FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB8622, 839 aa 1>>>pF1KB8622 839 - 839 aa - 839 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3415+/-0.00125; mu= 6.8499+/- 0.074 mean_var=243.9092+/-53.832, 0's: 0 Z-trim(109.1): 166 B-trim: 380 in 2/50 Lambda= 0.082122 statistics sampled from 10438 (10629) to 10438 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.683), E-opt: 0.2 (0.327), width: 16 Scan time: 3.330 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS6979.1 VAV2 gene_id:7410|Hs108|chr9 ( 839) 5729 693.2 5e-199 CCDS48053.1 VAV2 gene_id:7410|Hs108|chr9 ( 878) 3986 486.7 7.5e-137 CCDS12174.1 VAV1 gene_id:7409|Hs108|chr19 ( 845) 2808 347.1 7.5e-95 CCDS785.1 VAV3 gene_id:10451|Hs108|chr1 ( 847) 2287 285.4 2.9e-76 CCDS59341.1 VAV1 gene_id:7409|Hs108|chr19 ( 823) 2235 279.2 2e-74 CCDS59342.1 VAV1 gene_id:7409|Hs108|chr19 ( 813) 1924 242.3 2.5e-63 CCDS44181.1 VAV3 gene_id:10451|Hs108|chr1 ( 287) 792 107.8 2.9e-23 >>CCDS6979.1 VAV2 gene_id:7410|Hs108|chr9 (839 aa) initn: 5729 init1: 5729 opt: 5729 Z-score: 3686.7 bits: 693.2 E(32554): 5e-199 Smith-Waterman score: 5729; 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CCDS12 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 NFRPQMSQFLCLKNIRTFLKVCHDKFGLRNSELFDPFDLFDVRDFGKVISAVSRLSLHSI :.:::::::::::::::::..: .::::. ::::. ::::::.:::::: ..: :: : CCDS12 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 AQNKGIRPFPSEETTENDDDVYRSL-EELADEHDLGEDIYDCVPCEDG-GDDIYEDIIKV :::.:: :::.:: . .:.:.: .: ... : . ::.:::: :.. ::.::::... CCDS12 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDTVEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMRS 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 E-VQQPMKMGMTEDDKRNCCLLEIQETEAKYYRTLEDIEKNYMSPLRLVLSPADMAAVFI : :..: :: :: ::: ::: :::.:: :: :: .:......::. :.: :. .:: CCDS12 EPVSMPPKM--TEYDKRCCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 NLEDLIKVHHSFLRAIDVSVMV-GGSTLAKVFLDFKERLLIYGEYCSHMEHAQNTLNQLL :.:::..:: ::. . .. . :...: .::. .:::.:.::.:::..: :.. :... CCDS12 NIEDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVA 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 ASREDFRQKVEECTLKVQDGKFKLQDLLVVPMQRVLKYHLLLKELLSHSAERPERQQLKE :.::: ..:.:::. ....:.: :.:::.:::::::::::::.::..:. : :...:. CCDS12 AAREDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRL 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB8 ALEAMQDLAMYINEVKRDKETLRKISEFQSSIENLQVKLEEFGRPKIDGELKVRSIVNHT ::.::.:::. .::::::.::::.:..:: :::::. .: ..::::::::::. :. .. CCDS12 ALDAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRS 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB8 KQDRYLFLFDKVVIVCKRKGYSYELKEIIELLFHKMTDDPMNNKDVKKWSYGFYLIHLQG :.::: ::.::....:::.: ::.::....: .. :: ...: ::::. : ::. :: CCDS12 KMDRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQG 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB8 