Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8573
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8573, 890 aa
1>>>pF1KB8573 890 - 890 aa - 890 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.4055+/-0.00117; mu= 1.3847+/- 0.069
mean_var=229.4388+/-48.246, 0's: 0 Z-trim(108.5): 102 B-trim: 113 in 2/51
Lambda= 0.084672
statistics sampled from 10128 (10222) to 10128 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.66), E-opt: 0.2 (0.314), width: 16
Scan time: 4.760
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4199.1 KIF20A gene_id:10112|Hs108|chr5 ( 890) 5810 723.9 3.2e-208
CCDS7422.1 KIF11 gene_id:3832|Hs108|chr10 (1056) 495 74.6 1e-12
CCDS55217.1 KIF13B gene_id:23303|Hs108|chr8 (1826) 487 73.8 3.2e-12
CCDS47324.1 KIF4B gene_id:285643|Hs108|chr5 (1234) 483 73.2 3.2e-12
CCDS13200.1 KIF3B gene_id:9371|Hs108|chr20 ( 747) 478 72.5 3.3e-12
CCDS111.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1 (1770) 478 72.7 6.6e-12
CCDS47380.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1749) 476 72.5 7.7e-12
CCDS54967.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1757) 476 72.5 7.8e-12
CCDS54968.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1770) 476 72.5 7.8e-12
CCDS47381.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1805) 476 72.5 7.9e-12
CCDS11065.1 KIF1C gene_id:10749|Hs108|chr17 (1103) 457 70.0 2.7e-11
CCDS33744.1 KIF15 gene_id:56992|Hs108|chr3 (1388) 459 70.3 2.7e-11
CCDS112.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1 (1153) 457 70.0 2.8e-11
CCDS7407.1 KIF20B gene_id:9585|Hs108|chr10 (1780) 460 70.5 3e-11
CCDS60590.1 KIF20B gene_id:9585|Hs108|chr10 (1820) 459 70.4 3.4e-11
CCDS68768.1 CENPE gene_id:1062|Hs108|chr4 (2580) 458 70.4 4.8e-11
CCDS72722.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 ( 929) 447 68.7 5.4e-11
CCDS44079.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 (1028) 447 68.8 5.9e-11
CCDS213.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 (1029) 447 68.8 5.9e-11
>>CCDS4199.1 KIF20A gene_id:10112|Hs108|chr5 (890 aa)
initn: 5810 init1: 5810 opt: 5810 Z-score: 3851.6 bits: 723.9 E(32554): 3.2e-208
Smith-Waterman score: 5810; 100.0% identity (100.0% similar) in 890 aa overlap (1-890:1-890)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSQGILSPPAGLLSDDDVVVSPMFESTAADLGSVVRKNLLSDCSVVSTSLEDKQQVPSED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MSQGILSPPAGLLSDDDVVVSPMFESTAADLGSVVRKNLLSDCSVVSTSLEDKQQVPSED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 SMEKVKVYLRVRPLLPSELERQEDQGCVRIENVETLVLQAPKDSFALKSNERGIGQATHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 SMEKVKVYLRVRPLLPSELERQEDQGCVRIENVETLVLQAPKDSFALKSNERGIGQATHR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 FTFSQIFGPEVGQASFFNLTVKEMVKDVLKGQNWLIYTYGVTNSGKTHTIQGTIKDGGIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 FTFSQIFGPEVGQASFFNLTVKEMVKDVLKGQNWLIYTYGVTNSGKTHTIQGTIKDGGIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 PRSLALIFNSLQGQLHPTPDLKPLLSNEVIWLDSKQIRQEEMKKLSLLNGGLQEEELSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PRSLALIFNSLQGQLHPTPDLKPLLSNEVIWLDSKQIRQEEMKKLSLLNGGLQEEELSTS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LKRSVYIESRIGTSTSFDSGIAGLSSISQCTSSSQLDETSHRWAQPDTAPLPVPANIRFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LKRSVYIESRIGTSTSFDSGIAGLSSISQCTSSSQLDETSHRWAQPDTAPLPVPANIRFS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 IWISFFEIYNELLYDLLEPPSQQRKRQTLRLCEDQNGNPYVKDLNWIHVQDAEEAWKLLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 IWISFFEIYNELLYDLLEPPSQQRKRQTLRLCEDQNGNPYVKDLNWIHVQDAEEAWKLLK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 VGRKNQSFASTHLNQNSSRSHSIFSIRILHLQGEGDIVPKISELSLCDLAGSERCKDQKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VGRKNQSFASTHLNQNSSRSHSIFSIRILHLQGEGDIVPKISELSLCDLAGSERCKDQKS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 