911:46-956)
10 20 30
pF1KB8 MAQLFLPLLAALVLAQAPAALADVLEGDSS
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EEVEERVGSGEAVLTCVRSRRPSWKRPACSMAQLFLPLLAALVLAQAPAALADVLEGDSS
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 EDRAFRVRIAGDAPLQGVLGGALTIPCHVHYLRPPPSRRAVLGSPRVKWTFLSRGREAEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EDRAFRVRIAGDAPLQGVLGGALTIPCHVHYLRPPPSRRAVLGSPRVKWTFLSRGREAEV
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 LVARGVRVKVNEAYRFRVALPAYPASLTDVSLALSELRPNDSGIYRCEVQHGIDDSSDAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_016 CVPRRPARALHPEEDPEGRQGRLLGRWKALLIPPSSPMPGP
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.:: . .: ::::::: ::: :..:::::::.::::::::.::::.:::: : :::::.
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::. : .. :::::.::...::.: . :::.:..:: :.. ::..::::::: ::..
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:.: :: ::::: :::::: :::.: ::.:... ::::.:. ::... :. .
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. ::: : . . . . .. ::: :: ::.. ::.:.::. : .. ::.:
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: .: .: : : : . :.:.: :... :
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:::: :: : .::...: ::.:: : ::
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::.:::: ::: .:::::::::: :::::::: .:: : :: :. ::::.::: .
NP_001 IASPEQLQAAYEAGYEQCDAGWLRDQTVRYPIVSPRTPCVGDKDSSPGVRTYGVRPSTET
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:::::... :.::.:.. :..:..:: .:. ..: .::::::::::. :::.: ::
NP_001 YDVYCFVDRLEGEVFFATRLEQFTFQEALEFCESHNATLATTGQLYAAWSRGLDKCYAGW
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:::::.::::::: ::: :::.:..:.:::::.:. :: ...::: :: :: :
NP_001 LADGSLRYPIVTPRPACGGDKPGVRTVYLYPNQTGLPDPLSRHHAFCFRGISAVPSPGEE
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pF1KB8 ASNPASNPASDGLEA-IVT-VTETLEELQLPQEATESESRGAIYSIPIMEDGGGGSSTPE
.. ..:. :.: ::: :. . . . .:.: : : .: . ..:
NP_001 EGGTPTSPS--GVEEWIVTQVVPGVAAVPVEEETTAVPS-GETTAI-LEFTTEPENQTEW
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pF1KB8 DPAEAPRTLLEFE-TQSMVPPTGFSEEEGKALEEEEKYEDEEEKEEEEEEEEVEDEALWA
.:: .: . :::: . ::. : . . :: ::
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.::: ::. : : . :. :.. . :. : :. : ::. : . .::.
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. ::. :. : .:.. . :...: : . ::.: :. . .: .
NP_001 SWTELPSSGEE---SGAPDVSGDFTGSGDVSGHLDFSGQLSGDRASGLPSGDLDSSGLTS
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. : ::. . : : .: .: :: . :. :.:. . .:. : .. : : .
NP_001 TVGSGLPVESGLPSGDEERIEWPSTPTVGEL-PSGAEILEGSASGVGDLSGLPSGEVLET
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:::
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:. :: : . .: : . .: . .
NP_001 ITFVDTSLVEVAPTTFKEEEGLGSVELSGLPSGEADLSGKSGMVDVSGQFSGTVDSSGFT
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pF1KB8 FLFPNQTGFPNKHSRFNVYCFR---DSAQPSAIPEASN-PASNPASDGLEAIVTVTETLE
:. .:.:. .. . : :. ::. .:. :.: :. . .. :..:..
NP_001 SQTPEFSGLPSGIAEVSGESSRAEIGSSLPSGAYYGSGTPSSFPTVSLVDR--TLVESVT
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pF1KB8 ELQLPQEATESES-----RGAIYSIPIM--EDGG--------GGSSTPE-DPAEAPRTLL
. ::: :. : :: . : : : .: .: : .: .:
NP_001 QAPTAQEAGEGPSGILELSGAHSGAPDMSGEHSGFLDLSGLQSGLIEPSGEPPGTPYFSG
1950 1960 1970 1980 1990 2000
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pF1KB8 EFETQSMVP------------PTGFSEEEGKALEEEEKYEDEEEKEEEEEEEEV-EDEAL
.: . . : .:. : . : : . ..: .. : . :
NP_001 DFASTTNVSGESSVAMGTSGEASGLPEVTLITSEFVEGVTEPTISQELGQRPPVTHTPQL
2010 2020 2030 2040 2050 2060
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pF1KB8 WAWPSELSSPGP-EASLPTEPAA--QEKSLSQAPARAVLQP----GASPLPDGESEASRP
. ...:. : .. :. :.. . .:. .. ... : ::: :.. : :
NP_001 FESSGKVSTAGDISGATPVLPGSGVEVSSVPESSSETSAYPEAGFGASAAPEASREDSGS
2070 2080 2090 2100 2110 2120
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pF1KB8 PRVHGPPTETLPTPRERNLASPSP---STLVEAREVGEATGGPELSGVPRGESEETGSSE
: . .:: . .: :: : : . . . :::...::.:: :. .:.
NP_001 PDL----SETTSAFHEANLERSSGLGVSGSTLTFQEGEASAAPEVSGESTTTSD-VGTE-
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pF1KB8 GAPSLLPATRAPEGTRELEAPSEDNSGRTAPAGTSVQAQPVLPTDSASRGGVAVVPASGD
::.: :: . : : : : ::.:. :. .... .: . .. . . .
NP_001 -APGLPSATPTASGDRT--EISGDLSGHTSQLGVVISTS--IPESEWTQQTQRPAETHLE
2190 2200 2210 2220 2230
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pF1KB8 CVPSPCHNGGTCLEEEEGVRCLCLPGYGG-----------DLCDVGLRFCNPGWDAFQGA
: .: :: . :. : .. . . . :. ::. .::
NP_001 IESSSLLYSG---EETHTVETATSPTDASIPASPEWKRESESTAADQEVCEEGWNKYQGH
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pF1KB8 CYKHFSTRRSWEEAETQCRMYGAHLASISTPEEQDFINNRYREYQWIGLNDRTIEGDFLW
::.:: :..: .:: .:: .::.:: :::::.:.:: ..::::::::::::::: :
NP_001 CYRHFPDRETWVDAERRCREQQSHLSSIVTPEEQEFVNNNAQDYQWIGLNDRTIEGDFRW
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::: :. .::: :.:::..: .::.::::.::..:.:.:::::::: .::: : ..
NP_001 SDGHPMQFENWRPNQPDNFFAAGEDCVVMIWHEKGEWNDVPCNYHLPFTCKKGTATTYKR
2360 2370 2380 2390 2400 2410
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pF1KB8 PELPLAQVFGRPRLRYEVDTVLRYRCREGLAQRNLPLIRCQENGRWEAPQISCVPRRPAR
NP_001 RLQKRSSRHPRRSRPSTAH
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