Result of FASTA (ccds) for pF1KB8628
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8628, 841 aa
  1>>>pF1KB8628 841 - 841 aa - 841 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2193+/-0.00114; mu= 17.4070+/- 0.069
 mean_var=133.9749+/-28.027, 0's: 0 Z-trim(107.7): 177  B-trim: 340 in 1/51
 Lambda= 0.110806
 statistics sampled from 9541 (9755) to 9541 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.658), E-opt: 0.2 (0.3), width:  16
 Scan time:  4.510

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS41903.1 SLITRK6 gene_id:84189|Hs108|chr13      ( 841) 5585 905.3       0
CCDS14679.1 SLITRK4 gene_id:139065|Hs108|chrX      ( 837) 1137 194.3 7.5e-49
CCDS9465.1 SLITRK5 gene_id:26050|Hs108|chr13       ( 958) 1085 186.0 2.6e-46
CCDS3197.1 SLITRK3 gene_id:22865|Hs108|chr3        ( 977) 1078 184.9 5.8e-46
CCDS14680.1 SLITRK2 gene_id:84631|Hs108|chrX       ( 845) 1015 174.8 5.6e-43
CCDS9464.1 SLITRK1 gene_id:114798|Hs108|chr13      ( 696)  931 161.3 5.4e-39
CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5           (1523)  473 88.4   1e-16
CCDS64311.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5          (1530)  473 88.4   1e-16
CCDS7453.1 SLIT1 gene_id:6585|Hs108|chr10          (1534)  465 87.1 2.5e-16
CCDS75110.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4          (1525)  463 86.8 3.1e-16
CCDS75111.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4          (1521)  457 85.8   6e-16
CCDS3426.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4           (1529)  457 85.8   6e-16
CCDS3306.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3        ( 581)  369 71.3 5.3e-12
CCDS46984.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3       ( 587)  369 71.4 5.3e-12
CCDS34969.1 LRRC24 gene_id:441381|Hs108|chr8       ( 513)  359 69.7 1.5e-11
CCDS2876.1 LRTM1 gene_id:57408|Hs108|chr3          ( 345)  351 68.2 2.7e-11
CCDS13121.1 FLRT3 gene_id:23767|Hs108|chr20        ( 649)  349 68.2 5.2e-11


>>CCDS41903.1 SLITRK6 gene_id:84189|Hs108|chr13           (841 aa)
 initn: 5585 init1: 5585 opt: 5585  Z-score: 4833.3  bits: 905.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5585; 100.0% identity (100.0% similar) in 841 aa overlap (1-841:1-841)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MKLWIHLFYSSLLACISLHSQTPVLSSRGSCDSLCNCEEKDGTMLINCEAKGIKMVSEIS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MKLWIHLFYSSLLACISLHSQTPVLSSRGSCDSLCNCEEKDGTMLINCEAKGIKMVSEIS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 VPPSRPFQLSLLNNGLTMLHTNDFSGLTNAISIHLGFNNIADIEIGAFNGLGLLKQLHIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VPPSRPFQLSLLNNGLTMLHTNDFSGLTNAISIHLGFNNIADIEIGAFNGLGLLKQLHIN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 HNSLEILKEDTFHGLENLEFLQADNNFITVIEPSAFSKLNRLKVLILNDNAIESLPPNIF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 HNSLEILKEDTFHGLENLEFLQADNNFITVIEPSAFSKLNRLKVLILNDNAIESLPPNIF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 RFVPLTHLDLRGNQLQTLPYVGFLEHIGRILDLQLEDNKWACNCDLLQLKTWLENMPPQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RFVPLTHLDLRGNQLQTLPYVGFLEHIGRILDLQLEDNKWACNCDLLQLKTWLENMPPQS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 IIGDVVCNSPPFFKGSILSRLKKESICPTPPVYEEHEDPSGSLHLAATSSINDSRMSTKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 IIGDVVCNSPPFFKGSILSRLKKESICPTPPVYEEHEDPSGSLHLAATSSINDSRMSTKT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 TSILKLPTKAPGLIPYITKPSTQLPGPYCPIPCNCKVLSPSGLLIHCQERNIESLSDLRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TSILKLPTKAPGLIPYITKPSTQLPGPYCPIPCNCKVLSPSGLLIHCQERNIESLSDLRP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 PPQNPRKLILAGNIIHSLMKSDLVEYFTLEMLHLGNNRIEVLEEGSFMNLTRLQKLYLNG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PPQNPRKLILAGNIIHSLMKSDLVEYFTLEMLHLGNNRIEVLEEGSFMNLTRLQKLYLNG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB8 NHLTKLSKGMFLGLHNLEYLYLEYNAIKEILPGTFNPMPKLKVLYLNNNLLQVLPPHIFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NHLTKLSKGMFLGLHNLEYLYLEYNAIKEILPGTFNPMPKLKVLYLNNNLLQVLPPHIFS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB8 GVPLTKVNLKTNQFTHLPVSNILDDLDLLTQIDLEDNPWDCSCDLVGLQQWIQKLSKNTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GVPLTKVNLKTNQFTHLPVSNILDDLDLLTQIDLEDNPWDCSCDLVGLQQWIQKLSKNTV
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB8 TDDILCTSPGHLDKKELKALNSEILCPGLVNNPSMPTQTSYLMVTTPATTTNTADTILRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 TDDILCTSPGHLDKKELKALNSEILCPGLVNNPSMPTQTSYLMVTTPATTTNTADTILRS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB8 LTDAVPLSVLILGLLIMFITIVFCAAGIVVLVLHRRRRYKKKQVDEQMRDNSPVHLQYSM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LTDAVPLSVLILGLLIMFITIVFCAAGIVVLVLHRRRRYKKKQVDEQMRDNSPVHLQYSM
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB8 YGHKTTHHTTERPSASLYEQHMVSPMVHVYRSPSFGPKHLEEEEERNEKEGSDAKHLQRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 YGHKTTHHTTERPSASLYEQHMVSPMVHVYRSPSFGPKHLEEEEERNEKEGSDAKHLQRS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB8 LLEQENHSPLTGSNMKYKTTNQSTEFLSFQDASSLYRNILEKERELQQLGITEYLRKNIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LLEQENHSPLTGSNMKYKTTNQSTEFLSFQDASSLYRNILEKERELQQLGITEYLRKNIA
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB8 QLQPDMEAHYPGAHEELKLMETLMYSRPRKVLVEQTKNEYFELKANLHAEPDYLEVLEQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 QLQPDMEAHYPGAHEELKLMETLMYSRPRKVLVEQTKNEYFELKANLHAEPDYLEVLEQQ
              790       800       810       820       830       840