GERLKEAGNINTSLHTLGRCIAALRQNQQNRSKQNLVPFRDSKLTRVFQGFFTGRGRSCM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GERLKEAGNINTSLHTLGRCIAALRQNQQNRSKQNLVPFRDSKLTRVFQGFFTGRGRSCM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 IVNVNPCASTYDETLHVAKFSAIASQLVHAPPMQLGFPSLHSFIKEHSLQVSPSLEKGAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 IVNVNPCASTYDETLHVAKFSAIASQLVHAPPMQLGFPSLHSFIKEHSLQVSPSLEKGAK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 ADTGLDDDIENEADISMYGKEELLQVVEAMKTLLLKERQEKLQLEMHLRDEICNEMVEQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ADTGLDDDIENEADISMYGKEELLQVVEAMKTLLLKERQEKLQLEMHLRDEICNEMVEQM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 QQREQWCSEHLDTQKELLEEMYEEKLNILKESLTSFYQEEIQERDEKIEELEALLQEARQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QQREQWCSEHLDTQKELLEEMYEEKLNILKESLTSFYQEEIQERDEKIEELEALLQEARQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 QSVAHQQSGSELALRRSQRLAASASTQQLQEVKAKLQQCKAELNSTTEELHKYQKMLEPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QSVAHQQSGSELALRRSQRLAASASTQQLQEVKAKLQQCKAELNSTTEELHKYQKMLEPP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 PSAKPFTIDVDKKLEEGQKNIRLLRTELQKLGESLQSAERACCHSTGAGKLRQALTTCDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PSAKPFTIDVDKKLEEGQKNIRLLRTELQKLGESLQSAERACCHSTGAGKLRQALTTCDD
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 ILIKQDQTLAELQNNMVLVKLDLRKKAACIAEQYHTVLKLQGQVSAKKRLGTNQENQQPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ILIKQDQTLAELQNNMVLVKLDLRKKAACIAEQYHTVLKLQGQVSAKKRLGTNQENQQPN
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890
pF1KB8 QQPPGKKPFLRNLLPRTPTCQSSTDCSPYARILRSRRSPLLKSGPFGKKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QQPPGKKPFLRNLLPRTPTCQSSTDCSPYARILRSRRSPLLKSGPFGKKY
850 860 870 880 890
>>CCDS7422.1 KIF11 gene_id:3832|Hs108|chr10 (1056 aa)
initn: 646 init1: 199 opt: 495 Z-score: 341.7 bits: 74.6 E(32554): 1e-12
Smith-Waterman score: 504; 26.9% identity (59.8% similar) in 584 aa overlap (299-867:154-696)
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 QCTSSSQLDETSHRWAQPDTAPLPVPANIRFSIWISFFEIYNELLYDLLEPPSQQRKRQT
::. .:..::::: :.:::.: :. .:
CCDS74 EYTWEEDPLAGIIPRTLHQIFEKLTDNGTEFSVKVSLLEIYNEELFDLLNPSSDVSER--
130 140 150 160 170 180
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 LRLCEDQNGNP--YVKDLNWIHVQDAEEAWKLLKVGRKNQSFASTHLNQNSSRSHSIFSI
:.. .: .. .: :. : :.. .:....:. : ... :.: .: ::::::.::.
CCDS74 LQMFDDPRNKRGVIIKGLEEITVHNKDEVYQILEKGAAKRTTAATLMNAYSSRSHSVFSV
190 200 210 220 230 240
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 RILHLQG---EGDIVPKISELSLCDLAGSERC-KDQKSGERLKEAGNINTSLHTLGRCIA
: :.. .:. . ::..:.: :::::: .. .: .:::::: :: :::: :.
CCDS74 TI-HMKETTIDGEELVKIGKLNLVDLAGSENIGRSGAVDKRAREAGNINQSLLTLGRVIT
250 260 270 280 290 300
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 ALRQNQQNRSKQNLVPFRDSKLTRVFQGFFTGRGRSCMIVNVNPCASTYDETLHVAKFSA
:: . :. . ::.:.:::::..: . :: :. .:....: . . .::: . ...
CCDS74 ALVE----RTPH--VPYRESKLTRILQDSLGGRTRTSIIATISPASLNLEETLSTLEYAH
310 320 330 340 350
510 520 530 540 550
pF1KB8 IASQLVHAPPMQLGFPSLHSFIKEHSLQVSPSLEK---GAKADTGLDDDIENEADISMYG
:..... : .. . . ...:::.. .. :.. .:. .:. . :: .:
CCDS74 RAKNILNKPEVNQKLTK-KALIKEYTEEIE-RLKRDLAAAREKNGVYISEENFRVMSGKL
360 370 380 390 400 410
560 570 580 590 600 610
pF1KB8 KEELLQVVEAMKTLLLKERQEKLQLEMHLRDEICNEMVEQMQQREQWCSEHLDTQKELLE
. :.:: .. . :.. . :. . .. ::. .: .. : ...:.: .. :.
CCDS74 TVQEEQIVELIEKIGAVEEELNRVTELFMDNK--NEL-DQCKSDLQNKTQELETTQKHLQ
420 430 440 450 460
620 630 640 650 660 670
pF1KB8 EMYEEKLNILKESLTSFYQEEIQERDEKIEELEALLQEARQQSVAHQQSGSELALRRSQR
: ::...:: . .. .::... . : .. .... .. :: . : :..
CCDS74 ET---KLQLVKEE---YITSALESTEEKLHDAASKLLNTVEETT-KDVSGLHSKLDRKK-
470 480 490 500 510 520
680 690 700 710 720 730
pF1KB8 LAASASTQQLQEVKAKLQQCKAELNSTTEELHKYQKMLEPPPSAKPFTIDVDKKLEEG--
:.. . . :.. .: .::: ......... : . ..: : : .
