Result of FASTA (ccds) for pF1KB8630
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8630, 836 aa
  1>>>pF1KB8630 836 - 836 aa - 836 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6633+/-0.00121; mu= 18.6758+/- 0.072
 mean_var=71.4622+/-14.775, 0's: 0 Z-trim(101.7): 80  B-trim: 0 in 0/47
 Lambda= 0.151718
 statistics sampled from 6539 (6612) to 6539 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.551), E-opt: 0.2 (0.203), width:  16
 Scan time:  3.620

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS9025.1 TMTC2 gene_id:160335|Hs108|chr12        ( 836) 5519 1218.1       0
CCDS81717.1 TMTC2 gene_id:160335|Hs108|chr12       ( 637) 4146 917.5       0
CCDS9032.1 TMTC3 gene_id:160418|Hs108|chr12        ( 914)  777 180.2 1.4e-44
CCDS53772.1 TMTC1 gene_id:83857|Hs108|chr12        ( 882)  553 131.2 7.8e-30
CCDS8718.1 TMTC1 gene_id:83857|Hs108|chr12         ( 774)  422 102.5   3e-21
CCDS66575.1 TMTC4 gene_id:84899|Hs108|chr13        ( 630)  307 77.3 9.5e-14
CCDS41904.1 TMTC4 gene_id:84899|Hs108|chr13        ( 741)  307 77.3 1.1e-13
CCDS9497.2 TMTC4 gene_id:84899|Hs108|chr13         ( 760)  307 77.3 1.1e-13


>>CCDS9025.1 TMTC2 gene_id:160335|Hs108|chr12             (836 aa)
 initn: 5519 init1: 5519 opt: 5519  Z-score: 6523.9  bits: 1218.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5519; 100.0% identity (100.0% similar) in 836 aa overlap (1-836:1-836)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MIAELVSSALGLALYLNTLSADFCYDDSRAIKTNQDLLPETPWTHIFYNDFWGTLLTHSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 MIAELVSSALGLALYLNTLSADFCYDDSRAIKTNQDLLPETPWTHIFYNDFWGTLLTHSG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 SHKSYRPLCTLSFRLNHAIGGLNPWSYHLVNVLLHAAVTGLFTSFSKILLGDGYWTFMAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 SHKSYRPLCTLSFRLNHAIGGLNPWSYHLVNVLLHAAVTGLFTSFSKILLGDGYWTFMAG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 LMFASHPIHTEAVAGIVGRADVGASLFFLLSLLCYIKHCSTRGYSARTWGWFLGSGLCAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 LMFASHPIHTEAVAGIVGRADVGASLFFLLSLLCYIKHCSTRGYSARTWGWFLGSGLCAG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 CSMLWKEQGVTVLAVSAVYDVFVFHRLKIKQILPTIYKRKNLSLFLSISLLIFWGSSLLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 CSMLWKEQGVTVLAVSAVYDVFVFHRLKIKQILPTIYKRKNLSLFLSISLLIFWGSSLLG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 ARLYWMGNKPPSFSNSDNPAADSDSLLTRTLTFFYLPTKNLWLLLCPDTLSFDWSMDAVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 ARLYWMGNKPPSFSNSDNPAADSDSLLTRTLTFFYLPTKNLWLLLCPDTLSFDWSMDAVP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 LLKTVCDWRNLHTVAFYTGLLLLAYYGLKSPSVDRECNGKTVTNGKQNANGHSCLSDVEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 LLKTVCDWRNLHTVAFYTGLLLLAYYGLKSPSVDRECNGKTVTNGKQNANGHSCLSDVEY
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 QNSETKSSFASKVENGIKNDVSQRTQLPSTENIVVLSLSLLIIPFVPATNLFFYVGFVIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 QNSETKSSFASKVENGIKNDVSQRTQLPSTENIVVLSLSLLIIPFVPATNLFFYVGFVIA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB8 ERVLYIPSMGFCLLITVGARALYVKVQKRFLKSLIFYATATLIVFYGLKTAIRNGDWQNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 ERVLYIPSMGFCLLITVGARALYVKVQKRFLKSLIFYATATLIVFYGLKTAIRNGDWQNE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB8 EMLYRSGIKVNPAKAWGNLGNVLKSQSKISEAESAYRNALYYRSNMADMLYNLGLLLQEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 EMLYRSGIKVNPAKAWGNLGNVLKSQSKISEAESAYRNALYYRSNMADMLYNLGLLLQEN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB8 SRFAEALHYYKLAIGSRPTLASAYLNTGIILMNQGRTEEARRTFLKCSEIPDENLKDPHA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 SRFAEALHYYKLAIGSRPTLASAYLNTGIILMNQGRTEEARRTFLKCSEIPDENLKDPHA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB8 HKSSVTSCLYNLGKLYHEQGHYEEALSVYKEAIQKMPRQFAPQSLYNMMGEAYMRLSKLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 HKSSVTSCLYNLGKLYHEQGHYEEALSVYKEAIQKMPRQFAPQSLYNMMGEAYMRLSKLP
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB8 EAEHWYMESLRSKTDHIPAHLTYGKLLALTGRKSEAEKLFLKAIELDPTKGNCYMHYGQF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 EAEHWYMESLRSKTDHIPAHLTYGKLLALTGRKSEAEKLFLKAIELDPTKGNCYMHYGQF
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB8 LLEEARLIEAAEMAKKAAELDSTEFDVVFNAAHMLRQASLNEAAEKYYDLAARLRPNYPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 LLEEARLIEAAEMAKKAAELDSTEFDVVFNAAHMLRQASLNEAAEKYYDLAARLRPNYPA
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830      
pF1KB8 ALMNLGAILHLNGRLQKAEANYLRALQLKPDDVITQSNLRKLWNIMEKQGLKTSKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 ALMNLGAILHLNGRLQKAEANYLRALQLKPDDVITQSNLRKLWNIMEKQGLKTSKT
              790       800       810       820       830      

