Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8632
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8632, 838 aa
1>>>pF1KB8632 838 - 838 aa - 838 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1126+/-0.0011; mu= 12.6817+/- 0.066
mean_var=123.2765+/-24.232, 0's: 0 Z-trim(106.6): 37 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.115514
statistics sampled from 9039 (9071) to 9039 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.279), width: 16
Scan time: 3.630
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14501.1 GPRASP2 gene_id:114928|Hs108|chrX ( 838) 5566 939.6 0
CCDS35352.1 GPRASP1 gene_id:9737|Hs108|chrX (1395) 2043 352.6 2.7e-96
CCDS14502.1 BHLHB9 gene_id:80823|Hs108|chrX ( 547) 824 149.2 1.8e-35
CCDS59170.1 ARMCX4 gene_id:100131755|Hs108|chrX (2290) 702 129.3 7.7e-29
CCDS14500.1 ARMCX5 gene_id:64860|Hs108|chrX ( 558) 590 110.2 1e-23
CCDS14487.1 ARMCX1 gene_id:51309|Hs108|chrX ( 453) 424 82.5 1.8e-15
CCDS14489.1 ARMCX3 gene_id:51566|Hs108|chrX ( 379) 415 81.0 4.4e-15
CCDS55146.1 ARMC10 gene_id:83787|Hs108|chr7 ( 308) 404 79.1 1.3e-14
CCDS5728.1 ARMC10 gene_id:83787|Hs108|chr7 ( 343) 404 79.1 1.4e-14
>>CCDS14501.1 GPRASP2 gene_id:114928|Hs108|chrX (838 aa)
initn: 5566 init1: 5566 opt: 5566 Z-score: 5018.5 bits: 939.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5566; 100.0% identity (100.0% similar) in 838 aa overlap (1-838:1-838)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MTGAEIEPSAQAKPEKKAGEEVIAGPERENDVPLVVRPKVRTQATTGARPKTETKSVPAA
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CCDS14 MTGAEIEPSAQAKPEKKAGEEVIAGPERENDVPLVVRPKVRTQATTGARPKTETKSVPAA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 RPKTEAQAMSGARPKTEVQVMGGARPKTEAQGITGARPKTDARAVGGARSKTDAKAIPGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RPKTEAQAMSGARPKTEVQVMGGARPKTEAQGITGARPKTDARAVGGARSKTDAKAIPGA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 RPKDEAQAWAQSEFGTEAVSQAEGVSQTNAVAWPLATAESGSVTKSKGLSMDRELVNVDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RPKDEAQAWAQSEFGTEAVSQAEGVSQTNAVAWPLATAESGSVTKSKGLSMDRELVNVDA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 ETFPGTQGQKGIQPWFGPGEETNMGSWCYSRPRAREEASNESGFWSADETSTASSFWTGE
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CCDS14 ETFPGTQGQKGIQPWFGPGEETNMGSWCYSRPRAREEASNESGFWSADETSTASSFWTGE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 ETSVRSWPREESNTRSRHRAKHQTNPRSRPRSKQEAYVDSWSGSEDEASNPFSFWVGENT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ETSVRSWPREESNTRSRHRAKHQTNPRSRPRSKQEAYVDSWSGSEDEASNPFSFWVGENT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 NNLFRPRVREEANIRSKLRTNREDCFESESEDEFYKQSWVLPGEEANSRFRHRDKEDPNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NNLFRPRVREEANIRSKLRTNREDCFESESEDEFYKQSWVLPGEEANSRFRHRDKEDPNT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 ALKLRAQKDVDSDRVKQEPRFEEEVIIGSWFWAEKEASLEGGASAICESEPGTEEGAIGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ALKLRAQKDVDSDRVKQEPRFEEEVIIGSWFWAEKEASLEGGASAICESEPGTEEGAIGG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 SAYWAEEKSSLGAVAREEAKPESEEEAIFGSWFWDRDEACFDLNPCPVYKVSDRFRDAAE
