Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8687
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8687, 648 aa
1>>>pF1KB8687 648 - 648 aa - 648 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1250+/-0.00101; mu= 15.4741+/- 0.060
mean_var=85.6261+/-16.780, 0's: 0 Z-trim(105.4): 79 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.138603
statistics sampled from 8307 (8391) to 8307 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.622), E-opt: 0.2 (0.258), width: 16
Scan time: 3.030
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6 ( 648) 4293 868.9 0
CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX ( 631) 2506 511.5 1.4e-144
CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1031) 1173 245.1 3.6e-64
CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1032) 1173 245.1 3.6e-64
CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 1168 244.0 4.6e-64
CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 1164 243.2 8e-64
CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 729) 1140 238.4 2.6e-62
CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 731) 1140 238.4 2.6e-62
CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17 ( 938) 1007 211.9 3.3e-54
CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 575) 932 196.8 7e-50
CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 690) 932 196.8 8.2e-50
CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 704) 932 196.8 8.3e-50
CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 724) 932 196.8 8.5e-50
CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5 ( 622) 876 185.6 1.8e-46
CCDS55404.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 646) 819 174.2 4.9e-43
CCDS43931.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 662) 819 174.2 5e-43
CCDS14782.1 DDX3Y gene_id:8653|Hs108|chrY ( 660) 818 174.0 5.7e-43
CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17 ( 599) 761 162.6 1.4e-39
CCDS30964.1 DDX59 gene_id:83479|Hs108|chr1 ( 619) 748 160.0 8.9e-39
CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17 ( 411) 730 156.3 7.6e-38
CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 455) 714 153.1 7.6e-37
CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3 ( 407) 704 151.1 2.8e-36
CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 881) 708 152.1 3.1e-36
CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 882) 708 152.1 3.1e-36
CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 406) 702 150.7 3.7e-36
CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10 ( 737) 697 149.8 1.2e-35
CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11 ( 483) 684 147.2 5.1e-35
CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20 ( 796) 686 147.7 5.9e-35
CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 715) 684 147.2 7.2e-35
CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 783) 684 147.3 7.7e-35
CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2 ( 670) 651 140.6 6.6e-33
CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19 ( 483) 616 133.6 6.4e-31
CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11 ( 875) 619 134.3 6.9e-31
CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1 ( 824) 601 130.7 8e-30
CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19 ( 427) 587 127.7 3.2e-29
CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6 ( 428) 586 127.5 3.7e-29
CCDS9251.1 DDX55 gene_id:57696|Hs108|chr12 ( 600) 521 114.6 4e-25
CCDS58511.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 347) 510 112.3 1.2e-24
CCDS8770.1 DDX23 gene_id:9416|Hs108|chr12 ( 820) 512 112.9 1.8e-24
CCDS10889.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 478) 489 108.2 2.8e-23
CCDS10888.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 479) 489 108.2 2.8e-23
CCDS44766.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 483) 487 107.8 3.7e-23
CCDS81646.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 369) 473 104.9 2.1e-22
CCDS42187.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 370) 471 104.5 2.7e-22
CCDS82009.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 447) 429 96.1 1.1e-19
CCDS32475.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 448) 429 96.1 1.1e-19
CCDS58478.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 453) 429 96.2 1.1e-19
CCDS6952.1 DDX31 gene_id:64794|Hs108|chr9 ( 585) 370 84.4 4.8e-16
>>CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6 (648 aa)