>>CCDS81717.1 TMTC2 gene_id:160335|Hs108|chr12            (637 aa)
 initn: 4146 init1: 4146 opt: 4146  Z-score: 4901.5  bits: 917.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4146; 100.0% identity (100.0% similar) in 623 aa overlap (1-623:1-623)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MIAELVSSALGLALYLNTLSADFCYDDSRAIKTNQDLLPETPWTHIFYNDFWGTLLTHSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MIAELVSSALGLALYLNTLSADFCYDDSRAIKTNQDLLPETPWTHIFYNDFWGTLLTHSG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 SHKSYRPLCTLSFRLNHAIGGLNPWSYHLVNVLLHAAVTGLFTSFSKILLGDGYWTFMAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SHKSYRPLCTLSFRLNHAIGGLNPWSYHLVNVLLHAAVTGLFTSFSKILLGDGYWTFMAG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 LMFASHPIHTEAVAGIVGRADVGASLFFLLSLLCYIKHCSTRGYSARTWGWFLGSGLCAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LMFASHPIHTEAVAGIVGRADVGASLFFLLSLLCYIKHCSTRGYSARTWGWFLGSGLCAG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 CSMLWKEQGVTVLAVSAVYDVFVFHRLKIKQILPTIYKRKNLSLFLSISLLIFWGSSLLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 CSMLWKEQGVTVLAVSAVYDVFVFHRLKIKQILPTIYKRKNLSLFLSISLLIFWGSSLLG
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 ARLYWMGNKPPSFSNSDNPAADSDSLLTRTLTFFYLPTKNLWLLLCPDTLSFDWSMDAVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ARLYWMGNKPPSFSNSDNPAADSDSLLTRTLTFFYLPTKNLWLLLCPDTLSFDWSMDAVP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 LLKTVCDWRNLHTVAFYTGLLLLAYYGLKSPSVDRECNGKTVTNGKQNANGHSCLSDVEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LLKTVCDWRNLHTVAFYTGLLLLAYYGLKSPSVDRECNGKTVTNGKQNANGHSCLSDVEY
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 QNSETKSSFASKVENGIKNDVSQRTQLPSTENIVVLSLSLLIIPFVPATNLFFYVGFVIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QNSETKSSFASKVENGIKNDVSQRTQLPSTENIVVLSLSLLIIPFVPATNLFFYVGFVIA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB8 ERVLYIPSMGFCLLITVGARALYVKVQKRFLKSLIFYATATLIVFYGLKTAIRNGDWQNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ERVLYIPSMGFCLLITVGARALYVKVQKRFLKSLIFYATATLIVFYGLKTAIRNGDWQNE
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB8 EMLYRSGIKVNPAKAWGNLGNVLKSQSKISEAESAYRNALYYRSNMADMLYNLGLLLQEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EMLYRSGIKVNPAKAWGNLGNVLKSQSKISEAESAYRNALYYRSNMADMLYNLGLLLQEN
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB8 SRFAEALHYYKLAIGSRPTLASAYLNTGIILMNQGRTEEARRTFLKCSEIPDENLKDPHA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SRFAEALHYYKLAIGSRPTLASAYLNTGIILMNQGRTEEARRTFLKCSEIPDENLKDPHA
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB8 HKSSVTSCLYNLGKLYHEQGHYEEALSVYKEAIQKMPRQFAPQSLYNMMGEAYMRLSKLP
       :::::::::::::::::::::::                                     
CCDS81 HKSSVTSCLYNLGKLYHEQGHYEVWPMPLCPFPSPLF                       
              610       620       630                              

