Result of FASTA (ccds) for pF1KB8622
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8622, 839 aa
  1>>>pF1KB8622 839 - 839 aa - 839 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3415+/-0.00125; mu= 6.8499+/- 0.074
 mean_var=243.9092+/-53.832, 0's: 0 Z-trim(109.1): 166  B-trim: 380 in 2/50
 Lambda= 0.082122
 statistics sampled from 10438 (10629) to 10438 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.683), E-opt: 0.2 (0.327), width:  16
 Scan time:  3.330

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS6979.1 VAV2 gene_id:7410|Hs108|chr9            ( 839) 5729 693.2  5e-199
CCDS48053.1 VAV2 gene_id:7410|Hs108|chr9           ( 878) 3986 486.7 7.5e-137
CCDS12174.1 VAV1 gene_id:7409|Hs108|chr19          ( 845) 2808 347.1 7.5e-95
CCDS785.1 VAV3 gene_id:10451|Hs108|chr1            ( 847) 2287 285.4 2.9e-76
CCDS59341.1 VAV1 gene_id:7409|Hs108|chr19          ( 823) 2235 279.2   2e-74
CCDS59342.1 VAV1 gene_id:7409|Hs108|chr19          ( 813) 1924 242.3 2.5e-63
CCDS44181.1 VAV3 gene_id:10451|Hs108|chr1          ( 287)  792 107.8 2.9e-23


>>CCDS6979.1 VAV2 gene_id:7410|Hs108|chr9                 (839 aa)
 initn: 5729 init1: 5729 opt: 5729  Z-score: 3686.7  bits: 693.2 E(32554): 5e-199
Smith-Waterman score: 5729; 100.0% identity (100.0% similar) in 839 aa overlap (1-839:1-839)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MEQWRQCGRWLIDCKVLPPNHRVVWPSAVVFDLAQALRDGVLLCQLLHNLSPGSIDLKDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 MEQWRQCGRWLIDCKVLPPNHRVVWPSAVVFDLAQALRDGVLLCQLLHNLSPGSIDLKDI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 NFRPQMSQFLCLKNIRTFLKVCHDKFGLRNSELFDPFDLFDVRDFGKVISAVSRLSLHSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 NFRPQMSQFLCLKNIRTFLKVCHDKFGLRNSELFDPFDLFDVRDFGKVISAVSRLSLHSI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 AQNKGIRPFPSEETTENDDDVYRSLEELADEHDLGEDIYDCVPCEDGGDDIYEDIIKVEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 AQNKGIRPFPSEETTENDDDVYRSLEELADEHDLGEDIYDCVPCEDGGDDIYEDIIKVEV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 QQPMKMGMTEDDKRNCCLLEIQETEAKYYRTLEDIEKNYMSPLRLVLSPADMAAVFINLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 QQPMKMGMTEDDKRNCCLLEIQETEAKYYRTLEDIEKNYMSPLRLVLSPADMAAVFINLE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 DLIKVHHSFLRAIDVSVMVGGSTLAKVFLDFKERLLIYGEYCSHMEHAQNTLNQLLASRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 DLIKVHHSFLRAIDVSVMVGGSTLAKVFLDFKERLLIYGEYCSHMEHAQNTLNQLLASRE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 DFRQKVEECTLKVQDGKFKLQDLLVVPMQRVLKYHLLLKELLSHSAERPERQQLKEALEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 DFRQKVEECTLKVQDGKFKLQDLLVVPMQRVLKYHLLLKELLSHSAERPERQQLKEALEA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 MQDLAMYINEVKRDKETLRKISEFQSSIENLQVKLEEFGRPKIDGELKVRSIVNHTKQDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 MQDLAMYINEVKRDKETLRKISEFQSSIENLQVKLEEFGRPKIDGELKVRSIVNHTKQDR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB8 YLFLFDKVVIVCKRKGYSYELKEIIELLFHKMTDDPMNNKDVKKWSYGFYLIHLQGKQGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 YLFLFDKVVIVCKRKGYSYELKEIIELLFHKMTDDPMNNKDVKKWSYGFYLIHLQGKQGF
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB8 QFFCKTEDMKRKWMEQFEMAMSNIKPDKANANHHSFQMYTFDKTTNCKACKMFLRGTFYQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 QFFCKTEDMKRKWMEQFEMAMSNIKPDKANANHHSFQMYTFDKTTNCKACKMFLRGTFYQ
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB8 GYMCTKCGVGAHKECLEVIPPCKFTSPADLDASGAGPGPKMVAMQNYHGNPAPPGKPVLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 GYMCTKCGVGAHKECLEVIPPCKFTSPADLDASGAGPGPKMVAMQNYHGNPAPPGKPVLT
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB8 FQTGDVLELLRGDPESPWWEGRLVQTRKSGYFPSSSVKPCPVDGRPPISRPPSREIDYTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 FQTGDVLELLRGDPESPWWEGRLVQTRKSGYFPSSSVKPCPVDGRPPISRPPSREIDYTA
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB8 YPWFAGNMERQQTDNLLKSHASGTYLIRERPAEAERFAISIKFNDEVKHIKVVEKDNWIH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 YPWFAGNMERQQTDNLLKSHASGTYLIRERPAEAERFAISIKFNDEVKHIKVVEKDNWIH
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB8 ITEAKKFDSLLELVEYYQCHSLKESFKQLDTTLKYPYKSRERSASRASSRSPVFTPRVIG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 ITEAKKFDSLLELVEYYQCHSLKESFKQLDTTLKYPYKSRERSASRASSRSPVFTPRVIG
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830         
pF1KB8 TAVARYNFAARDMRELSLREGDVVRIYSRIGGDQGWWKGETNGRIGWFPSTYVEEEGIQ
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 TAVARYNFAARDMRELSLREGDVVRIYSRIGGDQGWWKGETNGRIGWFPSTYVEEEGIQ
              790       800       810       820       830         

