Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8691
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8691, 693 aa
1>>>pF1KB8691 693 - 693 aa - 693 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.2516+/-0.000959; mu= 0.3060+/- 0.059
mean_var=328.2644+/-66.859, 0's: 0 Z-trim(115.7): 30 B-trim: 11 in 1/52
Lambda= 0.070788
statistics sampled from 16272 (16299) to 16272 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.773), E-opt: 0.2 (0.501), width: 16
Scan time: 4.510
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14350.1 TSPYL2 gene_id:64061|Hs108|chrX ( 693) 4744 498.3 1.5e-140
CCDS5106.1 TSPYL4 gene_id:23270|Hs108|chr6 ( 414) 893 104.8 2.6e-22
CCDS42682.1 TSPYL6 gene_id:388951|Hs108|chr2 ( 410) 838 99.2 1.3e-20
CCDS34518.1 TSPYL1 gene_id:7259|Hs108|chr6 ( 437) 745 89.7 9.6e-18
CCDS34927.1 TSPYL5 gene_id:85453|Hs108|chr8 ( 417) 672 82.3 1.6e-15
CCDS48202.1 TSPY4 gene_id:728395|Hs108|chrY ( 314) 583 73.1 7.2e-13
CCDS48204.1 TSPY3 gene_id:728137|Hs108|chrY ( 308) 581 72.8 8.2e-13
CCDS65365.1 TSPY10 gene_id:100289087|Hs108|chrY ( 308) 581 72.8 8.2e-13
CCDS59533.1 TSPY8 gene_id:728403|Hs108|chrY ( 308) 581 72.8 8.2e-13
CCDS35465.1 TSPY2 gene_id:64591|Hs108|chrY ( 308) 580 72.7 8.8e-13
CCDS48205.1 TSPY1 gene_id:7258|Hs108|chrY ( 308) 568 71.5 2.1e-12
CCDS83519.1 TSPY10 gene_id:100289087|Hs108|chrY ( 294) 514 66.0 9.1e-11
>>CCDS14350.1 TSPYL2 gene_id:64061|Hs108|chrX (693 aa)
initn: 4744 init1: 4744 opt: 4744 Z-score: 2636.6 bits: 498.3 E(32554): 1.5e-140
Smith-Waterman score: 4744; 100.0% identity (100.0% similar) in 693 aa overlap (1-693:1-693)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDRPDEGPPAKTRRLSSSESPQRDPPPPPPPPPLLRLPLPPPQQRPRLQEETEAAQVLAD
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CCDS14 MDRPDEGPPAKTRRLSSSESPQRDPPPPPPPPPLLRLPLPPPQQRPRLQEETEAAQVLAD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 MRGVGLGPALPPPPPYVILEEGGIRAYFTLGAECPGWDSTIESGYGEAPPPTESLEALPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MRGVGLGPALPPPPPYVILEEGGIRAYFTLGAECPGWDSTIESGYGEAPPPTESLEALPT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 PEASGGSLEIDFQVVQSSSFGGEGALETCSAVGWAPQRLVDPKSKEEAIIIVEDEDEDER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PEASGGSLEIDFQVVQSSSFGGEGALETCSAVGWAPQRLVDPKSKEEAIIIVEDEDEDER
