Result of FASTA (omim) for
pF1KB8717
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8717, 481 aa
1>>>pF1KB8717 481 - 481 aa - 481 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5541+/-0.00036; mu= 17.6975+/- 0.023
mean_var=84.5122+/-16.722, 0's: 0 Z-trim(115.2): 31 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.139513
statistics sampled from 25554 (25585) to 25554 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.3), width: 16
Scan time: 9.620
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_079501 (OMIM: 609567) patatin-like phospholipas ( 481) 3272 668.5 1.1e-191
XP_016873517 (OMIM: 609059,610717) PREDICTED: pata ( 504) 973 205.8 2.3e-52
NP_065109 (OMIM: 609059,610717) patatin-like phosp ( 504) 973 205.8 2.3e-52
XP_006718328 (OMIM: 609059,610717) PREDICTED: pata ( 597) 963 203.8 1.1e-51
XP_006718329 (OMIM: 609059,610717) PREDICTED: pata ( 597) 963 203.8 1.1e-51
NP_620169 (OMIM: 611589) patatin-like phospholipas ( 429) 805 171.9 3.1e-42
NP_001139189 (OMIM: 612121,615024) patatin-like ph ( 532) 658 142.4 3e-33
XP_011512821 (OMIM: 612121,615024) PREDICTED: pata ( 572) 658 142.4 3.1e-33
XP_011543890 (OMIM: 300102) PREDICTED: patatin-lik ( 253) 539 118.2 2.7e-26
NP_004641 (OMIM: 300102) patatin-like phospholipas ( 253) 539 118.2 2.7e-26
NP_001135861 (OMIM: 300102) patatin-like phospholi ( 253) 539 118.2 2.7e-26
NP_775947 (OMIM: 612121,615024) patatin-like phosp ( 437) 481 106.7 1.4e-22
XP_011512822 (OMIM: 612121,615024) PREDICTED: pata ( 477) 481 106.7 1.5e-22
XP_016866266 (OMIM: 612121,615024) PREDICTED: pata ( 541) 472 105.0 5.6e-22
XP_016866265 (OMIM: 612121,615024) PREDICTED: pata ( 581) 472 105.0 5.9e-22
NP_001166143 (OMIM: 300102) patatin-like phospholi ( 166) 358 81.6 1.8e-15
NP_001139188 (OMIM: 612121,615024) patatin-like ph ( 446) 295 69.3 2.6e-11
XP_016866267 (OMIM: 612121,615024) PREDICTED: pata ( 486) 295 69.3 2.7e-11
NP_001171146 (OMIM: 611589) patatin-like phospholi ( 315) 262 62.5 2e-09
XP_011528261 (OMIM: 611589) PREDICTED: patatin-lik ( 289) 255 61.1 4.9e-09
>>NP_079501 (OMIM: 609567) patatin-like phospholipase do (481 aa)
initn: 3272 init1: 3272 opt: 3272 Z-score: 3562.0 bits: 668.5 E(85289): 1.1e-191
Smith-Waterman score: 3272; 99.8% identity (100.0% similar) in 481 aa overlap (1-481:1-481)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MYDAERGWSLSFAGCGFLGFYHVGATRCLSEHAPHLLRDARMLFGASAGALHCVGVLSGI
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NP_079 MYDAERGWSLSFAGCGFLGFYHVGATRCLSEHAPHLLRDARMLFGASAGALHCVGVLSGI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PLEQTLQVLSDLVRKARSRNIGIFHPSFNLSKFLRQGLCKCLPANVHQLISGKIGISLTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 PLEQTLQVLSDLVRKARSRNIGIFHPSFNLSKFLRQGLCKCLPANVHQLISGKIGISLTR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VSDGENVLVSDFRSKDEVVDALVCSCFIPFYSGLIPPSFRGVRYVDGGVSDNVPFIDAKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 VSDGENVLVSDFRSKDEVVDALVCSCFIPFYSGLIPPSFRGVRYVDGGVSDNVPFIDAKT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TITVSPFYGEYDICPKVKSTNFLHVDITKLSLRLCTGNLYLLSRAFVPPDLKVLGEICLR
