Result of FASTA (omim) for
pF1KB8630
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8630, 836 aa
1>>>pF1KB8630 836 - 836 aa - 836 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2023+/-0.000507; mu= 21.2416+/- 0.031
mean_var=73.5161+/-15.360, 0's: 0 Z-trim(108.6): 205 B-trim: 593 in 2/49
Lambda= 0.149583
statistics sampled from 16444 (16669) to 16444 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.535), E-opt: 0.2 (0.195), width: 16
Scan time: 8.190
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_689801 (OMIM: 615856) transmembrane and TPR rep ( 836) 5519 1201.5 0
XP_016874373 (OMIM: 615856) PREDICTED: transmembra ( 719) 4720 1029.0 0
NP_001307251 (OMIM: 615856) transmembrane and TPR ( 637) 4146 905.1 0
NP_001307250 (OMIM: 615856) transmembrane and TPR ( 591) 3855 842.3 0
NP_001180380 (OMIM: 615855) transmembrane and TPR ( 882) 553 129.8 5.2e-29
XP_016875494 (OMIM: 615855) PREDICTED: transmembra ( 813) 531 125.0 1.3e-27
XP_016875493 (OMIM: 615855) PREDICTED: transmembra ( 875) 511 120.8 2.8e-26
XP_016875496 (OMIM: 615855) PREDICTED: transmembra ( 618) 432 103.6 2.9e-21
XP_005253556 (OMIM: 615855) PREDICTED: transmembra ( 944) 432 103.7 4e-21
NP_787057 (OMIM: 615855) transmembrane and TPR rep ( 774) 422 101.5 1.5e-20
XP_016875495 (OMIM: 615855) PREDICTED: transmembra ( 668) 253 65.0 1.3e-09
XP_016875492 (OMIM: 615855) PREDICTED: transmembra ( 888) 253 65.1 1.6e-09
NP_858059 (OMIM: 300255) UDP-N-acetylglucosamine-- (1036) 251 64.7 2.5e-09
NP_858058 (OMIM: 300255) UDP-N-acetylglucosamine-- (1046) 251 64.7 2.5e-09
NP_001239607 (OMIM: 209900,600374,615982) Bardet-B ( 347) 163 45.4 0.00055
XP_011520151 (OMIM: 209900,600374,615982) PREDICTE ( 347) 163 45.4 0.00055
XP_011520150 (OMIM: 209900,600374,615982) PREDICTE ( 347) 163 45.4 0.00055
XP_016877943 (OMIM: 209900,600374,615982) PREDICTE ( 347) 163 45.4 0.00055
XP_016877940 (OMIM: 209900,600374,615982) PREDICTE ( 347) 163 45.4 0.00055
XP_016877941 (OMIM: 209900,600374,615982) PREDICTE ( 347) 163 45.4 0.00055
XP_016877942 (OMIM: 209900,600374,615982) PREDICTE ( 347) 163 45.4 0.00055
NP_149017 (OMIM: 209900,600374,615982) Bardet-Bied ( 519) 163 45.5 0.00075
XP_011520153 (OMIM: 209900,600374,615982) PREDICTE ( 275) 156 43.8 0.0013
NP_001307594 (OMIM: 209900,600374,615982) Bardet-B ( 496) 157 44.2 0.0018
XP_016877939 (OMIM: 209900,600374,615982) PREDICTE ( 504) 157 44.2 0.0018
NP_004652 (OMIM: 603462) cell division cycle prote ( 597) 151 42.9 0.005
XP_016885396 (OMIM: 300255) PREDICTED: UDP-N-acety ( 665) 149 42.5 0.0074
XP_016885397 (OMIM: 300255) PREDICTED: UDP-N-acety ( 665) 149 42.5 0.0074
>>NP_689801 (OMIM: 615856) transmembrane and TPR repeat- (836 aa)
initn: 5519 init1: 5519 opt: 5519 Z-score: 6433.9 bits: 1201.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5519; 100.0% identity (100.0% similar) in 836 aa overlap (1-836:1-836)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MIAELVSSALGLALYLNTLSADFCYDDSRAIKTNQDLLPETPWTHIFYNDFWGTLLTHSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 MIAELVSSALGLALYLNTLSADFCYDDSRAIKTNQDLLPETPWTHIFYNDFWGTLLTHSG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 SHKSYRPLCTLSFRLNHAIGGLNPWSYHLVNVLLHAAVTGLFTSFSKILLGDGYWTFMAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 SHKSYRPLCTLSFRLNHAIGGLNPWSYHLVNVLLHAAVTGLFTSFSKILLGDGYWTFMAG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LMFASHPIHTEAVAGIVGRADVGASLFFLLSLLCYIKHCSTRGYSARTWGWFLGSGLCAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 LMFASHPIHTEAVAGIVGRADVGASLFFLLSLLCYIKHCSTRGYSARTWGWFLGSGLCAG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 CSMLWKEQGVTVLAVSAVYDVFVFHRLKIKQILPTIYKRKNLSLFLSISLLIFWGSSLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 CSMLWKEQGVTVLAVSAVYDVFVFHRLKIKQILPTIYKRKNLSLFLSISLLIFWGSSLLG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 ARLYWMGNKPPSFSNSDNPAADSDSLLTRTLTFFYLPTKNLWLLLCPDTLSFDWSMDAVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 ARLYWMGNKPPSFSNSDNPAADSDSLLTRTLTFFYLPTKNLWLLLCPDTLSFDWSMDAVP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LLKTVCDWRNLHTVAFYTGLLLLAYYGLKSPSVDRECNGKTVTNGKQNANGHSCLSDVEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 LLKTVCDWRNLHTVAFYTGLLLLAYYGLKSPSVDRECNGKTVTNGKQNANGHSCLSDVEY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 QNSETKSSFASKVENGIKNDVSQRTQLPSTENIVVLSLSLLIIPFVPATNLFFYVGFVIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 QNSETKSSFASKVENGIKNDVSQRTQLPSTENIVVLSLSLLIIPFVPATNLFFYVGFVIA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 ERVLYIPSMGFCLLITVGARALYVKVQKRFLKSLIFYATATLIVFYGLKTAIRNGDWQNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 ERVLYIPSMGFCLLITVGARALYVKVQKRFLKSLIFYATATLIVFYGLKTAIRNGDWQNE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 EMLYRSGIKVNPAKAWGNLGNVLKSQSKISEAESAYRNALYYRSNMADMLYNLGLLLQEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 EMLYRSGIKVNPAKAWGNLGNVLKSQSKISEAESAYRNALYYRSNMADMLYNLGLLLQEN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 SRFAEALHYYKLAIGSRPTLASAYLNTGIILMNQGRTEEARRTFLKCSEIPDENLKDPHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 SRFAEALHYYKLAIGSRPTLASAYLNTGIILMNQGRTEEARRTFLKCSEIPDENLKDPHA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 HKSSVTSCLYNLGKLYHEQGHYEEALSVYKEAIQKMPRQFAPQSLYNMMGEAYMRLSKLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 HKSSVTSCLYNLGKLYHEQGHYEEALSVYKEAIQKMPRQFAPQSLYNMMGEAYMRLSKLP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 EAEHWYMESLRSKTDHIPAHLTYGKLLALTGRKSEAEKLFLKAIELDPTKGNCYMHYGQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 EAEHWYMESLRSKTDHIPAHLTYGKLLALTGRKSEAEKLFLKAIELDPTKGNCYMHYGQF
