Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8675
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8675, 622 aa
1>>>pF1KB8675 622 - 622 aa - 622 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0532+/-0.000868; mu= 12.0576+/- 0.053
mean_var=127.3969+/-24.867, 0's: 0 Z-trim(110.9): 25 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.113630
statistics sampled from 11961 (11978) to 11961 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.711), E-opt: 0.2 (0.368), width: 16
Scan time: 3.760
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8130.1 KLC2 gene_id:64837|Hs108|chr11 ( 622) 4064 677.7 1.3e-194
CCDS44653.1 KLC2 gene_id:64837|Hs108|chr11 ( 545) 3107 520.7 1.9e-147
CCDS4883.1 KLC4 gene_id:89953|Hs108|chr6 ( 619) 2673 449.6 5.6e-126
CCDS4882.1 KLC4 gene_id:89953|Hs108|chr6 ( 637) 2673 449.6 5.8e-126
CCDS45168.1 KLC1 gene_id:3831|Hs108|chr14 ( 618) 2604 438.3 1.4e-122
CCDS41996.1 KLC1 gene_id:3831|Hs108|chr14 ( 573) 2428 409.4 6.5e-114
CCDS32165.1 KLC1 gene_id:3831|Hs108|chr14 ( 560) 2419 407.9 1.8e-113
CCDS75459.1 KLC4 gene_id:89953|Hs108|chr6 ( 542) 2141 362.4 9.1e-100
CCDS12660.2 KLC3 gene_id:147700|Hs108|chr19 ( 504) 1654 282.5 9.2e-76
CCDS47429.1 KLC4 gene_id:89953|Hs108|chr6 ( 315) 1242 214.8 1.4e-55
CCDS3078.1 NPHP3 gene_id:27031|Hs108|chr3 (1330) 440 83.8 1.6e-15
>>CCDS8130.1 KLC2 gene_id:64837|Hs108|chr11 (622 aa)
initn: 4064 init1: 4064 opt: 4064 Z-score: 3607.5 bits: 677.7 E(32554): 1.3e-194
Smith-Waterman score: 4064; 99.8% identity (100.0% similar) in 622 aa overlap (1-622:1-622)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAMMVFPREEKLSQDEIVLGTKAVIQGLETLRGEHRALLAPLVAPEAGEAEPGSQERCIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MAMMVFPREEKLSQDEIVLGTKAVIQGLETLRGEHRALLAPLVAPEAGEAEPGSQERCIL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 LRRSLEAIELGLGEAQVILALSSHLGAVESEKQKLRAQVRRLVQENQWLREELAGTQQKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LRRSLEAIELGLGEAQVILALSSHLGAVESEKQKLRAQVRRLVQENQWLREELAGTQQKL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 QRSEQAVAQLEEEKQHLLFMSQIRKLDEDASPNEEKGDVPKDTLDDLFPNEDEQSPAPSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QRSEQAVAQLEEEKQHLLFMSQIRKLDEDASPNEEKGDVPKDTLDDLFPNEDEQSPAPSP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 GGGDVSGQHGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQALEDLEKTSGHDHPDVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GGGDVSGQHGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQALEDLEKTSGHDHPDVA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 TMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDALAIREKTLGKDHPAVAATLNNLAVLYGKRGKYKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDALAIREKTLGKDHPAVAATLNNLAVLYGKRGKYKE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 AEPLCKRALEIREKVLGKFRPDVAKQLSNLALLCQNQGKAEEVEYYYRRALEIYATRLGP
:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 AEPLCKRALEIREKVLGKFHPDVAKQLSNLALLCQNQGKAEEVEYYYRRALEIYATRLGP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 DDPNVAKTKNNLASCYLKQGKYQDAETLYKEILTRAHEKEFGSVNGDNKPIWMHAEEREE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DDPNVAKTKNNLASCYLKQGKYQDAETLYKEILTRAHEKEFGSVNGDNKPIWMHAEEREE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 SKDKRRDSAPYGEYGSWYKACKVDSPTVNTTLRSLGALYRRQGKLEAAHTLEDCASRNRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SKDKRRDSAPYGEYGSWYKACKVDSPTVNTTLRSLGALYRRQGKLEAAHTLEDCASRNRK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 QGLDPASQTKVVELLKDGSGRRGDRRSSRDMAGGAGPRSESDLEDVGPTAEWNGDGSGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QGLDPASQTKVVELLKDGSGRRGDRRSSRDMAGGAGPRSESDLEDVGPTAEWNGDGSGSL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 RRSGSFGKLRDALRRSSEMLVKKLQGGTPQEPPNPRMKRASSLNFLNKSVEEPTQPGGTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RRSGSFGKLRDALRRSSEMLVKKLQGGTPQEPPNPRMKRASSLNFLNKSVEEPTQPGGTG
