FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB8733, 488 aa 1>>>pF1KB8733 488 - 488 aa - 488 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.8387+/-0.000544; mu= -2.5416+/- 0.033 mean_var=310.8356+/-64.144, 0's: 0 Z-trim(117.4): 275 B-trim: 1401 in 1/54 Lambda= 0.072746 statistics sampled from 28996 (29292) to 28996 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.7), E-opt: 0.2 (0.343), width: 16 Scan time: 10.690 The best scores are: opt bits E(85289) NP_742013 (OMIM: 605700) E3 ubiquitin-protein liga ( 488) 3292 359.6 1.1e-98 NP_067076 (OMIM: 605700) E3 ubiquitin-protein liga ( 518) 1786 201.6 4.5e-51 NP_003132 (OMIM: 109092) E3 ubiquitin-protein liga ( 475) 1225 142.7 2.2e-33 NP_660215 (OMIM: 607868) E3 ubiquitin-protein liga ( 468) 1156 135.4 3.4e-31 XP_016857901 (OMIM: 607868) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 467) 1149 134.7 5.6e-31 NP_060543 (OMIM: 613184) E3 ubiquitin-protein liga ( 485) 1133 133.0 1.8e-30 XP_011542511 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 477) 1086 128.1 5.5e-29 XP_006711842 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 477) 1086 128.1 5.5e-29 NP_001020111 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein l ( 477) 1086 128.1 5.5e-29 NP_057186 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein liga ( 477) 1086 128.1 5.5e-29 XP_011542512 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 477) 1086 128.1 5.5e-29 XP_011542513 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 450) 997 118.7 3.4e-26 NP_892030 (OMIM: 616017) E3 ubiquitin-protein liga ( 500) 934 112.1 3.6e-24 NP_291027 (OMIM: 610530) E3 ubiquitin-protein liga ( 630) 869 105.4 4.8e-22 NP_060677 (OMIM: 616755) E3 ubiquitin-protein liga ( 475) 862 104.6 6.6e-22 XP_016857118 (OMIM: 616755) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 555) 861 104.5 7.9e-22 NP_001268380 (OMIM: 612548) E3 ubiquitin-protein l ( 487) 812 99.3 2.5e-20 NP_835226 (OMIM: 612548) E3 ubiquitin-protein liga ( 487) 812 99.3 2.5e-20 XP_011514091 (OMIM: 612548) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 486) 808 98.9 3.4e-20 NP_001268379 (OMIM: 612548) E3 ubiquitin-protein l ( 486) 808 98.9 3.4e-20 XP_006714995 (OMIM: 610530) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 520) 807 98.8 3.8e-20 XP_006714992 (OMIM: 610530) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 543) 807 98.8 4e-20 NP_963921 (OMIM: 610530) E3 ubiquitin-protein liga ( 518) 788 96.8 1.5e-19 XP_006714993 (OMIM: 610530) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 541) 788 96.9 1.6e-19 XP_006714994 (OMIM: 610530) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 525) 784 96.4 2.1e-19 NP_001003818 (OMIM: 607564) tripartite motif-conta ( 516) 769 94.8 6.1e-19 NP_477514 (OMIM: 607564) tripartite motif-containi ( 488) 760 93.9 1.1e-18 NP_439893 (OMIM: 605701) tripartite motif-containi ( 395) 704 87.9 5.7e-17 NP_006769 (OMIM: 605701) tripartite motif-containi ( 481) 704 88.0 6.5e-17 NP_006065 (OMIM: 606559) E3 ubiquitin-protein liga ( 498) 690 86.5 1.8e-16 NP_065091 (OMIM: 606124) tripartite motif-containi ( 452) 689 86.4 1.9e-16 NP_067629 (OMIM: 605684) tripartite motif-containi ( 488) 684 85.9 2.8e-16 NP_001003827 (OMIM: 605684) tripartite motif-conta ( 488) 684 85.9 2.8e-16 NP_001186502 (OMIM: 606559) E3 ubiquitin-protein l ( 494) 671 84.5 7.3e-16 NP_741983 (OMIM: 617007) tripartite motif-containi ( 493) 670 84.4 7.9e-16 NP_542783 (OMIM: 616017) E3 ubiquitin-protein liga ( 341) 663 83.5 1e-15 XP_016878725 (OMIM: 134610,249100,608107) PREDICTE ( 780) 669 84.5 1.2e-15 XP_011512527 (OMIM: 605701) PREDICTED: tripartite ( 413) 660 83.3 1.4e-15 NP_001128327 