FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB8580, 482 aa 1>>>pF1KB8580 482 - 482 aa - 482 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0885+/-0.000844; mu= 7.3947+/- 0.052 mean_var=167.9761+/-34.036, 0's: 0 Z-trim(113.6): 82 B-trim: 11 in 1/49 Lambda= 0.098958 statistics sampled from 14133 (14216) to 14133 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.738), E-opt: 0.2 (0.437), width: 16 Scan time: 3.230 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS10322.1 BTBD1 gene_id:53339|Hs108|chr15 ( 482) 3215 470.7 1.6e-132 CCDS12078.1 BTBD2 gene_id:55643|Hs108|chr19 ( 525) 2496 368.0 1.3e-101 CCDS32313.1 BTBD1 gene_id:53339|Hs108|chr15 ( 385) 2345 346.4 3.2e-95 CCDS10002.2 BTBD6 gene_id:90135|Hs108|chr14 ( 485) 1305 198.0 1.9e-50 CCDS13114.1 BTBD3 gene_id:22903|Hs108|chr20 ( 461) 1244 189.3 7.7e-48 CCDS13113.1 BTBD3 gene_id:22903|Hs108|chr20 ( 522) 1244 189.3 8.5e-48 >>CCDS10322.1 BTBD1 gene_id:53339|Hs108|chr15 (482 aa) initn: 3215 init1: 3215 opt: 3215 Z-score: 2492.8 bits: 470.7 E(32554): 1.6e-132 Smith-Waterman score: 3215; 100.0% identity (100.0% similar) in 482 aa overlap (1-482:1-482) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MASLGPAAAGEQASGAEAEPGPAGPPPPPSPSSLGPLLPLQREPLYNWQATKASLKERFA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 MASLGPAAAGEQASGAEAEPGPAGPPPPPSPSSLGPLLPLQREPLYNWQATKASLKERFA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 FLFNSELLSDVRFVLGKGRGAAAAGGPQRIPAHRFVLAAGSAVFDAMFNGGMATTSAEIE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 FLFNSELLSDVRFVLGKGRGAAAAGGPQRIPAHRFVLAAGSAVFDAMFNGGMATTSAEIE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 LPDVEPAAFLALLRFLYSDEVQIGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLTKHLRADNA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 LPDVEPAAFLALLRFLYSDEVQIGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLTKHLRADNA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB8 FMLLTQARLFDEPQLASLCLDTIDKSTMDAISAEGFTDIDIDTLCAVLERDTLSIRESRL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 FMLLTQARLFDEPQLASLCLDTIDKSTMDAISAEGFTDIDIDTLCAVLERDTLSIRESRL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB8 FGAVVRWAEAECQRQQLPVTFGNKQKVLGKALSLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILSDREV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 FGAVVRWAEAECQRQQLPVTFGNKQKVLGKALSLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILSDREV 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB8 VNLFLHFTVNPKPRVEYIDRPRCCLRGKECCINRFQQVESRWGYSGTSDRIRFTVNRRIS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 VNLFLHFTVNPKPRVEYIDRPRCCLRGKECCINRFQQVESRWGYSGTSDRIRFTVNRRIS 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB8 IVGFGLYGSIHGPTDYQVNIQIIEYEKKQTLGQNDTGFSCDGTANTFRVMFKEPIEILPN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 IVGFGLYGSIHGPTDYQVNIQIIEYEKKQTLGQNDTGFSCDGTANTFRVMFKEPIEILPN 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB8 VCYTACATLKGPDSHYGTKGLKKVVHETPAASKTVFFFFSSPGNNNGTSIEDGQIPEIIF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 VCYTACATLKGPDSHYGTKGLKKVVHETPAASKTVFFFFSSPGNNNGTSIEDGQIPEIIF 430 440 450 460 470 480 pF1KB8 YT :: CCDS10 YT >>CCDS12078.1 BTBD2 gene_id:55643|Hs108|chr19 (525 aa) initn: 2397 init1: 2156 opt: 2496 Z-score: 1937.5 bits: 368.0 E(32554): 1.3e-101 Smith-Waterman score: 2496; 77.6% identity (89.0% similar) in 491 aa overlap (7-482:42-525) 10 20 30 pF1KB8 MASLGPAAAGEQASGAEAEPGPAGPPPPPSPSS--- :::. :..: : :::. :: ::.:.. 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CCDS10 MAAELYAPASAAAADLANSNAGAAVGRKAGPRSPPSAPAPAPPPPAPAPPTLGN--NHQE 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KB8 EPLYNWQATKASLKERFAFLFNSELLSDVRFVLGKGRGAAAAGGPQRIPAHRFVLAAGSA : .:. . .:.:: :..::.::..::.::.: :. . .:::..:::.::. CCDS10 SP--GWRCCRPTLRERNALMFNNELMADVHFVVGP------PGATRTVPAHKYVLAVGSS 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KB8 VFDAMFNGGMATTSAEIELPDVEPAAFLALLRFLYSDEVQIGPETVMTTLYTAKKYAVPA :: ::: : .: ...::..::::::::: ::...::::... .::..:::.:::: ::: CCDS10 VFYAMFYGDLAEVKSEIHIPDVEPAAFLILLKYMYSDEIDLEADTVLATLYAAKKYIVPA 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KB8 LEAHCVEFLTKHLRADNAFMLLTQARLFDEPQLASLCLDTIDKSTMDAISAEGFTDIDID : ::.:: :.: :: .::.:.:::.::.:.. : ..:: .. :. .::: .:: . CCDS10 LAKACVNFLETSLEAKNACVLLSQSRLFEEPELTQRCWEVIDAQAEMALRSEGFCEIDRQ 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KB8 TLCAVLERDTLSIRESRLFGAVVRWAEAECQRQQLPVTFGNKQKVLGKALSLIRFPLMTI :: .. :..:. .:. .: ::. ::::::.:: ::.: ::..:::.:: :.:.: ::. 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CCDS13 CGSAEYSAKIEL----KRQGVVLGQNLSKYFSDGSSNTFPVWFEYPVQIEPDTFYTASVI 420 430 440 450 460 470 430 440 450 460 470 480 pF1KB8 LKGPD-SHYGTKGLKKVVHETPAASKTVFFFFSSPGNNNGTSIEDGQIPEIIFYT : : . :..: .:. .: .:.. : : ..:::... :::::.::: CCDS13 LDGNELSYFGQEGMTEV-----QCGKVTVQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPELIFYA 480 490 500 510 520 482 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Fri Nov 4 13:30:41 2016 done: Fri Nov 4 13:30:42 2016 Total Scan time: 3.230 Total Display time: 0.040 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]