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KB8 LSDSRTLSSSSMDLSRRSSLVG
::::::::::::::::::::::
CCDS81 LSDSRTLSSSSMDLSRRSSLVG
610 620
>>CCDS44653.1 KLC2 gene_id:64837|Hs108|chr11 (545 aa)
initn: 3104 init1: 3104 opt: 3107 Z-score: 2760.5 bits: 520.7 E(32554): 1.9e-147
Smith-Waterman score: 3420; 87.5% identity (87.6% similar) in 622 aa overlap (1-622:1-545)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAMMVFPREEKLSQDEIVLGTKAVIQGLETLRGEHRALLAPLVAPEAGEAEPGSQERCIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MAMMVFPREEKLSQDEIVLGTKAVIQGLETLRGEHRALLAPLVAPEAGEAEPGSQERCIL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 LRRSLEAIELGLGEAQVILALSSHLGAVESEKQKLRAQVRRLVQENQWLREELAGTQQKL
::::::::::::::::
CCDS44 LRRSLEAIELGLGEAQ--------------------------------------------
70
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 QRSEQAVAQLEEEKQHLLFMSQIRKLDEDASPNEEKGDVPKDTLDDLFPNEDEQSPAPSP
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ---------------------------------EEKGDVPKDTLDDLFPNEDEQSPAPSP
80 90 100
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 GGGDVSGQHGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQALEDLEKTSGHDHPDVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GGGDVSGQHGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQALEDLEKTSGHDHPDVA
110 120 130 140 150 160
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 TMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDALAIREKTLGKDHPAVAATLNNLAVLYGKRGKYKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDALAIREKTLGKDHPAVAATLNNLAVLYGKRGKYKE
170 180 190 200 210 220
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 AEPLCKRALEIREKVLGKFRPDVAKQLSNLALLCQNQGKAEEVEYYYRRALEIYATRLGP
:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AEPLCKRALEIREKVLGKFHPDVAKQLSNLALLCQNQGKAEEVEYYYRRALEIYATRLGP
230 240 250 260 270 280
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 DDPNVAKTKNNLASCYLKQGKYQDAETLYKEILTRAHEKEFGSVNGDNKPIWMHAEEREE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DDPNVAKTKNNLASCYLKQGKYQDAETLYKEILTRAHEKEFGSVNGDNKPIWMHAEEREE
290 300 310 320 330 340
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 SKDKRRDSAPYGEYGSWYKACKVDSPTVNTTLRSLGALYRRQGKLEAAHTLEDCASRNRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SKDKRRDSAPYGEYGSWYKACKVDSPTVNTTLRSLGALYRRQGKLEAAHTLEDCASRNRK
350 360 370 380 390 400
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 QGLDPASQTKVVELLKDGSGRRGDRRSSRDMAGGAGPRSESDLEDVGPTAEWNGDGSGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QGLDPASQTKVVELLKDGSGRRGDRRSSRDMAGGAGPRSESDLEDVGPTAEWNGDGSGSL
410 420 430 440 450 460
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 RRSGSFGKLRDALRRSSEMLVKKLQGGTPQEPPNPRMKRASSLNFLNKSVEEPTQPGGTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RRSGSFGKLRDALRRSSEMLVKKLQGGTPQEPPNPRMKRASSLNFLNKSVEEPTQPGGTG
470 480 490 500 510 520
610 620
pF1KB8 LSDSRTLSSSSMDLSRRSSLVG
::::::::::::::::::::::
CCDS44 LSDSRTLSSSSMDLSRRSSLVG
530 540
>>CCDS4883.1 KLC4 gene_id:89953|Hs108|chr6 (619 aa)
initn: 2394 init1: 1355 opt: 2673 Z-score: 2375.1 bits: 449.6 E(32554): 5.6e-126
Smith-Waterman score: 2692; 69.5% identity (85.9% similar) in 622 aa overlap (7-618:12-619)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MAMMVFPREEKLSQDEIVLGTKAVIQGLETLRGEHRALLAPLVAP-----EAGEA
: ..:::.::. .:. : ::::.::.::.:.: : ..:.