CCDS74 -AVDQHNAEAQDIFGK------NLNSL---FNNMEELIKDGSSKQKAMLEVHKTLFGNLL
530 540 550 560 570
740 750 760 770 780 790
pF1KB8 QKNIRLLRT-ELQKLGESLQSAERACCHSTGAGKLRQALTTCDDILIKQDQTLAELQNNM
.... : : :: :: : . :: .... . . ... .. .: :: :
CCDS74 SSSVSALDTITTVALG-SLTSIPENV--STHVSQIFNMILKEQSLAAESKTVLQELIN--
580 590 600 610 620
800 810 820 830 840 850
pF1KB8 VLVKLDLRKKAACI-AEQYHTVLKLQGQVSA--KKRLGTNQENQQPNQQPPGKKPFLRNL
..: :: .. : . ..::...:.. : : . .. .. ... : :: :
CCDS74 -VLKTDLLSSLEMILSPTVVSILKINSQLKHIFKTSLTVADKIEDQKKELDG---FLSIL
630 640 650 660 670 680
860 870 880 890
pF1KB8 LPRTPTCQSSTDCSPYARILRSRRSPLLKSGPFGKKY
: .: ::
CCDS74 CNNLHELQENTICSLVESQKQCGNLTEDLKTIKQTHSQELCKLMNLWTERFCALEEKCEN
690 700 710 720 730 740
>>CCDS55217.1 KIF13B gene_id:23303|Hs108|chr8 (1826 aa)
initn: 557 init1: 230 opt: 487 Z-score: 333.0 bits: 73.8 E(32554): 3.2e-12
Smith-Waterman score: 509; 26.6% identity (58.4% similar) in 579 aa overlap (299-862:144-653)
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 QCTSSSQLDETSHRWAQPDTAPLPVPANIRFSIWISFFEIYNELLYDLLEPPSQQRKRQT
:.. .:..::::: . :::.: . .:::
CCDS55 MGTADQPGLIPRLCSGLFERTQKEENEEQSFKVEVSYMEIYNEKVRDLLDPKG---SRQT
120 130 140 150 160 170
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 LRLCEDQNGNPYVKDLNWIHVQDAEEAWKLLKVGRKNQSFASTHLNQNSSRSHSIFSIRI
:.. : . .::: :. . : . .. .:.. : :... :.:..:..:::::..:.: .
CCDS55 LKVREHSVLGPYVDGLSKLAVTSYKDIESLMSEGNKSRTVAATNMNEESSRSHAVFKITL
180 190 200 210 220 230
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 LHLQGE---GDIVPKISELSLCDLAGSERC-KDQKSGERLKEAGNINTSLHTLGRCIAAL
: . : :...::: ::::::: : .:.::::..::: :: ::: :.::
CCDS55 THTLYDVKSGTSGEKVGKLSLVDLAGSERATKTGAAGDRLKEGSNINKSLTTLGLVISAL
240 250 260 270 280 290
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 RQNQQNRSKQNLVPFRDSKLTRVFQGFFTGRGRSCMIVNVNPCASTYDETLHVAKFSAIA
... ...:...::.::: :: ... . : ... :...:.: :..::::: . ... :
CCDS55 ADQSAGKNKNKFVPYRDSVLTWLLKDSLGGNSKTAMVATVSPAADNYDETLSTLRYADRA
300 310 320 330 340 350
510 520 530 540 550 560
pF1KB8 SQLVHAPPMQLGFPSLHSFIKEHSLQVSPSLEKGAKADTGLDDDIENEADISMYGKEELL
...:. :. ..: . .:. : ...:. .:.:
CCDS55 KHIVN-----------HAVVNE---------DPNARIIRDLREEVEKL-------REQLT
360 370 380
570 580 590 600 610 620
pF1KB8 QVVEAMKTLLLKERQEKLQLEMHLRDEICNEMVEQMQQREQWCSEHLDTQKELLEEMYEE
.. ::::. ::.: :. . .: .:. :.... :. .:. ::.: :
CCDS55 KA-EAMKSPELKDRLEESE---KLIQEMTVTWEEKLRKTEEIAQER---QKQL------E
390 400 410 420 430
630 640 650 660 670 680
pF1KB8 KLNILKESLTSFYQEEIQERDEKIEELEALLQEARQQSVAHQQSGSELALRRSQRLAASA
.:.: :. . :. :.: .. . : .. ... . . : .::
CCDS55 SLGI------SLQSSGIKVGDDKCFLVNLNADPALNELLVYYL--------KEHTLIGSA
440 450 460 470
690 700 710 720 730
pF1KB8 STQQLQEVKAKL--QQCKAELNSTTEELHKYQKMLEPPPSAKPF----TIDVDKKLEEGQ
..:..: . ..: ...: . : :: : ... : ... .:..:.
CCDS55 NSQDIQLCGMGILPEHCIIDITS------EGQVMLTPQKNTRTFVNGSSVSSPIQLHHGD
480 490 500 510 520 530
740 750 760 770 780 790
pF1KB8 K----NIRLLRTELQKLGESLQSAERACCHSTGAGKLRQALTTCDDILIKQDQTLAELQN
. : ...: .: : . ..::: . . : ... : ..... .:..