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 LLEEARLIEAAEMAKKAAELDSTEFDVVFNAAHMLRQASLNEAAEKYYDLAARLRPNYPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 LLEEARLIEAAEMAKKAAELDSTEFDVVFNAAHMLRQASLNEAAEKYYDLAARLRPNYPA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KB8 ALMNLGAILHLNGRLQKAEANYLRALQLKPDDVITQSNLRKLWNIMEKQGLKTSKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 ALMNLGAILHLNGRLQKAEANYLRALQLKPDDVITQSNLRKLWNIMEKQGLKTSKT
790 800 810 820 830
>>XP_016874373 (OMIM: 615856) PREDICTED: transmembrane a (719 aa)
initn: 4720 init1: 4720 opt: 4720 Z-score: 5503.0 bits: 1029.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4720; 100.0% identity (100.0% similar) in 719 aa overlap (118-836:1-719)
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 HLVNVLLHAAVTGLFTSFSKILLGDGYWTFMAGLMFASHPIHTEAVAGIVGRADVGASLF
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MAGLMFASHPIHTEAVAGIVGRADVGASLF
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 FLLSLLCYIKHCSTRGYSARTWGWFLGSGLCAGCSMLWKEQGVTVLAVSAVYDVFVFHRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FLLSLLCYIKHCSTRGYSARTWGWFLGSGLCAGCSMLWKEQGVTVLAVSAVYDVFVFHRL
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 KIKQILPTIYKRKNLSLFLSISLLIFWGSSLLGARLYWMGNKPPSFSNSDNPAADSDSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KIKQILPTIYKRKNLSLFLSISLLIFWGSSLLGARLYWMGNKPPSFSNSDNPAADSDSLL
100 110 120 130 140 150
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 TRTLTFFYLPTKNLWLLLCPDTLSFDWSMDAVPLLKTVCDWRNLHTVAFYTGLLLLAYYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TRTLTFFYLPTKNLWLLLCPDTLSFDWSMDAVPLLKTVCDWRNLHTVAFYTGLLLLAYYG
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 LKSPSVDRECNGKTVTNGKQNANGHSCLSDVEYQNSETKSSFASKVENGIKNDVSQRTQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LKSPSVDRECNGKTVTNGKQNANGHSCLSDVEYQNSETKSSFASKVENGIKNDVSQRTQL
220 230 240 250 260 270
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 PSTENIVVLSLSLLIIPFVPATNLFFYVGFVIAERVLYIPSMGFCLLITVGARALYVKVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PSTENIVVLSLSLLIIPFVPATNLFFYVGFVIAERVLYIPSMGFCLLITVGARALYVKVQ
280 290 300 310 320 330
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 KRFLKSLIFYATATLIVFYGLKTAIRNGDWQNEEMLYRSGIKVNPAKAWGNLGNVLKSQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KRFLKSLIFYATATLIVFYGLKTAIRNGDWQNEEMLYRSGIKVNPAKAWGNLGNVLKSQS
340 350 360 370 380 390
510 520 530 540 550 560
pF1KB8 KISEAESAYRNALYYRSNMADMLYNLGLLLQENSRFAEALHYYKLAIGSRPTLASAYLNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KISEAESAYRNALYYRSNMADMLYNLGLLLQENSRFAEALHYYKLAIGSRPTLASAYLNT
400 410 420 430 440 450
570 580 590 600 610 620
pF1KB8 GIILMNQGRTEEARRTFLKCSEIPDENLKDPHAHKSSVTSCLYNLGKLYHEQGHYEEALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GIILMNQGRTEEARRTFLKCSEIPDENLKDPHAHKSSVTSCLYNLGKLYHEQGHYEEALS
460 470 480 490 500 510
630 640 650 660 670 680
pF1KB8 VYKEAIQKMPRQFAPQSLYNMMGEAYMRLSKLPEAEHWYMESLRSKTDHIPAHLTYGKLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VYKEAIQKMPRQFAPQSLYNMMGEAYMRLSKLPEAEHWYMESLRSKTDHIPAHLTYGKLL
520 530 540 550 560 570
690 700 710 720 730 740
pF1KB8 ALTGRKSEAEKLFLKAIELDPTKGNCYMHYGQFLLEEARLIEAAEMAKKAAELDSTEFDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALTGRKSEAEKLFLKAIELDPTKGNCYMHYGQFLLEEARLIEAAEMAKKAAELDSTEFDV
580 590 600 610 620 630
750 760 770 780 790 800
pF1KB8 VFNAAHMLRQASLNEAAEKYYDLAARLRPNYPAALMNLGAILHLNGRLQKAEANYLRALQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VFNAAHMLRQASLNEAAEKYYDLAARLRPNYPAALMNLGAILHLNGRLQKAEANYLRALQ
640 650 660 670 680 690
810 820 830
pF1KB8 LKPDDVITQSNLRKLWNIMEKQGLKTSKT
:::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LKPDDVITQSNLRKLWNIMEKQGLKTSKT
700 710
>>NP_001307251 (OMIM: 615856) transmembrane and TPR repe (637 aa)
initn: 4146 init1: 4146 opt: 4146 Z-score: 4834.2 bits: 905.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4146; 100.0% identity (100.0% similar) in 623 aa overlap (1-623:1-623)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MIAELVSSALGLALYLNTLSADFCYDDSRAIKTNQDLLPETPWTHIFYNDFWGTLLTHSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MIAELVSSALGLALYLNTLSADFCYDDSRAIKTNQDLLPETPWTHIFYNDFWGTLLTHSG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 SHKSYRPLCTLSFRLNHAIGGLNPWSYHLVNVLLHAAVTGLFTSFSKILLGDGYWTFMAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SHKSYRPLCTLSFRLNHAIGGLNPWSYHLVNVLLHAAVTGLFTSFSKILLGDGYWTFMAG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LMFASHPIHTEAVAGIVGRADVGASLFFLLSLLCYIKHCSTRGYSARTWGWFLGSGLCAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LMFASHPIHTEAVAGIVGRADVGASLFFLLSLLCYIKHCSTRGYSARTWGWFLGSGLCAG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 CSMLWKEQGVTVLAVSAVYDVFVFHRLKIKQILPTIYKRKNLSLFLSISLLIFWGSSLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CSMLWKEQGVTVLAVSAVYDVFVFHRLKIKQILPTIYKRKNLSLFLSISLLIFWGSSLLG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 