initn: 4293 init1: 4293 opt: 4293 Z-score: 4640.4 bits: 868.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4293; 99.5% identity (99.8% similar) in 648 aa overlap (1-648:1-648)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSHHGGAPKASTWVVASRRSSTVSRAPERRPAEELNRTGPEGYSVGRGGRWRGTSRPPEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 MSHHGGAPKASTWVVASRRSSTVSRAPERRPAEELNRTGPEGYSVGRGGRWRGTSRPPEA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 VAAGHEELPLCFALKSHFVGAVIGRGGSKIKNIQSTTNTTIQIIQEQPESLVKIFGSKAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 VAAGHEELPLCFALKSHFVGAVIGRGGSKIKNIQSTTNTTIQIIQEQPESLVKIFGSKAM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 QTKAKAVIDNFVKKLEENYNSECGIDTAFQPSVGKDGSTDNNVVAGDRPLIDWDQIREEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 QTKAKAVIDNFVKKLEENYNSECGIDTAFQPSVGKDGSTDNNVVAGDRPLIDWDQIREEG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 LKWQKTKWADLPPIKKNFYKESTATSAMSKVEADSWRKENFNITWDDLKDGEKRPIPNPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 LKWQKTKWADLPPIKKNFYKESTATSAMSKVEADSWRKENFNITWDDLKDGEKRPIPNPT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 CTFDDAFQCYPEVMENIKKAGFQKPTPIQSQAWPIVLQGIDLIGVAQTGTGKTLCYLMPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 CTFDDAFQCYPEVMENIKKAGFQKPTPIQSQAWPIVLQGIDLIGVAQTGTGKTLCYLMPG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 FIHLVLQPSLKGQRNRPGMLVLTPTRELALQVEGECCKYSYKGLRSVCVYGGGNGDEQIE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS49 FIHLVLQPSLKGQRNRPGMLVLTPTRELALQVEGECCKYSYKGLRSVCVYGGGNRDEQIE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 ELKKGVDIIIATPGRLNDLQMSNFVNLKNITYLVLDEADKMLDMGFEPQIMKILLDVRPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 ELKKGVDIIIATPGRLNDLQMSNFVNLKNITYLVLDEADKMLDMGFEPQIMKILLDVRPD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 RQTVMTSATWPHSVHRLAQSYLKEPMIVYVGTLDLVAVSSVKQNIIVTTEEEKWSHMQTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 RQTVMTSATWPHSVHRLAQSYLKEPMIVYVGTLDLVAVSSVKQNIIVTTEEEKWSHMQTF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 LQSMSSTDKVIVFVSRKAVADHLSSDLILGNISVESLHGDREQRDREKALENFKTGKVRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 LQSMSSTDKVIVFVSRKAVADHLSSDLILGNISVESLHGDREQRDREKALENFKTGKVRI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 LIATDLASRGLDVHDVTHVYNFDFPRNIEEYVHRIGRTGRAGRTGVSITTLTRNDWRVAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 LIATDLASRGLDVHDVTHVYNFDFPRNIEEYVHRIGRTGRAGRTGVSITTLTRNDWRVAS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KB8 ELINILERANQSIPEELVSMAERFEAHQRKREMERKMERPQGRPKKFH
::::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::::::::::::
CCDS49 ELINILERANQSIPEELVSMAERFKAHQQKREMERKMERPQGRPKKFH
610 620 630 640
>>CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX (631 aa)
initn: 2523 init1: 2208 opt: 2506 Z-score: 2709.4 bits: 511.5 E(32554): 1.4e-144
Smith-Waterman score: 2506; 61.3% identity (83.9% similar) in 626 aa overlap (26-648:5-628)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSHHGGAPKASTWVVASRRSSTVSRAPERRPAEELNRTGPEGYSV--GRGGRWRGTSRPP
::: . :: : ...: .::. : :
CCDS35 MSHWAPEWKRAEANPRDLGASWDVRGSRGSGWSGPFGHQ
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 EAVAAGHEELPLCFALKSHFVGAVIGRGGSKIKNIQSTTNTTIQIIQEQPESLVKIFGSK
::: .: :::: .:...::.::: .:::::..: .::: ::::. . :. :.:::..
CCDS35 GPRAAGSREPPLCFKIKNNMVGVVIGYSGSKIKDLQHSTNTKIQIINGESEAKVRIFGNR
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 AMQTKAKAVIDNFVKKLEENYNSECGIDTAF-QPSVGKDGSTDNNVVAGDRPLIDWDQIR
:..::::.:.....: .:.:::: ..:.: : .:.. . :..:. .:: .::.::
CCDS35 EMKAKAKAAIETLIRK-QESYNSESSVDNAASQTPIGRNLGR-NDIVGEAEPLSNWDRIR
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 EEGLKWQKTKWADLPPIKKNFYKESTATSAMSKVEADSWRKENFNITWDDLKDGEKRPIP
.. .: :::::::.::::: :: ::: ::.... .::::::::: ::::.:::: ::
CCDS35 AAVVECEKRKWADLPPVKKNFYIESKATSCMSEMQVINWRKENFNITCDDLKSGEKRLIP
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 NPTCTFDDAFQCYPEVMENIKKAGFQKPTPIQSQAWPIVLQGIDLIGVAQTGTGKTLCYL
.::: : :::: ::.....: ..:. ::::::::::::.::::::: :::::::::: ::
CCDS35 KPTCRFKDAFQQYPDLLKSIIRVGIVKPTPIQSQAWPIILQGIDLIVVAQTGTGKTLSYL
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 MPGFIHLVLQPSLKGQRNRPGMLVLTPTRELALQVEGECCKYSYKGLRSVCVYGGGNGDE
::::::: :: . ::: ::::::::::::::.::.:: :::::::.:.:.::: : .
CCDS35 MPGFIHLDSQPISREQRNGPGMLVLTPTRELALHVEAECSKYSYKGLKSICIYGGRNRNG
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 QIEELKKGVDIIIATPGRLNDLQMSNFVNLKNITYLVLDEADKMLDMGFEPQIMKILLDV
:::...::::::::::::::::::.: :::..:::::.::::::::: ::::: ::::::
CCDS35 QIEDISKGVDIIIATPGRLNDLQMNNSVNLRSITYLVIDEADKMLDMEFEPQIRKILLDV
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 RPDRQTVMTSATWPHSVHRLAQSYLKEPMIVYVGTLDLVAVSSVKQNIIVTTEEEKWSHM
:::::::::::::: .:..:: ::::.:::::::.:.::::..::::::::::.:: .
CCDS35 RPDRQTVMTSATWPDTVRQLALSYLKDPMIVYVGNLNLVAVNTVKQNIIVTTEKEKRALT
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 QTFLQSMSSTDKVIVFVSRKAVADHLSSDLILGNISVESLHGDREQRDREKALENFKTGK
: :...:: .::::.:::.: .:: ::::. . .::.:::::. :: :.:.:.:.::.:.
