FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8724, 527 aa
1>>>pF1KB8724 527 - 527 aa - 527 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0156+/-0.00125; mu= 14.7193+/- 0.075
mean_var=70.7968+/-14.070, 0's: 0 Z-trim(101.2): 50 B-trim: 82 in 1/47
Lambda= 0.152429
statistics sampled from 6352 (6401) to 6352 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.556), E-opt: 0.2 (0.197), width: 16
Scan time: 2.980
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS11012.1 SERPINF1 gene_id:5176|Hs108|chr17 ( 418) 395 96.6 6.1e-20
CCDS42442.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 242) 366 90.1 3.1e-18
CCDS53870.1 SERPINE3 gene_id:647174|Hs108|chr13 ( 424) 351 86.9 5e-17
CCDS62460.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 192) 332 82.6 4.4e-16
CCDS7962.1 SERPING1 gene_id:710|Hs108|chr11 ( 500) 317 79.4 1e-14
>>CCDS13783.1 SERPIND1 gene_id:3053|Hs108|chr22 (499 aa)
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Smith-Waterman score: 3272; 100.0% identity (100.0% similar) in 499 aa overlap (29-527:1-499)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MWMLQRGVDQPGRLSLCSVFPPSFSSAKMKHSLNALLIFLIITSAWGGSKGPLDQLEKGG
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MKHSLNALLIFLIITSAWGGSKGPLDQLEKGG
10 20 30
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ETAQSADPQWEQLNNKNLSMPLLPADFHKENTVTNDWIPEGEEDDDYLDLEKIFSEDDDY
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IDIVDSLSVSPTDSDVSAGNILQLFHGKSRIQRLNILNAKFAFNLYRVLKDQVNTFDNIF
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IAPVGISTAMGMISLGLKGETHEQVHSILHFKDFVNASSKYEITTIHNLFRKLTHRLFRR
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 NFGYTLRSVNDLYIQKQFPILLDFKTKVREYYFAEAQIADFSDPAFISKTNNHIMKLTKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NFGYTLRSVNDLYIQKQFPILLDFKTKVREYYFAEAQIADFSDPAFISKTNNHIMKLTKG
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LIKDALENIDPATQMMILNCIYFKGSWVNKFPVEMTHNHNFRLNEREVVKVSMMQTKGNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LIKDALENIDPATQMMILNCIYFKGSWVNKFPVEMTHNHNFRLNEREVVKVSMMQTKGNF
280 290 300 310 320 330
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LLPKFKLEKNYNLVESLKLMGIRMLFDKNGNMAGISDQRIAIDLFKHQGTITVNEEGTQA
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TTVTTVGFMPLSTQVRFTVDRPFLFLIYEHRTSCLLFMGRVANPSRS
460 470 480 490
>>CCDS41982.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 (435 aa)
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Smith-Waterman score: 725; 35.9% identity (69.7% similar) in 379 aa overlap (157-527:65-435)
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LSVSPTDSDVSAGNILQLFHGKSRIQRLNILNAKFAFNLYRVLKDQVNTFDNIFIAPVGI
::. ::: ::: : .. . .:::..::..
CCDS41 PIYCVSPANAPSAYPRPSSTKSTPASQVYSLNTDFAFRLYRRLVLETPS-QNIFFSPVSV
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190 200 210 220 230 240
pF1KB8 STAMGMISLGLKGETHEQVHSILHFKDFVNASSKYEITTIHNLFRKLTHRLFRRNFGYTL
::...:.::: .. :. :. . : : : . : ..::. :..:.: : . ::
CCDS41 STSLAMLSLGAHSVTKTQILQGLGF----NLTHTPE-SAIHQGFQHLVHSLTVPSKDLTL
100 110 120 130 140
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 RSVNDLYIQKQFPILLDFKTKVREYYFAEAQIADFSDPAFI-SKTNNHIMKLTKGLIKDA
. . :...:.. . .: .:.. : ::. .:::.:.. .. :.:. : :.: . :
CCDS41 KMGSALFVKKELQLQANFLGNVKRLYEAEVFSTDFSNPSIAQARINSHVKKKTQGKVVDI
150 160 170 180 190 200
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LENIDPATQMMILNCIYFKGSWVNKFPVEMTH-NHNFRLNEREVVKVSMMQTKGNFLAAN
....: : :...: :.::..: . : :.:. : : ..:. .:.: ::. : .: .
CCDS41 IQGLDLLTAMVLVNHIFFKAKWEKPFHPEYTRKNFPFLVGEQVTVHVPMMHQKEQFAFGV
210 220 230 240 250 260
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 DQELDCDILQLEYVGGISMLIVVPHKMSGMKTLEAQLTPRVVERWQKSMTNRTREVLLPK
: ::.: .::..: : ..:.: : . :. :: :. :....:..:. .: ::..:.
