Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8792
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8792, 327 aa
1>>>pF1KB8792 327 - 327 aa - 327 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6356+/-0.00185; mu= 4.5849+/- 0.106
mean_var=236.8712+/-52.489, 0's: 0 Z-trim(102.4): 901 B-trim: 80 in 1/48
Lambda= 0.083333
statistics sampled from 5943 (6931) to 5943 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.535), E-opt: 0.2 (0.213), width: 16
Scan time: 1.590
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12507.1 ZNF781 gene_id:163115|Hs108|chr19 ( 327) 2168 274.6 7.8e-74
CCDS45985.1 ZNF844 gene_id:284391|Hs108|chr19 ( 666) 567 82.4 1.1e-15
CCDS33130.1 ZNF543 gene_id:125919|Hs108|chr19 ( 600) 535 78.5 1.5e-14
CCDS74346.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 314) 527 77.2 1.9e-14
CCDS74387.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 540) 531 78.0 1.9e-14
CCDS46097.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 679) 531 78.1 2.2e-14
CCDS83401.1 ZNF883 gene_id:169834|Hs108|chr9 ( 379) 526 77.2 2.3e-14
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 529 77.9 2.6e-14
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 532 78.5 2.7e-14
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 532 78.5 2.7e-14
CCDS42559.1 ZNF527 gene_id:84503|Hs108|chr19 ( 609) 525 77.3 3.4e-14
CCDS46077.1 ZNF780B gene_id:163131|Hs108|chr19 ( 833) 527 77.8 3.5e-14
CCDS12505.1 ZNF571 gene_id:51276|Hs108|chr19 ( 609) 524 77.2 3.7e-14
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 524 77.3 4.2e-14
CCDS33121.1 ZNF582 gene_id:147948|Hs108|chr19 ( 517) 521 76.8 4.2e-14
CCDS33102.1 ZNF331 gene_id:55422|Hs108|chr19 ( 463) 520 76.6 4.3e-14
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 522 77.0 4.4e-14
CCDS12494.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 418) 519 76.4 4.4e-14
CCDS46061.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 419) 519 76.4 4.4e-14
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 522 77.0 4.5e-14
CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7 ( 446) 519 76.5 4.6e-14
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 522 77.0 4.6e-14
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 522 77.0 4.6e-14
CCDS77773.1 ZNF717 gene_id:100131827|Hs108|chr3 ( 864) 523 77.3 5e-14
CCDS12496.1 ZNF790 gene_id:388536|Hs108|chr19 ( 636) 519 76.6 5.7e-14
CCDS74348.1 ZNF461 gene_id:92283|Hs108|chr19 ( 540) 517 76.3 6.1e-14
CCDS54257.1 ZNF461 gene_id:92283|Hs108|chr19 ( 563) 517 76.3 6.2e-14
CCDS46208.1 ZNF805 gene_id:390980|Hs108|chr19 ( 494) 516 76.2 6.2e-14
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 515 76.0 6.6e-14
CCDS33127.1 ZNF264 gene_id:9422|Hs108|chr19 ( 627) 517 76.4 6.7e-14
CCDS12945.1 ZNF471 gene_id:57573|Hs108|chr19 ( 626) 516 76.3 7.3e-14
CCDS46207.1 ZNF805 gene_id:390980|Hs108|chr19 ( 627) 516 76.3 7.3e-14
CCDS42535.1 ZNF626 gene_id:199777|Hs108|chr19 ( 528) 514 76.0 7.7e-14
CCDS33002.1 ZFP14 gene_id:57677|Hs108|chr19 ( 533) 514 76.0 7.7e-14
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 515 76.2 8.4e-14
CCDS69562.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 539) 513 75.8 8.5e-14
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 510 75.3 8.5e-14
CCDS46160.1 ZNF577 gene_id:84765|Hs108|chr19 ( 426) 511 75.5 8.6e-14
CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 560) 513 75.9 8.7e-14
