Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8707
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8707, 539 aa
1>>>pF1KB8707 539 - 539 aa - 539 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6874+/-0.000914; mu= 13.6984+/- 0.055
mean_var=137.4961+/-27.589, 0's: 0 Z-trim(109.9): 18 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.109378
statistics sampled from 11187 (11197) to 11187 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.693), E-opt: 0.2 (0.344), width: 16
Scan time: 3.480
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46965.1 FXR1 gene_id:8087|Hs108|chr3 ( 539) 3571 575.2 6.6e-164
CCDS3238.1 FXR1 gene_id:8087|Hs108|chr3 ( 621) 3529 568.6 7.2e-162
CCDS33894.1 FXR1 gene_id:8087|Hs108|chr3 ( 536) 2934 474.7 1.2e-133
CCDS45604.1 FXR2 gene_id:9513|Hs108|chr17 ( 673) 2010 329.0 1.1e-89
CCDS55519.1 FMR1 gene_id:2332|Hs108|chrX ( 611) 1689 278.3 1.8e-74
CCDS55518.1 FMR1 gene_id:2332|Hs108|chrX ( 537) 1670 275.2 1.3e-73
CCDS76039.1 FMR1 gene_id:2332|Hs108|chrX ( 586) 1670 275.3 1.4e-73
CCDS14682.1 FMR1 gene_id:2332|Hs108|chrX ( 632) 1670 275.3 1.5e-73
>>CCDS46965.1 FXR1 gene_id:8087|Hs108|chr3 (539 aa)
initn: 3571 init1: 3571 opt: 3571 Z-score: 3056.2 bits: 575.2 E(32554): 6.6e-164
Smith-Waterman score: 3571; 100.0% identity (100.0% similar) in 539 aa overlap (1-539:1-539)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAELTVEVRGSNGAFYKGFIKDVHEDSLTVVFENNWQPERQVPFNEVRLPPPPDIKKEIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MAELTVEVRGSNGAFYKGFIKDVHEDSLTVVFENNWQPERQVPFNEVRLPPPPDIKKEIS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 EGDEVEVYSRANDQEPCGWWLAKVRMMKGEFYVIEYAACDATYNEIVTFERLRPVNQNKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EGDEVEVYSRANDQEPCGWWLAKVRMMKGEFYVIEYAACDATYNEIVTFERLRPVNQNKT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VKKNTFFKCTVDVPEDLREACANENAHKDFKKAVGACRIFYHPETTQLMILSASEATVKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VKKNTFFKCTVDVPEDLREACANENAHKDFKKAVGACRIFYHPETTQLMILSASEATVKR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 VNILSDMHLRSIRTKLMLMSRNEEATKHLECTKQLAAAFHEEFVVREDLMGLAIGTHGSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VNILSDMHLRSIRTKLMLMSRNEEATKHLECTKQLAAAFHEEFVVREDLMGLAIGTHGSN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 IQQARKVPGVTAIELDEDTGTFRIYGESADAVKKARGFLEFVEDFIQVPRNLVGKVIGKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IQQARKVPGVTAIELDEDTGTFRIYGESADAVKKARGFLEFVEDFIQVPRNLVGKVIGKN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 GKVIQEIVDKSGVVRVRIEGDNENKLPREDGMVPFVFVGTKESIGNVQVLLEYHIAYLKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GKVIQEIVDKSGVVRVRIEGDNENKLPREDGMVPFVFVGTKESIGNVQVLLEYHIAYLKE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 VEQLRMERLQIDEQLRQIGSRSYSGRGRGRRGPNYTSGYGTNSELSNPSETESERKDELS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VEQLRMERLQIDEQLRQIGSRSYSGRGRGRRGPNYTSGYGTNSELSNPSETESERKDELS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 DWSLAGEDDRDSRHQRDSRRRPGGRGRSVSGGRGRGGPRGGKSSISSVLKDPDSNPYSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DWSLAGEDDRDSRHQRDSRRRPGGRGRSVSGGRGRGGPRGGKSSISSVLKDPDSNPYSLL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KB8 DNTESDQTADTDASESHHSTNRRRRSRRRRTDEDAVLMDGMTESDTASVNENGLGKRCD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DNTESDQTADTDASESHHSTNRRRRSRRRRTDEDAVLMDGMTESDTASVNENGLGKRCD
