Result of FASTA (omim) for
pF1KB8724
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8724, 527 aa
1>>>pF1KB8724 527 - 527 aa - 527 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8451+/-0.00051; mu= 15.5706+/- 0.032
mean_var=71.2875+/-13.991, 0's: 0 Z-trim(108.5): 130 B-trim: 757 in 1/50
Lambda= 0.151903
statistics sampled from 16415 (16558) to 16415 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.544), E-opt: 0.2 (0.194), width: 16
Scan time: 7.850
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000176 (OMIM: 142360,612356) heparin cofactor 2 ( 499) 3272 726.9 3.4e-209
XP_011535017 (OMIM: 615677) PREDICTED: serpin A9 i ( 417) 725 168.7 3.1e-41
XP_011535016 (OMIM: 615677) PREDICTED: serpin A9 i ( 417) 725 168.7 3.1e-41
NP_783866 (OMIM: 615677) serpin A9 isoform A [Homo ( 435) 725 168.7 3.2e-41
NP_001271204 (OMIM: 615677) serpin A9 isoform C [H ( 399) 691 161.2 5.2e-39
NP_057270 (OMIM: 605271) protein Z-dependent prote ( 444) 638 149.6 1.8e-35
NP_001094077 (OMIM: 605271) protein Z-dependent pr ( 444) 638 149.6 1.8e-35
XP_005267790 (OMIM: 605271) PREDICTED: protein Z-d ( 444) 638 149.6 1.8e-35
XP_016876842 (OMIM: 605271) PREDICTED: protein Z-d ( 484) 638 149.6 1.9e-35
XP_011535019 (OMIM: 615677) PREDICTED: serpin A9 i ( 337) 635 148.9 2.2e-35
XP_011535018 (OMIM: 615677) PREDICTED: serpin A9 i ( 337) 635 148.9 2.2e-35
NP_001747 (OMIM: 122500,611489) corticosteroid-bin ( 405) 636 149.2 2.3e-35
NP_001076 (OMIM: 107280) alpha-1-antichymotrypsin ( 423) 630 147.9 5.8e-35
NP_001121173 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 623 146.3 1.7e-34
NP_001121178 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 623 146.3 1.7e-34
NP_001121172 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 623 146.3 1.7e-34
NP_001002236 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 623 146.3 1.7e-34
NP_001121174 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 623 146.3 1.7e-34
XP_016876859 (OMIM: 107400,606963,613490) PREDICTE ( 418) 623 146.3 1.7e-34
NP_001002235 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 623 146.3 1.7e-34
NP_001121176 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 623 146.3 1.7e-34
NP_001121177 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 623 146.3 1.7e-34
NP_001121175 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 623 146.3 1.7e-34
NP_001121179 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1- ( 418) 623 146.3 1.7e-34
NP_000286 (OMIM: 107400,606963,613490) alpha-1-ant ( 418) 623 146.3 1.7e-34
XP_005245255 (OMIM: 107300,613118) PREDICTED: anti ( 416) 610 143.5 1.2e-33
NP_000479 (OMIM: 107300,613118) antithrombin-III p ( 464) 610 143.5 1.3e-33
XP_011512974 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 454) 605 142.4 2.8e-33
NP_001258751 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 390) 596 140.4 9.5e-33
NP_001258754 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376) 595 140.2 1.1e-32
NP_001284628 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376) 595 140.2 1.1e-32
NP_001258753 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376) 595 140.2 1.1e-32
NP_001284629 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376) 595 140.2 1.1e-32
XP_011512976 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 376) 595 140.2 1.1e-32
XP_011512975 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 376) 595 140.2 1.1e-32
NP_004559 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isoform ( 376) 595 140.2 1.1e-32
NP_001182220 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 380) 595 140.2 1.1e-32
XP_016866429 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 380) 595 140.2 1.1e-32
