Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8680
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8680, 633 aa
1>>>pF1KB8680 633 - 633 aa - 633 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5415+/-0.000899; mu= 10.5038+/- 0.054
mean_var=156.2460+/-31.356, 0's: 0 Z-trim(111.8): 33 B-trim: 83 in 1/52
Lambda= 0.102605
statistics sampled from 12678 (12702) to 12678 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.735), E-opt: 0.2 (0.39), width: 16
Scan time: 3.210
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS216.1 NBPF3 gene_id:84224|Hs108|chr1 ( 633) 4310 650.0 2.7e-186
CCDS81275.1 NBPF3 gene_id:84224|Hs108|chr1 ( 577) 3920 592.3 6e-169
CCDS57977.1 NBPF3 gene_id:84224|Hs108|chr1 ( 563) 3538 535.7 6.2e-152
CCDS72881.1 NBPF12 gene_id:149013|Hs108|chr1 (1457) 2773 422.8 1.6e-117
CCDS72895.1 NBPF9 gene_id:400818|Hs108|chr1 ( 942) 2745 418.5 2e-116
CCDS72896.1 NBPF9 gene_id:400818|Hs108|chr1 (1111) 2745 418.6 2.3e-116
CCDS72852.1 NBPF15 gene_id:284565|Hs108|chr1 ( 670) 2714 413.8 3.7e-115
CCDS76206.1 NBPF10 gene_id:100132406|Hs108|chr1 (3795) 2727 416.3 3.7e-115
CCDS41381.2 NBPF11 gene_id:200030|Hs108|chr1 ( 865) 2669 407.2 4.6e-113
CCDS57976.1 NBPF3 gene_id:84224|Hs108|chr1 ( 621) 2218 340.4 4.4e-93
CCDS44182.1 NBPF4 gene_id:148545|Hs108|chr1 ( 638) 1523 237.5 4.2e-62
CCDS44184.1 NBPF6 gene_id:653149|Hs108|chr1 ( 638) 1523 237.5 4.2e-62
CCDS72856.1 NBPF20 gene_id:100288142|Hs108|chr1 (5207) 1053 168.6 1.9e-40
>>CCDS216.1 NBPF3 gene_id:84224|Hs108|chr1 (633 aa)
initn: 4310 init1: 4310 opt: 4310 Z-score: 3458.1 bits: 650.0 E(32554): 2.7e-186
Smith-Waterman score: 4310; 100.0% identity (100.0% similar) in 633 aa overlap (1-633:1-633)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MPLTPTVQGFQWTLRGPDVETSPFGAPRAASHGVGRHQELRDPTVPGPTSSATNVSMVVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 MPLTPTVQGFQWTLRGPDVETSPFGAPRAASHGVGRHQELRDPTVPGPTSSATNVSMVVS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 AGPWSGEKAEMNILEINKKSRPQLAENKQQFRNLKQKCLVTQVAYFLANRQNNYDYEDCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 AGPWSGEKAEMNILEINKKSRPQLAENKQQFRNLKQKCLVTQVAYFLANRQNNYDYEDCK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 DLIKSMLRDERLLTEEKLAEELGQAEELRQYKVLVHSQERELTQLREKLQEGRDASRSLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 DLIKSMLRDERLLTEEKLAEELGQAEELRQYKVLVHSQERELTQLREKLQEGRDASRSLN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 QHLQALLTPDEPDNSQGRDLREQLAEGCRLAQHLVQKLSPENDDDEDEDVKVEEAEKVQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 QHLQALLTPDEPDNSQGRDLREQLAEGCRLAQHLVQKLSPENDDDEDEDVKVEEAEKVQE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LYAPREVQKAEEKEVPEDSLEECAITCSNSHHPCESNQPYGNTRITFEEDQVDSTLIDSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 LYAPREVQKAEEKEVPEDSLEECAITCSNSHHPCESNQPYGNTRITFEEDQVDSTLIDSS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 SHDEWLDAVCIIPENESDHEQEEEKGPVSPRNLQESEEEEAPQESWDEGDWTLSIPPDMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 SHDEWLDAVCIIPENESDHEQEEEKGPVSPRNLQESEEEEAPQESWDEGDWTLSIPPDMS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 ASYQSDRSTFHSVEEQQVGLALDIGRHWCDQVKKEDQEATSPRLSRELLDEKEPEVLQDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 ASYQSDRSTFHSVEEQQVGLALDIGRHWCDQVKKEDQEATSPRLSRELLDEKEPEVLQDS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 LDRFYSTPFEYLELPDLCQPYRSDFYSLQEQHLGLALDLDRMKKDQEEEEDQGPPCPRLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 LDRFYSTPFEYLELPDLCQPYRSDFYSLQEQHLGLALDLDRMKKDQEEEEDQGPPCPRLS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 RELPEVVEPEDLQDSLDRWYSTPFSYPELPDSCQPYGSCFYSLEEEHVGFSLDVDEIEKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 RELPEVVEPEDLQDSLDRWYSTPFSYPELPDSCQPYGSCFYSLEEEHVGFSLDVDEIEKY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 QEGEEDQKPPCPRLNEVLMEAEEPEVLQDSLDRCYSTTSTYFQLHASFQQYRSAFYSFEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 QEGEEDQKPPCPRLNEVLMEAEEPEVLQDSLDRCYSTTSTYFQLHASFQQYRSAFYSFEE
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KB8 QDVSLALDVDNRFFTLTVIRHHLAFQMGVIFPH
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS21 QDVSLALDVDNRFFTLTVIRHHLAFQMGVIFPH
610 620 630
>>CCDS81275.1 NBPF3 gene_id:84224|Hs108|chr1 (577 aa)
initn: 3920 init1: 3920 opt: 3920 Z-score: 3146.6 bits: 592.3 E(32554): 6e-169
Smith-Waterman score: 3920; 100.0% identity (100.0% similar) in 577 aa overlap (57-633:1-577)
30 40 50 60 70 80
pF1KB8 PRAASHGVGRHQELRDPTVPGPTSSATNVSMVVSAGPWSGEKAEMNILEINKKSRPQLAE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MVVSAGPWSGEKAEMNILEINKKSRPQLAE
