Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8781
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8781, 262 aa
1>>>pF1KB8781 262 - 262 aa - 262 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1862+/-0.00169; mu= 7.4105+/- 0.100
mean_var=250.6713+/-50.210, 0's: 0 Z-trim(105.2): 948 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.081007
statistics sampled from 7275 (8292) to 7275 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.569), E-opt: 0.2 (0.255), width: 16
Scan time: 1.850
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2720.2 ZNF501 gene_id:115560|Hs108|chr3 ( 271) 1885 233.6 1.1e-61
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1443 182.4 5.7e-46
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1297 165.4 8.4e-41
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1297 165.5 8.7e-41
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1297 165.5 8.8e-41
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1297 165.5 8.9e-41
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 1251 159.7 2.6e-39
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 1251 159.9 3e-39
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 1251 159.9 3.1e-39
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1240 158.6 7.2e-39
CCDS69562.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 539) 1238 158.4 9.2e-39
CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 560) 1238 158.5 9.4e-39
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1237 158.5 1.2e-38
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 536) 1231 157.6 1.6e-38
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 592) 1231 157.7 1.7e-38
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 1218 156.2 5.3e-38
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 1211 155.2 7.6e-38
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1210 155.3 1e-37
CCDS12943.1 ZNF583 gene_id:147949|Hs108|chr19 ( 569) 1206 154.7 1.3e-37
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1206 154.9 1.4e-37
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 1202 154.4 2e-37
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 1199 153.9 2.2e-37
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1198 153.8 2.5e-37
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1199 154.0 2.5e-37
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 1200 154.3 2.6e-37
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1200 154.3 2.6e-37
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1198 153.9 2.6e-37
CCDS12947.1 ZNF71 gene_id:58491|Hs108|chr19 ( 489) 1194 153.2 3.1e-37
CCDS12854.1 ZNF83 gene_id:55769|Hs108|chr19 ( 516) 1194 153.3 3.2e-37
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 1193 153.3 4e-37
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 1193 153.3 4e-37
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 1193 153.3 4.1e-37
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 1193 153.4 4.3e-37
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 1189 152.8 5e-37
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 1189 152.8 5.2e-37
CCDS45852.1 ZNF397 gene_id:84307|Hs108|chr18 ( 534) 1188 152.6 5.3e-37
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 1189 152.8 5.3e-37
CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 ( 869) 1191 153.2 5.5e-37
CCDS6787.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 630) 1188 152.7 5.8e-37
CCDS65109.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 631) 1188 152.7 5.8e-37
CCDS65110.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 645) 1188 152.7 5.9e-37
CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17 ( 502) 1184 152.1 7e-37