490 500 510 520 530
>>CCDS3238.1 FXR1 gene_id:8087|Hs108|chr3 (621 aa)
initn: 3529 init1: 3529 opt: 3529 Z-score: 3019.5 bits: 568.6 E(32554): 7.2e-162
Smith-Waterman score: 3529; 100.0% identity (100.0% similar) in 534 aa overlap (1-534:1-534)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAELTVEVRGSNGAFYKGFIKDVHEDSLTVVFENNWQPERQVPFNEVRLPPPPDIKKEIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MAELTVEVRGSNGAFYKGFIKDVHEDSLTVVFENNWQPERQVPFNEVRLPPPPDIKKEIS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 EGDEVEVYSRANDQEPCGWWLAKVRMMKGEFYVIEYAACDATYNEIVTFERLRPVNQNKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EGDEVEVYSRANDQEPCGWWLAKVRMMKGEFYVIEYAACDATYNEIVTFERLRPVNQNKT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VKKNTFFKCTVDVPEDLREACANENAHKDFKKAVGACRIFYHPETTQLMILSASEATVKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VKKNTFFKCTVDVPEDLREACANENAHKDFKKAVGACRIFYHPETTQLMILSASEATVKR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 VNILSDMHLRSIRTKLMLMSRNEEATKHLECTKQLAAAFHEEFVVREDLMGLAIGTHGSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VNILSDMHLRSIRTKLMLMSRNEEATKHLECTKQLAAAFHEEFVVREDLMGLAIGTHGSN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 IQQARKVPGVTAIELDEDTGTFRIYGESADAVKKARGFLEFVEDFIQVPRNLVGKVIGKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IQQARKVPGVTAIELDEDTGTFRIYGESADAVKKARGFLEFVEDFIQVPRNLVGKVIGKN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 GKVIQEIVDKSGVVRVRIEGDNENKLPREDGMVPFVFVGTKESIGNVQVLLEYHIAYLKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GKVIQEIVDKSGVVRVRIEGDNENKLPREDGMVPFVFVGTKESIGNVQVLLEYHIAYLKE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 VEQLRMERLQIDEQLRQIGSRSYSGRGRGRRGPNYTSGYGTNSELSNPSETESERKDELS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VEQLRMERLQIDEQLRQIGSRSYSGRGRGRRGPNYTSGYGTNSELSNPSETESERKDELS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 DWSLAGEDDRDSRHQRDSRRRPGGRGRSVSGGRGRGGPRGGKSSISSVLKDPDSNPYSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DWSLAGEDDRDSRHQRDSRRRPGGRGRSVSGGRGRGGPRGGKSSISSVLKDPDSNPYSLL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KB8 DNTESDQTADTDASESHHSTNRRRRSRRRRTDEDAVLMDGMTESDTASVNENGLGKRCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DNTESDQTADTDASESHHSTNRRRRSRRRRTDEDAVLMDGMTESDTASVNENGLVTVADY
490 500 510 520 530 540
CCDS32 ISRAESQSRQRNLPRETLAKNKKEMAKDVIEEHGPSEKAINGPTSASGDDISKLQRTPGE
550 560 570 580 590 600
>>CCDS33894.1 FXR1 gene_id:8087|Hs108|chr3 (536 aa)
initn: 2934 init1: 2934 opt: 2934 Z-score: 2513.0 bits: 474.7 E(32554): 1.2e-133
Smith-Waterman score: 2934; 100.0% identity (100.0% similar) in 449 aa overlap (86-534:1-449)
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 KKEISEGDEVEVYSRANDQEPCGWWLAKVRMMKGEFYVIEYAACDATYNEIVTFERLRPV