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CCDS14 SAYWAEEKSSLGAVAREEAKPESEEEAIFGSWFWDRDEACFDLNPCPVYKVSDRFRDAAE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 ELNASSRPQTWDEVTVEFKPGLFHGVGFRSTSPFGIPEEASEMLEAKPKNLELSPEGEEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ELNASSRPQTWDEVTVEFKPGLFHGVGFRSTSPFGIPEEASEMLEAKPKNLELSPEGEEQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 ESLLQPDQPSPEFTFQYDPSYRSVREIREHLRARESAESESWSCSCIQCELKIGSEEFEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ESLLQPDQPSPEFTFQYDPSYRSVREIREHLRARESAESESWSCSCIQCELKIGSEEFEE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 FLLLMDKIRDPFIHEISKIAMGMRSASQFTRDFIRDSGVVSLIETLLNYPSSRVRTSFLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FLLLMDKIRDPFIHEISKIAMGMRSASQFTRDFIRDSGVVSLIETLLNYPSSRVRTSFLE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 NMIHMAPPYPNLNMIETFICQVCEETLAHSVDSLEQLTGIRMLRHLTMTIDYHTLIANYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NMIHMAPPYPNLNMIETFICQVCEETLAHSVDSLEQLTGIRMLRHLTMTIDYHTLIANYM
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 SGFLSLLTTANARTKFHVLKMLLNLSENPAVAKKLFSAKALSIFVGLFNIEETNDNIQIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SGFLSLLTTANARTKFHVLKMLLNLSENPAVAKKLFSAKALSIFVGLFNIEETNDNIQIV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KB8 IKMFQNISNIIKSGKMSLIDDDFSLEPLISAFREFEELAKQLQAQIDNQNDPEVGQQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IKMFQNISNIIKSGKMSLIDDDFSLEPLISAFREFEELAKQLQAQIDNQNDPEVGQQS
790 800 810 820 830
>>CCDS35352.1 GPRASP1 gene_id:9737|Hs108|chrX (1395 aa)
initn: 2409 init1: 1468 opt: 2043 Z-score: 1842.2 bits: 352.6 E(32554): 2.7e-96
Smith-Waterman score: 2128; 47.2% identity (69.2% similar) in 850 aa overlap (39-838:559-1395)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 SAQAKPEKKAGEEVIAGPERENDVPLVVRPKVRTQATTG--ARPKTETKSVPAARPKTEA
.: .: : ::: .: ... .. .:
CCDS35 SVESGVGVSCESRTRSEEEEVIGPWFWSGEQVDIEAGIGEEARPGAEEETIFGSWFWAEN
530 540 550 560 570 580
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 QAMSGARPKTEVQVMGGARPKTEAQGITGAR--PKTDARAVGGARSKTDAKAIPGAR-PK
:.. : .: ..: ::. : . : :. ...: . : . ::.. . : :
CCDS35 QTYMDCRAETSCDTMQGAE---EEEPIIGSWFWTRVEACVEGDVNSKSSLEDKEEAMIPC
590 600 610 620 630 640
130 140 150 160 170
pF1KB8 DEAQAWAQSEFGTEAVSQ-AEGVSQTNAVA--W----PLATAESGSVTKSKGLSMDRELV
:. .. . :: . . :. .:: . : : .:. ::. ....:
CCDS35 FGAKEEVSMKHGTGVRCRFMAGAEETNNKSCFWAEKEPCMYPAGGGSWKSRP-EEEEDIV
650 660 670 680 690 700
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 NVDAETFPGTQGQKGIQPWFGPGEETNM-GSWCYSRPRAREEASNESGFWSADE-----T
: . :. . : :. ::.:. :. .. ..::. .: ::. :: :
CCDS35 NSWFWSRKYTKPEAIIGSWLWATEESNIDGTGEKAKLLTEEETIINSWFWKEDEAISEAT
710 720 730 740 750 760
240 250 260 270 280
pF1KB8 STASSFWTGEETSV-RSWPREESNTRSRHRAKHQTNPRSRPRSKQEAYVDSWSGSEDEAS
. : .:: .. :: .. ..: . .: ..: ...:. : :: :...:.