CCDS47944.1 ZNF251 gene_id:90987|Hs108|chr8 ( 671) 1184 152.3 8.3e-37
CCDS35106.1 ZNF483 gene_id:158399|Hs108|chr9 ( 744) 1184 152.3 8.8e-37
CCDS12861.1 ZNF677 gene_id:342926|Hs108|chr19 ( 584) 1182 152.0 9e-37
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 1177 151.2 1.2e-36
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1180 151.9 1.2e-36
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1177 151.4 1.4e-36
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1177 151.4 1.4e-36
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 1173 150.9 1.9e-36
>>CCDS2720.2 ZNF501 gene_id:115560|Hs108|chr3 (271 aa)
initn: 1885 init1: 1885 opt: 1885 Z-score: 1221.1 bits: 233.6 E(32554): 1.1e-61
Smith-Waterman score: 1885; 99.6% identity (100.0% similar) in 262 aa overlap (1-262:10-271)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MKHGRVNVQKKPSKCSECGKFFTQRSSLTQHQRIHRGEKPYVCSECGSCFR
:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 MNSSQISLRMKHGRVNMQKKPSKCSECGKFFTQRSSLTQHQRIHRGEKPYVCSECGSCFR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 KQSNLTQHLRIHTGEKPYKCNECEKAFQTKAILVQHLRIHTGEKPYKCNECGKAFCQSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 KQSNLTQHLRIHTGEKPYKCNECEKAFQTKAILVQHLRIHTGEKPYKCNECGKAFCQSPS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 LIKHQRIHTGEKPYKCTECGKAFSQSICLTRHQRSHSGDKPFKCNECGKAFNQSACLMQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 LIKHQRIHTGEKPYKCTECGKAFSQSICLTRHQRSHSGDKPFKCNECGKAFNQSACLMQH
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 QRIHSGEKPYTCTECGKAFTQNSSLVEHERTHTGEKLYKCSECEKTFRKQAHLSEHYRIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 QRIHSGEKPYTCTECGKAFTQNSSLVEHERTHTGEKLYKCSECEKTFRKQAHLSEHYRIH
190 200 210 220 230 240
240 250 260
pF1KB8 TGEKPYECVGCGKSFRHSSALLRHQRLHAGE
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 TGEKPYECVGCGKSFRHSSALLRHQRLHAGE
250 260 270
>>CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 (544 aa)
initn: 2443 init1: 1422 opt: 1443 Z-score: 938.8 bits: 182.4 E(32554): 5.7e-46
Smith-Waterman score: 1471; 69.9% identity (82.7% similar) in 289 aa overlap (2-262:256-544)
10 20 30
pF1KB8 MKHGRVNVQKKPSKCSECGKFFTQRSSLTQH
.: :... .:: ::..::: :.: . : .:
CCDS27 LTQHQRIHTGEKPYKCNECGNSFRNHSHLTEHQRIHTGEKPYKCNRCGKAFNQNTHLIHH
230 240 250 260 270 280
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 QRIHRGEKPYVCSECGSCFRKQSNLTQHLRIHTGEKPYKCNECEKAFQTKAILVQHLRIH
:::: :::::.:::::: :::.:::::: ::::::::.::.:: :.::::: : :: :::
CCDS27 QRIHTGEKPYICSECGSSFRKHSNLTQHQRIHTGEKPHKCDECGKTFQTKANLSQHQRIH
290 300 310 320 330 340
100 110 120 130
pF1KB8 TGEKPYKCNECGKAFCQSPSLIKHQRIHTGEKPYKCTECGKAFSQS--------------
.:::::::.::::::::::::::::::::::::::: ::::::.::
CCDS27 SGEKPYKCKECGKAFCQSPSLIKHQRIHTGEKPYKCKECGKAFTQSTPLTKHQRIHTGER
350 360 370 380 390 400
140 150 160 170 180
pF1KB8 --------------ICLTRHQRSHSGDKPFKCNECGKAFNQSACLMQHQRIHSGEKPYTC
::: ::::::.:.::.:::::::.:::..:: ::.:::.::::: :
CCDS27 PYKCSECGKAFIQSICLIRHQRSHTGEKPYKCNECGKGFNQNTCLTQHMRIHTGEKPYKC
410 420 430 440 450 460
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TECGKAFTQNSSLVEHERTHTGEKLYKCSECEKTFRKQAHLSEHYRIHTGEKPYECVGCG
::::::...:::.::.:::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::. ::
CCDS27 KECGKAFAHSSSLTEHHRTHTGEKLYKCSECEKTFRKYAHLSEHYRIHTGEKPYECIECG
470 480 490 500 510 520
250 260
pF1KB8 KSFRHSSALLRHQRLHAGE
: :::::.:.:::.::.:.
CCDS27 KFFRHSSVLFRHQKLHSGD
530 540
>--
initn: 1870 init1: 500 opt: 509 Z-score: 348.9 bits: 73.3 E(32554): 4.1e-13
Smith-Waterman score: 515; 43.8% identity (68.0% similar) in 194 aa overlap (9-196:66-254)
10 20 30
pF1KB8 MKHGRVNVQKKPSKCSECGKFFTQRSSLTQHQRIHRGE
...: . .: : :.... . ::.