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 NKQQFRNLKQKCLVTQVAYFLANRQNNYDYEDCKDLIKSMLRDERLLTEEKLAEELGQAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NKQQFRNLKQKCLVTQVAYFLANRQNNYDYEDCKDLIKSMLRDERLLTEEKLAEELGQAE
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 ELRQYKVLVHSQERELTQLREKLQEGRDASRSLNQHLQALLTPDEPDNSQGRDLREQLAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ELRQYKVLVHSQERELTQLREKLQEGRDASRSLNQHLQALLTPDEPDNSQGRDLREQLAE
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 GCRLAQHLVQKLSPENDDDEDEDVKVEEAEKVQELYAPREVQKAEEKEVPEDSLEECAIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GCRLAQHLVQKLSPENDDDEDEDVKVEEAEKVQELYAPREVQKAEEKEVPEDSLEECAIT
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 CSNSHHPCESNQPYGNTRITFEEDQVDSTLIDSSSHDEWLDAVCIIPENESDHEQEEEKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 CSNSHHPCESNQPYGNTRITFEEDQVDSTLIDSSSHDEWLDAVCIIPENESDHEQEEEKG
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 PVSPRNLQESEEEEAPQESWDEGDWTLSIPPDMSASYQSDRSTFHSVEEQQVGLALDIGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PVSPRNLQESEEEEAPQESWDEGDWTLSIPPDMSASYQSDRSTFHSVEEQQVGLALDIGR
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 HWCDQVKKEDQEATSPRLSRELLDEKEPEVLQDSLDRFYSTPFEYLELPDLCQPYRSDFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 HWCDQVKKEDQEATSPRLSRELLDEKEPEVLQDSLDRFYSTPFEYLELPDLCQPYRSDFY
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 SLQEQHLGLALDLDRMKKDQEEEEDQGPPCPRLSRELPEVVEPEDLQDSLDRWYSTPFSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SLQEQHLGLALDLDRMKKDQEEEEDQGPPCPRLSRELPEVVEPEDLQDSLDRWYSTPFSY
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KB8 PELPDSCQPYGSCFYSLEEEHVGFSLDVDEIEKYQEGEEDQKPPCPRLNEVLMEAEEPEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PELPDSCQPYGSCFYSLEEEHVGFSLDVDEIEKYQEGEEDQKPPCPRLNEVLMEAEEPEV
460 470 480 490 500 510
570 580 590 600 610 620
pF1KB8 LQDSLDRCYSTTSTYFQLHASFQQYRSAFYSFEEQDVSLALDVDNRFFTLTVIRHHLAFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LQDSLDRCYSTTSTYFQLHASFQQYRSAFYSFEEQDVSLALDVDNRFFTLTVIRHHLAFQ
520 530 540 550 560 570
630
pF1KB8 MGVIFPH
:::::::
CCDS81 MGVIFPH
>>CCDS57977.1 NBPF3 gene_id:84224|Hs108|chr1 (563 aa)
initn: 3839 init1: 3538 opt: 3538 Z-score: 2841.2 bits: 535.7 E(32554): 6.2e-152
Smith-Waterman score: 3703; 88.9% identity (88.9% similar) in 633 aa overlap (1-633:1-563)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MPLTPTVQGFQWTLRGPDVETSPFGAPRAASHGVGRHQELRDPTVPGPTSSATNVSMVVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 MPLTPTVQGFQWTLRGPDVETSPFGAPRAASHGVGRHQELRDPT----------------
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 AGPWSGEKAEMNILEINKKSRPQLAENKQQFRNLKQKCLVTQVAYFLANRQNNYDYEDCK
::::::
CCDS57 ------------------------------------------------------DYEDCK
50
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 DLIKSMLRDERLLTEEKLAEELGQAEELRQYKVLVHSQERELTQLREKLQEGRDASRSLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 DLIKSMLRDERLLTEEKLAEELGQAEELRQYKVLVHSQERELTQLREKLQEGRDASRSLN
60 70 80 90 100 110
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 QHLQALLTPDEPDNSQGRDLREQLAEGCRLAQHLVQKLSPENDDDEDEDVKVEEAEKVQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 QHLQALLTPDEPDNSQGRDLREQLAEGCRLAQHLVQKLSPENDDDEDEDVKVEEAEKVQE
120 130 140 150 160 170
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LYAPREVQKAEEKEVPEDSLEECAITCSNSHHPCESNQPYGNTRITFEEDQVDSTLIDSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LYAPREVQKAEEKEVPEDSLEECAITCSNSHHPCESNQPYGNTRITFEEDQVDSTLIDSS
180 190 200 210 220 230
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 SHDEWLDAVCIIPENESDHEQEEEKGPVSPRNLQESEEEEAPQESWDEGDWTLSIPPDMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 SHDEWLDAVCIIPENESDHEQEEEKGPVSPRNLQESEEEEAPQESWDEGDWTLSIPPDMS
240 250 260 270 280 290
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 ASYQSDRSTFHSVEEQQVGLALDIGRHWCDQVKKEDQEATSPRLSRELLDEKEPEVLQDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 ASYQSDRSTFHSVEEQQVGLALDIGRHWCDQVKKEDQEATSPRLSRELLDEKEPEVLQDS
300 310 320 330 340 350
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 LDRFYSTPFEYLELPDLCQPYRSDFYSLQEQHLGLALDLDRMKKDQEEEEDQGPPCPRLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 LDRFYSTPFEYLELPDLCQPYRSDFYSLQEQHLGLALDLDRMKKDQEEEEDQGPPCPRLS
360 370 380 390 400 410
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 RELPEVVEPEDLQDSLDRWYSTPFSYPELPDSCQPYGSCFYSLEEEHVGFSLDVDEIEKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 RELPEVVEPEDLQDSLDRWYSTPFSYPELPDSCQPYGSCFYSLEEEHVGFSLDVDEIEKY
420 430 440 450 460 470
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 QEGEEDQKPPCPRLNEVLMEAEEPEVLQDSLDRCYSTTSTYFQLHASFQQYRSAFYSFEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 QEGEEDQKPPCPRLNEVLMEAEEPEVLQDSLDRCYSTTSTYFQLHASFQQYRSAFYSFEE
480 490 500 510 520 530