CCDS41 DTELNCFVLQMDYKGDAVAFFVLPSK-GKMRQLEQALSARTLRKWSHSLQKRWIEVFIPR
270 280 290 300 310 320
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 FKLEKNYNLVESLKLMGIRMLFDKNGNMAGISDQRIAIDLFK--HQGTITVNEEGTQATT
:.. .::: : :::. .::::....::. .: .... : :.... :.::::.::.
CCDS41 FSISASYNLETILPKMGIQNVFDKNADFSGIA-KRDSLQVSKATHKAVLDVSEEGTEATA
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490 500 510 520
pF1KB8 VTTVGFMPLSTQ--VRFTV--DRPFLFLIYEHRTSCLLFMGRVANPSRS
.::. :. : . ::: .: ::..: .. :. .::.:.: ::..:
CCDS41 ATTTKFIVRSKDGPSYFTVSFNRTFLMMITNKATDGILFLGKVENPTKS
390 400 410 420 430
>>CCDS9923.1 SERPINA10 gene_id:51156|Hs108|chr14 (444 aa)
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Smith-Waterman score: 638; 31.8% identity (63.7% similar) in 377 aa overlap (152-525:73-442)
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pF1KB8 DIVDSLSVSPTDSDVSAGNILQLFHGKSRIQRLNILNAKFAFNLYRVLKDQVNTFDNIFI
:.: ...:.:.: : : .. :. .
CCDS99 QAPKEEEEDEQEASEEKASEEEKAWLMASRQQLAKETSNFGFSLLR--KISMRHDGNMVF
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190 200 210 220 230 240
pF1KB8 APVGISTAMGMISLGLKGETHEQVHSILHFKDFVNASSKYEITTIHNLFRKLTHRLFRRN
.: :.: :: . :: : :. :.. ::.. : . . . .::. : . : ::
CCDS99 SPFGMSLAMTGLMLGATGPTETQIKRGLHLQ----ALKPTKPGLLPSLFKGLRETL-SRN
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pF1KB8 FGYTLRSVNDLYIQKQFPILLDFKTKVREYYFAEAQIADFSDPAFISKTNNH-IMKLTKG
. : . . .:.:.: . : . ..:. .: .: . . .. :: : : :.:
CCDS99 LELGLTQGSFAFIHKDFDVKETFFNLSKRYFDTECVPMNFRNASQAKRLMNHYINKETRG
160 170 180 190 200 210
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pF1KB8 LIKDALENIDPATQMMILNCIYFKGSWVNKFPVEMTHNHNFRLNEREVVKVSMMQTKGNF
: ...:.: :...... : :::.:.. : .:. .:.:.. ...:: :: :.:
CCDS99 KIPKLFDEINPETKLILVDYILFKGKWLTPFDPVFTEVDTFHLDKYKTIKVPMMYGAGKF
220 230 240 250 260 270
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pF1KB8 LAANDQELDCDILQLEYVGGISMLIVVPHKMSGMKTLEAQLTPRVVERWQKSMTNRTREV
.. :... : .:.: : :. .::.:. .::. .:: :: .:: : ..: .:. ::
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..:::::...:.. : :. :::: .:. .... .: . . .. .. .: :.:.::
CCDS99 FFPKFKLDQKYEMHELLRQMGIRRIFSPFADLSELSATGRNLQVSRVLQRTVIEVDERGT
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pF1KB8 QATTVTTVGFMPLSTQVRFTVDRPFLFLIYEHRTSCLLFMGRVANPSRS
.:.. . : . ::::: :.:::. .. :::.:::.::.
CCDS99 EAVAGILSEITAYSMPPVIKVDRPFHFMIYEETSGMLLFLGRVVNPTLL
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>>CCDS9924.1 SERPINA6 gene_id:866|Hs108|chr14 (405 aa)
initn: 348 init1: 236 opt: 637 Z-score: 759.3 bits: 149.8 E(32554): 5.7e-36
Smith-Waterman score: 637; 31.9% identity (67.0% similar) in 370 aa overlap (158-524:43-404)
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pF1KB8 SVSPTDSDVSAGNILQLFHGKSRIQRLNILNAKFAFNLYRVLKDQVNTFDNIFIAPVGIS
:. :::.::. : .. ::::.::.::
CCDS99 PTSGLWTVQAMDPNAAYVNMSNHHRGLASANVDFAFSLYKHLV-ALSPKKNIFISPVSIS
20 30 40 50 60 70
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pF1KB8 TAMGMISLGLKGETHEQVHSILHFKDFVNASSKYEITTIHNLFRKLTHRLF-RRNFGYTL
:..:.::: :.:. :. . : : : . . : : ::. :..: :.:: . . . .