ARLYWMGNKPPSFSNSDNPAADSDSLLTRTLTFFYLPTKNLWLLLCPDTLSFDWSMDAVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ARLYWMGNKPPSFSNSDNPAADSDSLLTRTLTFFYLPTKNLWLLLCPDTLSFDWSMDAVP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LLKTVCDWRNLHTVAFYTGLLLLAYYGLKSPSVDRECNGKTVTNGKQNANGHSCLSDVEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLKTVCDWRNLHTVAFYTGLLLLAYYGLKSPSVDRECNGKTVTNGKQNANGHSCLSDVEY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 QNSETKSSFASKVENGIKNDVSQRTQLPSTENIVVLSLSLLIIPFVPATNLFFYVGFVIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QNSETKSSFASKVENGIKNDVSQRTQLPSTENIVVLSLSLLIIPFVPATNLFFYVGFVIA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 ERVLYIPSMGFCLLITVGARALYVKVQKRFLKSLIFYATATLIVFYGLKTAIRNGDWQNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ERVLYIPSMGFCLLITVGARALYVKVQKRFLKSLIFYATATLIVFYGLKTAIRNGDWQNE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 EMLYRSGIKVNPAKAWGNLGNVLKSQSKISEAESAYRNALYYRSNMADMLYNLGLLLQEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EMLYRSGIKVNPAKAWGNLGNVLKSQSKISEAESAYRNALYYRSNMADMLYNLGLLLQEN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 SRFAEALHYYKLAIGSRPTLASAYLNTGIILMNQGRTEEARRTFLKCSEIPDENLKDPHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SRFAEALHYYKLAIGSRPTLASAYLNTGIILMNQGRTEEARRTFLKCSEIPDENLKDPHA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 HKSSVTSCLYNLGKLYHEQGHYEEALSVYKEAIQKMPRQFAPQSLYNMMGEAYMRLSKLP
:::::::::::::::::::::::
NP_001 HKSSVTSCLYNLGKLYHEQGHYEVWPMPLCPFPSPLF
610 620 630
>>NP_001307250 (OMIM: 615856) transmembrane and TPR repe (591 aa)
initn: 3855 init1: 3855 opt: 3855 Z-score: 4495.3 bits: 842.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3855; 100.0% identity (100.0% similar) in 591 aa overlap (246-836:1-591)
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 IYKRKNLSLFLSISLLIFWGSSLLGARLYWMGNKPPSFSNSDNPAADSDSLLTRTLTFFY
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGNKPPSFSNSDNPAADSDSLLTRTLTFFY
10 20 30
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 LPTKNLWLLLCPDTLSFDWSMDAVPLLKTVCDWRNLHTVAFYTGLLLLAYYGLKSPSVDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LPTKNLWLLLCPDTLSFDWSMDAVPLLKTVCDWRNLHTVAFYTGLLLLAYYGLKSPSVDR
40 50 60 70 80 90
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 ECNGKTVTNGKQNANGHSCLSDVEYQNSETKSSFASKVENGIKNDVSQRTQLPSTENIVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ECNGKTVTNGKQNANGHSCLSDVEYQNSETKSSFASKVENGIKNDVSQRTQLPSTENIVV
100 110 120 130 140 150
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 LSLSLLIIPFVPATNLFFYVGFVIAERVLYIPSMGFCLLITVGARALYVKVQKRFLKSLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LSLSLLIIPFVPATNLFFYVGFVIAERVLYIPSMGFCLLITVGARALYVKVQKRFLKSLI
160 170 180 190 200 210
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 FYATATLIVFYGLKTAIRNGDWQNEEMLYRSGIKVNPAKAWGNLGNVLKSQSKISEAESA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FYATATLIVFYGLKTAIRNGDWQNEEMLYRSGIKVNPAKAWGNLGNVLKSQSKISEAESA
220 230 240 250 260 270
520 530 540 550 560 570
pF1KB8 YRNALYYRSNMADMLYNLGLLLQENSRFAEALHYYKLAIGSRPTLASAYLNTGIILMNQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YRNALYYRSNMADMLYNLGLLLQENSRFAEALHYYKLAIGSRPTLASAYLNTGIILMNQG
280 290 300 310 320 330
580 590 600 610 620 630
pF1KB8 RTEEARRTFLKCSEIPDENLKDPHAHKSSVTSCLYNLGKLYHEQGHYEEALSVYKEAIQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RTEEARRTFLKCSEIPDENLKDPHAHKSSVTSCLYNLGKLYHEQGHYEEALSVYKEAIQK
340 350 360 370 380 390
640 650 660 670 680 690
pF1KB8 MPRQFAPQSLYNMMGEAYMRLSKLPEAEHWYMESLRSKTDHIPAHLTYGKLLALTGRKSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MPRQFAPQSLYNMMGEAYMRLSKLPEAEHWYMESLRSKTDHIPAHLTYGKLLALTGRKSE
400 410 420 430 440 450
700 710 720 730 740 750
pF1KB8 AEKLFLKAIELDPTKGNCYMHYGQFLLEEARLIEAAEMAKKAAELDSTEFDVVFNAAHML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AEKLFLKAIELDPTKGNCYMHYGQFLLEEARLIEAAEMAKKAAELDSTEFDVVFNAAHML
460 470 480 490 500 510
760 770 780 790 800 810
pF1KB8 RQASLNEAAEKYYDLAARLRPNYPAALMNLGAILHLNGRLQKAEANYLRALQLKPDDVIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RQASLNEAAEKYYDLAARLRPNYPAALMNLGAILHLNGRLQKAEANYLRALQLKPDDVIT
520 530 540 550 560 570
820 830
pF1KB8 QSNLRKLWNIMEKQGLKTSKT
:::::::::::::::::::::
NP_001 QSNLRKLWNIMEKQGLKTSKT
580 590
>>NP_001180380 (OMIM: 615855) transmembrane and TPR repe (882 aa)
initn: 1176 init1: 225 opt: 553 Z-score: 641.8 bits: 129.8 E(85289): 5.2e-29
Smith-Waterman score: 1147; 32.2% identity (55.8% similar) in 911 aa overlap (3-829:30-872)
10 20 30
pF1KB8 MIAELVSSALGLALYLNTLSADFCYDDSRAIKT
: :...: : : .:...: .:: :: .
NP_001 MVVTTSARGGGGDRTPSRRRGCGLAPAGAAALLAGASCLC-YGRSLQGEFVHDDVWAIVN
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 NQDLLPETP--WTHIFYNDFWGTLLTHSGSHKSYRPLCTLSFRLNHAIGGLNPWSYHLVN
: :. : .: : :: ::::: .... :::::::::.:.:.:: . :.::. .: ::
NP_001 NPDVRPGAPLRWG-IFTNDFWGKGMAENTSHKSYRPLCVLTFKLNIFLTGMNPFYFHAVN
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 VLLHAAVTG-LFTSFSKILLGDGYWTFMAGLMFASHPIHTEAVAGIVGRADVGASLFFLL
..:: :: :. . .: .. . .:...:.:: ::::::::::::::::: : :.:::
NP_001 IILHCLVTLVLMYTCDKTVFKNRGLAFVTALLFAVHPIHTEAVAGIVGRADVLACLLFLL
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200
pF1KB8 SLLCYIKH----CSTRGYSARTWGWFLGSGLCAG-CSMLWKEQGVTVLAVSAVYDVFVFH
..: : . : .. . . .:: .: : :.:: :: :.::..: :::.: .