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 536) 512 75.7 9.2e-14
CCDS12842.2 ZNF577 gene_id:84765|Hs108|chr19 ( 485) 511 75.5 9.4e-14
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 592) 512 75.8 9.8e-14
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 510 75.4 1e-13
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 513 76.0 1e-13
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 510 75.4 1e-13
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 513 76.0 1.1e-13
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 509 75.3 1.1e-13
CCDS42557.1 ZNF829 gene_id:374899|Hs108|chr19 ( 432) 508 75.1 1.1e-13
CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 623) 510 75.6 1.2e-13
CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 510 75.6 1.2e-13
>>CCDS12507.1 ZNF781 gene_id:163115|Hs108|chr19 (327 aa)
initn: 2168 init1: 2168 opt: 2168 Z-score: 1439.0 bits: 274.6 E(32554): 7.8e-74
Smith-Waterman score: 2168; 100.0% identity (100.0% similar) in 327 aa overlap (1-327:1-327)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MQRNAMYLKNVAETACNFQLTQYQISHANQKPYECQICGKPFRKRAHLTQHNRIHTGGKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MQRNAMYLKNVAETACNFQLTQYQISHANQKPYECQICGKPFRKRAHLTQHNRIHTGGKP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 YECKECGKVFICCSTLIQHKRTHTSEKPYECLECRKTFRRSAHLIRHQRIHTGEKPYKCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YECKECGKVFICCSTLIQHKRTHTSEKPYECLECRKTFRRSAHLIRHQRIHTGEKPYKCK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 QCWKAFASVSDLIDIGKFTLMRDFTNVQNVGRHLTIAQLLFSIREFTLVRSPLNVRNVAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QCWKAFASVSDLIDIGKFTLMRDFTNVQNVGRHLTIAQLLFSIREFTLVRSPLNVRNVAK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 HSIIAQHLLNTRELILMRNLMNVRNVKRLLGKVHILLNIKEFILVRNHMSVSNVGRLSLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HSIIAQHLLNTRELILMRNLMNVRNVKRLLGKVHILLNIKEFILVRNHMSVSNVGRLSLV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 FLILIDIREFTLVKNPMNVKNVVELLTIVQLLFNTREFTLVRRLMNISSVGRFLSPVQHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FLILIDIREFTLVKNPMNVKNVVELLTIVQLLFNTREFTLVRRLMNISSVGRFLSPVQHL
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KB8 FNIREHILMKNLMNVSNARRPSSIMHI
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FNIREHILMKNLMNVSNARRPSSIMHI
310 320
>>CCDS45985.1 ZNF844 gene_id:284391|Hs108|chr19 (666 aa)
initn: 821 init1: 401 opt: 567 Z-score: 395.2 bits: 82.4 E(32554): 1.1e-15
Smith-Waterman score: 613; 37.4% identity (65.6% similar) in 305 aa overlap (20-321:240-540)
10 20 30 40
pF1KB8 MQRNAMYLKNVAETACNFQLTQYQISHANQKPYECQICGKPFRKRAHLT
: .. .:...:::::. ::: : . :
CCDS45 SIYLIHERVHTGEKPYKCKQCGKAFSYSTSLQIHERTHTGEKPYECKECGKAFGSPNSLY
210 220 230 240 250 260
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 QHNRIHTGGKPYECKECGKVFICCSTLIQHKRTHTSEKPYECLECRKTFRRSAHLIRHQR
.: : ::: ::::::.:::.: .. :.:::. :: ::: .: :.:. ..: ::.
CCDS45 EHRRTHTGEKPYECKQCGKAFRWFHSFQIHERTHSEEKAYECTKCGKAFKCPSYLCRHEV
270 280 290 300 310 320
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 IHTGEKPYKCKQCWKAFASVSDLIDIGKFTLMRDFTNVQNVGRHLTIAQLLFSIREFTLV
:.:.:: .:::: ::.. .. . : :: . . ..: . : . . ...:.::
CCDS45 THSGKKPCECKQCGKALSYLNFQRHMKMHTRMRPY-KCKTVEKPLILPVRFEDMKELTLE
330 340 350 360 370 380
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 RSPLNVRNVAKHSIIAQHLLNTRELILMRNLMNVRNVKRLLGKVHILLNI-KEFILVRNH
:. .:. .:.: ::. . . : : :: ::: .: . . . . ..: : . : ::.
