Result of FASTA (ccds) for pF1KB8783
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8783, 277 aa
  1>>>pF1KB8783 277 - 277 aa - 277 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7585+/-0.000776; mu= 18.3082+/- 0.047
 mean_var=74.8466+/-15.380, 0's: 0 Z-trim(109.8): 191  B-trim: 755 in 2/48
 Lambda= 0.148248
 statistics sampled from 10931 (11144) to 10931 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.722), E-opt: 0.2 (0.342), width:  16
 Scan time:  2.430

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS35357.1 RAB40A gene_id:142684|Hs108|chrX       ( 277) 1868 408.5 2.7e-114
CCDS35353.1 RAB40AL gene_id:282808|Hs108|chrX      ( 278) 1829 400.1 8.8e-112
CCDS11816.1 RAB40B gene_id:10966|Hs108|chr17       ( 278) 1613 354.0 7.1e-98
CCDS10413.1 RAB40C gene_id:57799|Hs108|chr16       ( 281) 1445 318.0 4.7e-87
CCDS76691.1 RAB15 gene_id:376267|Hs108|chr14       ( 212)  511 118.1 5.2e-27
CCDS1058.1 RAB13 gene_id:5872|Hs108|chr1           ( 203)  491 113.8 9.8e-26
CCDS12339.1 RAB8A gene_id:4218|Hs108|chr19         ( 207)  485 112.6 2.4e-25
CCDS10183.1 RAB8B gene_id:51762|Hs108|chr15        ( 207)  483 112.1 3.2e-25
CCDS1720.1 RAB10 gene_id:10890|Hs108|chr2          ( 200)  482 111.9 3.7e-25
CCDS46306.1 RAB1A gene_id:5861|Hs108|chr2          ( 205)  452 105.5 3.2e-23
CCDS31613.1 RAB1B gene_id:81876|Hs108|chr11        ( 201)  440 102.9 1.9e-22
CCDS33850.1 RAB43 gene_id:339122|Hs108|chr3        ( 212)  437 102.3   3e-22
CCDS10212.1 RAB11A gene_id:8766|Hs108|chr15        ( 216)  432 101.3 6.4e-22
CCDS12201.1 RAB11B gene_id:9230|Hs108|chr19        ( 218)  431 101.0 7.5e-22
CCDS41846.1 RAB35 gene_id:11021|Hs108|chr12        ( 201)  424 99.5   2e-21
CCDS42410.1 RAB12 gene_id:201475|Hs108|chr18       ( 244)  423 99.4 2.7e-21
CCDS12257.1 RAB3D gene_id:9545|Hs108|chr19         ( 219)  413 97.2 1.1e-20
CCDS3976.1 RAB3C gene_id:115827|Hs108|chr5         ( 227)  413 97.2 1.1e-20
CCDS81812.1 RAB15 gene_id:376267|Hs108|chr14       ( 166)  407 95.8 2.2e-20
CCDS560.1 RAB3B gene_id:5865|Hs108|chr1            ( 219)  407 95.9 2.6e-20
CCDS34762.2 RAB19 gene_id:401409|Hs108|chr7        ( 217)  405 95.5 3.5e-20
CCDS12372.1 RAB3A gene_id:5864|Hs108|chr19         ( 220)  399 94.2 8.7e-20
CCDS10460.1 RAB26 gene_id:25837|Hs108|chr16        ( 256)  391 92.6 3.2e-19
CCDS6175.1 RAB2A gene_id:5862|Hs108|chr8           ( 212)  389 92.1 3.7e-19
CCDS6827.1 RAB14 gene_id:51552|Hs108|chr9          ( 215)  386 91.4 5.9e-19
CCDS9570.1 RAB2B gene_id:84932|Hs108|chr14         ( 216)  385 91.2 6.8e-19
CCDS32722.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17       ( 223)  385 91.2   7e-19
CCDS33030.1 RAB4B gene_id:53916|Hs108|chr19        ( 213)  384 91.0 7.8e-19
CCDS58373.1 RAB11A gene_id:8766|Hs108|chr15        ( 155)  382 90.4 8.4e-19
CCDS8264.1 RAB30 gene_id:27314|Hs108|chr11         ( 203)  382 90.5   1e-18
CCDS31050.1 RAB4A gene_id:5867|Hs108|chr1          ( 218)  373 88.6 4.1e-18
CCDS76806.1 RAB26 gene_id:25837|Hs108|chr16        ( 190)  367 87.3   9e-18
CCDS44803.1 CRACR2A gene_id:84766|Hs108|chr12      ( 731)  372 88.9 1.1e-17
CCDS82198.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17       ( 196)  360 85.8 2.6e-17
CCDS54161.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17       ( 228)  360 85.9 2.9e-17
CCDS75442.1 RAB44 gene_id:401258|Hs108|chr6        (1021)  367 88.0 2.9e-17
CCDS7155.1 RAB18 gene_id:22931|Hs108|chr10         ( 206)  359 85.6 3.1e-17
CCDS56275.1 RAB43 gene_id:339122|Hs108|chr3        ( 155)  356 84.9   4e-17
CCDS11703.1 RAB37 gene_id:326624|Hs108|chr17       ( 216)  355 84.8 5.8e-17
CCDS41413.1 RAB25 gene_id:57111|Hs108|chr1         ( 213)  348 83.3 1.6e-16
CCDS3747.1 RAB33B gene_id:83452|Hs108|chr4         ( 229)  347 83.1   2e-16
CCDS53836.1 RAB35 gene_id:11021|Hs108|chr12        ( 152)  343 82.1 2.7e-16
CCDS11419.1 RAB5C gene_id:5878|Hs108|chr17         ( 216)  342 82.0   4e-16
CCDS58551.1 RAB5C gene_id:5878|Hs108|chr17         ( 249)  342 82.1 4.4e-16
CCDS8900.1 RAB5B gene_id:5869|Hs108|chr12          ( 215)  341 81.8 4.6e-16
CCDS14766.1 RAB39B gene_id:116442|Hs108|chrX       ( 213)  340 81.6 5.3e-16
CCDS8338.1 RAB39A gene_id:54734|Hs108|chr11        ( 217)  340 81.6 5.4e-16
CCDS3082.1 RAB6B gene_id:51560|Hs108|chr3          ( 208)  335 80.5 1.1e-15
CCDS8223.1 RAB6A gene_id:5870|Hs108|chr11          ( 208)  335 80.5 1.1e-15
CCDS4962.1 RAB23 gene_id:51715|Hs108|chr6          ( 237)  335 80.5 1.2e-15