NP_001 AFLSYNRSLDQGCVGGSFPSTVSPFFLLLSLFLGTCAMLVKETGITVFGVCLVYDLFSLS
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250
pF1KB8 RLKIKQ----ILPTIYKRKNLSLFLSISLLIFW--GSSL-LGARLYWMGNK---PPSFSN
. :. . : .. . :. :.. . . : : . :: ..
NP_001 NKQDKSSNGALCPRSPQQPGSPQPSSLPGHPHRENGKQQRFPHKGAWGGCHSPLPPEPKS
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 SDNPAADSDSL-LTRTLTFFYLPTKNLWLLLCPDTLSFDWSMDAVPLLKTVCDWRNLHTV
: :.. . : ::. :: . :.:::: : :: .::.. ..::..:. : ::: :.
NP_001 SGFPVSPRAVWSMMRFLTYSYLLAFNVWLLLAPVTLCYDWQVGSIPLVETIWDMRNLATI
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KB8 AFYTGLLLLAYYGLKSPSVDRECNGKTVTNGKQNANGHSCLSDVEYQNSETKSSFASKVE
. . . ::. . ::. .. : :
NP_001 FLAVVMALLSLH---------------------------CLA--AFKRLEHKE-------
360 370 380
380 390 400 410 420 430
pF1KB8 NGIKNDVSQRTQLPSTENIVVLSLSLLIIPFVPATNLFFYVGFVIAERVLYIPSMGFCLL
:...: .:..::.::.:::: ::::.::::::.::::.:.:
NP_001 -------------------VLVGLLFLVFPFIPASNLFFRVGFVVAERVLYMPSMGYCIL
390 400 410 420
440 450 460 470 480 490
pF1KB8 ITVGARALYVKVQKRFLKSLIFYATATLIVFYGLKTAIRNGDWQNEEMLYRSGIKVNP--
.. : : . ... .:: .:. :..... ::. .: : ..: :.:::... :
NP_001 FVHGLSKLCTWLNRCGATTLIV-STVLLLLLFSWKTVKQNEIWLSRESLFRSGVQTLPHN
430 440 450 460 470 480
500 510 520 530 540 550
pF1KB8 AKAWGNLGNVLKSQSKISEAESAYRNALYYRSNMADMLYNLGLLLQENSRFAEALHYYKL
::. : .: ::.:.. .:: ::.:: :. : ::: : ... ::: ::.
NP_001 AKVHYNYANFLKDQGRNKEAIYHYRTALKLYPRHASALNNLGTLTRDT---AEAKMYYQR
490 500 510 520 530
560 570 580 590
pF1KB8 AIGSRPTLASAYLNTGIILMNQGRTEEARRTFLKCS-----EIPD------------ENL
:. .: : .: : .: .: . ::: :.:: : :. : : .
NP_001 ALQLHPQHNRALFNLGNLLKSQEKKEEAI-TLLKDSIKYGPEFADAYSSLASLLAEQERF
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640
pF1KB8 KDPHA-HKSSVTSC-----LYN-LGKLYHEQGHYEEALSVYKEAIQKMPRQFAPQSLYNM
:. . ..... .: :.: : . . : :.:.. :..::. : . . .. :.
NP_001 KEAEEIYQTGIKNCPDSSDLHNNYGVFLVDTGLPEKAVAHYQQAIKLSPSHHV--AMVNL
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KB8 MGEAYMRLSKLPEAEHWYMESLRSKTDHIPAHLT-YGKLLALTGRKSEAEKLFLKAIELD
:. : :.. ::.:: ..: .. : :. : : ::: :: ... .: :.
NP_001 -GRLYRSLGENSMAEEWYKRAL--QVAHKAEILSPLGALYYNTGRYEEALQIYQEAAALQ
660 670 680 690 700 710
710 720 730
pF1KB8 PTKGNCYMHYGQFL-----------------------LEEARLI-----------EAAEM
:.. . . .: : :: ::. .: .
NP_001 PSQRELRLALAQVLAVMGQTKEAEKMTNHIVSEETGCLECYRLLSAIYSKQENHDKALDA
720 730 740 750 760 770
740 750 760 770 780
pF1KB8 AKKAAELDSTEFDVV----FNAAHMLRQASLNEAAEKYYDLAARLRPNYPAALMNLGAIL
:: .: . :. :. ...::. .: . : . : .:..: :. : ::.:.:
NP_001 IDKALQLKPKDPKVISELFFTKGNQLREQNLLDKAFESYRVAVQLNPDQAQAWMNMGGIQ
780 790 800 810 820 830
790 800 810 820 830
pF1KB8 HLNGRLQKAEANYLRALQLKPDDVITQSNLRKLWNIMEKQGLKTSKT
:..:. .:.: : ::::: ::. . . :: :: . .::.
NP_001 HIKGKYVSARAYYERALQLVPDSKLLKENLAKL-DRLEKRLQEVREKDQT
840 850 860 870 880
>>XP_016875494 (OMIM: 615855) PREDICTED: transmembrane a (813 aa)
initn: 1176 init1: 225 opt: 531 Z-score: 616.6 bits: 125.0 E(85289): 1.3e-27
Smith-Waterman score: 1075; 31.7% identity (54.1% similar) in 900 aa overlap (3-829:30-803)
10 20 30
pF1KB8 MIAELVSSALGLALYLNTLSADFCYDDSRAIKT
: :...: : : .:...: .:: :: .
XP_016 MVVTTSARGGGGDRTPSRRRGCGLAPAGAAALLAGASCLC-YGRSLQGEFVHDDVWAIVN
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 NQDLLPETP--WTHIFYNDFWGTLLTHSGSHKSYRPLCTLSFRLNHAIGGLNPWSYHLVN
: :. : .: : :: ::::: .... :::::::::.:.:.:: . :.::. .: ::
XP_016 NPDVRPGAPLRWG-IFTNDFWGKGMAENTSHKSYRPLCVLTFKLNIFLTGMNPFYFHAVN
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 VLLHAAVTG-LFTSFSKILLGDGYWTFMAGLMFASHPIHTEAVAGIVGRADVGASLFFLL
..:: :: :. . .: .. . .:...:.:: ::::::::::::::::: : :.:::
XP_016 IILHCLVTLVLMYTCDKTVFKNRGLAFVTALLFAVHPIHTEAVAGIVGRADVLACLLFLL
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200
pF1KB8 SLLCYIKH----CSTRGYSARTWGWFLGSGLCAG-CSMLWKEQGVTVLAVSAVYDVFVFH
..: : . : .. . . .:: .: : :.:: :: :.::..: :::.:
XP_016 AFLSYNRSLDQGCVGGSFPSTVSPFFLLLSLFLGTCAMLVKETGITVFGVCLVYDLF---
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 RLKIKQILPTIYKRKNLSLFLSISLLIFWGSSLLGARLYWMGNKPPSFSNSDNPAADSDS
:.::... .
XP_016 ----------------------------------------------SLSNKQDKS-----
240
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 LLTRTLTFFYLPTKNLWLLLCPDTLSFDWSMDAVPLLKTVCDWRNLHTVAFYTGLLLLAY
::. :: . :.:::: : :: .::.. ..::..:. : ::: :. . . . ::.