CCDS55 RILWGNNHFFRLNLPK---KKKKAEREDEDQDPSMKNENSSEQLDVDGDSSSEVSSEVNF
540 550 560 570 580
800 810 820 830 840 850
pF1KB8 NMVLVKLDLRKKAACIAEQYHTVLK-LQGQVSAKKRLGTNQENQQPNQQPPGKKPFLRNL
:. ..... :: . ....:. :. : .:: . : :. . .. . : :
CCDS55 NYEYAQMEVTMKALGSNDPMQSILNSLEQQHEEEKR--SALERQRLMYEHELEQ-LRRRL
590 600 610 620 630 640
860 870 880 890
pF1KB8 LPRTPTCQSSTDCSPYARILRSRRSPLLKSGPFGKKY
:. .:.:
CCDS55 SPEKQNCRSMDRFSFHSPSAQQRLRQWAEEREATLNNSLMRLREQIVKANLLVREANYIA
650 660 670 680 690 700
>>CCDS47324.1 KIF4B gene_id:285643|Hs108|chr5 (1234 aa)
initn: 428 init1: 138 opt: 483 Z-score: 332.8 bits: 73.2 E(32554): 3.2e-12
Smith-Waterman score: 493; 25.2% identity (60.3% similar) in 564 aa overlap (295-847:130-671)
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 SSISQCTSSSQLDETSHRWAQPDTAPLPVPANIRFSIWISFFEIYNELLYDLLEPPSQQR
....:.. .:..::::: . ::: : .:
CCDS47 GAYTAEQENEPTVGIIPRVIQLLFKEIDKKSDFEFTLKVSYLEIYNEEILDLLCP---SR
100 110 120 130 140 150
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 KRQTLRLCEDQNGNPYVKDLNWIHVQDAEEAWKLLKVGRKNQSFASTHLNQNSSRSHSIF
.. . . :: . . . :. : : .. . :. : .... ::: .:..:::::.::
CCDS47 EKAQINIREDPKEGIKIVGLTEKTVLVALDTVSCLEQGNNSRTVASTAMNSQSSRSHAIF
160 170 180 190 200 210
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 SIRILHLQGEGDIVPKISELSLCDLAGSERCKDQKS-GERLKEAGNINTSLHTLGRCIAA
.: : . . :.: : ::::::: : :. :.::::. ::: .: :: :.:
CCDS47 TISIEQRKKSDKNCSFRSKLHLVDLAGSERQKKTKAEGDRLKEGININRGLLCLGNVISA
220 230 240 250 260 270
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 LRQNQQNRSKQNLVPFRDSKLTRVFQGFFTGRGRSCMIVNVNPCASTYDETLHVAKFSAI
: ... : ..::.:::::::..: . : ... ::. :.: :. .::: . ...
CCDS47 LGDDK----KGSFVPYRDSKLTRLLQDSLGGNSHTLMIACVSPADSNLEETLSTLRYADR
280 290 300 310 320 330
510 520 530 540 550 560
pF1KB8 ASQLVHAPPMQLGFPSLH-SFIKEHSLQVSPSLEKGAKADTGLDDDIENEADISMYGKEE
: .. . : ... . . . .:.. :.. : . :.. : : .:. : . :.
CCDS47 ARKIKNKPIVNIDPHTAELNHLKQQVQQLQVLLLQ-AHGGT-LPGSINAEPS------EN
340 350 360 370 380
570 580 590 600 610 620
pF1KB8 LLQVVEAMKTLLLKERQEKLQLEMHLRDEICNEMVEQMQQREQWCSEHLDTQKELLEEMY
: ...: ..:. :..:::. . .:.:.. :: .:.:... : :..
CCDS47 LQSLMEKNQSLV--EENEKLSRCLSKAAGQTAQMLERIILTEQ-VNEKLNAKLEELRQHV
390 400 410 420 430 440
630 640 650 660 670 680
pF1KB8 EEKLNILKESLTSFYQEEIQERDEKIEELEALLQEARQQSVAHQQSGSELALRRSQRLAA
::. :.. . .. ..:..: : : .:. :. . ...:: .. . :... .. .
CCDS47 ACKLD-LQKLVETLEDQELKENVEIICNLQQLITQLSDETVACTAAAIDTAVEEEAQVET
450 460 470 480 490 500
690 700 710 720 730
pF1KB8 SASTQQLQEV--------KAKLQQCKAELNSTTEELHKY-QKMLEPPPSAKPFTIDVDKK
: :.. ... .:.... .:::.. . .:: . . .:. .. . .
CCDS47 SPETSRSSDAFTTQHALHQAQMSKEVVELNNALALKEALVRKMTQNDNQLQPIQFQYQDN
510 520 530 540 550 560
740 750 760 770 780 790
pF1KB8 LEEGQKNIRLLRTELQKLGESLQSAERACCHSTGAGKLRQALTTCDDILIKQDQTLAELQ
... . .. :. : ..: . ::.:.. .. . . .. : . . . : : :
CCDS47 IKNLELEVINLQKEKEELVRELQTAKKNVNQAKLSEHRHKLLQELEGQIADLKKKLNE-Q
570 580 590 600 610
800 810 820 830 840 850
pF1KB8 NNMVLVKLDLRKKAACIAEQYHTVLKLQGQVSAKKRLGTNQENQQPNQQPPGKKPFLRNL
.... .: . .. .. . .. ..: : .:. ... . :. . .: :.