>>CCDS9032.1 TMTC3 gene_id:160418|Hs108|chr12             (914 aa)
 initn: 1087 init1: 296 opt: 777  Z-score: 913.8  bits: 180.2 E(32554): 1.4e-44
Smith-Waterman score: 1131; 30.2% identity (58.6% similar) in 850 aa overlap (13-835:18-792)

                    10        20        30        40        50     
pF1KB8      MIAELVSSALGLALYLNTLSADFCYDDSRAIKTNQDLLPETPWTHIFYNDFWGTL
                        : : :.:   : .::  ::  :.:: : ::   .: :::::: 
CCDS90 MANINLKEITLIVGVVTACYWNSLFCGFVFDDVSAILDNKDLHPSTPLKTLFQNDFWGTP
               10        20        30        40        50        60

          60        70        80        90       100       110     
pF1KB8 LTHSGSHKSYRPLCTLSFRLNHAIGGLNPWSYHLVNVLLHAAVTGLFTSFSKILLGDGYW
       ...  :::::::: .:.::::. .. :.: ::::.:...::.:. .: .  :..: :.  
CCDS90 MSEERSHKSYRPLTVLTFRLNYLLSELKPMSYHLLNMIFHAVVSVIFLKVCKLFL-DNKS
               70        80        90       100       110          

         120       130       140       150       160        170    
pF1KB8 TFMAGLMFASHPIHTEAVAGIVGRADVGASLFFLLSLLCYIKHCSTRGYSART-WGWFLG
       . .:.:.:: ::::::::.:.::::.. .:.::: ..: : .   ..: .    :  .  
CCDS90 SVIASLLFAVHPIHTEAVTGVVGRAELLSSIFFLAAFLSYTR---SKGPDNSIIWTPIAL
     120       130       140       150       160          170      

          180       190       200       210         220            
pF1KB8 SGLCAGCSMLWKEQGVTVLAVSAVYDVFVFHRLKIKQILPTI--YKRKNLSLFLS-----
       . . .. . : ::::.::...  ::.::. .   .  .  :   . : . :. .:     
CCDS90 TVFLVAVATLCKEQGITVVGICCVYEVFIAQGYTLPLLCTTAGQFLRGKGSIPFSMLQTL
        180       190       200       210       220       230      