CCDS27 DSSGIVVKRFQEDEYQDSTFEEKYACEGMKENSPREIAESCLF--QEGGFGRITFIHKEA
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 KPYVCSECGSCFRKQ----SNLTQHLRIHTGEKPYKCNECEKAFQTKAILVQHL--RIHT
: . :. : :.:. :.:. .::. : :. .. . . .::. : : . :
CCDS27 PPEIISQ-GYNFEKSLLLTSSLVTRLRVSTEESLHQWETSN--IQTNDISDQSKCPTLCT
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 GEKPYKCNECGKAFCQSPSLIKHQRIHTGEKPYKCTECGKAFSQSICLTRHQRSHSGDKP
.: .:::::::.: :: :: .::: ::::.:: : :::::::.: :..::: :.: ::
CCDS27 QKKSWKCNECGKTFTQSSSLTQHQRTHTGERPYTCEECGKAFSRSSFLVQHQRIHTGVKP
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 FKCNECGKAFNQSACLMQHQRIHSGEKPYTCTECGKAFTQNSSLVEHERTHTGEKLYKCS
. :..:::.: . : ::::::.::::: :.:::..: ..: :
CCDS27 YGCEQCGKTFRCRSFLTQHQRIHTGEKPYKCNECGNSFRNHSHLTEHQRIHTGEKPYKCN
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260
pF1KB8 ECEKTFRKQAHLSEHYRIHTGEKPYECVGCGKSFRHSSALLRHQRLHAGE
CCDS27 RCGKAFNQNTHLIHHQRIHTGEKPYICSECGSSFRKHSNLTQHQRIHTGEKPHKCDECGK
280 290 300 310 320 330
>>CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (616 aa)
initn: 2429 init1: 1297 opt: 1297 Z-score: 846.0 bits: 165.4 E(32554): 8.4e-41
Smith-Waterman score: 1297; 64.4% identity (85.4% similar) in 261 aa overlap (2-262:217-477)
10 20 30
pF1KB8 MKHGRVNVQKKPSKCSECGKFFTQRSSLTQH
:: :... .:: ::..::. :.: . : ::
CCDS74 LIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQH
190 200 210 220 230 240
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 QRIHRGEKPYVCSECGSCFRKQSNLTQHLRIHTGEKPYKCNECEKAFQTKAILVQHLRIH
:: : ::::: :::::. : .:...:: : :::::::.:.:: :::. . :.::::::
CCDS74 QRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIH
250 260 270 280 290 300
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 TGEKPYKCNECGKAFCQSPSLIKHQRIHTGEKPYKCTECGKAFSQSICLTRHQRSHSGDK
::::::.:.:::::: .: :: ::::::::::::.: ::::::.: : .:::.:.:.:
CCDS74 TGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEK
310 320 330 340 350 360
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 PFKCNECGKAFNQSACLMQHQRIHSGEKPYTCTECGKAFTQNSSLVEHERTHTGEKLYKC
:..:.::::::.::. : .:.:::.::::: :.::::.:...::: .::::::::: :.:
CCDS74 PYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYEC
370 380 390 400 410 420
220 230 240 250 260
pF1KB8 SECEKTFRKQAHLSEHYRIHTGEKPYECVGCGKSFRHSSALLRHQRLHAGE
:.: :.::...::..: ::::::::::: :::.: :::.: .:::.:.::
CCDS74 SQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCG
430 440 450 460 470 480
CCDS74 RAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFS
490 500 510 520 530 540
>--
initn: 1321 init1: 710 opt: 710 Z-score: 475.3 bits: 96.8 E(32554): 3.8e-20
Smith-Waterman score: 710; 64.7% identity (88.5% similar) in 139 aa overlap (67-205:478-616)
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 GEKPYVCSECGSCFRKQSNLTQHLRIHTGEKPYKCNECEKAFQTKAILVQHLRIHTGEKP
:::.::.: .::. : :.:: ::::::::
CCDS74 GEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKP
450 460 470 480 490 500
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 YKCNECGKAFCQSPSLIKHQRIHTGEKPYKCTECGKAFSQSICLTRHQRSHSGDKPFKCN
:.::.::.:: :: ::.:::::: :::: :.::::.::.: :..:.:.:.:.::..:.
CCDS74 YECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECH
510 520 530 540 550 560
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 ECGKAFNQSACLMQHQRIHSGEKPYTCTECGKAFTQNSSLVEHERTHTGEKLYKCSECEK
.:::.: ::. : ::.:::.:::::.: .::::::..:::..:.:::::
CCDS74 DCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
570 580 590 600 610
220 230 240 250 260
pF1KB8 TFRKQAHLSEHYRIHTGEKPYECVGCGKSFRHSSALLRHQRLHAGE
>>CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (658 aa)
initn: 2429 init1: 1297 opt: 1297 Z-score: 845.7 bits: 165.5 E(32554): 8.7e-41
Smith-Waterman score: 1297; 64.4% identity (85.4% similar) in 261 aa overlap (2-262:259-519)
10 20 30
pF1KB8 MKHGRVNVQKKPSKCSECGKFFTQRSSLTQH
:: :... .:: ::..::. :.: . : ::
CCDS74 LIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQH
230 240 250 260 270 280
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 QRIHRGEKPYVCSECGSCFRKQSNLTQHLRIHTGEKPYKCNECEKAFQTKAILVQHLRIH
:: : ::::: :::::. : .:...:: : :::::::.:.:: :::. . :.::::::
CCDS74 QRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIH
290 300 310 320 330 340
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 TGEKPYKCNECGKAFCQSPSLIKHQRIHTGEKPYKCTECGKAFSQSICLTRHQRSHSGDK
::::::.:.:::::: .: :: ::::::::::::.: ::::::.: : .:::.:.:.:
CCDS74 TGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEK
350 360 370 380 390 400
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 PFKCNECGKAFNQSACLMQHQRIHSGEKPYTCTECGKAFTQNSSLVEHERTHTGEKLYKC
:..:.::::::.::. : .:.:::.::::: :.::::.:...::: .::::::::: :.:
CCDS74 PYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYEC
410 420 430 440 450 460