>>CCDS48053.1 VAV2 gene_id:7410|Hs108|chr9                (878 aa)
 initn: 3897 init1: 2173 opt: 3986  Z-score: 2570.4  bits: 486.7 E(32554): 7.5e-137
Smith-Waterman score: 5621; 95.6% identity (95.6% similar) in 878 aa overlap (1-839:1-878)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MEQWRQCGRWLIDCKVLPPNHRVVWPSAVVFDLAQALRDGVLLCQLLHNLSPGSIDLKDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MEQWRQCGRWLIDCKVLPPNHRVVWPSAVVFDLAQALRDGVLLCQLLHNLSPGSIDLKDI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 NFRPQMSQFLCLKNIRTFLKVCHDKFGLRNSELFDPFDLFDVRDFGKVISAVSRLSLHSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 NFRPQMSQFLCLKNIRTFLKVCHDKFGLRNSELFDPFDLFDVRDFGKVISAVSRLSLHSI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 AQNKGIRPFPSEETTENDDDVYRSLEELADEHDLGEDIYDCVPCEDGGDDIYEDIIKVEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 AQNKGIRPFPSEETTENDDDVYRSLEELADEHDLGEDIYDCVPCEDGGDDIYEDIIKVEV
              130       140       150       160       170       180

                   190       200       210       220       230     
pF1KB8 QQPM-----KMGMTEDDKRNCCLLEIQETEAKYYRTLEDIEKNYMSPLRLVLSPADMAAV
       ::::     :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 QQPMIRYMQKMGMTEDDKRNCCLLEIQETEAKYYRTLEDIEKNYMSPLRLVLSPADMAAV
              190       200       210       220       230       240

         240       250       260       270       280       290     
pF1KB8 FINLEDLIKVHHSFLRAIDVSVMVGGSTLAKVFLDFKERLLIYGEYCSHMEHAQNTLNQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 FINLEDLIKVHHSFLRAIDVSVMVGGSTLAKVFLDFKERLLIYGEYCSHMEHAQNTLNQL
              250       260       270       280       290       300