CCDS45 RNLMNASTVVKPSIVPVPFTIMKGLTLERNPMNVSSVVKP-SFLPLPFDIMKGLTLERNR
390 400 410 420 430 440
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 MSVSNVGRLSLVFLILIDIREFTLVKNPMNVKNVVELLTIVQLLFNT-REFTLVRRLMNI
:::::::. : . . .. .:: .:::::..::. .. : :. . .:: : :..
CCDS45 MSVSNVGKPSDLPHTFKCMEGLTLKRNPMNVSSVVKP-SFFPLPFDIMKGLTLERNPMSV
450 460 470 480 490 500
290 300 310 320
pF1KB8 SSVGRFLSPVQHLFN-IREHILMKNLMNVSNARRPSSIMHI
:.::. : . : :. .. : .: ::..:...:
CCDS45 SNVGKP-SHLPHTFKCMKGLTLESNCMNLNNVKKPLDLSETFKFMKRHTLERNPIRNMEK
510 520 530 540 550 560
CCDS45 HSTISLPFKYMQQCTEDRMPMNVKSVTKHSYLPRSFEYMQEHTLERNPMNVRNAEKRSII
570 580 590 600 610 620
>>CCDS33130.1 ZNF543 gene_id:125919|Hs108|chr19 (600 aa)
initn: 1493 init1: 519 opt: 535 Z-score: 375.0 bits: 78.5 E(32554): 1.5e-14
Smith-Waterman score: 539; 40.4% identity (63.3% similar) in 218 aa overlap (20-209:382-599)
10 20 30 40
pF1KB8 MQRNAMYLKNVAETACNFQLTQYQISHANQKPYECQICGKPFRKRAHLT
: :. : :...:::.:. ::: : .:.::
CCDS33 SYLTWHQQIHTGVKPFECNECGKAFCESADLIQHYIIHTGEKPYKCMECGKAFNRRSHLK
360 370 380 390 400 410
50 60 70 80 90
pF1KB8 QHNRIHTGGKPYECKECGKVFICCSTLIQHKRTHTSEKPYEC------------------
::.::::: :::::.::::.: :::.. ::::::.::::::
CCDS33 QHQRIHTGEKPYECSECGKAFTHCSTFVLHKRTHTGEKPYECKECGKAFSDRADLIRHFS
420 430 440 450 460 470
100 110 120 130 140
pF1KB8 ----------LECRKTFRRSAHLIRHQRIHTGEKPYKCKQCWKAFASVSDLIDIGKFTLM
.:: :.: ::.:: :::.::::::::.: :: ::: ..:: . .
CCDS33 IHTGEKPYECVECGKAFNRSSHLTRHQQIHTGEKPYECIQCGKAFCRSANLIRHSIIHTG
480 490 500 510 520 530
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 RDFTNVQNVGRHLTIAQLLFSIREFTLVRSPLNVRNVAKHSIIAQHLLNTRELILMRNLM
. . .. :. .. .. : ... :.: : .:.. . :: .: .::.: ....
CCDS33 EKPYECSECGKAFNRGSSLTHHQRIHTGRNPTIVTDVGRPFMTAQTSVNIQELLLGKEFL
540 550 560 570 580 590
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 NVRNVKRLLGKVHILLNIKEFILVRNHMSVSNVGRLSLVFLILIDIREFTLVKNPMNVKN
:. . . :
CCDS33 NITTEENLW
600
>>CCDS74346.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 (314 aa)
initn: 519 init1: 519 opt: 527 Z-score: 373.0 bits: 77.2 E(32554): 1.9e-14
Smith-Waterman score: 527; 43.6% identity (72.6% similar) in 179 aa overlap (16-194:134-312)
10 20 30 40
pF1KB8 MQRNAMYLKNVAETACNFQLTQYQISHANQKPYECQICGKPFRKR
:. .::... :...:::::. ::: : .