610 620 630
pF1KB8 QDVSLALDVDNRFFTLTVIRHHLAFQMGVIFPH
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 QDVSLALDVDNRFFTLTVIRHHLAFQMGVIFPH
540 550 560
>>CCDS72881.1 NBPF12 gene_id:149013|Hs108|chr1 (1457 aa)
initn: 3830 init1: 2770 opt: 2773 Z-score: 2223.4 bits: 422.8 E(32554): 1.6e-117
Smith-Waterman score: 2773; 75.0% identity (87.2% similar) in 577 aa overlap (37-609:519-1095)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 VQGFQWTLRGPDVETSPFGAPRAASHGVGRHQELRDPT----VPGPTSSATNVSMVVSAG
:.: .: ::::::::::::::::::
CCDS72 CDSNQPHKNIKITFEEDKVNSSLVVDRESSHDECQDALNILPVPGPTSSATNVSMVVSAG
490 500 510 520 530 540
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PWSGEKAEMNILEINKKSRPQLAENKQQFRNLKQKCLVTQVAYFLANRQNNYDYEDCKDL
: :.:::::::::::.: ::::::.:::::.::.::.::::: :::..::.: ::.::::
CCDS72 PLSSEKAEMNILEINEKLRPQLAEKKQQFRSLKEKCFVTQVACFLAKQQNKYKYEECKDL
550 560 570 580 590 600
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 IKSMLRDERLLTEEKLAEELGQAEELRQYKVLVHSQERELTQLREKLQEGRDASRSLNQH
.:::::.: . ::::::.: ::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.:
CCDS72 LKSMLRNELQFKEEKLAEQLKQAEELRQYKVLVHSQERELTQLREKLREGRDASRSLNEH
610 620 630 640 650 660
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 LQALLTPDEPDNSQGRDLREQLAEGCRLAQHLVQKLSPENDDDEDEDVKVEEAEKVQELY
:::::::::::.:::.::.::::::::::::::::::::::.:.::::.:: :::::.
CCDS72 LQALLTPDEPDKSQGQDLQEQLAEGCRLAQHLVQKLSPENDNDDDEDVQVEVAEKVQKSS
670 680 690 700 710 720
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 APREVQKAEEKEVPEDSLEECAITCSNSHHPCESNQPYGNTRITFEEDQVDSTLIDSSSH
.:::.:::::::::::::::::::::::: : .::::. .:.::::::.:::::: ::::
CCDS72 SPREMQKAEEKEVPEDSLEECAITCSNSHGPYDSNQPHRKTKITFEEDKVDSTLIGSSSH
730 740 750 760 770 780
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 DEWLDAVCIIPENESDHEQEEEKGPVSPRNLQESEEEEAPQESWDEGDWTLSIPPDMSAS
:: ::: :::::::: :.:::::::::::::::::::.:::::::: ::::::. ::
CCDS72 VEWEDAVHIIPENESDDEEEEEKGPVSPRNLQESEEEEVPQESWDEGYSTLSIPPERLAS
790 800 810 820 830 840
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 YQSDRSTFHSVEEQQVGLALDIGRHWCDQVKKEDQEATSPRLSRELLDEKEPEVLQDSLD
::: :::::.::::: .:.::::: :::::::::::.:::::::: ::::::::::::
CCDS72 YQSYSSTFHSLEEQQVCMAVDIGRHRWDQVKKEDQEATGPRLSRELLAEKEPEVLQDSLD
850 860 870 880 890 900
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 RFYSTPFEYLELPDLCQPYRSDFYSLQEQHLGLALDLDRMKKDQEEEEDQGPPCPRLSRE
: :::: :: : : :::::: :: :..:..:::.:.:...: :: :::: : :::::::
CCDS72 RCYSTPSVYLGLTDSCQPYRSAFYVLEQQRVGLAVDMDEIEKYQEVEEDQDPSCPRLSRE
910 920 930 940 950 960
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 LPEVVEPEDLQDSLDRWYSTPFSYPELPDSCQPYGSCFYSLEEEHVGFSLDVDEIEKYQE
: ::: ::::::: :::: .: :::: ::: : :::::...:..::::.:.: ::
CCDS72 LLAEKEPEVLQDSLDRCYSTPSGYLELPDLGQPYRSAVYSLEEQYLGLALDVDRIKKDQE
970 980 990 1000 1010 1020
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 GEEDQKPPCPRLNEVLMEAEEPEVLQDSLDRCYSTTSTYFQLHASFQQYRSAFYSFEEQD
:::: ::::::.. :.:. ::::::::::::::: :. .. : : :::.::..::.
CCDS72 EEEDQGPPCPRLSRELLEVVEPEVLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPYRSSFYALEEKH
1030 1040 1050 1060 1070 1080
610 620 630
pF1KB8 VSLALDVDNRFFTLTVIRHHLAFQMGVIFPH
:...:::
CCDS72 VGFSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKKRRRGRKEGEEDQNPPCPRLSRELLAEKEPEVLQ
1090 1100 1110 1120 1130 1140
>--
initn: 1438 init1: 1353 opt: 1356 Z-score: 1089.8 bits: 213.0 E(32554): 2.2e-54
Smith-Waterman score: 1356; 78.9% identity (91.7% similar) in 265 aa overlap (37-297:248-512)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 VQGFQWTLRGPDVETSPFGAPRAASHGVGRHQELRDPT----VPGPTSSATNVSMVVSAG
:.: .: ::::::::::::::::::
CCDS72 CDSIQPHKNIKITFEEDKVNSTVVVDRKSSHDECQDALNILPVPGPTSSATNVSMVVSAG
220 230 240 250 260 270
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PWSGEKAEMNILEINKKSRPQLAENKQQFRNLKQKCLVTQVAYFLANRQNNYDYEDCKDL
: :.:::::::::::.: ::::::.:::::.::.::.:::.: :::..::.: ::.::::
CCDS72 PLSSEKAEMNILEINEKLRPQLAEKKQQFRSLKEKCFVTQLAGFLAKQQNKYKYEECKDL
280 290 300 310 320 330
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 IKSMLRDERLLTEEKLAEELGQAEELRQYKVLVHSQERELTQLREKLQEGRDASRSLNQH
::::::.: . ::::::.: ::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.:
CCDS72 IKSMLRNELQFKEEKLAEQLKQAEELRQYKVLVHSQERELTQLREKLREGRDASRSLNEH
340 350 360 370 380 390
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 LQALLTPDEPDNSQGRDLREQLAEGCRLAQHLVQKLSPENDDDEDEDVKVEEAEKVQELY
:::::::::::.:::.::.::::::::::::::::::::::.::::::.::: ::: :
CCDS72 LQALLTPDEPDKSQGQDLQEQLAEGCRLAQHLVQKLSPENDEDEDEDVQVEEDEKVLESS
400 410 420 430 440 450
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 APREVQKAEEKEVPEDSLEECAITCSNSHHPCESNQPYGNTRITFEEDQVDSTLIDSSSH
.:::.:::::..::::::::::::::::: ::.::::. : .::::::.:.:.:.