XP_016 ----FLTYSYLLAFNVWLLLAPVTLCYDWQVGSIPLVETIWDMRNLATIFLAVVMALLSL
250 260 270 280 290 300
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 YGLKSPSVDRECNGKTVTNGKQNANGHSCLSDVEYQNSETKSSFASKVENGIKNDVSQRT
. ::. .. : :
XP_016 H---------------------------CLA--AFKRLEHKE------------------
310
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 QLPSTENIVVLSLSLLIIPFVPATNLFFYVGFVIAERVLYIPSMGFCLLITVGARALYVK
:...: .:..::.::.:::: ::::.::::::.::::.:.:.. : : .
XP_016 --------VLVGLLFLVFPFIPASNLFFRVGFVVAERVLYMPSMGYCILFVHGLSKLCTW
320 330 340 350 360
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 VQKRFLKSLIFYATATLIVFYGLKTAIRNGDWQNEEMLYRSGIKVNP--AKAWGNLGNVL
... .:: .:. :..... ::. .: : ..: :.:::... : ::. : .: :
XP_016 LNRCGATTLIV-STVLLLLLFSWKTVKQNEIWLSRESLFRSGVQTLPHNAKVHYNYANFL
370 380 390 400 410 420
510 520 530 540 550 560
pF1KB8 KSQSKISEAESAYRNALYYRSNMADMLYNLGLLLQENSRFAEALHYYKLAIGSRPTLASA
:.:.. .:: ::.:: :. : ::: : ... ::: ::. :. .: :
XP_016 KDQGRNKEAIYHYRTALKLYPRHASALNNLGTLTRDT---AEAKMYYQRALQLHPQHNRA
430 440 450 460 470 480
570 580 590 600
pF1KB8 YLNTGIILMNQGRTEEARRTFLKCS-----EIPD------------ENLKDPHA-HKSSV
.: : .: .: . ::: :.:: : :. : : .:. . .....
XP_016 LFNLGNLLKSQEKKEEAI-TLLKDSIKYGPEFADAYSSLASLLAEQERFKEAEEIYQTGI
490 500 510 520 530 540
610 620 630 640 650
pF1KB8 TSC-----LYN-LGKLYHEQGHYEEALSVYKEAIQKMPRQFAPQSLYNMMGEAYMRLSKL
.: :.: : . . : :.:.. :..::. : . . .. :. :. : :..
XP_016 KNCPDSSDLHNNYGVFLVDTGLPEKAVAHYQQAIKLSPSHHV--AMVNL-GRLYRSLGEN
550 560 570 580 590
660 670 680 690 700 710
pF1KB8 PEAEHWYMESLRSKTDHIPAHLT-YGKLLALTGRKSEAEKLFLKAIELDPTKGNCYMHYG
::.:: ..: .. : :. : : ::: :: ... .: :.:.. . . .
XP_016 SMAEEWYKRAL--QVAHKAEILSPLGALYYNTGRYEEALQIYQEAAALQPSQRELRLALA
600 610 620 630 640 650
720 730 740
pF1KB8 QFL-----------------------LEEARLI-----------EAAEMAKKAAELDSTE
: : :: ::. .: . :: .: .
XP_016 QVLAVMGQTKEAEKMTNHIVSEETGCLECYRLLSAIYSKQENHDKALDAIDKALQLKPKD
660 670 680 690 700 710
750 760 770 780 790 800
pF1KB8 FDVV----FNAAHMLRQASLNEAAEKYYDLAARLRPNYPAALMNLGAILHLNGRLQKAEA
:. :. ...::. .: . : . : .:..: :. : ::.:.: :..:. .:.:
XP_016 PKVISELFFTKGNQLREQNLLDKAFESYRVAVQLNPDQAQAWMNMGGIQHIKGKYVSARA
720 730 740 750 760 770
810 820 830
pF1KB8 NYLRALQLKPDDVITQSNLRKLWNIMEKQGLKTSKT
: ::::: ::. . . :: :: . .::.
XP_016 YYERALQLVPDSKLLKENLAKL-DRLEKRLQEVREKDQT
780 790 800 810
>>XP_016875493 (OMIM: 615855) PREDICTED: transmembrane a (875 aa)
initn: 1140 init1: 249 opt: 511 Z-score: 592.8 bits: 120.8 E(85289): 2.8e-26
Smith-Waterman score: 1268; 33.6% identity (57.9% similar) in 904 aa overlap (3-829:30-865)
10 20 30
pF1KB8 MIAELVSSALGLALYLNTLSADFCYDDSRAIKT
: :...: : : .:...: .:: :: .
XP_016 MVVTTSARGGGGDRTPSRRRGCGLAPAGAAALLAGASCLC-YGRSLQGEFVHDDVWAIVN
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 NQDLLPETP--WTHIFYNDFWGTLLTHSGSHKSYRPLCTLSFRLNHAIGGLNPWSYHLVN
: :. : .: : :: ::::: .... :::::::::.:.:.:: . :.::. .: ::
XP_016 NPDVRPGAPLRWG-IFTNDFWGKGMAENTSHKSYRPLCVLTFKLNIFLTGMNPFYFHAVN
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 VLLHAAVTG-LFTSFSKILLGDGYWTFMAGLMFASHPIHTEAVAGIVGRADVGASLFFLL
..:: :: :. . .: .. . .:...:.:: ::::::::::::::::: : :.:::
XP_016 IILHCLVTLVLMYTCDKTVFKNRGLAFVTALLFAVHPIHTEAVAGIVGRADVLACLLFLL
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200
pF1KB8 SLLCYIKH----CSTRGYSARTWGWFLGSGLCAG-CSMLWKEQGVTVLAVSAVYDVFVFH
..: : . : .. . . .:: .: : :.:: :: :.::..: :::.: .
XP_016 AFLSYNRSLDQGCVGGSFPSTVSPFFLLLSLFLGTCAMLVKETGITVFGVCLVYDLFSLS
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 RLKIKQILPTIYKRK---NLSLFLSISLLIF-WGSSLLGARLYWMGNKPPSFSNSDNPAA
. :. : . .:. .. ::. ..:.. . .: ::. ::.. : ::..::::.
XP_016 NKQDKSYLRASSNRNFLLTMRPFLKRAILVLSYVLVILYFRLWIMGGSMPLFSEQDNPAS
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 DSDSLLTRTLTFFYLPTKNLWLLLCPDTLSFDWSMDAVPLLKTVCDWRNLHTVAFYTGLL
: .::: ::. :: . :.:::: : :: .::.. ..::..:. : ::: :. . . .