CCDS47 SKLLKLKESTERTVSKLNQEIW-MMKNQ-RVQLMRQMKEDAEKFRQWKQKKDKEVIQLKE
620 630 640 650 660 670
860 870 880 890
pF1KB8 LPRTPTCQSSTDCSPYARILRSRRSPLLKSGPFGKKY
CCDS47 RDRKRQYELLKLERNFQKQSSVLRRKTEEAAAANKRLKDALQKQREVTDKRKETQSHGKE
680 690 700 710 720 730
>>CCDS13200.1 KIF3B gene_id:9371|Hs108|chr20 (747 aa)
initn: 598 init1: 140 opt: 478 Z-score: 332.6 bits: 72.5 E(32554): 3.3e-12
Smith-Waterman score: 513; 30.3% identity (62.8% similar) in 449 aa overlap (296-718:135-570)
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 SISQCTSSSQLDETSHRWAQPDTAPLPVPANIRFSIWISFFEIYNELLYDLLEPPSQQRK
: .. . :..:::.: . ::: ..: :
CCDS13 TMEGIRGDPEKRGVIPNSFDHIFTHISRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLL--SKDQTK
110 120 130 140 150 160
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 RQTLRLCEDQNGNPYVKDLNWIHVQDAEEAWKLLKVGRKNQSFASTHLNQNSSRSHSIFS
: :.: : . . :::::. . .....: ....:: .:.: ..:..:..:::::.::
CCDS13 R--LELKERPDTGVYVKDLSSFVTKSVKEIEHVMNVGNQNRSVGATNMNEHSSRSHAIFV
170 180 190 200 210 220
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 IRI----LHLQGEGDIVPKISELSLCDLAGSER-CKDQKSGERLKEAGNINTSLHTLGRC
: : . :.::. : ....:.: ::::::: : .::::::: .:: :: .::
CCDS13 ITIECSEVGLDGENHI--RVGKLNLVDLAGSERQAKTGAQGERLKEATKINLSLSALGNV
230 240 250 260 270
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 IAALRQNQQNRSKQNLVPFRDSKLTRVFQGFFTGRGRSCMIVNVNPCASTYDETLHVAKF
:.:: .. :.. .:.:::::::..: . : ... :..::.: . . .::: . ..
CCDS13 ISALVDG-----KSTHIPYRDSKLTRLLQDSLGGNAKTVMVANVGPASYNVEETLTTLRY
280 290 300 310 320 330
510 520 530 540 550
pF1KB8 SAIASQLVHAPPMQLGFP--SLHSFIKEHSLQVSPSLEKGAKADTGLDDDIENEADISMY
. :... . : .. : .: ..:. ... .::: . . . .. . .
CCDS13 ANRAKNIKNKPRVNED-PKDALLREFQEEIARLKAQLEKRSIGRRKRREKRREGGGSGGG
340 350 360 370 380 390
560 570 580 590 600
pF1KB8 GKEELLQVVEAM-----KTLLLKERQEKLQLEMH--LRDE--ICNEMVEQMQQREQWCSE
:.:: . :. : .:.::::..: . ..:. . .: .. ....:. :
CCDS13 GEEEEEEGEEGEEEGDDKDDYWREQQEKLEIEKRAIVEDHSLVAEEKMRLLKEKEKKM-E
400 410 420 430 440 450
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 HLDTQKELLEEM------YEEKLNILKESL---TSFYQEEIQERDEKIEELEALLQEARQ
: .:. : . .: :: . ... :. :. .... ..: : . .: .:
CCDS13 DLRREKDAAEMLGAKIKAMESKLLVGGKNIVDHTNEQQKILEQKRQEIAEQKRREREIQQ
460 470 480 490 500 510
670 680 690 700 710
pF1KB8 QSVAHQQSGSELALRRSQ-RLAASASTQQLQEVKAKLQQCKAELNSTTEELHKYQKMLEP
: .... :: :. . .. .:..:... .::: :::... :: : .. ::
CCDS13 QMESRDEETLELKETYSSLQQEVDIKTKKLKKLFSKLQAVKAEIHDLQEEHIKERQELEQ
520 530 540 550 560 570
720 730 740 750 760 770
pF1KB8 PPSAKPFTIDVDKKLEEGQKNIRLLRTELQKLGESLQSAERACCHSTGAGKLRQALTTCD
CCDS13 TQNELTRELKLKHLIIENFIPLEEKSKIMNRAFFDEEEDHWKLHPITRLENQQMMKRPVS
580 590 600 610 620 630
>>CCDS111.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1 (1770 aa)
initn: 497 init1: 201 opt: 478 Z-score: 327.2 bits: 72.7 E(32554): 6.6e-12
Smith-Waterman score: 478; 24.5% identity (58.7% similar) in 567 aa overlap (297-844:138-692)
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 ISQCTSSSQLDETSHRWAQPDTAPLPVPANIRFSIWISFFEIYNELLYDLLEPPSQQRKR
. .:. .:..::: : . :::.: ...
CCDS11 MGKQEESQAGIIPQLCEELFEKINDNCNEEMSYSVEVSYMEIYCERVRDLLNP----KNK
110 120 130 140 150 160
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 QTLRLCEDQNGNPYVKDLNWIHVQDAEEAWKLLKVGRKNQSFASTHLNQNSSRSHSIFSI
.::. : .:::.::. . : . . :. .: : .. :.:..:..:::::..:.:
CCDS11 GNLRVREHPLLGPYVEDLSKLAVTSYTDIADLMDAGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFTI
170 180 190 200 210 220
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 RILHLQGEGDI---VPKISELSLCDLAGSERCKDQKS-GERLKEAGNINTSLHTLGRCIA
. . . ... . :.:..:: ::::::: . . : ::::..::: :: :::. :.