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NP_079 TITVSPFYGEYDICPKVKSTNFLHVDITKLSLRLCTGNLYLLSRAFVPPDLKVLGEICLR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 GYLDAFRFLEEKGICNRPQPGLKSSSEGMDPEVAMPSWANMSLDSSPESAALAVRLEGDE
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NP_079 GYLDAFRFLEEKGICNRPQPGLKSSSEGMDPEVAMPSWANMSLDSSPESAALAVRLEGDE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LLDHLRLSILPWDESILDTLSPRLATALSEEMKDKGGYMSKICNLLPIRIMSYVMLPCTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 LLDHLRLSILPWDESILDTLSPRLATALSEEMKDKGGYMSKICNLLPIRIMSYVMLPCTL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 PVESAIAIVQRLVTWLPDMPDDVLWLQWVTSQVFTRVLMCLLPASRSQMPVSSQQASPCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_079 PVESAIAIVQRLVTWLPDMPDDVLWLQWVTSQVFTRVLMCLLPASRSQMPVSSQQASPCT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 PEQDWPCWTPCSPEGCPAETKAEATPRSILRSSLNFFLGNKVPAGAEGLSTFPSFSLEKS
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NP_079 PEQDWPCWTPCSPKGCPAETKAEATPRSILRSSLNFFLGNKVPAGAEGLSTFPSFSLEKS
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 L
:
NP_079 L
>>XP_016873517 (OMIM: 609059,610717) PREDICTED: patatin- (504 aa)
initn: 1172 init1: 957 opt: 973 Z-score: 1061.0 bits: 205.8 E(85289): 2.3e-52
Smith-Waterman score: 1165; 42.8% identity (68.1% similar) in 458 aa overlap (1-456:1-429)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MYDAERGWSLSFAGCGFLGFYHVGATRCLSEHAPHLLRDARMLFGASAGALHCVGVLSGI
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XP_016 MFPREKTWNISFAGCGFLGVYYVGVASCLREHAPFLVANATHIYGASAGALTATALVTGV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PLEQTLQVLSDLVRKARSRNIGIFHPSFNLSKFLRQGLCKCLPANVHQLISGKIGISLTR
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XP_016 CLGEAGAKFIEVSKEARKRFLGPLHPSFNLVKIIRSFLLKVLPADSHEHASGRLGISLTR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VSDGENVLVSDFRSKDEVVDALVCSCFIPFYSGLIPPSFRGVRYVDGGVSDNVPFIDAKT
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XP_016 VSDGENVIISHFNSKDELIQANVCSGFIPVYCGLIPPSLQGVRYVDGGISDNLPLYELKN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TITVSPFYGEYDICPKVKSTNFLHVDITKLSLRLCTGNLYLLSRAFVPPDLKVLGEICLR
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XP_016 TITVSPFSGESDICPQDSSTNIHELRVTNTSIQFNLRNLYRLSKALFPPEPLVLREMCKQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 GYLDAFRFLEEKGICNRPQPGLKSSSEGMDPEVAMPSWANMSLDSSPESAALAVRLEGDE
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XP_016 GYRDGLRFLQRNGLLNRPNPLL-----ALPP--ARPH--------GPEDKDQAV--ESAQ
250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LLDHLRLSILPWDESILDTLSPRLATALSEEMKDKGGYMSKICNLLPIRIMSYVMLPCTL
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XP_016 AEDY---SQLPGEDHILEHLPARLNEALLEACVEPTDLLTTLSNMLPVRLATAMMVPYTL
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410
pF1KB8 PVESAIAIVQRLVTWLPDMPDDVLWLQWVTSQVFTRVLMCLLPASRSQMPVSSQQAS--P
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XP_016 PLESALSFTIRLLEWLPDVPEDIRWMKEQTGSICQYLVM------RAKRKLGRHLPSRLP
350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 CTPEQDWPCWTPCSPEGCPAETKAEATPRSILRSSLNFFLGNKVPAGAEGLSTFPSFSLE
