Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8727
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8727, 492 aa
1>>>pF1KB8727 492 - 492 aa - 492 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9327+/-0.000757; mu= 12.8064+/- 0.046
mean_var=116.6694+/-23.544, 0's: 0 Z-trim(112.7): 24 B-trim: 667 in 1/52
Lambda= 0.118740
statistics sampled from 13400 (13424) to 13400 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.744), E-opt: 0.2 (0.412), width: 16
Scan time: 3.540
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13913.1 TOM1 gene_id:10043|Hs108|chr22 ( 492) 3225 562.9 2.8e-160
CCDS46696.1 TOM1 gene_id:10043|Hs108|chr22 ( 493) 3208 560.0 2.1e-159
CCDS46698.1 TOM1 gene_id:10043|Hs108|chr22 ( 460) 2984 521.6 7.1e-148
CCDS46697.1 TOM1 gene_id:10043|Hs108|chr22 ( 447) 2112 372.2 6.4e-103
CCDS42270.1 TOM1L2 gene_id:146691|Hs108|chr17 ( 507) 1503 267.9 1.8e-71
CCDS74003.1 TOM1L2 gene_id:146691|Hs108|chr17 ( 483) 1197 215.5 1e-55
CCDS32584.1 TOM1L2 gene_id:146691|Hs108|chr17 ( 457) 814 149.9 5.6e-36
CCDS74001.1 TOM1L2 gene_id:146691|Hs108|chr17 ( 389) 699 130.1 4.2e-30
CCDS74002.1 TOM1L2 gene_id:146691|Hs108|chr17 ( 462) 698 130.0 5.5e-30
CCDS11582.1 TOM1L1 gene_id:10040|Hs108|chr17 ( 476) 511 98.0 2.5e-20
CCDS82160.1 TOM1L1 gene_id:10040|Hs108|chr17 ( 346) 496 95.3 1.1e-19
CCDS74000.1 TOM1L2 gene_id:146691|Hs108|chr17 ( 388) 480 92.6 8.2e-19
CCDS11717.1 GGA3 gene_id:23163|Hs108|chr17 ( 723) 396 78.4 3e-14
CCDS13951.1 GGA1 gene_id:26088|Hs108|chr22 ( 639) 377 75.1 2.5e-13
CCDS7122.1 STAM gene_id:8027|Hs108|chr10 ( 540) 363 72.6 1.2e-12
CCDS33643.1 GGA1 gene_id:26088|Hs108|chr22 ( 552) 354 71.1 3.5e-12
CCDS2196.1 STAM2 gene_id:10254|Hs108|chr2 ( 525) 345 69.6 9.7e-12
>>CCDS13913.1 TOM1 gene_id:10043|Hs108|chr22 (492 aa)
initn: 3225 init1: 3225 opt: 3225 Z-score: 2991.0 bits: 562.9 E(32554): 2.8e-160
Smith-Waterman score: 3225; 100.0% identity (100.0% similar) in 492 aa overlap (1-492:1-492)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDFLLGNPFSSPVGQRIEKATDGSLQSEDWALNMEICDIINETEEGPKDALRAVKKRIVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MDFLLGNPFSSPVGQRIEKATDGSLQSEDWALNMEICDIINETEEGPKDALRAVKKRIVG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 NKNFHEVMLALTVLETCVKNCGHRFHVLVASQDFVESVLVRTILPKNNPPTIVHDKVLNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NKNFHEVMLALTVLETCVKNCGHRFHVLVASQDFVESVLVRTILPKNNPPTIVHDKVLNL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 IQSWADAFRSSPDLTGVVTIYEDLRRKGLEFPMTDLDMLSPIHTPQRTVFNSETQSGQDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IQSWADAFRSSPDLTGVVTIYEDLRRKGLEFPMTDLDMLSPIHTPQRTVFNSETQSGQDS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 VGTDSSQQEDSGQHAAPLPAPPILSGDTPIAPTPEQIGKLRSELEMVSGNVRVMSEMLTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VGTDSSQQEDSGQHAAPLPAPPILSGDTPIAPTPEQIGKLRSELEMVSGNVRVMSEMLTE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LVPTQAEPADLELLQELNRTCRAMQQRVLELIPQIANEQLTEELLIVNDNLNNVFLRHER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LVPTQAEPADLELLQELNRTCRAMQQRVLELIPQIANEQLTEELLIVNDNLNNVFLRHER
