Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8721
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8721, 557 aa
1>>>pF1KB8721 557 - 557 aa - 557 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2741+/-0.000742; mu= 19.2000+/- 0.045
mean_var=71.8194+/-14.344, 0's: 0 Z-trim(109.1): 35 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.151340
statistics sampled from 10633 (10665) to 10633 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.699), E-opt: 0.2 (0.328), width: 16
Scan time: 3.540
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13738.1 CCT8L2 gene_id:150160|Hs108|chr22 ( 557) 3645 805.1 0
CCDS33528.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 ( 548) 917 209.4 9e-54
CCDS68181.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 ( 529) 913 208.5 1.6e-53
CCDS68180.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 ( 475) 822 188.6 1.4e-47
CCDS8991.1 CCT2 gene_id:10576|Hs108|chr12 ( 535) 525 123.8 5.1e-28
CCDS55843.1 CCT2 gene_id:10576|Hs108|chr12 ( 488) 485 115.1 2e-25
CCDS54367.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 499) 423 101.5 2.5e-21
CCDS46336.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 543) 406 97.9 3.4e-20
CCDS82990.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 448) 393 95.0 2.1e-19
CCDS82989.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 486) 393 95.0 2.3e-19
CCDS3877.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 541) 359 87.6 4.2e-17
CCDS82988.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 520) 358 87.4 4.8e-17
CCDS54366.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 456) 354 86.4 7.8e-17
CCDS77996.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 503) 352 86.0 1.1e-16
CCDS30888.1 CCT3 gene_id:7203|Hs108|chr1 ( 507) 349 85.4 1.8e-16
CCDS58711.1 CCT4 gene_id:10575|Hs108|chr2 ( 509) 305 75.8 1.4e-13
CCDS1140.2 CCT3 gene_id:7203|Hs108|chr1 ( 545) 299 74.5 3.7e-13
CCDS34640.1 CCT6A gene_id:908|Hs108|chr7 ( 486) 298 74.2 4e-13
CCDS5523.1 CCT6A gene_id:908|Hs108|chr7 ( 531) 298 74.3 4.2e-13
CCDS54105.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 ( 485) 283 71.0 3.8e-12
CCDS5269.1 TCP1 gene_id:6950|Hs108|chr6 ( 556) 282 70.8 5e-12
CCDS42696.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 339) 271 68.2 1.8e-11
CCDS33206.1 CCT4 gene_id:10575|Hs108|chr2 ( 539) 263 66.6 8.6e-11
>>CCDS13738.1 CCT8L2 gene_id:150160|Hs108|chr22 (557 aa)
initn: 3645 init1: 3645 opt: 3645 Z-score: 4297.8 bits: 805.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3645; 99.8% identity (99.8% similar) in 557 aa overlap (1-557:1-557)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDSTVPSALELPQRLALNPRESPRSPEEEEPHLLSSLAAVQTLASVIRPCYGPHGRQKFL
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CCDS13 MDSTVPSALELPQRLALNPRESPRSPEEEEPHLLSSLAAVQTLASVIRPCYGPHGRQKFL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 VTMKGETVCTGCATAILRALELEHPAAWLLREAGQTQAENSGDGTAFVVLLTEALLEQAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VTMKGETVCTGCATAILRALELEHPAAWLLREAGQTQAENSGDGTAFVVLLTEALLEQAE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 QLLKAGLPRPQLREAYATATAEVLATLPSLAIQSLGPLEDPSWALHSVMNTHTLSPMDHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QLLKAGLPRPQLREAYATATAEVLATLPSLAIQSLGPLEDPSWALHSVMNTHTLSPMDHL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TKLVAHACWAIKELDGSFKPERVGVCALPGGTLEDSCLLPGLAISGKLCGQMATVLSGAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TKLVAHACWAIKELDGSFKPERVGVCALPGGTLEDSCLLPGLAISGKLCGQMATVLSGAR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 VALFACPFGPAHPNAPATARLSSPADLAQFSKGSDQLLEKQVGQLAAAGINVAVVLGEVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VALFACPFGPAHPNAPATARLSSPADLAQFSKGSDQLLEKQVGQLAAAGINVAVVLGEVD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 EETLTLADKYGIVVIQARSRMEIIYLSEVLDTPLLPRLLPPQRPGKCQRVYRQELGDGLA
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CCDS13 EETLTLADKYGIVVIQARSWMEIIYLSEVLDTPLLPRLLPPQRPGKCQRVYRQELGDGLA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 VVFEWECTGTPALTVVLRGATTQGLRSAEQAVYHGIDAYFQLCQDPRLIPGAGATEMALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VVFEWECTGTPALTVVLRGATTQGLRSAEQAVYHGIDAYFQLCQDPRLIPGAGATEMALA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 KMLSDKGSRLEGPSGPAFLAFAWALKYLPKTLAENAGLAVSDVMAEMSGVHQGGNLLMGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KMLSDKGSRLEGPSGPAFLAFAWALKYLPKTLAENAGLAVSDVMAEMSGVHQGGNLLMGV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 GTEGIINVAQEGVWDTLIVKAQGFRAVAEVVLQLVTVDEIVVAKKSPTHQEIWNPDSKKT
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CCDS13 GTEGIINVAQEGVWDTLIVKAQGFRAVAEVVLQLVTVDEIVVAKKSPTHQEIWNPDSKKT
490 500 510 520 530 540
550
pF1KB8 KKHPPPVETKKILGLNN
:::::::::::::::::
CCDS13 KKHPPPVETKKILGLNN
550
>>CCDS33528.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 (548 aa)
initn: 852 init1: 318 opt: 917 Z-score: 1078.9 bits: 209.4 E(32554): 9e-54
Smith-Waterman score: 934; 32.0% identity (64.7% similar) in 547 aa overlap (5-536:5-545)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDSTVPSALELPQRLALNPRESPRSPEEEEPHLLSSLAAVQTLASVIRPCYGPHGRQKFL
::.: . : : .:. . : . .. : . ::.. : :::.: .:..
