FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB8628, 841 aa 1>>>pF1KB8628 841 - 841 aa - 841 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2193+/-0.00114; mu= 17.4070+/- 0.069 mean_var=133.9749+/-28.027, 0's: 0 Z-trim(107.7): 177 B-trim: 340 in 1/51 Lambda= 0.110806 statistics sampled from 9541 (9755) to 9541 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.658), E-opt: 0.2 (0.3), width: 16 Scan time: 4.510 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS41903.1 SLITRK6 gene_id:84189|Hs108|chr13 ( 841) 5585 905.3 0 CCDS14679.1 SLITRK4 gene_id:139065|Hs108|chrX ( 837) 1137 194.3 7.5e-49 CCDS9465.1 SLITRK5 gene_id:26050|Hs108|chr13 ( 958) 1085 186.0 2.6e-46 CCDS3197.1 SLITRK3 gene_id:22865|Hs108|chr3 ( 977) 1078 184.9 5.8e-46 CCDS14680.1 SLITRK2 gene_id:84631|Hs108|chrX ( 845) 1015 174.8 5.6e-43 CCDS9464.1 SLITRK1 gene_id:114798|Hs108|chr13 ( 696) 931 161.3 5.4e-39 CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1523) 473 88.4 1e-16 CCDS64311.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1530) 473 88.4 1e-16 CCDS7453.1 SLIT1 gene_id:6585|Hs108|chr10 (1534) 465 87.1 2.5e-16 CCDS75110.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1525) 463 86.8 3.1e-16 CCDS75111.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1521) 457 85.8 6e-16 CCDS3426.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1529) 457 85.8 6e-16 CCDS3306.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3 ( 581) 369 71.3 5.3e-12 CCDS46984.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3 ( 587) 369 71.4 5.3e-12 CCDS34969.1 LRRC24 gene_id:441381|Hs108|chr8 ( 513) 359 69.7 1.5e-11 CCDS2876.1 LRTM1 gene_id:57408|Hs108|chr3 ( 345) 351 68.2 2.7e-11 CCDS13121.1 FLRT3 gene_id:23767|Hs108|chr20 ( 649) 349 68.2 5.2e-11 >>CCDS41903.1 SLITRK6 gene_id:84189|Hs108|chr13 (841 aa) initn: 5585 init1: 5585 opt: 5585 Z-score: 4833.3 bits: 905.3 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5585; 100.0% identity (100.0% similar) in 841 aa overlap (1-841:1-841) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MKLWIHLFYSSLLACISLHSQTPVLSSRGSCDSLCNCEEKDGTMLINCEAKGIKMVSEIS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 MKLWIHLFYSSLLACISLHSQTPVLSSRGSCDSLCNCEEKDGTMLINCEAKGIKMVSEIS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 VPPSRPFQLSLLNNGLTMLHTNDFSGLTNAISIHLGFNNIADIEIGAFNGLGLLKQLHIN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 VPPSRPFQLSLLNNGLTMLHTNDFSGLTNAISIHLGFNNIADIEIGAFNGLGLLKQLHIN 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 HNSLEILKEDTFHGLENLEFLQADNNFITVIEPSAFSKLNRLKVLILNDNAIESLPPNIF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 HNSLEILKEDTFHGLENLEFLQADNNFITVIEPSAFSKLNRLKVLILNDNAIESLPPNIF 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB8 RFVPLTHLDLRGNQLQTLPYVGFLEHIGRILDLQLEDNKWACNCDLLQLKTWLENMPPQS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 RFVPLTHLDLRGNQLQTLPYVGFLEHIGRILDLQLEDNKWACNCDLLQLKTWLENMPPQS 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB8 IIGDVVCNSPPFFKGSILSRLKKESICPTPPVYEEHEDPSGSLHLAATSSINDSRMSTKT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 IIGDVVCNSPPFFKGSILSRLKKESICPTPPVYEEHEDPSGSLHLAATSSINDSRMSTKT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB8 