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 FERFRTGQTTKAPSEAEPAADLIDMGPDPAATGNLSSQLAGMNLGSSSVRAGLQSLEASG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FERFRTGQTTKAPSEAEPAADLIDMGPDPAATGNLSSQLAGMNLGSSSVRAGLQSLEASG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 RLEDEFDMFALTRGSSLADQRKEVKYEAPQATDGLAGALDARQQSTGAIPVTQACLMEDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RLEDEFDMFALTRGSSLADQRKEVKYEAPQATDGLAGALDARQQSTGAIPVTQACLMEDI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 EQWLSTDVGNDAEEPKGVTSEEFDKFLEERAKAADRLPNLSSPSAEGPPGPPSGPAPRKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EQWLSTDVGNDAEEPKGVTSEEFDKFLEERAKAADRLPNLSSPSAEGPPGPPSGPAPRKK
430 440 450 460 470 480
490
pF1KB8 TQEKDDDMLFAL
::::::::::::
CCDS13 TQEKDDDMLFAL
490
>>CCDS46696.1 TOM1 gene_id:10043|Hs108|chr22 (493 aa)
initn: 3206 init1: 2875 opt: 3208 Z-score: 2975.2 bits: 560.0 E(32554): 2.1e-159
Smith-Waterman score: 3208; 99.6% identity (99.8% similar) in 493 aa overlap (1-492:1-493)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDFLLGNPFSSPVGQRIEKATDGSLQSEDWALNMEICDIINETEEGPKDALRAVKKRIVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MDFLLGNPFSSPVGQRIEKATDGSLQSEDWALNMEICDIINETEEGPKDALRAVKKRIVG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 NKNFHEVMLALTVLETCVKNCGHRFHVLVASQDFVESVLVRTILPKNNPPTIVHDKVLNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NKNFHEVMLALTVLETCVKNCGHRFHVLVASQDFVESVLVRTILPKNNPPTIVHDKVLNL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 IQSWADAFRSSPDLTGVVTIYEDLRRKGLEFPMTDLDMLSPIHTPQRTVFNSETQSGQDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IQSWADAFRSSPDLTGVVTIYEDLRRKGLEFPMTDLDMLSPIHTPQRTVFNSETQSGQDS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 VGTDSSQQEDSGQHAAPLPAPPILSGDTPIAPTPEQIGKLRSELEMVSGNVRVMSEMLTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VGTDSSQQEDSGQHAAPLPAPPILSGDTPIAPTPEQIGKLRSELEMVSGNVRVMSEMLTE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LVPTQAEPADLELLQELNRTCRAMQQRVLELIPQIANEQLTEELLIVNDNLNNVFLRHER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LVPTQAEPADLELLQELNRTCRAMQQRVLELIPQIANEQLTEELLIVNDNLNNVFLRHER
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 FERFRTGQTTKAPSEAEPAADLIDMGPDPAATGNLSSQLAGMNLGSSSVRAGLQSLEASG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FERFRTGQTTKAPSEAEPAADLIDMGPDPAATGNLSSQLAGMNLGSSSVRAGLQSLEASG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 RLEDEFDMFALTRGSSLADQRKEVKYEAPQATDGLAGALDARQQSTGAIPVTQACLMEDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RLEDEFDMFALTRGSSLADQRKEVKYEAPQATDGLAGALDARQQSTGAIPVTQACLMEDI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KB8 EQWLSTDVGNDAEEPKGVTSE-EFDKFLEERAKAADRLPNLSSPSAEGPPGPPSGPAPRK