CCDS33 MALHVPKAPGFAQML----KEGAKHFSGLEEAVYRNIQACKELAQTTRTAYGPNGMNKMV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 VTMKGETVCTGCATAILRALELEHPAAWLLREAGQTQAENSGDGTAFVVLLTEALLEQAE
.. . :. :..::: ::..:::: .. :.. : .. :::: ::.... :::: ::
CCDS33 INHLEKLFVTNDAATILRELEVQHPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVFAGALLELAE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB8 QLLKAGLPRPQLREAYATATAEVLATLPSLAIQSLGPLEDPSWALHSVMNTHTLSPMD--
.::. :: .. :.: : .. ::.:. : :.: . . :.. : .: .
CCDS33 ELLRIGLSVSEVIEGYEIACRKAHEILPNLVCCSAKNLRDID-EVSSLLRTSIMSKQYGN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 --HLTKLVAHACWAIKELDGSFKPERVGVCALPGGTLEDSCLLPGLAISGKLCGQMATVL
:.::.:.:: .: .: :. . . :: . :. . .: .: :.... . :....:
CCDS33 EVFLAKLIAQACVSIFPDSGHFNVDNIRVCKILGSGISSSSVLHGMVFKKETEGDVTSV-
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 SGARVALFACPFGPAHPNAPATARLSSPADLAQFSKGSDQLLEKQVGQLAAAGINVAVVL
. :..:...::: .. .:. ... .: .:::: ..:.. :: .: .: ::.:.
CCDS33 KDAKIAVYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGANVVVTG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 GEVDEETLTLADKYGIVVIQARSRMEIIYLSEVLDTPLLPRLLPP--QRPGKCQRVYRQE
:.: . .: :.::.:.... :. .. : ... . :::: :: .. :.:. :: .:
CCDS33 GKVADMALHYANKYNIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLEEMGHCDSVYLSE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 LGDGLAVVFEWECTGTPALTVVLRGATTQGLRSAEQAVYHGIDAYFQLCQDPRLIPGAGA
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CCDS33 VGDTQVVVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAVDDGVNTFKVLTRDKRLVPGGGA
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 TEMALAKMLSDKGSRLEGPSGPAFLAFAWALKYLPKTLAENAGLAVSDVMAEMSGVHQGG
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CCDS33 TEIELAKQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKANEVISKLYAVHQEG
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520
pF1KB8 NLLMGVGTEG----IINVAQEGVWDTLIVKAQGFRAVAEVVLQLVTVDEIVVAK-----K
: .:. :. . .. . :. :: . : ... ...... .. ::.:..:: :
CCDS33 NKNVGLDIEAEVPAVKDMLEAGILDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIMAKPAGGPK
480 490 500 510 520 530
530 540 550
pF1KB8 SPTHQEIWNPDSKKTKKHPPPVETKKILGLNN
:. .. :. :
CCDS33 PPSGKKDWDDDQND
540
>>CCDS68181.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 (529 aa)
initn: 852 init1: 318 opt: 913 Z-score: 1074.4 bits: 208.5 E(32554): 1.6e-53
Smith-Waterman score: 930; 32.4% identity (65.7% similar) in 522 aa overlap (30-536:7-526)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDSTVPSALELPQRLALNPRESPRSPEEEEPHLLSSLAAVQTLASVIRPCYGPHGRQKFL
: . .. : . ::.. : :::.: .:..