CCDS35 QEFVENMSPNDKVIMFVSQKHIADDLSSDFNIQGISAESLHGNSEQSDQERAVEDFKSGN
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 VRILIATDLASRGLDVHDVTHVYNFDFPRNIEEYVHRIGRTGRAGRTGVSITTLTRNDWR
..:::.::..:::::..:::::::.::::::. ::::.: ::.:.::.:.: .:. : .
CCDS35 IKILITTDIVSRGLDLNDVTHVYNYDFPRNIDVYVHRVGYIGRTGKTGTSVTLITQRDSK
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640
pF1KB8 VASELINILERANQSIPEELVSMAERFEAHQRKREMERKMERPQGRPKKFH
.:.:::.::.:::::.::.:: :::... .:.::. : . ..: : :.:.
CCDS35 MAGELIKILDRANQSVPEDLVVMAEQYKLNQQKRHRETRSRKPGQRRKEFYFLS
580 590 600 610 620 630
>>CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1031 aa)
initn: 805 init1: 376 opt: 1173 Z-score: 1265.6 bits: 245.1 E(32554): 3.6e-64
Smith-Waterman score: 1173; 42.2% identity (71.6% similar) in 462 aa overlap (193-647:330-780)
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 VVAGDRPLIDWDQIREEGLKWQKTKWADLPPIKKNFYKESTATSAMSKVEADSWRKENFN
:..:::: : . ::. :.. .: : .
CCDS34 EVDLQTALTGYQTKQRKLLEPVDHGKIEYEPFRKNFYVEVPELAKMSQEEVNVFRLEMEG
300 310 320 330 340 350
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 ITWDDLKDGEKRPIPNPTCTFDDAFQC--YPEVMENIKKAGFQKPTPIQSQAWPIVLQGI
:: .: . :.: .. :: ......:: :..::::::.:: : ...:
CCDS34 IT---VKG---KGCPKPIKSW---VQCGISMKILNSLKKHGYEKPTPIQTQAIPAIMSGR
360 370 380 390 400 410
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 DLIGVAQTGTGKTLCYLMPGFIHLVLQPSLKGQRNRPGMLVLTPTRELALQVEGECCKYS
::::.:.::.:::. .:.: : :.. : ::. . . : ...:::::::::. :: :.:
CCDS34 DLIGIAKTGSGKTIAFLLPMFRHIMDQRSLE-EGEGPIAVIMTPTRELALQITKECKKFS
420 430 440 450 460
350 360 370 380 390
pF1KB8 YK-GLRSVCVYGGGNGDEQIEELKKGVDIIIATPGRLNDLQMSN---FVNLKNITYLVLD
::: :::::: . .::: :::.:..::. ::::. :. .: .::. .::.:::
CCDS34 KTLGLRVVCVYGGTGISEQIAELKRGAEIIVCTPGRMIDMLAANSGRVTNLRRVTYVVLD
470 480 490 500 510 520
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 EADKMLDMGFEPQIMKILLDVRPDRQTVMTSATWPHSVHRLAQSYLKEPMIVYVGTLDLV
:::.:.:::::::.:.:. .::::::::: :::.:.... ::. :..:. : :: ..:
CCDS34 EADRMFDMGFEPQVMRIVDNVRPDRQTVMFSATFPRAMEALARRILSKPIEVQVGGRSVV
530 540 550 560 570 580
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 AVSSVKQNIIVTTEEEKWSHMQTFLQSMSSTDKVIVFVSRKAVADHLSSDLILGNISVES
:.:.:..:: ::.:. .. .: .. . .::.::... :: : .::. .. :
CCDS34 C-SDVEQQVIVIEEEKKFLKLLELLGHYQESGSVIIFVDKQEHADGLLKDLMRASYPCMS
590 600 610 620 630 640
520 530 540 550 560 570
pF1KB8 LHGDREQRDREKALENFKTGKVRILIATDLASRGLDVHDVTHVYNFDFPRNIEEYVHRIG
::: .: ::.. ...::.: ..:.::..:.:::::. . : :.. : . :.:::: :
CCDS34 LHGGIDQYDRDSIINDFKNGTCKLLVATSVAARGLDVKHLILVVNYSCPNHYEDYVHRAG
650 660 670 680 690 700
580 590 600 610 620 630
pF1KB8 RTGRAGRTGVSITTLTRNDWRVASELINILERANQSIPEELVSMAERFEAHQRKR-EMER
:::::: : . : .:... : :...:. :: .. ..: .: .. :. .:. . .. .