::::::::::::::::::::: .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EQWLSTDVGNDAEEPKGVTSEGKFDKFLEERAKAADRLPNLSSPSAEGPPGPPSGPAPRK
430 440 450 460 470 480
480 490
pF1KB8 KTQEKDDDMLFAL
:::::::::::::
CCDS46 KTQEKDDDMLFAL
490
>>CCDS46698.1 TOM1 gene_id:10043|Hs108|chr22 (460 aa)
initn: 2982 init1: 2651 opt: 2984 Z-score: 2768.3 bits: 521.6 E(32554): 7.1e-148
Smith-Waterman score: 2984; 99.6% identity (99.8% similar) in 460 aa overlap (34-492:1-460)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 LLGNPFSSPVGQRIEKATDGSLQSEDWALNMEICDIINETEEGPKDALRAVKKRIVGNKN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MEICDIINETEEGPKDALRAVKKRIVGNKN
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 FHEVMLALTVLETCVKNCGHRFHVLVASQDFVESVLVRTILPKNNPPTIVHDKVLNLIQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FHEVMLALTVLETCVKNCGHRFHVLVASQDFVESVLVRTILPKNNPPTIVHDKVLNLIQS
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 WADAFRSSPDLTGVVTIYEDLRRKGLEFPMTDLDMLSPIHTPQRTVFNSETQSGQDSVGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 WADAFRSSPDLTGVVTIYEDLRRKGLEFPMTDLDMLSPIHTPQRTVFNSETQSGQDSVGT
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 DSSQQEDSGQHAAPLPAPPILSGDTPIAPTPEQIGKLRSELEMVSGNVRVMSEMLTELVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DSSQQEDSGQHAAPLPAPPILSGDTPIAPTPEQIGKLRSELEMVSGNVRVMSEMLTELVP
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 TQAEPADLELLQELNRTCRAMQQRVLELIPQIANEQLTEELLIVNDNLNNVFLRHERFER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TQAEPADLELLQELNRTCRAMQQRVLELIPQIANEQLTEELLIVNDNLNNVFLRHERFER
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 FRTGQTTKAPSEAEPAADLIDMGPDPAATGNLSSQLAGMNLGSSSVRAGLQSLEASGRLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FRTGQTTKAPSEAEPAADLIDMGPDPAATGNLSSQLAGMNLGSSSVRAGLQSLEASGRLE
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 DEFDMFALTRGSSLADQRKEVKYEAPQATDGLAGALDARQQSTGAIPVTQACLMEDIEQW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DEFDMFALTRGSSLADQRKEVKYEAPQATDGLAGALDARQQSTGAIPVTQACLMEDIEQW
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 LSTDVGNDAEEPKGVTSE-EFDKFLEERAKAADRLPNLSSPSAEGPPGPPSGPAPRKKTQ
:::::::::::::::::: .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LSTDVGNDAEEPKGVTSEGKFDKFLEERAKAADRLPNLSSPSAEGPPGPPSGPAPRKKTQ
400 410 420 430 440 450
490
pF1KB8 EKDDDMLFAL
::::::::::
CCDS46 EKDDDMLFAL
460
>>CCDS46697.1 TOM1 gene_id:10043|Hs108|chr22 (447 aa)
initn: 2112 init1: 2112 opt: 2112 Z-score: 1961.2 bits: 372.2 E(32554): 6.4e-103