         300       310       320       330       340       350     
pF1KB8 LASREDFRQKVEECTLKVQDGKFKLQDLLVVPMQRVLKYHLLLKELLSHSAERPERQQLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LASREDFRQKVEECTLKVQDGKFKLQDLLVVPMQRVLKYHLLLKELLSHSAERPERQQLK
              310       320       330       340       350       360

         360       370       380       390       400       410     
pF1KB8 EALEAMQDLAMYINEVKRDKETLRKISEFQSSIENLQVKLEEFGRPKIDGELKVRSIVNH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EALEAMQDLAMYINEVKRDKETLRKISEFQSSIENLQVKLEEFGRPKIDGELKVRSIVNH
              370       380       390       400       410       420

         420       430       440       450       460            470
pF1KB8 TKQDRYLFLFDKVVIVCKRKGYSYELKEIIELLFHKMTDDPMNNKDVKK-----WSYGFY
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::     ::::::
CCDS48 TKQDRYLFLFDKVVIVCKRKGYSYELKEIIELLFHKMTDDPMNNKDVKKSHGKMWSYGFY
              430       440       450       460       470       480

              480       490       500       510       520       530
pF1KB8 LIHLQGKQGFQFFCKTEDMKRKWMEQFEMAMSNIKPDKANANHHSFQMYTFDKTTNCKAC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LIHLQGKQGFQFFCKTEDMKRKWMEQFEMAMSNIKPDKANANHHSFQMYTFDKTTNCKAC
              490       500       510       520       530       540

              540       550       560       570       580       590
pF1KB8 KMFLRGTFYQGYMCTKCGVGAHKECLEVIPPCKFTSPADLDASGAGPGPKMVAMQNYHGN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KMFLRGTFYQGYMCTKCGVGAHKECLEVIPPCKFTSPADLDASGAGPGPKMVAMQNYHGN
              550       560       570       580       590       600

              600       610       620       630       640       650
pF1KB8 PAPPGKPVLTFQTGDVLELLRGDPESPWWEGRLVQTRKSGYFPSSSVKPCPVDGRPPISR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PAPPGKPVLTFQTGDVLELLRGDPESPWWEGRLVQTRKSGYFPSSSVKPCPVDGRPPISR
              610       620       630       640       650       660

              660       670       680       690       700       710
pF1KB8 PPSREIDYTAYPWFAGNMERQQTDNLLKSHASGTYLIRERPAEAERFAISIKFNDEVKHI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PPSREIDYTAYPWFAGNMERQQTDNLLKSHASGTYLIRERPAEAERFAISIKFNDEVKHI
              670       680       690       700       710       720

              720       730       740       750       760       770
pF1KB8 KVVEKDNWIHITEAKKFDSLLELVEYYQCHSLKESFKQLDTTLKYPYKSRERSASRASSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KVVEKDNWIHITEAKKFDSLLELVEYYQCHSLKESFKQLDTTLKYPYKSRERSASRASSR
              730       740       750       760       770       780

                                           780       790       800 
pF1KB8 SP-----------------------------VFTPRVIGTAVARYNFAARDMRELSLREG
       ::                             :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SPASCASYNFSFLSPQGLSFASQGPSAPFWSVFTPRVIGTAVARYNFAARDMRELSLREG
              790       800       810       820       830       840

             810       820       830         
pF1KB8 DVVRIYSRIGGDQGWWKGETNGRIGWFPSTYVEEEGIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 DVVRIYSRIGGDQGWWKGETNGRIGWFPSTYVEEEGIQ
              850       860       870        

>>CCDS12174.1 VAV1 gene_id:7409|Hs108|chr19               (845 aa)
 initn: 2737 init1: 1235 opt: 2808  Z-score: 1816.3  bits: 347.1 E(32554): 7.5e-95
Smith-Waterman score: 2995; 52.0% identity (78.5% similar) in 856 aa overlap (1-836:1-840)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MEQWRQCGRWLIDCKVLPPNHRVVWPSAVVFDLAQALRDGVLLCQLLHNLSPGSIDLKDI
       :: :::: .:::.:.::::.:::.: .: : .:::::::::::::::.:: : .:.:...
CCDS12 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
               10        20        30        40        50        60