CCDS48 MSGLVLGQRDEPAGHRLSQEEILGSTRLVSQGLEALRSEHQAVLQSLSQTIECLQQGGHE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 EPGSQERCILLRRSLEAIELGLGEAQVILALSSHLGAVESEKQKLRAQVRRLVQENQWLR
: .:. ::::.: :::::.::::.:::.:::..::::::::::::::: :::::::
CCDS48 EGLVHEKARQLRRSMENIELGLSEAQVMLALASHLSTVESEKQKLRAQVRRLCQENQWLR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KB8 EELAGTQQKLQRSEQAVAQLEEEKQHLLFMSQIRKLDEDASPNEEK-GDVPKDTLDDLFP
.:::::::.:::::::::::::::.:: :..:.:. :::. .::: ::. ::.::::::
CCDS48 DELAGTQQRLQRSEQAVAQLEEEKKHLEFLGQLRQYDEDGHTSEEKEGDATKDSLDDLFP
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 NEDEQSPAP--SPGGGDVSGQHGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQALED
::.:..:. : : : ...:.::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS48 NEEEEDPSNGLSRGQGATAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYAAQGRYEVAVPLCKQALED
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 LEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDALAIREKTLGKDHPAVAATLNN
::.:::. ::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::: :::::::::::
CCDS48 LERTSGRGHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDALSIRESTLGPDHPAVAATLNN
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 LAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKFRPDVAKQLSNLALLCQNQGKAEEVEYYY
::::::::::::::::::.::::::::::: .:::::::.::::::::::: : :: ::
CCDS48 LAVLYGKRGKYKEAEPLCQRALEIREKVLGTNHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEAVERYY
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 RRALEIYATRLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKYQDAETLYKEILTRAHEKEFGSVNGD
.::: :: .::::.::::.::::::::::::::: .::::::::::::: .:::::. :
CCDS48 QRALAIYEGQLGPDNPNVARTKNNLASCYLKQGKYAEAETLYKEILTRAHVQEFGSVDDD
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 NKPIWMHAEEREE-SKDKRRDSA-PYGEYGSWYKACKVDSPTVNTTLRSLGALYRRQGKL
.:::::::::::: ::....... ::.:::.:::::::.:::::::::.:::::::::::
CCDS48 HKPIWMHAEEREEMSKSRHHEGGTPYAEYGGWYKACKVSSPTVNTTLRNLGALYRRQGKL
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KB8 EAAHTLEDCASRNRKQGLDPASQTKVVELLKDGSGRRGDRRSSRDMAGGAGPRSESDLED
:::.:::.:: :.:.:: :: :::::.::: ...::: .... : . : ::
CCDS48 EAAETLEECALRSRRQGTDPISQTKVAELLGESDGRRTSQEGPGDSVKFEGG------ED
490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB8 VGPTAEWNGDGSGSLRRSGSFGKLRDALRRSSEMLVKKLQGGTPQEPPNPRMKRASSLNF
.. ..::.:::::.:.::::.::.::.::::::.::.:::: :. : . ::::.:::.
CCDS48 ASVAVEWSGDGSGTLQRSGSLGKIRDVLRRSSELLVRKLQGTEPR-PSSSNMKRAASLNY
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620
pF1KB8 LNKSVEEPTQPGGTGLSDSRTLSSSSMDLSRRSSLVG
:: ::... :. :: ::.:.:::: :
CCDS48 LN-------QPSAAPLQVSRGLSASTMDLSSSS
600 610
>>CCDS4882.1 KLC4 gene_id:89953|Hs108|chr6 (637 aa)
initn: 2394 init1: 1355 opt: 2673 Z-score: 2375.0 bits: 449.6 E(32554): 5.8e-126
Smith-Waterman score: 2692; 69.5% identity (85.9% similar) in 622 aa overlap (7-618:30-637)
10 20 30
pF1KB8 MAMMVFPREEKLSQDEIVLGTKAVIQGLETLRGEHRA
: ..:::.::. .:. : ::::.::.::.:
CCDS48 MEVTGFGVTRPGKVPQARMSGLVLGQRDEPAGHRLSQEEILGSTRLVSQGLEALRSEHQA
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 LLAPLVAP-----EAGEAEPGSQERCILLRRSLEAIELGLGEAQVILALSSHLGAVESEK
.: : ..:. : .:. ::::.: :::::.::::.:::.:::..:::::
CCDS48 VLQSLSQTIECLQQGGHEEGLVHEKARQLRRSMENIELGLSEAQVMLALASHLSTVESEK
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 QKLRAQVRRLVQENQWLREELAGTQQKLQRSEQAVAQLEEEKQHLLFMSQIRKLDEDASP
:::::::::: :::::::.:::::::.:::::::::::::::.:: :..:.:. :::.