CCDS34 RTGRAGNKGYAYTFITEDQARYAGDIIKALELSGTAVPPDLEKLWSDFKDQQKAEGKIIK
710 720 730 740 750 760
640
pF1KB8 KMERPQGRPKKFH
: .:. ::
CCDS34 KSSGFSGKGFKFDETEQALANERKKLQKAALGLQDSDDEDAAVDIDEQIESMFNSKKRVK
770 780 790 800 810 820
>>CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1032 aa)
initn: 805 init1: 376 opt: 1173 Z-score: 1265.6 bits: 245.1 E(32554): 3.6e-64
Smith-Waterman score: 1173; 42.2% identity (71.6% similar) in 462 aa overlap (193-647:330-780)
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 VVAGDRPLIDWDQIREEGLKWQKTKWADLPPIKKNFYKESTATSAMSKVEADSWRKENFN
:..:::: : . ::. :.. .: : .
CCDS75 EVDLQTALTGYQTKQRKLLEPVDHGKIEYEPFRKNFYVEVPELAKMSQEEVNVFRLEMEG
300 310 320 330 340 350
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 ITWDDLKDGEKRPIPNPTCTFDDAFQC--YPEVMENIKKAGFQKPTPIQSQAWPIVLQGI
:: .: . :.: .. :: ......:: :..::::::.:: : ...:
CCDS75 IT---VKG---KGCPKPIKSW---VQCGISMKILNSLKKHGYEKPTPIQTQAIPAIMSGR
360 370 380 390 400 410
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 DLIGVAQTGTGKTLCYLMPGFIHLVLQPSLKGQRNRPGMLVLTPTRELALQVEGECCKYS
::::.:.::.:::. .:.: : :.. : ::. . . : ...:::::::::. :: :.:
CCDS75 DLIGIAKTGSGKTIAFLLPMFRHIMDQRSLE-EGEGPIAVIMTPTRELALQITKECKKFS
420 430 440 450 460
350 360 370 380 390
pF1KB8 YK-GLRSVCVYGGGNGDEQIEELKKGVDIIIATPGRLNDLQMSN---FVNLKNITYLVLD
::: :::::: . .::: :::.:..::. ::::. :. .: .::. .::.:::
CCDS75 KTLGLRVVCVYGGTGISEQIAELKRGAEIIVCTPGRMIDMLAANSGRVTNLRRVTYVVLD
470 480 490 500 510 520
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 EADKMLDMGFEPQIMKILLDVRPDRQTVMTSATWPHSVHRLAQSYLKEPMIVYVGTLDLV
:::.:.:::::::.:.:. .::::::::: :::.:.... ::. :..:. : :: ..:
CCDS75 EADRMFDMGFEPQVMRIVDNVRPDRQTVMFSATFPRAMEALARRILSKPIEVQVGGRSVV
530 540 550 560 570 580
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 AVSSVKQNIIVTTEEEKWSHMQTFLQSMSSTDKVIVFVSRKAVADHLSSDLILGNISVES
:.:.:..:: ::.:. .. .: .. . .::.::... :: : .::. .. :
CCDS75 C-SDVEQQVIVIEEEKKFLKLLELLGHYQESGSVIIFVDKQEHADGLLKDLMRASYPCMS
590 600 610 620 630 640
520 530 540 550 560 570
pF1KB8 LHGDREQRDREKALENFKTGKVRILIATDLASRGLDVHDVTHVYNFDFPRNIEEYVHRIG
::: .: ::.. ...::.: ..:.::..:.:::::. . : :.. : . :.:::: :
CCDS75 LHGGIDQYDRDSIINDFKNGTCKLLVATSVAARGLDVKHLILVVNYSCPNHYEDYVHRAG
650 660 670 680 690 700
580 590 600 610 620 630
pF1KB8 RTGRAGRTGVSITTLTRNDWRVASELINILERANQSIPEELVSMAERFEAHQRKR-EMER
:::::: : . : .:... : :...:. :: .. ..: .: .. :. .:. . .. .
CCDS75 RTGRAGNKGYAYTFITEDQARYAGDIIKALELSGTAVPPDLEKLWSDFKDQQKAEGKIIK
710 720 730 740 750 760
640
pF1KB8 KMERPQGRPKKFH
: .:. ::
CCDS75 KSSGFSGKGFKFDETEQALANERKKLQKAALGLQDSDDEDAAVDIDEQIESMFNSKKRVK
770 780 790 800 810 820
>>CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 (614 aa)
initn: 1035 init1: 631 opt: 1168 Z-score: 1263.6 bits: 244.0 E(32554): 4.6e-64
Smith-Waterman score: 1168; 42.1% identity (71.0% similar) in 489 aa overlap (154-631:11-486)
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 AKAVIDNFVKKLEENYNSECGIDTAFQPSVGKDGSTDNNVVAGDR--PLIDWDQIREEGL
:.: . .:.: :: . .. . :
CCDS11 MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPL-SGKKFGNPGE
10 20 30
190 200 210 220 230
pF1KB8 KWQKTKWA--DLPPIKKNFYKESTATSAMSKVEADSWRKENFNITWDDLKDGEKRPIPNP
: : :: .:: ..::::.: . . :....:. . .:: :.. :.:
CCDS11 KLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQEVETYRRSK-EITVR----GHN--CPKP
40 50 60 70 80 90
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 TCTFDDAFQCYP-EVMENIKKAGFQKPTPIQSQAWPIVLQGIDLIGVAQTGTGKTLCYLM
. .: .: .: .::. : . .: .:: ::.:.::..:.:.:..::::::.:::: ::.