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XP_016 EQVELRRVQSLPSVPLSCAAYR--EALP-GWMRNNLSLGDALAKWEECQRQLLLGLFCTN
400 410 420 430 440 450
480
pF1KB8 KSL
XP_016 VAFPPEALRMRAPADPAPAPADPASPQHQLAGPAPLLSTPAPEARPVIGALGL
460 470 480 490 500
>>NP_065109 (OMIM: 609059,610717) patatin-like phospholi (504 aa)
initn: 1172 init1: 957 opt: 973 Z-score: 1061.0 bits: 205.8 E(85289): 2.3e-52
Smith-Waterman score: 1165; 42.8% identity (68.1% similar) in 458 aa overlap (1-456:1-429)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MYDAERGWSLSFAGCGFLGFYHVGATRCLSEHAPHLLRDARMLFGASAGALHCVGVLSGI
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NP_065 MFPREKTWNISFAGCGFLGVYYVGVASCLREHAPFLVANATHIYGASAGALTATALVTGV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PLEQTLQVLSDLVRKARSRNIGIFHPSFNLSKFLRQGLCKCLPANVHQLISGKIGISLTR
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NP_065 CLGEAGAKFIEVSKEARKRFLGPLHPSFNLVKIIRSFLLKVLPADSHEHASGRLGISLTR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VSDGENVLVSDFRSKDEVVDALVCSCFIPFYSGLIPPSFRGVRYVDGGVSDNVPFIDAKT
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NP_065 VSDGENVIISHFNSKDELIQANVCSGFIPVYCGLIPPSLQGVRYVDGGISDNLPLYELKN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TITVSPFYGEYDICPKVKSTNFLHVDITKLSLRLCTGNLYLLSRAFVPPDLKVLGEICLR
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NP_065 TITVSPFSGESDICPQDSSTNIHELRVTNTSIQFNLRNLYRLSKALFPPEPLVLREMCKQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 GYLDAFRFLEEKGICNRPQPGLKSSSEGMDPEVAMPSWANMSLDSSPESAALAVRLEGDE
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NP_065 GYRDGLRFLQRNGLLNRPNPLL-----ALPP--ARPH--------GPEDKDQAV--ESAQ
250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LLDHLRLSILPWDESILDTLSPRLATALSEEMKDKGGYMSKICNLLPIRIMSYVMLPCTL
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NP_065 AEDY---SQLPGEDHILEHLPARLNEALLEACVEPTDLLTTLSNMLPVRLATAMMVPYTL
290 300 310 320 330 340
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pF1KB8 PVESAIAIVQRLVTWLPDMPDDVLWLQWVTSQVFTRVLMCLLPASRSQMPVSSQQAS--P
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NP_065 PLESALSFTIRLLEWLPDVPEDIRWMKEQTGSICQYLVM------RAKRKLGRHLPSRLP
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pF1KB8 CTPEQDWPCWTPCSPEGCPAETKAEATPRSILRSSLNFFLGNKVPAGAEGLSTFPSFSLE
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NP_065 EQVELRRVQSLPSVPLSCAAYR--EALP-GWMRNNLSLGDALAKWEECQRQLLLGLFCTN
400 410 420 430 440 450
480
pF1KB8 KSL
NP_065 VAFPPEALRMRAPADPAPAPADPASPQHQLAGPAPLLSTPAPEARPVIGALGL
460 470 480 490 500
>>XP_006718328 (OMIM: 609059,610717) PREDICTED: patatin- (597 aa)
initn: 985 init1: 957 opt: 963 Z-score: 1049.0 bits: 203.8 E(85289): 1.1e-51
Smith-Waterman score: 965; 48.5% identity (72.5% similar) in 324 aa overlap (1-324:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MYDAERGWSLSFAGCGFLGFYHVGATRCLSEHAPHLLRDARMLFGASAGALHCVGVLSGI
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XP_006 MFPREKTWNISFAGCGFLGVYYVGVASCLREHAPFLVANATHIYGASAGALTATALVTGV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PLEQTLQVLSDLVRKARSRNIGIFHPSFNLSKFLRQGLCKCLPANVHQLISGKIGISLTR
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XP_006 CLGEAGAKFIEVSKEARKRFLGPLHPSFNLVKIIRSFLLKVLPADSHEHASGRLGISLTR