CCDS72 SPREMQKAEESKVPEDSLEECAITCSNSHGPCDSNQPHKNIKITFEEDKVNSSLVVDRES
460 470 480 490 500 510
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CCDS72 SHDECQDALNILPVPGPTSSATNVSMVVSAGPLSSEKAEMNILEINEKLRPQLAEKKQQF
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:::::::::..:..::.: ::::::..: ::.:::::: :::.:: . ::::::.: :::
CCDS72 NKQQFRNLKERCFLTQLAGFLANRQKKYKYEECKDLIKFMLRNERQFKEEKLAEQLKQAE
40 50 60 70 80 90
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:::::::::::::::::::::::.::::::::::.::::::::::::.:::.::.:::::
CCDS72 ELRQYKVLVHSQERELTQLREKLREGRDASRSLNEHLQALLTPDEPDKSQGQDLQEQLAE
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::::::.::::::::::.::::::.::: ::: : ::::::::::..::::::::::::
CCDS72 GCRLAQQLVQKLSPENDEDEDEDVQVEEDEKVLESSAPREVQKAEESKVPEDSLEECAIT
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::::: ::.: ::. : .::::::.:.::..
CCDS72 CSNSHGPCDSIQPHKNIKITFEEDKVNSTVVVDRKSSHDECQDALNILPVPGPTSSATNV
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CCDS72 SMVVSAGPLSSEKAEMNILEINEKLRPQLAEKKQQFRSLKEKCFVTQLAGFLAKQQNKYK
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: ::...: :: .: :. :. :
CCDS72 SLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKKRRRGRKEGEEDQNPPCPRLSRELLAEKEPEVLQDSL
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: : : :. .. : ::.:. .:.:.::::.:. . : .:::. . :::::
CCDS72 DRWYSTPSVYLGLTDPCQPYRSAFYVLEQQRVGLAVDMDEIEKYQEVEEDQDPSCPRLSR
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::: ::::::::::::: :::: ::::::: ::::: :::.::.::::::.::.::::
CCDS72 ELLAEKEPEVLQDSLDRCYSTPSGYLELPDLGQPYRSAVYSLEEQYLGLALDVDRIKKDQ
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::::::::::::::::: :::::: ::::::: :::: : : ::::::: : ::.:::.
CCDS72 EEEEDQGPPCPRLSRELLEVVEPEVLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPYRSSFYALEEK
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:::::::: :::: .::::::.::::::: ::::.::::::
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::::
CCDS72 QDSLDRCYSTPSMYFELPDSFQHYRSVFYSFEEQHITFALDMDNSFFTLTVTSLHLVFQM
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:: :::.:: . ::::::.: :::::::::::::.::::::::::::.::::::::::.:
CCDS72 IKFMLRNERQFKEEKLAEQLKQAEELRQYKVLVHAQERELTQLREKLREGRDASRSLNEH
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:::::::::::.:::.::.::::::::::::::::::::::.:.::::..: :::::.
CCDS72 LQALLTPDEPDKSQGQDLQEQLAEGCRLAQHLVQKLSPENDNDDDEDVQIEVAEKVQKSS
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::::.::::::::::::::::::: :::: : .::::. .:.::::::.:::::: ::::
CCDS72 APREMQKAEEKEVPEDSLEECAITYSNSHGPYDSNQPHRKTKITFEEDKVDSTLIGSSSH
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: ::: :::::::: :.:::::::::::::::::::.:::::::: : ::::.: ::
CCDS72 VEREDAVHIIPENESDDEEEEEKGPVSPRNLQESEEEEVPQESWDEGYSTPSIPPEMLAS
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:.: :::::.::::: .:.::::: :::::::::::.::::::::::: :::::::::
CCDS72 YKSYSSTFHSLEEQQVCMAVDIGRHRWDQVKKEDQEATGPRLSRELLDEKGPEVLQDSLD
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: :::: ::: : :::::: :: :..:..:::.:.:...: :: :::: : :::::::
CCDS72 RCYSTPSGCLELTDSCQPYRSAFYVLEQQRVGLAVDMDEIEKYQEVEEDQDPSCPRLSRE
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: . ::: ::::: :::::: .: :::: :::.: :::::...:..::.:.:.: ::
CCDS72 LLDEKEPEVLQDSLGRWYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSLEEQYLGLALDLDRIKKDQE
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:::: ::::::.. :.:. ::::::::::::::: :. .. : : : :.::..::.
CCDS72 EEEDQGPPCPRLSRELLEVVEPEVLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPYGSSFYALEEKH
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:...:::
CCDS72 VGFSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKERRRGRKEGEEDQNPPCPRLNGVLMEVEEPEVLQ
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:::::::::.:::::::::::.: ::::::
CCDS72 MVVSAGPWSSEKAEMNILEINEKLRPQLAE
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CCDS72 NKQQFGNLKERCFLTQLAGFLANRQKKYKYEECKDLIKFMLRNERQFKEEKLAEQLKQAE
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CCDS72 ELRQYKVLVHSQERELTQLKEKLREGRDASRSLNEHLQALLTPDEPDKSQGQDLQEQLAE
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:::::::::::::::::.::::::.::: ::: : ::::::::::..: ::::::::::
CCDS72 GCRLAQHLVQKLSPENDEDEDEDVQVEEDEKVLESSAPREVQKAEESKVAEDSLEECAIT
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pF1KB8 CSNSHHPCESNQPYGNTRITFEEDQVDSTLIDSSSHDEWLDAVCIIPENESDHEQEEEKG
::::: ::.::::. : .::::::.:.:::.
