FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB8642, 1091 aa 1>>>pF1KB8642 1091 - 1091 aa - 1091 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.4168+/-0.000744; mu= -11.6885+/- 0.045 mean_var=540.1926+/-109.664, 0's: 0 Z-trim(113.7): 77 B-trim: 0 in 0/56 Lambda= 0.055182 statistics sampled from 23102 (23143) to 23102 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.602), E-opt: 0.2 (0.271), width: 16 Scan time: 13.140 The best scores are: opt bits E(85289) XP_016860404 (OMIM: 609387) PREDICTED: structural (1091) 7076 580.2 2.2e-164 NP_078900 (OMIM: 609387) structural maintenance of (1091) 7076 580.2 2.2e-164 NP_001135758 (OMIM: 609387) structural maintenance (1091) 7076 580.2 2.2e-164 XP_016860403 (OMIM: 609387) PREDICTED: structural (1110) 6025 496.6 3.4e-139 XP_011531409 (OMIM: 609387) PREDICTED: structural (1110) 6025 496.6 3.4e-139 XP_016860402 (OMIM: 609387) PREDICTED: structural (1110) 6025 496.6 3.4e-139 XP_016860405 (OMIM: 609387) PREDICTED: structural (1064) 5749 474.6 1.4e-132 XP_011531410 (OMIM: 609387) PREDICTED: structural (1083) 4698 390.9 2.1e-107 XP_005251894 (OMIM: 609386) PREDICTED: structural (1086) 381 47.2 0.00061 XP_006713522 (OMIM: 605575) PREDICTED: structural (1210) 338 43.9 0.007 >>XP_016860404 (OMIM: 609387) PREDICTED: structural main (1091 aa) initn: 7076 init1: 7076 opt: 7076 Z-score: 3072.3 bits: 580.2 E(85289): 2.2e-164 Smith-Waterman score: 7076; 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