CCDS11 VLNFYEA--NFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLL
100 110 120 130 140 150
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 PGFIHLVLQPSLKGQRNRPGMLVLTPTRELALQVE---GECCKYSYKGLRSVCVYGGGNG
:...:. :: :. . . : :::.:::::: ::. .: :. :.:.:.:::.
CCDS11 PAIVHINHQPFLE-RGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACR--LKSTCIYGGAPK
160 170 180 190 200
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 DEQIEELKKGVDIIIATPGRLNDLQMSNFVNLKNITYLVLDEADKMLDMGFEPQIMKILL
::..:..::.: ::::::: :. . .::. :::::::::.:::::::::: ::.
CCDS11 GPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVD
210 220 230 240 250 260
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 DVRPDRQTVMTSATWPHSVHRLAQSYLKEPMIVYVGTLDLVAVSSVKQNIIVTTEEEKWS
..::::::.: :::::. :..::...::. . . .:.:.: : .. : . : . ::
CCDS11 QIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDE
270 280 290 300 310 320
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 HMQTFLQSMSST--DKVIVFVSRKAVADHLSSDLILGNISVESLHGDREQRDREKALENF
.. ... . : .:.:::: : :.:. . . . ..:::. :..:. .:..:
CCDS11 KLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEF
330 340 350 360 370 380
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 KTGKVRILIATDLASRGLDVHDVTHVYNFDFPRNIEEYVHRIGRTGRAGRTGVSITTLTR
: ::. ::::::.:::::::.:: : :.:.: . :.:.::::::.:. .::.. : .:
CCDS11 KHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTP
390 400 410 420 430 440
600 610 620 630 640
pF1KB8 NDWRVASELINILERANQSIPEELVSMAE-RFEAHQRKREMERKMERPQGRPKKFH
:. . .:.::..:..:::.: .:....: : ...: :
CCDS11 NNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNT
450 460 470 480 490 500
CCDS11 FRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAANYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTY
510 520 530 540 550 560
>>CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 (614 aa)
initn: 1035 init1: 631 opt: 1164 Z-score: 1259.3 bits: 243.2 E(32554): 8e-64
Smith-Waterman score: 1164; 43.4% identity (72.2% similar) in 461 aa overlap (180-631:38-486)
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 QPSVGKDGSTDNNVVAGDRPLIDWDQIREEGLKWQKTKWA--DLPPIKKNFYKESTATSA
: : : :: .:: ..::::.: .
CCDS82 ADEGTSVRFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLAR
10 20 30 40 50 60
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 MSKVEADSWRKENFNITWDDLKDGEKRPIPNPTCTFDDAFQCYP-EVMENIKKAGFQKPT
. :....:. . .:: :.. :.:. .: .: .: .::. : . .: .::
CCDS82 RTAQEVETYRRSK-EIT----VRGHN--CPKPVLNFYEA--NFPANVMDVIARQNFTEPT
70 80 90 100 110
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 PIQSQAWPIVLQGIDLIGVAQTGTGKTLCYLMPGFIHLVLQPSLKGQRNRPGMLVLTPTR
::.:.::..:.:.:..::::::.:::: ::.:...:. :: :. . . : :::.:::
CCDS82 AIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLE-RGDGPICLVLAPTR
120 130 140 150 160 170
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 ELALQVE---GECCKYSYKGLRSVCVYGGGNGDEQIEELKKGVDIIIATPGRLNDLQMSN
::: ::. .: :. :.:.:.:::. ::..:..::.: ::::::: :. .
CCDS82 ELAQQVQQVAAEYCRACR--LKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECG
180 190 200 210 220 230
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 FVNLKNITYLVLDEADKMLDMGFEPQIMKILLDVRPDRQTVMTSATWPHSVHRLAQSYLK
.::. :::::::::.:::::::::: ::. ..::::::.: :::::. :..::...::
CCDS82 KTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLK
240 250 260 270 280 290
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 EPMIVYVGTLDLVAVSSVKQNIIVTTEEEKWSHMQTFLQSMSST--DKVIVFVSRKAVAD
. . . .:.:.: : .. : . : . :: .. ... . : .:.:::: : :
CCDS82 DYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCD
300 310 320 330 340 350
510 520 530 540 550 560
pF1KB8 HLSSDLILGNISVESLHGDREQRDREKALENFKTGKVRILIATDLASRGLDVHDVTHVYN
.:. . . . ..:::. :..:. .:..:: ::. ::::::.:::::::.:: : :
CCDS82 ELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVIN
360 370 380 390 400 410
570 580 590 600 610 620
pF1KB8 FDFPRNIEEYVHRIGRTGRAGRTGVSITTLTRNDWRVASELINILERANQSIPEELVSMA
.:.: . :.:.::::::.:. .::.. : .: :. . .:.::..:..:::.: .:....