CCDS72 CSNSHGPCDSNQPHKNIKITFEEDEVNSTLVVDRESSHDECQDALNILPVPGPTSSATNV
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CCDS72 SMVVSAGPLSSEKAEMNILEINEKLRPQLAEKKQQFRNLKEKCFLTQLAGFLANQQNKYK
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CCDS72 FSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKERRRGRKEGEEDQNPPCPRLNGVLMEVEEPEVLQDS
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:: :::: : ::.: :::.:::.::::::: .:.:: :::::::::: ::.::: ::
CCDS72 LDGCYSTPSMYFELPDSFQHYRSVFYSFEEQHISFALYVDNRFFTLTVTSLHLVFQMEVI
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::.
CCDS72 FPQ
940
>>CCDS72896.1 NBPF9 gene_id:400818|Hs108|chr1 (1111 aa)
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pF1KB8 VQGFQWTLRGPDVETSPFGAPRAASHGVGRHQELRDPT----VPGPTSSATNVSMVVSAG
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CCDS72 CDSNQPHKNIKITFEEDEVNSTLVVDRESSHDECQDALNILPVPGPTSSATNVSMVVSAG
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pF1KB8 PWSGEKAEMNILEINKKSRPQLAENKQQFRNLKQKCLVTQVAYFLANRQNNYDYEDCKDL
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CCDS72 PLSSEKAEMNILEINEKLRPQLAEKKQQFRNLKEKCFLTQLAGFLANQQNKYKYEECKDL
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pF1KB8 IKSMLRDERLLTEEKLAEELGQAEELRQYKVLVHSQERELTQLREKLQEGRDASRSLNQH
:: :::.:: . ::::::.: :::::::::::::.::::::::::::.::::::::::.:
CCDS72 IKFMLRNERQFKEEKLAEQLKQAEELRQYKVLVHAQERELTQLREKLREGRDASRSLNEH
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pF1KB8 LQALLTPDEPDNSQGRDLREQLAEGCRLAQHLVQKLSPENDDDEDEDVKVEEAEKVQELY
:::::::::::.:::.::.::::::::::::::::::::::.:.::::..: :::::.
CCDS72 LQALLTPDEPDKSQGQDLQEQLAEGCRLAQHLVQKLSPENDNDDDEDVQIEVAEKVQKSS
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pF1KB8 APREVQKAEEKEVPEDSLEECAITCSNSHHPCESNQPYGNTRITFEEDQVDSTLIDSSSH
::::.::::::::::::::::::: :::: : .::::. .:.::::::.:::::: ::::
CCDS72 APREMQKAEEKEVPEDSLEECAITYSNSHGPYDSNQPHRKTKITFEEDKVDSTLIGSSSH
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pF1KB8 DEWLDAVCIIPENESDHEQEEEKGPVSPRNLQESEEEEAPQESWDEGDWTLSIPPDMSAS
: ::: :::::::: :.:::::::::::::::::::.:::::::: : ::::.: ::
CCDS72 VEREDAVHIIPENESDDEEEEEKGPVSPRNLQESEEEEVPQESWDEGYSTPSIPPEMLAS
520 530 540 550 560 570
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pF1KB8 YQSDRSTFHSVEEQQVGLALDIGRHWCDQVKKEDQEATSPRLSRELLDEKEPEVLQDSLD
:.: :::::.::::: .:.::::: :::::::::::.::::::::::: :::::::::
CCDS72 YKSYSSTFHSLEEQQVCMAVDIGRHRWDQVKKEDQEATGPRLSRELLDEKGPEVLQDSLD
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pF1KB8 RFYSTPFEYLELPDLCQPYRSDFYSLQEQHLGLALDLDRMKKDQEEEEDQGPPCPRLSRE
: :::: ::: : :::::: :: :..:..:::.:.:...: :: :::: : :::::::
CCDS72 RCYSTPSGCLELTDSCQPYRSAFYVLEQQRVGLAVDMDEIEKYQEVEEDQDPSCPRLSRE
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pF1KB8 LPEVVEPEDLQDSLDRWYSTPFSYPELPDSCQPYGSCFYSLEEEHVGFSLDVDEIEKYQE
: . ::: ::::: :::::: .: :::: :::.: :::::...:..::.:.:.: ::
CCDS72 LLDEKEPEVLQDSLGRWYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSLEEQYLGLALDLDRIKKDQE
700 710 720 730 740 750
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pF1KB8 GEEDQKPPCPRLNEVLMEAEEPEVLQDSLDRCYSTTSTYFQLHASFQQYRSAFYSFEEQD
:::: ::::::.. :.:. ::::::::::::::: :. .. : : : :.::..::.