>>CCDS35357.1 RAB40A gene_id:142684|Hs108|chrX            (277 aa)
 initn: 1868 init1: 1868 opt: 1868  Z-score: 2165.5  bits: 408.5 E(32554): 2.7e-114
Smith-Waterman score: 1868; 100.0% identity (100.0% similar) in 277 aa overlap (1-277:1-277)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MSAPGSPDQAYDFLLKFLLVGDRDVGKSEILESLQDGAAESPYSHLGGIDYKTTTILLDG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MSAPGSPDQAYDFLLKFLLVGDRDVGKSEILESLQDGAAESPYSHLGGIDYKTTTILLDG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 QRVKLKLWDTSGQGRFCTIFRSYSRGAQGVILVYDIANRWSFEGMDRWIKKIEEHAPGVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 QRVKLKLWDTSGQGRFCTIFRSYSRGAQGVILVYDIANRWSFEGMDRWIKKIEEHAPGVP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 KILVGNRLHLAFKRQVPREQAQAYAERLGVTFFEVSPLCNFNIIESFTELARIVLLRHRM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KILVGNRLHLAFKRQVPREQAQAYAERLGVTFFEVSPLCNFNIIESFTELARIVLLRHRM
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 NWLGRPSKVLSLQDLCCRTIVSCTPVHLVDKLPLPSTLRSHLKSFSMAKGLNARMMRGLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NWLGRPSKVLSLQDLCCRTIVSCTPVHLVDKLPLPSTLRSHLKSFSMAKGLNARMMRGLS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       
pF1KB8 YSLTTSSTHKSSLCKVEIVCPPQSPPKNCTRNSCKIS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 YSLTTSSTHKSSLCKVEIVCPPQSPPKNCTRNSCKIS
              250       260       270       

