Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8699
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8699, 541 aa
1>>>pF1KB8699 541 - 541 aa - 541 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4212+/-0.00088; mu= 8.0782+/- 0.053
mean_var=131.1059+/-26.395, 0's: 0 Z-trim(110.6): 86 B-trim: 20 in 1/50
Lambda= 0.112012
statistics sampled from 11637 (11728) to 11637 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.717), E-opt: 0.2 (0.36), width: 16
Scan time: 3.620
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS648.2 ANKRD13C gene_id:81573|Hs108|chr1 ( 541) 3572 588.8 5.2e-168
CCDS9140.1 ANKRD13A gene_id:88455|Hs108|chr12 ( 590) 522 96.0 1.3e-19
CCDS11251.1 ANKRD13B gene_id:124930|Hs108|chr17 ( 626) 501 92.6 1.5e-18
CCDS31616.2 ANKRD13D gene_id:338692|Hs108|chr11 ( 605) 491 91.0 4.4e-18
>>CCDS648.2 ANKRD13C gene_id:81573|Hs108|chr1 (541 aa)
initn: 3572 init1: 3572 opt: 3572 Z-score: 3129.7 bits: 588.8 E(32554): 5.2e-168
Smith-Waterman score: 3572; 99.1% identity (99.4% similar) in 541 aa overlap (1-541:1-541)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MTGEKIRSLRRDHKPSKEEGDLLEPGDEEAAAALGGTFTRSRIGKGGKACHKTFSNHHHR
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CCDS64 MTGEKIRSLRRDHKPSKEEGDLLEPGDEEAAAALGGTFTRSRIGKGGKACHKIFSNHHHR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 LQLKAAPASSNPPGAPALPLHNSSVTANSQSPALLAGTNPVAVVADGGSCPAHYPVHECV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LQLKAAPASSNPPGAPALPLHNSSVTANSQSPALLAGTNPVAVVADGGSCPAHYPVHECV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 FKGDVRRLSSLIRTHNIGQKDNHGNTPLHLAVMLGNKECAHLLLAHNAPVKVKNAQGWSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 FKGDVRRLSSLIRTHNIGQKDNHGNTPLHLAVMLGNKECAHLLLAHNAPVKVKNAQGWSP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 LAEAISYGDRQMITALLRKLKQQSRESVEEKRPRLLKALKELGDFYLELHWDFQSWVPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LAEAISYGDRQMITALLRKLKQQSRESVEEKRPRLLKALKELGDFYLELHWDFQSWVPLL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 SRILPSDACKIYKQGINIRLDTTLIDFTDMKCQRGGLSFIFNGDAAPSESFVVLDNEQKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SRILPSDACKIYKQGINIRLDTTLIDFTDMKCQRGDLSFIFNGDAAPSESFVVLDNEQKV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 YQRIHHEESEMETEEEVDILMSSDIYSATLSTKSISFTRAQTGWLFREDKTGRVGNFLAD
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CCDS64 YQRIHHEESEMETEEEVDILMSSDIYSATLSTKSISFTRAQTGWLFREDKTERVGNFLAD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 FYLVNGLVLESRKRREHLSEEDILRNKAIMESLSKGGNIMEQNFEPIRRQSLSPPPQNTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS64 FYLVNGLVLESRKRREHLSEEDILRNKAIMESLSKGGNIMEQNFEPIRRQSLTPPPQNTI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 TWEEYISAENGKAPHLGRELVCKESKKTFKATIAMSQEFPLGIELLLNVLEVVAPFKHFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 TWEEYISAENGKAPHLGRELVCKESKKTFKATIAMSQEFPLGIELLLNVLEVVAPFKHFN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 KLREFVQMKLPPGFPVKLDIPVFPTITATVTFQEFQYDEFDGSIFTIPDDYKEDPSRFPD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS64 KLREFVQMKLPPGFPVKLDIPVFPTITATVTFQEFRYDEFDGSIFTIPDDYKEDPSRFPD
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 L
:
CCDS64 L
>>CCDS9140.1 ANKRD13A gene_id:88455|Hs108|chr12 (590 aa)
initn: 701 init1: 513 opt: 522 Z-score: 465.4 bits: 96.0 E(32554): 1.3e-19
Smith-Waterman score: 852; 36.3% identity (66.3% similar) in 424 aa overlap (109-512:4-425)
80 90 100 110 120 130
pF1KB8 PLHNSSVTANSQSPALLAGTNPVAVVADGGSCPA--HYPVHECVFKGDVRRLSSLIRTHN
.: : :::.: :.:.: :.: . .. .:
CCDS91 MSSACDAGDHYPLHLLVWKNDYRQLEKELQGQN
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KB8 IGQKDNHGNTPLHLAVMLGNKECAHLLLAHNAPVKVKNAQGWSPLAEAISYGDRQMITAL
. : .: : ::::: ::. : :..:: :.: : .: :::. : ::.: :: .:. ..