CCDS11 VFTQKKHDNETNLSTEKVSKISLVDLAGSERADSTGAKGTRLKEGANINKSLTTLGKVIS
230 240 250 260 270 280
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 ALRQNQQNRSKQNLVPFRDSKLTRVFQGFFTGRGRSCMIVNVNPCASTYDETLHVAKFSA
:: . .....: ...:.::: :: ... . : .:. :.. ..: .::::: . ...
CCDS11 ALAEVSKKKKKTDFIPYRDSVLTWLLRENLGGNSRTAMVAALSPADINYDETLSTLRYAD
290 300 310 320 330 340
510 520 530 540 550
pF1KB8 IASQL-VHAPPMQLGFPSLHSFIKEHSLQVSPSLEK---GAKADTGLDDDIENEADISMY
:.:. .: . .: .::. ... :. : ::.. . . .. :.
CCDS11 RAKQIKCNAVINEDPNAKLVRELKEEVTRLKDLLRAQGLGDIIDTSMGSLTSSPSSCSLS
350 360 370 380 390 400
560 570 580 590 600 610
pF1KB8 GKEELLQVVEAMKTLLLKERQEKLQLEMHLRDEICNEMVEQMQQREQWCSEHLDTQKE-L
.. : .:. .. .. :. ... ..: :. : ... . .: . ..: :
CCDS11 SQVGLTSVTSIQERIMSTPGGEEAIERLKESEKIIAELNETWEEKLRK-TEAIRMEREAL
410 420 430 440 450 460
620 630 640 650 660 670
pF1KB8 LEEMYEEKLNILKESLT-SFYQEEIQERDEKIEELEALLQEARQQSVAH--QQSGSELAL
: :: . : ... : . .. . . ...: . :..: . . :. :
CCDS11 LAEM---GVAIREDGGTLGVFSPKKTPHLVNLNE-DPLMSECLLYYIKDGITRVGQADAE
470 480 490 500 510
680 690 700 710 720 730
pF1KB8 RRSQRLAASASTQQLQEVKAKLQQCKAELNSTTEELHKYQKMLEPPPSAKPFTIDVDKKL
::.. . ..: .. . . . .. ..:. : : .. . ... ..: . ...
CCDS11 RRQDIVLSGAHIKEEHCIFRSERSNSGEVIVTLEPCERSETYVNGKRVSQPVQLRSGNRI
520 530 540 550 560 570
740 750 760 770 780 790
pF1KB8 EEGQKNI-RLLRTELQKLG-ESLQSAERACCHSTGAGKLRQALTTCDDILIKQDQTLAEL
:.... :. . : . :. ::: . :. : . : .::.. .:
CCDS11 IMGKNHVFRFNHPEQARAEREKTPSAETPSEPVDWTFAQRELLEK-QGIDMKQEME-KRL
580 590 600 610 620 630
800 810 820 830 840
pF1KB8 QNNMVLVKLDLRKKAACIAEQ----YHTVLK-LQGQVSAKKRLGTNQENQQPNQQPPGKK
:. .: : . ...: . :: :.. :. :: :: ... . . :... ... :
CCDS11 QEMEILYKKE-KEEADLLLEQQRLDYESKLQALQKQVETRSLAAETTEEEEEEEEVPWTQ
640 650 660 670 680 690
850 860 870 880 890
pF1KB8 PFLRNLLPRTPTCQSSTDCSPYARILRSRRSPLLKSGPFGKKY
CCDS11 HEFELAQWAFRKWKSHQFTSLRDLLWGNAVYLKEANAISVELKKKVQFQFVLLTDTLYSP
700 710 720 730 740 750
>>CCDS47380.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1749 aa)
initn: 543 init1: 219 opt: 476 Z-score: 326.0 bits: 72.5 E(32554): 7.7e-12
Smith-Waterman score: 488; 33.7% identity (64.4% similar) in 326 aa overlap (299-617:143-437)
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 QCTSSSQLDETSHRWAQPDTAPLPVPANIRFSIWISFFEIYNELLYDLLEPPSQQRKRQT
:.. .:..::::: . :::.: .. ::.
CCDS47 MGHAEQLGLIPRLCCALFKRISLEQNESQTFKVEVSYMEIYNEKVRDLLDPKGS---RQS
120 130 140 150 160
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 LRLCEDQNGNPYVKDLNWIHVQDAEEAWKLLKVGRKNQSFASTHLNQNSSRSHSIFSIRI
:.. : . .::: :. . : . :. .:.. : :... :.:..:..:::::..:.: :
CCDS47 LKVREHKVLGPYVDGLSQLAVTSFEDIESLMSEGNKSRTVAATNMNEESSRSHAVFNIII
170 180 190 200 210 220
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 ---LHLQGEGDIVPKISELSLCDLAGSERC-KDQKSGERLKEAGNINTSLHTLGRCIAAL
:. :. :.:..:: ::::::: : .::::::..::: :: ::: :..:
CCDS47 TQTLYDLQSGNSGEKVSKVSLVDLAGSERVSKTGAAGERLKEGSNINKSLTTLGLVISSL
230 240 250 260 270 280
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 RQNQQNRSKQNLVPFRDSKLTRVFQGFFTGRGRSCMIVNVNPCASTYDETLHVAKFSAIA
.. ...:...::.::: :: ... . : ... ::....: :..:.::: . ... :
CCDS47 ADQAAGKGKSKFVPYRDSVLTWLLKDNLGGNSQTSMIATISPAADNYEETLSTLRYADRA
290 300 310 320 330 340
510 520 530 540 550 560
pF1KB8 SQLVHAPPMQLGFPSLHSFIKEHSLQVSPSLEKGAKADTGLDDDIENEADISMYGKEELL
...:. :. ..: . .::. : ...:. .:.:
CCDS47 KRIVN-----------HAVVNE---------DPNAKVIRELREEVEKL-------REQLS
350 360 370 380
570 580 590 600 610 620
pF1KB8 QVVEAMKTLLLKER---QEKLQLEMHLRDEICNEMVEQMQQREQWCSEHLDTQKELLEEM
:. ::::. :::. .::: :. . : . .:.. :..: : . . :.