Smith-Waterman score: 2818; 90.9% identity (90.9% similar) in 492 aa overlap (1-492:1-447)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDFLLGNPFSSPVGQRIEKATDGSLQSEDWALNMEICDIINETEEGPKDALRAVKKRIVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MDFLLGNPFSSPVGQRIEKATDGSLQSEDWALNMEICDIINETEEGPKDALRAVKKRIVG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 NKNFHEVMLALTVLETCVKNCGHRFHVLVASQDFVESVLVRTILPKNNPPTIVHDKVLNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NKNFHEVMLALTVLETCVKNCGHRFHVLVASQDFVESVLVRTILPKNNPPTIVHDKVLNL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 IQSWADAFRSSPDLTGVVTIYEDLRRKGLEFPMTDLDMLSPIHTPQRTVFNSETQSGQDS
:: :::::::::::::
CCDS46 IQ---------------------------------------------TVFNSETQSGQDS
130
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 VGTDSSQQEDSGQHAAPLPAPPILSGDTPIAPTPEQIGKLRSELEMVSGNVRVMSEMLTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VGTDSSQQEDSGQHAAPLPAPPILSGDTPIAPTPEQIGKLRSELEMVSGNVRVMSEMLTE
140 150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LVPTQAEPADLELLQELNRTCRAMQQRVLELIPQIANEQLTEELLIVNDNLNNVFLRHER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LVPTQAEPADLELLQELNRTCRAMQQRVLELIPQIANEQLTEELLIVNDNLNNVFLRHER
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 FERFRTGQTTKAPSEAEPAADLIDMGPDPAATGNLSSQLAGMNLGSSSVRAGLQSLEASG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FERFRTGQTTKAPSEAEPAADLIDMGPDPAATGNLSSQLAGMNLGSSSVRAGLQSLEASG
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 RLEDEFDMFALTRGSSLADQRKEVKYEAPQATDGLAGALDARQQSTGAIPVTQACLMEDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RLEDEFDMFALTRGSSLADQRKEVKYEAPQATDGLAGALDARQQSTGAIPVTQACLMEDI
320 330 340 350 360 370
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 EQWLSTDVGNDAEEPKGVTSEEFDKFLEERAKAADRLPNLSSPSAEGPPGPPSGPAPRKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EQWLSTDVGNDAEEPKGVTSEEFDKFLEERAKAADRLPNLSSPSAEGPPGPPSGPAPRKK
380 390 400 410 420 430
490
pF1KB8 TQEKDDDMLFAL
::::::::::::
CCDS46 TQEKDDDMLFAL
440
>>CCDS42270.1 TOM1L2 gene_id:146691|Hs108|chr17 (507 aa)
initn: 1446 init1: 971 opt: 1503 Z-score: 1396.6 bits: 267.9 E(32554): 1.8e-71
Smith-Waterman score: 2022; 63.6% identity (82.9% similar) in 514 aa overlap (1-492:1-507)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDFLLGNPFSSPVGQRIEKATDGSLQSEDWALNMEICDIINETEEGPKDALRAVKKRIVG
:.::::::::.:::: .:::::::::::::.:::::::::::::::::::.::.:::. :
CCDS42 MEFLLGNPFSTPVGQCLEKATDGSLQSEDWTLNMEICDIINETEEGPKDAIRALKKRLNG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 NKNFHEVMLALTVLETCVKNCGHRFHVLVASQDFVESVLVRTILPKNNPPTIVHDKVLNL
:.:..:::::::::::::::::::::.:::..::..::::. : :::::::::.:::: :
CCDS42 NRNYREVMLALTVLETCVKNCGHRFHILVANRDFIDSVLVKIISPKNNPPTIVQDKVLAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 IQSWADAFRSSPDLTGVVTIYEDLRRKGLEFPMTDLDMLSPIHTPQRTVFNSETQSGQDS
::.::::::::::::::: :::.:.:::.::::.::: :::::::::.: :.. .