CCDS74 FRHPSRLTHHQKIHTGKKPFECKECGKTFICGSDLTRHHRIHTGEKPYECKECGKAFSSG
110 120 130 140 150 160
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 AHLTQHNRIHTGGKPYECKECGKVFICCSTLIQHKRTHTSEKPYECLECRKTFRRSAHLI
...:.:.::::: ::::::::::.: :.. ::.: ::.:::::: :: ..: .:..::
CCDS74 SNFTRHQRIHTGEKPYECKECGKAFSSGSNFTQHQRIHTGEKPYECKECGNAFSQSSQLI
170 180 190 200 210 220
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 RHQRIHTGEKPYKCKQCWKAFASVSDLIDIGKFTLMRDFTNVQNVGRHLTIAQLLFSIRE
.:::::::::::.::.: ::: : ::: .. . . . :. . .. :.: ..
CCDS74 KHQRIHTGEKPYECKECEKAFRSGSDLTRHQRIHTGEKPYECKICGKAYSQSSQLISHHR
230 240 250 260 270 280
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 FTLVRSPLNVRNVAKHSIIAQHLLNTRELILMRNLMNVRNVKRLLGKVHILLNIKEFILV
. ..: . :. .:. .:.. ..:
CCDS74 IHTSEKPYEYRECGKNFNYDPQLIQHQNLYW
290 300 310
>>CCDS74387.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 (540 aa)
initn: 2685 init1: 521 opt: 531 Z-score: 372.9 bits: 78.0 E(32554): 1.9e-14
Smith-Waterman score: 531; 62.1% identity (82.8% similar) in 116 aa overlap (18-133:221-336)
10 20 30 40
pF1KB8 MQRNAMYLKNVAETACNFQLTQYQISHANQKPYECQICGKPFRKRAH
.::::.: :...:::::.:::: : .
CCDS74 WGSSLAKHEIIHTGEKPYKCKECGKAFSRGYQLTQHQKIHTGKKPYECKICGKAFCWGYQ
200 210 220 230 240 250
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 LTQHNRIHTGGKPYECKECGKVFICCSTLIQHKRTHTSEKPYECLECRKTFRRSAHLIRH
::.:. .::: ::::::::::.: : :.::::.: ::.:::::: :: :.: :. :: .:
CCDS74 LTRHQIFHTGEKPYECKECGKAFNCGSSLIQHERIHTGEKPYECKECGKAFSRGYHLSQH
260 270 280 290 300 310
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 QRIHTGEKPYKCKQCWKAFASVSDLIDIGKFTLMRDFTNVQNVGRHLTIAQLLFSIREFT
:.:::::::..::.: :::. :.:.
CCDS74 QKIHTGEKPFECKECGKAFSWGSSLVKHERVHTGEKSHECKECGKTFCSGYQLTRHQVFH
320 330 340 350 360 370
>--
initn: 1424 init1: 464 opt: 481 Z-score: 340.4 bits: 72.0 E(32554): 1.2e-12
Smith-Waterman score: 484; 59.8% identity (82.2% similar) in 107 aa overlap (27-133:342-448)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MQRNAMYLKNVAETACNFQLTQYQISHANQKPYECQICGKPFRKRAHLTQHNRIHT
:...: .::. ::: : . .::.:. .::
CCDS74 KIHTGEKPFECKECGKAFSWGSSLVKHERVHTGEKSHECKECGKTFCSGYQLTRHQVFHT
320 330 340 350 360 370
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 GGKPYECKECGKVFICCSTLIQHKRTHTSEKPYECLECRKTFRRSAHLIRHQRIHTGEKP
: ::::::::::.: : :.:.::.: ::.:::::: :: :.: :. :: .::.:::::::
CCDS74 GEKPYECKECGKAFNCGSSLVQHERIHTGEKPYECKECGKAFSRGYHLTQHQKIHTGEKP
380 390 400 410 420 430
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 YKCKQCWKAFASVSDLIDIGKFTLMRDFTNVQNVGRHLTIAQLLFSIREFTLVRSPLNVR
.:::.: :::. :.:.