CCDS82 YDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLV
420 430 440 450 460 470
630 640
pF1KB8 E-RFEAHQRKREMERKMERPQGRPKKFH
: : ...: :
CCDS82 EDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVY
480 490 500 510 520 530
>>CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 (729 aa)
initn: 1008 init1: 615 opt: 1140 Z-score: 1232.2 bits: 238.4 E(32554): 2.6e-62
Smith-Waterman score: 1140; 42.7% identity (70.7% similar) in 454 aa overlap (180-622:114-553)
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 QPSVGKDGSTDNNVVAGDRPLIDWDQIREEGLKWQKTKW--ADLPPIKKNFYKESTATSA
: . .: :: ..:: ..:::: : ..
CCDS33 GFGDRDRDRDRGGFGARGGGGLPPKKFGNPGERLRKKKWDLSELPKFEKNFYVEHPEVAR
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 MSKVEADSWRKENFNITWDDLKDGEKRPIPNPTCTFDDAFQCYPE-VMENIKKAGFQKPT
.. :.: :... .:: .. :. :.:. .: : .:. ::. . : .::
CCDS33 LTPYEVDELRRKK-EIT---VRGGD--VCPKPVFAFHHA--NFPQYVMDVLMDQHFTEPT
150 160 170 180 190
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 PIQSQAWPIVLQGIDLIGVAQTGTGKTLCYLMPGFIHLVLQPSLKGQRNRPGMLVLTPTR
::: :..:..:.: :..:.::::.:::: ::.:...:. :: :. . . : :::.:::
CCDS33 PIQCQGFPLALSGRDMVGIAQTGSGKTLAYLLPAIVHINHQPYLE-RGDGPICLVLAPTR
200 210 220 230 240 250
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 ELALQVE------GECCKYSYKGLRSVCVYGGGNGDEQIEELKKGVDIIIATPGRLNDLQ
::: ::. :.: . :.:.:.:::. ::..:..::.: ::::::: :.
CCDS33 ELAQQVQQVADDYGKCSR-----LKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFL
260 270 280 290 300
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 MSNFVNLKNITYLVLDEADKMLDMGFEPQIMKILLDVRPDRQTVMTSATWPHSVHRLAQS
:. .::. :::::::::.:::::::::: ::. ..::::::.: :::::. :..::..
CCDS33 ESGKTNLRRCTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAED
310 320 330 340 350 360
450 460 470 480 490
pF1KB8 YLKEPMIVYVGTLDLVAVSSVKQNIIVTTEEEKWSHMQTFLQSMSST--DKVIVFVSRKA
.:.. . ::.:.: : .. : . : : :: .. ... . . .:.:.:: :
CCDS33 FLRDYTQINVGNLELSANHNILQIVDVCMESEKDHKLIQLMEEIMAEKENKTIIFVETKR
370 380 390 400 410 420
500 510 520 530 540 550
pF1KB8 VADHLSSDLILGNISVESLHGDREQRDREKALENFKTGKVRILIATDLASRGLDVHDVTH
: :. . . . .:::. : .:. .:..:..::. ::::::.:::::::.::
CCDS33 RCDDLTRRMRRDGWPAMCIHGDKSQPERDWVLNEFRSGKAPILIATDVASRGLDVEDVKF
430 440 450 460 470 480
560 570 580 590 600 610
pF1KB8 VYNFDFPRNIEEYVHRIGRTGRAGRTGVSITTLTRNDWRVASELINILERANQSIPEELV
: :.:.: . :.::::::::.:. :.. : .: .. . : :::..::.:::.: .:.
CCDS33 VINYDYPNSSEDYVHRIGRTARSTNKGTAYTFFTPGNLKQARELIKVLEEANQAINPKLM
490 500 510 520 530 540
620 630 640
pF1KB8 SMAERFEAHQRKREMERKMERPQGRPKKFH
....
CCDS33 QLVDHRGGGGGGGGRSRYRTTSSANNPNLMYQDECDRRLRGVKDGGRRDSASYRDRSETD
550 560 570 580 590 600
>>CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 (731 aa)
initn: 1008 init1: 615 opt: 1140 Z-score: 1232.2 bits: 238.4 E(32554): 2.6e-62
Smith-Waterman score: 1140; 42.7% identity (70.7% similar) in 454 aa overlap (180-622:114-553)
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 QPSVGKDGSTDNNVVAGDRPLIDWDQIREEGLKWQKTKW--ADLPPIKKNFYKESTATSA
: . .: :: ..:: ..:::: : ..
CCDS46 GFGDRDRDRDRGGFGARGGGGLPPKKFGNPGERLRKKKWDLSELPKFEKNFYVEHPEVAR
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 MSKVEADSWRKENFNITWDDLKDGEKRPIPNPTCTFDDAFQCYPE-VMENIKKAGFQKPT
.. :.: :... .:: .. :. :.:. .: : .:. ::. . : .::
CCDS46 LTPYEVDELRRKK-EIT---VRGGD--VCPKPVFAFHHA--NFPQYVMDVLMDQHFTEPT
150 160 170 180 190
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 PIQSQAWPIVLQGIDLIGVAQTGTGKTLCYLMPGFIHLVLQPSLKGQRNRPGMLVLTPTR
::: :..:..:.: :..:.::::.:::: ::.:...:. :: :. . . : :::.:::
CCDS46 PIQCQGFPLALSGRDMVGIAQTGSGKTLAYLLPAIVHINHQPYLE-RGDGPICLVLAPTR
200 210 220 230 240 250
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 ELALQVE------GECCKYSYKGLRSVCVYGGGNGDEQIEELKKGVDIIIATPGRLNDLQ
::: ::. :.: . :.:.:.:::. ::..:..::.: ::::::: :.