CCDS47 QA-EAMKAPELKEKLEESEKLIKELTVTWEEKLRKTEEIAQERQRQLESMGISLEMSGIK
390 400 410 420 430 440
630 640 650 660 670 680
pF1KB8 YEEKLNILKESLTSFYQEEIQERDEKIEELEALLQEARQQSVAHQQSGSELALRRSQRLA
CCDS47 VGDDKCYLVNLNADPALNELLVYYLKDHTRVGADTSQDIQLFGIGIQPQHCEIDIASDGD
450 460 470 480 490 500
>>CCDS54967.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1757 aa)
initn: 543 init1: 219 opt: 476 Z-score: 326.0 bits: 72.5 E(32554): 7.8e-12
Smith-Waterman score: 488; 33.7% identity (64.4% similar) in 326 aa overlap (299-617:143-437)
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 QCTSSSQLDETSHRWAQPDTAPLPVPANIRFSIWISFFEIYNELLYDLLEPPSQQRKRQT
:.. .:..::::: . :::.: .. ::.
CCDS54 MGHAEQLGLIPRLCCALFKRISLEQNESQTFKVEVSYMEIYNEKVRDLLDPKGS---RQS
120 130 140 150 160
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 LRLCEDQNGNPYVKDLNWIHVQDAEEAWKLLKVGRKNQSFASTHLNQNSSRSHSIFSIRI
:.. : . .::: :. . : . :. .:.. : :... :.:..:..:::::..:.: :
CCDS54 LKVREHKVLGPYVDGLSQLAVTSFEDIESLMSEGNKSRTVAATNMNEESSRSHAVFNIII
170 180 190 200 210 220
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 ---LHLQGEGDIVPKISELSLCDLAGSERC-KDQKSGERLKEAGNINTSLHTLGRCIAAL
:. :. :.:..:: ::::::: : .::::::..::: :: ::: :..:
CCDS54 TQTLYDLQSGNSGEKVSKVSLVDLAGSERVSKTGAAGERLKEGSNINKSLTTLGLVISSL
230 240 250 260 270 280
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 RQNQQNRSKQNLVPFRDSKLTRVFQGFFTGRGRSCMIVNVNPCASTYDETLHVAKFSAIA
.. ...:...::.::: :: ... . : ... ::....: :..:.::: . ... :
CCDS54 ADQAAGKGKSKFVPYRDSVLTWLLKDNLGGNSQTSMIATISPAADNYEETLSTLRYADRA
290 300 310 320 330 340
510 520 530 540 550 560
pF1KB8 SQLVHAPPMQLGFPSLHSFIKEHSLQVSPSLEKGAKADTGLDDDIENEADISMYGKEELL
...:. :. ..: . .::. : ...:. .:.:
CCDS54 KRIVN-----------HAVVNE---------DPNAKVIRELREEVEKL-------REQLS
350 360 370 380
570 580 590 600 610 620
pF1KB8 QVVEAMKTLLLKER---QEKLQLEMHLRDEICNEMVEQMQQREQWCSEHLDTQKELLEEM
:. ::::. :::. .::: :. . : . .:.. :..: : . . :.
CCDS54 QA-EAMKAPELKEKLEESEKLIKELTVTWEEKLRKTEEIAQERQRQLESMGISLEMSGIK
390 400 410 420 430 440
630 640 650 660 670 680
pF1KB8 YEEKLNILKESLTSFYQEEIQERDEKIEELEALLQEARQQSVAHQQSGSELALRRSQRLA
CCDS54 VGDDKCYLVNLNADPALNELLVYYLKDHTRVGADTSQDIQLFGIGIQPQHCEIDIASDGD
450 460 470 480 490 500
>>CCDS54968.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1770 aa)
initn: 543 init1: 219 opt: 476 Z-score: 325.9 bits: 72.5 E(32554): 7.8e-12
Smith-Waterman score: 488; 33.7% identity (64.4% similar) in 326 aa overlap (299-617:143-437)
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 QCTSSSQLDETSHRWAQPDTAPLPVPANIRFSIWISFFEIYNELLYDLLEPPSQQRKRQT
:.. .:..::::: . :::.: .. ::.