220 230 240 250 260
pF1KB8 SECEKTFRKQAHLSEHYRIHTGEKPYECVGCGKSFRHSSALLRHQRLHAGE
:.: :.::...::..: ::::::::::: :::.: :::.: .:::.:.::
CCDS74 SQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCG
470 480 490 500 510 520
CCDS74 RAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFS
530 540 550 560 570 580
>--
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40 50 60 70 80 90
pF1KB8 GEKPYVCSECGSCFRKQSNLTQHLRIHTGEKPYKCNECEKAFQTKAILVQHLRIHTGEKP
:::.::.: .::. : :.:: ::::::::
CCDS74 GEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKP
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pF1KB8 YKCNECGKAFCQSPSLIKHQRIHTGEKPYKCTECGKAFSQSICLTRHQRSHSGDKPFKCN
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CCDS74 YECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECH
550 560 570 580 590 600
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pF1KB8 ECGKAFNQSACLMQHQRIHSGEKPYTCTECGKAFTQNSSLVEHERTHTGEKLYKCSECEK
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CCDS74 DCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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10 20 30
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:: :... .:: ::..::. :.: . : ::
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CCDS12 TGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEK
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pF1KB8 PFKCNECGKAFNQSACLMQHQRIHSGEKPYTCTECGKAFTQNSSLVEHERTHTGEKLYKC
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CCDS12 PYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYEC
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pF1KB8 SECEKTFRKQAHLSEHYRIHTGEKPYECVGCGKSFRHSSALLRHQRLHAGE
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CCDS12 SQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCG
490 500 510 520 530 540
CCDS12 RAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFS
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40 50 60 70 80 90
pF1KB8 GEKPYVCSECGSCFRKQSNLTQHLRIHTGEKPYKCNECEKAFQTKAILVQHLRIHTGEKP
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CCDS12 GEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKP
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pF1KB8 YKCNECGKAFCQSPSLIKHQRIHTGEKPYKCTECGKAFSQSICLTRHQRSHSGDKPFKCN
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CCDS12 YECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECH
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pF1KB8 ECGKAFNQSACLMQHQRIHSGEKPYTCTECGKAFTQNSSLVEHERTHTGEKLYKCSECEK
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CCDS12 DCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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10 20 30
pF1KB8 MKHGRVNVQKKPSKCSECGKFFTQRSSLTQH
:: :... .:: ::..::. :.: . : ::
CCDS54 LIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQH
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pF1KB8 QRIHRGEKPYVCSECGSCFRKQSNLTQHLRIHTGEKPYKCNECEKAFQTKAILVQHLRIH
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pF1KB8 TGEKPYKCNECGKAFCQSPSLIKHQRIHTGEKPYKCTECGKAFSQSICLTRHQRSHSGDK
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CCDS54 TGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEK
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160 170 180 190 200 210
pF1KB8 PFKCNECGKAFNQSACLMQHQRIHSGEKPYTCTECGKAFTQNSSLVEHERTHTGEKLYKC
:..:.::::::.::. : .:.:::.::::: :.::::.:...::: .::::::::: :.:
CCDS54 PYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYEC
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220 230 240 250 260
pF1KB8 SECEKTFRKQAHLSEHYRIHTGEKPYECVGCGKSFRHSSALLRHQRLHAGE
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CCDS54 SQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCG
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40 50 60 70 80 90
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:::.::.: .::. : :.:: ::::::::
CCDS54 GEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKP
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pF1KB8 YKCNECGKAFCQSPSLIKHQRIHTGEKPYKCTECGKAFSQSICLTRHQRSHSGDKPFKCN
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CCDS54 YECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECH
580 590 600 610 620 630
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 ECGKAFNQSACLMQHQRIHSGEKPYTCTECGKAFTQNSSLVEHERTHTGEKLYKCSECEK
.:::.: ::. : ::.:::.:::::.: .::::::..:::..:.:::::
CCDS54 DCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
640 650 660 670 680
220 230 240 250 260
pF1KB8 TFRKQAHLSEHYRIHTGEKPYECVGCGKSFRHSSALLRHQRLHAGE
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10 20 30
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:::::::::.:::::: ..:.:::::::::::.:. :::::::: :: :::.:.:.