CCDS35 DREESRPEAEEGDIIGSW--FWAGEEDRLEPAAETREEDRLAAEKEGIVGSWFGAREET-
770 780 790 800 810 820
290 300 310 320 330
pF1KB8 NPFSFWVGENTNNLFRPRVREEANIRSKLRTNREDC--------FESES---EDEFYKQS
. .: ... :...:: : .. ..: :::. :.:. :
CCDS35 --IRREAGSCSKS--SPKAEEEEVIIGSWFWEEEASPEAVAGVGFESKPGTEEEEITVGS
830 840 850 860 870
340 350 360 370 380
pF1KB8 WVLPGEEANSRFRHRDKEDPNTALK---LRAQKDVDSDRVKQE--------PRFEEEVII
: : :::. . . :. .. . . .. :. .:..: :. .::.:.
CCDS35 WFWPEEEASIQAGSQAVEEMESETEEETIFGSWFWDGKEVSEEAGPCCVSKPEDDEEMIV
880 890 900 910 920 930
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 GSWFWAEKEASLEGGASAICESEPGTEEGAIGGSAYWAEE----KSSLGAVAREEAKPES
::::.. .: : :. : :::.: .::::: :: . ::. ... :. .. .
CCDS35 ESWFWSRDKAIKETGTVATCESKPENEEGAIVGSWFEAEDEVDNRTDNGSNCGSRTLAD-
940 950 960 970 980 990
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 EEEAIFGSWFWDRDEACFDLNPCPVYKVSDRFRDAAE-ELNASSRPQTWDEVTVEFKPGL
:.::: ::::: ::: :. :: ::... : ..: : . : :::.:.::::.::::
CCDS35 EDEAIVGSWFWAGDEAHFESNPSPVFRAICRSTCSVEQEPDPSRRPQSWEEVTVQFKPGP
1000 1010 1020 1030 1040 1050
510 520 530 540 550
pF1KB8 FHGVGFRSTSPFGIPEEAS----EMLEAKPKNLELSPEGEEQESLLQPDQPSPEFTFQYD
. ::: : ::: .:.::. ::. .::.:. ::::::.:::::::::::::: ::::
CCDS35 WGRVGFPSISPFRFPKEAASLFCEMFGGKPRNMVLSPEGEDQESLLQPDQPSPEFPFQYD
1060 1070 1080 1090 1100 1110
560 570 580 590 600 610
pF1KB8 PSYRSVREIREHLRARESAESESWSCSCIQCELKIGSEEFEEFLLLMDKIRDPFIHEISK
::::::.::::::::.::.: :: ::.:::::::::::::::.::::.::::::::::::
CCDS35 PSYRSVQEIREHLRAKESTEPESSSCNCIQCELKIGSEEFEELLLLMEKIRDPFIHEISK
1120 1130 1140 1150 1160 1170
620 630 640 650 660 670
pF1KB8 IAMGMRSASQFTRDFIRDSGVVSLIETLLNYPSSRVRTSFLENMIHMAPPYPNLNMIETF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:.:.
CCDS35 IAMGMRSASQFTRDFIRDSGVVSLIETLLNYPSSRVRTSFLENMIRMAPPYPNLNIIQTY
1180 1190 1200 1210 1220 1230
680 690 700 710 720 730
pF1KB8 ICQVCEETLAHSVDSLEQLTGIRMLRHLTMTIDYHTLIANYMSGFLSLLTTANARTKFHV
::.:::::::.:::: :::.::::.:::: : :::::.:::::::::::.:.::.:.:::
CCDS35 ICKVCEETLAYSVDSPEQLSGIRMIRHLTTTTDYHTLVANYMSGFLSLLATGNAKTRFHV
1240 1250 1260 1270 1280 1290
740 750 760 770 780 790
pF1KB8 LKMLLNLSENPAVAKKLFSAKALSIFVGLFNIEETNDNIQIVIKMFQNISNIIKSGKMSL
:::::::::: ..:.:.::.:.: :.:::: ::::::::::. .:.::.: ::. . .