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 ESMRSSRRRRRRRRRKQRKVKRESRERNAERMESILQALEDIQLDLEAVNIKAGKAFLRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ESMRSSRRRRRRRRRKQRKVKRESRERNAERMESILQALEDIQLDLEAVNIKAGKAFLRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 KRKFIQMRRPFLERRDLIIQHIPGFWVKAFLNHPRISILINRRDEDIFRYLTNLQVQDLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KRKFIQMRRPFLERRDLIIQHIPGFWVKAFLNHPRISILINRRDEDIFRYLTNLQVQDLR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 HISMGYKMKLYFQTNPYFTNMVIVKEFQRNRSGRLVSHSTPIRWHRGQEPQARRHGNQDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 HISMGYKMKLYFQTNPYFTNMVIVKEFQRNRSGRLVSHSTPIRWHRGQEPQARRHGNQDA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 SHSFFSWFSNHSLPEADRIAEIIKNDLWVNPLRYYLRERGSRIKRKKQEMKKRKTRGRCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SHSFFSWFSNHSLPEADRIAEIIKNDLWVNPLRYYLRERGSRIKRKKQEMKKRKTRGRCE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 VVIMEDAPDYYAVEDIFSEISDIDETIHDIKISDFMETTDYFETTDNEITDINENICDSE
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CCDS14 VVIMEDAPDYYAVEDIFSEISDIDETIHDIKISDFMETTDYFETTDNEITDINENICDSE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 NPDHNEVPNNETTDNNESADDHETTDNNESADDNNENPEDNNKNTDDNEENPNNNENTYG
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CCDS14 NPDHNEVPNNETTDNNESADDHETTDNNESADDNNENPEDNNKNTDDNEENPNNNENTYG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 NNFFKGGFWGSHGNNQDSSDSDNEADEASDDEDNDGNEGDNEGSDDDGNEGDNEGSDDDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NNFFKGGFWGSHGNNQDSSDSDNEADEASDDEDNDGNEGDNEGSDDDGNEGDNEGSDDDD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 RDIEYYEKVIEDFDKDQADYEDVIEIISDESVEEEGIEEGIQQDEDIYEEGNYEEEGSED
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CCDS14 RDIEYYEKVIEDFDKDQADYEDVIEIISDESVEEEGIEEGIQQDEDIYEEGNYEEEGSED
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KB8 VWEEGEDSDDSDLEDVLQVPNGWANPGKRGKTG
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VWEEGEDSDDSDLEDVLQVPNGWANPGKRGKTG
670 680 690
>>CCDS5106.1 TSPYL4 gene_id:23270|Hs108|chr6 (414 aa)
initn: 871 init1: 549 opt: 893 Z-score: 514.0 bits: 104.8 E(32554): 2.6e-22
Smith-Waterman score: 893; 42.5% identity (67.8% similar) in 369 aa overlap (40-402:28-392)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 AKTRRLSSSESPQRDPPPPPPPPPLLRLPLPPPQQRPRLQEETEAAQVLADMRGVGLGPA
: .: :.:::::.::.:. : .: .
CCDS51 MSGLDGGNKLPLAQTGGLAAPDHASGDPDRDQCQGLREETEATQVMANTGGGSLETV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 LPPPPPYVILEEGGIRAYFTLGAECPGWDSTIESGYGEAPPPTESLEALPTPEASGGSLE
.. : . :.. : .: ..: .::: :..::: . ::. .: .
CCDS51 AEGGASQDPVDCGPALRVPVAGSR--GGAAT-KAGQEDAPPSTKGLEAASAAEAADSSQK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 IDFQVVQSSSFGGEGALETCSAVGWAPQRLVDPKSKE----EAIIIVEDEDEDERESMRS
:. . . .:. :::.:.: : . : . :.:: . : . : : : .