NP_001258752 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 395) 595 140.2 1.1e-32
NP_000345 (OMIM: 300932,314200) thyroxine-binding ( 415) 592 139.5 1.8e-32
XP_005249241 (OMIM: 601799) PREDICTED: serpin B9 i ( 376) 587 138.4 3.6e-32
NP_004146 (OMIM: 601799) serpin B9 [Homo sapiens] ( 376) 587 138.4 3.6e-32
NP_001271205 (OMIM: 615677) serpin A9 isoform D [H ( 286) 582 137.3 6e-32
NP_006208 (OMIM: 605587) serpin I2 isoform 2 precu ( 405) 575 135.8 2.4e-31
NP_001012303 (OMIM: 605587) serpin I2 isoform 1 pr ( 415) 575 135.8 2.4e-31
NP_000615 (OMIM: 601841) plasma serine protease in ( 406) 571 134.9 4.4e-31
NP_002631 (OMIM: 601697,617115) serpin B8 isoform ( 374) 548 129.9 1.3e-29
NP_942130 (OMIM: 601697,617115) serpin B8 isoform ( 374) 548 129.9 1.3e-29
NP_005016 (OMIM: 602445,604218) neuroserpin precur ( 410) 546 129.5 2e-29
XP_016862107 (OMIM: 602445,604218) PREDICTED: neur ( 410) 546 129.5 2e-29
>>NP_000176 (OMIM: 142360,612356) heparin cofactor 2 pre (499 aa)
initn: 3272 init1: 3272 opt: 3272 Z-score: 3876.6 bits: 726.9 E(85289): 3.4e-209
Smith-Waterman score: 3272; 100.0% identity (100.0% similar) in 499 aa overlap (29-527:1-499)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MWMLQRGVDQPGRLSLCSVFPPSFSSAKMKHSLNALLIFLIITSAWGGSKGPLDQLEKGG
::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MKHSLNALLIFLIITSAWGGSKGPLDQLEKGG
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 ETAQSADPQWEQLNNKNLSMPLLPADFHKENTVTNDWIPEGEEDDDYLDLEKIFSEDDDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ETAQSADPQWEQLNNKNLSMPLLPADFHKENTVTNDWIPEGEEDDDYLDLEKIFSEDDDY
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 IDIVDSLSVSPTDSDVSAGNILQLFHGKSRIQRLNILNAKFAFNLYRVLKDQVNTFDNIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 IDIVDSLSVSPTDSDVSAGNILQLFHGKSRIQRLNILNAKFAFNLYRVLKDQVNTFDNIF
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 IAPVGISTAMGMISLGLKGETHEQVHSILHFKDFVNASSKYEITTIHNLFRKLTHRLFRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 IAPVGISTAMGMISLGLKGETHEQVHSILHFKDFVNASSKYEITTIHNLFRKLTHRLFRR
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 NFGYTLRSVNDLYIQKQFPILLDFKTKVREYYFAEAQIADFSDPAFISKTNNHIMKLTKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NFGYTLRSVNDLYIQKQFPILLDFKTKVREYYFAEAQIADFSDPAFISKTNNHIMKLTKG
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LIKDALENIDPATQMMILNCIYFKGSWVNKFPVEMTHNHNFRLNEREVVKVSMMQTKGNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LIKDALENIDPATQMMILNCIYFKGSWVNKFPVEMTHNHNFRLNEREVVKVSMMQTKGNF
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 LAANDQELDCDILQLEYVGGISMLIVVPHKMSGMKTLEAQLTPRVVERWQKSMTNRTREV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LAANDQELDCDILQLEYVGGISMLIVVPHKMSGMKTLEAQLTPRVVERWQKSMTNRTREV
340 350 360 370 380 390
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pF1KB8 LLPKFKLEKNYNLVESLKLMGIRMLFDKNGNMAGISDQRIAIDLFKHQGTITVNEEGTQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LLPKFKLEKNYNLVESLKLMGIRMLFDKNGNMAGISDQRIAIDLFKHQGTITVNEEGTQA
400 410 420 430 440 450
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pF1KB8 TTVTTVGFMPLSTQVRFTVDRPFLFLIYEHRTSCLLFMGRVANPSRS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TTVTTVGFMPLSTQVRFTVDRPFLFLIYEHRTSCLLFMGRVANPSRS
460 470 480 490
>>XP_011535017 (OMIM: 615677) PREDICTED: serpin A9 isofo (417 aa)
initn: 544 init1: 164 opt: 725 Z-score: 861.3 bits: 168.7 E(85289): 3.1e-41
Smith-Waterman score: 725; 35.9% identity (69.7% similar) in 379 aa overlap (157-527:47-417)
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LSVSPTDSDVSAGNILQLFHGKSRIQRLNILNAKFAFNLYRVLKDQVNTFDNIFIAPVGI
::. ::: ::: : .. . .:::..::..