CCDS91 VEAVDPRGRTLLHLAVSLGHLESARVLLRHKADVTKENRQGWTVLHEAVSTGDPEMVYTV
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KB8 LRKLKQQSRESVEEKRPRLLKALKELGDFYLELHWDFQSWVPLLSRILPSDACKIYKQGI
:.. .. . : :.::. . : :::....:.: :::::.::: :.:.:.:.:.:
CCDS91 LQHRDYHNTSMALEGVPELLQKILEAPDFYVQMKWEFTSWVPLVSRICPNDVCRIWKSGA
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 NIRLDTTLIDFTDMKCQRGGLSFIFNGDAAPSESFVVLDNEQKVYQRIHHEESEMET---
..:.: ::. : .:. :: ::::.:. .: . : ... : . .:::
CCDS91 KLRVDITLLGFENMSWIRGRRSFIFKGEDNWAELMEVNHDDKVVTTERFDLSQEMERLTL
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360
pF1KB8 ------EEEVDILMSSDIYSATLSTKSISFTRAQTG-WLFREDKTGRVGNFLADFYLVNG
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CCDS91 DLMKPKSREVERRLTSPVINTSLDTKNIAFERTKSGFWGWRTDKAEVVNGYEAKVYTVNN
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 LVLESRKRREHLSEEDILRNKAIMESLSKGGNIMEQNFEP---IRRQSLSPPPQNTITWE
. . .. : :::.::. : :: . : . . .:..: . . . ..:: .
CCDS91 VNVITKIRTEHLTEEEKKRYKADRNPLESLLGTVEHQFGAQGDLTTECATANNPTAITPD
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470
pF1KB8 EYISAE-NGKAPHLGR--ELVCKESKKTFKATIAMSQEFPLG-IELLLNVLEVVAPFK-H
::.. : . : .:: ::. . .: ::: . : .::::. .: .. .....: . :
CCDS91 EYFNEEFDLKDRDIGRPKELTIRTQK--FKAMLWMCEEFPLSLVEQVIPIIDLMARTSAH
340 350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 FNKLREFVQMKLPPGFPVKLDIPVFPTITATVTFQEFQYDEFDGSIFTIPDDYKEDPSRF
: .::.:.....:::::::..::.: ...: .::
CCDS91 FARLRDFIKLEFPPGFPVKIEIPLFHVLNARITFGNVNGCSTAEESVSQNVEGTQADSAS
400 410 420 430 440 450
540
pF1KB8 PDL
CCDS91 HITNFEVDQSVFEIPESYYVQDNGRNVHLQDEDYEIMQFAIQQSLLESSRSQELSGPASN
460 470 480 490 500 510
>>CCDS11251.1 ANKRD13B gene_id:124930|Hs108|chr17 (626 aa)
initn: 745 init1: 452 opt: 501 Z-score: 446.7 bits: 92.6 E(32554): 1.5e-18
Smith-Waterman score: 810; 35.7% identity (62.7% similar) in 459 aa overlap (100-536:3-456)
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 SNPPGAPALPLHNSSVTANSQSPALLAGTNPVAVVADGGSCPAHYPVHECVFKGDVRRLS
:. . : : ..::.: :... :.:
CCDS11 MIPANASARKGP-EGKYPLHYLVWHNRHRELE
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 SLIRTH--NIGQKDNHGNTPLHLAVMLGNKECAHLLLAHNAPVKVKNAQGWSPLAEAISY
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CCDS11 KEVRAGQVDIEQLDPRGRTPLHLATTLGHLECARVLLAHGADVGRENRSGWTVLQEAVST
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 GDRQMITALLRKLKQQSRESVEEKRPRLLKALKELGDFYLELHWDFQSWVPLLSRILPSD
: ... .:: : . : ::. :.. :::.:..:.: :::::.:.: :::
CCDS11 RDLELVQLVLRYRDYQRVVKRLAGIPVLLEKLRKAQDFYVEMKWEFTSWVPLVSKICPSD
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 ACKIYKQGINIRLDTTLIDFTDMKCQRGGLSFIFNGDAAPSESFVVLDNEQKVYQR----
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CCDS11 TYKVWKSGQNLRVDTTLLGFDHMTWQRGNRSFVFRGQDT-SAVVMEIDHDRRVVYTETLA
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350
pF1KB8 IHHEESEM------ETEEEVDILMSSDIYSATLSTKSISFTRAQTGWL-FREDKTGRVGN
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CCDS11 LAGQDRELLLAAAQPTEEQVLSRLTAPVVTTQLDTKNISFERNKTGILGWRSEKTEMVNG
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 FLADFYLVNGLVLESRKRREHLSEEDILRNKAIMESLSKGGNIMEQNFEP----IRRQSL
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CCDS11 YEAKVYGASNVELITRTRTEHLSEQHKGKVKGCKTPLQSFLGIAEQHGGPQNGTLITQTL
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460
pF1KB8 SPPPQNTITWEEYISA--ENGKAPHLGRELVCKESKKTFKATIAMSQEFPLGI-ELLLNV
: ..:: :::.. : :. .:: . . . ::: . . .: ::.. : . .