CCDS68 MHFSGLEEAVYRNIQACKELAQTTRTAYGPNGMNKMV
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 VTMKGETVCTGCATAILRALELEHPAAWLLREAGQTQAENSGDGTAFVVLLTEALLEQAE
.. . :. :..::: ::..:::: .. :.. : .. :::: ::.... :::: ::
CCDS68 INHLEKLFVTNDAATILRELEVQHPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVFAGALLELAE
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170
pF1KB8 QLLKAGLPRPQLREAYATATAEVLATLPSLAIQSLGPLEDPSWALHSVMNTHTLSPMD--
.::. :: .. :.: : .. ::.:. : :.: . . :.. : .: .
CCDS68 ELLRIGLSVSEVIEGYEIACRKAHEILPNLVCCSAKNLRDID-EVSSLLRTSIMSKQYGN
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 --HLTKLVAHACWAIKELDGSFKPERVGVCALPGGTLEDSCLLPGLAISGKLCGQMATVL
:.::.:.:: .: .: :. . . :: . :. . .: .: :.... . :....:
CCDS68 EVFLAKLIAQACVSIFPDSGHFNVDNIRVCKILGSGISSSSVLHGMVFKKETEGDVTSV-
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 SGARVALFACPFGPAHPNAPATARLSSPADLAQFSKGSDQLLEKQVGQLAAAGINVAVVL
. :..:...::: .. .:. ... .: .:::: ..:.. :: .: .: ::.:.
CCDS68 KDAKIAVYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGANVVVTG
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 GEVDEETLTLADKYGIVVIQARSRMEIIYLSEVLDTPLLPRLLPP--QRPGKCQRVYRQE
:.: . .: :.::.:.... :. .. : ... . :::: :: .. :.:. :: .:
CCDS68 GKVADMALHYANKYNIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLEEMGHCDSVYLSE
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 LGDGLAVVFEWECTGTPALTVVLRGATTQGLRSAEQAVYHGIDAYFQLCQDPRLIPGAGA
.:: .:::. : :.::::.: . . . :.:: :.... : .: ::.::.::
CCDS68 VGDTQVVVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAVDDGVNTFKVLTRDKRLVPGGGA
340 350 360 370 380 390
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pF1KB8 TEMALAKMLSDKGSRLEGPSGPAFLAFAWALKYLPKTLAENAGLAVSDVMAEMSGVHQGG
::. :::.... : : :. :: :.. .:..::::.:. ...:.... .::: :
CCDS68 TEIELAKQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKANEVISKLYAVHQEG
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520
pF1KB8 NLLMGVGTEG----IINVAQEGVWDTLIVKAQGFRAVAEVVLQLVTVDEIVVAK-----K
: .:. :. . .. . :. :: . : ... ...... .. ::.:..:: :
CCDS68 NKNVGLDIEAEVPAVKDMLEAGILDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIMAKPAGGPK
460 470 480 490 500 510
530 540 550
pF1KB8 SPTHQEIWNPDSKKTKKHPPPVETKKILGLNN
:. .. :. :
CCDS68 PPSGKKDWDDDQND
520
>>CCDS68180.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 (475 aa)
initn: 761 init1: 318 opt: 822 Z-score: 967.6 bits: 188.6 E(32554): 1.4e-47
Smith-Waterman score: 839; 32.3% identity (66.0% similar) in 470 aa overlap (82-536:5-472)
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 GPHGRQKFLVTMKGETVCTGCATAILRALELEHPAAWLLREAGQTQAENSGDGTAFVVLL
..:::: .. :.. : .. :::: ::...
CCDS68 MDQMVQHPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVF
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 TEALLEQAEQLLKAGLPRPQLREAYATATAEVLATLPSLAIQSLGPLEDPSWALHSVMNT
. :::: ::.::. :: .. :.: : .. ::.:. : :.: . . :.. :
CCDS68 AGALLELAEELLRIGLSVSEVIEGYEIACRKAHEILPNLVCCSAKNLRDID-EVSSLLRT
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220
pF1KB8 HTLSPMD----HLTKLVAHACWAIKELDGSFKPERVGVCALPGGTLEDSCLLPGLAISGK
.: . :.::.:.:: .: .: :. . . :: . :. . .: .: :.... .