CCDS99 MALAMLSLGTCGHTRAQLLQGLGF----NLTERSE-TEIHQGFQHL-HQLFAKSDTSLEM
80 90 100 110 120
250 260 270 280 290 300
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: :... .. .: .:.. ...:: .:. .:.: : :. :... . :.: : :
CCDS99 TMGNALFLDGSLELLESFSADIKHYYESEVLAMNFQDWATASRQINSYVKNKTQGKIVDL
130 140 150 160 170 180
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LENIDPATQMMILNCIYFKGSWVNKFPVEMTHNHNFRLNEREVVKVSMMQTKGNFLAAND
. ..: . ....: :.:::.:.. : . :...:: ..: :::: :: .... .:
CCDS99 FSGLDSPAILVLVNYIFFKGTWTQPFDLASTREENFYVDETTVVKVPMMLQSSTISYLHD
190 200 210 220 230 240
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 QELDCDILQLEYVGGISMLIVVPHKMSGMKTLEAQLTPRVVERWQKSMTNRTREVLLPKF
.:: :...:..:::. ......: : . :.:. : :. ...::. ..:. .. .::
CCDS99 SELPCQLVQMNYVGNGTVFFILPDK-GKMNTVIAALSRDTINRWSAGLTSSQVDLYIPKV
250 260 270 280 290 300
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 KLEKNYNLVESLKLMGIRMLFDKNGNMAGIS-DQRIAIDLFKHQGTITVNEEGTQATTVT
. :.: . :. ::: :: ...:.. :. : .. . :.... .::::.... :
CCDS99 TISGVYDLGDVLEEMGIADLFTNQANFSRITQDAQLKSSKVVHKAVLQLNEEGVDTAGST
310 320 330 340 350 360
490 500 510 520
pF1KB8 TVGFMPLSTQVRFTVDRPFLFLIYEHRTSCLLFMGRVANPSRS
: . : . . ..::...:..: : ::..:: ::
CCDS99 GVTLNLTSKPIILRFNQPFIIMIFDHFTWSSLFLARVMNPV
370 380 390 400
>>CCDS32150.1 SERPINA3 gene_id:12|Hs108|chr14 (423 aa)
initn: 349 init1: 101 opt: 630 Z-score: 750.7 bits: 148.3 E(32554): 1.7e-35
Smith-Waterman score: 630; 32.1% identity (67.1% similar) in 380 aa overlap (158-527:53-423)
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 SVSPTDSDVSAGNILQLFHGKSRIQRLNILNAKFAFNLYRVLKDQVNTFDNIFIAPVGIS
:. :::.::. : .. :....:..::
CCDS32 CHPNSPLDEENLTQENQDRGTHVDLGLASANVDFAFSLYKQLVLKAPD-KNVIFSPLSIS
30 40 50 60 70 80
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TAMGMISLGLKGETHEQVHSILHFKDFVNASSKYEITTIHNLFRKLTHRLFRRNFGYTLR
::....::: .. : .. . :.:. .. .:. :: :. :..: . : . . :
CCDS32 TALAFLSLGAHNTTLTEILKGLKFN--LTETSEAEI---HQSFQHLLRTLNQSSDELQLS
90 100 110 120 130
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 SVNDLYIQKQFPILLDFKTKVREYYFAEAQIADFSDPAFISKT-NNHIMKLTKGLIKDAL
: .....:. .: : ... : .:: .::.: : .: :... . :.: : : .
CCDS32 MGNAMFVKEQLSLLDRFTEDAKRLYGSEAFATDFQDSAAAKKLINDYVKNGTRGKITDLI
140 150 160 170 180 190
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 ENIDPATQMMILNCIYFKGSWVNKFPVEMTHNHNFRLNEREVVKVSMMQTKGNFLAA-ND
...: :.:...: :.::..: : . ::. : :.... : : ::. . . :
CCDS32 KDLDSQTMMVLVNYIFFKAKWEMPFDPQDTHQSRFYLSKKKWVMVPMMSLHHLTIPYFRD
200 210 220 230 240 250
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 QELDCDILQLEYVGGISMLIVVPHKMSGMKTLEAQLTPRVVERWQKSMTNRT-REVLLPK
.::.: ...:.:.:. : :...: . . :. .::.: :....::. :. : :. :::
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:.. ..::: . : .::. : ......::. : .:.. :.... : ::::.:...
CCDS32 FSISRDYNLNDILLQLGIEEAFTSKADLSGITGARNLAVSQVVHKAVLDVFEEGTEASAA
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490 500 510 520
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:.: . :: : ::: .::::..: :. ..::..:.::...