70 80 90 100 110 120
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pF1KB8 VSDGENVLVSDFRSKDEVVDALVCSCFIPFYSGLIPPSFRGVRYVDGGVSDNVPFIDAKT
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XP_006 VSDGENVIISHFNSKDELIQANVCSGFIPVYCGLIPPSLQGVRYVDGGISDNLPLYELKN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TITVSPFYGEYDICPKVKSTNFLHVDITKLSLRLCTGNLYLLSRAFVPPDLKVLGEICLR
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XP_006 TITVSPFSGESDICPQDSSTNIHELRVTNTSIQFNLRNLYRLSKALFPPEPLVLREMCKQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 GYLDAFRFLEEKGICNRPQPGLKSSSEGMDPEVAMPSWANMSLDSSPESAALAVRLEGDE
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XP_006 GYRDGLRFLQRNGLLNRPNPLL-----ALPP--ARPH--------GPEDKDQAV--ESAQ
250 260 270 280
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pF1KB8 LLDHLRLSILPWDESILDTLSPRLATALSEEMKDKGGYMSKICNLLPIRIMSYVMLPCTL
:. : :: .. ::. : ::
XP_006 AEDY---SQLPGEDHILEHLPARLNEGAHLGDGRGGGEAGGKEREERTVSRGGKPSGSWA
290 300 310 320 330 340
>>XP_006718329 (OMIM: 609059,610717) PREDICTED: patatin- (597 aa)
initn: 985 init1: 957 opt: 963 Z-score: 1049.0 bits: 203.8 E(85289): 1.1e-51
Smith-Waterman score: 965; 48.5% identity (72.5% similar) in 324 aa overlap (1-324:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MYDAERGWSLSFAGCGFLGFYHVGATRCLSEHAPHLLRDARMLFGASAGALHCVGVLSGI
:. :. :..::::::::: :.::.. :: :::: :. .: ..::::::: .....:.
XP_006 MFPREKTWNISFAGCGFLGVYYVGVASCLREHAPFLVANATHIYGASAGALTATALVTGV
10 20 30 40 50 60
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pF1KB8 PLEQTLQVLSDLVRKARSRNIGIFHPSFNLSKFLRQGLCKCLPANVHQLISGKIGISLTR
: .. . .. ..::.: .: .:::::: :..:. : : :::. :. ::..::::::
XP_006 CLGEAGAKFIEVSKEARKRFLGPLHPSFNLVKIIRSFLLKVLPADSHEHASGRLGISLTR
70 80 90 100 110 120
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pF1KB8 VSDGENVLVSDFRSKDEVVDALVCSCFIPFYSGLIPPSFRGVRYVDGGVSDNVPFIDAKT
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XP_006 VSDGENVIISHFNSKDELIQANVCSGFIPVYCGLIPPSLQGVRYVDGGISDNLPLYELKN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TITVSPFYGEYDICPKVKSTNFLHVDITKLSLRLCTGNLYLLSRAFVPPDLKVLGEICLR
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XP_006 TITVSPFSGESDICPQDSSTNIHELRVTNTSIQFNLRNLYRLSKALFPPEPLVLREMCKQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 GYLDAFRFLEEKGICNRPQPGLKSSSEGMDPEVAMPSWANMSLDSSPESAALAVRLEGDE
:: :..:::...:. :::.: : .. : : : .::. :: :. .
XP_006 GYRDGLRFLQRNGLLNRPNPLL-----ALPP--ARPH--------GPEDKDQAV--ESAQ
250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LLDHLRLSILPWDESILDTLSPRLATALSEEMKDKGGYMSKICNLLPIRIMSYVMLPCTL
:. : :: .. ::. : ::
XP_006 AEDY---SQLPGEDHILEHLPARLNEGAHLGDGRGGGEAGGKEREERTVSRGGKPSGSWA
290 300 310 320 330 340
>>NP_620169 (OMIM: 611589) patatin-like phospholipase do (429 aa)
initn: 977 init1: 786 opt: 805 Z-score: 879.2 bits: 171.9 E(85289): 3.1e-42
Smith-Waterman score: 968; 38.0% identity (67.2% similar) in 424 aa overlap (5-422:6-415)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MYDAERG-WSLSFAGCGFLGFYHVGATRCLSEHAPHLLRDARMLFGASAGALHCVGVLS
:.: :.:::.: :.:: .:::::.:: ..::.::. :: ..:.:.:::. :...