KQGFQFFCKTEDMKRKWMEQFEMAMSNIKPDKANANHHSFQMYTFDKTTNCKACKMFLRG ::...: ::...:.:::::::::.::: :..:.:: :.:::..:..::.::::.:.::: CCDS12 AQGYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRG 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 pF1KB8 TFYQGYMCTKCGVGAHKECLEVIPPCKFTS---PADL----------DASGAGPG-PKMV :::::: : .: ..:::::: .::: . :. . : . : ::: CCDS12 TFYQGYRCHRCRASAHKECLGRVPPCGRHGQDFPGTMKKDKLHRRAQDKKRNELGLPKME 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KB8 AMQNYHGNPAPPGK--PVLTFQTGDVLELLRGDPESPWWEGRLVQTRKSGYFPSSSVKPC ..:.:.: : ::: : : .. ::..:: ... :. ::::: ..: . :.:: . ::: CCDS12 VFQEYYGLPPPPGAIGPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTSTNEIGWFPCNRVKPY 600 610 620 630 640 650 650 660 670 680 690 700 pF1KB8 PVDGRPPISRPPSREIDYTAYPWFAGNMERQQTDNLLKSHASGTYLIRERPAEAERFAIS : : ::. : ... :.:: ::: ....: ....::.:.:.: .: .:::: CCDS12 -VHG------PPQ---DLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAIS 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 pF1KB8 IKFNDEVKHIKVVEKDNWIHITEAKKFDSLLELVEYYQCHSLKESFKQLDTTLKYPYKSR ::.: ::::::.. .. .::: : : .: ::::.:: .:::. ::.:::::..:.: CCDS12 IKYNVEVKHIKIMTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEP 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 pF1KB8 ERSASRASSRSPVFTPRVIGTAVARYNFAARDMRELSLREGDVVRIYSRIGGDQGWWKGE :. :. :: : . . .::: :::.: ::: ::::.:::...: .. :.::::.:: CCDS12 EK---RTISRPAVGSTKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNK-KGQQGWWRGE 770 780 790 800 810 820 830 pF1KB8 TNGRIGWFPSTYVEEEGIQ ::.::::..::::. CCDS12 IYGRVGWFPANYVEEDYSEYC 830 840 >>CCDS785.1 VAV3 gene_id:10451|Hs108|chr1 (847 aa) initn: 2524 init1: 1847 opt: 2287 Z-score: 1482.7 bits: 285.4 E(32554): 2.9e-76 Smith-Waterman score: 3179; 54.1% identity (80.1% similar) in 861 aa overlap (1-836:1-846) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MEQWRQCGRWLIDCKVLPPNHRVVWPSAVVFDLAQALRDGVLLCQLLHNLSPGSIDLKDI :: :.::..::: ::::: ::::.: :: ::::::.:::::::::::.:: ::.::.: CCDS78 MEPWKQCAQWLIHCKVLPTNHRVTWDSAQVFDLAQTLRDGVLLCQLLNNLRAHSINLKEI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 NFRPQMSQFLCLKNIRTFLKVCHDKFGLRNSELFDPFDLFDVRDFGKVISAVSRLSLHSI :.::::::::::::::::: .: . ::.:.::::. ::::::::::::: ..:::: : CCDS78 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLTACCETFGMRKSELFEAFDLFDVRDFGKVIETLSRLSRTPI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 AQNKGIRPFPSEETTENDDDVYRSLEELADEH--DLGEDIYDCVPCEDGGDDIYEDIIKV : ::::::.::. ::.:.:..: .: :: . ::.:::: :: : ..:::..:. CCDS78 ALATGIRPFPTEESI-NDEDIYKGLPDLIDETLVEDEEDLYDCVYGEDEGGEVYEDLMKA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 E-VQQPMKMGMTEDDKRNCCLLEIQETEAKYYRTLEDIEKNYMSPLRLVLSPADMAAVFI : ..:: :.: :.::: ::..:: :: .:::.::: .:.::. :. :.. .::: CCDS78 EEAHQPK---CPENDIRSCCLAEIKQTEEKYTETLESIEKYFMAPLKRFLTAAEFDSVFI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 