CCDS68 SIMSKQYGNEVFLAKLIAQACVSIFPDSGHFNVDNIRVCKILGSGISSSSVLHGMVFKKE
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 LCGQMATVLSGARVALFACPFGPAHPNAPATARLSSPADLAQFSKGSDQLLEKQVGQLAA
:....: . :..:...::: .. .:. ... .: .:::: ..:.. :: .:
CCDS68 TEGDVTSV-KDAKIAVYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIAD
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 AGINVAVVLGEVDEETLTLADKYGIVVIQARSRMEIIYLSEVLDTPLLPRLLPP--QRPG
.: ::.:. :.: . .: :.::.:.... :. .. : ... . :::: :: .. :
CCDS68 TGANVVVTGGKVADMALHYANKYNIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLEEMG
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 KCQRVYRQELGDGLAVVFEWECTGTPALTVVLRGATTQGLRSAEQAVYHGIDAYFQLCQD
.:. :: .:.:: .:::. : :.::::.: . . . :.:: :.... : .:
CCDS68 HCDSVYLSEVGDTQVVVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAVDDGVNTFKVLTRD
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 PRLIPGAGATEMALAKMLSDKGSRLEGPSGPAFLAFAWALKYLPKTLAENAGLAVSDVMA
::.::.::::. :::.... : : :. :: :.. .:..::::.:. ...:..
CCDS68 KRLVPGGGATEIELAKQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKANEVIS
340 350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KB8 EMSGVHQGGNLLMGVGTEG----IINVAQEGVWDTLIVKAQGFRAVAEVVLQLVTVDEIV
.. .::: :: .:. :. . .. . :. :: . : ... ...... .. ::.:.
CCDS68 KLYAVHQEGNKNVGLDIEAEVPAVKDMLEAGILDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQII
400 410 420 430 440 450
530 540 550
pF1KB8 VAK-----KSPTHQEIWNPDSKKTKKHPPPVETKKILGLNN
.:: : :. .. :. :
CCDS68 MAKPAGGPKPPSGKKDWDDDQND
460 470
>>CCDS8991.1 CCT2 gene_id:10576|Hs108|chr12 (535 aa)
initn: 368 init1: 220 opt: 525 Z-score: 616.4 bits: 123.8 E(32554): 5.1e-28
Smith-Waterman score: 525; 25.4% identity (59.3% similar) in 523 aa overlap (27-530:19-533)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDSTVPSALELPQRLALNPRESPRSPEEEEPHLLSSLAAVQTLASVIRPCYGPHGRQKFL
:. : :.:. .. ....... ::.: .:.:
CCDS89 MASLSLAPVNIFKAGADEERAETARLTSFIGAIAIGDLVKSTLGPKGMDKIL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB8 VTMKGET--VCTGCATAILRALELEHPAAWLLREAGQTQAENSGDGTAFVVLLTEALLEQ
.. .. . :. ...::. . ...::: .: . ...: .. ::::. :..:. ::..
CCDS89 LSSGRDASLMVTNDGATILKNIGVDNPAAKVLVDMSRVQDDEVGDGTTSVTVLAAELLRE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 AEQLLKAGLPRPQL-----REAYATATAEVLATLPSLAIQSLGPLEDPSWALHSVMNTHT
::.:. . .:: ::: .: .:.. . . . . .: ......
CCDS89 AESLIAKKI-HPQTIIAGWREATKAAREALLSSAVDHGSDEVKFRQDLMNIAGTTLSSKL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 LSPM-DHLTKLVAHACWAIKELDGSFKPERVGVCALPGGTLEDSCLLPGLAISGKLCGQM
:. ::.::: : :. .: :: . : . . ::.: :: : :. .. :. ..
CCDS89 LTHHKDHFTKL---AVEAVLRLKGSGNLEAIHIIKKLGGSLADSYLDEGFLLDKKIGVNQ
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 ATVLSGARVALFACPFGPAHPNAPAT-ARLSSPADLAQFSKGSDQLLEKQVGQLAAAGIN
. .:.. . . . . .. .:..: : .:.. .. . ....: .. :::
CCDS89 PKRIENAKILIANTGMDTDKIKIFGSRVRVDSTAKVAEIEHAEKEKMKEKVERILKHGIN
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300 310 320 330 340
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:. . . .:. . : : : :.:::::: : : ::.... .. . : .:
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: . :.: .:: .:. ... ..: : . :. ..: ::..:: .:.::: .:..:.
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. ..:. :: :. :: : ..: :. ... :: : . ..::.. .. ::.:. :
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530
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.:::.. : .. .:.... .: . .. .. :.:: :: :.:.: : . . : .
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CCDS54 VWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDETIKNPRSTVDAPTAAGRGRGRGRPH
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. ..::. . . : :. . : . . ..: .. .. .: .:
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CCDS46 ARHAQGGTWYGVDINNEDIADNFEAFVWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDETIKNPRS
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CCDS46 TVDAPTAAGRGRGRGRPH
530 540
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557 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]