NP_620 MGFLEEEGRWNLSFSGAGYLGAHHVGATECLRQRAPRLLQGARRIYGSSSGALNAVSIVC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 GIPLEQTLQVLSDLVRKARSRNIGIFHPSFNLSKFLRQGLCKCLPANVHQLISGKIGISL
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NP_620 GKSVDFCCSHLLGMVGQLERLSLSILHPAYAPIEHVKQQLQDALPPDAHVLASQRLGISL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 TRVSDGENVLVSDFRSKDEVVDALVCSCFIPFYSGLIPPSFRGVRYVDGGVSDNVPFIDA
:: ::.: ::.:: . ::...::::. ..::: ::::: ::: ::.::..:.:.:: :
NP_620 TRWPDGRNFLVTDFATCDELIQALVCTLYFPFYCGLIPPEFRGERYIDGALSNNLPFADC
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 KTTITVSPFYGEYDICPKVKSTNFLHVDITKLSLRLCTGNLYLLSRAFVPPDLKVLGEIC
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NP_620 PSTITVSPFHGTVDICPQSTSPNLHELNVFNFSFQISTENFFLGLICLIPPSLEVVADNC
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 LRGYLDAFRFLEEKGICNRPQPGLKSSSEGMDPEVAMPSWANMSLDSSPESAALAVRLEG
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NP_620 RQGYLDALRFLERRGLTKEPVLWTLVSKE--PPAPADGNW-DAGCDQRWKGG-----LSL
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 DELLDHLRLSILPWDESILDTLSPRLATALSEEMKDKGGYMSKICNLLPIRIMSYVMLPC
. . :.... .: .. :::.: .::.. . ... . : ....:..:::
NP_620 NWKVPHVQVKDVP----NFEQLSPELEAALKKACTRDPSRWARFWHSGPGQVLTYLLLPC
300 310 320 330 340
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pF1KB8 TLPVESAIAIVQRLVTWLPDMPDDVLWLQWVTS----QVFTRVLMCLL-PASRSQMPVSS
::: : .:::.::::.: :. :.: . .::.:. :: : : :
NP_620 TLPFEYIYFRSRRLVVWLPDVPADLWWMQGLLRNMALEVFSRTKAQLLGPISPPATRV--
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 QQASPCTPEQDWPCWTPCSPEGCPAETKAEATPRSILRSSLNFFLGNKVPAGAEGLSTFP
..:: :.
NP_620 LETSPLQPQIAPHREELGPTHQA
410 420
>>NP_001139189 (OMIM: 612121,615024) patatin-like phosph (532 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB8 MYDAERGWSLSFAGCGFLGFYHVGATRCLSEHAPHLLRDARMLFGASAGALHCV
: . :.::.: :::.::..::. : . ::..:. :. . :.::::. .
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pF1KB8 GVLSGIPLEQTLQVLSDLVRKARSRNIGIFHPSFNLSKFLRQGLCKCLPANVHQLISGKI
.. :: ... :.::. : .... .: . :: .. ...:: : . :: . ... .::.
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pF1KB8 GISLTRVSDGENVLVSDFRSKDEVVDALVCSCFIPFYSGLIPPSFRGVRYVDGGVSDNVP
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pF1KB8 FIDAKTTITVSPFYGEYDICPKVKSTNFLHVDITKLSLRLCTGNLYLLSRAFVPPDLKVL
.::.: : :. ::::. . : . . :... :. ...:. :::: .:
NP_001 CAFWTDAITISTFSGQQDICPRDCPAIFHDFRMFNCSFQFSLENIARMTHALFPPDLVIL
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pF1KB8 GEICLRGYLDAFRFLEEKGICNRPQPGLKSSSEGMD-PEVAMPSWANMSL-DSSPESAAL
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pF1KB8 AVRLEGDELLDHLRLSILPWDESILDTLSPRLATALSEEMKDKGGYMSKICNLLPIRIMS
..: . :. . : : . :. .. ..: .:. . : . :
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pF1KB8 YVMLPCTLPVESAIAIVQRLVTWLPDMPDDVLWLQWVTSQVFTRVLMCLLPASRSQMPVS
: : . :.:. : : :.. : : :. . : : . :..:.