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MMKGEFYVIEYAACDATYNEIVTFERLRPV
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 NQNKTVKKNTFFKCTVDVPEDLREACANENAHKDFKKAVGACRIFYHPETTQLMILSASE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NQNKTVKKNTFFKCTVDVPEDLREACANENAHKDFKKAVGACRIFYHPETTQLMILSASE
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 ATVKRVNILSDMHLRSIRTKLMLMSRNEEATKHLECTKQLAAAFHEEFVVREDLMGLAIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ATVKRVNILSDMHLRSIRTKLMLMSRNEEATKHLECTKQLAAAFHEEFVVREDLMGLAIG
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 THGSNIQQARKVPGVTAIELDEDTGTFRIYGESADAVKKARGFLEFVEDFIQVPRNLVGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 THGSNIQQARKVPGVTAIELDEDTGTFRIYGESADAVKKARGFLEFVEDFIQVPRNLVGK
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 VIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRIEGDNENKLPREDGMVPFVFVGTKESIGNVQVLLEYHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRIEGDNENKLPREDGMVPFVFVGTKESIGNVQVLLEYHI
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 AYLKEVEQLRMERLQIDEQLRQIGSRSYSGRGRGRRGPNYTSGYGTNSELSNPSETESER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AYLKEVEQLRMERLQIDEQLRQIGSRSYSGRGRGRRGPNYTSGYGTNSELSNPSETESER
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 KDELSDWSLAGEDDRDSRHQRDSRRRPGGRGRSVSGGRGRGGPRGGKSSISSVLKDPDSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KDELSDWSLAGEDDRDSRHQRDSRRRPGGRGRSVSGGRGRGGPRGGKSSISSVLKDPDSN
340 350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 PYSLLDNTESDQTADTDASESHHSTNRRRRSRRRRTDEDAVLMDGMTESDTASVNENGLG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PYSLLDNTESDQTADTDASESHHSTNRRRRSRRRRTDEDAVLMDGMTESDTASVNENGLV
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 KRCD
CCDS33 TVADYISRAESQSRQRNLPRETLAKNKKEMAKDVIEEHGPSEKAINGPTSASGDDISKLQ
460 470 480 490 500 510
>>CCDS45604.1 FXR2 gene_id:9513|Hs108|chr17 (673 aa)
initn: 2365 init1: 1985 opt: 2010 Z-score: 1723.7 bits: 329.0 E(32554): 1.1e-89
Smith-Waterman score: 2364; 65.3% identity (81.1% similar) in 577 aa overlap (4-534:14-576)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MAELTVEVRGSNGAFYKGFIKDVHEDSLTVVFENNWQPERQVPFNEVRLP
: ::::::::::::::.:::::::.:. :::::: :::.::..::::
CCDS45 MGGLASGGDVEPGLPVEVRGSNGAFYKGFVKDVHEDSVTIFFENNWQSERQIPFGDVRLP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 PPPDIKKEISEGDEVEVYSRANDQEPCGWWLAKVRMMKGEFYVIEYAACDATYNEIVTFE
:: : .:::.::::::::::::.:::::::::.::::::.::::::::::::::::::.:
CCDS45 PPADYNKEITEGDEVEVYSRANEQEPCGWWLARVRMMKGDFYVIEYAACDATYNEIVTLE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 RLRPVNQNKTVKKNTFFKCTVDVPEDLREACANENAHKDFKKAVGACRIFYHPETTQLMI
:::::: : . :..::: :. :::::::::.:::.::.::::.:: :: . ...:.:
CCDS45 RLRPVNPNPLATKGSFFKVTMAVPEDLREACSNENVHKEFKKALGANCIFLNITNSELFI
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 LSASEATVKRVNILSDMHLRSIRTKLMLMSRNEEATKHLECTKQLAAAFHEEFVVREDLM
::..:: :::...:.:::.::.::::.::::::::::::: .:::::::.:::.::::::
CCDS45 LSTTEAPVKRASLLGDMHFRSLRTKLLLMSRNEEATKHLETSKQLAAAFQEEFTVREDLM
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 GLAIGTHGSNIQQARKVPGVTAIELDEDTGTFRIYGESADAVKKARGFLEFVEDFIQVPR