CCDS46 ELAQQVQQVADDYGKCSR-----LKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFL
260 270 280 290 300
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 MSNFVNLKNITYLVLDEADKMLDMGFEPQIMKILLDVRPDRQTVMTSATWPHSVHRLAQS
:. .::. :::::::::.:::::::::: ::. ..::::::.: :::::. :..::..
CCDS46 ESGKTNLRRCTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAED
310 320 330 340 350 360
450 460 470 480 490
pF1KB8 YLKEPMIVYVGTLDLVAVSSVKQNIIVTTEEEKWSHMQTFLQSMSST--DKVIVFVSRKA
.:.. . ::.:.: : .. : . : : :: .. ... . . .:.:.:: :
CCDS46 FLRDYTQINVGNLELSANHNILQIVDVCMESEKDHKLIQLMEEIMAEKENKTIIFVETKR
370 380 390 400 410 420
500 510 520 530 540 550
pF1KB8 VADHLSSDLILGNISVESLHGDREQRDREKALENFKTGKVRILIATDLASRGLDVHDVTH
: :. . . . .:::. : .:. .:..:..::. ::::::.:::::::.::
CCDS46 RCDDLTRRMRRDGWPAMCIHGDKSQPERDWVLNEFRSGKAPILIATDVASRGLDVEDVKF
430 440 450 460 470 480
560 570 580 590 600 610
pF1KB8 VYNFDFPRNIEEYVHRIGRTGRAGRTGVSITTLTRNDWRVASELINILERANQSIPEELV
: :.:.: . :.::::::::.:. :.. : .: .. . : :::..::.:::.: .:.
CCDS46 VINYDYPNSSEDYVHRIGRTARSTNKGTAYTFFTPGNLKQARELIKVLEEANQAINPKLM
490 500 510 520 530 540
620 630 640
pF1KB8 SMAERFEAHQRKREMERKMERPQGRPKKFH
....
CCDS46 QLVDHRGGGGGGGKGGRSRYRTTSSANNPNLMYQDECDRRLRGVKDGGRRDSASYRDRSE
550 560 570 580 590 600
>>CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17 (938 aa)
initn: 981 init1: 839 opt: 1007 Z-score: 1086.8 bits: 211.9 E(32554): 3.3e-54
Smith-Waterman score: 1011; 37.2% identity (66.4% similar) in 476 aa overlap (159-631:185-642)
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 DNFVKKLEENYNSECGIDTAFQPSVGKDGSTDNNVVAGDRPLIDWDQIREEGLKWQKTKW
.:.: .: . .:: : .
CCDS32 DDQEAYFRYMAENPTAGVVQEEEEDNLEYDSDGNPIAPTKKIID-------PLPPIDHSE
160 170 180 190 200
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 ADLPPIKKNFYKESTATSAMSKVE-ADSWRKENFNITWDDLKDGEKRPIPNPTCTFDDAF
: ::..::::.: . .. . : .: :. .. : : : : .: :
CCDS32 IDYPPFEKNFYNEHEEITNLTPQQLIDLRHKLNLRVS------GAA-P-PRPGSSFAH-F
210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 QCYPEVMENIKKAGFQKPTPIQSQAWPIVLQGIDLIGVAQTGTGKTLCYLMPGFIHLVLQ
..:..:.:. . .::::: :. :..:.: :.::.:.::.::: .. : .::.. :
CCDS32 GFDEQLMHQIRKSEYTQPTPIQCQGVPVALSGRDMIGIAKTGSGKTAAFIWPMLIHIMDQ
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 PSLKGQRNRPGMLVLTPTRELALQVEGECCKYSYK-GLRSVCVYGGGNGDEQIEELKKGV
:. . : ... ::::: :...:: ... .:::: :::::. :: . :..:.
CCDS32 KELE-PGDGPIAVIVCPTRELCQQIHAECKRFGKAYNLRSVAVYGGGSMWEQAKALQEGA
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 DIIIATPGRLNDLQMSNFVNLKNITYLVLDEADKMLDMGFEPQIMKILLDVRPDRQTVMT
.:.. ::::: : .. .::. ..:::.::::.:.::::: :. .: :::::::..
CCDS32 EIVVCTPGRLIDHVKKKATNLQRVSYLVFDEADRMFDMGFEYQVRSIASHVRPDRQTLLF
380 390 400 410 420 430
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 SATWPHSVHRLAQSYLKEPMIVYVGTLDLVAVSSVKQNI-IVTTEEEKWSHMQTFLQSMS
:::. .....::.. : .:. : : . : .: : . :. . ::. . : ..