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CCDS12 VFQEYYGLPPPPGAIGPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTSTNEIGWFPCNRVKPY
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CCDS12 -VHG------PPQ---DLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAIS
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CCDS12 IKYNVEVKHIKIMTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEP
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CCDS12 EK---RTISRPAVGSTKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNK-KGQQGWWRGE
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CCDS12 IYGRVGWFPANYVEEDYSEYC
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CCDS78 MEPWKQCAQWLIHCKVLPTNHRVTWDSAQVFDLAQTLRDGVLLCQLLNNLRAHSINLKEI
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CCDS78 ALATGIRPFPTEESI-NDEDIYKGLPDLIDETLVEDEEDLYDCVYGEDEGGEVYEDLMKA
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CCDS78 KTKEDVKLKLEECSKRANNGKFTLRDLLVVPMQRVLKYHLLLQELVKHTTDPTEKANLKL
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CCDS78 TFYQGYLCFKCGARAHKECLGRVDNCGRVNSGEQGTLKLPEKRTNGLRRTPKQVDPGLPK
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CCDS78 MQVIRNYSGTP-PPALHEGPPLQLQAGDTVELLKGDAHSLFWQGRNLASGEVGFFPSDAV
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CCDS78 KEPEHSAGQRGNRAGNSLLSPKVLGIAIARYDFCARDMRELSLLKGDVVKIYTKMSAN-G
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CCDS78 WWRGEVNGRVGWFPSTYVEEDE  
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>>CCDS59341.1 VAV1 gene_id:7409|Hs108|chr19               (823 aa)
 initn: 2684 init1: 1235 opt: 2235  Z-score: 1449.6  bits: 279.2 E(32554): 2e-74
Smith-Waterman score: 2899; 50.8% identity (76.8% similar) in 856 aa overlap (1-836:1-818)

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pF1KB8 MEQWRQCGRWLIDCKVLPPNHRVVWPSAVVFDLAQALRDGVLLCQLLHNLSPGSIDLKDI
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CCDS59 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
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pF1KB8 NFRPQMSQFLCLKNIRTFLKVCHDKFGLRNSELFDPFDLFDVRDFGKVISAVSRLSLHSI
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CCDS59 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI
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pF1KB8 AQNKGIRPFPSEETTENDDDVYRSL-EELADEHDLGEDIYDCVPCEDG-GDDIYEDIIKV
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CCDS59 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDTVEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMRS
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pF1KB8 E-VQQPMKMGMTEDDKRNCCLLEIQETEAKYYRTLEDIEKNYMSPLRLVLSPADMAAVFI
       : :..: ::  :: ::: ::: :::.:: ::  :: .:......::.  :.: :.  .::
CCDS59 EPVSMPPKM--TEYDKRCCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFI
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pF1KB8 NLEDLIKVHHSFLRAIDVSVMV-GGSTLAKVFLDFKERLLIYGEYCSHMEHAQNTLNQLL
       :.:::..::  ::. .  .. . :...: .::. .:::.:.::.:::..: :.. :... 
CCDS59 NIEDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVA
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pF1KB8 ASREDFRQKVEECTLKVQDGKFKLQDLLVVPMQRVLKYHLLLKELLSHSAERPERQQLKE
       :.::: ..:.:::. ....:.: :.:::.:::::::::::::.::..:. :  :...:. 
CCDS59 AAREDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRL
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pF1KB8 ALEAMQDLAMYINEVKRDKETLRKISEFQSSIENLQVKLEEFGRPKIDGELKVRSIVNHT
       ::.::.:::. .::::::.::::.:..:: :::::. .: ..::::::::::. :.  ..
CCDS59 ALDAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRS
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CCDS59 KMDRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQG
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pF1KB8 TFYQGYMCTKCGVGAHKECLEVIPPCKFTS---PADL----------DASGAGPG-PKMV
       :::::: : .: ..::::::  .:::   .   :. .          : .    : ::: 
CCDS59 TFYQGYRCHRCRASAHKECLGRVPPCGRHGQDFPGTMKKDKLHRRAQDKKRNELGLPKME
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pF1KB8 AMQNYHGNPAPPGK--PVLTFQTGDVLELLRGDPESPWWEGRLVQTRKSGYFPSSSVKPC
       ..:.:.: : :::   : : .. ::..:: ... :. ::::                   
CCDS59 VFQEYYGLPPPPGAIGPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEG-------------------
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pF1KB8 PVDGRPPISRPPSREIDYTAYPWFAGNMERQQTDNLLKSHASGTYLIRERPAEAERFAIS
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CCDS59 ----------PPQ---DLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAIS
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pF1KB8 IKFNDEVKHIKVVEKDNWIHITEAKKFDSLLELVEYYQCHSLKESFKQLDTTLKYPYKSR
       ::.: ::::::..  ..  .::: : : .: ::::.:: .:::. ::.:::::..:.:  
CCDS59 IKYNVEVKHIKIMTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEP
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pF1KB8 ERSASRASSRSPVFTPRVIGTAVARYNFAARDMRELSLREGDVVRIYSRIGGDQGWWKGE
       :.   :. ::  : . . .::: :::.: :::  ::::.:::...: ..  :.::::.::
CCDS59 EK---RTISRPAVGSTKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNK-KGQQGWWRGE
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pF1KB8 TNGRIGWFPSTYVEEEGIQ  
         ::.::::..::::.     
CCDS59 IYGRVGWFPANYVEEDYSEYC
            810       820   