        
pF1KB8 T
       :
CCDS41 T
        

>>CCDS14679.1 SLITRK4 gene_id:139065|Hs108|chrX           (837 aa)
 initn: 2022 init1: 887 opt: 1137  Z-score: 990.5  bits: 194.3 E(32554): 7.5e-49
Smith-Waterman score: 2092; 41.3% identity (68.1% similar) in 869 aa overlap (1-841:1-832)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MKLWIHLFYSSLLACISLHSQTPVLSSRGSCDSLCNCEEKDGTMLINCEAKGIKMVSEIS
       : ::. :. :.:..  .  :.  :      :. .:.:   .... .:::  ..   ....
CCDS14 MFLWLFLILSALISSTNADSDISVEI----CN-VCSCVSVENVLYVNCEKVSVYRPNQLK
               10        20             30        40        50     

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 VPPSRPFQLSLLNNGLTMLHTNDFSGLTNAISIHLGFNNIADIEIGAFNGLGLLKQLHIN
        : :  ..:.. :: :..:. : : ....:.:.::: :.. .:: ::: ::. :::::.:
CCDS14 PPWSNFYHLNFQNNFLNILYPNTFLNFSHAVSLHLGNNKLQNIEGGAFLGLSALKQLHLN
          60        70        80        90       100       110     

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 HNSLEILKEDTFHGLENLEFLQADNNFITVIEPSAFSKLNRLKVLILNDNAIESLPPNIF
       .: :.::. ::: :.::::.:::: :.:  :: .::.::..::::::::: :  :: :::
CCDS14 NNELKILRADTFLGIENLEYLQADYNLIKYIERGAFNKLHKLKVLILNDNLISFLPDNIF
         120       130       140       150       160       170     

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 RFVPLTHLDLRGNQLQTLPYVGFLEHIGRILDLQLEDNKWACNCDLLQLKTWLENMPPQS
       ::. :::::.:::..: :::.: ::::::...:::::: : :.:::: ::.:::::: . 
CCDS14 RFASLTHLDIRGNRIQKLPYIGVLEHIGRVVELQLEDNPWNCSCDLLPLKAWLENMPYNI
         180       190       200       210       220       230     

              250       260                  270         280       
pF1KB8 IIGDVVCNSPPFFKGSILSRLKKESICPT-----------PPVYEE--HEDPSGSLHLAA
        ::...:..:  . : .:.. .:. .::            ::   :  .  :.:  : . 
CCDS14 YIGEAICETPSDLYGRLLKETNKQELCPMGTGSDFDVRILPPSQLENGYTTPNG--HTTQ
         240       250       260       270       280         290   

       290       300       310                 320         330     
pF1KB8 TSSINDSRMSTKTTSILKLPTKAPGLIP----------YITKPSTQLPGPY--CPIPCNC
       ::     :. ::  .  . :.:  :..            :.. .:..: :   :: :: :
CCDS14 TSL---HRLVTKPPKTTN-PSKISGIVAGKALSNRNLSQIVSYQTRVP-PLTPCPAPCFC
              300        310       320       330        340        