CCDS72 EEEDQGPPCPRLSRELLEVVEPEVLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPYGSSFYALEEKH
760 770 780 790 800 810
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pF1KB8 VSLALDVDNRFFTLTVIRHHLAFQMGVIFPH
:...:::
CCDS72 VGFSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKKRRRGRKEGEENQNPPCPRLSRELLDEKEPEVLQ
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CCDS72 MVVSAGPWSSEKAEMNILEINEKLRPQLAE
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 NKQQFRNLKQKCLVTQVAYFLANRQNNYDYEDCKDLIKSMLRDERLLTEEKLAEELGQAE
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CCDS72 NKQQFGNLKERCFLTQLAGFLANRQKKYKYEECKDLIKFMLRNERQFKEEKLAEQLKQAE
40 50 60 70 80 90
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pF1KB8 ELRQYKVLVHSQERELTQLREKLQEGRDASRSLNQHLQALLTPDEPDNSQGRDLREQLAE
:::::::::::::::::::.:::.::::::::::.::::::::::::.:::.::.:::::
CCDS72 ELRQYKVLVHSQERELTQLKEKLREGRDASRSLNEHLQALLTPDEPDKSQGQDLQEQLAE
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 GCRLAQHLVQKLSPENDDDEDEDVKVEEAEKVQELYAPREVQKAEEKEVPEDSLEECAIT
:::::::::::::::::.::::::.::: ::: : ::::::::::..: ::::::::::
CCDS72 GCRLAQHLVQKLSPENDEDEDEDVQVEEDEKVLESSAPREVQKAEESKVAEDSLEECAIT
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CCDS72 CSNSHGPCDSNQPHKNIKITFEEDEVNSTLVVDRESSHDECQDALNILPVPGPTSSATNV
220 230 240 250 260 270
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initn: 1217 init1: 761 opt: 774 Z-score: 625.8 bits: 126.8 E(32554): 1.5e-28
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pF1KB8 QSDRSTFHSVEEQQVGLALDIGRHWCDQVKKEDQEATSPRLSRELLDEKEPEVLQDSLDR
.:.:. ::::::::::::::::::::::
CCDS72 DVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKKRRRGRKEGEENQNPPCPRLSRELLDEKEPEVLQDSLDR
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pF1KB8 FYSTPFEYLELPDLCQPYRSDFYSLQEQHLGLALDLDRMKKDQEEEEDQGPPCPRLSREL
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CCDS72 CYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSLEEQYLGLALDVDRIKKDQEEEEDQGPPCPRLSREL
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pF1KB8 PEVVEPEDLQDSLDRWYSTPFSYPELPDSCQPYGSCFYSLEEEHVGFSLDVDEIEK----
:::::: ::::::: :::: : : ::::::::: ::.:::.:::::::: ::::
CCDS72 LEVVEPEVLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPYGSSFYALEEKHVGFSLDVGEIEKKGKG
950 960 970 980 990 1000
540 550 560 570 580
pF1KB8 ---------------YQEGEEDQKPPCPRLNEVLMEAEEPEVLQDSLDRCYSTTSTYFQL
.::::::.::::::: ::::.::::::::::: :::: : ::.:
CCDS72 KKRRGRRSKKERRRGRKEGEEDQNPPCPRLNGVLMEVEEPEVLQDSLDGCYSTPSMYFEL
1010 1020 1030 1040 1050 1060
590 600 610 620 630
pF1KB8 HASFQQYRSAFYSFEEQDVSLALDVDNRFFTLTVIRHHLAFQMGVIFPH
:::.:::.::::::: .:.:: :::::::::: ::.::: ::::.
CCDS72 PDSFQHYRSVFYSFEEQHISFALYVDNRFFTLTVTSLHLVFQMEVIFPQ
1070 1080 1090 1100 1110
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30 40 50 60 70 80
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::::::: :.:::::::::::.: ::::::
CCDS72 MVVSAGPLSSEKAEMNILEINEKLRPQLAE
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90 100 110 120 130 140
pF1KB8 NKQQFRNLKQKCLVTQVAYFLANRQNNYDYEDCKDLIKSMLRDERLLTEEKLAEELGQAE
.::::::::.::..::.: ::::::..: ::.:::::: :::.:: . ::::::.: :::
CCDS72 KKQQFRNLKEKCFLTQLAGFLANRQKKYKYEECKDLIKFMLRNERQFKEEKLAEQLKQAE
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
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::::::::::.::::::::::::.::::::::::.::::::::::::.:::.::.:::::
CCDS72 ELRQYKVLVHAQERELTQLREKLREGRDASRSLNEHLQALLTPDEPDKSQGQDLQEQLAE
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 GCRLAQHLVQKLSPENDDDEDEDVKVEEAEKVQELYAPREVQKAEEKEVPEDSLEECAIT
::::.::::::::::::.:.::::.:: :::::. ::::.:::::::::::::::::::
CCDS72 GCRLTQHLVQKLSPENDNDDDEDVQVEVAEKVQKSSAPREMQKAEEKEVPEDSLEECAIT
160 170 180 190 200 210
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pF1KB8 CSNSHHPCESNQPYGNTRITFEEDQVDSTLIDSSSHDEWLDAVCIIPENESDHEQEEEKG
::::: : .::::. .:.::::::.:::::: :::: :: ::: :::::::: :.:::::
CCDS72 CSNSHGPYDSNQPHKKTKITFEEDKVDSTLIGSSSHVEWEDAVHIIPENESDDEEEEEKG
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 PVSPRNLQESEEEEAPQESWDEGDWTLSIPPDMSASYQSDRSTFHSVEEQQVGLALDIGR
::::::::::::::.:::::::: ::::::.: ::::: :::::.::::: .:.::::
CCDS72 PVSPRNLQESEEEEVPQESWDEGYSTLSIPPEMLASYQSYSSTFHSLEEQQVCMAVDIGR
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
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: :::::::::::.:::::::::::::::::::::: :::: ::: : :::::: ::
CCDS72 HRWDQVKKEDQEATGPRLSRELLDEKEPEVLQDSLDRCYSTPSGCLELTDSCQPYRSAFY
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pF1KB8 SLQEQHLGLALDLDRMKKDQEEEEDQGPPCPRLSRELPEVVEPEDLQDSLDRWYSTPFSY
:..:..:::.:.:...: :: :::: : :::::::: . ::: ::::::: :::: .:
CCDS72 VLEQQRVGLAIDMDEIEKYQEVEEDQDPSCPRLSRELLDEKEPEVLQDSLDRCYSTPSDY
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KB8 PELPDSCQPYGSCFYSLEEEHVGFSLDVDEIEKYQEGEEDQKPPCPRLNEVLMEAEEPEV
:::: :::.: :::::...:..::::.:.: :: :::: ::::::.. :.:. ::::
CCDS72 LELPDLGQPYSSAVYSLEEQYLGLALDVDRIKKDQEEEEDQGPPCPRLSRELLEVVEPEV
460 470 480 490 500 510
570 580 590 600 610 620
pF1KB8 LQDSLDRCYSTTSTYFQLHASFQQYRSAFYSFEEQDVSLALDVDNRFFTLTVIRHHLAFQ
::::::::::: :. .. : : : :.::..::. :...:::
CCDS72 LQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPYGSSFYALEEKHVGFSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRS
520 530 540 550 560 570
630
pF1KB8 MGVIFPH
CCDS72 KKKRRRGRKEGEDDNPPCPRLYGVLMEVEEPEVLQDSLDRCYSTPSMYFEQPDSFQHYRS
580 590 600 610 620 630
>--
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520 530 540 550 560 570
pF1KB8 DSCQPYGSCFYSLEEEHVGFSLDVDEIEKYQEGEEDQKPPCPRLNEVLMEAEEPEVLQDS
.:::.:. :::::: ::::.:::::::::
CCDS72 FSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKKRRRGRKEGEDDN-PPCPRLYGVLMEVEEPEVLQDS
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KB8 LDRCYSTTSTYFQLHASFQQYRSAFYSFEEQDVSLALDVDNRFFTLTVIRHHLAFQMGVI
::::::: : ::. :::.:::.::::::. .:.:: :::::::::: ::.::::::
CCDS72 LDRCYSTPSMYFEQPDSFQHYRSVFYSFEEEHISFALYVDNRFFTLTVTSLHLVFQMGVI
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pF1KB8 FPH
::.