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pF1KB8 SQQASPCTPEQDWPCWTPCSPEGCPAET---KAEATPRSILRSSLNFFLGNKVPAGAEGL
:: .:.:. .: : ::.. .: ..:: : : .: .:
NP_001 PPGLSPLSPQQQ------VQPSGSPARSLHSQAPTSPRPSLGPST---VGAPQTLPRSSL
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470 480
pF1KB8 STFPSFSLEKSL
:.::.
NP_001 SAFPAQPPVEELGQEQPQAVALLVSSKPKSAVPLVHVKETVSKPYVTESPAEDSNWVNKV
450 460 470 480 490 500
>>XP_011512821 (OMIM: 612121,615024) PREDICTED: patatin- (572 aa)
initn: 672 init1: 646 opt: 658 Z-score: 717.5 bits: 142.4 E(85289): 3.1e-33
Smith-Waterman score: 677; 31.2% identity (57.4% similar) in 477 aa overlap (3-474:9-448)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MYDAERGWSLSFAGCGFLGFYHVGATRCLSEHAPHLLRDARMLFGASAGALHCV
: . :.::.: :::.::..::. : . ::..:. :. . :.::::. .
XP_011 MEEQVFKGDPDTPHSISFSGSGFLSFYQAGAVDALRDLAPRMLETAHRFAGTSAGAVIAA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 GVLSGIPLEQTLQVLSDLVRKARSRNIGIFHPSFNLSKFLRQGLCKCLPANVHQLISGKI
.. :: ... :.::. : .... .: . :: .. ...:: : . :: . ... .::.
XP_011 LAICGIEMDEYLRVLNVGVAEVKKSFLGPLSPSCKMVQMMRQFLYRVLPEDSYKVTTGKL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 GISLTRVSDGENVLVSDFRSKDEVVDALVCSCFIPFYSGLIPPSFRGVRYVDGGVSDNVP
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XP_011 HVSLTRLTDGENVVVSEFTSKEELIEALYCSCFVPVYCGLIPPTYRGVRYIDGGFTGMQP
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180 190 200 210 220 230
pF1KB8 FIDAKTTITVSPFYGEYDICPKVKSTNFLHVDITKLSLRLCTGNLYLLSRAFVPPDLKVL
.::.: : :. ::::. . : . . :... :. ...:. :::: .:
XP_011 CAFWTDAITISTFSGQQDICPRDCPAIFHDFRMFNCSFQFSLENIARMTHALFPPDLVIL
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240 250 260 270 280 290
pF1KB8 GEICLRGYLDAFRFLEEKGICNRPQPGLKSSSEGMD-PEVAMPSWANMSL-DSSPESAAL
. ::: :: .:.. . :.:::. . :.: . ...: . :: .
XP_011 HDYYYRGYEDAVLYLRRLNAVY-----LNSSSKRVIFPRVEVYCQIELALGNECPERSQP
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 AVRLEGDELLDHLRLSILPWDESILDTLSPRLATALSEEMKDKGGYMSKICNLLPIRIMS
..: . :. . : : . :. .. ..: .:. . : . :
XP_011 SLRARQAS----LEGATQPHKEWV-----PK-----GDGRGSHGPPVSQPVQTLEFTCES
300 310 320 330 340
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pF1KB8 YVMLPCTLPVESAIAIVQRLVTWLPDMPDDVLWLQWVTSQVFTRVLMCLLPASRSQMPVS
: : . :.:. : : :.. : : :. . : : . :..:.
XP_011 PVSAPVS-PLEQPPA--QPLASSTP------LSLSGMPPVSFPAVHKPPSSTPGSSLPTP
350 360 370 380 390
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pF1KB8 SQQASPCTPEQDWPCWTPCSPEGCPAET---KAEATPRSILRSSLNFFLGNKVPAGAEGL
:: .:.:. .: : ::.. .: ..:: : : .: .:
XP_011 PPGLSPLSPQQQ------VQPSGSPARSLHSQAPTSPRPSLGPST---VGAPQTLPRSSL
400 410 420 430 440
470 480
pF1KB8 STFPSFSLEKSL
:.::.