         340         350       360       370       380       390   
pF1KB8 KVLSPS--GLLIHCQERNIESLSDLRPPPQNPRKLILAGNIIHSLMKSDLVEYFTLEMLH
       :.  ::  :: ..:::.::.:.:.: : : : .:: . :: :...  ::....  :..::
CCDS14 KT-HPSDLGLSVNCQEKNIQSMSELIPKPLNAKKLHVNGNSIKDVDVSDFTDFEGLDLLH
      350        360       370       380       390       400       

           400       410       420       430       440       450   
pF1KB8 LGNNRIEVLEEGSFMNLTRLQKLYLNGNHLTKLSKGMFLGLHNLEYLYLEYNAIKEILPG
       ::.:.: :..   : ::: :..::::::.. .:   .: :::::.::::::: ::::  :
CCDS14 LGSNQITVIKGDVFHNLTNLRRLYLNGNQIERLYPEIFSGLHNLQYLYLEYNLIKEISAG
       410       420       430       440       450       460       

           460       470       480       490       500       510   
pF1KB8 TFNPMPKLKVLYLNNNLLQVLPPHIFSGVPLTKVNLKTNQFTHLPVSNILDDLDLLTQID
       ::. ::.:..::::::::. :: .::::.::...::..:.: .::::..::.:. :::::
CCDS14 TFDSMPNLQLLYLNNNLLKSLPVYIFSGAPLARLNLRNNKFMYLPVSGVLDQLQSLTQID
       470       480       490       500       510       520       

           520       530       540       550       560       570   
pF1KB8 LEDNPWDCSCDLVGLQQWIQKLSKNTVTDDILCTSPGHLDKKELKALNSEILCPGLVNNP
       :: :::::.::::.:. :..::: . :. .. : .: .. . :::.:..::::: :.:.:
CCDS14 LEGNPWDCTCDLVALKLWVEKLSDGIVVKELKCETPVQFANIELKSLKNEILCPKLLNKP
       530       540       550       560       570       580       

           580       590       600        610       620       630  
pF1KB8 SMPTQTSYLMVTTPATTTNTADTILRSLTDA-VPLSVLILGLLIMFITIVFCAAGIVVLV
       : :  .      .:: : .:    .::   . ::::.:::..:...:  :: :  ..:.:
CCDS14 SAPFTSP-----APAITFTTPLGPIRSPPGGPVPLSILILSILVVLILTVFVAFCLLVFV
       590            600       610       620       630       640  

            640       650       660       670       680       690  
pF1KB8 LHRRRRYKKKQVDEQMRDNSPVHLQYSMYGHKTTHHTTERPSASLYEQHMVSPMVHVYRS
       :.: ..   :.      : . ..::   . :::    ... . :  :  . . . .. .:
CCDS14 LRRNKKPTVKHEGLGNPDCGSMQLQLRKHDHKT----NKKDGLST-EAFIPQTIEQMSKS
            650       660       670           680        690       

            700       710       720       730       740       750  
pF1KB8 PSFGPKHLEEEEERNEKEGSDAKHLQRSLLEQENHSPLTGSNMKYKTTNQSTEFLSFQDA
        . : :. :     ..  :.  : ..:.. ..:.    . .  . .: ..  :..  .:.
CCDS14 HTCGLKESETGFMFSDPPGQ--KVVMRNVADKEKDLLHVDTRKRLSTIDELDELFPSRDS
       700       710         720       730       740       750     

            760       770       780       790       800       810  
pF1KB8 SSLYRNILEKERELQQLGITEYLRKNIAQLQPDMEAHYPGAHEELKLMETLMYSRPRKVL
       . . .:.::...: ...:.. .            : .::  . . :  ..:. .   :..
CCDS14 NVFIQNFLESKKEYNSIGVSGF------------EIRYPEKQPDKKSKKSLIGGNHSKIV
         760       770                   780       790       800   

            820       830       840      
pF1KB8 VEQTKNEYFELKANLHAEPDYLEVLEQQT     
       ::: :.:::::::.:.. ::::.:::.::     
CCDS14 VEQRKSEYFELKAKLQSSPDYLQVLEEQTALNKI
           810       820       830       

>>CCDS9465.1 SLITRK5 gene_id:26050|Hs108|chr13            (958 aa)
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                                     ::. : :::::: . ..:: .::  .::::
CCDS94 MHSWMLQTLAFAVTSLVLSCAETIDYYGEICDNACPCEEKDGILTVSCENRGIISLSEIS
        20        30        40        50        60        70       