CCDS35 LKMLLNLSENLFMTKELLSAEAVSEFIGLFNREETNDNIQIVLAIFENIGNNIKK-ETVF
1300 1310 1320 1330 1340 1350
800 810 820 830
pF1KB8 IDDDFSLEPLISAFREFEELAKQLQAQIDNQNDPEVGQQS
::::..:::::::.. :..::.::.. ::::::: :..
CCDS35 SDDDFNIEPLISAFHKVEKFAKELQGKTDNQNDPEGDQEN
1360 1370 1380 1390
>--
initn: 922 init1: 376 opt: 883 Z-score: 797.4 bits: 159.3 E(32554): 4.3e-38
Smith-Waterman score: 1039; 42.5% identity (64.7% similar) in 482 aa overlap (1-459:1-445)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MTGAEIEPSAQAKPEKKAGEEVIAGPERENDVPLVVRPKVRTQATTGARPKTETKSVPAA
::::::: .::.::::: ::::..: : ::::::::::::::::
CCDS35 MTGAEIESGAQVKPEKKPGEEVVGGAEIENDVPLVVRPKVRTQA----------------
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 RPKTEAQAMSGARPKTEVQVMGGARPKTEAQGITGARPKTDARAVGGARSKTDAKAIPGA
: : :::::.. .:: :: :.:.. :::::: :. ::::: .
CCDS35 ------QIMPGARPKNKSKVMPGASTKVETS------------AVGGARPKSKAKAIPVS
50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 RPKDEAQAWAQSEFGTEAVSQAEGVSQTNAVAWPLATAESGSVTKSKGLSMDRELVNVDA
: :.::: ::: .::.: .:..: :::: .: ::....: :.:.: :: ::::::.:.
CCDS35 RFKEEAQMWAQPRFGAERLSKTERNSQTNIIASPLVSTDSVLVAKTKYLSEDRELVNTDT
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230
pF1KB8 ETFPGTQG--QKGIQPWFGPGEETNMGSWCYSRPRAREEASNESGFWSADETSTASSFWT
:.:: .. : :.:: : ::::::::: :: ...::: .: : .:. :..: ::.
CCDS35 ESFPRRKAHYQAGFQPSFRSKEETNMGSWCCPRPTSKQEASPNSDFKWVDK-SVSSLFWS
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 GEETSVRSWP--REESNTRSRHRAKHQTNPRSRPRSKQEAYVDSWSGSEDEASNPFSFWV
:.:.... : : ....:: : :....: :: ...:: :. : ::::::. . ::.
CCDS35 GDEVTAKFHPGNRVKDSNRSMHMANQEANTMSRSQTNQELYIASSSGSEDESVKTPWFWA
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 GENTNNLFRPRVREEANIRSKLRTNREDCFESES--EDEFYKQSWVLPGEEANSRFRHRD
..::. :: :. : ::..:...: :: : : : . .:: :.::. : . :
CCDS35 RDKTNTWSGPR--EDPNSRSRFRSKKEVYVESSSGSEHEDHLESWFGAGKEAKFRSKMRA
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400
pF1KB8 KEDPNTALKLRAQKD--VDS-----DRVKQEPRF--EEEVIIGSWFWAEKEASLEG----
.. :. . ::... .: : .:.: : ::.. : .::: ..
CCDS35 GKEANNRARHRAKREACIDFMPGSIDVIKKESCFWPEENANTFSRPMIKKEARARAMTKE
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450
pF1KB8 ----GASAICESEPGTEEGAIGGSAYWAEEKSSLGAVAREEAKPESEEEAIFGSWFWDRD
: : ..: .:: :. :. .:: ..::.. : :.. . :.:.:.::::: ..