XP_011 SAFPAQPPVEELGQEQPQAVALLVSSKPKSAVPLVHVKETVSKPYVTESPAEDSNWVNKV
450 460 470 480 490 500
>>XP_011543890 (OMIM: 300102) PREDICTED: patatin-like ph (253 aa)
initn: 506 init1: 358 opt: 539 Z-score: 593.0 bits: 118.2 E(85289): 2.7e-26
Smith-Waterman score: 539; 35.0% identity (70.0% similar) in 243 aa overlap (9-249:5-246)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MYDAERGWSLSFAGCGFLGFYHVGATRCLSEHAPHLLRDARMLFGASAGALHCVGVLSGI
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XP_011 MKHINLSFAACGFLGIYHLGAASALCRHGKKLVKDVKAFAGASAGSL-VASVLLTA
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pF1KB8 P--LEQTLQVLSDLVRKARSRNIGIFHPSFNLSKFLRQGLCKCLPANVHQLISGKIGISL
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XP_011 PEKIEECNQFTYKFAEEIRRQSFGAVTPGYDFMARLRSGMESILPPSAHELAQNRLHVSI
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pF1KB8 TRVSDGENVLVSDFRSKDEVVDALVCSCFIPFYSGLIPPSFRGVRYVDGGVSDNVPFIDA
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XP_011 TNAKTRENHLVSTFSSREDLIKVLLASSFVPIYAGLKLVEYKGQKWVDGGLTNALPILPV
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pF1KB8 KTTITVSPFYGEYDICPKVKSTNFLHVDITKLSLRLCTGNLYLLSRAFVPPDLKVLGEIC
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XP_011 GRTVTISPFSGRLDISPQDKGQLDLYVNIAKQDIMLSLANLVRLNQALFPPSKRKMESLY
180 190 200 210 220 230
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pF1KB8 LRGYLDAFRFLEEKGICNRPQPGLKSSSEGMDPEVAMPSWANMSLDSSPESAALAVRLEG
:. :. .::
XP_011 QCGFDDTVKFLLKENWFE
240 250
>>NP_004641 (OMIM: 300102) patatin-like phospholipase do (253 aa)
initn: 506 init1: 358 opt: 539 Z-score: 593.0 bits: 118.2 E(85289): 2.7e-26
Smith-Waterman score: 539; 35.0% identity (70.0% similar) in 243 aa overlap (9-249:5-246)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MYDAERGWSLSFAGCGFLGFYHVGATRCLSEHAPHLLRDARMLFGASAGALHCVGVLSGI
.::::.:::::.::.::. : .:. .:..:.. . :::::.: ..::
NP_004 MKHINLSFAACGFLGIYHLGAASALCRHGKKLVKDVKAFAGASAGSL-VASVLLTA
10 20 30 40 50
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pF1KB8 P--LEQTLQVLSDLVRKARSRNIGIFHPSFNLSKFLRQGLCKCLPANVHQLISGKIGISL
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NP_004 PEKIEECNQFTYKFAEEIRRQSFGAVTPGYDFMARLRSGMESILPPSAHELAQNRLHVSI
60 70 80 90 100 110
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pF1KB8 TRVSDGENVLVSDFRSKDEVVDALVCSCFIPFYSGLIPPSFRGVRYVDGGVSDNVPFIDA
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NP_004 TNAKTRENHLVSTFSSREDLIKVLLASSFVPIYAGLKLVEYKGQKWVDGGLTNALPILPV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 KTTITVSPFYGEYDICPKVKSTNFLHVDITKLSLRLCTGNLYLLSRAFVPPDLKVLGEIC
:.:.::: :. :: :. :. :.:.:.: .. : .:: :..:. ::. . . .
NP_004 GRTVTISPFSGRLDISPQDKGQLDLYVNIAKQDIMLSLANLVRLNQALFPPSKRKMESLY
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 LRGYLDAFRFLEEKGICNRPQPGLKSSSEGMDPEVAMPSWANMSLDSSPESAALAVRLEG
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NP_004 QCGFDDTVKFLLKENWFE
240 250
481 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 14:52:17 2016 done: Fri Nov 4 14:52:18 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]