NLEDLIKVHHSFLRAI-DVSVMVGGSTLAKVFLDFKERLLIYGEYCSHMEHAQNTLNQLL :. .:.:.:..... : : : . ..: .::...::::.:::.::: .: : ..:. . CCDS78 NIPELVKLHRNLMQEIHDSIVNKNDQNLYQVFINYKERLVIYGQYCSGVESAISSLDYIS 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 ASREDFRQKVEECTLKVQDGKFKLQDLLVVPMQRVLKYHLLLKELLSHSAERPERQQLKE ..:: . :.:::. ....::: :.:::::::::::::::::.::..:... :. .:: CCDS78 KTKEDVKLKLEECSKRANNGKFTLRDLLVVPMQRVLKYHLLLQELVKHTTDPTEKANLKL 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB8 ALEAMQDLAMYINEVKRDKETLRKISEFQSSIENLQVKLEEFGRPKIDGELKVRSIVNHT ::.::.:::.:.::::::.::::.:..:: :::::. . ::::. :::... .. .:: CCDS78 ALDAMKDLAQYVNEVKRDNETLREIKQFQLSIENLNQPVLLFGRPQGDGEIRITTLDKHT 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB8 KQDRYLFLFDKVVIVCKRKGYSYELKEIIELLFHKMTDDPMNNKDVKKWSYGFYLIHLQG ::.:..:::: .:::::::: .::.::::.: .:....: ..:. ::::::::::: :: CCDS78 KQERHIFLFDLAVIVCKRKGDNYEMKEIIDLQQYKIANNPTTDKENKKWSYGFYLIHTQG 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB8 KQGFQFFCKTEDMKRKWMEQFEMAMSNIKPDKANANHHSFQMYTFDKTTNCKACKMFLRG ..:..:.:::.:.:.::.::::::.:::.:: :..: :.:.:.:: ..:.::.:.:.::: CCDS78 QNGLEFYCKTKDLKKKWLEQFEMALSNIRPDYADSNFHDFKMHTFTRVTSCKVCQMLLRG 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 pF1KB8 TFYQGYMCTKCGVGAHKECLEVIPPC---------------KFTSPADLDASGAGPG-PK ::::::.: :::. :::::: . : : :. . . :: :: CCDS78 TFYQGYLCFKCGARAHKECLGRVDNCGRVNSGEQGTLKLPEKRTNGLRRTPKQVDPGLPK 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 pF1KB8 MVAMQNYHGNPAPPG---KPVLTFQTGDVLELLRGDPESPWWEGRLVQTRKSGYFPSSSV : ...:: :.: ::. : : .:.::..:::.:: .: .:.:: . . . :.:::..: CCDS78 MQVIRNYSGTP-PPALHEGPPLQLQAGDTVELLKGDAHSLFWQGRNLASGEVGFFPSDAV 600 610 620 630 640 650 640 650 660 670 680 690 pF1KB8 KPCPVDGRPPISRPPSREIDYTAYPWFAGNMERQQTDNLLKSHASGTYLIRERPAEAERF :::: .: .::. ::.:: ::: :... : .....:::.:.: :. .. CCDS78 KPCPCVPKP---------VDYSCQPWYAGAMERLQAETELINRVNSTYLVRHRTKESGEY 660 670 680 690 700 700 710 720 730 740 750 pF1KB8 AISIKFNDEVKHIKVVEKDNWIHITEAKKFDSLLELVEYYQCHSLKESFKQLDTTLKYPY :::::.:.:.::::.. .:...::.: .:: ::.::::::. :::::.:. :::::..:: CCDS78 AISIKYNNEAKHIKILTRDGFFHIAENRKFKSLMELVEYYKHHSLKEGFRTLDTTLQFPY 710 720 730 740 750 760 760 770 780 790 800 810 pF1KB8 KSRERSASRASSRS--PVFTPRVIGTAVARYNFAARDMRELSLREGDVVRIYSRIGGDQG : :.::.. ..:. ...:.:.: :.:::.: ::::::::: .::::.::...... : CCDS78 KEPEHSAGQRGNRAGNSLLSPKVLGIAIARYDFCARDMRELSLLKGDVVKIYTKMSAN-G 770 780 790 800 810 820 820 830 pF1KB8 WWKGETNGRIGWFPSTYVEEEGIQ ::.::.:::.::::::::::. CCDS78 WWRGEVNGRVGWFPSTYVEEDE 830 840 >>CCDS59341.1 VAV1 gene_id:7409|Hs108|chr19 (823 aa) initn: 2684 init1: 1235 opt: 2235 Z-score: 1449.6 bits: 279.2 E(32554): 2e-74 Smith-Waterman score: 2899; 50.8% identity (76.8% similar) in 856 aa overlap (1-836:1-818) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MEQWRQCGRWLIDCKVLPPNHRVVWPSAVVFDLAQALRDGVLLCQLLHNLSPGSIDLKDI :: :::: .:::.:.::::.:::.: .: : .:::::::::::::::.:: : .:.:... CCDS59 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 NFRPQMSQFLCLKNIRTFLKVCHDKFGLRNSELFDPFDLFDVRDFGKVISAVSRLSLHSI :.:::::::::::::::::..: .::::. ::::. ::::::.:::::: ..: :: : CCDS59 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 AQNKGIRPFPSEETTENDDDVYRSL-EELADEHDLGEDIYDCVPCEDG-GDDIYEDIIKV :::.:: :::.:: . .:.:.: .: ... : . ::.:::: :.. ::.::::... CCDS59 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDTVEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMRS 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 E-VQQPMKMGMTEDDKRNCCLLEIQETEAKYYRTLEDIEKNYMSPLRLVLSPADMAAVFI : :..: :: :: ::: ::: :::.:: :: :: .:......::. :.: :. .:: CCDS59 EPVSMPPKM--TEYDKRCCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 NLEDLIKVHHSFLRAIDVSVMV-GGSTLAKVFLDFKERLLIYGEYCSHMEHAQNTLNQLL :.:::..:: ::. . .. . :...: .::. .:::.:.::.:::..: :.. :... CCDS59 NIEDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVA 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 ASREDFRQKVEECTLKVQDGKFKLQDLLVVPMQRVLKYHLLLKELLSHSAERPERQQLKE :.::: ..:.:::. ....:.: :.:::.:::::::::::::.::..:. : :...:. CCDS59 AAREDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRL 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB8 ALEAMQDLAMYINEVKRDKETLRKISEFQSSIENLQVKLEEFGRPKIDGELKVRSIVNHT ::.::.:::. .::::::.::::.:..:: :::::. .: ..::::::::::. :. .. CCDS59 ALDAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRS 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB8 KQDRYLFLFDKVVIVCKRKGYSYELKEIIELLFHKMTDDPMNNKDVKKWSYGFYLIHLQG :.::: ::.::....:::.: ::.::....: .. :: ...: ::::. : ::. :: CCDS59 KMDRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQG 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB8 KQGFQFFCKTEDMKRKWMEQFEMAMSNIKPDKANANHHSFQMYTFDKTTNCKACKMFLRG ::...: ::...:.:::::::::.::: :..:.:: :.:::..:..::.::::.:.::: CCDS59 AQGYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRG 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 pF1KB8 TFYQGYMCTKCGVGAHKECLEVIPPCKFTS---PADL----------DASGAGPG-PKMV :::::: : .: ..:::::: .::: . :. . : . : ::: CCDS59 TFYQGYRCHRCRASAHKECLGRVPPCGRHGQDFPGTMKKDKLHRRAQDKKRNELGLPKME 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KB8 AMQNYHGNPAPPGK--PVLTFQTGDVLELLRGDPESPWWEGRLVQTRKSGYFPSSSVKPC ..:.:.: : ::: : : .. ::..:: ... :. :::: CCDS59 VFQEYYGLPPPPGAIGPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEG------------------- 600 610 620 630 650 660 670 680 690 700 pF1KB8 PVDGRPPISRPPSREIDYTAYPWFAGNMERQQTDNLLKSHASGTYLIRERPAEAERFAIS ::. : ... :.:: ::: ....: ....::.:.:.: .: .:::: CCDS59 ----------PPQ---DLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAIS 640 650 660 670 680 710 720 730 740 750 760 pF1KB8 IKFNDEVKHIKVVEKDNWIHITEAKKFDSLLELVEYYQCHSLKESFKQLDTTLKYPYKSR ::.: ::::::.. .. .::: : : .: ::::.:: .:::. ::.:::::..:.: CCDS59 IKYNVEVKHIKIMTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEP 690 700 710 720 730 740 770 780 790 800 810 820 pF1KB8 ERSASRASSRSPVFTPRVIGTAVARYNFAARDMRELSLREGDVVRIYSRIGGDQGWWKGE :. :. :: : . . .::: :::.: ::: ::::.:::...: .. :.::::.:: CCDS59 EK---RTISRPAVGSTKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNK-KGQQGWWRGE 750 760 770 780 790 800 830 pF1KB8 TNGRIGWFPSTYVEEEGIQ ::.::::..::::. CCDS59 IYGRVGWFPANYVEEDYSEYC 810 820 >>CCDS59342.1 VAV1 gene_id:7409|Hs108|chr19 (813 aa) initn: 2752 init1: 1235 opt: 1924 Z-score: 1250.5 bits: 242.3 E(32554): 2.5e-63 Smith-Waterman score: 2816; 49.7% identity (75.8% similar) in 855 aa overlap (1-836:1-808) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MEQWRQCGRWLIDCKVLPPNHRVVWPSAVVFDLAQALRDGVLLCQLLHNLSPGSIDLKDI :: :::: .:::.:.::::.:::.: .: : .:::::::::::::::.:: : .:.:... CCDS59 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 NFRPQMSQFLCLKNIRTFLKVCHDKFGLRNSELFDPFDLFDVRDFGKVISAVSRLSLHSI :.:::::::::::::::::..: .::::. ::::. ::::::.:::::: ..: :: : CCDS59 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 AQNKGIRPFPSEETTENDDDVYRSL-EELADEHDLGEDIYDCVPCEDG-GDDIYEDIIKV :::.:: :::.:: . .:.:.: .: ... : . ::.:::: :.. ::.::::... CCDS59 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDTVEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMRS 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 EVQQPMKMGMTEDDKRNCCLLEIQETEAKYYRTLEDIEKNYMSPLRLVLSPADMAAVFIN : :..: ....::. :.: :. .::: CCDS59 E---PVSM------------------------------PHFLKPLQRFLKPQDIEIIFIN 190 200 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 LEDLIKVHHSFLRAIDVSVMV-GGSTLAKVFLDFKERLLIYGEYCSHMEHAQNTLNQLLA .:::..:: ::. . .. . :...: .::. .:::.:.::.:::..: :.. :... : CCDS59 IEDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAA 210 220 230 240 250 260 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 SREDFRQKVEECTLKVQDGKFKLQDLLVVPMQRVLKYHLLLKELLSHSAERPERQQLKEA .::: ..:.:::. ....:.: :.:::.:::::::::::::.::..:. : :...:. : CCDS59 AREDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLA 270 280 290 300 310 320 360 370 380 390 400 410 pF1KB8 LEAMQDLAMYINEVKRDKETLRKISEFQSSIENLQVKLEEFGRPKIDGELKVRSIVNHTK :.::.:::. .::::::.::::.:..:: :::::. .: ..::::::::::. :. ..: CCDS59 LDAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSK 330 340 350 360 370 380 420 430 440 450 460 470 pF1KB8 QDRYLFLFDKVVIVCKRKGYSYELKEIIELLFHKMTDDPMNNKDVKKWSYGFYLIHLQGK .::: ::.::....:::.: ::.::....: .. :: ...: ::::. : ::. :: CCDS59 MDRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGA 390 400 410 420 430 440 480 490 500 510 520 530 pF1KB8 QGFQFFCKTEDMKRKWMEQFEMAMSNIKPDKANANHHSFQMYTFDKTTNCKACKMFLRGT ::...: ::...:.:::::::::.::: :..:.:: :.:::..:..::.::::.:.:::: CCDS59 QGYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRGT 450 460 470 480 490 500 540 550 560 570 580 pF1KB8 FYQGYMCTKCGVGAHKECLEVIPPCKFTS---PADL----------DASGAGPG-PKMVA ::::: : .: ..:::::: .::: . :. . : . : ::: . CCDS59 FYQGYRCHRCRASAHKECLGRVPPCGRHGQDFPGTMKKDKLHRRAQDKKRNELGLPKMEV 510 520 530 540 550 560 590 600 610 620 630 640 pF1KB8 MQNYHGNPAPPGK--PVLTFQTGDVLELLRGDPESPWWEGRLVQTRKSGYFPSSSVKPCP .:.:.: : ::: : : .. ::..:: ... :. ::::: ..: . :.:: . ::: CCDS59 FQEYYGLPPPPGAIGPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTSTNEIGWFPCNRVKPY- 570 580 590 600 610 620 650 660 670 680 690 700 pF1KB8 VDGRPPISRPPSREIDYTAYPWFAGNMERQQTDNLLKSHASGTYLIRERPAEAERFAISI : : ::. : ... :.:: ::: ....: ....::.:.:.: .: .::::: CCDS59 VHG------PPQ---DLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISI 630 640 650 660 670 710 720 730 740 750 760 pF1KB8 KFNDEVKHIKVVEKDNWIHITEAKKFDSLLELVEYYQCHSLKESFKQLDTTLKYPYKSRE :.: ::::::.. .. .::: : : .: ::::.:: .:::. ::.:::::..:.: : CCDS59 KYNVEVKHIKIMTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPE 680 690 700 710 720 730 770 780 790 800 810 820 pF1KB8 RSASRASSRSPVFTPRVIGTAVARYNFAARDMRELSLREGDVVRIYSRIGGDQGWWKGET . :. :: : . . .::: :::.: ::: ::::.:::...: .. :.::::.:: CCDS59 K---RTISRPAVGSTKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNK-KGQQGWWRGEI 740 750 760 770 780 790 830 pF1KB8 NGRIGWFPSTYVEEEGIQ ::.::::..::::. CCDS59 YGRVGWFPANYVEEDYSEYC 800 810 >>CCDS44181.1 VAV3 gene_id:10451|Hs108|chr1 (287 aa) initn: 691 init1: 427 opt: 792 Z-score: 531.2 bits: 107.8 E(32554): 2.9e-23 Smith-Waterman score: 939; 49.3% identity (78.0% similar) in 282 aa overlap (561-836:16-286) 540 550 560 570 580 pF1KB8 KMFLRGTFYQGYMCTKCGVGAHKECLEVIPPCKFTSPADLDASGAGPG-PKMVAMQNYHG : : :. . . :: ::: ...:: : CCDS44 MPIFTFLSEQGTLKLPEKRTNGLRRTPKQVDPGLPKMQVIRNYSG 10 20 30 40 590 600 610 620 630 640 pF1KB8 NPAPPG---KPVLTFQTGDVLELLRGDPESPWWEGRLVQTRKSGYFPSSSVKPCPVDGRP .: ::. : : .:.::..:::.:: .: .:.:: . . . :.:::..::::: .: CCDS44 TP-PPALHEGPPLQLQAGDTVELLKGDAHSLFWQGRNLASGEVGFFPSDAVKPCPCVPKP 50 60 70 80 90 100 650 660 670 680 690 700 pF1KB8 PISRPPSREIDYTAYPWFAGNMERQQTDNLLKSHASGTYLIRERPAEAERFAISIKFNDE .::. ::.:: ::: :... : .....:::.:.: :. ..:::::.:.: CCDS44 ---------VDYSCQPWYAGAMERLQAETELINRVNSTYLVRHRTKESGEYAISIKYNNE 110 120 130 140 150 710 720 730 740 750 760 pF1KB8 VKHIKVVEKDNWIHITEAKKFDSLLELVEYYQCHSLKESFKQLDTTLKYPYKSRERSASR .::::.. .:...::.: .:: ::.::::::. :::::.:. :::::..::: :.::.. CCDS44 AKHIKILTRDGFFHIAENRKFKSLMELVEYYKHHSLKEGFRTLDTTLQFPYKEPEHSAGQ 160 170 180 190 200 210 770 780 790 800 810 820 pF1KB8 ASSRS--PVFTPRVIGTAVARYNFAARDMRELSLREGDVVRIYSRIGGDQGWWKGETNGR ..:. ...:.:.: :.:::.: ::::::::: .::::.::...... :::.::.::: CCDS44 RGNRAGNSLLSPKVLGIAIARYDFCARDMRELSLLKGDVVKIYTKMSAN-GWWRGEVNGR 220 230 240 250 260 270 830 pF1KB8 IGWFPSTYVEEEGIQ .::::::::::. CCDS44 VGWFPSTYVEEDE 280 839 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 19:47:09 2016 done: Sat Nov 5 19:47:09 2016 Total Scan time: 3.330 Total Display time: 0.180 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]