CCDS32 TAVKITLLSALVETRTIVRF--NRPFLMIIVPTDTQNIFFMSKVTNPKQA
380 390 400 410 420
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:..:.::: :..::... :.: : . : . ::. :..: . : . . : .
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CCDS99 TGTYDLKSVLGQLGITKVFSNGADLSGVTEE-APLKLSKAVHKAVLTIDEKGTEAAGAMF
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CCDS99 LEAIPMSIPPEVKFNKPFVFLMIEQNTKSPLFMGKVVNPTQK
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:..:..::::..: .:: ..: .:. ...: : .. ... .: : .: ::. ::.:
CCDS13 FLSPLSISTAFAMTKLGACNDTLQQLMEVFKF-DTISEKTSDQI---HFFFAKLNCRLYR
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CCDS13 KANKSSKLVSANRLFGDKSLTFNETYQDISELVYGAKLQPLDFKENAEQSRAAINKWVSN
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CCDS13 KTEGRITDVIPSEAINELTVLVLVNTIYFKGLWKSKFSPENTRKELFYKADGESCSASMM
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CCDS13 YQEGKFRYRRVAE-GTQVLELPFKGDDITMVLILPKPEKSLAKVEKELTPEVLQEWLDEL
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CCDS13 AFLEVNEEGSEAAASTAVVIAGRSLNPNRVTFKANRPFLVFIREVPLNTIIFMGRVANPC
410 420 430 440 450 460
pF1KB8 RS
CCDS13 VK
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CCDS99 NMDLGFKLLKKLA-FYNPGRNIFLSPLSISTAFSMLCLGAQDSTLDEIKQGFNFR-----
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....: :.. ::: :: .: . .. :..:.: ::.. : .:. ....: . . .:
CCDS99 KEEDFFLEKNSSVKVPMMFRSGIYQVGYDDKLSCTILEIPYQKNITAIFILPDE-GKLKH
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:: : . ::. .. :. .: .:.... ...: ..:. .:. .:...:... :.
CCDS99 LEKGLQVDTFSRWKTLLSRRVVDVSVPRLHMTGTFDLKKTLSYIGVSKIFEEHGDLTKIA
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CCDS99 PHRSLKVGEAVHKAELKMDERGTEGAAGTGAQTLPMETPLVVKIDKPYLLLIYSEKIPSV
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pF1KB8 LFMGRVANPSRS
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CCDS99 LFLGKIVNPIGK
410
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CCDS44 SCALAMVYMGAKGNTAAQMAQILSF----NKSGGG--GDIHQGFQSLLTEVNKTGTQYLL
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CCDS44 LLSPGSVDPLTRLVLVNAVYFRGNWDEQFDKENTEERLFKVSKNEEKPVQMMFKQSTFKK
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CCDS44 TYIGEIFTQILVLPYVGKELNMIIMLPDETTDLRTVEKELTYEKFVEWTRLDMMDEEEVE
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CCDS44 EAAAATAAIMMMRCARFVPRFCADHPFLFFIQHSKTNGILFCGRFSSP
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: :..:. .: ::.: :. .:: : : :. ::. :..: .. . . : :
CCDS75 SCALAMVYMGAKGNTAAQMAQILSF----NKSGGG--GDIHQGFQSLLTEVNKTGTQYLL
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pF1KB8 RSVNDLYIQKQFPILLDFKTKVREYYFAEAQIADFSDPAFISKT--NNHIMKLTKGLIKD
: .: :. .:. .: .:. . ...: :: . :: . . :. :. . . :.: : .
CCDS75 RMANRLFGEKSCDFLSSFRDSCQKFYQAEMEELDFISAVEKSRKHINTWVAEKTEGKIAE
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pF1KB8 ALE--NIDPATQMMILNCIYFKGSWVNKFPVEMTHNHNFRLNEREVVKVSMMQTKGNFLA
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CCDS75 LLSPGSVDPLTRLVLVNAVYFRGNWDEQFDKENTEERLFKVSKNEEKPVQMMFKQSTFKK
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CCDS75 TYIGEIFTQILVLPYVGKELNMIIMLPDETTDLRTVEKELTYEKFVEWTRLDMMDEEEVE
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CCDS75 VSLPRFKLEESYDMESVLRNLGMTDAFELGKADFSGMSQTDLSLSKVVHKSFVEVNEEGT
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CCDS75 EAAAATAAIMMMRCARFVPRFCADHPFLFFIQHSKTNGILFCGRFSSP
340 350 360 370 380
527 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Fri Nov 4 14:57:13 2016 done: Fri Nov 4 14:57:13 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]