>>CCDS35353.1 RAB40AL gene_id:282808|Hs108|chrX           (278 aa)
 initn: 1651 init1: 1651 opt: 1829  Z-score: 2120.4  bits: 400.1 E(32554): 8.8e-112
Smith-Waterman score: 1829; 97.8% identity (99.3% similar) in 278 aa overlap (1-277:1-278)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MSAPGSPDQAYDFLLKFLLVGDRDVGKSEILESLQDGAAESPYSHLGGIDYKTTTILLDG
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS35 MSAPGSPDQAYDFLLKFLLVGDRDVGKSEILESLQDGTAESPYSHLGGIDYKTTTILLDG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 QRVKLKLWDTSGQGRFCTIFRSYSRGAQGVILVYDIANRWSFEGMDRWIKKIEEHAPGVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 QRVKLKLWDTSGQGRFCTIFRSYSRGAQGVILVYDIANRWSFEGMDRWIKKIEEHAPGVP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 KILVGNRLHLAFKRQVPREQAQAYAERLGVTFFEVSPLCNFNIIESFTELARIVLLRHRM
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS35 KILVGNRLHLAFKRQVPREQAQAYAERLGVTFFEVSPLCNFNIIESFTELARIVLLRHRL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 NWLGRPSKVLSLQDLCCRTIVSCTPVHLVDKLPLPSTLRSHLKSFSMAKGLNARMMRGLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:::::::::::::::::::::::
CCDS35 NWLGRPSKVLSLQDLCCRTIVSCTPVHLVDKLPLPIALRSHLKSFSMAKGLNARMMRGLS
              190       200       210       220       230       240

              250        260       270       
pF1KB8 YSLTTSSTHK-SSLCKVEIVCPPQSPPKNCTRNSCKIS
       :::::::::: ::::::.::::::::::::::::::::
CCDS35 YSLTTSSTHKRSSLCKVKIVCPPQSPPKNCTRNSCKIS
              250       260       270        

>>CCDS11816.1 RAB40B gene_id:10966|Hs108|chr17            (278 aa)
 initn: 1472 init1: 1472 opt: 1613  Z-score: 1870.7  bits: 354.0 E(32554): 7.1e-98
Smith-Waterman score: 1613; 88.1% identity (94.6% similar) in 278 aa overlap (1-277:1-278)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MSAPGSPDQAYDFLLKFLLVGDRDVGKSEILESLQDGAAESPYSHLGGIDYKTTTILLDG
       ::: ::: .::::::::::::: ::::.::: :::::::::::.: .:::::::::::::
CCDS11 MSALGSPVRAYDFLLKFLLVGDSDVGKGEILASLQDGAAESPYGHPAGIDYKTTTILLDG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 QRVKLKLWDTSGQGRFCTIFRSYSRGAQGVILVYDIANRWSFEGMDRWIKKIEEHAPGVP
       .::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::.:.:::::::
CCDS11 RRVKLQLWDTSGQGRFCTIFRSYSRGAQGVILVYDIANRWSFDGIDRWIKEIDEHAPGVP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 KILVGNRLHLAFKRQVPREQAQAYAERLGVTFFEVSPLCNFNIIESFTELARIVLLRHRM
       ::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::: :
CCDS11 KILVGNRLHLAFKRQVPTEQAQAYAERLGVTFFEVSPLCNFNITESFTELARIVLLRHGM
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 NWLGRPSKVLSLQDLCCRTIVSCTPVHLVDKLPLPSTLRSHLKSFSMAKGLNARMMRGLS
       . : ::::::::::::::..::::::::::::::: .:::::::::::.:::::::.: :
CCDS11 DRLWRPSKVLSLQDLCCRAVVSCTPVHLVDKLPLPIALRSHLKSFSMANGLNARMMHGGS
              190       200       210       220       230       240

              250        260       270       
pF1KB8 YSLTTSSTHK-SSLCKVEIVCPPQSPPKNCTRNSCKIS
       :::::::::: ::: ::..: :::::::::::::::::
CCDS11 YSLTTSSTHKRSSLRKVKLVRPPQSPPKNCTRNSCKIS
              250       260       270        