CCDS42 IQAWADAFRSSPDLTGVVHIYEELKRKGVEFPMADLDALSPIHTPQRSV--PEVDPAATM
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB8 VGTDSSQQEDSGQHAAPLPAP------PILSGDTPIAPTPEQIGKLRSELEMVSGNVRVM
..:.:. ..:....: ::: : :: ::. . :::..:::::..: ::..::
CCDS42 PRSQSQQRTSAGSYSSPPPAPYSAPQAPALSVTGPITANSEQIARLRSELDVVRGNTKVM
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 SEMLTELVPTQAEPADLELLQELNRTCRAMQQRVLELIPQIANEQLTEELLIVNDNLNNV
::::::.:: : . .::::::::::::::::::..::: ...::..::::: :::.::::
CCDS42 SEMLTEMVPGQEDSSDLELLQELNRTCRAMQQRIVELISRVSNEEVTEELLHVNDDLNNV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KB8 FLRHERFERFRTGQTTKAPSEA---EPAAD-LIDMGP-DPAAT----GN------LSSQL
:::.:::::.:.:.... :.. : . : :::.:: .::.. :: :::::
CCDS42 FLRYERFERYRSGRSVQNASNGVLNEVTEDNLIDLGPGSPAVVSPMVGNTAPPSSLSSQL
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 AGMNLGSSSVRAGLQSLEASGRLEDEFDMFALTRGSSLADQRKEVKYEAPQATDGLAGAL
::..::. :: . :.::. . .: ::::: :::.:::.::: : :: :::. :::.::
CCDS42 AGLDLGTESVSGTLSSLQQCNP-RDGFDMFAQTRGNSLAEQRKTVTYEDPQAVGGLASAL
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB8 DARQQSTGAIPVTQACLMEDIEQWLSTDV-GNDAEEPKGVTSEEFDKFLEERAKAADRLP
: :.::. .:::.: .:.::: :: ::. :.: :: ::::::::::::::::::. .:
CCDS42 DNRKQSSEGIPVAQPSVMDDIEVWLRTDLKGDDLEE--GVTSEEFDKFLEERAKAAEMVP
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490
pF1KB8 NLSSPSAEGPPGPPSGPAPRKKTQEKDDDMLFAL
.: :: :.: .: :.:. ::: :...: ::::
CCDS42 DLPSPPMEAP-APASNPSGRKKP-ERSEDALFAL
480 490 500
>>CCDS74003.1 TOM1L2 gene_id:146691|Hs108|chr17 (483 aa)
initn: 1900 init1: 962 opt: 1197 Z-score: 1113.6 bits: 215.5 E(32554): 1e-55
Smith-Waterman score: 1795; 58.1% identity (73.4% similar) in 537 aa overlap (1-492:1-483)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDFLLGNPFSSPVGQRIEKATDGSLQSEDWALNMEICDIINETEEGPKDALRAVKKRIVG
:.::::::::.:::: .:::::::::::::.:::::::::::::::::::.::.:::. :
CCDS74 MEFLLGNPFSTPVGQCLEKATDGSLQSEDWTLNMEICDIINETEEGPKDAIRALKKRLNG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 NKNFHEVMLALTVLETCVKNCGHRFHVLVASQDFVESVLVRTILPKNNPPTIVHDKVLNL
:.:..:::::::::::::::::::::.:::..::..::::. : :::::::::.:::: :
CCDS74 NRNYREVMLALTVLETCVKNCGHRFHILVANRDFIDSVLVKIISPKNNPPTIVQDKVLAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 IQSWADAFRSSPDLTGVVTIYEDLRRKGLEFPMTDLDMLSPIHTPQRTVFNSETQSGQDS
::.::::::::::::::: :::.:.:::.::::.::: :::::::::
CCDS74 IQAWADAFRSSPDLTGVVHIYEELKRKGVEFPMADLDALSPIHTPQR-------------
130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 VGTDSSQQEDSGQHAAPLPAPPILSGDTPIAPTPEQIGKLRSELEMVSGNVRVMSEMLTE
:..:::::..: ::..::::::::
CCDS74 ------------------------------------IARLRSELDVVRGNTKVMSEMLTE
170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LVPTQAEPADLELLQELNRTCRAMQQRVLELIPQIANEQLTEELLIVNDNLNNVFLRHER
.:: : . .::::::::::::::::::..::: ...::..::::: :::.:::::::.::
CCDS74 MVPGQEDSSDLELLQELNRTCRAMQQRIVELISRVSNEEVTEELLHVNDDLNNVFLRYER