CCDS51 NGCQLGEPRGPAGQKALEACGAGGLGSQMIPGKKAKEVTTKKRAISAAVEKEGEAGAAME
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 SRRRRRRRRRKQRKVKRESRERNAERMESILQALEDIQLDLEAVNIKAGKAFLRLKRKFI
.. ..... ::.:.: : : .... ...:: :. .: :: .: .:::.:.:::
CCDS51 EKKVVQKEKKVAGGVKEETRPR-APKINNCMDSLEAIDQELSNVNAQADRAFLQLERKFG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 QMRRPFLERRDLIIQHIPGFWVKAFLNHPRISILINRRDEDIFRYLTNLQVQDLRHISMG
.::: ..::..:::.:::::: :: :::..: .:. .:::..::. ::.:..:.: :
CCDS51 RMRRLHMQRRSFIIQNIPGFWVTAFRNHPQLSPMISGQDEDMLRYMINLEVEELKHPRAG
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 YKMKLYFQTNPYFTNMVIVKEFQRNRSGRLVSHSTPIRWHRGQEPQARRHGNQDASH--S
:.:. :: :::: : .:::..: :::.:: ::::::::::.:::. : :.... :
CCDS51 CKFKFIFQGNPYFRNEGLVKEYERRSSGRVVSLSTPIRWHRGQDPQAHIHRNREGNTIPS
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 FFSWFSNHSLPEADRIAEIIKNDLWVNPLRYYLRERGSRIKRKKQEMKKRKTRGRCEVVI
::.:::.::: : ::::::::..:: :::.::: .: :
CCDS51 FFNWFSDHSLLEFDRIAEIIKGELWPNPLQYYLMGEGPRRGIRGPPRQPVESARSFRFQS
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 MEDAPDYYAVEDIFSEISDIDETIHDIKISDFMETTDYFETTDNEITDINENICDSENPD
CCDS51 G
>>CCDS42682.1 TSPYL6 gene_id:388951|Hs108|chr2 (410 aa)
initn: 867 init1: 653 opt: 838 Z-score: 483.7 bits: 99.2 E(32554): 1.3e-20
Smith-Waterman score: 841; 38.6% identity (64.4% similar) in 399 aa overlap (26-406:4-393)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDRPDEGPPAKTRRLSSSESPQRDPPPPPPPPPLLRLPLPPPQQRPRLQEETEAAQVLAD
: : : : : :.: : .:...:..:.::
CCDS42 MSLPESPHSPATLDYALEDPHQGQRSREKSKATEVMAD
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KB8 MRGVGLGPALPPPPPYVILEEGGIRAY--------FTLGAECPGWDSTIESGYGEAPPPT
: : : . ::: : : :. : . .. ..:..: .:::.
CCDS42 MFDGRLEPIVFPPPR---LPEEGVAPQDPADGGHTFHILVDAGRSHGAIKAGQEVTPPPA
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160
pF1KB8 ESLEALPTPEASGGSLEIDFQVVQSSSFGGEGALETCSAVGWAPQRLV------DPKSKE
:.::: . .. :::. : .. ..::: :::::.: : . .... : : .:
CCDS42 EGLEAASASLTTDGSLKNGFPGEETHGLGGEKALETCGA-GRSESEVIAEGKAEDVKPEE
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 EAIIIVEDEDEDERESMRSSRRRRRRRRRKQRKVKRESRERNAERMESI---LQALEDIQ
:.. . ... : : . .. : .:.::. . .. :. ::.::
CCDS42 CAMFSAPVDEKPGGEEMDVA-----EENRAIDEVNREAGPGPGPGPLNVGLHLNPLESIQ
160 170 180 190 200
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 LDLEAVNIKAGKAFLRLKRKFIQMRRPFLERRDLIIQHIPGFWVKAFLNHPRISILINRR
:.:..:: .: .:.:...:.: :... .::.:. ::..:::::: :: .::..: .: .
CCDS42 LELDSVNAEADRALLQVERRFGQIHEYYLEQRNDIIRNIPGFWVTAFRHHPQLSAMIRGQ
210 220 230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 DEDIFRYLTNLQVQDLRHISMGYKMKLYFQTNPYFTNMVIVKEFQRNRSGRLVSHSTPIR
: ... :::::.:..::: : :.:..:: :::: : .::: .. :..:: :: :
CCDS42 DAEMLSYLTNLEVKELRHPRTGCKFKFFFQRNPYFRNKLIVKVYEVRSFGQVVSFSTLIM
270 280 290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 WHRGQEPQARRHGNQDASHSFFSWFSNHSLPEADRIAEIIKNDLWVNPLRYYLR-ERGSR
:.::. ::. : :. . :::.:::.:::::.::::.:::.::: :::.::: : . :
CCDS42 WRRGHGPQSFIHRNRHVICSFFTWFSDHSLPESDRIAQIIKEDLWSNPLQYYLLGEDAHR
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 IKRKKQEMKKRKTRGRCEVVIMEDAPDYYAVEDIFSEISDIDETIHDIKISDFMETTDYF
.:.