>>CCDS59342.1 VAV1 gene_id:7409|Hs108|chr19               (813 aa)
 initn: 2752 init1: 1235 opt: 1924  Z-score: 1250.5  bits: 242.3 E(32554): 2.5e-63
Smith-Waterman score: 2816; 49.7% identity (75.8% similar) in 855 aa overlap (1-836:1-808)

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pF1KB8 MEQWRQCGRWLIDCKVLPPNHRVVWPSAVVFDLAQALRDGVLLCQLLHNLSPGSIDLKDI
       :: :::: .:::.:.::::.:::.: .: : .:::::::::::::::.:: : .:.:...
CCDS59 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
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pF1KB8 NFRPQMSQFLCLKNIRTFLKVCHDKFGLRNSELFDPFDLFDVRDFGKVISAVSRLSLHSI
       :.:::::::::::::::::..: .::::. ::::. ::::::.:::::: ..: ::   :
CCDS59 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI
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pF1KB8 AQNKGIRPFPSEETTENDDDVYRSL-EELADEHDLGEDIYDCVPCEDG-GDDIYEDIIKV
       :::.:: :::.:: . .:.:.: .: ... :  .  ::.::::  :.. ::.::::... 
CCDS59 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDTVEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMRS
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pF1KB8 EVQQPMKMGMTEDDKRNCCLLEIQETEAKYYRTLEDIEKNYMSPLRLVLSPADMAAVFIN
       :   :..:                               ....::.  :.: :.  .:::
CCDS59 E---PVSM------------------------------PHFLKPLQRFLKPQDIEIIFIN
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pF1KB8 LEDLIKVHHSFLRAIDVSVMV-GGSTLAKVFLDFKERLLIYGEYCSHMEHAQNTLNQLLA
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CCDS59 IEDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAA
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       .::: ..:.:::. ....:.: :.:::.:::::::::::::.::..:. :  :...:. :
CCDS59 AREDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLA
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CCDS59 LDAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSK
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pF1KB8 QDRYLFLFDKVVIVCKRKGYSYELKEIIELLFHKMTDDPMNNKDVKKWSYGFYLIHLQGK
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CCDS59 MDRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGA
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pF1KB8 QGFQFFCKTEDMKRKWMEQFEMAMSNIKPDKANANHHSFQMYTFDKTTNCKACKMFLRGT
       ::...: ::...:.:::::::::.::: :..:.:: :.:::..:..::.::::.:.::::
CCDS59 QGYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRGT
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       ::::: : .: ..::::::  .:::   .   :. .          : .    : ::: .
CCDS59 FYQGYRCHRCRASAHKECLGRVPPCGRHGQDFPGTMKKDKLHRRAQDKKRNELGLPKMEV
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pF1KB8 MQNYHGNPAPPGK--PVLTFQTGDVLELLRGDPESPWWEGRLVQTRKSGYFPSSSVKPCP
       .:.:.: : :::   : : .. ::..:: ... :. ::::: ..: . :.:: . :::  
CCDS59 FQEYYGLPPPPGAIGPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTSTNEIGWFPCNRVKPY-
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pF1KB8 VDGRPPISRPPSREIDYTAYPWFAGNMERQQTDNLLKSHASGTYLIRERPAEAERFAISI
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CCDS59 VHG------PPQ---DLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISI
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pF1KB8 KFNDEVKHIKVVEKDNWIHITEAKKFDSLLELVEYYQCHSLKESFKQLDTTLKYPYKSRE
       :.: ::::::..  ..  .::: : : .: ::::.:: .:::. ::.:::::..:.:  :
CCDS59 KYNVEVKHIKIMTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPE
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pF1KB8 RSASRASSRSPVFTPRVIGTAVARYNFAARDMRELSLREGDVVRIYSRIGGDQGWWKGET
       .   :. ::  : . . .::: :::.: :::  ::::.:::...: ..  :.::::.:: 
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pF1KB8 NGRIGWFPSTYVEEEGIQ  
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CCDS59 YGRVGWFPANYVEEDYSEYC
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>>CCDS44181.1 VAV3 gene_id:10451|Hs108|chr1               (287 aa)
 initn: 691 init1: 427 opt: 792  Z-score: 531.2  bits: 107.8 E(32554): 2.9e-23
Smith-Waterman score: 939; 49.3% identity (78.0% similar) in 282 aa overlap (561-836:16-286)