CCDS48 QKLRAQVRRLCQENQWLRDELAGTQQRLQRSEQAVAQLEEEKKHLEFLGQLRQYDEDGHT
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200
pF1KB8 NEEK-GDVPKDTLDDLFPNEDEQSPAP--SPGGGDVSGQHGGYEIPARLRTLHNLVIQYA
.::: ::. ::.::::::::.:..:. : : : ...:.::::::::::::::::::::
CCDS48 SEEKEGDATKDSLDDLFPNEEEEDPSNGLSRGQGATAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYA
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 SQGRYEVAVPLCKQALEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDALAI
.:::::::::::::::::::.:::. ::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS48 AQGRYEVAVPLCKQALEDLERTSGRGHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDALSI
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 REKTLGKDHPAVAATLNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKFRPDVAKQLSN
::.::: :::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::: .:::::::.:
CCDS48 RESTLGPDHPAVAATLNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCQRALEIREKVLGTNHPDVAKQLNN
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 LALLCQNQGKAEEVEYYYRRALEIYATRLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKYQDAETLY
:::::::::: : :: ::.::: :: .::::.::::.::::::::::::::: .:::::
CCDS48 LALLCQNQGKYEAVERYYQRALAIYEGQLGPDNPNVARTKNNLASCYLKQGKYAEAETLY
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 KEILTRAHEKEFGSVNGDNKPIWMHAEEREE-SKDKRRDSA-PYGEYGSWYKACKVDSPT
:::::::: .:::::. :.:::::::::::: ::....... ::.:::.:::::::.:::
CCDS48 KEILTRAHVQEFGSVDDDHKPIWMHAEEREEMSKSRHHEGGTPYAEYGGWYKACKVSSPT
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 VNTTLRSLGALYRRQGKLEAAHTLEDCASRNRKQGLDPASQTKVVELLKDGSGRRGDRRS
::::::.::::::::::::::.:::.:: :.:.:: :: :::::.::: ...::: ....
CCDS48 VNTTLRNLGALYRRQGKLEAAETLEECALRSRRQGTDPISQTKVAELLGESDGRRTSQEG
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KB8 SRDMAGGAGPRSESDLEDVGPTAEWNGDGSGSLRRSGSFGKLRDALRRSSEMLVKKLQGG
: . : ::.. ..::.:::::.:.::::.::.::.::::::.::.::::
CCDS48 PGDSVKFEGG------EDASVAVEWSGDGSGTLQRSGSLGKIRDVLRRSSELLVRKLQGT
550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
pF1KB8 TPQEPPNPRMKRASSLNFLNKSVEEPTQPGGTGLSDSRTLSSSSMDLSRRSSLVG
:. : . ::::.:::.:: ::... :. :: ::.:.:::: :
CCDS48 EPR-PSSSNMKRAASLNYLN-------QPSAAPLQVSRGLSASTMDLSSSS
600 610 620 630
>>CCDS45168.1 KLC1 gene_id:3831|Hs108|chr14 (618 aa)
initn: 2547 init1: 1768 opt: 2604 Z-score: 2314.0 bits: 438.3 E(32554): 1.4e-122
Smith-Waterman score: 2615; 69.0% identity (85.1% similar) in 606 aa overlap (1-589:5-607)
10 20 30 40
pF1KB8 MAMMVFPRE---EKLSQDEIVLGTKAVIQGLETLRGEHRALLAPLVAP----EAGE
:. ::. .: :::.::::. :: ::::::.:..:: ..: :. . .