CCDS11 SQANPTAITAEEYFNPNFELGNRD-MGRPMELTTKTQKFKAKLWLCEEHPLSLCEQVAPI
340 350 360 370 380
470 480 490 500 510 520
pF1KB8 LEVVAPFKH-FNKLREFVQMKLPPGFPVKLDIPVFPTITATVTFQEFQY-DEFDGSIFTI
....: . : :::.:. ..::::::::..::.: ..: .:: ... :: :.
CCDS11 IDLMAVSNALFAKLRDFITLRLPPGFPVKIEIPIFHILNARITFGNLNGCDEPVPSVRGS
390 400 410 420 430 440
530 540
pF1KB8 PDDYKEDPSRFPDL
:.. : ::
CCDS11 PSS--ETPSPGSDSSSVSSSSSTTSCRGCEISPALFEAPRGYSMMGGQREAATRDDDDDL
450 460 470 480 490 500
>>CCDS31616.2 ANKRD13D gene_id:338692|Hs108|chr11 (605 aa)
initn: 738 init1: 457 opt: 491 Z-score: 438.2 bits: 91.0 E(32554): 4.4e-18
Smith-Waterman score: 821; 34.7% identity (66.4% similar) in 441 aa overlap (108-528:3-440)
80 90 100 110 120 130
pF1KB8 LPLHNSSVTANSQSPALLAGTNPVAVVADGGSCPAHYPVHECVFKGDVRRLSSLIRTH--
: :. .:.:. :. . :.: . ...:
CCDS31 MAGPGPT-FPLHRLVWANRHRELEAALHSHQH
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KB8 NIGQKDNHGNTPLHLAVMLGNKECAHLLLAHNAPVKVKNAQGWSPLAEAISYGDRQMITA
.: :.: .: :::.::: ::: : ...:: ::: : .: :::. : ::.: :: .:.
CCDS31 DIEQEDPRGRTPLELAVSLGNLESVRVLLRHNANVGKENRQGWAVLQEAVSTGDPEMVQL
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KB8 LLRKLKQQSRESVEEKRPRLLKALKELGDFYLELHWDFQSWVPLLSRILPSDACKIYKQG
.:. : . :.::. :.. :::.:..:.: :::::.:.. :::. ...:.:
CCDS31 VLQYRDYQRATQRLAGIPELLNKLRQAPDFYVEMKWEFTSWVPLVSKMCPSDVYRVWKRG
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 INIRLDTTLIDFTDMKCQRGGLSFIFNGDAAPSESFVVLDNEQKVYQR-----IHHEESE
..:.::.:. : : ::: ::::.:. : . . : ..: :. . ... :.
CCDS31 ESLRVDTSLLGFEHMTWQRGRRSFIFKGQEAGALVMEVDHDRQVVHVETLGLTLQEPETL
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360
pF1KB8 ME----TEEEVDILMSSDIYSATLSTKSISFTRAQTG-WLFREDKTGRVGNFLADFYLVN
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CCDS31 LAAMRPSEEHVASRLTSPIVSTHLDTRNVAFERNKCGIWGWRSEKMETVSGYEAKVYSAT
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 GLVLESRKRREHLSEEDILRNKAIMESLSKGGNIMEQNFE----PIRRQSLSPPPQNTIT
.. : .: : ::::..: :.:: ... .. .:. :.. :. :: ..:.
CCDS31 NVELVTRTRTEHLSDQDKSRSKAGKTPFQSFLGMAQQHSSHTGAPVQ-QAASPTNPTAIS
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470
pF1KB8 WEEYISAE-NGKAPHLGRELVCKESKKTFKATIAMSQEFPLGI-ELLLNVLEVVAPFK-H
:::.. . . .. ..:: . . . . ::::. .:.: ::.. . . .....: . :
CCDS31 PEEYFDPNFSLESRNIGRPIEMSSKVQRFKATLWLSEEHPLSLGDQVTPIIDLMAISNAH
340 350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 FNKLREFVQMKLPPGFPVKLDIPVFPTITATVTFQEF-QYDEFDGSIFTIPDDYKEDPSR
: :::.:. ..::::::::..::.: ...: .::... :: .:.. .:
CCDS31 FAKLRDFITLRLPPGFPVKIEIPLFHVLNARITFSNLCGCDEPLSSVW-VPAPSSAVAAS
400 410 420 430 440
540
pF1KB8 FPDL
CCDS31 GNPFPCEVDPTVFEVPNGYSVLGMERNEPLRDEDDDLLQFAIQQSLLEAGTEAEQVTVWE
450 460 470 480 490 500
541 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 14:43:46 2016 done: Fri Nov 4 14:43:47 2016
Total Scan time: 3.620 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]