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pF1KB8 VPPSRP-FQLSLLNNGLTMLHTNDFSGLTNAISIHLGFNNIADIEIGAFNGLGLLKQLHI
        ::  : ..: : .: :. :. :.: . :.:  .::: : : ::: :::.::  :..::.
CCDS94 -PPRFPIYHLLLSGNLLNRLYPNEFVNYTGASILHLGSNVIQDIETGAFHGLRGLRRLHL
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pF1KB8 NHNSLEILKEDTFHGLENLEFLQADNNFITVIEPSAFSKLNRLKVLILNDNAIESLPPNI
       :.:.::.:..::: ::::::.::.: :.:.::::.::.::. :.::::::: . ::: :.
CCDS94 NNNKLELLRDDTFLGLENLEYLQVDYNYISVIEPNAFGKLHLLQVLILNDNLLSSLPNNL
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pF1KB8 FRFVPLTHLDLRGNQLQTLPYVGFLEHIGRILDLQLEDNKWACNCDLLQLKTWLENMPPQ
       ::::::::::::::.:. :::::.:.:. ....::::.: : :.:.:..:: ::...  .
CCDS94 FRFVPLTHLDLRGNRLKLLPYVGLLQHMDKVVELQLEENPWNCSCELISLKDWLDSISYS
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pF1KB8 SIIGDVVCNSPPFFKGSILSRLKKESICPTPPVYEEHEDP------SGSLHLAATSSIND
       ...:::::..:  ..:  :....:. .::   . . .  :      .: :: .. .:.:.
CCDS94 ALVGDVVCETPFRLHGRDLDEVSKQELCPRRLISDYEMRPQTPLSTTGYLH-TTPASVNS
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pF1KB8 SRMSTKTTSILKLPTKAP-GL----IPYITKPSTQLP---------GPY-----------
         ..:..... : : : : :      : . .:... :         ::            
CCDS94 --VATSSSAVYKPPLKPPKGTRQPNKPRV-RPTSRQPSKDLGYSNYGPSIAYQTKSPVPL
           320       330       340        350       360       370  

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pF1KB8 -CPIPCNCKV-LSPSGLLIHCQERNIESLSDLRPPPQNPRKLILAGNIIHSLMKSDLVEY
        ::  :.:.. .:  :: ..::::.:::...:.: : ::.:. :. : :  . ..:..: 
CCDS94 ECPTACSCNLQISDLGLNVNCQERKIESIAELQPKPYNPKKMYLTENYIAVVRRTDFLEA
            380       390       400       410       420       430  

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pF1KB8 FTLEMLHLGNNRIEVLEEGSFMNLTRLQKLYLNGNHLTKLSKGMFLGLHNLEYLYLEYNA
         :..:::::::: .... .: .:: :..::::::.. .::  .: ::..:.::.:.:: 
CCDS94 TGLDLLHLGNNRISMIQDRAFGDLTNLRRLYLNGNRIERLSPELFYGLQSLQYLFLQYNL
            440       450       460       470       480       490  

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pF1KB8 IKEILPGTFNPMPKLKVLYLNNNLLQVLPPHIFSGVPLTKVNLKTNQFTHLPVSNILDDL
       :.::  :::.:.:.:..:.:::::::..:  .:::. : ..::..:.:: ::::..::.:
CCDS94 IREIQSGTFDPVPNLQLLFLNNNLLQAMPSGVFSGLTLLRLNLRSNHFTSLPVSGVLDQL
            500       510       520       530       540       550  