CCDS72 FPQ
670
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:.: .: ::::::::::::::::::
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: :.:::::::::::.: ::::::.::::::::.::..::.. ::::.:..: ::.::::
CCDS76 PLSSEKAEMNILEINEKLRPQLAEKKQQFRNLKEKCFLTQLSGFLANQQKKYKYEECKDL
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pF1KB8 IKSMLRDERLLTEEKLAEELGQAEELRQYKVLVHSQERELTQLREKLQEGRDASRSLNQH
:: :::.:: . ::::::.: :::::::::::::.::::::::.:::.::::::::::.:
CCDS76 IKFMLRNERQFKEEKLAEQLKQAEELRQYKVLVHAQERELTQLKEKLREGRDASRSLNEH
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::::::: :::.:::.::.::::::::::::::::::::::.:.::::.:: :::::.
CCDS76 LQALLTPYEPDKSQGQDLQEQLAEGCRLAQHLVQKLSPENDNDDDEDVQVEVAEKVQKSS
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pF1KB8 APREVQKAEEKEVPEDSLEECAITCSNSHHPCESNQPYGNTRITFEEDQVDSTLIDSSSH
::::.::::::::::::::::::: :::: .::::. .:.::::::.:::::: ::::
CCDS76 APREMQKAEEKEVPEDSLEECAITYSNSHGSYDSNQPHRKTKITFEEDKVDSTLIGSSSH
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pF1KB8 DEWLDAVCIIPENESDHEQEEEKGPVSPRNLQESEEEEAPQESWDEGDWTLSIPPDMSAS
:: ::: :::::::: :.:::::::::::::::::::.:::::::: ::::::.: ::
CCDS76 VEWEDAVHIIPENESDDEEEEEKGPVSPRNLQESEEEEVPQESWDEGYSTLSIPPEMLAS
520 530 540 550 560 570
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 YQSDRSTFHSVEEQQVGLALDIGRHWCDQVKKEDQEATSPRLSRELLDEKEPEVLQDSLD
::: :::::.::::: .:.::::: :::::::::::.::::::::::: ::::::: :
CCDS76 YQSYSSTFHSLEEQQVCMAVDIGRHRWDQVKKEDQEATGPRLSRELLDEKGPEVLQDSQD
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: :::: ::: : :::::: :: :..:..:::.:.:...: :: :::: : :::::::
CCDS76 RCYSTPSGCLELTDSCQPYRSAFYILEQQRVGLAIDMDEIEKYQEVEEDQDPSCPRLSRE
640 650 660 670 680 690
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 LPEVVEPEDLQDSLDRWYSTPFSYPELPDSCQPYGSCFYSLEEEHVGFSLDVDEIEKYQE
: . ::: ::::::: :::: .: :::: :::.: :::::...:..::::.:.: ::
CCDS76 LLDEKEPEVLQDSLDRCYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSLEEQYLGLALDVDRIKKDQE
700 710 720 730 740 750
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pF1KB8 GEEDQKPPCPRLNEVLMEAEEPEVLQDSLDRCYSTTSTYFQLHASFQQYRSAFYSFEEQD
:::: ::::::.. :.:. ::::::::::::::: :. .. : : : :.::..::.
CCDS76 EEEDQGPPCPRLSRELLEVVEPEVLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPYGSSFYALEEKH
760 770 780 790 800 810
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pF1KB8 VSLALDVDNRFFTLTVIRHHLAFQMGVIFPH
:...:::
CCDS76 VGFSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKERRRGRKEGEEDQNPPCPRLSRELLDEKGPEVLQ
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>--
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30 40 50 60 70 80
pF1KB8 PRAASHGVGRHQELRDPTVPGPTSSATNVSMVVSAGPWSGEKAEMNILEINKKSRPQLAE
:::::::::.:::::::::::. ::::::
CCDS76 MVVSAGPWSSEKAEMNILEINETLRPQLAE
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pF1KB8 NKQQFRNLKQKCLVTQVAYFLANRQNNYDYEDCKDLIKSMLRDERLLTEEKLAEELGQAE
.:::::.::.::..::.: ::::::..: ::.:::::: :::.:: . ::::::.: :::
CCDS76 KKQQFRSLKEKCFLTQLAGFLANRQKKYKYEECKDLIKFMLRNERQFKEEKLAEQLKQAE
40 50 60 70 80 90
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:::::::::::::::::::::::.::::::::: .::::::::::::.:::.::.:::::
CCDS76 ELRQYKVLVHSQERELTQLREKLREGRDASRSLYEHLQALLTPDEPDKSQGQDLQEQLAE
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:::::::::::::::::.::::::.::::::: : ::::::::::..::::::::::::
CCDS76 GCRLAQHLVQKLSPENDEDEDEDVQVEEAEKVLESSAPREVQKAEESKVPEDSLEECAIT
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::::: ::.::::. : .::::::.:.:::.
CCDS76 CSNSHGPCDSNQPHKNIKITFEEDEVNSTLVVDRESSHDECQDALNILPVPGPTSSATNV
220 230 240 250 260 270
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CCDS76 SMVVSAGPLSSEKAEMNILEINEKLRPQLAEKKQQFRNLKEKCFLTQLSGFLANQQKKYK
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pF1KB8 YEDCKDLIKSMLRDERLLTEEKLAEELGQAEELRQYKVLVHSQE-------RELTQLREK
.:...:. . ..:. ::: . .:
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pF1KB8 --LQEGRDASRSLNQHLQALLTPD--EPDNSQGRDLREQLAEGCRLAQHLVQKLSPENDD
::.. : : . : :: .: .: .:.:: : : ..: :.