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       ..:...  :.:: .  :.  . .. : :.  ::::: : .  :: ::: ::   : ::::
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        :. :  ::.: ..::.... : ::: : .:.  : .:. ....                
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                     :... .:.                          :...: :. .::
CCDS90 --------------YSGDSSKT--------------------------VLMALCLMALPF
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       .::.:::: ::::.::::::.::::::.:.. : . . .:     .:.: .   . .:. 
CCDS90 IPASNLFFPVGFVVAERVLYVPSMGFCILVAHGWQKISTK---SVFKKLSWICLSMVILT
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       ..:::  :: ::..:  :. :..:::   :: :.:.:..:...... .: . . .: . .
CCDS90 HSLKTFHRNWDWESEYTLFMSALKVNKNNAKLWNNVGHALENEKNFERALKYFLQATHVQ
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        .     .:.:   .. .:  :: . : .: .  : .          :  .::. : : :
CCDS90 PDDIGAHMNVGRTYKNLNRTKEAEESYMMAKSLMPQIIPGKKYAARIAPNHLNVYINLAN
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pF1KB8 QGRTEEARRTFLKCSEIPDENLKDPHAHKSSVTSCLYNLGKLYHEQGHYEEALSVYKEAI
         :..:.:       :  :.  ..  . . .  .   . :.:  ....  .:  .: .:.
CCDS90 LIRANESRL------EEADQLYRQAISMRPDFKQAYISRGELLLKMNKPLKAKEAYLKAL
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pF1KB8 QKMPRQFAPQSLYNMMGEAYMRLSKLPEAEHWYMESLRSKTDHIPAHLTYGKLLALTGR-
       . . :. :  .:.  .. ....:..  :: . . ..:. .  :  : .. . ..  .:. 
CCDS90 E-LDRNNA--DLWYNLAIVHIELKEPNEALKNFNRALELNPKHKLALFNSAIVMQESGEV
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pF1KB8 --KSEAEKLFLKAIELDPTKGNCYMHYGQFLLEEARLIEAAEMAKKAAELDSTEFDVVFN
         . ::.: .:. :. .:  .: :.. :.. ... .  ::    ::: .:..   ...::
CCDS90 KLRPEARKRLLSYINEEPLDANGYFNLGMLAMDDKKDNEAEIWMKKAIKLQADFRSALFN
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pF1KB8 AAHMLRQASLNEAAEKYYDLAARLRPNYPAALMNLGAILHLNGR--LQKAEANYLRALQL
        : .  :.. .  :    .   :  :..  .:.  : :: .: .  .  :.  . : :..
CCDS90 LALLYSQTAKELKALPILEELLRYYPDHIKGLILKGDIL-MNQKKDILGAKKCFERILEM
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pF1KB8 KPDDVITQSNLRKLWNIMEKQGLKTSKT                                
        :..:  . ::  .. . ::. ::. .                                 
CCDS90 DPSNVQGKHNLCVVY-FEEKDLLKAERCLLETLALAPHEEYIQRHLNIVRDKISSSSFIE
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       ..::  ::  :. . .: .. .   .:...:.:: ::::::::::::::::: : :.:::
CCDS53 IILHCLVTLVLMYTCDKTVFKNRGLAFVTALLFAVHPIHTEAVAGIVGRADVLACLLFLL
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CCDS53 AFLSYNRSLDQGCVGGSFPSTVSPFFLLLSLFLGTCAMLVKETGITVFGVCLVYDLFSLS
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         . :.    . :   .. .     :.        :..  .  .  : : .   ::  ..
CCDS53 NKQDKSSNGALCPRSPQQPGSPQPSSLPGHPHRENGKQQRFPHKGAWGGCHSPLPPEPKS
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pF1KB8 SDNPAADSDSL-LTRTLTFFYLPTKNLWLLLCPDTLSFDWSMDAVPLLKTVCDWRNLHTV
       :  :..      . : ::. :: . :.:::: : :: .::.. ..::..:. : ::: :.
CCDS53 SGFPVSPRAVWSMMRFLTYSYLLAFNVWLLLAPVTLCYDWQVGSIPLVETIWDMRNLATI
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        . . . ::. .                           ::.   ..  : :        
CCDS53 FLAVVMALLSLH---------------------------CLA--AFKRLEHKE-------
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                          :...: .:..::.::.:::: ::::.::::::.::::.:.:
CCDS53 -------------------VLVGLLFLVFPFIPASNLFFRVGFVVAERVLYMPSMGYCIL
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pF1KB8 ITVGARALYVKVQKRFLKSLIFYATATLIVFYGLKTAIRNGDWQNEEMLYRSGIKVNP--
       .. :   : . ...    .::  .:. :..... ::. .:  : ..: :.:::... :  
CCDS53 FVHGLSKLCTWLNRCGATTLIV-STVLLLLLFSWKTVKQNEIWLSRESLFRSGVQTLPHN
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       ::.  : .: ::.:.. .::   ::.::      :. : ::: : ...   :::  ::. 
CCDS53 AKVHYNYANFLKDQGRNKEAIYHYRTALKLYPRHASALNNLGTLTRDT---AEAKMYYQR
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pF1KB8 AIGSRPTLASAYLNTGIILMNQGRTEEARRTFLKCS-----EIPD------------ENL
       :.  .:    : .: : .: .: . :::  :.:: :     :. :            : .
CCDS53 ALQLHPQHNRALFNLGNLLKSQEKKEEAI-TLLKDSIKYGPEFADAYSSLASLLAEQERF
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pF1KB8 KDPHA-HKSSVTSC-----LYN-LGKLYHEQGHYEEALSVYKEAIQKMPRQFAPQSLYNM
       :. .  ..... .:     :.:  : .  . :  :.:.. :..::.  : . .  .. :.
CCDS53 KEAEEIYQTGIKNCPDSSDLHNNYGVFLVDTGLPEKAVAHYQQAIKLSPSHHV--AMVNL
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pF1KB8 MGEAYMRLSKLPEAEHWYMESLRSKTDHIPAHLT-YGKLLALTGRKSEAEKLFLKAIELD
        :. :  :..   ::.:: ..:  .. :    :.  : :   :::  :: ... .:  :.
CCDS53 -GRLYRSLGENSMAEEWYKRAL--QVAHKAEILSPLGALYYNTGRYEEALQIYQEAAALQ
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pF1KB8 PTKGNCYMHYGQFL-----------------------LEEARLI-----------EAAEM
       :.. .  .  .: :                       ::  ::.           .: . 
CCDS53 PSQRELRLALAQVLAVMGQTKEAEKMTNHIVSEETGCLECYRLLSAIYSKQENHDKALDA
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pF1KB8 AKKAAELDSTEFDVV----FNAAHMLRQASLNEAAEKYYDLAARLRPNYPAALMNLGAIL
         :: .:   .  :.    :. ...::. .: . : . : .:..: :.   : ::.:.: 
CCDS53 IDKALQLKPKDPKVISELFFTKGNQLREQNLLDKAFESYRVAVQLNPDQAQAWMNMGGIQ
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pF1KB8 HLNGRLQKAEANYLRALQLKPDDVITQSNLRKLWNIMEKQGLKTSKT   
       :..:.  .:.: : ::::: ::. . . :: :: . .::.          
CCDS53 HIKGKYVSARAYYERALQLVPDSKLLKENLAKL-DRLEKRLQEVREKDQT
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>>CCDS8718.1 TMTC1 gene_id:83857|Hs108|chr12              (774 aa)
 initn: 965 init1: 221 opt: 422  Z-score: 495.0  bits: 102.5 E(32554): 3e-21
Smith-Waterman score: 914; 30.8% identity (54.2% similar) in 812 aa overlap (82-811:1-747)