CCDS45 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 AEPGSQERCILLRRSLEAIELGLGEAQVILALSSHLGAVESEKQKLRAQVRRLVQENQWL
.:. ..:.::: .::::.::::..:::.::.:::::::::::::::: ::::::
CCDS45 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 REELAGTQQKLQRSEQAVAQLEEEKQHLLFMSQIRKLDEDASPNEEKG-DVPKDTLDDLF
:.:::.::::::.:::.::::::::.:: ::.:..: :.: ::.:.: : :. :::::
CCDS45 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 PNEDEQSPAPS----PGGGDVSGQHGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQA
:: ::..:. . ... ...:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PN-DEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQA
190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 LEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDALAIREKTLGKDHPAVAAT
:::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::
CCDS45 LEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAAT
240 250 260 270 280 290
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CCDS45 LNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVE
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350 360 370 380 390 400
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CCDS45 YYYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSV
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CCDS45 DDENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGK
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.:::.:::. : :.:::::: . . .:.:.:.: . ..: ::. . . ::
CCDS45 FEAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENM--EKRRSRESLNVDVVKYESGPD
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:.:. ..::::::.:::.:::::.::: ..::::: ::.::.::. .: : :: .
CCDS45 GGEEVSMSVEWNGDGTGSLKRSGSFSKLRASIRRSSEKLVRKLKGGSSRESEPKNPGASL
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: : : :
CCDS45 AEPLFVENDSSSSGLEDATAN
600 610
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10 20 30 40
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:. ::. .: :::.::::. :: ::::::.:..:: ..: :. . .
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.:. ..:.::: .::::.::::..:::.::.:::::::::::::::: ::::::
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170 180 190 200 210 220
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:: ::..:. . ... ...:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 PN-DEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQA
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:::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::
CCDS41 LEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAAT
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 LNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKFRPDVAKQLSNLALLCQNQGKAEEVE
:::::::::::::::::::::::::::::::::: .:::::::.::::::::::: ::::
CCDS41 LNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVE
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:::.:::::: :.::::::::::::::::::::::::...::::::::::::::.:::::
CCDS41 YYYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSV
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pF1KB8 NGDNKPIWMHAEEREESKDKRRDSAPYGEYGSWYKACKVDSPTVNTTLRSLGALYRRQGK
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CCDS41 DDENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGK
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pF1KB8 LEAAHTLEDCASRNRKQGLDPASQTKVVELLKDGSGRRGDRRSSRDMAGGAGPRSESDL-
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CCDS41 FEAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENM--EKRRSRESLNVDVVKYESGPD
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pF1KB8 --EDVGPTAEWNGDGSGSLRRSGSFGKLRDALRRSSEMLVKKLQGGTPQEPPNPRMKRAS
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CCDS41 GGEEVSMSVEWNGGVSG---RASFCGKRQQQQWPGRRHR
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10 20 30 40
pF1KB8 MAMMVFPRE---EKLSQDEIVLGTKAVIQGLETLRGEHRALLAPLVAP----EAGE
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CCDS32 MYDNMSTMVYIKEDKLEKLTQDEIISKTKQVIQGLEALKNEHNSILQSLLETLKCLKKDD
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50 60 70 80 90 100
pF1KB8 AEPGSQERCILLRRSLEAIELGLGEAQVILALSSHLGAVESEKQKLRAQVRRLVQENQWL
.:. ..:.::: .::::.::::..:::.::.:::::::::::::::: ::::::
CCDS32 ESNLVEEKSNMIRKSLEMLELGLSEAQVMMALSNHLNAVESEKQKLRAQVRRLCQENQWL
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pF1KB8 REELAGTQQKLQRSEQAVAQLEEEKQHLLFMSQIRKLDEDASPNEEKG-DVPKDTLDDLF