TSILKLPTKAPGLIPYITKPSTQLPGPYCPIPCNCKVLSPSGLLIHCQERNIESLSDLRP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 TSILKLPTKAPGLIPYITKPSTQLPGPYCPIPCNCKVLSPSGLLIHCQERNIESLSDLRP 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB8 PPQNPRKLILAGNIIHSLMKSDLVEYFTLEMLHLGNNRIEVLEEGSFMNLTRLQKLYLNG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 PPQNPRKLILAGNIIHSLMKSDLVEYFTLEMLHLGNNRIEVLEEGSFMNLTRLQKLYLNG 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB8 NHLTKLSKGMFLGLHNLEYLYLEYNAIKEILPGTFNPMPKLKVLYLNNNLLQVLPPHIFS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 NHLTKLSKGMFLGLHNLEYLYLEYNAIKEILPGTFNPMPKLKVLYLNNNLLQVLPPHIFS 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB8 GVPLTKVNLKTNQFTHLPVSNILDDLDLLTQIDLEDNPWDCSCDLVGLQQWIQKLSKNTV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 GVPLTKVNLKTNQFTHLPVSNILDDLDLLTQIDLEDNPWDCSCDLVGLQQWIQKLSKNTV 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KB8 TDDILCTSPGHLDKKELKALNSEILCPGLVNNPSMPTQTSYLMVTTPATTTNTADTILRS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 TDDILCTSPGHLDKKELKALNSEILCPGLVNNPSMPTQTSYLMVTTPATTTNTADTILRS 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KB8 LTDAVPLSVLILGLLIMFITIVFCAAGIVVLVLHRRRRYKKKQVDEQMRDNSPVHLQYSM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 LTDAVPLSVLILGLLIMFITIVFCAAGIVVLVLHRRRRYKKKQVDEQMRDNSPVHLQYSM 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KB8 YGHKTTHHTTERPSASLYEQHMVSPMVHVYRSPSFGPKHLEEEEERNEKEGSDAKHLQRS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 YGHKTTHHTTERPSASLYEQHMVSPMVHVYRSPSFGPKHLEEEEERNEKEGSDAKHLQRS 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KB8 LLEQENHSPLTGSNMKYKTTNQSTEFLSFQDASSLYRNILEKERELQQLGITEYLRKNIA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 LLEQENHSPLTGSNMKYKTTNQSTEFLSFQDASSLYRNILEKERELQQLGITEYLRKNIA 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KB8 QLQPDMEAHYPGAHEELKLMETLMYSRPRKVLVEQTKNEYFELKANLHAEPDYLEVLEQQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS41 QLQPDMEAHYPGAHEELKLMETLMYSRPRKVLVEQTKNEYFELKANLHAEPDYLEVLEQQ 790 800 810 820 830 840 pF1KB8 T : CCDS41 T >>CCDS14679.1 SLITRK4 gene_id:139065|Hs108|chrX (837 aa) initn: 2022 init1: 887 opt: 1137 Z-score: 990.5 bits: 194.3 E(32554): 7.5e-49 Smith-Waterman score: 2092; 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CCDS14 MFLWLFLILSALISSTNADSDISVEI----CN-VCSCVSVENVLYVNCEKVSVYRPNQLK 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 VPPSRPFQLSLLNNGLTMLHTNDFSGLTNAISIHLGFNNIADIEIGAFNGLGLLKQLHIN : : ..:.. :: :..:. : : ....:.:.::: :.. .:: ::: ::. :::::.: CCDS14 PPWSNFYHLNFQNNFLNILYPNTFLNFSHAVSLHLGNNKLQNIEGGAFLGLSALKQLHLN 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 HNSLEILKEDTFHGLENLEFLQADNNFITVIEPSAFSKLNRLKVLILNDNAIESLPPNIF .: :.::. ::: :.::::.:::: :.: :: .::.::..::::::::: : :: ::: CCDS14 NNELKILRADTFLGIENLEYLQADYNLIKYIERGAFNKLHKLKVLILNDNLISFLPDNIF 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB8 RFVPLTHLDLRGNQLQTLPYVGFLEHIGRILDLQLEDNKWACNCDLLQLKTWLENMPPQS ::. :::::.:::..: :::.: ::::::...:::::: : :.:::: ::.:::::: . CCDS14 RFASLTHLDIRGNRIQKLPYIGVLEHIGRVVELQLEDNPWNCSCDLLPLKAWLENMPYNI 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 pF1KB8 IIGDVVCNSPPFFKGSILSRLKKESICPT-----------PPVYEE--HEDPSGSLHLAA ::...:..: . : .:.. .:. .:: :: : . :.: : . CCDS14 YIGEAICETPSDLYGRLLKETNKQELCPMGTGSDFDVRILPPSQLENGYTTPNG--HTTQ 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 pF1KB8 TSSINDSRMSTKTTSILKLPTKAPGLIP----------YITKPSTQLPGPY--CPIPCNC :: :. :: . . :.: :.. :.. .:..: : :: :: : CCDS14 TSL---HRLVTKPPKTTN-PSKISGIVAGKALSNRNLSQIVSYQTRVP-PLTPCPAPCFC 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 390 pF1KB8 KVLSPS--GLLIHCQERNIESLSDLRPPPQNPRKLILAGNIIHSLMKSDLVEYFTLEMLH :. :: :: ..:::.::.:.:.: : : : .:: . :: :... ::.... :..:: CCDS14 KT-HPSDLGLSVNCQEKNIQSMSELIPKPLNAKKLHVNGNSIKDVDVSDFTDFEGLDLLH 350 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 450 pF1KB8 LGNNRIEVLEEGSFMNLTRLQKLYLNGNHLTKLSKGMFLGLHNLEYLYLEYNAIKEILPG ::.:.: :.. : ::: :..::::::.. .: .: :::::.::::::: :::: : CCDS14 LGSNQITVIKGDVFHNLTNLRRLYLNGNQIERLYPEIFSGLHNLQYLYLEYNLIKEISAG 410 420 430 440 450 460 460 470 480 490 500 510 pF1KB8 TFNPMPKLKVLYLNNNLLQVLPPHIFSGVPLTKVNLKTNQFTHLPVSNILDDLDLLTQID ::. ::.:..::::::::. :: .::::.::...::..:.: .::::..::.:. ::::: CCDS14 TFDSMPNLQLLYLNNNLLKSLPVYIFSGAPLARLNLRNNKFMYLPVSGVLDQLQSLTQID 470 480 490 500 510 520 520 530 540 550 560 570 pF1KB8 LEDNPWDCSCDLVGLQQWIQKLSKNTVTDDILCTSPGHLDKKELKALNSEILCPGLVNNP :: :::::.::::.:. :..::: . :. .. : .: .. . :::.:..::::: :.:.: CCDS14 LEGNPWDCTCDLVALKLWVEKLSDGIVVKELKCETPVQFANIELKSLKNEILCPKLLNKP 530 540 550 560 570 580 580 590 600 610 620 630 pF1KB8 SMPTQTSYLMVTTPATTTNTADTILRSLTDA-VPLSVLILGLLIMFITIVFCAAGIVVLV : : . .:: : .: .:: . ::::.:::..:...: :: : ..:.: CCDS14 SAPFTSP-----APAITFTTPLGPIRSPPGGPVPLSILILSILVVLILTVFVAFCLLVFV 590 600 610 620 630 640 640 650 660 670 680 690 pF1KB8 LHRRRRYKKKQVDEQMRDNSPVHLQYSMYGHKTTHHTTERPSASLYEQHMVSPMVHVYRS :.: .. :. : . ..:: . ::: ... . : : . . . .. .: CCDS14 LRRNKKPTVKHEGLGNPDCGSMQLQLRKHDHKT----NKKDGLST-EAFIPQTIEQMSKS 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 pF1KB8 PSFGPKHLEEEEERNEKEGSDAKHLQRSLLEQENHSPLTGSNMKYKTTNQSTEFLSFQDA . : :. : .. :. : ..:.. ..:. . . . .: .. :.. .:. CCDS14 HTCGLKESETGFMFSDPPGQ--KVVMRNVADKEKDLLHVDTRKRLSTIDELDELFPSRDS 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 pF1KB8 SSLYRNILEKERELQQLGITEYLRKNIAQLQPDMEAHYPGAHEELKLMETLMYSRPRKVL . . .:.::...: ...:.. . : .:: . . : ..:. . :.. CCDS14 NVFIQNFLESKKEYNSIGVSGF------------EIRYPEKQPDKKSKKSLIGGNHSKIV 760 770 780 790 800 820 830 840 pF1KB8 VEQTKNEYFELKANLHAEPDYLEVLEQQT ::: :.:::::::.:.. ::::.:::.:: CCDS14 VEQRKSEYFELKAKLQSSPDYLQVLEEQTALNKI 810 820 830 >>CCDS9465.1 SLITRK5 gene_id:26050|Hs108|chr13 (958 aa) initn: 2108 init1: 906 opt: 1085 Z-score: 944.9 bits: 186.0 E(32554): 2.6e-46 Smith-Waterman score: 1980; 40.1% identity (69.3% similar) in 825 aa overlap (31-764:48-863) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MKLWIHLFYSSLLACISLHSQTPVLSSRGSCDSLCNCEEKDGTMLINCEAKGIKMVSEIS ::. : :::::: . ..:: .:: .:::: CCDS94 MHSWMLQTLAFAVTSLVLSCAETIDYYGEICDNACPCEEKDGILTVSCENRGIISLSEIS 20 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 pF1KB8 VPPSRP-FQLSLLNNGLTMLHTNDFSGLTNAISIHLGFNNIADIEIGAFNGLGLLKQLHI :: : ..: : .: :. :. :.: . :.: .::: : : ::: :::.:: :..::. CCDS94 -PPRFPIYHLLLSGNLLNRLYPNEFVNYTGASILHLGSNVIQDIETGAFHGLRGLRRLHL 80 90 100 110 120 130 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 