XP_016 FSPYILTRFLTYSYLLAFNVWLLLAPVTLCYDWQVGSIPLVETIWDMRNLATIFLAVVMA
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 LLAYYGLKSPSVDRECNGKTVTNGKQNANGHSCLSDVEYQNSETKSSFASKVENGIKNDV
::. . ::. .. : :
XP_016 LLSLH---------------------------CLA--AFKRLEHKE--------------
360 370
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 SQRTQLPSTENIVVLSLSLLIIPFVPATNLFFYVGFVIAERVLYIPSMGFCLLITVGARA
:...: .:..::.::.:::: ::::.::::::.::::.:.:.. :
XP_016 ------------VLVGLLFLVFPFIPASNLFFRVGFVVAERVLYMPSMGYCILFVHGLSK
380 390 400 410 420
450 460 470 480 490
pF1KB8 LYVKVQKRFLKSLIFYATATLIVFYGLKTAIRNGDWQNEEMLYRSGIKVNP--AKAWGNL
: . ... .:: .:. :..... ::. .: : ..: :.:::... : ::. :
XP_016 LCTWLNRCGATTLIV-STVLLLLLFSWKTVKQNEIWLSRESLFRSGVQTLPHNAKVHYNY
430 440 450 460 470 480
500 510 520 530 540 550
pF1KB8 GNVLKSQSKISEAESAYRNALYYRSNMADMLYNLGLLLQENSRFAEALHYYKLAIGSRPT
.: ::.:.. .:: ::.:: :. : ::: : ... ::: ::. :. .:
XP_016 ANFLKDQGRNKEAIYHYRTALKLYPRHASALNNLGTLTRDT---AEAKMYYQRALQLHPQ
490 500 510 520 530
560 570 580 590 600
pF1KB8 LASAYLNTGIILMNQGRTEEARRTFLKCS-----EIPD------------ENLKDPHA-H
: .: : .: .: . ::: :.:: : :. : : .:. . .
XP_016 HNRALFNLGNLLKSQEKKEEAI-TLLKDSIKYGPEFADAYSSLASLLAEQERFKEAEEIY
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650
pF1KB8 KSSVTSC-----LYN-LGKLYHEQGHYEEALSVYKEAIQKMPRQFAPQSLYNMMGEAYMR
.... .: :.: : . . : :.:.. :..::. : . . .. :. :. :
XP_016 QTGIKNCPDSSDLHNNYGVFLVDTGLPEKAVAHYQQAIKLSPSHHV--AMVNL-GRLYRS
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB8 LSKLPEAEHWYMESLRSKTDHIPAHLT-YGKLLALTGRKSEAEKLFLKAIELDPTKGNCY
:.. ::.:: ..: .. : :. : : ::: :: ... .: :.:.. .
XP_016 LGENSMAEEWYKRAL--QVAHKAEILSPLGALYYNTGRYEEALQIYQEAAALQPSQRELR
660 670 680 690 700 710
720 730 740
pF1KB8 MHYGQFL-----------------------LEEARLI-----------EAAEMAKKAAEL
. .: : :: ::. .: . :: .:
XP_016 LALAQVLAVMGQTKEAEKMTNHIVSEETGCLECYRLLSAIYSKQENHDKALDAIDKALQL
720 730 740 750 760 770
750 760 770 780 790
pF1KB8 DSTEFDVV----FNAAHMLRQASLNEAAEKYYDLAARLRPNYPAALMNLGAILHLNGRLQ
. :. :. ...::. .: . : . : .:..: :. : ::.:.: :..:.
XP_016 KPKDPKVISELFFTKGNQLREQNLLDKAFESYRVAVQLNPDQAQAWMNMGGIQHIKGKYV
780 790 800 810 820 830
800 810 820 830
pF1KB8 KAEANYLRALQLKPDDVITQSNLRKLWNIMEKQGLKTSKT
.:.: : ::::: ::. . . :: :: . .::.
XP_016 SARAYYERALQLVPDSKLLKENLAKL-DRLEKRLQEVREKDQT
840 850 860 870
>>XP_016875496 (OMIM: 615855) PREDICTED: transmembrane a (618 aa)
initn: 797 init1: 249 opt: 432 Z-score: 502.8 bits: 103.6 E(85289): 2.9e-21
Smith-Waterman score: 762; 30.8% identity (54.8% similar) in 671 aa overlap (225-829:4-608)
200 210 220 230 240 250
pF1KB8 VSAVYDVFVFHRLKIKQILPTIYKRKNLSLFLSISLLIF-WGSSLLGARLYWMGNKPPSF
::. ..:.. . .: ::. ::.. : :
XP_016 MRPFLKRAILVLSYVLVILYFRLWIMGGSMPLF
10 20 30
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 SNSDNPAADSDSLLTRTLTFFYLPTKNLWLLLCPDTLSFDWSMDAVPLLKTVCDWRNLHT
:..::::. : .::: ::. :: . :.:::: : :: .::.. ..::..:. : ::: :
XP_016 SEQDNPASFSPYILTRFLTYSYLLAFNVWLLLAPVTLCYDWQVGSIPLVETIWDMRNLAT
40 50 60 70 80 90
320 330 340 350 360 370
pF1KB8 VAFYTGLLLLAYYGLKSPSVDRECNGKTVTNGKQNANGHSCLSDVEYQNSETKSSFASKV
. . . . ::. . ::. .. : :
XP_016 IFLAVVMALLSLH---------------------------CLA--AFKRLEHKE------
100 110
380 390 400 410 420 430
pF1KB8 ENGIKNDVSQRTQLPSTENIVVLSLSLLIIPFVPATNLFFYVGFVIAERVLYIPSMGFCL
:...: .:..::.::.:::: ::::.::::::.::::.:.
XP_016 --------------------VLVGLLFLVFPFIPASNLFFRVGFVVAERVLYMPSMGYCI
120 130 140 150
440 450 460 470 480 490
pF1KB8 LITVGARALYVKVQKRFLKSLIFYATATLIVFYGLKTAIRNGDWQNEEMLYRSGIKVNP-
:.. : : . ... .:: .:. :..... ::. .: : ..: :.:::... :
XP_016 LFVHGLSKLCTWLNRCGATTLIV-STVLLLLLFSWKTVKQNEIWLSRESLFRSGVQTLPH
160 170 180 190 200 210
500 510 520 530 540 550
pF1KB8 -AKAWGNLGNVLKSQSKISEAESAYRNALYYRSNMADMLYNLGLLLQENSRFAEALHYYK
::. : .: ::.:.. .:: ::.:: :. : ::: : ... ::: ::.
XP_016 NAKVHYNYANFLKDQGRNKEAIYHYRTALKLYPRHASALNNLGTLTRDT---AEAKMYYQ
220 230 240 250 260 270
560 570 580 590
pF1KB8 LAIGSRPTLASAYLNTGIILMNQGRTEEARRTFLKCS-----EIPD------------EN
:. .: : .: : .: .: . ::: :.:: : :. : :
XP_016 RALQLHPQHNRALFNLGNLLKSQEKKEEAI-TLLKDSIKYGPEFADAYSSLASLLAEQER
280 290 300 310 320 330
600 610 620 630 640
pF1KB8 LKDPHA-HKSSVTSC-----LYN-LGKLYHEQGHYEEALSVYKEAIQKMPRQFAPQSLYN
.:. . ..... .: :.: : . . : :.:.. :..::. : . . .. :
XP_016 FKEAEEIYQTGIKNCPDSSDLHNNYGVFLVDTGLPEKAVAHYQQAIKLSPSHHV--AMVN
340 350 360 370 380 390
650 660 670 680 690 700
pF1KB8 MMGEAYMRLSKLPEAEHWYMESLRSKTDHIPAHLT-YGKLLALTGRKSEAEKLFLKAIEL
. :. : :.. ::.:: ..: .. : :. : : ::: :: ... .: :
XP_016 L-GRLYRSLGENSMAEEWYKRAL--QVAHKAEILSPLGALYYNTGRYEEALQIYQEAAAL
400 410 420 430 440
710 720 730
pF1KB8 DPTKGNCYMHYGQFL-----------------------LEEARLI-----------EAAE
.:.. . . .: : :: ::. .: .