CCDS32 SATFRKKIEKLARDILIDPIRVVQGDIGE-ANEDVTQIVEILHSGPSKWNWLTRRLVEFT
440 450 460 470 480 490
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 STDKVIVFVSRKAVADHLSSDLILGNISVESLHGDREQRDREKALENFKTGKVRILIATD
:. .:..::..:: :..:...: . .. :::: .: .:.:.. .:: . .:.:::
CCDS32 SSGSVLLFVTKKANAEELANNLKQEGHNLGLLHGDMDQSERNKVISDFKKKDIPVLVATD
500 510 520 530 540 550
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 LASRGLDVHDVTHVYNFDFPRNIEEYVHRIGRTGRAGRTGVSITTLTRNDWRVASELINI
.:.::::. .. : :.: :.:. ..::::::::::. ::. : :: .: :..:.
CCDS32 VAARGLDIPSIKTVINYDVARDIDTHTHRIGRTGRAGEKGVAYTLLTPKDSNFAGDLVRN
560 570 580 590 600 610
610 620 630 640
pF1KB8 LERANQSIPEELVSMAERFEAHQRKREMERKMERPQGRPKKFH
:: ::: . .::...: . ...:
CCDS32 LEGANQHVSKELLDLAMQNAWFRKSRFKGGKGKKLNIGGGGLGYRERPGLGSENMDRGNN
620 630 640 650 660 670
>>CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 (575 aa)
initn: 844 init1: 364 opt: 932 Z-score: 1009.0 bits: 196.8 E(32554): 7e-50
Smith-Waterman score: 932; 40.4% identity (71.2% similar) in 396 aa overlap (237-621:135-526)
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 AMSKVEADSWRKENFNITWDDLKDGEKRPIPNPTCTFDDAFQCYPEVMENIKKAGFQKPT
: ::..: : . .:: :::. : :
CCDS54 DEDSIFAHYQTGINFDKYDTILVEVSGHDAPPAILTFEEANLCQT-LNNNIAKAGYTKLT
110 120 130 140 150 160
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 PIQSQAWPIVLQGIDLIGVAQTGTGKTLCYLMPGFIHLVLQPSLKGQR----NRPGMLVL
:.:. . ::.: : ::.. ::::.::: .:.: . :. .. .. ..: ..: ...
CCDS54 PVQKYSIPIILAGRDLMACAQTGSGKTAAFLLPILAHM-MHDGITASRFKELQEPECIIV
170 180 190 200 210 220
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 TPTRELALQVEGECCKYSYKG-LRSVCVYGGGNGDEQIEELKKGVDIIIATPGRLNDLQM
.:::::. :. : :.:. .:.: .::: . ..:... .: .:. :::::: :.
CCDS54 APTRELVNQIYLEARKFSFGTCVRAVVIYGGTQLGHSIRQIVQGCNILCATPGRLMDIIG
230 240 250 260 270 280
390 400 410 420 430
pF1KB8 SNFVNLKNITYLVLDEADKMLDMGFEPQIMKIL----LDVRPDRQTVMTSATWPHSVHRL
.. ..::.: ::::::::.:::::: :.. :.. . . .:::.: :::.:. ..::
CCDS54 KEKIGLKQIKYLVLDEADRMLDMGFGPEMKKLISCPGMPSKEQRQTLMFSATFPEEIQRL
290 300 310 320 330 340
440 450 460 470 480 490
pF1KB8 AQSYLKEP-MIVYVGTLDLVAVSSVKQNIIVTTEEEKWSHMQTFLQSMSSTDKVIVFVSR
: .:: ..: :: . : .:.:... . . : .. .:..... ....:::
CCDS54 AAEFLKSNYLFVAVGQVGG-ACRDVQQTVLQVGQFSKREKLVEILRNIGD-ERTMVFVET
350 360 370 380 390 400
500 510 520 530 540 550
pF1KB8 KAVADHLSSDLILGNISVESLHGDREQRDREKALENFKTGKVRILIATDLASRGLDVHDV
: :: ... : .::. :.:::::::.::.:: .:. :: .:.::..:.::::...:
CCDS54 KKKADFIATFLCQEKISTTSIHGDREQREREQALGDFRFGKCPVLVATSVAARGLDIENV
410 420 430 440 450 460
560 570 580 590 600 610
pF1KB8 THVYNFDFPRNIEEYVHRIGRTGRAGRTGVSITTLT-RNDWRVASELINILERANQSIPE
:: :::.: .:.::::::::::: : :: .:. . ..: ..:. :...: :.:..:
CCDS54 QHVINFDLPSTIDEYVHRIGRTGRCGNTGRAISFFDLESDNHLAQPLVKVLTDAQQDVPA
470 480 490 500 510 520
620 630 640
pF1KB8 ELVSMAERFEAHQRKREMERKMERPQGRPKKFH
: .:
CCDS54 WLEEIAFSTYIPGFSGSTRGNVFASVDTRKGKSTLNTAGFSSSQAPNPVDDESWD
530 540 550 560 570
648 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 14:34:58 2016 done: Fri Nov 4 14:34:58 2016
Total Scan time: 3.030 Total Display time: 0.120
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]