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pF1KB8 KMFLRGTFYQGYMCTKCGVGAHKECLEVIPPCKFTSPADLDASGAGPG-PKMVAMQNYHG
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CCDS44                MPIFTFLSEQGTLKLPEKRTNGLRRTPKQVDPGLPKMQVIRNYSG
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pF1KB8 NPAPPG---KPVLTFQTGDVLELLRGDPESPWWEGRLVQTRKSGYFPSSSVKPCPVDGRP
       .: ::.    : : .:.::..:::.:: .: .:.:: . . . :.:::..:::::   .:
CCDS44 TP-PPALHEGPPLQLQAGDTVELLKGDAHSLFWQGRNLASGEVGFFPSDAVKPCPCVPKP
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pF1KB8 PISRPPSREIDYTAYPWFAGNMERQQTDNLLKSHASGTYLIRERPAEAERFAISIKFNDE
                .::.  ::.:: ::: :... : .....:::.:.:  :. ..:::::.:.:
CCDS44 ---------VDYSCQPWYAGAMERLQAETELINRVNSTYLVRHRTKESGEYAISIKYNNE
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pF1KB8 VKHIKVVEKDNWIHITEAKKFDSLLELVEYYQCHSLKESFKQLDTTLKYPYKSRERSASR
       .::::.. .:...::.: .:: ::.::::::. :::::.:. :::::..:::  :.::..
CCDS44 AKHIKILTRDGFFHIAENRKFKSLMELVEYYKHHSLKEGFRTLDTTLQFPYKEPEHSAGQ
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pF1KB8 ASSRS--PVFTPRVIGTAVARYNFAARDMRELSLREGDVVRIYSRIGGDQGWWKGETNGR
        ..:.   ...:.:.: :.:::.: ::::::::: .::::.::...... :::.::.:::
CCDS44 RGNRAGNSLLSPKVLGIAIARYDFCARDMRELSLLKGDVVKIYTKMSAN-GWWRGEVNGR
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pF1KB8 IGWFPSTYVEEEGIQ
       .::::::::::.   
CCDS44 VGWFPSTYVEEDE  
          280         




839 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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