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CCDS87                               MNPFYFHAVNIILHCLVTLVLMYTCDKTVF
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pF1KB8 GDGYWTFMAGLMFASHPIHTEAVAGIVGRADVGASLFFLLSLLCYIKH----CSTRGYSA
        .   .:...:.:: ::::::::::::::::: : :.:::..: : .     :   .. .
CCDS87 KNRGLAFVTALLFAVHPIHTEAVAGIVGRADVLACLLFLLAFLSYNRSLDQGCVGGSFPS
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pF1KB8 RTWGWFLGSGLCAG-CSMLWKEQGVTVLAVSAVYDVFVFHRLKIKQ----ILPTIYKRKN
        .  .::  .:  : :.:: :: :.::..:  :::.: .   . :.    . :   .. .
CCDS87 TVSPFFLLLSLFLGTCAMLVKETGITVFGVCLVYDLFSLSNKQDKSSNGALCPRSPQQPG
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            :.        :..  .  .  : : .   ::  ..:  :..      . : ::. 
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       :: . :.:::: : :: .::.. ..::..:. : ::: :. . . . ::. .        
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       ...: .:..::.::.:::: ::::.::::::.::::.:.:.. :   : . ...    .:
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       :  .:. :..... ::. .:  : ..: :.:::... :  ::.  : .: ::.:.. .::
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          ::.::      :. : ::: : ...   :::  ::. :.  .:    : .: : .: 
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       .: . :::  :.:: :     :. :            : .:. .  ..... .:     :
CCDS87 SQEKKEEAI-TLLKDSIKYGPEFADAYSSLASLLAEQERFKEAEEIYQTGIKNCPDSSDL
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       .:  : .  . :  :.:.. :..::.  : . .  .. :. :. :  :..   ::.:: .
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       .:  .. :    :.  : :   :::  :: ... .:  :.:.. .  .  .: :      
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       . ...::. .: . : . : .:..: :.   : ::.:.: :..:.  .:.: : ::::: 
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       ::                           
CCDS87 PDSKLLKENLAKLDRLEKRLQEVREKDQT
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>>CCDS66575.1 TMTC4 gene_id:84899|Hs108|chr13             (630 aa)
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CCDS66 ---------RRILTLGLGFLVIPFLPASNLFFRVGFVVAERVLYLPSVGYCVLLTFGFGA
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       :. : .... . :   ::.:.    ...  . ::: .:.: ... :: .  .::.  .: 
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pF1KB8 LASAYLNTGIILMNQGRTEEARRTFLKCSEIPDENLKDPHAHKSSVTSCLYNLGKLYHEQ
       .:.:..: ::.  .  : : :....           .    :. .  .: ::::.:: . 
CCDS66 FAAAWMNLGIVQNSLKRFEAAEQSY-----------RTAIKHRRKYPDCYYNLGRLYADL
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       ... .::.....: . :  ...: ...  .. ..    ..: .::    :.:.   .   
CCDS66 NRHVDALNAWRNATVLKPEHSLAWNNMIILLDNT----GNLAQAEAVGREALELIPNDHS
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         .. ...:. . . .:.: ::::::. .:   :   ..:.. .   :  .  ..:::  
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CCDS66 EI-SLQLDPTASGTKENYGLLRRKLELMQKKAV                           
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>>CCDS41904.1 TMTC4 gene_id:84899|Hs108|chr13             (741 aa)
 initn: 1171 init1: 280 opt: 307  Z-score: 359.2  bits: 77.3 E(32554): 1.1e-13
Smith-Waterman score: 1275; 32.4% identity (63.2% similar) in 774 aa overlap (3-746:22-716)