CCDS42 ARRRLVREPVEIPRPFGFQCG
390 400 410
>>CCDS34518.1 TSPYL1 gene_id:7259|Hs108|chr6 (437 aa)
initn: 793 init1: 733 opt: 745 Z-score: 432.0 bits: 89.7 E(32554): 9.6e-18
Smith-Waterman score: 847; 40.0% identity (65.5% similar) in 400 aa overlap (43-407:31-420)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 RRLSSSESPQRDPPPPPPPPPLLRLPLPPPQQRPRLQEETEAAQVLADM-RGVGLGPALP
.: ::....::.::.:. .: . :::
CCDS34 MSGLDGVKRTTPLQTHSIIISDQVPSDQDAHQYLRLRDQSEATQVMAEPGEGGSETVALP
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120
pF1KB8 PPPPYVILEEGGIRAYFTLGAECP-----GWDS--TIESGYGEAPPPTESLEALPTPEAS
:::: ::::. . . : : . .:..: :. ::.:.: : . :.
CCDS34 PPPPS---EEGGVPQDAAGRGGTPQIRVVGGRGHVAIKAGQEEGQPPAEGLAAASVVMAA
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB8 GGSLEIDFQVVQSSSFGGEGALETCSAVGWAPQRLVDPKSKEEAI----------IIVED
::. : ::: ::: :.: : . . ... : . ..:
CCDS34 DRSLKKGVQ-------GGEKALEICGAQRSASELTAGAEAEAEEVKTGKCATVSAAVAER
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210
pF1KB8 EDED-------ERESMRSSRRRRRR-------RRRKQRKVKRESRERNAER--MESI-LQ
:. . :.: :. . . ... . .. ....:.::... :.. ..
CCDS34 ESAEVVKEGLAEKEVMEEQMEVEEQPPEGEEIEVAEEDRLEEEAREEEGPWPLHEALRMD
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 ALEDIQLDLEAVNIKAGKAFLRLKRKFIQMRRPFLERRDLIIQHIPGFWVKAFLNHPRIS
:: :::.:..:: .: .:: .:..:: .::: .::::. :::.:::::. :: :::..:
CCDS34 PLEAIQLELDTVNAQADRAFQQLEHKFGRMRRHYLERRNYIIQNIPGFWMTAFRNHPQLS
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 ILINRRDEDIFRYLTNLQVQDLRHISMGYKMKLYFQTNPYFTNMVIVKEFQRNRSGRLVS
.: .: ...::.:::.:..::: : :.:..:. :::: : .::::.. :::.::
CCDS34 AMIRGQDAEMLRYITNLEVKELRHPRTGCKFKFFFRRNPYFRNKLIVKEYEVRSSGRVVS
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 HSTPIRWHRGQEPQARRHGNQDASHSFFSWFSNHSLPEADRIAEIIKNDLWVNPLRYYLR
:::: :.::.:::. . ::: :::.:::.:::::.:.::::::.::: :::.:::
CCDS34 LSTPIIWRRGHEPQSFIRRNQDLICSFFTWFSDHSLPESDKIAEIIKEDLWPNPLQYYLL
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 ERGSRIKRKKQEMKKRKTRGRCEVVIMEDAPDYYAVEDIFSEISDIDETIHDIKISDFME
..: : :..