XP_011 PIYCVSPANAPSAYPRPSSTKSTPASQVYSLNTDFAFRLYRRLVLETPS-QNIFFSPVSV
20 30 40 50 60 70
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 STAMGMISLGLKGETHEQVHSILHFKDFVNASSKYEITTIHNLFRKLTHRLFRRNFGYTL
::...:.::: .. :. :. . : : : . : ..::. :..:.: : . ::
XP_011 STSLAMLSLGAHSVTKTQILQGLGF----NLTHTPE-SAIHQGFQHLVHSLTVPSKDLTL
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250 260 270 280 290 300
pF1KB8 RSVNDLYIQKQFPILLDFKTKVREYYFAEAQIADFSDPAFI-SKTNNHIMKLTKGLIKDA
. . :...:.. . .: .:.. : ::. .:::.:.. .. :.:. : :.: . :
XP_011 KMGSALFVKKELQLQANFLGNVKRLYEAEVFSTDFSNPSIAQARINSHVKKKTQGKVVDI
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310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LENIDPATQMMILNCIYFKGSWVNKFPVEMTH-NHNFRLNEREVVKVSMMQTKGNFLAAN
....: : :...: :.::..: . : :.:. : : ..:. .:.: ::. : .: .
XP_011 IQGLDLLTAMVLVNHIFFKAKWEKPFHPEYTRKNFPFLVGEQVTVHVPMMHQKEQFAFGV
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pF1KB8 DQELDCDILQLEYVGGISMLIVVPHKMSGMKTLEAQLTPRVVERWQKSMTNRTREVLLPK
: ::.: .::..: : ..:.: : . :. :: :. :....:..:. .: ::..:.
XP_011 DTELNCFVLQMDYKGDAVAFFVLPSK-GKMRQLEQALSARTLRKWSHSLQKRWIEVFIPR
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pF1KB8 FKLEKNYNLVESLKLMGIRMLFDKNGNMAGISDQRIAIDLFK--HQGTITVNEEGTQATT
:.. .::: : :::. .::::....::. .: .... : :.... :.::::.::.
XP_011 FSISASYNLETILPKMGIQNVFDKNADFSGIA-KRDSLQVSKATHKAVLDVSEEGTEATA
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490 500 510 520
pF1KB8 VTTVGFMPLSTQ--VRFTV--DRPFLFLIYEHRTSCLLFMGRVANPSRS
.::. :. : . ::: .: ::..: .. :. .::.:.: ::..:
XP_011 ATTTKFIVRSKDGPSYFTVSFNRTFLMMITNKATDGILFLGKVENPTKS
370 380 390 400 410
>>XP_011535016 (OMIM: 615677) PREDICTED: serpin A9 isofo (417 aa)
initn: 544 init1: 164 opt: 725 Z-score: 861.3 bits: 168.7 E(85289): 3.1e-41
Smith-Waterman score: 725; 35.9% identity (69.7% similar) in 379 aa overlap (157-527:47-417)
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LSVSPTDSDVSAGNILQLFHGKSRIQRLNILNAKFAFNLYRVLKDQVNTFDNIFIAPVGI
::. ::: ::: : .. . .:::..::..
XP_011 PIYCVSPANAPSAYPRPSSTKSTPASQVYSLNTDFAFRLYRRLVLETPS-QNIFFSPVSV
20 30 40 50 60 70
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 STAMGMISLGLKGETHEQVHSILHFKDFVNASSKYEITTIHNLFRKLTHRLFRRNFGYTL
::...:.::: .. :. :. . : : : . : ..::. :..:.: : . ::
XP_011 STSLAMLSLGAHSVTKTQILQGLGF----NLTHTPE-SAIHQGFQHLVHSLTVPSKDLTL
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pF1KB8 RSVNDLYIQKQFPILLDFKTKVREYYFAEAQIADFSDPAFI-SKTNNHIMKLTKGLIKDA
. . :...:.. . .: .:.. : ::. .:::.:.. .. :.:. : :.: . :
XP_011 KMGSALFVKKELQLQANFLGNVKRLYEAEVFSTDFSNPSIAQARINSHVKKKTQGKVVDI
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pF1KB8 LENIDPATQMMILNCIYFKGSWVNKFPVEMTH-NHNFRLNEREVVKVSMMQTKGNFLAAN
....: : :...: :.::..: . : :.:. : : ..:. .:.: ::. : .: .
XP_011 IQGLDLLTAMVLVNHIFFKAKWEKPFHPEYTRKNFPFLVGEQVTVHVPMMHQKEQFAFGV
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370 380 390 400 410 420
pF1KB8 DQELDCDILQLEYVGGISMLIVVPHKMSGMKTLEAQLTPRVVERWQKSMTNRTREVLLPK
: ::.: .::..: : ..:.: : . :. :: :. :....:..:. .: ::..:.
XP_011 DTELNCFVLQMDYKGDAVAFFVLPSK-GKMRQLEQALSARTLRKWSHSLQKRWIEVFIPR
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430 440 450 460 470 480
pF1KB8 FKLEKNYNLVESLKLMGIRMLFDKNGNMAGISDQRIAIDLFK--HQGTITVNEEGTQATT
:.. .::: : :::. .::::....::. .: .... : :.... :.::::.::.