>>CCDS10413.1 RAB40C gene_id:57799|Hs108|chr16            (281 aa)
 initn: 1449 init1: 1342 opt: 1445  Z-score: 1676.4  bits: 318.0 E(32554): 4.7e-87
Smith-Waterman score: 1445; 74.0% identity (92.2% similar) in 281 aa overlap (1-277:1-281)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MSAPGSPDQAYDFLLKFLLVGDRDVGKSEILESLQDGAAESPYSHLGGIDYKTTTILLDG
       :.. ::: ..::.::::::::: ::::.:::::::::::::::.. .:::::::::::::
CCDS10 MGSQGSPVKSYDYLLKFLLVGDSDVGKGEILESLQDGAAESPYAYSNGIDYKTTTILLDG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 QRVKLKLWDTSGQGRFCTIFRSYSRGAQGVILVYDIANRWSFEGMDRWIKKIEEHAPGVP
       .::::.:::::::::::::::::::::::..:::::.:::::.:.:::::.:.:::::::
CCDS10 RRVKLELWDTSGQGRFCTIFRSYSRGAQGILLVYDITNRWSFDGIDRWIKEIDEHAPGVP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 KILVGNRLHLAFKRQVPREQAQAYAERLGVTFFEVSPLCNFNIIESFTELARIVLLRHRM
       .:::::::::::::::: :::.::::.  .::::::::::::.:::::::.::::.:: :
CCDS10 RILVGNRLHLAFKRQVPTEQARAYAEKNCMTFFEVSPLCNFNVIESFTELSRIVLMRHGM
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 NWLGRPSKVLSLQDLCCRTIVSCTPVHLVDKLPLPSTLRSHLKSFSMAKGLNARMMRGLS
       . . ::..:.::::::::.:::::::::.:::::: :..:::::::::.:.:: ::.: :
CCDS10 EKIWRPNRVFSLQDLCCRAIVSCTPVHLIDKLPLPVTIKSHLKSFSMANGMNAVMMHGRS
              190       200       210       220       230       240

                  250       260       270       
pF1KB8 YSLTTSS----THKSSLCKVEIVCPPQSPPKNCTRNSCKIS
       :::....    .. .:: . . . ::::::.::.:..::::
CCDS10 YSLASGAGGGGSKGNSLKRSKSIRPPQSPPQNCSRSNCKIS
              250       260       270       280 

>>CCDS76691.1 RAB15 gene_id:376267|Hs108|chr14            (212 aa)
 initn: 499 init1: 323 opt: 511  Z-score: 598.4  bits: 118.1 E(32554): 5.2e-27
Smith-Waterman score: 511; 42.9% identity (71.2% similar) in 191 aa overlap (9-195:3-193)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MSAPGSPDQAYDFLLKFLLVGDRDVGKSEILESLQDGAAESPYSHLGGIDYKTTTILLDG
               . :: :...::.::  :::. .:  . :.  .: .    :.:.:  :: .::
CCDS76       MAKQYDVLFRLLLIGDSGVGKTCLLCRFTDNEFHSSHISTIGVDFKMKTIEVDG
                     10        20        30        40        50    

               70        80        90       100       110          
pF1KB8 QRVKLKLWDTSGQGRFCTIFRSYSRGAQGVILVYDIANRWSFEGMDRWIKKIEEHAP-GV
        .:....:::.:: :. :: ..: : :::..:::::... :.. . .:.. ..:.:: ::
CCDS76 IKVRIQIWDTAGQERYQTITKQYYRRAQGIFLVYDISSERSYQHIMKWVSDVDEYAPEGV
           60        70        80        90       100       110    

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB8 PKILVGNRLHLAFKRQVPREQAQAYAERLGVTFFEVSPLCNFNIIESFTELARIVLLRHR
        :::.::.     :::: :::.:  :.. :. :.:.:   :.:: ::::.:...::  ::
CCDS76 QKILIGNKADEEQKRQVGREQGQQLAKEYGMDFYETSACTNLNIKESFTRLTELVLQAHR
          120       130       140       150       160       170    

     180          190       200       210       220       230      
pF1KB8 MNWLG---RPSKVLSLQDLCCRTIVSCTPVHLVDKLPLPSTLRSHLKSFSMAKGLNARMM
        .  :   : :. :.: .:                                         
CCDS76 KELEGLRMRASNELALAELEEEEGKPEGPANSSKTCWC                      
          180       190       200       210                        

>>CCDS1058.1 RAB13 gene_id:5872|Hs108|chr1                (203 aa)
 initn: 490 init1: 340 opt: 491  Z-score: 575.5  bits: 113.8 E(32554): 9.8e-26
Smith-Waterman score: 491; 43.5% identity (74.7% similar) in 170 aa overlap (9-177:3-172)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MSAPGSPDQAYDFLLKFLLVGDRDVGKSEILESLQDGAAESPYSHLGGIDYKTTTILLDG
               .::: :.:.::.::  :::. ..  . .   .. :    :::.:  :. ..:
CCDS10       MAKAYDHLFKLLLIGDSGVGKTCLIIRFAEDNFNNTYISTIGIDFKIRTVDIEG
                     10        20        30        40        50    