CCDS76 EVLQDSLD--RCYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSLEEQYL-GLALDVDRIKK-----DQ
2910 2920 2930 2940 2950
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pF1KB8 DEDEDVKVEEAEKVQELYAPREVQKAEEKEVPEDSLEECAITCSNSHHPCESNQPYGNTR
.:.:: .. .: ::. .. : :: .:::..: : :. . .: ::::..
CCDS76 EEEED----QGPPCPRL--SRELLEVVEPEVLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPYGSSF
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pF1KB8 ITFEEDQVDSTL----IDSSSHDEWLDAVCIIPENESDH-EQEEEKGPVSPRNLQESEEE
..:: .: .: :..... . . : . . : ::...: :: .: .:
CCDS76 YALEEKHVGFSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKERRRGRKEGEEDQNPPCPRLSRELLDE
3010 3020 3030 3040 3050 3060
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pF1KB8 EAPQESWDEGDWTLSIPP---DMSASYQSDRSTFHSVEEQQVGLALDIGRHWCDQVKKED
..:. : : : : ... : : ::.:. .:.:.::::.:. . : .::
CCDS76 KGPEVLQDSLDRCYSTPSGCLELTDSCQPYRSAFYVLEQQHVGLAVDMDEIEKYQEVEED
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pF1KB8 QEATSPRLSRELLDEKEPEVLQDSLDRFYSTPFEYLELPDLCQPYRSDFYSLQEQHLGLA
:. . :::::::::::::::::::::: :::: ::::::: ::: : :::.::.::::
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::.::.:::.:::::: :::::::::: :::::: ::::::: :::: : : :::::::
CCDS76 LDVDRIKKDEEEEEDQDPPCPRLSRELLEVVEPEVLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPY
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pF1KB8 GSCFYSLEEEHVGFSLDVDEIEK-------------------YQEGEEDQKPPCPRLNEV
:: ::.:::.:::::::: :::: .::::::.::::::..
CCDS76 GSSFYALEEKHVGFSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKERRRGRKEGEEDQNPPCPRLSRE
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pF1KB8 LMEAEEPEVLQDSLDRCYSTTSTYFQLHASFQQYRSAFYSFEEQDVSLALDVDNRFFTLT
:.. . :::::::::::::: : :..: : : :::::: .:.: :.::.:.:
CCDS76 LLDEKGPEVLQDSLDRCYSTPSGYLELTDSCQPYRSAFYVLEQQHVGLAVDMDEIEKYQE
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pF1KB8 VIRHHLAFQMGVIFPH
CCDS76 VEEDQDPSCPRLSRELLDEKEPEVLQDSLDRCYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSLEEQY
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pF1KB8 YEDCKDLIKSMLRDERLLTEEKLAEELGQAEELRQYKVLVHSQE-------RELTQLREK
.:...:. . ..:. ::: . .:
CCDS76 GCLELTDSCQPYRSAFYVLEQQRVGFAVDMDEIEKYQEVEEDQDPSCPRLSRELLDEKEP
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pF1KB8 --LQEGRDASRSLNQHLQALLTPD--EPDNSQGRDLREQLAEGCRLAQHLVQKLSPENDD
::.. : : . : :: .: .: .:.:: : : :.... ....
CCDS76 EVLQDSLD--RCYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSLEEQYL-GLALD---VDRIKKDEEE
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pF1KB8 DEDEDVKVEEAEKVQELYAPREVQKAEEKEVPEDSLEECAITCSNSHHPCESNQPYGNTR
.::.: . ::. .. : :: .:::..: : :. . .: ::::..
CCDS76 EEDQDPPCPRLS--------RELLEVVEPEVLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPYGSSF
1250 1260 1270 1280 1290
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pF1KB8 ITFEEDQVDSTL----IDSSSHDEWLDAVCIIPENESDH-EQEEEKGPVSPRNLQESEEE
..:: .: .: :..... . . : . . : ::...: :: .: ::
CCDS76 YALEEKHVGFSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKERRRGRKEGEEDQNPPCPRLSRELLEE
1300 1310 1320 1330 1340 1350
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pF1KB8 EAPQESWDEGDWTLSIPP---DMSASYQSDRSTFHSVEEQQVGLALDIGRHWCDQVKKED
..:. : : : : ... : : ::.:. .:.:.::.:.:. . : .::
CCDS76 KGPEVLQDSLDRCYSTPSGCLELTDSCQPYRSAFYVLEQQRVGFAVDMDEIEKYQEVEED
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pF1KB8 QEATSPRLSRELLDEKEPEVLQDSLDRFYSTPFEYLELPDLCQPYRSDFYSLQEQHLGLA
:. . :::::::::::::::::::::: :::: ::::::: ::: : :::.::.::::
CCDS76 QDPSCPRLSRELLDEKEPEVLQDSLDRCYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSLEEQYLGLA
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::.::.:::.:::::: :::::::::: :::::: ::::::: :::: : : :::::::
CCDS76 LDVDRIKKDEEEEEDQDPPCPRLSRELLEVVEPEVLQDSLDRCYSTPSSCLEQPDSCQPY
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pF1KB8 GSCFYSLEEEHVGFSLDVDEIEK-------------------YQEGEEDQKPPCPRLNEV
:: ::.:::.:::::::: :::: .::::::.::::::..
CCDS76 GSSFYALEEKHVGFSLDVGEIEKKGKGKKRRGRRSKKERRRGRKEGEEDQNPPCPRLSRE
1540 1550 1560 1570 1580 1590
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:.. . :::::::::::::: : ..: : : :::::: .:.: :.::.:.:
CCDS76 LLDEKGPEVLQDSLDRCYSTPSGCLELTDSCQPYRSAFYVLEQQHVGLAVDMDEIEKYQE
1600 1610 1620 1630 1640 1650
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pF1KB8 VIRHHLAFQMGVIFPH
CCDS76 VEEDQDPSCPRLSRELLDEKEPEVLQDSLDRCYSTPSGYLELPDLGQPYSSAVYSLEEQY
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>--
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..:. : : : : ... : : ::.:. .:.:.::::.:. . : .::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]