XP_016 QPSQRELRLALAQVLAVMGQTKEAEKMTNHIVSEETGCLECYRLLSAIYSKQENHDKALD
450 460 470 480 490 500
740 750 760 770 780
pF1KB8 MAKKAAELDSTEFDVV----FNAAHMLRQASLNEAAEKYYDLAARLRPNYPAALMNLGAI
:: .: . :. :. ...::. .: . : . : .:..: :. : ::.:.:
XP_016 AIDKALQLKPKDPKVISELFFTKGNQLREQNLLDKAFESYRVAVQLNPDQAQAWMNMGGI
510 520 530 540 550 560
790 800 810 820 830
pF1KB8 LHLNGRLQKAEANYLRALQLKPDDVITQSNLRKLWNIMEKQGLKTSKT
:..:. .:.: : ::::: ::. . . :: :: . .::.
XP_016 QHIKGKYVSARAYYERALQLVPDSKLLKENLAKL-DRLEKRLQEVREKDQT
570 580 590 600 610
>>XP_005253556 (OMIM: 615855) PREDICTED: transmembrane a (944 aa)
initn: 1140 init1: 249 opt: 432 Z-score: 500.2 bits: 103.7 E(85289): 4e-21
Smith-Waterman score: 1079; 31.6% identity (53.7% similar) in 925 aa overlap (49-829:76-934)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 LSADFCYDDSRAIKTNQDLLPETPWTHIFYNDFWGTLLTHSGSHKSYRPLCTLSFRLNHA
::::: .... :::::::::.:.:.::
XP_005 QGEFVHDDVWAIVNNPDVRPGAPLRWGIFTNDFWGKGMAENTSHKSYRPLCVLTFKLNIF
50 60 70 80 90 100
80 90 100 110 120 130
pF1KB8 IGGLNPWSYHLVNVLLHAAVTG-LFTSFSKILLGDGYWTFMAGLMFASHPIHTEAVAGIV
. :.::. .: ::..:: :: :. . .: .. . .:...:.:: ::::::::::::
XP_005 LTGMNPFYFHAVNIILHCLVTLVLMYTCDKTVFKNRGLAFVTALLFAVHPIHTEAVAGIV
110 120 130 140 150 160
140 150 160 170 180 190
pF1KB8 GRADVGASLFFLLSLLCYIKH----CSTRGYSARTWGWFLGSGLCAG-CSMLWKEQGVTV
::::: : :.:::..: : . : .. . . .:: .: : :.:: :: :.::
XP_005 GRADVLACLLFLLAFLSYNRSLDQGCVGGSFPSTVSPFFLLLSLFLGTCAMLVKETGITV
170 180 190 200 210 220
200 210
pF1KB8 LAVSAVYDVFVF--------------------------------HRLKIKQ---------
..: :::.: . :: . ::
XP_005 FGVCLVYDLFSLSNKQDKSSNGALCPRSPQQPGSPQPSSLPGHPHRENGKQQRFPHKGAW
230 240 250 260 270 280
220 230
pF1KB8 -----------------ILPTI------YKR----KNLSL----FLSISLLIF-WGSSLL
. : : : .:. : ::. ..:.. . .:
XP_005 GGCHSPLPPEPKSSGFPVSPRAVWSMMRYLRASSNRNFLLTMRPFLKRAILVLSYVLVIL
290 300 310 320 330 340
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 GARLYWMGNKPPSFSNSDNPAADSDSLLTRTLTFFYLPTKNLWLLLCPDTLSFDWSMDAV
::. ::.. : ::..::::. : .::: ::. :: . :.:::: : :: .::.. ..
XP_005 YFRLWIMGGSMPLFSEQDNPASFSPYILTRFLTYSYLLAFNVWLLLAPVTLCYDWQVGSI
350 360 370 380 390 400
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 PLLKTVCDWRNLHTVAFYTGLLLLAYYGLKSPSVDRECNGKTVTNGKQNANGHSCLSDVE
::..:. : ::: :. . . . ::. . ::.
XP_005 PLVETIWDMRNLATIFLAVVMALLSLH---------------------------CLA--A
410 420 430
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 YQNSETKSSFASKVENGIKNDVSQRTQLPSTENIVVLSLSLLIIPFVPATNLFFYVGFVI
.. : : :...: .:..::.::.:::: ::::.
XP_005 FKRLEHKE--------------------------VLVGLLFLVFPFIPASNLFFRVGFVV
440 450 460 470
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 AERVLYIPSMGFCLLITVGARALYVKVQKRFLKSLIFYATATLIVFYGLKTAIRNGDWQN
::::::.::::.:.:.. : : . ... .:: .:. :..... ::. .: : .
XP_005 AERVLYMPSMGYCILFVHGLSKLCTWLNRCGATTLIV-STVLLLLLFSWKTVKQNEIWLS
480 490 500 510 520
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 EEMLYRSGIKVNP--AKAWGNLGNVLKSQSKISEAESAYRNALYYRSNMADMLYNLGLLL
.: :.:::... : ::. : .: ::.:.. .:: ::.:: :. : ::: :
XP_005 RESLFRSGVQTLPHNAKVHYNYANFLKDQGRNKEAIYHYRTALKLYPRHASALNNLGTLT
530 540 550 560 570 580
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 QENSRFAEALHYYKLAIGSRPTLASAYLNTGIILMNQGRTEEARRTFLKCS-----EIPD
... ::: ::. :. .: : .: : .: .: . ::: :.:: : :. :
XP_005 RDT---AEAKMYYQRALQLHPQHNRALFNLGNLLKSQEKKEEAI-TLLKDSIKYGPEFAD
590 600 610 620 630 640
600 610 620 630
pF1KB8 ------------ENLKDPHA-HKSSVTSC-----LYN-LGKLYHEQGHYEEALSVYKEAI
: .:. . ..... .: :.: : . . : :.:.. :..::
XP_005 AYSSLASLLAEQERFKEAEEIYQTGIKNCPDSSDLHNNYGVFLVDTGLPEKAVAHYQQAI
650 660 670 680 690 700
640 650 660 670 680 690
pF1KB8 QKMPRQFAPQSLYNMMGEAYMRLSKLPEAEHWYMESLRSKTDHIPAHLT-YGKLLALTGR
. : . . .. :. :. : :.. ::.:: ..: .. : :. : : :::
XP_005 KLSPSHHV--AMVNL-GRLYRSLGENSMAEEWYKRAL--QVAHKAEILSPLGALYYNTGR
710 720 730 740 750 760
700 710 720
pF1KB8 KSEAEKLFLKAIELDPTKGNCYMHYGQFL-----------------------LEEARLI-
:: ... .: :.:.. . . .: : :: ::.