::::::::.:::::::::::::::: :.: :::::::. .: ..::..::: :: .::::
CCDS45 GLAIGTHGANIQQARKVPGVTAIELGEETCTFRIYGETPEACRQARSYLEFSEDSVQVPR
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 NLVGKVIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRIEGDNENKLPREDGMVPFVFVGTKESIGNVQVL
:::::::::::::::::::::::::::.::::..: :::.:::::.::::.:.:.:.:.:
CCDS45 NLVGKVIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRVEGDNDKKNPREEGMVPFIFVGTRENISNAQAL
310 320 330 340 350 360
360 370
pF1KB8 LEYHIAYLKEVEQLRMERLQIDEQLRQIG-------------------------------
::::..::.::::::.:::::::::::::
CCDS45 LEYHLSYLQEVEQLRLERLQIDEQLRQIGLGFRPPGSGRGSGGSDKAGYSTDESSSSSLH
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KB8 -SR----SYSGRGRGRR--GPNYTSGYGTNSELSNPSETESERKDELSDWSLAGEDDRDS
.: ::.::::::: :: .:: .:..:. ::::::...: . :: :::
CCDS45 ATRTYGGSYGGRGRGRRTGGP----AYGPSSDVSTASETESEKREEPNR---AGPGDRDP
430 440 450 460 470
440 450 460 470 480
pF1KB8 -RHQRDSRRRPGGRGRSVSGGRGRGGP-------RGGKSSISSVLKDPDSNPYSLLDNTE
. ..::::: .:::::: : : ..:::::::::::::::::::..:
CCDS45 PTRGEESRRRP-------TGGRGRGPPPAPRPTSRYNSSSISSVLKDPDSNPYSLLDTSE
480 490 500 510 520
490 500 510 520 530
pF1KB8 SDQTADTDASESHHSTNRRRRSRRRRTDEDAVLMDGMTESDTASVNENGLGKRCD
. .:.. .: .. ::::::::::::: ..::: ::: ...::::
CCDS45 PEPPVDSEPGEPPPASARRRRSRRRRTDEDRTVMDGGLESDGPNMTENGLEDESRPQRRN
530 540 550 560 570 580
CCDS45 RSRRRRNRGNRTDGSISGDRQPVTVADYISRAESQSRQRPPLERTKPSEDSLSGQKGDSV
590 600 610 620 630 640
>>CCDS55519.1 FMR1 gene_id:2332|Hs108|chrX (611 aa)
initn: 2142 init1: 1670 opt: 1689 Z-score: 1450.5 bits: 278.3 E(32554): 1.8e-74
Smith-Waterman score: 2071; 62.3% identity (76.9% similar) in 549 aa overlap (1-476:1-545)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAELTVEVRGSNGAFYKGFIKDVHEDSLTVVFENNWQPERQVPFNEVRLPPPPDIKKEIS
: ::.::::::::::::.:.:::::::.::.:::::::.::.::..::.::: .:.:.
CCDS55 MEELVVEVRGSNGAFYKAFVKDVHEDSITVAFENNWQPDRQIPFHDVRFPPPVGYNKDIN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 EGDEVEVYSRANDQEPCGWWLAKVRMMKGEFYVIEYAACDATYNEIVTFERLRPVNQNKT
:.::::::::::..::: ::::::::.:::::::::::::::::::::.:::: :: ::
CCDS55 ESDEVEVYSRANEKEPCCWWLAKVRMIKGEFYVIEYAACDATYNEIVTIERLRSVNPNKP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VKKNTFFKCTVDVPEDLREACANENAHKDFKKAVGACRIFYHPETTQLMILSASEATVKR
. :.:: : .:::::::. ::.: ::::::::::: . : ::. ::.::: .:.: ::
CCDS55 ATKDTFHKIKLDVPEDLRQMCAKEAAHKDFKKAVGAFSVTYDPENYQLVILSINEVTSKR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 VNILSDMHLRSIRTKLMLMSRNEEATKHLECTKQLAAAFHEEFVVREDLMGLAIGTHGSN
...: :::.::.:::: :. :::::.:.:: ..:::. :::.:.::::::::::::::.:
CCDS55 AHMLIDMHFRSLRTKLSLIMRNEEASKQLESSRQLASRFHEQFIVREDLMGLAIGTHGAN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 IQQARKVPGVTAIELDEDTGTFRIYGESADAVKKARGFLEFVEDFIQVPRNLVGKVIGKN
:::::::::::::.::::: ::.::::. :::::::.::::.:: :::::::::::::::
CCDS55 IQQARKVPGVTAIDLDEDTCTFHIYGEDQDAVKKARSFLEFAEDVIQVPRNLVGKVIGKN
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KB8 GKVIQEIVDKSGVVRVRIEGDNENKLPRED------------------------------
::.::::::::::::::::..::...:.:.