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                            :.:: ...... .  . ..:: .:::.:: .:.::  ::
CCDS41 MAVLDTDLDHILPSSVLPPFWAKLVVGSVAIVCFARSYDGDFVFDDSEAIVNNKDLQAET
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pF1KB8 PWTHIFYNDFWGTLLTHSGSHKSYRPLCTLSFRLNHAI-GGLNPWSYHLVNVLLHAAVTG
       :   ....::::. :. . :::::::: .:.::.:. . ::..: ..:.::.:::.... 
CCDS41 PLGDLWHHDFWGSRLSSNTSHKSYRPLTVLTFRINYYLSGGFHPVGFHVVNILLHSGISV
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pF1KB8 LFTSFSKILLGDGYWT-------------FMAGLMFASHPIHTEAVAGIVGRADVGASLF
       :...  ..:.:   .:             ..:.:.:: ::.::: :::.:::::.  .::
CCDS41 LMVDVFSVLFGGLQYTSKGRRLHLAPRASLLAALLFAVHPVHTECVAGVVGRADLLCALF
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pF1KB8 FLLSLLCYIK---HCSTRGYSARTWGWFLGSGLCAGCSMLWKEQGVTVLAVSAVYDVFVF
       ::::.: : :   . . .:  . :. : : : . .. .:: ::::.:::...::.:..:.
CCDS41 FLLSFLGYCKAFRESNKEGAHSSTF-WVLLSIFLGAVAMLCKEQGITVLGLNAVFDILVI
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pF1KB8 HRLKIKQILPTI-YKRKNL---------SLFLSISLLIFWGSSLLGARLYWMGNKPPSFS
        .... .:.  . .: :.:         .:.. ..::   :...: .:   ::. ::.:.
CCDS41 GKFNVLEIVQKVLHKDKSLENLGMLRNGGLLFRMTLLTSGGAGMLYVRWRIMGTGPPAFT
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pF1KB8 NSDNPAADSDSLLTRTLTFFYLPTKNLWLLLCPDTLSFDWSMDAVPLLKTVCDWRNLHTV
       . ::::. .::.:.:.... :  . : ::::::  : :::::  .::.:.. ::: .  .
CCDS41 EVDNPASFADSMLVRAVNYNYYYSLNAWLLLCPWWLCFDWSMGCIPLIKSISDWRVIALA
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pF1KB8 AFYTGLLLLAYYGLKSPSVDRECNGKTVTNGKQNANGHSCLSDVEYQNSETKSSFASKVE
       :..  :. :   .:        :.           .::.                     
CCDS41 ALWFCLIGLICQAL--------CS----------EDGHK---------------------
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pF1KB8 NGIKNDVSQRTQLPSTENIVVLSLSLLIIPFVPATNLFFYVGFVIAERVLYIPSMGFCLL
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CCDS41 ----------------RRILTLGLGFLVIPFLPASNLFFRVGFVVAERVLYLPSVGYCVL
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