NHNSLEILKEDTFHGLENLEFLQADNNFITVIEPSAFSKLNRLKVLILNDNAIESLPPNI :.:.::.:..::: ::::::.::.: :.:.::::.::.::. :.::::::: . ::: :. CCDS94 NNNKLELLRDDTFLGLENLEYLQVDYNYISVIEPNAFGKLHLLQVLILNDNLLSSLPNNL 140 150 160 170 180 190 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 FRFVPLTHLDLRGNQLQTLPYVGFLEHIGRILDLQLEDNKWACNCDLLQLKTWLENMPPQ ::::::::::::::.:. :::::.:.:. ....::::.: : :.:.:..:: ::... . CCDS94 FRFVPLTHLDLRGNRLKLLPYVGLLQHMDKVVELQLEENPWNCSCELISLKDWLDSISYS 200 210 220 230 240 250 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 SIIGDVVCNSPPFFKGSILSRLKKESICPTPPVYEEHEDP------SGSLHLAATSSIND ...:::::..: ..: :....:. .:: . . . : .: :: .. .:.:. CCDS94 ALVGDVVCETPFRLHGRDLDEVSKQELCPRRLISDYEMRPQTPLSTTGYLH-TTPASVNS 260 270 280 290 300 310 300 310 320 pF1KB8 SRMSTKTTSILKLPTKAP-GL----IPYITKPSTQLP---------GPY----------- ..:..... : : : : : : . .:... : :: CCDS94 --VATSSSAVYKPPLKPPKGTRQPNKPRV-RPTSRQPSKDLGYSNYGPSIAYQTKSPVPL 320 330 340 350 360 370 330 340 350 360 370 380 pF1KB8 -CPIPCNCKV-LSPSGLLIHCQERNIESLSDLRPPPQNPRKLILAGNIIHSLMKSDLVEY :: :.:.. .: :: ..::::.:::...:.: : ::.:. :. : : . ..:..: CCDS94 ECPTACSCNLQISDLGLNVNCQERKIESIAELQPKPYNPKKMYLTENYIAVVRRTDFLEA 380 390 400 410 420 430 390 400 410 420 430 440 pF1KB8 FTLEMLHLGNNRIEVLEEGSFMNLTRLQKLYLNGNHLTKLSKGMFLGLHNLEYLYLEYNA :..:::::::: .... .: .:: :..::::::.. .:: .: ::..:.::.:.:: CCDS94 TGLDLLHLGNNRISMIQDRAFGDLTNLRRLYLNGNRIERLSPELFYGLQSLQYLFLQYNL 440 450 460 470 480 490 450 460 470 480 490 500 pF1KB8 IKEILPGTFNPMPKLKVLYLNNNLLQVLPPHIFSGVPLTKVNLKTNQFTHLPVSNILDDL :.:: :::.:.:.:..:.:::::::..: .:::. : ..::..:.:: ::::..::.: CCDS94 IREIQSGTFDPVPNLQLLFLNNNLLQAMPSGVFSGLTLLRLNLRSNHFTSLPVSGVLDQL 500 510 520 530 540 550 510 520 530 540 550 560 pF1KB8 DLLTQIDLEDNPWDCSCDLVGLQQWIQKLSKNTVTDDILCTSPGHLDKKELKALNSEILC : ::::.::::::.::.::.. :...:. ....:...: .: .. . ......::.:: CCDS94 KSLIQIDLHDNPWDCTCDIVGMKLWVEQLKVGVLVDEVICKAPKKFAETDMRSIKSELLC 560 570 580 590 600 610 570 580 590 600 610 pF1KB8 PG----LVNNPS-----MPTQTSYLMVTTPATTTNT--ADTILRSLTDA--VPLSVLILG : .:..:. .:..:: ..:::. :. : . : . : ::::::::. CCDS94 PDYSDVVVSTPTPSSIQVPARTS---AVTPAVRLNSTGAPASLGAGGGASSVPLSVLILS 620 630 640 650 660 620 630 640 650 660 pF1KB8 LLIMFITIVFCAAGIVVLVLHRRRRYKKKQVDEQMRDNSPVHLQYSMYG---------HK ::..:: :: :::. :::..::.. .. ... . : : ..:::.:: : CCDS94 LLLVFIMSVFVAAGLFVLVMKRRKKNQSDHTSTNNSDVSSFNMQYSVYGGGGGTGGHPHA 670 680 690 700 710 720 670 680 690 700 710 pF1KB8 TTHHT------TERPSASLYEQHMVSPMVHVYRSPSFGPKH---LEEEEERNEKE--GSD .:: .. :.. .:: .. :. :. ..: . .. .:. .. .: . :. CCDS94 HVHHRGPALPKVKTPAGHVYE-YIPHPLGHMCKNPIYRSREGNSVEDYKDLHELKVTYSS 730 740 750 760 770 780 720 730 740 pF1KB8 AKHLQRSLL-----EQENHSP------------------LTGSNMKYKTTNQSTEFLS-F .:::.. .: ...: : . .. .: . ..:: CCDS94 NHHLQQQQQPPPPPQQPQQQPPPQLQLQPGEEERRESHHLRSPAYSVSTIEPREDLLSPV 790 800 810 820 830 840 750 760 770 780 790 800 pF1KB8 QDASSLYRNILEKERELQQLGITEYLRKNIAQLQPDMEAHYPGAHEELKLMETLMYSRPR :::. .::.::: .. CCDS94 QDADRFYRGILEPDKHCSTTPAGNSLPEYPKFPCSPAAYTFSPNYDLRRPHQYLHPGAGD 850 860 870 880 890 900 >>CCDS3197.1 SLITRK3 gene_id:22865|Hs108|chr3 (977 aa) initn: 1600 init1: 818 opt: 1078 Z-score: 938.7 bits: 184.9 E(32554): 5.8e-46 Smith-Waterman score: 1827; 37.4% identity (67.5% similar) in 851 aa overlap (3-791:15-841) 10 20 