CCDS55 GKLIQEIVDKSGVVRVRIEAENEKNVPQEEEIMPPNSLPSNNSRVGPNAPEEKKHLDIKE
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370
pF1KB8 ---------------GMVPFVFVGTKESIGNVQVLLEYHIAYLKEVEQLRMERLQIDEQL
:::::::::::.::.:. :::.::. :::::.:::.:::::::::
CCDS55 NSTHFSQPNSTKVQRGMVPFVFVGTKDSIANATVLLDYHLNYLKEVDQLRLERLQIDEQL
370 380 390 400 410 420
380 390 400
pF1KB8 RQIG---------------------------SRSYSGRGRGRRGPNYTSGYGTNSELSNP
:::: :: : .::.:::::.::: ::::: ::
CCDS55 RQIGASSRPPPNRTDKEKSYVTDDGQGMGRGSRPYRNRGHGRRGPGYTS--GTNSEASNA
430 440 450 460 470
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 SETESERKDELSDWSLAG-EDDRDSRHQRDSRRRPGGRGRSVSGGRGRGGPRGGKSSISS
:::::...::::::::: :..:.: .: . :: :: ::. .::::::: :... :
CCDS55 SETESDHRDELSDWSLAPTEEERESFLRRGDGRRRGGGGRG-QGGRGRGGGFKGNDDHSR
480 490 500 510 520 530
470 480 490 500 510 520
pF1KB8 VLKDPDSNPYSLLDNTESDQTADTDASESHHSTNRRRRSRRRRTDEDAVLMDGMTESDTA
. . : ::
CCDS55 TDNRP-RNPREAKGRTTDGSLQIRVDCNNERSVHTKTLQNTSSEGSRLRTGKDRNQKKEK
540 550 560 570 580 590
>>CCDS55518.1 FMR1 gene_id:2332|Hs108|chrX (537 aa)
initn: 1670 init1: 1670 opt: 1670 Z-score: 1435.0 bits: 275.2 E(32554): 1.3e-73
Smith-Waterman score: 1670; 74.0% identity (91.0% similar) in 334 aa overlap (1-334:1-334)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAELTVEVRGSNGAFYKGFIKDVHEDSLTVVFENNWQPERQVPFNEVRLPPPPDIKKEIS
: ::.::::::::::::.:.:::::::.::.:::::::.::.::..::.::: .:.:.
CCDS55 MEELVVEVRGSNGAFYKAFVKDVHEDSITVAFENNWQPDRQIPFHDVRFPPPVGYNKDIN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 EGDEVEVYSRANDQEPCGWWLAKVRMMKGEFYVIEYAACDATYNEIVTFERLRPVNQNKT
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...: :::.::.:::: :. :::::.:.:: ..:::. :::.:.::::::::::::::.:
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370 380 390 400 410 420
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>>CCDS14682.1 FMR1 gene_id:2332|Hs108|chrX (632 aa)
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10 20 30 40 50 60
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CCDS14 ESDEVEVYSRANEKEPCCWWLAKVRMIKGEFYVIEYAACDATYNEIVTIERLRSVNPNKP
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CCDS14 ATKDTFHKIKLDVPEDLRQMCAKEAAHKDFKKAVGAFSVTYDPENYQLVILSINEVTSKR
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pF1KB8 VNILSDMHLRSIRTKLMLMSRNEEATKHLECTKQLAAAFHEEFVVREDLMGLAIGTHGSN
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CCDS14 AHMLIDMHFRSLRTKLSLIMRNEEASKQLESSRQLASRFHEQFIVREDLMGLAIGTHGAN
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]