Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8742
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8742, 375 aa
1>>>pF1KB8742 375 - 375 aa - 375 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1489+/-0.000923; mu= 11.6334+/- 0.055
mean_var=61.2936+/-12.553, 0's: 0 Z-trim(104.0): 33 B-trim: 16 in 1/50
Lambda= 0.163820
statistics sampled from 7660 (7682) to 7660 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.604), E-opt: 0.2 (0.236), width: 16
Scan time: 2.670
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13656.1 KCNJ15 gene_id:3772|Hs108|chr21 ( 375) 2443 586.0 1.8e-167
CCDS1193.1 KCNJ10 gene_id:3766|Hs108|chr1 ( 379) 1484 359.4 3e-99
CCDS8477.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs108|chr11 ( 372) 1159 282.6 3.9e-76
CCDS8476.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs108|chr11 ( 391) 1159 282.6 4.1e-76
CCDS11219.1 KCNJ12 gene_id:3768|Hs108|chr17 ( 433) 969 237.7 1.5e-62
CCDS74015.1 KCNJ18 gene_id:100134444|Hs108|chr17 ( 433) 954 234.1 1.8e-61
CCDS11688.1 KCNJ2 gene_id:3759|Hs108|chr17 ( 427) 925 227.3 2e-59
CCDS8479.1 KCNJ5 gene_id:3762|Hs108|chr11 ( 419) 875 215.5 7.1e-56
CCDS12721.1 KCNJ14 gene_id:3770|Hs108|chr19 ( 436) 873 215.0 1e-55
CCDS2200.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs108|chr2 ( 501) 846 208.6 9.8e-54
CCDS42927.1 KCNJ6 gene_id:3763|Hs108|chr21 ( 423) 844 208.1 1.1e-53
CCDS31436.1 KCNJ11 gene_id:3767|Hs108|chr11 ( 390) 839 206.9 2.4e-53
CCDS2498.1 KCNJ13 gene_id:3769|Hs108|chr2 ( 360) 808 199.6 3.6e-51
CCDS1194.1 KCNJ9 gene_id:3765|Hs108|chr1 ( 393) 806 199.1 5.4e-51
CCDS8692.1 KCNJ8 gene_id:3764|Hs108|chr12 ( 424) 774 191.6 1.1e-48
CCDS11687.1 KCNJ16 gene_id:3773|Hs108|chr17 ( 418) 744 184.5 1.5e-46
CCDS74141.1 KCNJ16 gene_id:3773|Hs108|chr17 ( 453) 744 184.5 1.6e-46
CCDS53606.1 KCNJ11 gene_id:3767|Hs108|chr11 ( 303) 698 173.6 2e-43
CCDS13971.1 KCNJ4 gene_id:3761|Hs108|chr22 ( 445) 694 172.7 5.7e-43
CCDS58733.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs108|chr2 ( 235) 532 134.4 1e-31
>>CCDS13656.1 KCNJ15 gene_id:3772|Hs108|chr21 (375 aa)
initn: 2443 init1: 2443 opt: 2443 Z-score: 3120.3 bits: 586.0 E(32554): 1.8e-167
Smith-Waterman score: 2443; 100.0% identity (100.0% similar) in 375 aa overlap (1-375:1-375)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDAIHIGMSSTPLVKHTAGAGLKANRPRVMSKSGHSNVRIDKVDGIYLLYLQDLWTTVID
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CCDS13 MDAIHIGMSSTPLVKHTAGAGLKANRPRVMSKSGHSNVRIDKVDGIYLLYLQDLWTTVID
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 MKWRYKLTLFAATFVMTWFLFGVIYYAIAFIHGDLEPGEPISNHTPCIMKVDSLTGAFLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MKWRYKLTLFAATFVMTWFLFGVIYYAIAFIHGDLEPGEPISNHTPCIMKVDSLTGAFLF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 SLESQTTIGYGVRSITEECPHAIFLLVAQLVITTLIEIFITGTFLAKIARPKKRAETIKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SLESQTTIGYGVRSITEECPHAIFLLVAQLVITTLIEIFITGTFLAKIARPKKRAETIKF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 SHCAVITKQNGKLCLVIQVANMRKSLLIQCQLSGKLLQTHVTKEGERILLNQATVKFHVD
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CCDS13 SHCAVITKQNGKLCLVIQVANMRKSLLIQCQLSGKLLQTHVTKEGERILLNQATVKFHVD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 SSSESPFLILPMTFYHVLDETSPLRDLTPQNLKEKEFELVVLLNATVESTSAVCQSRTSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SSSESPFLILPMTFYHVLDETSPLRDLTPQNLKEKEFELVVLLNATVESTSAVCQSRTSY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 IPEEIYWGFEFVPVVSLSKNGKYVADFSQFEQIRKSPDCTFYCADSEKQQLEEKYRQEDQ