CCDS34 REGVRRARRRPLREPVEIPRPFGFQSG
420 430
>>CCDS34927.1 TSPYL5 gene_id:85453|Hs108|chr8 (417 aa)
initn: 735 init1: 659 opt: 672 Z-score: 392.0 bits: 82.3 E(32554): 1.6e-15
Smith-Waterman score: 733; 34.7% identity (63.2% similar) in 421 aa overlap (10-418:13-403)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MDRPDEGPPAKTRRLSSSESPQRDPPPPPPPPPLLRLPLPPPQQRPRLQEETEAAQV
::.: . ... : : : : : :.: : :.:.::::
CCDS34 MSGRSRGRKSSRAKNRGKGRAKARVR-PAPDDAPRD------PDPSQYQSLGEDTQAAQV
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KB8 LADMRGVGLGPALPPPPPYVIL---EEGGIRAYFTLG----AECPG--WDSTIESGYGEA
: :.: : .: .: ::.. : . : :. : ... . : :.:
CCDS34 QA---GAGWG-GLEAAASAQLLRLGEEAACRLPLDCGLALRARAAGDHGQAAARPGPGKA
60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 PPPTESLEALPTPEASGGSL---EIDFQVVQSSSFGGEGALETCSAVGWAPQRLVDPKSK
.: : : . ...:.. . .: . . .:. : ::::..: .:: .. ..:
CCDS34 ASLSERLAADTVFVGTAGTVGRPKNAPRVGNRRGPAGKKAPETCSTAGRGPQVIAGGRQK
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 EEAIIIVEDEDEDERESMRSSRRRRRRRRRKQRKVKRESRERNAERMESILQALEDIQLD
. : : :. ........: . . :. ...::..::
CCDS34 KGAA--------GENTSVSAGEEKKEERDAGS----------GPPATEGSMDTLENVQLK
170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 LEAVNIKAGKAFLRLKRKFIQMRRPFLERRDLIIQHIPGFWVKAFLNHPRISILINRRDE
:: .: .: .:.:::.::: :.: ::::. .::.::::: .:: :::... ..: ...
CCDS34 LENMNAQADRAYLRLSRKFGQLRLQHLERRNHLIQNIPGFWGQAFQNHPQLASFLNSQEK
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 DIFRYLTNLQVQDLRHISMGYKMKLYFQTNPYFTNMVIVKEFQRNRSGRLVSHSTPIRWH
... ::..:.:..: .:::.:.::. :::: : :..::. . ::..::.::::.:
CCDS34 EVLSYLNSLEVEELGLARLGYKIKFYFDRNPYFQNKVLIKEYGCGPSGQVVSRSTPIQWL
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 RGQEPQARRHGNQDASHSFFSWFSNHSLPEADRIAEIIKNDLWVNPLRYYLRERGSRIKR
:.. :. .:: . ..:::.:::::: :.:.:.:::...:: :::..:: .:.:...
CCDS34 PGHDLQSLSQGNPENNRSFFGWFSNHSSIESDKIVEIINEELWPNPLQFYLLSEGARVEK
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 KKQEMKKRKTRGRCEVVIMEDAPDYYAVEDIFSEISDIDETIHDIKISDFMETTDYFETT
: : . :. :.
CCDS34 GK-EKEGRQGPGKQPMETTQPGVSQSN
400 410
>>CCDS48202.1 TSPY4 gene_id:728395|Hs108|chrY (314 aa)
initn: 623 init1: 573 opt: 583 Z-score: 344.5 bits: 73.1 E(32554): 7.2e-13
Smith-Waterman score: 583; 37.8% identity (66.8% similar) in 259 aa overlap (141-399:48-298)
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 PTESLEALPTPEASGGSLEIDFQVVQSSSFGGEGALETCSAVGWAPQRLVDPKSKEEAII
:. :. .:.: :.: : ..
CCDS48 GFCGVGRAAQALVCASAKEGTAFRMEAVQEGAAGVESEQAALGEEAVLLLDDIMAEVEVV
20 30 40 50 60 70
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 IVEDEDEDERESMRSSRRRRRRRRRKQRKVKRESRERNAERMESILQALEDIQLDLEAVN
.: : :.:.. .::.. .: :. : . :: :. : .:..:: ::
CCDS48 -AEVEVVAEEEGLV---ERREEAQRAQQAVPGPG----PMTPESALEELLAVQVELEPVN
80 90 100 110 120
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 IKAGKAFLRLKRKFIQMRRPFLERRDLIIQHIPGFWVKAFLNHPRISILINRRDEDIFRY
.: ::: : ..:. . :.: :.:: .:: .::::.... :::..: ::. .:::.. :
CCDS48 AQARKAFSRQREKMERRRKPHLDRRGAVIQSVPGFWANVIANHPQMSALITDEDEDMLSY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]