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pF1KB8 DLLTQIDLEDNPWDCSCDLVGLQQWIQKLSKNTVTDDILCTSPGHLDKKELKALNSEILC
         : ::::.::::::.::.::.. :...:. ....:...: .: .. . ......::.::
CCDS94 KSLIQIDLHDNPWDCTCDIVGMKLWVEQLKVGVLVDEVICKAPKKFAETDMRSIKSELLC
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pF1KB8 PG----LVNNPS-----MPTQTSYLMVTTPATTTNT--ADTILRSLTDA--VPLSVLILG
       :     .:..:.     .:..::   ..:::.  :.  : . : .   :  ::::::::.
CCDS94 PDYSDVVVSTPTPSSIQVPARTS---AVTPAVRLNSTGAPASLGAGGGASSVPLSVLILS
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pF1KB8 LLIMFITIVFCAAGIVVLVLHRRRRYKKKQVDEQMRDNSPVHLQYSMYG---------HK
       ::..::  :: :::. :::..::.. .. ... .  : :  ..:::.::         : 
CCDS94 LLLVFIMSVFVAAGLFVLVMKRRKKNQSDHTSTNNSDVSSFNMQYSVYGGGGGTGGHPHA
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pF1KB8 TTHHT------TERPSASLYEQHMVSPMVHVYRSPSFGPKH---LEEEEERNEKE--GSD
        .::       .. :.. .:: ..  :. :. ..: .  ..   .:. .. .: .   :.
CCDS94 HVHHRGPALPKVKTPAGHVYE-YIPHPLGHMCKNPIYRSREGNSVEDYKDLHELKVTYSS
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pF1KB8 AKHLQRSLL-----EQENHSP------------------LTGSNMKYKTTNQSTEFLS-F
        .:::..       .: ...:                  : .  .. .: .   ..::  
CCDS94 NHHLQQQQQPPPPPQQPQQQPPPQLQLQPGEEERRESHHLRSPAYSVSTIEPREDLLSPV
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pF1KB8 QDASSLYRNILEKERELQQLGITEYLRKNIAQLQPDMEAHYPGAHEELKLMETLMYSRPR
       :::. .::.::: ..                                             
CCDS94 QDADRFYRGILEPDKHCSTTPAGNSLPEYPKFPCSPAAYTFSPNYDLRRPHQYLHPGAGD
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>>CCDS3197.1 SLITRK3 gene_id:22865|Hs108|chr3             (977 aa)
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pF1KB8             MKLWIHLFYSSLLACISLHSQTPVLSSRGS------CDSLCNCEEKDG
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CCDS31 MKPSIAEMLHRGRMLWI-----ILLSTIALGWTTPIPLIEDSEEIDEPCFDPCYCEVKES
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pF1KB8 TMLINCEAKGIKMVSEISVPPSRPFQLSLLNNGLTMLHTNDFSGLTNAISIHLGFNNIAD
        . :.:..::.  .:.:.   ::::.: :  :..  :.::.:  :.::.::.:: : . :
CCDS31 LFHIHCDSKGFTNISQITEFWSRPFKLYLQRNSMRKLYTNSFLHLNNAVSINLGNNALQD
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pF1KB8 IEIGAFNGLGLLKQLHINHNSLEILKEDTFHGLENLEFLQADNNFITVIEPSAFSKLNRL
       :. :::::: .::.:....:.:.....::: :::.::.:::: : :  :: .:: .:..:
CCDS31 IQTGAFNGLKILKRLYLHENKLDVFRNDTFLGLESLEYLQADYNVIKRIESGAFRNLSKL
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pF1KB8 KVLILNDNAIESLPPNIFRFVPLTHLDLRGNQLQTLPYVGFLEHIGR-ILDLQLEDNKWA
       .::::::: :  :: :.:. : :::::::::.:..: : :.:.:::: ...::::.: : 
CCDS31 RVLILNDNLIPMLPTNLFKAVSLTHLDLRGNRLKVLFYRGMLDHIGRSLMELQLEENPWN
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pF1KB8 CNCDLLQLKTWLENMPPQSIIGDVVCNSPPFFKGSILSRLKKESICPT------------
       :.:...:::.::: .:  ...::..:..:  :.:. : ...:  .::             
CCDS31 CTCEIVQLKSWLERIPYTALVGDITCETPFHFHGKDLREIRKTELCPLLSDSEVEASLGI
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pF1KB8 PPVYEEHED-----PSG---SLHLAATS----SINDSRMSTKTTSILKLPTKAPGLIPYI
       :     .:.     ::.   :.:..:.:    : : .   ::     . :. . .: :  
CCDS31 PHSSSSKENAWPTKPSSMLSSVHFTASSVEYKSSNKQPKPTKQPRTPRPPSTSQALYPGP
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pF1KB8 TKP-----STQLPGPY-CPIPCNCKV-LSPSGLLIHCQERNIESLSDLRPPPQNPRKLIL
       ..:     .:. : :  ::  :.:.. ..  :: ..:.::.....:.: : : : .:: :
CCDS31 NQPPIAPYQTRPPIPIICPTGCTCNLHINDLGLTVNCKERGFNNISELLPRPLNAKKLYL
         360       370       380       390       400       410     

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pF1KB8 AGNIIHSLMKSDLVEYFTLEMLHLGNNRIEVLEEGSFMNLTRLQKLYLNGNHLTKLSKGM
       ..:.:.....::. .. .:..::::::::  ...:.:.::  :..:.:::: . ::. ::
CCDS31 SSNLIQKIYRSDFWNFSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGNDIEKLTPGM
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pF1KB8 FLGLHNLEYLYLEYNAIKEILPGTFNPMPKLKVLYLNNNLLQVLPPHIFSGVPLTKVNLK
       : ::..:.:::.:.:.:.:: :..:. ::.::.:.::::::..::   :.:. :...::.
CCDS31 FRGLQSLHYLYFEFNVIREIQPAAFSLMPNLKLLFLNNNLLRTLPTDAFAGTSLARLNLR
         480       490       500       510       520       530     

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pF1KB8 TNQFTHLPVSNILDDLDLLTQIDLEDNPWDCSCDLVGLQQWIQKLSKNTVTDDILCTSPG
        : : .:::...:. :. ..::::..:::::.:::: ..:::. .:. .:. :.:: :: 
CCDS31 KNYFLYLPVAGVLEHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQWIETISSVSVVGDVLCRSPE
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pF1KB8 HLDKKELKALNSEILCPGLVN------NPSMPTQTSYLMVTTPATTTNTADTILRSLTDA
       .: ........ :.::: ...      .:..: ..  . . : :.  . .          
CCDS31 NLTHRDVRTIELEVLCPEMLHVAPAGESPAQPGDSHLIGAPTSASPYEFSPP-----GGP
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pF1KB8 VPLSVLILGLLIMFITIVFCAAGIVVLVLHRRRR---YKKKQVDEQMRDNSPVHLQ-YSM
       ::::::::.::..:.. :: :::. . ::.:::.   ...:.  ..  : . ...: . .
CCDS31 VPLSVLILSLLVLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKKLPFRSKR--QEGVDLTGIQMQCHRL
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pF1KB8 Y------------GHKTTHHTTER--PSASLYEQHMVSPMVHVYRSPSFGPKHLEEEEER
       .            : . :  . :.  : . .:: ..  :....  .: . :.   :::: 
CCDS31 FEDGGGGGGGSGGGGRPTLSSPEKAPPVGHVYE-YIPHPVTQMCNNPIYKPR---EEEEV
      710       720       730       740        750          760    