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CCDS13 IPEEIYWGFEFVPVVSLSKNGKYVADFSQFEQIRKSPDCTFYCADSEKQQLEEKYRQEDQ
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB8 RERELRTLLLQQSNV
:::::::::::::::
CCDS13 RERELRTLLLQQSNV
370
>>CCDS1193.1 KCNJ10 gene_id:3766|Hs108|chr1 (379 aa)
initn: 1453 init1: 1143 opt: 1484 Z-score: 1895.3 bits: 359.4 E(32554): 3e-99
Smith-Waterman score: 1484; 62.9% identity (82.3% similar) in 372 aa overlap (10-375:17-379)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MDAIHIGMSSTPLVKHTAGAGLKANRPRVMSKSGHSNVRIDKVDGIYLLYLQD
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CCDS11 MTSVAKVYYSQTTQTESRPLM----GPGIR--RRRVLTKDGRSNVRMEHIADKRFLYLKD
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 LWTTVIDMKWRYKLTLFAATFVMTWFLFGVIYYAIAFIHGDLEPGEPISNHTPCIMKVDS
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CCDS11 LWTTFIDMQWRYKLLLFSATFAGTWFLFGVVWYLVAVAHGDLLELDPPANHTPCVVQVHT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 LTGAFLFSLESQTTIGYGVRSITEECPHAIFLLVAQLVITTLIEIFITGTFLAKIARPKK
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CCDS11 LTGAFLFSLESQTTIGYGFRYISEECPLAIVLLIAQLVLTTILEIFITGTFLAKIARPKK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 RAETIKFSHCAVITKQNGKLCLVIQVANMRKSLLIQCQLSGKLLQTHVTKEGERILLNQA
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CCDS11 RAETIRFSQHAVVASHNGKPCLMIRVANMRKSLLIGCQVTGKLLQTHQTKEGENIRLNQV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 TVKFHVDSSSESPFLILPMTFYHVLDETSPLRDLTPQNLKEKEFELVVLLNATVESTSAV
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CCDS11 NVTFQVDTASDSPFLILPLTFYHVVDETSPLKDL-PLRSGEGDFELVLILSGTVESTSAT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB8 CQSRTSYIPEEIYWGFEFVPVVSLSKNGKYVADFSQFEQIRK--SP----DCTFYCADSE
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CCDS11 CQVRTSYLPEEILWGYEFTPAISLSASGKYIADFSLFDQVVKVASPSGLRDSTVRYGDPE
300 310 320 330 340 350
350 360 370
pF1KB8 KQQLEEKYRQEDQRERELRTLLLQQSNV
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CCDS11 KLKLEESLRE--QAEKEGSALSVRISNV
360 370
>>CCDS8477.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs108|chr11 (372 aa)
initn: 1091 init1: 1091 opt: 1159 Z-score: 1480.3 bits: 282.6 E(32554): 3.9e-76
Smith-Waterman score: 1159; 50.8% identity (83.1% similar) in 331 aa overlap (21-348:15-344)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MDAIHIGMSSTPLVKHTAGAGLKANRPRVMSKSGHSNVRIDKVDGI-YLLYLQDLWTTVI
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CCDS84 MFKHLRKWVVTRFFGHSRQRARLVSKDGRCNIEFGNVEAQSRFIFFVDIWTTVL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 DMKWRYKLTLFAATFVMTWFLFGVIYYAIAFIHGDLEPGEPISNHTPCIMKVDSLTGAFL
:.:::::.:.: ..:. .::.::...::.:.:: :: .: .:::::. ....::.:::
CCDS84 DLKWRYKMTIFITAFLGSWFFFGLLWYAVAYIHKDLPEFHPSANHTPCVENINGLTSAFL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 FSLESQTTIGYGVRSITEECPHAIFLLVAQLVITTLIEIFITGTFLAKIARPKKRAETIK
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CCDS84 FSLETQVTIGYGFRCVTEQCATAIFLLIFQSILGVIINSFMCGAILAKISRPKKRAKTIT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 FSHCAVITKQNGKLCLVIQVANMRKSLLIQCQLSGKLLQTHVTKEGERILLNQATVKFHV
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CCDS84 FSKNAVISKRGGKLCLLIRVANLRKSLLIGSHIYGKLLKTTVTPEGETIILDQININFVV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 DSSSESPFLILPMTFYHVLDETSPLRDLTPQNLKEKEFELVVLLNATVESTSAVCQSRTS
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CCDS84 DAGNENLFFISPLTIYHVIDHNSPFFHMAAETLLQQDFELVVFLDGTVESTSATCQVRTS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 YIPEEIYWGFEFVPVVSLSKNGKYVADFSQFEQIRK--SPDCTFYCADSEKQQLEEKYRQ