               70        80        90       100       110          
pF1KB8 QRVKLKLWDTSGQGRFCTIFRSYSRGAQGVILVYDIANRWSFEGMDRWIKKIEEHAP-GV
       ...::..:::.:: :: ::  .: :::.:.::::::... :::... :.:.:.:.:  ::
CCDS10 KKIKLQVWDTAGQERFKTITTAYYRGAMGIILVYDITDEKSFENIQNWMKSIKENASAGV
           60        70        80        90       100       110    

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB8 PKILVGNRLHLAFKRQVPREQAQAYAERLGVTFFEVSPLCNFNIIESFTELARIVLLRHR
        ..:.::.  .  ::.: .:::.  :.. :. :::.:   ..:. :.:. ::: .::.  
CCDS10 ERLLLGNKCDMEAKRKVQKEQADKLAREHGIRFFETSAKSSMNVDEAFSSLARDILLKSG
          120       130       140       150       160       170    

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB8 MNWLGRPSKVLSLQDLCCRTIVSCTPVHLVDKLPLPSTLRSHLKSFSMAKGLNARMMRGL
                                                                   
CCDS10 GRRSGNGNKPPSTDLKTCDKKNTNKCSLG                               
          180       190       200                                  

>>CCDS12339.1 RAB8A gene_id:4218|Hs108|chr19              (207 aa)
 initn: 378 init1: 378 opt: 485  Z-score: 568.5  bits: 112.6 E(32554): 2.4e-25
Smith-Waterman score: 485; 45.5% identity (73.9% similar) in 165 aa overlap (9-172:3-167)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MSAPGSPDQAYDFLLKFLLVGDRDVGKSEILESLQDGAAESPYSHLGGIDYKTTTILLDG
               ..::.:.:.::.::  :::. .:  ... : .: .    :::.:  :: :::
CCDS12       MAKTYDYLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSEDAFNSTFISTIGIDFKIRTIELDG
                     10        20        30        40        50    

               70        80        90       100       110          
pF1KB8 QRVKLKLWDTSGQGRFCTIFRSYSRGAQGVILVYDIANRWSFEGMDRWIKKIEEHAPG-V
       .:.::..:::.:: :: ::  .: :::.:..:::::.:. ::...  ::..::::: . :
CCDS12 KRIKLQIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIRNWIRNIEEHASADV
           60        70        80        90       100       110    

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB8 PKILVGNRLHLAFKRQVPREQAQAYAERLGVTFFEVSPLCNFNIIESFTELARIVLLRHR
        :...::.  .  :::: .:...  :   :. :.:.:   :.:. ..:  :::       
CCDS12 EKMILGNKCDVNDKRQVSKERGEKLALDYGIKFMETSAKANINVENAFFTLARDIKAKMD
          120       130       140       150       160       170    

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB8 MNWLGRPSKVLSLQDLCCRTIVSCTPVHLVDKLPLPSTLRSHLKSFSMAKGLNARMMRGL
                                                                   
CCDS12 KKLEGNSPQGSNQGVKITPDQQKRSSFFRCVLL                           
          180       190       200                                  

>>CCDS10183.1 RAB8B gene_id:51762|Hs108|chr15             (207 aa)
 initn: 465 init1: 370 opt: 483  Z-score: 566.2  bits: 112.1 E(32554): 3.2e-25
Smith-Waterman score: 483; 42.6% identity (72.7% similar) in 176 aa overlap (9-181:3-178)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MSAPGSPDQAYDFLLKFLLVGDRDVGKSEILESLQDGAAESPYSHLGGIDYKTTTILLDG
               ..::.:.:.::.::  :::. .:  ... : .. .    :::.:  :: :::
CCDS10       MAKTYDYLFKLLLIGDSGVGKTCLLFRFSEDAFNTTFISTIGIDFKIRTIELDG
                     10        20        30        40        50    

               70        80        90       100       110          
pF1KB8 QRVKLKLWDTSGQGRFCTIFRSYSRGAQGVILVYDIANRWSFEGMDRWIKKIEEHAPG-V
       ...::..:::.:: :: ::  .: :::.:..:::::.:. ::...  ::..::::: . :
CCDS10 KKIKLQIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGIMLVYDITNEKSFDNIKNWIRNIEEHASSDV
           60        70        80        90       100       110    

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB8 PKILVGNRLHLAFKRQVPREQAQAYAERLGVTFFEVSPLCNFNIIESFTELARIVL--LR
        ....::.  .  :::: .:...  :   :. :.:.:   . :. :.:  ::: ..  : 
CCDS10 ERMILGNKCDMNDKRQVSKERGEKLAIDYGIKFLETSAKSSANVEEAFFTLARDIMTKLN
          120       130       140       150       160       170    