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CCDS32 RDELANTQQKLQKSEQSVAQLEEEKKHLEFMNQLKKYDDDISPSEDKDTDSTKEPLDDLF
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:: ::..:. . ... ...:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PN-DEDDPGQGIQQQHSSAAAAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQA
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pF1KB8 LEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDALAIREKTLGKDHPAVAAT
:::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::
CCDS32 LEDLEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKDAANLLNDALAIREKTLGKDHPAVAAT
240 250 260 270 280 290
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pF1KB8 LNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKFRPDVAKQLSNLALLCQNQGKAEEVE
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CCDS32 LNNLAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKDHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEEVE
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CCDS32 YYYQRALEIYQTKLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKFKQAETLYKEILTRAHEREFGSV
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pF1KB8 NGDNKPIWMHAEEREESKDKRRDSAPYGEYGSWYKACKVDSPTVNTTLRSLGALYRRQGK
. .::::::::::::: : :..:.. .::::.::::::::::::.:::..::::::::::
CCDS32 DDENKPIWMHAEEREECKGKQKDGTSFGEYGGWYKACKVDSPTVTTTLKNLGALYRRQGK
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pF1KB8 LEAAHTLEDCASRNRKQGLDPASQTKVVELLKDGSGRRGDRRSSRDMAGGAGPRSESDL-
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CCDS32 FEAAETLEEAAMRSRKQGLDNVHKQRVAEVLNDPENM--EKRRSRESLNVDVVKYESGPD
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pF1KB8 --EDVGPTAEWNGDGSGSLRRSGSFGKLRDALRRSSEMLVKKLQGGTPQEPPNPRMKRAS
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CCDS32 GGEEVSMSVEWNGMRKMKLGLVN
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pF1KB8 GTQQKLQRSEQAVAQLEEEKQHLLFMSQIRKLDEDASPNEEKGDVPKDTLDDLFPNEDEQ
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pF1KB8 SPAP--SPGGGDVSGQHGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQALEDLEKTS
.:. : : : ...:.::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::.::
CCDS75 DPSNGLSRGQGATAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYAAQGRYEVAVPLCKQALEDLERTS
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:. ::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::: ::::::::::::::::
CCDS75 GRGHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDALSIRESTLGPDHPAVAATLNNLAVLY
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pF1KB8 GKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKFRPDVAKQLSNLALLCQNQGKAEEVEYYYRRALE
:::::::::::::.::::::::::: .:::::::.::::::::::: : :: ::.:::
CCDS75 GKRGKYKEAEPLCQRALEIREKVLGTNHPDVAKQLNNLALLCQNQGKYEAVERYYQRALA
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pF1KB8 IYATRLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKYQDAETLYKEILTRAHEKEFGSVNGDNKPIW
:: .::::.::::.::::::::::::::: .::::::::::::: .:::::. :.::::
CCDS75 IYEGQLGPDNPNVARTKNNLASCYLKQGKYAEAETLYKEILTRAHVQEFGSVDDDHKPIW
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pF1KB8 MHAEEREE-SKDKRRDSA-PYGEYGSWYKACKVDSPTVNTTLRSLGALYRRQGKLEAAHT
:::::::: ::....... ::.:::.:::::::.:::::::::.::::::::::::::.:
CCDS75 MHAEEREEMSKSRHHEGGTPYAEYGGWYKACKVSSPTVNTTLRNLGALYRRQGKLEAAET
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pF1KB8 LEDCASRNRKQGLDPASQTKVVELLKDGSGRRGDRRSSRDMAGGAGPRSESDLEDVGPTA
::.:: :.:.:: :: :::::.::: ...::: .... : . : ::.. ..
CCDS75 LEECALRSRRQGTDPISQTKVAELLGESDGRRTSQEGPGDSVKFEGG------EDASVAV
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pF1KB8 EWNGDGSGSLRRSGSFGKLRDALRRSSEMLVKKLQGGTPQEPPNPRMKRASSLNFLNKSV
::.:::::.:.::::.::.::.::::::.::.:::: :. : . ::::.:::.::
CCDS75 EWSGDGSGTLQRSGSLGKIRDVLRRSSELLVRKLQGTEPR-PSSSNMKRAASLNYLN---
470 480 490 500 510
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pF1KB8 EEPTQPGGTGLSDSRTLSSSSMDLSRRSSLVG
::... :. :: ::.:.:::: :
CCDS75 ----QPSAAPLQVSRGLSASTMDLSSSS
520 530 540
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10 20 30 40 50
pF1KB8 MAMMVFPREEKLSQDEIVLGTKAVIQGLETLRGEHRALLAPLVAPEAGEAEPGS
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.:. .. .::::::::::::::.::::.:.::.:.:::.::.:.:::.::: :::
CCDS12 LEMLEEKQQVVSHSLEAIELGLGEAQVLLALSAHVGALEAEKQRLRSQARRLAQENVWLR
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::: ::..:. ::..::::::::.:: :..:.:. : : .. .. .:.: .:::.