CCDS54 MGHAEQLGLIPRLCCALFKRISLEQNESQTFKVEVSYMEIYNEKVRDLLDPKGS---RQS
120 130 140 150 160
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 LRLCEDQNGNPYVKDLNWIHVQDAEEAWKLLKVGRKNQSFASTHLNQNSSRSHSIFSIRI
:.. : . .::: :. . : . :. .:.. : :... :.:..:..:::::..:.: :
CCDS54 LKVREHKVLGPYVDGLSQLAVTSFEDIESLMSEGNKSRTVAATNMNEESSRSHAVFNIII
170 180 190 200 210 220
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 ---LHLQGEGDIVPKISELSLCDLAGSERC-KDQKSGERLKEAGNINTSLHTLGRCIAAL
:. :. :.:..:: ::::::: : .::::::..::: :: ::: :..:
CCDS54 TQTLYDLQSGNSGEKVSKVSLVDLAGSERVSKTGAAGERLKEGSNINKSLTTLGLVISSL
230 240 250 260 270 280
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 RQNQQNRSKQNLVPFRDSKLTRVFQGFFTGRGRSCMIVNVNPCASTYDETLHVAKFSAIA
.. ...:...::.::: :: ... . : ... ::....: :..:.::: . ... :
CCDS54 ADQAAGKGKSKFVPYRDSVLTWLLKDNLGGNSQTSMIATISPAADNYEETLSTLRYADRA
290 300 310 320 330 340
510 520 530 540 550 560
pF1KB8 SQLVHAPPMQLGFPSLHSFIKEHSLQVSPSLEKGAKADTGLDDDIENEADISMYGKEELL
...:. :. ..: . .::. : ...:. .:.:
CCDS54 KRIVN-----------HAVVNE---------DPNAKVIRELREEVEKL-------REQLS
350 360 370 380
570 580 590 600 610 620
pF1KB8 QVVEAMKTLLLKER---QEKLQLEMHLRDEICNEMVEQMQQREQWCSEHLDTQKELLEEM
:. ::::. :::. .::: :. . : . .:.. :..: : . . :.
CCDS54 QA-EAMKAPELKEKLEESEKLIKELTVTWEEKLRKTEEIAQERQRQLESMGISLEMSGIK
390 400 410 420 430 440
630 640 650 660 670 680
pF1KB8 YEEKLNILKESLTSFYQEEIQERDEKIEELEALLQEARQQSVAHQQSGSELALRRSQRLA
CCDS54 VGDDKCYLVNLNADPALNELLVYYLKDHTRVGADTSQDIQLFGIGIQPQHCEIDIASDGD
450 460 470 480 490 500
>>CCDS47381.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1805 aa)
initn: 543 init1: 219 opt: 476 Z-score: 325.8 bits: 72.5 E(32554): 7.9e-12
Smith-Waterman score: 488; 33.7% identity (64.4% similar) in 326 aa overlap (299-617:143-437)
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 QCTSSSQLDETSHRWAQPDTAPLPVPANIRFSIWISFFEIYNELLYDLLEPPSQQRKRQT
:.. .:..::::: . :::.: .. ::.
CCDS47 MGHAEQLGLIPRLCCALFKRISLEQNESQTFKVEVSYMEIYNEKVRDLLDPKGS---RQS
120 130 140 150 160
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 LRLCEDQNGNPYVKDLNWIHVQDAEEAWKLLKVGRKNQSFASTHLNQNSSRSHSIFSIRI
:.. : . .::: :. . : . :. .:.. : :... :.:..:..:::::..:.: :
CCDS47 LKVREHKVLGPYVDGLSQLAVTSFEDIESLMSEGNKSRTVAATNMNEESSRSHAVFNIII
170 180 190 200 210 220
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 ---LHLQGEGDIVPKISELSLCDLAGSERC-KDQKSGERLKEAGNINTSLHTLGRCIAAL
:. :. :.:..:: ::::::: : .::::::..::: :: ::: :..:
CCDS47 TQTLYDLQSGNSGEKVSKVSLVDLAGSERVSKTGAAGERLKEGSNINKSLTTLGLVISSL
230 240 250 260 270 280
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 RQNQQNRSKQNLVPFRDSKLTRVFQGFFTGRGRSCMIVNVNPCASTYDETLHVAKFSAIA
.. ...:...::.::: :: ... . : ... ::....: :..:.::: . ... :
CCDS47 ADQAAGKGKSKFVPYRDSVLTWLLKDNLGGNSQTSMIATISPAADNYEETLSTLRYADRA
290 300 310 320 330 340
510 520 530 540 550 560
pF1KB8 SQLVHAPPMQLGFPSLHSFIKEHSLQVSPSLEKGAKADTGLDDDIENEADISMYGKEELL
...:. :. ..: . .::. : ...:. .:.:
CCDS47 KRIVN-----------HAVVNE---------DPNAKVIRELREEVEKL-------REQLS
350 360 370 380
570 580 590 600 610 620
pF1KB8 QVVEAMKTLLLKER---QEKLQLEMHLRDEICNEMVEQMQQREQWCSEHLDTQKELLEEM
:. ::::. :::. .::: :. . : . .:.. :..: : . . :.
CCDS47 QA-EAMKAPELKEKLEESEKLIKELTVTWEEKLRKTEEIAQERQRQLESMGISLEMSGIK
390 400 410 420 430 440
630 640 650 660 670 680
pF1KB8 YEEKLNILKESLTSFYQEEIQERDEKIEELEALLQEARQQSVAHQQSGSELALRRSQRLA
CCDS47 VGDDKCYLVNLNADPALNELLVYYLKDHTRVGADTSQDIQLFGIGIQPQHCEIDIASDGD
450 460 470 480 490 500
890 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 20:24:29 2016 done: Sat Nov 5 20:24:29 2016
Total Scan time: 4.760 Total Display time: 0.210
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]