CCDS74 FKCKECGKAFSWGSSLVKHERVHTNEKSYECKDCGKAFGSGYQLSVHQRFHTGEKLYQRK
440 450 460 470 480 490
>>CCDS46097.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 (679 aa)
initn: 2685 init1: 521 opt: 531 Z-score: 371.7 bits: 78.1 E(32554): 2.2e-14
Smith-Waterman score: 531; 62.1% identity (82.8% similar) in 116 aa overlap (18-133:360-475)
10 20 30 40
pF1KB8 MQRNAMYLKNVAETACNFQLTQYQISHANQKPYECQICGKPFRKRAH
.::::.: :...:::::.:::: : .
CCDS46 WGSSLAKHEIIHTGEKPYKCKECGKAFSRGYQLTQHQKIHTGKKPYECKICGKAFCWGYQ
330 340 350 360 370 380
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 LTQHNRIHTGGKPYECKECGKVFICCSTLIQHKRTHTSEKPYECLECRKTFRRSAHLIRH
::.:. .::: ::::::::::.: : :.::::.: ::.:::::: :: :.: :. :: .:
CCDS46 LTRHQIFHTGEKPYECKECGKAFNCGSSLIQHERIHTGEKPYECKECGKAFSRGYHLSQH
390 400 410 420 430 440
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 QRIHTGEKPYKCKQCWKAFASVSDLIDIGKFTLMRDFTNVQNVGRHLTIAQLLFSIREFT
:.:::::::..::.: :::. :.:.
CCDS46 QKIHTGEKPFECKECGKAFSWGSSLVKHERVHTGEKSHECKECGKTFCSGYQLTRHQVFH
450 460 470 480 490 500
>--
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Smith-Waterman score: 484; 59.8% identity (82.2% similar) in 107 aa overlap (27-133:481-587)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MQRNAMYLKNVAETACNFQLTQYQISHANQKPYECQICGKPFRKRAHLTQHNRIHT
:...: .::. ::: : . .::.:. .::
CCDS46 KIHTGEKPFECKECGKAFSWGSSLVKHERVHTGEKSHECKECGKTFCSGYQLTRHQVFHT
460 470 480 490 500 510
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 GGKPYECKECGKVFICCSTLIQHKRTHTSEKPYECLECRKTFRRSAHLIRHQRIHTGEKP
: ::::::::::.: : :.:.::.: ::.:::::: :: :.: :. :: .::.:::::::
CCDS46 GEKPYECKECGKAFNCGSSLVQHERIHTGEKPYECKECGKAFSRGYHLTQHQKIHTGEKP
520 530 540 550 560 570
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 YKCKQCWKAFASVSDLIDIGKFTLMRDFTNVQNVGRHLTIAQLLFSIREFTLVRSPLNVR
.:::.: :::. :.:.
CCDS46 FKCKECGKAFSWGSSLVKHERVHTNEKSYECKDCGKAFGSGYQLSVHQRFHTGEKLYQRK
580 590 600 610 620 630
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10 20 30 40 50
pF1KB8 MQRNAMYLKNVAETACNFQLTQYQISHANQKPYECQICGKPFRKRAHLTQHN
: .:::.: .: ..:::::.:::: : . ..:.::.
CCDS83 MESEKIYMTANPYLCTECGKGYTCLASLTQHQKTHIGEKPYECKICGKSFTRNSNLVQHQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 RIHTGGKPYECKECGKVFICCSTLIQHKRTHTSEKPYECLECRKTFRRSAHLIRHQRIHT
::::: :::::.::::.: ..::::.:.::.:::::: ::.::: . . : :.::::
CCDS83 RIHTGEKPYECNECGKAFSQSTNLIQHQRVHTGEKPYECNECEKTFSHRSSLRNHERIHT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 GEKPYKCKQCWKAFASVSDLIDIGKFTLMRDFTNVQNVGRHLTIAQLLFSIREFTLVRSP
::::: :..: :::. .: :
CCDS83 GEKPYPCNECGKAFSHISALTQHHRIHTGKKPYECTECGKTFSRSTHLIEHQGIHSEEKS
130 140 150 160 170 180
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10 20 30 40
pF1KB8 MQRNAMYLKNVAETACNFQLTQYQISHANQKPYECQICGKPFRKRA
: .: ..: :: ..:::::. ::: ::. .