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB8 HRMNWLGRPSKVLSLQDLCCRTIVSCTPVHLVDKLPLPSTLRSHLKSFSMAKGLNARMMR
       ..::                                                        
CCDS10 RKMNDSNSAGAGGPVKITENRSKKTSFFRCSLL                           
          180       190       200                                  

>>CCDS1720.1 RAB10 gene_id:10890|Hs108|chr2               (200 aa)
 initn: 467 init1: 370 opt: 482  Z-score: 565.2  bits: 111.9 E(32554): 3.7e-25
Smith-Waterman score: 482; 43.5% identity (74.4% similar) in 168 aa overlap (9-175:4-171)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MSAPGSPDQAYDFLLKFLLVGDRDVGKSEILESLQDGAAESPYSHLGGIDYKTTTILLDG
               ..::.:.:.::.::  :::. .:  ..: : .. .    :::.:  :. :.:
CCDS17      MAKKTYDLLFKLLLIGDSGVGKTCVLFRFSDDAFNTTFISTIGIDFKIKTVELQG
                    10        20        30        40        50     

               70        80        90       100       110          
pF1KB8 QRVKLKLWDTSGQGRFCTIFRSYSRGAQGVILVYDIANRWSFEGMDRWIKKIEEHA-PGV
       ...::..:::.:: :: ::  :: :::.:..:::::.:  :::....:...:.:::   :
CCDS17 KKIKLQIWDTAGQERFHTITTSYYRGAMGIMLVYDITNGKSFENISKWLRNIDEHANEDV
          60        70        80        90       100       110     

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB8 PKILVGNRLHLAFKRQVPREQAQAYAERLGVTFFEVSPLCNFNIIESFTELARIVLLRHR
        ..:.::.  .  :: ::. ...  :.. :. :::.:   :.:: ..:  ::. .:    
CCDS17 ERMLLGNKCDMDDKRVVPKGKGEQIAREHGIRFFETSAKANINIEKAFLTLAEDILRKTP
         120       130       140       150       160       170     

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB8 MNWLGRPSKVLSLQDLCCRTIVSCTPVHLVDKLPLPSTLRSHLKSFSMAKGLNARMMRGL
                                                                   
CCDS17 VKEPNSENVDISSGGGVTGWKSKCC                                   
         180       190       200                                   

>>CCDS46306.1 RAB1A gene_id:5861|Hs108|chr2               (205 aa)
 initn: 470 init1: 344 opt: 452  Z-score: 530.4  bits: 105.5 E(32554): 3.2e-23
Smith-Waterman score: 452; 40.9% identity (69.3% similar) in 176 aa overlap (6-180:3-176)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MSAPGSPDQAYDFLLKFLLVGDRDVGKSEILESLQDGAAESPYSHLGGIDYKTTTILLDG
            : .  ::.:.:.::.::  :::: .:  . : .    :    :.:.:  :: :::
CCDS46    MSSMNPEYDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDTYTESYISTIGVDFKIRTIELDG
                  10        20        30        40        50       

               70        80        90       100       110          
pF1KB8 QRVKLKLWDTSGQGRFCTIFRSYSRGAQGVILVYDIANRWSFEGMDRWIKKIEEHAP-GV
       . .::..:::.:: :: ::  :: :::.:.:.:::.... ::... .:...:...:  .:
CCDS46 KTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIVVYDVTDQESFNNVKQWLQEIDRYASENV
        60        70        80        90       100       110       

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB8 PKILVGNRLHLAFKRQVPREQAQAYAERLGVTFFEVSPLCNFNIIESFTELARIVLLRHR
        :.::::.  :. :. :    :. .:. ::. :.:.:     :. .::  .:  . ...:
CCDS46 NKLLVGNKCDLTTKKVVDYTTAKEFADSLGIPFLETSAKNATNVEQSFMTMA--AEIKKR
       120       130       140       150       160         170     

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB8 MNWLGRPSKVLSLQDLCCRTIVSCTPVHLVDKLPLPSTLRSHLKSFSMAKGLNARMMRGL
       :                                                           
CCDS46 MGPGATAGGAEKSNVKIQSTPVKQSGGGCC                              
         180       190       200                                   




277 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 15:34:32 2016 done: Fri Nov  4 15:34:33 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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