30 40 pF1KB8 MKLWIHLFYSSLLACISLHSQTPVLSSRGS------CDSLCNCEEKDG ::: ::. :.: ::. . : : . : :: :.. CCDS31 MKPSIAEMLHRGRMLWI-----ILLSTIALGWTTPIPLIEDSEEIDEPCFDPCYCEVKES 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KB8 TMLINCEAKGIKMVSEISVPPSRPFQLSLLNNGLTMLHTNDFSGLTNAISIHLGFNNIAD . :.:..::. .:.:. ::::.: : :.. :.::.: :.::.::.:: : . : CCDS31 LFHIHCDSKGFTNISQITEFWSRPFKLYLQRNSMRKLYTNSFLHLNNAVSINLGNNALQD 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KB8 IEIGAFNGLGLLKQLHINHNSLEILKEDTFHGLENLEFLQADNNFITVIEPSAFSKLNRL :. :::::: .::.:....:.:.....::: :::.::.:::: : : :: .:: .:..: CCDS31 IQTGAFNGLKILKRLYLHENKLDVFRNDTFLGLESLEYLQADYNVIKRIESGAFRNLSKL 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KB8 KVLILNDNAIESLPPNIFRFVPLTHLDLRGNQLQTLPYVGFLEHIGR-ILDLQLEDNKWA .::::::: : :: :.:. : :::::::::.:..: : :.:.:::: ...::::.: : CCDS31 RVLILNDNLIPMLPTNLFKAVSLTHLDLRGNRLKVLFYRGMLDHIGRSLMELQLEENPWN 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 pF1KB8 CNCDLLQLKTWLENMPPQSIIGDVVCNSPPFFKGSILSRLKKESICPT------------ :.:...:::.::: .: ...::..:..: :.:. : ...: .:: CCDS31 CTCEIVQLKSWLERIPYTALVGDITCETPFHFHGKDLREIRKTELCPLLSDSEVEASLGI 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 pF1KB8 PPVYEEHED-----PSG---SLHLAATS----SINDSRMSTKTTSILKLPTKAPGLIPYI : .:. ::. :.:..:.: : : . :: . :. . .: : CCDS31 PHSSSSKENAWPTKPSSMLSSVHFTASSVEYKSSNKQPKPTKQPRTPRPPSTSQALYPGP 300 310 320 330 340 350 320 330 340 350 360 370 pF1KB8 TKP-----STQLPGPY-CPIPCNCKV-LSPSGLLIHCQERNIESLSDLRPPPQNPRKLIL ..: .:. : : :: :.:.. .. :: ..:.::.....:.: : : : .:: : CCDS31 NQPPIAPYQTRPPIPIICPTGCTCNLHINDLGLTVNCKERGFNNISELLPRPLNAKKLYL 360 370 380 390 400 410 380 390 400 410 420 430 pF1KB8 AGNIIHSLMKSDLVEYFTLEMLHLGNNRIEVLEEGSFMNLTRLQKLYLNGNHLTKLSKGM ..:.:.....::. .. .:..:::::::: ...:.:.:: :..:.:::: . ::. :: CCDS31 SSNLIQKIYRSDFWNFSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGNDIEKLTPGM 420 430 440 450 460 470 440 450 460 470 480 490 pF1KB8 FLGLHNLEYLYLEYNAIKEILPGTFNPMPKLKVLYLNNNLLQVLPPHIFSGVPLTKVNLK : ::..:.:::.:.:.:.:: :..:. ::.::.:.::::::..:: :.:. :...::. CCDS31 FRGLQSLHYLYFEFNVIREIQPAAFSLMPNLKLLFLNNNLLRTLPTDAFAGTSLARLNLR 480 490 500 510 520 530 500 510 520 530 540 550 pF1KB8 TNQFTHLPVSNILDDLDLLTQIDLEDNPWDCSCDLVGLQQWIQKLSKNTVTDDILCTSPG : : .:::...:. :. ..::::..:::::.:::: ..:::. .:. .:. :.:: :: CCDS31 KNYFLYLPVAGVLEHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQWIETISSVSVVGDVLCRSPE 540 550 560 570 580 590 560 570 580 590 600 pF1KB8 HLDKKELKALNSEILCPGLVN------NPSMPTQTSYLMVTTPATTTNTADTILRSLTDA .: ........ :.::: ... .:..: .. . . : :. . . CCDS31 NLTHRDVRTIELEVLCPEMLHVAPAGESPAQPGDSHLIGAPTSASPYEFSPP-----GGP 600 610 620 630 640 650 610 620 630 640 650 660 pF1KB8 VPLSVLILGLLIMFITIVFCAAGIVVLVLHRRRR---YKKKQVDEQMRDNSPVHLQ-YSM ::::::::.::..:.. :: :::. . ::.:::. ...:. .. : . ...: . . CCDS31 VPLSVLILSLLVLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKKLPFRSKR--QEGVDLTGIQMQCHRL 660 670 680 690 700 670 680 690 700 pF1KB8 Y------------GHKTTHHTTER--PSASLYEQHMVSPMVHVYRSPSFGPKHLEEEEER . : . : . :. : . .:: .. :.... .: . :. :::: CCDS31 FEDGGGGGGGSGGGGRPTLSSPEKAPPVGHVYE-YIPHPVTQMCNNPIYKPR---EEEEV 710 720 730 740 750 760 710 720 730 740 750 760 pF1KB8 NEKEGSDAKHLQRSLLEQENHSPLTGSNMKYKTTNQSTEFLSFQDASSLYRNILEKEREL . ...: .:. .. : : . ..: .: . .. : ::..::::.: CCDS31 AVSSAQEAGSAERG--GPGTQPPGMGEAL--LGSEQFAE--TPKENHSNYRTLLEKEKE- 770 780 790 800 810 770 780 790 800 810 820 pF1KB8 QQLGITEYLRKNIAQLQPDMEAHYPGAHEELKLMETLMYSRPRKVLVEQTKNEYFELKAN :... ..:. .. . :.: CCDS31 WALAVSSSQLNTIVTVN-HHHPHHPAVGGVSGVVGGTGGDLAGFRHHEKNGGVVLFPPGG 820 830 840 850 860 870 >>CCDS14680.1 SLITRK2 gene_id:84631|Hs108|chrX (845 aa) initn: 1895 init1: 845 opt: 1015 Z-score: 885.1 bits: 174.8 E(32554): 5.6e-43 Smith-Waterman score: 2027; 40.4% identity (69.3% similar) in 861 aa overlap (7-841:5-840) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MKLWIHLFYSSLLACISLHSQTPVLSSRGSCDSLCNCEEKDGTMLINCEAKGIKMVSEIS ... :.:. .. . ... : : ::::.... :::: ::. :: .. CCDS14 MLSGVWFLSVLTVAGILQTESRKTAKDICKIRCLCEEKENVLNINCENKGFTTVSLLQ 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 VPPSRPFQLSLLNNGLTMLHTNDFSGLTNAISIHLGFNNIADIEIGAFNGLGLLKQLHIN : : .:: : .: :: :. :.: . .::...::: :.. .:. :::.:: ::.::.: CCDS14 PPQYRIYQLFLNGNLLTRLYPNEFVNYSNAVTLHLGNNGLQEIRTGAFSGLKTLKRLHLN 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 HNSLEILKEDTFHGLENLEFLQADNNFITVIEPSAFSKLNRLKVLILNDNAIESLPPNIF .:.::::.:::: :::.::.:::: :.:..:: .::::::.::::::::: . ::: :.: CCDS14 NNKLEILREDTFLGLESLEYLQADYNYISAIEAGAFSKLNKLKVLILNDNLLLSLPSNVF 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB8 RFVPLTHLDLRGNQLQTLPYVGFLEHIGRILDLQLEDNKWACNCDLLQLKTWLENMPPQS ::: :::::::::.:...:..: ::::: :...:::.: : :.:::: ::.::... CCDS14 RFVLLTHLDLRGNRLKVMPFAGVLEHIGGIMEIQLEENPWNCTCDLLPLKAWLDTI--TV 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 pF1KB8 IIGDVVCNSPPFFKGSILSRLKKESICPTPPVYEEHEDPS-GSLHLAATS-SINDSRMST ..:..::..: ..:. ...: ....:: . . . : .. :. : ..: . : CCDS14 FVGEIVCETPFRLHGKDVTQLTRQDLCPRKSASDSSQRGSHADTHVQRLSPTMNPALNPT 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KB8 KTTSILKLPTKAPGLIPYIT--------KP----STQLPGPY-CPIPCNCKVLSP-SGLL .. . . : : .: : .:. : : :: : : : .:: CCDS14 RAPKASRPPKMRNRPTPRVTVSKDRQSFGPIMVYQTKSPVPLTCPSSCVCTSQSSDNGLN 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KB8 IHCQERNIESLSDLRPPPQNPRKLILAGNIIHSLMKSDLVEYFTLEMLHLGNNRIEVLEE ..::::.. ..:::.: : .:.:: :.:: .....:.::.:: .:..:::::::: :..: CCDS14 VNCQERKFTNISDLQPKPTSPKKLYLTGNYLQTVYKNDLLEYSSLDLLHLGNNRIAVIQE 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KB8 GSFMNLTRLQKLYLNGNHLTKLSKGMFLGLHNLEYLYLEYNAIKEILPGTFNPMPKLKVL :.: ::: :..::::::.: : .:: ::..:.:::::::.:::: : ::. . .:..: CCDS14 GAFTNLTSLRRLYLNGNYLEVLYPSMFDGLQSLQYLYLEYNVIKEIKPLTFDALINLQLL 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KB8 YLNNNLLQVLPPHIFSGVPLTKVNLKTNQFTHLPVSNILDDLDLLTQIDLEDNPWDCSCD .::::::. :: .::.:. ::..::..:.:.::::...::.: . ::::..:::::.:: CCDS14 FLNNNLLRSLPDNIFGGTALTRLNLRNNHFSHLPVKGVLDQLPAFIQIDLQENPWDCTCD 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KB8 LVGLQQWIQKLSKNTVTDDILCTSPGHLDKKELKALNSEILCPGLVNNPSMPTQTSYLM- ..::..: .. .. .. ... : ::.. . :: :. : .:: ..:.. : : CCDS14 IMGLKDWTEHANSPVIINEVTCESPAKHAGEILKFLGREAICP---DSPNLSDGTVLSMN 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KB8 --VTTPATTTNTADTILRSLTDAVPLSVLILGLLIMFITIVFCAAGIVVLVLHRRRRYKK . :: . . . .. : :::::::::::..:: : .::. :.::.::. . CCDS14 HNTDTPRSLSVSPSSY-PELHTEVPLSVLILGLLVVFILSVCFGAGLFVFVLKRRKGVPS 600 610 620 630 640 