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein l ( 343) 658 83.0 1.5e-15 NP_000234 (OMIM: 134610,249100,608107) pyrin isofo ( 781) 666 84.2 1.5e-15 NP_001008275 (OMIM: 613288) tripartite motif-conta ( 477) 661 83.5 1.5e-15 XP_011512525 (OMIM: 605701) PREDICTED: tripartite ( 499) 660 83.4 1.6e-15 XP_011512523 (OMIM: 605701) PREDICTED: tripartite ( 499) 660 83.4 1.6e-15 XP_011512524 (OMIM: 605701) PREDICTED: tripartite ( 499) 660 83.4 1.6e-15 NP_001291425 (OMIM: 613184) E3 ubiquitin-protein l ( 262) 650 82.1 2.1e-15 XP_005253240 (OMIM: 608487) PREDICTED: tripartite ( 493) 656 83.0 2.2e-15 NP_149023 (OMIM: 608487) tripartite motif-containi ( 493) 656 83.0 2.2e-15 XP_016856908 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 262) 648 81.9 2.5e-15 XP_016856907 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 262) 648 81.9 2.5e-15 XP_011538873 (OMIM: 111620,111750,609017) PREDICTE ( 468) 651 82.4 3e-15 >>NP_742013 (OMIM: 605700) E3 ubiquitin-protein ligase T (488 aa) initn: 3292 init1: 3292 opt: 3292 Z-score: 1892.4 bits: 359.6 E(85289): 1.1e-98 Smith-Waterman score: 3292; 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41.8% identity (69.9% similar) in 471 aa overlap (15-483:2-464) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL ..:: : . :..: .::. . ::: :::::.::. ::.. . NP_003 MASAARLTMMWEEVTCPICLDPFVEPVSIECGHSFCQECISQVGKG- 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSLFCYE :::::. ..:::::::..::. :... :. . : : : : ::: . NP_003 -GGSVCPVCRQRFLLKNLRPNRQLANMVNNLKEISQEAREGTQGERCAVHGERLHLFCEK 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 DQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEKKPG : .:.: .:: :. :: :..:::..:.:::.:::: : :..: . . . : . NP_003 DGKALCWVCAQSRKHRDHAMVPLEEAAQEYQEKLQVALGELRRKQELAEKLEVEIAIKRA 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KB8 ELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDL . :. ::.....: :: . . : ::.: :..::..:.. :. : :. :.:... . : NP_003 DWKKTVETQKSRIHAEFVQQKNFLVEEEQRQLQELEKDEREQLRILGEKEAKLAQQSQAL 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KB8 AHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFALRK .: .:.. .: .:..:.:..: .::. :. . .. .: :: .. . : .:.: NP_003 QELISELDRRCHSSALELLQEVIIVLERSESWNLKDLDITSPEL-RSVCHVP----GLKK 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KB8 ILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEGFTS .:. . .::::.::.: :.:::::..:.. .:. ...: . .:: :: ::... : : NP_003 MLRTCAVHITLDPDTANPWLILSEDRRQVRLGDTQ-QSIPGNEERFDSYPMVLGAQHFHS 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 pF1KB8 GRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTPFTPLH :.:::::.: : : .::::::: :::.. ..:.: . ::: .:: : : : :::: NP_003 GKHYWEVDVTGKEAWDLGVCRDSVRRKGHFLLSSKSGFWTIWLWNKQKYEAGTYPQTPLH 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 pF1KB8 IKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDR-SHIYTFTD-TFTEKLWPLFYPGIRAGRKNAAP ..: : .:::::::::: .::::.::. : ::.:.. .:: : :.: ::. : ::.:: NP_003 LQVPPCQVGIFLDYEAGMVSFYNITDHGSLIYSFSECAFTGPLRPFFSPGFNDGGKNTAP 400 410 420 430 440 450 480 pF1KB8 LTIRPPTDWE ::. : NP_003 LTLCPLNIGSQGSTDY 460 470 >>NP_660215 (OMIM: 607868) E3 ubiquitin-protein ligase T (468 aa) initn: 1242 init1: 484 opt: 1156 Z-score: 681.1 bits: 135.4 E(85289): 3.4e-31 Smith-Waterman score: 1308; 45.1% identity (71.2% similar) in 466 aa overlap (22-483:9-457) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL ::: ::.:..::.:. .::. .::::::. :: : : . NP_660 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQP 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSLFCYE : . :: ::. : :.::::: :..:.:.:..:. . ...:: :.: :. :: . NP_660 EGPYACPECRELSPQRNLRPNRPLAKMAEMARRLHPPSP--VPQGVCPAHREPLAAFCGD 