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340
pF1KB8 FERFRTGQTTKAPSEA---EPAAD-LIDMGP-DPAAT----GN------LSSQLAGMNLG
:::.:.:.... :.. : . : :::.:: .::.. :: :::::::..::
CCDS74 FERYRSGRSVQNASNGVLNEVTEDNLIDLGPGSPAVVSPMVGNTAPPSSLSSQLAGLDLG
260 270 280 290 300 310
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pF1KB8 SSSVRAGLQSLEASGRLEDEFDMFALTRGSSLADQRKEVKYEAPQATDGLAGALDARQQS
. :: . :.::. . .: ::::: :::.:::.::: : :: :::. :::.::: :.::
CCDS74 TESVSGTLSSLQQCNP-RDGFDMFAQTRGNSLAEQRKTVTYEDPQAVGGLASALDNRKQS
320 330 340 350 360 370
410 420 430
pF1KB8 T-----------------------------GAIPVTQACLMEDIEQWLSTDV-GNDAEEP
. : :::.: .:.::: :: ::. :.: ::
CCDS74 SEGTFLSSAQKRGRGGESDLEPIDSWLITQGMIPVAQPSVMDDIEVWLRTDLKGDDLEE-
380 390 400 410 420
440 450 460 470 480 490
pF1KB8 KGVTSEEFDKFLEERAKAADRLPNLSSPSAEGPPGPPSGPAPRKKTQEKDDDMLFAL
::::::::::::::::::. .:.: :: :.: .: :.:. ::: :...: ::::
CCDS74 -GVTSEEFDKFLEERAKAAEMVPDLPSPPMEAP-APASNPSGRKKP-ERSEDALFAL
430 440 450 460 470 480
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10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDFLLGNPFSSPVGQRIEKATDGSLQSEDWALNMEICDIINETEEGPKDALRAVKKRIVG
:.::::::::.:::: .:::::::::::::.:::::::::::::::::::.::.:::. :
CCDS32 MEFLLGNPFSTPVGQCLEKATDGSLQSEDWTLNMEICDIINETEEGPKDAIRALKKRLNG
10 20 30 40 50 60
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pF1KB8 NKNFHEVMLALTVLETCVKNCGHRFHVLVASQDFVESVLVRTILPKNNPPTIVHDKVLNL
:.:..:::::::
CCDS32 NRNYREVMLALT------------------------------------------------
70
130 140 150 160 170 180
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.::::::::::::::: :::.:.:::.::::.::: :::::::::.: :.. .
CCDS32 --AWADAFRSSPDLTGVVHIYEELKRKGVEFPMADLDALSPIHTPQRSV--PEVDPAATM
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..:.:. ..:....: ::: : :: ::. . :::..:::::..: ::..::
CCDS32 PRSQSQQRTSAGSYSSPPPAPYSAPQAPALSVTGPITANSEQIARLRSELDVVRGNTKVM
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::::::.:: : . .::::::::::::::::::..::: ...::..::::: :::.::::
CCDS32 SEMLTEMVPGQEDSSDLELLQELNRTCRAMQQRIVELISRVSNEEVTEELLHVNDDLNNV
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pF1KB8 FLRHERFERFRTGQTTKAPSEA---EPAAD-LIDMGP-DPAAT----GN------LSSQL
:::.:::::.:.:.... :.. : . : :::.:: .::.. :: :::::
CCDS32 FLRYERFERYRSGRSVQNASNGVLNEVTEDNLIDLGPGSPAVVSPMVGNTAPPSSLSSQL
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::..::. :: . :.::. . .: ::::: :::.:::.::: : :: :::. :::.::
CCDS32 AGLDLGTESVSGTLSSLQQCNP-RDGFDMFAQTRGNSLAEQRKTVTYEDPQAVGGLASAL
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pF1KB8 DARQQSTGAIPVTQACLMEDIEQWLSTDV-GNDAEEPKGVTSEEFDKFLEERAKAADRLP
: :.::. .:::.: .:.::: :: ::. :.: :: ::::::::::::::::::. .:
CCDS32 DNRKQSSEGIPVAQPSVMDDIEVWLRTDLKGDDLEE--GVTSEEFDKFLEERAKAAEMVP
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pF1KB8 NLSSPSAEGPPGPPSGPAPRKKTQEKDDDMLFAL