CCDS35 EAKTKARARAKQEARSEEEALIGTWFWATDESSMADEASIESSLQVEDESIIGSWFWTEE
390 400 410 420 430 440
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 EACFDLNPCPVYKVSDRFRDAAEELNASSRPQTWDEVTVEFKPGLFHGVGFRSTSPFGIP
::
CCDS35 EASMGTGASSKSRPRTDGERIGDSLFGAREKTSMKTGAEATSESILAADDEQVIIGSWFW
450 460 470 480 490 500
>>CCDS14502.1 BHLHB9 gene_id:80823|Hs108|chrX (547 aa)
initn: 825 init1: 284 opt: 824 Z-score: 750.3 bits: 149.2 E(32554): 1.8e-35
Smith-Waterman score: 827; 29.1% identity (62.2% similar) in 580 aa overlap (260-822:2-547)
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 TSTASSFWTGEETSVRSWPREESNTRSRHRAKHQTNPRSRPRSKQEAYVDSWSGSEDEAS
: ... :.. .....: ... .:.: ::.
CCDS14 MAGTKNKTRAQAKTEKKAAIQAKAGAEREAT
10 20 30
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 NPFSFWVGENTNNLFRP--RVREEANIRSKLRTNREDCFESESEDEFYKQSWVLPGEEAN
. . :: ..: .:. .. .:. ... :... .. : :
CCDS14 G------------VVRPVAKTRAKAKAKTGSKTDAVAEMKAVSKNKVVAET----KEGAL
40 50 60 70
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 SRFRHRDKEDPNTALKLRAQKDVDSDRVKQEPRFE------EEVIIGSWFWAEKEASLEG
:. . : . . : : .. :. :.: . ::. :.:::: .:: :
CCDS14 SEPKTLGKAMGDFTPK--AGNESTSSTCKNEAGTDAWFWAGEEATINSWFWNGEEA---G
80 90 100 110 120 130
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 GASAICESEPGTEEGAIGGSAYWAEEKSSLGAVAREEA-KPESEEEAIFGSWFWDRDEAC
.. . ...: ::... : . . :: . .. : ::: ..:.:::. :..
CCDS14 NSFSTKNDKP-----EIGAQVCAEELEPAAGADCKPRSGAEEEEEENVIGNWFWEGDDTS
140 150 160 170 180
470 480 490 500 510
pF1KB8 FDLNPCPVYKVSDRFRDAAEELNASSRPQTWDEVTV-EFKPGLFHGV-GFRSTSPFGIPE
:: :: :: .. . . :.: ..::. :.:::. :.. .: :::: .:
CCDS14 FDPNPKPVSRIVKP--QPVYEINEKNRPKDWSEVTIWPNAPAVTPAVLGFRSQAPSEASP
190 200 210 220 230 240
520 530 540 550 560 570
pF1KB8 EASEMLEAKPKN---LELSPEGEEQESLLQPDQPSPEFTFQYDPSYRSVREIREHLRARE
. .: . .: : .. . ... . .:: :: :. :: ... :::...: ::
CCDS14 PSYIVLASAEENACSLPVATACRPSRNTRSCSQPIPECRFDSDPCIQTIDEIRRQIRIRE
250 260 270 280 290 300
580 590 600 610 620 630
pF1KB8 SAESESWSCSC-IQCELKIGSEEFEEFLLLMDKIRDPFIHEISKIAMGMRSASQFTRDFI
. ..: : ..: . :::::... :. . ::.::.:..::::.... :...::
CCDS14 VNGIKPFACPCKMECYMD--SEEFEKLVSLLKSTTDPLIHKIARIAMGVHNVHPFAQEFI
310 320 330 340 350 360
640 650 660 670 680 690
pF1KB8 RDSGVVSLIETLLNYPSSRVRTSFLENMIHMAPPYPNLNM--IETFICQVCEETLAHSVD
. :::.:::.::..:: ..: ...: . :: . . :: . ..:.::.. ..