XP_005 YEEALQIYQEAAALQPSQRELRLALAQVLAVMGQTKEAEKMTNHIVSEETGCLECYRLLS
770 780 790 800 810 820
730 740 750 760 770
pF1KB8 ----------EAAEMAKKAAELDSTEFDVV----FNAAHMLRQASLNEAAEKYYDLAARL
.: . :: .: . :. :. ...::. .: . : . : .:..:
XP_005 AIYSKQENHDKALDAIDKALQLKPKDPKVISELFFTKGNQLREQNLLDKAFESYRVAVQL
830 840 850 860 870 880
780 790 800 810 820 830
pF1KB8 RPNYPAALMNLGAILHLNGRLQKAEANYLRALQLKPDDVITQSNLRKLWNIMEKQGLKTS
:. : ::.:.: :..:. .:.: : ::::: ::. . . :: :: . .::.
XP_005 NPDQAQAWMNMGGIQHIKGKYVSARAYYERALQLVPDSKLLKENLAKL-DRLEKRLQEVR
890 900 910 920 930
pF1KB8 KT
XP_005 EKDQT
940
>>NP_787057 (OMIM: 615855) transmembrane and TPR repeat- (774 aa)
initn: 965 init1: 221 opt: 422 Z-score: 489.8 bits: 101.5 E(85289): 1.5e-20
Smith-Waterman score: 914; 30.8% identity (54.2% similar) in 812 aa overlap (82-811:1-747)
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 WGTLLTHSGSHKSYRPLCTLSFRLNHAIGGLNPWSYHLVNVLLHAAVTG-LFTSFSKILL
.::. .: ::..:: :: :. . .: ..
NP_787 MNPFYFHAVNIILHCLVTLVLMYTCDKTVF
10 20 30
120 130 140 150 160
pF1KB8 GDGYWTFMAGLMFASHPIHTEAVAGIVGRADVGASLFFLLSLLCYIKH----CSTRGYSA
. .:...:.:: ::::::::::::::::: : :.:::..: : . : .. .
NP_787 KNRGLAFVTALLFAVHPIHTEAVAGIVGRADVLACLLFLLAFLSYNRSLDQGCVGGSFPS
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 RTWGWFLGSGLCAG-CSMLWKEQGVTVLAVSAVYDVFVFHRLKIKQ----ILPTIYKRKN
. .:: .: : :.:: :: :.::..: :::.: . . :. . : .. .
NP_787 TVSPFFLLLSLFLGTCAMLVKETGITVFGVCLVYDLFSLSNKQDKSSNGALCPRSPQQPG
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270
pF1KB8 LSLFLSISLLIFW--GSSL-LGARLYWMGNK---PPSFSNSDNPAADSDSL-LTRTLTFF
:. :.. . . : : . :: ..: :.. . : ::.
NP_787 SPQPSSLPGHPHRENGKQQRFPHKGAWGGCHSPLPPEPKSSGFPVSPRAVWSMMRFLTYS
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 YLPTKNLWLLLCPDTLSFDWSMDAVPLLKTVCDWRNLHTVAFYTGLLLLAYYGLKSPSVD
:: . :.:::: : :: .::.. ..::..:. : ::: :. . . . ::. .
NP_787 YLLAFNVWLLLAPVTLCYDWQVGSIPLVETIWDMRNLATIFLAVVMALLSLH--------
220 230 240 250 260
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 RECNGKTVTNGKQNANGHSCLSDVEYQNSETKSSFASKVENGIKNDVSQRTQLPSTENIV
::. .. : : :
NP_787 -------------------CLA--AFKRLEHKE--------------------------V
270
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 VLSLSLLIIPFVPATNLFFYVGFVIAERVLYIPSMGFCLLITVGARALYVKVQKRFLKSL
...: .:..::.::.:::: ::::.::::::.::::.:.:.. : : . ... .:
NP_787 LVGLLFLVFPFIPASNLFFRVGFVVAERVLYMPSMGYCILFVHGLSKLCTWLNRCGATTL
280 290 300 310 320 330
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 IFYATATLIVFYGLKTAIRNGDWQNEEMLYRSGIKVNP--AKAWGNLGNVLKSQSKISEA
: .:. :..... ::. .: : ..: :.:::... : ::. : .: ::.:.. .::
NP_787 IV-STVLLLLLFSWKTVKQNEIWLSRESLFRSGVQTLPHNAKVHYNYANFLKDQGRNKEA
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KB8 ESAYRNALYYRSNMADMLYNLGLLLQENSRFAEALHYYKLAIGSRPTLASAYLNTGIILM
::.:: :. : ::: : ... ::: ::. :. .: : .: : .:
NP_787 IYHYRTALKLYPRHASALNNLGTLTRDT---AEAKMYYQRALQLHPQHNRALFNLGNLLK
400 410 420 430 440 450
580 590 600
pF1KB8 NQGRTEEARRTFLKCS-----EIPD------------ENLKDPHA-HKSSVTSC-----L
.: . ::: :.:: : :. : : .:. . ..... .: :
NP_787 SQEKKEEAI-TLLKDSIKYGPEFADAYSSLASLLAEQERFKEAEEIYQTGIKNCPDSSDL
460 470 480 490 500 510
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 YN-LGKLYHEQGHYEEALSVYKEAIQKMPRQFAPQSLYNMMGEAYMRLSKLPEAEHWYME
.: : . . : :.:.. :..::. : . . .. :. :. : :.. ::.:: .
NP_787 HNNYGVFLVDTGLPEKAVAHYQQAIKLSPSHHV--AMVNL-GRLYRSLGENSMAEEWYKR
520 530 540 550 560
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 SLRSKTDHIPAHLT-YGKLLALTGRKSEAEKLFLKAIELDPTKGNCYMHYGQFL------
.: .. : :. : : ::: :: ... .: :.:.. . . .: :
NP_787 AL--QVAHKAEILSPLGALYYNTGRYEEALQIYQEAAALQPSQRELRLALAQVLAVMGQT
570 580 590 600 610 620
730 740
pF1KB8 -----------------LEEARLI-----------EAAEMAKKAAELDSTEFDVV----F
:: ::. .: . :: .: . :. :
NP_787 KEAEKMTNHIVSEETGCLECYRLLSAIYSKQENHDKALDAIDKALQLKPKDPKVISELFF
630 640 650 660 670 680
750 760 770 780 790 800
pF1KB8 NAAHMLRQASLNEAAEKYYDLAARLRPNYPAALMNLGAILHLNGRLQKAEANYLRALQLK
. ...::. .: . : . : .:..: :. : ::.:.: :..:. .:.: : :::::
NP_787 TKGNQLREQNLLDKAFESYRVAVQLNPDQAQAWMNMGGIQHIKGKYVSARAYYERALQLV
690 700 710 720 730 740
810 820 830
pF1KB8 PDDVITQSNLRKLWNIMEKQGLKTSKT
::
NP_787 PDSKLLKENLAKLDRLEKRLQEVREKDQT
750 760 770
836 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 13:58:35 2016 done: Fri Nov 4 13:58:37 2016
Total Scan time: 8.190 Total Display time: 0.210
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]