.: :: :.: .: :.:. ::: :...: ::::
CCDS32 DLPSPPMEAP-APASNPSGRKKP-ERSEDALFAL
430 440 450
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10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDFLLGNPFSSPVGQRIEKATDGSLQSEDWALNMEICDIINETEEGPKDALRAVKKRIVG
:.::::::::.:::: .:::::::::::::.:::::::::::::::::::.::.:::. :
CCDS74 MEFLLGNPFSTPVGQCLEKATDGSLQSEDWTLNMEICDIINETEEGPKDAIRALKKRLNG
10 20 30 40 50 60
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pF1KB8 NKNFHEVMLALTVLETCVKNCGHRFHVLVASQDFVESVLVRTILPKNNPPTIVHDKVLNL
:.:..:::::::::::::::::::::.:::..::..::::. : :::::::::.:::: :
CCDS74 NRNYREVMLALTVLETCVKNCGHRFHILVANRDFIDSVLVKIISPKNNPPTIVQDKVLAL
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::
CCDS74 IQ----------------------------------------------------------
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pF1KB8 VGTDSSQQEDSGQHAAPLPAPPILSGDTPIAPTPEQIGKLRSELEMVSGNVRVMSEMLTE
:..:::::..: ::..::::::::
CCDS74 ------------------------------------IARLRSELDVVRGNTKVMSEMLTE
130 140
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LVPTQAEPADLELLQELNRTCRAMQQRVLELIPQIANEQLTEELLIVNDNLNNVFLRHER
.:: : . .::::::::::::::::::..::: ...::..::::: :::.:::::::.::
CCDS74 MVPGQEDSSDLELLQELNRTCRAMQQRIVELISRVSNEEVTEELLHVNDDLNNVFLRYER
150 160 170 180 190 200
310 320 330 340
pF1KB8 FERFRTGQTTKAPSEA---EPAAD-LIDMGP-DPAAT----GN------LSSQLAGMNLG
:::.:.:.... :.. : . : :::.:: .::.. :: :::::::..::
CCDS74 FERYRSGRSVQNASNGVLNEVTEDNLIDLGPGSPAVVSPMVGNTAPPSSLSSQLAGLDLG
210 220 230 240 250 260
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 SSSVRAGLQSLEASGRLEDEFDMFALTRGSSLADQRKEVKYEAPQATDGLAGALDARQQS
. :: . :.::. . .: ::::: :::.:::.::: : :: :::. :::.::: :.::
CCDS74 TESVSGTLSSLQQCNP-RDGFDMFAQTRGNSLAEQRKTVTYEDPQAVGGLASALDNRKQS
270 280 290 300 310 320
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pF1KB8 TGAIPVTQACLMEDIEQWLSTDVGNDAEEPKGVTSEEFDKFLEERAKAADRLPNLSSPSA
: :.: :: ::::::::::::::::::. .:.: ::
CCDS74 -------------------SEGKGDDLEE--GVTSEEFDKFLEERAKAAEMVPDLPSPPM
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pF1KB8 EGPPGPPSGPAPRKKTQEKDDDMLFAL
:.: .: :.:. ::: :...: ::::
CCDS74 EAP-APASNPSGRKKP-ERSEDALFAL
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pF1KB8 IQSWADAFRSSPDLTGVVTIYEDLRRKGLEFPMTDLDMLSPIHTPQRTVFNSETQSGQDS
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CCDS74 IQS---------------------------VPEVD---------PAATMPRSQSQQ-RTS
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pF1KB8 VGTDSSQQEDSGQHAAPLPAP--PILSGDTPIAPTPEQIGKLRSELEMVSGNVRVMSEML
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CCDS74 AGSYSSPPP------APYSAPQAPALSVTGPITANSEQIARLRSELDVVRGNTKVMSEML
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pF1KB8 TELVPTQAEPADLELLQELNRTCRAMQQRVLELIPQIANEQLTEELLIVNDNLNNVFLRH
::.:: : . .::::::::::::::::::..::: ...::..::::: :::.:::::::.