CCDS64 RGHSDFSRHQSHHSSERPYMCNECGKAFSQNSSLKKHQKSHMSEKPYECNECGKAFRRSS
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pF1KB8 HLTQHNRIHTGGKPYECKECGKVFICCSTLIQHKRTHTSEKPYECLECRKTFRRSAHLIR
.: ::.:::.: ::: :.::::.: :.::.:.::::.:::.:: :: :.: .:::: .
CCDS64 NLIQHQRIHSGEKPYVCSECGKAFRRSSNLIKHHRTHTGEKPFECGECGKAFSQSAHLRK
340 350 360 370 380 390
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 HQRIHTGEKPYKCKQCWKAFASVSDLIDIGKFTLMRDFTNVQNVGRHLTIAQLLFSIREF
:::.:::::::.:..: : :. ::.:: . . . .. :. .. .. :.. :..
CCDS64 HQRVHTGEKPYECNDCGKPFSRVSNLIKHHRVHTGEKPYKCSDCGKAFSQSSSLIQHRRI
400 410 420 430 440 450
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 TLVRSPLNVRNVAKHSIIAQHLLNTRELILMRNLMNVRNVKRLLGKVHILLNIKEFILVR
..: .: :: ... . .: ...:
CCDS64 HTGEKP-HVCNVCGKAFSYSSVLRKHQIIHTGEKPYRCSVCGKAFSHSSALIQHQGVHTG
460 470 480 490 500 510
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10 20 30 40
pF1KB8 MQRNAMYLKNVAETACNFQLTQYQISHANQKPYECQICGKPFRKRAHLT
:::.. :...::::: ::: ::.:..:.
CCDS74 LRLTQHQQIHTGEKPYQCQECGKAFVSVSGLTQHHRIHTGEKPYECPDCGKAFRQRTYLN
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pF1KB8 QHNRIHTGGKPYECKECGKVFICCSTLIQHKRTHTSEKPYECLECRKTFRRSAHLIRHQR
:: ::::: :::::::::: : :: ::::...::.::::. :: :.: . ::.::.
CCDS74 QHRRIHTGEKPYECKECGKSFTFCSGLIQHQQNHTDEKPYDGKECGKSFTSHSTLIQHQQ
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pF1KB8 IHTGEKPYKCKQCWKAFASVSDLIDIGKFTLMRDFTNVQNVGRHLTIAQLLFSIREFTLV
:::::::: ::.: :.:.: : ::. .. . . . .. :. .: . :.. . .