        710       720       730       740       750       760      
pF1KB8 NEKEGSDAKHLQRSLLEQENHSPLTGSNMKYKTTNQSTEFLSFQDASSLYRNILEKEREL
         . ...:   .:.     .. :  :  .    ..: .:  . ..  : ::..::::.: 
CCDS31 AVSSAQEAGSAERG--GPGTQPPGMGEAL--LGSEQFAE--TPKENHSNYRTLLEKEKE-
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        770       780       790       800       810       820      
pF1KB8 QQLGITEYLRKNIAQLQPDMEAHYPGAHEELKLMETLMYSRPRKVLVEQTKNEYFELKAN
         :...    ..:. ..   . :.:                                   
CCDS31 WALAVSSSQLNTIVTVN-HHHPHHPAVGGVSGVVGGTGGDLAGFRHHEKNGGVVLFPPGG
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pF1KB8 MKLWIHLFYSSLLACISLHSQTPVLSSRGSCDSLCNCEEKDGTMLINCEAKGIKMVSEIS
             ... :.:.  .. .     ...  :   : ::::.... :::: ::.  :: ..
CCDS14   MLSGVWFLSVLTVAGILQTESRKTAKDICKIRCLCEEKENVLNINCENKGFTTVSLLQ
                 10        20        30        40        50        

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pF1KB8 VPPSRPFQLSLLNNGLTMLHTNDFSGLTNAISIHLGFNNIADIEIGAFNGLGLLKQLHIN
        :  : .:: : .: :: :. :.: . .::...::: :.. .:. :::.::  ::.::.:
CCDS14 PPQYRIYQLFLNGNLLTRLYPNEFVNYSNAVTLHLGNNGLQEIRTGAFSGLKTLKRLHLN
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pF1KB8 HNSLEILKEDTFHGLENLEFLQADNNFITVIEPSAFSKLNRLKVLILNDNAIESLPPNIF
       .:.::::.:::: :::.::.:::: :.:..:: .::::::.::::::::: . ::: :.:
CCDS14 NNKLEILREDTFLGLESLEYLQADYNYISAIEAGAFSKLNKLKVLILNDNLLLSLPSNVF
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pF1KB8 RFVPLTHLDLRGNQLQTLPYVGFLEHIGRILDLQLEDNKWACNCDLLQLKTWLENMPPQS
       ::: :::::::::.:...:..: ::::: :...:::.: : :.:::: ::.::...    
CCDS14 RFVLLTHLDLRGNRLKVMPFAGVLEHIGGIMEIQLEENPWNCTCDLLPLKAWLDTI--TV
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pF1KB8 IIGDVVCNSPPFFKGSILSRLKKESICPTPPVYEEHEDPS-GSLHLAATS-SINDSRMST
       ..:..::..:  ..:. ...: ....::   . .  .  : .. :.   : ..: .   :
CCDS14 FVGEIVCETPFRLHGKDVTQLTRQDLCPRKSASDSSQRGSHADTHVQRLSPTMNPALNPT
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pF1KB8 KTTSILKLPTKAPGLIPYIT--------KP----STQLPGPY-CPIPCNCKVLSP-SGLL
       .. .  . :       : .:         :    .:. : :  ::  : :   :  .:: 
CCDS14 RAPKASRPPKMRNRPTPRVTVSKDRQSFGPIMVYQTKSPVPLTCPSSCVCTSQSSDNGLN
        300       310       320       330       340       350      

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pF1KB8 IHCQERNIESLSDLRPPPQNPRKLILAGNIIHSLMKSDLVEYFTLEMLHLGNNRIEVLEE
       ..::::.. ..:::.: : .:.:: :.:: .....:.::.:: .:..:::::::: :..:
CCDS14 VNCQERKFTNISDLQPKPTSPKKLYLTGNYLQTVYKNDLLEYSSLDLLHLGNNRIAVIQE
        360       370       380       390       400       410      