CCDS14 NEVGVVTLIESLLSFPSPEMRK---KTVITLNPPSGDERQRKIELHVKHMCKETMSFPLN
370 380 390 400 410
700 710 720 730 740 750
pF1KB8 SLEQLTGIRMLRHLTMTIDYHTLIANYMSGFLSLLTTANARTKFHVLKMLLNLSENPAVA
: : .:...: .:: . .: ..:::.: .. ::...: .:. :::.:::.::::..:
CCDS14 SPGQQSGLKILGQLTTDFVHHYIVANYFSELFHLLSSGNCKTRNLVLKLLLNMSENPTAA
420 430 440 450 460 470
760 770 780 790 800 810
pF1KB8 KKLFSAKALSIFVGLFNIEETNDNIQIVIKMFQNISNIIKSGKMSLIDDDFSLEPLISAF
. ... :::. . .:: .:.. :. . .: ::.. :..:.. ..: .: . :.. :
CCDS14 RDMINMKALAALKLIFNQKEAKANLVSGVAIFINIKEHIRKGSIVVVDH-LSYNTLMAIF
480 490 500 510 520 530
820 830
pF1KB8 REFEELAKQLQAQIDNQNDPEVGQQS
:: .:. . .
CCDS14 REVKEIIETM
540
>>CCDS59170.1 ARMCX4 gene_id:100131755|Hs108|chrX (2290 aa)
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20 30 40 50 60
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: : .. . .:. .:.: . : .:.. . ::: .. . . :: .. :
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:.:. : .: . . :: :.. : : :.... :: .: . .. : :
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:.. ..: :.: ..: .:: . : ... :: :...: ::.
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.::.: . :.: :: .:.. : . :: .. :.. . ::: ::
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: :: . .: . ..: : :: :... : .. ... : :
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1880 1890 1900 1910 1920 1930
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:...: . : : .: . .. :: . . : :.. . :
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pF1KB8 -PSPEFTFQYDPSYRSVREIREHLRARESAESESWSCSCIQCELKIGSEEFEEFLLLMDK
.:. : . :. : :.. :. : ... ::: : . : .. ...:... ...
CCDS59 WSETKFAHQSEASFPVEDESRKQTRTGE--KTRPWSCRC-KHEANMDPRDLEKLICMIEM
2000 2010 2020 2030 2040 2050
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pF1KB8 IRDPFIHEISKIAMGMRSASQFTRDFIRDSGVVSLIETLLNYPSSRVRTSFLENMIHMAP
.:: .:::.. :. . ..... .:. : .:.::.::: : :: . :. . ...
CCDS59 TEDPSVHEIANNALYNSADYSYSHEVVRNVGGISVIESLLNNPYPSVRQKALNALNNISV
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: ..:.. ::::.:... ..: ::.:.:..::::.: .:. ...::.: :: ::
CCDS59 AAENHRKVKTYLNQVCEDTVTYPLNSNVQLAGLRLIRHLTITSEYQHMVTNYISEFLRLL
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:.....:: ::: ::::.:.::...: :. :.: . ....:. .::..:: ....:.::
CCDS59 TVGSGETKDHVLGMLLNFSKNPSMTKDLLIANAPTSLINIFSKKETKENILNALSLFENI
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. .: .. .: :: . : :.. . ::.:.: . ::::: ..
CCDS59 NYHFKRRAKAFTQDKFSKNSLYFLFQRPKACAKKLRALAAECNDPEVKERVELLISKL
2240 2250 2260 2270 2280 2290
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10 20
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CCDS14 ARVNGKT--------QAEAVAEAELKT--ESVTQAKAGDGAMTRTHTVTYREAMAVTREV
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: . .: : :.. .. . . .. :. . ... : ...:... . : .
CCDS14 IKVEDTT--KTRVMVETKTKPLAERSIVPQTKSKAMPMSRVSTVTKSEVKVVAVIEANIR
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: ... : :: .:..:.: . .: . . . :: ::::: ..:. ..
CCDS14 SYAKSHDKANTGSRPDRREETSIGMKSSDEDEENICSWFWTGEEPSVGSWFWPEEETSLQ
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. :. :.... . . . :. ... .:... . . : .: : .: : : .
CCDS14 VYK-PLPKIQEKPKPTHKPTLTIKQKVIAWSRARYIVLVP--VEG-GEQSLPPEGNWTLV
200 210 220 230 240 250
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CCDS14 ETLIE--------TPLG------IRPLTKIPPY---HGPYYQTLAEIKKQIRQREKYGPN
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CCDS14 PKACHCKSRGFSLEPKEFDKLVALLKLTKDPFIHEIATMIMGISPAYPFTQDIIHDVGIT
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.::.:.: :. . . . : . . . . :..: :::. .. ..: ::.:.