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CCDS84 YVPEEVLWGYRFAPIVSKTKEGKYRVDFHNFSKTVEVETPHCAM-CLYNEKDVRARMKRG
300 310 320 330 340 350
360 370
pF1KB8 EDQRERELRTLLLQQSNV
CCDS84 YDNPNFILSEVNETDDTKM
360 370
>>CCDS8476.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs108|chr11 (391 aa)
initn: 1091 init1: 1091 opt: 1159 Z-score: 1479.9 bits: 282.6 E(32554): 4.1e-76
Smith-Waterman score: 1159; 50.8% identity (83.1% similar) in 331 aa overlap (21-348:34-363)
10 20 30 40
pF1KB8 MDAIHIGMSSTPLVKHTAGAGLKANRPRVMSKSGHSNVRIDKVDGI-YLL
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CCDS84 SSRNVFDTLIRVLTESMFKHLRKWVVTRFFGHSRQRARLVSKDGRCNIEFGNVEAQSRFI
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 YLQDLWTTVIDMKWRYKLTLFAATFVMTWFLFGVIYYAIAFIHGDLEPGEPISNHTPCIM
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CCDS84 FFVDIWTTVLDLKWRYKMTIFITAFLGSWFFFGLLWYAVAYIHKDLPEFHPSANHTPCVE
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 KVDSLTGAFLFSLESQTTIGYGVRSITEECPHAIFLLVAQLVITTLIEIFITGTFLAKIA
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CCDS84 NINGLTSAFLFSLETQVTIGYGFRCVTEQCATAIFLLIFQSILGVIINSFMCGAILAKIS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 RPKKRAETIKFSHCAVITKQNGKLCLVIQVANMRKSLLIQCQLSGKLLQTHVTKEGERIL
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CCDS84 RPKKRAKTITFSKNAVISKRGGKLCLLIRVANLRKSLLIGSHIYGKLLKTTVTPEGETII
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 LNQATVKFHVDSSSESPFLILPMTFYHVLDETSPLRDLTPQNLKEKEFELVVLLNATVES
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CCDS84 LDQININFVVDAGNENLFFISPLTIYHVIDHNSPFFHMAAETLLQQDFELVVFLDGTVES
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 TSAVCQSRTSYIPEEIYWGFEFVPVVSLSKNGKYVADFSQFEQIRK--SPDCTFYCADSE
:::.:: ::::.:::. ::..:.:.:: .:.::: .:: .: . . .: :.. : .:
CCDS84 TSATCQVRTSYVPEEVLWGYRFAPIVSKTKEGKYRVDFHNFSKTVEVETPHCAM-CLYNE
310 320 330 340 350 360
350 360 370
pF1KB8 KQQLEEKYRQEDQRERELRTLLLQQSNV
:
CCDS84 KDVRARMKRGYDNPNFILSEVNETDDTKM
370 380 390
>>CCDS11219.1 KCNJ12 gene_id:3768|Hs108|chr17 (433 aa)
initn: 897 init1: 697 opt: 969 Z-score: 1236.4 bits: 237.7 E(32554): 1.5e-62
Smith-Waterman score: 969; 43.3% identity (76.1% similar) in 330 aa overlap (26-355:43-367)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MDAIHIGMSSTPLVKHTAGAGLKANRPRVMSKSGHSNVRIDKVDGIYLLYLQDLW
: : ..:.:. :... ..: :: :..
CCDS11 VSSEEDGLHLVTMSGANGFGNGKVHTRRRCRNRFVKKNGQCNIEFANMDEKSQRYLADMF
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 TTVIDMKWRYKLTLFAATFVMTWFLFGVIYYAIAFIHGDLEPGEPISNHTPCIMKVDSLT
:: .:..::: : .:. .:. .:.:::.:...:: ::::::.: ..:::.:.: ..
CCDS11 TTCVDIRWRYMLLIFSLAFLASWLLFGIIFWVIAVAHGDLEPAEG-RGRTPCVMQVHGFM
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 GAFLFSLESQTTIGYGVRSITEECPHAIFLLVAQLVITTLIEIFITGTFLAKIARPKKRA
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CCDS11 AAFLFSIETQTTIGYGLRCVTEECPVAVFMVVAQSIVGCIIDSFMIGAIMAKMARPKKRA
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 ETIKFSHCAVITKQNGKLCLVIQVANMRKSLLIQCQLSGKLLQTHVTKEGERILLNQATV
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CCDS11 QTLLFSHNAVVALRDGKLCLMWRVGNLRKSHIVEAHVRAQLIKPRVTEEGEYIPLDQIDI
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 KFHVDSSSESPFLILPMTFYHVLDETSPLRDLTPQNLKEKEFELVVLLNATVESTSAVCQ
:.. . ::. :.:. : .::.::: .. :.:. .::.::.:.. ::.:. . :
CCDS11 DVGFDKGLDRIFLVSPITILHEIDEASPLFGISRQDLETDDFEIVVILEGMVEATAMTTQ
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 SRTSYIPEEIYWGFEFVPVVSLSKNGKYVADFSQFEQIRKSPDCTFYCADSEKQQLEEKY
.:.::. .:: :: .: ::. :: .: :.:.:.. . :. : : : :. .:.:.