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pF1KB8 GSFMNLTRLQKLYLNGNHLTKLSKGMFLGLHNLEYLYLEYNAIKEILPGTFNPMPKLKVL
       :.: ::: :..::::::.:  :  .:: ::..:.:::::::.:::: : ::. . .:..:
CCDS14 GAFTNLTSLRRLYLNGNYLEVLYPSMFDGLQSLQYLYLEYNVIKEIKPLTFDALINLQLL
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pF1KB8 YLNNNLLQVLPPHIFSGVPLTKVNLKTNQFTHLPVSNILDDLDLLTQIDLEDNPWDCSCD
       .::::::. :: .::.:. ::..::..:.:.::::...::.:  . ::::..:::::.::
CCDS14 FLNNNLLRSLPDNIFGGTALTRLNLRNNHFSHLPVKGVLDQLPAFIQIDLQENPWDCTCD
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pF1KB8 LVGLQQWIQKLSKNTVTDDILCTSPGHLDKKELKALNSEILCPGLVNNPSMPTQTSYLM-
       ..::..: .. .. .. ... : ::..   . :: :. : .::   ..:..   :   : 
CCDS14 IMGLKDWTEHANSPVIINEVTCESPAKHAGEILKFLGREAICP---DSPNLSDGTVLSMN
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pF1KB8 --VTTPATTTNTADTILRSLTDAVPLSVLILGLLIMFITIVFCAAGIVVLVLHRRRRYKK
         . :: . . . ..    :   :::::::::::..::  :  .::. :.::.::.   .
CCDS14 HNTDTPRSLSVSPSSY-PELHTEVPLSVLILGLLVVFILSVCFGAGLFVFVLKRRKGVPS
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pF1KB8 KQVDEQMRDNSPVHLQYSMYGHKTTHHTTERPSASLYEQHMVSPMVHVYRSPSFGPKHLE
          . .  : :  .:::. :. .: :  :.   . .:. ..  :. .. ..: .  :. .
CCDS14 VPRNTNNLDVSSFQLQYGSYNTET-HDKTD---GHVYN-YIPPPVGQMCQNPIYMQKEGD
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pF1KB8 E-EEERNEKEGSDAKHLQRSLLEQENHSPLTGSNMKYKTTNQSTEFLSFQ----DASSLY
            :: .:      .. : ::.... : : .   :  : ..::.:  :    .   ::
CCDS14 PVAYYRNLQE------FSYSNLEEKKEEPATPA---Y--TISATELLEKQATPREPELLY
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pF1KB8 RNILEKERELQQLGITEYLRKNIA--QLQPDMEAHYPGAHEELKLMETLMYSRPRKVLVE
       .:: :. .:: . :...:   ..   :. :..:..    ... .. .:..:. ::: .: 
CCDS14 QNIAERVKELPSAGLVHYNFCTLPKRQFAPSYESRR---QNQDRINKTVLYGTPRKCFVG
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pF1KB8 QTKNEYFELKANLHAEPDYLEVLEQQT     
       :.: ..  :.:. ..:::::::::.::     
CCDS14 QSKPNHPLLQAKPQSEPDYLEVLEKQTAISQL
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>>CCDS9464.1 SLITRK1 gene_id:114798|Hs108|chr13           (696 aa)
 initn: 1591 init1: 793 opt: 931  Z-score: 813.5  bits: 161.3 E(32554): 5.4e-39
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pF1KB8 MKLWIHLFYSSLLACISLHSQTPVLSSRGSC-DSLCNCEEKDGTMLINCEAKGIKMVSEI
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CCDS94 MLLWILLLETSL--CFAAGNVTGDV-----CKEKICSCNEIEGDLHVDCEKKGFTSLQRF
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pF1KB8 SVPPSRPFQLSLLNNGLTMLHTNDFSGLTNAISIHLGFNNIADIEIGAFNGLGLLKQLHI
       ..: :. ..: : .:.:: :  :.:... ::.:.:.  :.. .:  ::: :: :.:.:::
CCDS94 TAPTSQFYHLFLHGNSLTRLFPNEFANFYNAVSLHMENNGLHEIVPGAFLGLQLVKRLHI
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pF1KB8 NHNSLEILKEDTFHGLENLEFLQADNNFITVIEPSAFSKLNRLKVLILNDNAIESLPPNI
       :.:... ....:: ::..::.:::: :..  :.:.::. ::.:.::::::: : .:: :.
CCDS94 NNNKIKSFRKQTFLGLDDLEYLQADFNLLRDIDPGAFQDLNKLEVLILNDNLISTLPANV
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pF1KB8 FRFVPLTHLDLRGNQLQTLPYVGFLEHIGRILDLQLEDNKWACNCDLLQLKTWLENMPPQ
       :..::.::::::::.:.::::   ::.:  : .. :::: : :.::::.:: ::::.: .
CCDS94 FQYVPITHLDLRGNRLKTLPYEEVLEQIPGIAEILLEDNPWDCTCDLLSLKEWLENIPKN
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pF1KB8 SIIGDVVCNSPPFFKGSILSRLKKESICP----------TPPVYEEHEDPSGSL------
       ..:: :::..:  ..:. :..  ....::          .::. ::   : : :      
CCDS94 ALIGRVVCEAPTRLQGKDLNETTEQDLCPLKNRVDSSLPAPPAQEETFAP-GPLPTPFKT
           240       250       260       270       280        290  