650 650 660 670 680 690 700 pF1KB8 KQVDEQMRDNSPVHLQYSMYGHKTTHHTTERPSASLYEQHMVSPMVHVYRSPSFGPKHLE . . : : .:::. :. .: : :. . .:. .. :. .. ..: . :. . CCDS14 VPRNTNNLDVSSFQLQYGSYNTET-HDKTD---GHVYN-YIPPPVGQMCQNPIYMQKEGD 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 pF1KB8 E-EEERNEKEGSDAKHLQRSLLEQENHSPLTGSNMKYKTTNQSTEFLSFQ----DASSLY :: .: .. : ::.... : : . : : ..::.: : . :: CCDS14 PVAYYRNLQE------FSYSNLEEKKEEPATPA---Y--TISATELLEKQATPREPELLY 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 pF1KB8 RNILEKERELQQLGITEYLRKNIA--QLQPDMEAHYPGAHEELKLMETLMYSRPRKVLVE .:: :. .:: . :...: .. :. :..:.. ... .. .:..:. ::: .: CCDS14 QNIAERVKELPSAGLVHYNFCTLPKRQFAPSYESRR---QNQDRINKTVLYGTPRKCFVG 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KB8 QTKNEYFELKANLHAEPDYLEVLEQQT :.: .. :.:. ..:::::::::.:: CCDS14 QSKPNHPLLQAKPQSEPDYLEVLEKQTAISQL 820 830 840 >>CCDS9464.1 SLITRK1 gene_id:114798|Hs108|chr13 (696 aa) initn: 1591 init1: 793 opt: 931 Z-score: 813.5 bits: 161.3 E(32554): 5.4e-39 Smith-Waterman score: 1692; 41.3% identity (70.1% similar) in 688 aa overlap (1-663:1-674) 10 20 30 40 50 pF1KB8 MKLWIHLFYSSLLACISLHSQTPVLSSRGSC-DSLCNCEEKDGTMLINCEAKGIKMVSEI : ::: :. .:: :.. . : . : ...:.:.: .: . ..:: ::. .... CCDS94 MLLWILLLETSL--CFAAGNVTGDV-----CKEKICSCNEIEGDLHVDCEKKGFTSLQRF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB8 SVPPSRPFQLSLLNNGLTMLHTNDFSGLTNAISIHLGFNNIADIEIGAFNGLGLLKQLHI ..: :. ..: : .:.:: : :.:... ::.:.:. :.. .: ::: :: :.:.::: CCDS94 TAPTSQFYHLFLHGNSLTRLFPNEFANFYNAVSLHMENNGLHEIVPGAFLGLQLVKRLHI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 NHNSLEILKEDTFHGLENLEFLQADNNFITVIEPSAFSKLNRLKVLILNDNAIESLPPNI :.:... ....:: ::..::.:::: :.. :.:.::. ::.:.::::::: : .:: :. CCDS94 NNNKIKSFRKQTFLGLDDLEYLQADFNLLRDIDPGAFQDLNKLEVLILNDNLISTLPANV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 FRFVPLTHLDLRGNQLQTLPYVGFLEHIGRILDLQLEDNKWACNCDLLQLKTWLENMPPQ :..::.::::::::.:.:::: ::.: : .. :::: : :.::::.:: ::::.: . CCDS94 FQYVPITHLDLRGNRLKTLPYEEVLEQIPGIAEILLEDNPWDCTCDLLSLKEWLENIPKN 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB8 SIIGDVVCNSPPFFKGSILSRLKKESICP----------TPPVYEEHEDPSGSL------ ..:: :::..: ..:. :.. ....:: .::. :: : : : CCDS94 ALIGRVVCEAPTRLQGKDLNETTEQDLCPLKNRVDSSLPAPPAQEETFAP-GPLPTPFKT 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 pF1KB8 -----HLAATSSINDSRMSTKTTSILKLPTKAPGLIPYITKP-STQLPGPYCPIPCNCKV : . :. : . . .: :: : . .:: ...:: :: :.: CCDS94 NGQEDHATPGSAPNGGTKIPGNWQIKIRPTAAIATGSSRNKPLANSLP---CPGGCSCDH 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 390 pF1KB8 LSPSGLLIHCQERNIESLSDLRPPPQNPRKLILAGNIIHSLMKSDLVEYFTLEMLHLGNN . ::: ..:..::. ::.::.: .: ..:.: : :::. :: .:.: .: .: :::: CCDS94 IPGSGLKMNCNNRNVSSLADLKPKLSNVQELFLRDNKIHSIRKSHFVDYKNLILLDLGNN 350 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 450 pF1KB8 RIEVLEEGSFMNLTRLQKLYLNGNHLTKLSKGMFLGLHNLEYLYLEYNAIKEILPGTFNP : ..:...: :: :. ::...:.: ::. : ::.::::: .:::::. ::::::: CCDS94 NIATVENNTFKNLLDLRWLYMDSNYLDTLSREKFAGLQNLEYLNVEYNAIQLILPGTFNA 410 420 430 440 450 460 460 470 480 490 500 510 pF1KB8 MPKLKVLYLNNNLLQVLPPHIFSGVPLTKVNLKTNQFTHLPVSNILDDLDLLTQIDLEDN ::::..: ::::::. :: .:.:: :.:..:..: : .:::...::.: . ::::. : CCDS94 MPKLRILILNNNLLRSLPVDVFAGVSLSKLSLHNNYFMYLPVAGVLDQLTSIIQIDLHGN 