CCDS11 ARSSYLANEILWGHRFEPVLFEEKN-QYKIDYSHFHKTYEVPS-TPRC--SAKDLVENKF
320 330 340 350 360
360 370
pF1KB8 RQEDQRERELRTLLLQQSNV
CCDS11 LLPSANSFCYENELAFLSRDEEDEADGDQDGRSRDGLSPQARHDFDRLQAGGGVLEQRPY
370 380 390 400 410 420
>>CCDS74015.1 KCNJ18 gene_id:100134444|Hs108|chr17 (433 aa)
initn: 884 init1: 683 opt: 954 Z-score: 1217.3 bits: 234.1 E(32554): 1.8e-61
Smith-Waterman score: 954; 43.3% identity (75.5% similar) in 330 aa overlap (26-355:43-367)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MDAIHIGMSSTPLVKHTAGAGLKANRPRVMSKSGHSNVRIDKVDGIYLLYLQDLW
: : ..:.:. :. . ..: :: :..
CCDS74 VSLEEDGLHLVTMSGANGFGNGKVHTRRRCRNRFVKKNGQCNIAFANMDEKSQRYLADMF
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 TTVIDMKWRYKLTLFAATFVMTWFLFGVIYYAIAFIHGDLEPGEPISNHTPCIMKVDSLT
:: .:..::: : .:. .:. .:.:::::...:: ::::::.: ..:::.:.: ..
CCDS74 TTCVDIRWRYMLLIFSLAFLASWLLFGVIFWVIAVAHGDLEPAEG-HGRTPCVMQVHGFM
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 GAFLFSLESQTTIGYGVRSITEECPHAIFLLVAQLVITTLIEIFITGTFLAKIARPKKRA
.:::::.:.:::::::.: .:::: :.:..::: .. .:. :. :...::.:::::::
CCDS74 AAFLFSIETQTTIGYGLRCVTEECLVAVFMVVAQSIVGCIIDSFMIGAIMAKMARPKKRA
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 ETIKFSHCAVITKQNGKLCLVIQVANMRKSLLIQCQLSGKLLQTHVTKEGERILLNQATV
.:. ::: ::.. ..:::::. .:.:.::: ... .. ..:.. .::.::: : :.: .
CCDS74 QTLLFSHNAVVALRDGKLCLMWRVGNLRKSHIVEAHVRAQLIKPRVTEEGEYIPLDQIDI
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 KFHVDSSSESPFLILPMTFYHVLDETSPLRDLTPQNLKEKEFELVVLLNATVESTSAVCQ
:.. . ::. :.:. : .::.::: .. :.:. .::.::.:.. ::.:. . :
CCDS74 DVGFDKGLDRIFLVSPITILHEIDEASPLFGISRQDLETDDFEIVVILEGMVEATAMTTQ
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 SRTSYIPEEIYWGFEFVPVVSLSKNGKYVADFSQFEQIRKSPDCTFYCADSEKQQLEEKY
.:.::. .:: :: .: ::. :: .: :.:.:.. . :. : : : :. .:.:.
CCDS74 ARSSYLANEILWGHRFEPVLFEEKN-QYKIDYSHFHKTYEVPS-TPRC--SAKDLVENKF
320 330 340 350 360
360 370
pF1KB8 RQEDQRERELRTLLLQQSNV
CCDS74 LLPSANSFCYENELAFLSRDEEDEADGDQDGRSRDGLSPQARHDFDRLQAGGGVLEQRPY
370 380 390 400 410 420
>>CCDS11688.1 KCNJ2 gene_id:3759|Hs108|chr17 (427 aa)
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Smith-Waterman score: 925; 42.1% identity (73.9% similar) in 330 aa overlap (26-355:44-366)
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CCDS84 ELAEMKREGRLLQYLPSPPLLGGCAEAGLDAEAEQNEEDEPKGLGGSREARGSV
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.:
CCDS12 EQASHSLKSSFPGSLTAFCYENELALSCCQEEDEDDETEEGNGVETEDGAASPRVLTPTL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]