CCDS14 VMIENLVNNPNVKEHPGALSMVDDSSESSEEPKSGESYIHQVCKGIISCPLNSPVQLAGL
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..: ::.. .. : .:..:. ::.::. ....:::.:::.. ::.: : ...:.:::.
CCDS14 KLLGHLSIKFEDHYVITSYIPDFLTLLNKGSVKTKFYVLKVFSCLSKNHANTRELISAKV
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:: .:. :: .:.. :: .:..:.::. .:. . . :. ::: :.: .....
CCDS14 LSSLVAPFNKNESKANILNIIEIFENINFQFKTKAKLFTKEKFTKSELISIFQEAKQFGQ
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830
pF1KB8 QLQAQIDNQNDPEVGQQS
.:: .. ...::::
CCDS14 KLQ-DLAEHSDPEVRDKVIRLILKL
540 550
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CCDS14 KARSKSTRAPATTWPVRRGKFNFPYKIDDILSAPDLQKVLNILERTNDPFIQEVALVTLG
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:..:.. .:: :..:.:.: ..:.: :. :.. . :..:: .: ::....:..
CCDS14 CDDTMVCRLDSAVQMAGLRLLTNMTVTNHYQHLLSYSFPDFFALLFLGNHFTKIQIMKLI
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CCDS14 INFTENPAMTRELVSCKVPSELISLFNKEWDREILLNILTLFENINDNIKNEGLASSRKE
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CCDS14 FSRSSLFFLFKESGVCVKKIKA-LANHNDLVVKVKVLKVLTKL
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CCDS14 CDDTITSRLNSSVQLAGLRLLTNMTVTNEYQHMLANSISDFFRLFSAGNEETKLQVLKLL
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CCDS55 TRGRRRGDRELGIRSSKSAEDLTDGSYDDVLNAEQLQKLLYLLESTEDPVIIERALITLG
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CCDS55 NNAAFSVNQAIIRELGGIPIVANKINHSNQSIKEKALNALNNLSVNVENQIKIKIYISQV
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CCDS55 CEDVFSGPLNSAVQLAGLTLLTNMTVTNDHQHMLHSYITDLFQVLLTGNGNTKVQVLKLL
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CCDS55 LNLSENPAMTEGLLRAQVDSSFLSLYDSHVAKEILLRVLTLFQNIKNCLK------IEGH
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CCDS55 LAVQPTFTEGSLFFLLHGEECAQKIRALVDHH-DAEVKEKVVTIIPKI
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CCDS57 ARPQTGGTWESQWSKTSQPEDLTDGSYDDVLNAEQLQKLLYLLESTEDPVIIERALITLG
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CCDS57 NNAAFSVNQAIIRELGGIPIVANKINHSNQSIKEKALNALNNLSVNVENQIKIKIYISQV
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pF1KB8 CEETLAHSVDSLEQLTGIRMLRHLTMTIDYHTLIANYMSGFLSLLTTANARTKFHVLKML
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CCDS57 CEDVFSGPLNSAVQLAGLTLLTNMTVTNDHQHMLHSYITDLFQVLLTGNGNTKVQVLKLL
190 200 210 220 230 240
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pF1KB8 LNLSENPAVAKKLFSAKALSIFVGLFNIEETNDNIQIVIKMFQNISNIIKSGKMSLIDDD
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CCDS57 LNLSENPAMTEGLLRAQVDSSFLSLYDSHVAKEILLRVLTLFQNIKNCLK------IEGH
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pF1KB8 FSLEPLISAFREF-----EELAKQLQAQIDNQNDPEVGQQS
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CCDS57 LAVQPTFTEGSLFFLLHGEECAQKIRALVDHH-DAEVKEKVVTIIPKI
300 310 320 330 340
838 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 14:00:24 2016 done: Fri Nov 4 14:00:25 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]