470 480 490 500 510 520 520 530 540 550 560 570 pF1KB8 PWDCSCDLVGLQQWIQKLSKNTVTDDILCTSPGHLDKKELKALNSEILCPGLVNNPSMPT ::.::: .: ..:: ..:..... .:. : .: .. .:.. :... .:: : : :: CCDS94 PWECSCTIVPFKQWAERLGSEVLMSDLKCETPVNFFRKDFMLLSNDEICPQLYARIS-PT 530 540 550 560 570 580 580 590 600 610 620 630 pF1KB8 QTSYLMVTTPATTTNT-ADTILRSLTDAVPLSVLILGLLIMFITIVFCAAGIVVLVLHRR ::. .: . :.: ... : :. : .:::. :::..:.: .: ..:..:..:. : CCDS94 LTSHSKNSTGLAETGTHSNSYLD--TSRVSISVLVPGLLLVFVTSAFTVVGMLVFILRNR 590 600 610 620 630 640 640 650 660 670 680 690 pF1KB8 RRYKKKQVDEQMRD-NSPVHLQYSMYGHKTTHHTTERPSASLYEQHMVSPMVHVYRSPSF .: :..... . . :: . : : : CCDS94 KRSKRRDANSSASEINSLQTVCDSSYWHNGPYNADGAHRVYDCGSHSLSD 650 660 670 680 690 >>CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1523 aa) initn: 328 init1: 240 opt: 473 Z-score: 413.6 bits: 88.4 E(32554): 1e-16 Smith-Waterman score: 551; 24.5% identity (52.6% similar) in 701 aa overlap (13-695:20-625) 10 20 30 40 50 pF1KB8 MKLWIHLFYSSLLACISLHSQTPVLSSRGSCDSLCNCEEKDGTMLINCEAKGI :: :. : :... : . :.: . ..:.. :. CCDS43 MAPGWAGVGAAVRARLALALALASVLSGPPAVA----CPTKCTCSAAS----VDCHGLGL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB8 KMVSEISVPPSRPFQLSLLNNGLTMLHTNDFSGLTNAISIHLGFNNIADIEIGAFNGLGL . : . ..: . .:.: :..: . ::.:: : .:: :... :: :::. : CCDS43 RAVPR-GIPRNAE-RLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQ 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 LKQLHINHNSLEILKEDTFHGLENLEFLQADNNFITVIEPSAFSKLNRLKVLILNDNAIE :..:..:.:.:..: : :.. .: :. ..: : : .:: .. .: : :..: : CCDS43 LERLRLNKNKLQVLPELLFQSTPKLTRLDLSENQIQGIPRKAFRGITDVKNLQLDNNHIS 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 SLPPNIFRFV-PLTHLDLRGNQLQTLPYVGFLEHIGRILDLQLEDNKWACNCDLLQLKTW . . :: . : : : .:... . ..: .:. .: :.:..:. :.: : :. : CCDS43 CIEDGAFRALRDLEILTLNNNNISRILVTSF-NHMPKIRTLRLHSNHLYCDCHLAWLSDW 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 LENMPPQSIIGD-VVCNSPPFFKG-SILSRLKKESICPTPPVYEEHEDPSGSLHLAATSS :.. . .:. ..: .: ..: .. . ::: .::.: : .: CCDS43 LRQ---RRTVGQFTLCMAPVHLRGFNVADVQKKEYVCPAP-----HSEP----------- 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 INDSRMSTKTTSILKLPTKAPGLIPYITKPSTQLPGPYCPIPCNCKVLSPSGLLIHCQER :: . . :: ::.: :. .. :. . 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CCDS43 GLMEIPANL---PEGIVEIRLEQNSIKAIPAGAFTQYKKLKRIDISKNQISDIAPDAFQG 300 310 320 330 340 350 410 420 430 440 450 460 pF1KB8 LTRLQKLYLNGNHLTKLSKGMFLGLHNLEYLYLEYNAIKEILPGTFNPMPKLKVLYLNNN : : .: : ::..:.. ::.: :: .:. : :. : :. . .::. . .:..: : .: CCDS43 LKSLTSLVLYGNKITEIVKGLFDGLVSLQLLLLNANKINCLRVNTFQDLQNLNLLSLYDN 360 370 380 390 400 410 470 480 490 500 510 520 pF1KB8 LLQVLPPHIFSGVPLTKVNLKTNQFTHLPVSNILDDLDLLTQIDLEDNPWDCSCDLVGLQ ::.. .:. :: .. : :: .::. :.: : : CCDS43 KLQTISKGLFA--PLQSI-----QTLHLA-----------------QNPFVCDCHLKWLA 420 430 440 530 540 550 560 570 580 pF1KB8 QWIQKLSKNTV-TDDILCTSPGHLDKKELKALNSEIL-CPGLVNNPSMPTQTSYLMVTTP ...: : . :. :.:: .: .:... ..:. . : : . : .. .. .. : CCDS43 DYLQD---NPIETSGARCSSPRRLANKRISQIKSKKFRCSGSEDYRSRFSSECFMDLVCP 450 460 470 480 490 500 590 600 610 620 630 pF1KB8 ------ATTTNTADTILRSLTDAVPLSVLILGLLIMFITIVFCAAGIVVLVLHRRR---- .: .. .. : . . .: : : : .. :. :.:: . . :. 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