CCDS12 EELEETQRRLRASEESVAQLEEEKRHLEFLGQLRQYDPPAESQQSESPPRRDSLASLFPS
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pF1KB8 EDEQSPAPSPGGGDVSGQHGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQALEDLEK
:.:. .: .:. ...:.::::::::::::::::::::.:::::::::::.:::::::.
CCDS12 EEEERKGPEAAGA-AAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYAGQGRYEVAVPLCRQALEDLER
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pF1KB8 TSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDALAIREKTLGKDHPAVAATLNNLAV
.::: ::::::::::::::::::::::::. ::.::: :::.::: .:::::::::::::
CCDS12 SSGHCHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEATDLLHDALQIREQTLGPEHPAVAATLNNLAV
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pF1KB8 LYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKFRPDVAKQLSNLALLCQNQGKAEEVEYYYRRA
::::::.:.::::::.::::::::::: .:::::::.::::::::::: :.:: .: ::
CCDS12 LYGKRGRYREAEPLCQRALEIREKVLGADHPDVAKQLNNLALLCQNQGKFEDVERHYARA
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pF1KB8 LEIYATRLGPDDPNVAKTKNNLASCYLKQGKYQDAETLYKEILTRAH-EKEFGSVNGDNK
: :: . :: ::::::::::::: ::::.:::.:: :::::: . .:. : .
CCDS12 LSIYEALGGPHDPNVAKTKNNLASAYLKQNKYQQAEELYKEILHKEDLPAPLGAPNTGTA
360 370 380 390 400 410
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pF1KB8 PIWMHAEEREESKDKRRDSAPYGEYGSWYKACKVDSPTVNTTLRSLGALYRRQGKLEAAH
.: .: : .: :.: :
CCDS12 GDAEQALRRSSSLSKIRESIRRGSEKLVSRLRGEAAAGAAGMKRAMSLNTLNVDAPRAPG
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pF1KB8 MAMMVFPREEKLSQDEIVLGTKAVIQGLETLRGEHRALLAPLVAP-----EAGEA
: ..:::.::. .:. : ::::.::.::.:.: : ..:.
CCDS47 MSGLVLGQRDEPAGHRLSQEEILGSTRLVSQGLEALRSEHQAVLQSLSQTIECLQQGGHE
10 20 30 40 50 60
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pF1KB8 EPGSQERCILLRRSLEAIELGLGEAQVILALSSHLGAVESEKQKLRAQVRRLVQENQWLR
: .:. ::::.: :::::.::::.:::.:::..::::::::::::::: :::::::
CCDS47 EGLVHEKARQLRRSMENIELGLSEAQVMLALASHLSTVESEKQKLRAQVRRLCQENQWLR
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pF1KB8 EELAGTQQKLQRSEQAVAQLEEEKQHLLFMSQIRKLDEDASPNEEK-GDVPKDTLDDLFP
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CCDS47 DELAGTQQRLQRSEQAVAQLEEEKKHLEFLGQLRQYDEDGHTSEEKEGDATKDSLDDLFP
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pF1KB8 NEDEQSPAP--SPGGGDVSGQHGGYEIPARLRTLHNLVIQYASQGRYEVAVPLCKQALED
::.:..:. : : : ...:.::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS47 NEEEEDPSNGLSRGQGATAAQQGGYEIPARLRTLHNLVIQYAAQGRYEVAVPLCKQALED
190 200 210 220 230 240
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pF1KB8 LEKTSGHDHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDALAIREKTLGKDHPAVAATLNN
::.:::. ::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::: :::::.
CCDS47 LERTSGRGHPDVATMLNILALVYRDQNKYKEAAHLLNDALSIRESTLGPDHPAVSIPCPP
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pF1KB8 LAVLYGKRGKYKEAEPLCKRALEIREKVLGKFRPDVAKQLSNLALLCQNQGKAEEVEYYY
CCDS47 HPTPRTPHHCCFGLS
310
622 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 14:28:42 2016 done: Fri Nov 4 14:28:43 2016
Total Scan time: 3.760 Total Display time: 0.140
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]