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pF1KB8 -----HLAATSSINDSRMSTKTTSILKLPTKAPGLIPYITKP-STQLPGPYCPIPCNCKV
            : .  :. : .     . .:   :: : .     .:: ...::   ::  :.:  
CCDS94 NGQEDHATPGSAPNGGTKIPGNWQIKIRPTAAIATGSSRNKPLANSLP---CPGGCSCDH
            300       310       320       330       340            

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pF1KB8 LSPSGLLIHCQERNIESLSDLRPPPQNPRKLILAGNIIHSLMKSDLVEYFTLEMLHLGNN
       .  ::: ..:..::. ::.::.:  .: ..:.:  : :::. :: .:.: .: .: ::::
CCDS94 IPGSGLKMNCNNRNVSSLADLKPKLSNVQELFLRDNKIHSIRKSHFVDYKNLILLDLGNN
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pF1KB8 RIEVLEEGSFMNLTRLQKLYLNGNHLTKLSKGMFLGLHNLEYLYLEYNAIKEILPGTFNP
        : ..:...: ::  :. ::...:.:  ::.  : ::.::::: .:::::. ::::::: 
CCDS94 NIATVENNTFKNLLDLRWLYMDSNYLDTLSREKFAGLQNLEYLNVEYNAIQLILPGTFNA
     410       420       430       440       450       460         

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pF1KB8 MPKLKVLYLNNNLLQVLPPHIFSGVPLTKVNLKTNQFTHLPVSNILDDLDLLTQIDLEDN
       ::::..: ::::::. ::  .:.:: :.:..:..: : .:::...::.:  . ::::. :
CCDS94 MPKLRILILNNNLLRSLPVDVFAGVSLSKLSLHNNYFMYLPVAGVLDQLTSIIQIDLHGN
     470       480       490       500       510       520         

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pF1KB8 PWDCSCDLVGLQQWIQKLSKNTVTDDILCTSPGHLDKKELKALNSEILCPGLVNNPSMPT
       ::.::: .: ..:: ..:..... .:. : .: .. .:..  :... .:: :    : ::
CCDS94 PWECSCTIVPFKQWAERLGSEVLMSDLKCETPVNFFRKDFMLLSNDEICPQLYARIS-PT
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pF1KB8 QTSYLMVTTPATTTNT-ADTILRSLTDAVPLSVLILGLLIMFITIVFCAAGIVVLVLHRR
        ::.   .:  . :.: ... :   :. : .:::. :::..:.: .: ..:..:..:. :
CCDS94 LTSHSKNSTGLAETGTHSNSYLD--TSRVSISVLVPGLLLVFVTSAFTVVGMLVFILRNR
      590       600       610         620       630       640      

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pF1KB8 RRYKKKQVDEQMRD-NSPVHLQYSMYGHKTTHHTTERPSASLYEQHMVSPMVHVYRSPSF
       .: :..... .  . ::   .  : : :                                
CCDS94 KRSKRRDANSSASEINSLQTVCDSSYWHNGPYNADGAHRVYDCGSHSLSD          
        650       660       670       680       690                

>>CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5                (1523 aa)
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pF1KB8        MKLWIHLFYSSLLACISLHSQTPVLSSRGSCDSLCNCEEKDGTMLINCEAKGI
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CCDS43 MAPGWAGVGAAVRARLALALALASVLSGPPAVA----CPTKCTCSAAS----VDCHGLGL
               10        20        30            40            50  

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pF1KB8 KMVSEISVPPSRPFQLSLLNNGLTMLHTNDFSGLTNAISIHLGFNNIADIEIGAFNGLGL
       . : . ..: .   .:.:  :..: .   ::.:: :   .::  :... :: :::. :  
CCDS43 RAVPR-GIPRNAE-RLDLDRNNITRITKMDFAGLKNLRVLHLEDNQVSVIERGAFQDLKQ
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CCDS64 -----------------------------PSCNANSISCPSPCTC-----SNNIVDCRGK
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CCDS64 KLQTISKGLFA--PLQSI-----QTLHLA-----------------QNPFVCDCHLKWLA
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>>CCDS7453.1 SLIT1 gene_id:6585|Hs108|chr10               (1534 aa)
 initn: 424 init1: 235 opt: 465  Z-score: 406.7  bits: 87.1 E(32554): 2.5e-16
Smith-Waterman score: 537; 26.3% identity (54.0% similar) in 548 aa overlap (30-567:33-514)

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CCDS74 NIPRNTE-RLELNGNNITRIHKNDFAGLKQLRVLQLMENQIGAVERGAFDDMKELERLRL
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CCDS74 FRALRGLEVLTLNNNNITTIPVSSF-NHMPKLRTFRLHSNHLFCDCHLAWLSQWLRQRPT
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pF1KB8 QSIIGDVVCNSPPFFKGSILSRLKK-ESICPTPPVYEEHEDPSGSLHLAATSSINDSRMS
        ... .  :..:  ..:  .....: :  :            ::.               
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CCDS74 -----------GEAGRVPTCT-----LSSGSCPAMCTC-----SNGIVDCRGKGLTAIPA
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