CCDS74 TEMVPGQEDSSDLELLQELNRTCRAMQQRIVELISRVSNEEVTEELLHVNDDLNNVFLRY
200 210 220 230 240 250
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pF1KB8 ERFERFRTGQTTKAPSEA---EPAAD-LIDMGP-DPAAT----GN------LSSQLAGMN
:::::.:.:.... :.. : . : :::.:: .::.. :: :::::::..
CCDS74 ERFERYRSGRSVQNASNGVLNEVTEDNLIDLGPGSPAVVSPMVGNTAPPSSLSSQLAGLD
260 270 280 290 300 310
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pF1KB8 LGSSSVRAGLQSLEASGRLEDEFDMFALTRGSSLADQRKEVKYEAPQATDGLAGALDARQ
::. :: . :.::. . .: ::::: :::.:::.::: : :: :::. :::.::: :.
CCDS74 LGTESVSGTLSSLQQCNP-RDGFDMFAQTRGNSLAEQRKTVTYEDPQAVGGLASALDNRK
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pF1KB8 QSTGAIPVTQACLMEDIEQWLSTDV-GNDAEEPKGVTSEEFDKFLEERAKAADRLPNLSS
::. .:::.: .:.::: :: ::. :.: :: ::::::::::::::::::. .:.: :
CCDS74 QSSEGIPVAQPSVMDDIEVWLRTDLKGDDLEE--GVTSEEFDKFLEERAKAAEMVPDLPS
380 390 400 410 420 430
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pF1KB8 PSAEGPPGPPSGPAPRKKTQEKDDDMLFAL
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CCDS74 PPMEAP-APASNPSGRKKP-ERSEDALFAL
440 450 460
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.:... ::. ::::: ...:.:::. :.:::::: :..:::::..:.::::
CCDS11 MAFGKSHRDPYATSVGHLIEKATFAGVQTEDWGQFMHICDIINTTQDGPKDAVKALKKRI
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pF1KB8 VGNKNFHEVMLALTVLETCVKNCGHRFHVLVASQDFVESVLVRTILPKNNPPTIVHDKVL
: : .:..:.:.... ::.::: :. :.....::. ::. . :. : : .....:
CCDS11 SKNYNHKEIQLTLSLIDMCVQNCGPSFQSLIVKKEFVKENLVKLLNPRYNLPLDIQNRIL
70 80 90 100 110 120
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CCDS11 NFIKTWSQGFPGGVDVSEVKEVYLDLVKKGVQFPPSE----------------AEAETAR
130 140 150 160
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pF1KB8 DSVGTDSSQQEDSGQHAAPLPAPPILSGDTPIAPTPEQIGKLRSELEMVSGNVRVMSEML
. .. ::. : .:: . : .. .. .:::::::.:::.::. :::::: .:
CCDS11 QETAQISSNPPTS-VPTAPALSSVIAPKNSTVTLVPEQIGKLHSELDMVKMNVRVMSAIL
170 180 190 200 210 220
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pF1KB8 TELVPTQAEPADLELLQELNRTCRAMQQRVLELIPQIANEQLTEELLIVNDNLNNVFLRH
: .: . . :.::::.: .: : ::.:...:. . ::..: ::. ::..:::..: .
CCDS11 MENTPGSENHEDIELLQKLYKTGREMQERIMDLLVVVENEDVTVELIQVNEDLNNAILGY
230 240 250 260 270 280
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pF1KB8 ERFERF--RTGQTTKAPSEA-----EPAA---DLIDMGPDP----AATGNLSS---QLAG
::: : : . .: .:: ::.: ::.:..:.: :. :.:.. ::.:
CCDS11 ERFTRNQQRILEQNKNQKEATNTTSEPSAPSQDLLDLSPSPRMPRATLGELNTMNNQLSG
290 300 310 320 330 340
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pF1KB8 MN--LGSSSVRAGLQSLEASGRLEDEFDMFALTRGSSLADQRKEVKYEAPQATDGLAGAL
.: : ::.: .:.
CCDS11 LNFSLPSSDVTNNLKPSLHPQMNLLALENTEIPPFAQRTSQNLTSSHAYDNFLEHSNSVF
350 360 370 380 390 400
492 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]