XP_011 FSISASYNLETILPKMGIQNVFDKNADFSGIA-KRDSLQVSKATHKAVLDVSEEGTEATA
310 320 330 340 350 360
490 500 510 520
pF1KB8 VTTVGFMPLSTQ--VRFTV--DRPFLFLIYEHRTSCLLFMGRVANPSRS
.::. :. : . ::: .: ::..: .. :. .::.:.: ::..:
XP_011 ATTTKFIVRSKDGPSYFTVSFNRTFLMMITNKATDGILFLGKVENPTKS
370 380 390 400 410
>>NP_783866 (OMIM: 615677) serpin A9 isoform A [Homo sap (435 aa)
initn: 544 init1: 164 opt: 725 Z-score: 861.0 bits: 168.7 E(85289): 3.2e-41
Smith-Waterman score: 725; 35.9% identity (69.7% similar) in 379 aa overlap (157-527:65-435)
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LSVSPTDSDVSAGNILQLFHGKSRIQRLNILNAKFAFNLYRVLKDQVNTFDNIFIAPVGI
::. ::: ::: : .. . .:::..::..
NP_783 PIYCVSPANAPSAYPRPSSTKSTPASQVYSLNTDFAFRLYRRLVLETPS-QNIFFSPVSV
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 STAMGMISLGLKGETHEQVHSILHFKDFVNASSKYEITTIHNLFRKLTHRLFRRNFGYTL
::...:.::: .. :. :. . : : : . : ..::. :..:.: : . ::
NP_783 STSLAMLSLGAHSVTKTQILQGLGF----NLTHTPE-SAIHQGFQHLVHSLTVPSKDLTL
100 110 120 130 140
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pF1KB8 RSVNDLYIQKQFPILLDFKTKVREYYFAEAQIADFSDPAFI-SKTNNHIMKLTKGLIKDA
. . :...:.. . .: .:.. : ::. .:::.:.. .. :.:. : :.: . :
NP_783 KMGSALFVKKELQLQANFLGNVKRLYEAEVFSTDFSNPSIAQARINSHVKKKTQGKVVDI
150 160 170 180 190 200
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pF1KB8 LENIDPATQMMILNCIYFKGSWVNKFPVEMTH-NHNFRLNEREVVKVSMMQTKGNFLAAN
....: : :...: :.::..: . : :.:. : : ..:. .:.: ::. : .: .
NP_783 IQGLDLLTAMVLVNHIFFKAKWEKPFHPEYTRKNFPFLVGEQVTVHVPMMHQKEQFAFGV
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pF1KB8 DQELDCDILQLEYVGGISMLIVVPHKMSGMKTLEAQLTPRVVERWQKSMTNRTREVLLPK
: ::.: .::..: : ..:.: : . :. :: :. :....:..:. .: ::..:.
NP_783 DTELNCFVLQMDYKGDAVAFFVLPSK-GKMRQLEQALSARTLRKWSHSLQKRWIEVFIPR
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pF1KB8 FKLEKNYNLVESLKLMGIRMLFDKNGNMAGISDQRIAIDLFK--HQGTITVNEEGTQATT
:.. .::: : :::. .::::....::. .: .... : :.... :.::::.::.
NP_783 FSISASYNLETILPKMGIQNVFDKNADFSGIA-KRDSLQVSKATHKAVLDVSEEGTEATA
330 340 350 360 370 380
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pF1KB8 VTTVGFMPLSTQ--VRFTV--DRPFLFLIYEHRTSCLLFMGRVANPSRS
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pF1KB8 FGYTLRSVNDLYIQKQFPILLDFKTKVREYYFAEAQIADFSDPAFISKTNNH-IMKLTKG
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pF1KB8 LIKDALENIDPATQMMILNCIYFKGSWVNKFPVEMTHNHNFRLNEREVVKVSMMQTKGNF
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XP_016 KIPKLFDEINPETKLILVDYILFKGKWLTPFDPVFTEVDTFHLDKYKTIKVPMMYGAGKF
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pF1KB8 LAANDQELDCDILQLEYVGGISMLIVVPHKMSGMKTLEAQLTPRVVERWQKSMTNRTREV
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XP_016 ASTFDKNFRCHVLKLPYQGNATMLVVLMEKMGDHLALEDYLTTDLVETWLRNMKTRNMEV
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XP_011 GILFLGKVENPTKS
330
527 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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start: Fri Nov 4 14:57:13 2016 done: Fri Nov 4 14:57:15 2016
Total Scan time: 7.850 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]