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pF1KB8 KPFKCNECGKAFNQSACLMQHQRIHSGEKPYTCTECGKAFTQNSSLVEHERTHTGEKLYK
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CCDS75 KPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHTGEKPYKCNECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYE
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220 230 240 250 260
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:.:: :.: ... ::.: ::::: ::::: :::.:: :::..:::::::::
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10 20 30
pF1KB8 MKHGRVNVQKKPSKCSECGKFFTQRSSLTQ
..: :... .:: ::::::. :.: ..::.
CCDS69 SLSQHQKSHTGEKPYECSECGKAFSQSSSLIQHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTK
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::: : ::::: :::: . : : :.:: :::::::::.:..: :::. .: :..: :
CCDS69 HQRTHTGEKPYRCSECEKAFSDCSALVQHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRT
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CCDS69 KPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHTGEKPYKCNECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYE
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pF1KB8 CSECEKTFRKQAHLSEHYRIHTGEKPYECVGCGKSFRHSSALLRHQRLHAGE
:.:: :.: ... ::.: ::::: ::::: :::.:: :::..:::::::::
CCDS69 CNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKPYECSECGKAFRCSSAFVRHQRLHAGE
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CCDS68 SLSQHQKSHTGEKPYECSECGKAFSQSSSLIQHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQNANLTK
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CCDS68 HQRTHTGEKPYRCSECEKAFSDCSALVQHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRHSANLTNHQRT
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pF1KB8 HTGEKPYKCNECGKAFCQSPSLIKHQRIHTGEKPYKCTECGKAFSQSICLTRHQRSHSGD
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CCDS68 HTGEKPYKCSECGKAFSYCAAFIQHQRIHTGEKPYRCAACGKAFSQSANLTNHQRTHTGE
330 340 350 360 370 380
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 KPFKCNECGKAFNQSACLMQHQRIHSGEKPYTCTECGKAFTQNSSLVEHERTHTGEKLYK
::.::.::::::.::. :. ::. :.::::: :.:::: :...:.:..:. ::::: :.
CCDS68 KPYKCSECGKAFSQSTNLIIHQKTHTGEKPYKCNECGKFFSESSALIRHHIIHTGEKPYE
390 400 410 420 430 440
220 230 240 250 260
pF1KB8 CSECEKTFRKQAHLSEHYRIHTGEKPYECVGCGKSFRHSSALLRHQRLHAGE
:.:: :.: ... ::.: ::::: ::::: :::.:: :::..:::::::::
CCDS68 CNECGKAFNQSSSLSQHQRIHTGVKPYECSECGKAFRCSSAFVRHQRLHAGE
450 460 470 480 490
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10 20 30
pF1KB8 MKHGRVNVQKKPSKCSECGKFFTQRSSLTQ
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CCDS44 ELIKTQRMFVGKKIYECNQCSKTFSQSSSLLKHQRIHTGEKPYKCNVCGKHFIERSSLTV
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CCDS44 HQRIHTGEKPYKCNECGKAFSQSMNLTVHQRTHTGEKPYQCKECGKAFHKNSSLIQHERI
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pF1KB8 HTGEKPYKCNECGKAFCQSPSLIKHQRIHTGEKPYKCTECGKAFSQSICLTRHQRSHSGD
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CCDS44 HTGEKPYKCNECGKAFTQSMNLTVHQRTHTGEKPYECNECGKAFSQSMHLIVHQRSHTGE
210 220 230 240 250 260
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 KPFKCNECGKAFNQSACLMQHQRIHSGEKPYTCTECGKAFTQNSSLVEHERTHTGEKLYK
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CCDS44 KPYECSQCGKAFSKSSTLTLHQRNHTGEKPYKCNKCGKSFSQSTYLIEHQRLHSGVKPFE
270 280 290 300 310 320
220 230 240 250 260
pF1KB8 CSECEKTFRKQAHLSEHYRIHTGEKPYECVGCGKSFRHSSALLRHQRLHAGE
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CCDS44 CNECGKAFSKNSSLTQHRRIHTGEKPYECMVCGKHFTGRSSLTVHQVIHTGEKPYECNEC
330 340 350 360 370 380
CCDS44 GKAFSQSAYLIEHQRIHTGEKPYECDQCGKAFIKNSSLTVHQRTHTGEKPYQCNECGKAF
390 400 410 420 430 440
262 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 15:33:21 2016 done: Fri Nov 4 15:33:21 2016
Total Scan time: 1.850 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]