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 DQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEKKPG . . .: : : : :: : ::.::... : ::.: :: :....:. ... .. NP_660 ELRLLCAACERSGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADETCV 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KB8 ELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDL ...:::.::..: :::.:.: : ::.: ::.:::::: ..: ::::.:::::.. : NP_660 LWQKMVESQRQNVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHL 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KB8 AHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFALRK :.: ::.::.: .. .:.:.:..:.. . :: . : .:: .. : .: . NP_660 AELIAELEGRCQLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMEL-RTVCRVP----GLVE 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KB8 ILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEGFTS :... .::::::.::.:.:.:::::.::. . : . :::.:.:: ::::. : ::: NP_660 TLRRFRGDVTLDPDTANPELILSEDRRSVQRGDLR-QALPDSPERFDPGPCVLGQERFTS 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 pF1KB8 GRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRK--GELTPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTPFTP :::::::::::.: ::.::::..:.:: :::. .:.: . .. :. : .. ..: NP_660 GRHYWEVEVGDRTSWALGVCRENVNRKEKGELSA--GNGFW-ILVFLGSYYNSSERALAP 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KB8 LHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTDT-FTEKLWPLFYPGIRAGRKNAA : . :.::::::::::: ::::..:: : .. : . :. : ::: : .. . NP_660 L--RDPPRRVGIFLDYEAGHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPL----SSSPT 400 410 420 430 440 450 480 pF1KB8 PLTI-RPPTDWE :.:: :: NP_660 PMTICRPKGGSGDTLAPQ 460 >>XP_016857901 (OMIM: 607868) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (467 aa) initn: 1066 init1: 308 opt: 1149 Z-score: 677.2 bits: 134.7 E(85289): 5.6e-31 Smith-Waterman score: 1301; 45.3% identity (71.2% similar) in 466 aa overlap (22-483:9-456) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL ::: ::.:..::.:. .::. .::::::. :: : : . XP_016 MAAPDLSTNLQEEATCAICLDYFTDPVMTDCGHNFCRECIRRCWGQP 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 ERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSLFCYE : . :: ::. : :.::::: :..:.:.:..:. . ...:: :.: :. :: . XP_016 EGPYACPECRELSPQRNLRPNRPLAKMAEMARRLHPPSP--VPQGVCPAHREPLAAFCGD 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 DQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEEKKPG . . .: : : : :: : ::.::... : ::.: :: :....:. ... .. XP_016 ELRLLCAACERSGEHWAHRVRPLQDAAEDLKAKLEKSLEHLRKQMQDALLFQAQADET-C 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KB8 ELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLGDKRRDL : ..:::.::..: :::.:.: : ::.: ::.:::::: ..: ::::.:::::.. : XP_016 VLWQMVESQRQNVLGEFERLRRLLAEEEQQLLQRLEEEELEVLPRLREGAAHLGQQSAHL 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KB8 AHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNFPRQYFALRK :.: ::.::.: .. .:.:.:..:.. . :: . : .:: .. : .: . XP_016 AELIAELEGRCQLPALGLLQDIKDALRRVQDVKLQPPEVVPMEL-RTVCRVP----GLVE 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 pF1KB8 ILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPCVLATEGFTS :... .::::::.::.:.:.:::::.::. . : . :::.:.:: ::::. : ::: XP_016 TLRRFRGDVTLDPDTANPELILSEDRRSVQRGDLR-QALPDSPERFDPGPCVLGQERFTS 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 pF1KB8 GRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRK--GELTPLPETGYWRVRLWNGDKYAATTTPFTP :::::::::::.: ::.::::..:.:: :::. .:.: . .. :. : .. ..: XP_016 GRHYWEVEVGDRTSWALGVCRENVNRKEKGELSA--GNGFW-ILVFLGSYYNSSERALAP 340 350 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KB8 LHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTDT-FTEKLWPLFYPGIRAGRKNAA : . :.::::::::::: ::::..:: : .. : . :. : ::: : .. . XP_016 L--RDPPRRVGIFLDYEAGHLSFYSATDGSLLFIFPEIPFSGTLRPLFSPL----SSSPT 400 410 420 430 440 480 pF1KB8 PLTI-RPPTDWE :.:: :: XP_016 PMTICRPKGGSGDTLAPQ 450 460 >>NP_060543 (OMIM: 613184) E3 ubiquitin-protein ligase T (485 aa) initn: 889 init1: 402 opt: 1133 Z-score: 667.9 bits: 133.0 E(85289): 1.8e-30 Smith-Waterman score: 1133; 38.1% identity (66.7% similar) in 480 aa overlap (18-481:5-478) 10 20 30 40 50 pF1KB8 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWE-- : .: . :..: .:. .:.::. :.:::.::..:.. :: NP_060 MDPTALVEAIVEEVACPICMTFLREPMSIDCGHSFCHSCLSGLWEIP 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KB8 --DLERDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHHEALSL . . . ::.:: . :.:::: ::...:: .. :. .:: .: : :.. NP_060 GESQNWGYTCPLCRAPVQPRNLRPNWQLANVVEKVRLLRLHPGMGLKGDLCERHGEKLKM 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 FCYEDQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSSEE :: :: .: :. : :.::.:::..:.. ::: .:.. :: :... .: . . .:. NP_060 FCKEDVLIMCEACSQSPEHEAHSVVPMEDVAWEYKWELHEALEHLKKEQEEAWKLEVGER 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 pF1KB8 KKPGELKRLVESRRQQILREFEEL----------HRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRL :. . : ::.:.:.:. :::. ::.: : . :. :..: . .:.: NP_060 KRTATWKIQVETRKQSIVWEFEKYQRLLEKKQPPHRQLGAEVAAALASLQREAAETMQKL 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB8 RENAAHLGDKRRDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEK . : ..: .. . : .. ::.. . . ::.:.. .:.. .. . .. .:.::. NP_060 ELNHSELIQQSQVLWRMIAELKERSQRPVRWMLQDIQEVLNRSKSWSLQQPEPISLELKT 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KB8 NFSNFPRQYFALRKILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRF . . ..::.::: ::: :::.::. :..::::: :.. .: . :::.:.:: NP_060 DC-----RVLGLREILKTYAADVRLDPDTAYSRLIVSEDRKRVHYGDTNQK-LPDNPERF 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KB8 TFYPCVLATEGFTSGRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNG : ::... ..::::::::::::...:..:::...:.:: . :. :.: .:: .: NP_060 YRYNIVLGSQCISSGRHYWEVEVGDRSEWGLGVCKQNVDRKEVVYLSPHYGFWVIRLRKG 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KB8 DKYAATTTPFTPLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTD-RSHIYTFTD-TFTEKLWPL ..: : : . : . : :.:::::.:::: .::::::: :::.:: : .: : NP_060 NEYRAGTDEYPILSLPVPPRRVGIFVDYEAHDISFYNVTDCGSHIFTFPRYPFPGRLLPY 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB8 FYPGIRAGRKNAAPLTIRPPTDWE : : : .:.:::.: NP_060 FSPCYSIGTNNTAPLAICSLDGED 470 480 >>XP_011542511 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (477 aa) initn: 1113 init1: 417 opt: 1086 Z-score: 641.3 bits: 128.1 E(85289): 5.5e-29 Smith-Waterman score: 1086; 37.8% identity (66.6% similar) in 473 aa overlap (23-481:10-473) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL :: ::.::.::.:. .::. ::::::.::: :: XP_011 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKA 10 20 30 40 70 80 90 100 110 pF1KB8 -------ER--DFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHH .: .:::: ::. : :.: ::: : ...:.:.: ..... .:: .:: XP_011 RGKKGRRKRKGSFPCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQHPGLQKQ----DLCQEHH 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 EALSLFCYEDQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRC : :.::: .:: .:..: :. :: : :.: ..:.: :: ::.. .: :.... . XP_011 EPLKLFCQKDQSPICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNL 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 KSSEEKKPGELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAA .. ::.. .: . :. ::..:. :::... : ::.: ::. :: ::.. .::::..: XP_011 QAREEQSLAEWQGKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVA 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 HLGDKRRDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNF : . ..: : ..: . :. ..::.:.: : . ..:... . .. XP_011 CLDRQGHSLELLLLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRV 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 PRQYFALRKILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPC : : .:: .:.... :.: .:.: :.: :.:. . . . . ::. ::: XP_011 PGQIEVLRGFLEDVVPDAT----SAYPYLLLYESRQRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYPC 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 pF1KB8 VLATEGFTSGRHYWEVEV---GDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNGDK ... .:.:::::::: . :: ::.:::::.:::: .. ::.:.: :.: .: : XP_011 AVGQTAFSSGRHYWEVGMNITGDAL-WALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTK 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 pF1KB8 YAATTTPFTPLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTD-TFTEKLWPLFYP : .: . .::. . :...:::::.::: .:::.:.: ::..:... :: : :.: XP_011 YLSTFSALTPVMLMEPPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFFCL 400 410 420 430 440 450 470 480 pF1KB8 GI-RAGRKNAAPLTIRPPTDWE : ..:. . .:. XP_011 GAPKSGQMVISTVTMWVKG 460 470 >>XP_006711842 (OMIM: 606123) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (477 aa) initn: 1113 init1: 417 opt: 1086 Z-score: 641.3 bits: 128.1 E(85289): 5.5e-29 Smith-Waterman score: 1086; 37.8% identity (66.6% similar) in 473 aa overlap (23-481:10-473) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL :: ::.::.::.:. .::. ::::::.::: :: XP_006 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKA 10 20 30 40 70 80 90 100 110 pF1KB8 -------ER--DFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHH .: .:::: ::. : :.: ::: : ...:.:.: ..... .:: .:: XP_006 RGKKGRRKRKGSFPCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQHPGLQKQ----DLCQEHH 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 EALSLFCYEDQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRC : :.::: .:: .:..: :. :: : :.: ..:.: :: ::.. .: :.... . XP_006 EPLKLFCQKDQSPICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNL 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 KSSEEKKPGELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAA .. ::.. .: . :. ::..:. :::... : ::.: ::. :: ::.. .::::..: XP_006 QAREEQSLAEWQGKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVA 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 HLGDKRRDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNF : . ..: : ..: . :. ..::.:.: : . ..:... . .. XP_006 CLDRQGHSLELLLLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRV 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 PRQYFALRKILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPC : : .:: .:.... :.: .:.: :.: :.:. . . . . ::. ::: XP_006 PGQIEVLRGFLEDVVPDAT----SAYPYLLLYESRQRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYPC 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 pF1KB8 VLATEGFTSGRHYWEVEV---GDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNGDK ... .:.:::::::: . :: ::.:::::.:::: .. ::.:.: :.: .: : XP_006 AVGQTAFSSGRHYWEVGMNITGDAL-WALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTK 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 pF1KB8 YAATTTPFTPLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTD-TFTEKLWPLFYP : .: . .::. . :...:::::.::: .:::.:.: ::..:... :: : :.: XP_006 YLSTFSALTPVMLMEPPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFFCL 400 410 420 430 440 450 470 480 pF1KB8 GI-RAGRKNAAPLTIRPPTDWE : ..:. . .:. XP_006 GAPKSGQMVISTVTMWVKG 460 470 >>NP_001020111 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein ligas (477 aa) initn: 1113 init1: 417 opt: 1086 Z-score: 641.3 bits: 128.1 E(85289): 5.5e-29 Smith-Waterman score: 1086; 37.8% identity (66.6% similar) in 473 aa overlap (23-481:10-473) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL :: ::.::.::.:. .::. ::::::.::: :: NP_001 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKA 10 20 30 40 70 80 90 100 110 pF1KB8 -------ER--DFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHH .: .:::: ::. : :.: ::: : ...:.:.: ..... .:: .:: NP_001 RGKKGRRKRKGSFPCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQHPGLQKQ----DLCQEHH 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 EALSLFCYEDQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRC : :.::: .:: .:..: :. :: : :.: ..:.: :: ::.. .: :.... . NP_001 EPLKLFCQKDQSPICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNL 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 KSSEEKKPGELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAA .. ::.. .: . :. ::..:. :::... : ::.: ::. :: ::.. .::::..: NP_001 QAREEQSLAEWQGKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVA 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 HLGDKRRDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNF : . ..: : ..: . :. ..::.:.: : . ..:... . .. NP_001 CLDRQGHSLELLLLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRV 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 PRQYFALRKILKQLIADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFYPC : : .:: .:.... :.: .:.: :.: :.:. . . . . ::. ::: NP_001 PGQIEVLRGFLEDVVPDAT----SAYPYLLLYESRQRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYPC 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 pF1KB8 VLATEGFTSGRHYWEVEV---GDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNGDK ... .:.:::::::: . :: ::.:::::.:::: .. ::.:.: :.: .: : NP_001 AVGQTAFSSGRHYWEVGMNITGDAL-WALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTK 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 pF1KB8 YAATTTPFTPLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTD-TFTEKLWPLFYP : .: . .::. . :...:::::.::: .:::.:.: ::..:... :: : :.: NP_001 YLSTFSALTPVMLMEPPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFFCL 400 410 420 430 440 450 470 480 pF1KB8 GI-RAGRKNAAPLTIRPPTDWE : ..:. . .:. NP_001 GAPKSGQMVISTVTMWVKG 460 470 >>NP_057186 (OMIM: 606123) E3 ubiquitin-protein ligase T (477 aa) initn: 1113 init1: 417 opt: 1086 Z-score: 641.3 bits: 128.1 E(85289): 5.5e-29 Smith-Waterman score: 1086; 37.8% identity (66.6% similar) in 473 aa overlap (23-481:10-473) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL :: ::.::.::.:. .::. ::::::.::: :: NP_057 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKA 10 20 30 40 70 80 90 100 110 pF1KB8 -------ER--DFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQLQAVKRKIRDESLCPQHH .: .:::: ::. : :.: ::: : ...:.:.: ..... .:: .:: NP_057 RGKKGRRKRKGSFPCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQHPGLQKQ----DLCQEHH 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 EALSLFCYEDQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRC : :.::: .:: .:..: :. :: : :.: ..:.: :: ::.. .: :.... . NP_057 EPLKLFCQKDQSPICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLREQITRTGNL 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 KSSEEKKPGELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAA .. ::.. .: . :. ::..:. :::... : ::.: ::. :: ::.. .::::..: NP_057 QAREEQSLAEWQGKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVA 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 HLGDKRRDLAHLAAEVEGKCLQSGFEMLKDVKSTLEKCEKVKTMEVTSVSIELEKNFSNF : . ..: : ..: . :. ..::.:.: : . ..:... . .. 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