CCDS74 IHTGEKPYDCKECGKSFTSHSTLIQHQQIHTGEKLYDCKECGKSFTSHSTLIQHQPLHTG
720 730 740 750 760 770
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 RSPLNVRNVAKHSIIAQHLLNTRELILMRNLMNVRNVKRLLGKVHILLNIKEFILVRNHM
..: . .. .: . . :.. :
CCDS74 EKPYHCKECGKSFTLRSALIQHRPVHTGEKRYSCKECGKSFTSRSTLIEHQRIHTGEKPY
780 790 800 810 820 830
>--
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10 20 30 40
pF1KB8 MQRNAMYLKNVAETACNFQLTQYQISHANQKPYECQICGKPFRKRAHLT
::... :...:::::. ::: ::.:.:::
CCDS74 SKLTQHQRIHTGEKPYRCHECGKAFVRFSGLTKHHSIHTGEKPYECKTCGKSFRQRTHLT
880 890 900 910 920 930
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 QHNRIHTGGKPYECKECGKVFICCSTLIQHKRTHTSEKPYECLECRKTFRRSAHLIRHQR
:.::::: .::::::::: : : : ::.:.::::.::::.: :: :.:: ..: .:.:
CCDS74 LHQRIHTGDRPYECKECGKSFTCGSELIRHQRTHTGEKPYDCKECGKAFRCPSQLSQHKR
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110 120 130 140 150 160
pF1KB8 IHTGEKPYKCKQCWKAFASVSDLIDIGKFTLMRDFTNVQNVGRHLTIAQLLFSIREFTLV
:::::: :.: .: ::: .: :
CCDS74 IHTGEKTYQCPECGKAFFYASGLSRHQSVHTGEKPYECKTCGKAFKQLTQLTRHQRIHDL
1000 1010 1020 1030 1040 1050
>--
initn: 919 init1: 494 opt: 494 Z-score: 345.5 bits: 73.9 E(32554): 6.3e-13
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10 20 30 40
pF1KB8 MQRNAMYLKNVAETACNFQLTQYQISHANQKPYECQICGKPFRKRAHLT
: .: :...:::.:. ::: : .:. :
CCDS74 SALLQHQRIHTGEKPYHCKECGKSFTFRSGLIGHQAVHTGEKPYDCKECGKSFTSRSALI
490 500 510 520 530 540
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 QHNRIHTGGKPYECKECGKVFICCSTLIQHKRTHTSEKPYECLECRKTFRRSAHLIRHQR
::.::::: :::.:::::: : :::.::.. ::.::::.: :: :.:: .: .::.
CCDS74 QHQRIHTGEKPYHCKECGKSFTVGSTLLQHQQIHTGEKPYDCKECGKAFRLRLRLTQHQQ
550 560 570 580 590 600
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 IHTGEKPYKCKQCWKAFASVSDLIDIGKFTLMRDFTNVQNVGRHLTIAQLLFSIREFTLV
::::::::.:..: :::.:::
CCDS74 IHTGEKPYQCQECGKAFVSVSGLTQHHRIHTGEKPYECPDCGKAFRQRTYLNQHRRIHTG
610 620 630 640 650 660
>--
initn: 475 init1: 475 opt: 484 Z-score: 339.0 bits: 72.7 E(32554): 1.5e-12
Smith-Waterman score: 495; 45.7% identity (69.8% similar) in 162 aa overlap (19-180:207-368)
10 20 30 40
pF1KB8 MQRNAMYLKNVAETACNFQLTQYQISHANQKPYECQICGKPFRKRAHL
.: :.: .....:.::: : :: :::
CCDS74 FSYLVKHQRIHTGEKPCACKEYGKAFISGSHLIQHQKMYTDERPHECQESVKAFRPSAHL
180 190 200 210 220 230
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 TQHNRIHTGGKPYECKECGKVFICCSTLIQHKRTHTSEKPYECLECRKTFRRSAHLIRHQ
:: ::::: :::::::::: : ::: ::.. ::.::::.: .: :.: .. :::::
CCDS74 IQHWRIHTGDKPYECKECGKSFTSGSTLNQHQQIHTGEKPYHCKQCGKSFTVGSTLIRHQ
240 250 260 270 280 290
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 RIHTGEKPYKCKQCWKAFASVSDLIDIGKFTLMRDFTNVQNVGRHLTIAQLLFSIREFTL
.:::::::: ::.: :.::: : :: .. . . .. :. .:. . :. ...
CCDS74 QIHTGEKPYDCKECGKSFASGSALIRHQRIHTGEKPYDCKECGKSFTFHSALIRHQRIHT
300 310 320 330 340 350
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 VRSPLNVRNVAKHSIIAQHLLNTRELILMRNLMNVRNVKRLLGKVHILLNIKEFILVRNH
..: . .. .:
CCDS74 GEKPYDCKECGKSFTFRSGLIGHQAIHTGEKPYDCKECGKSFTAGSTLIQHQRIHTGEKP
360 370 380 390 400 410
>>CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090 aa)
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Smith-Waterman score: 532; 45.1% identity (71.7% similar) in 173 aa overlap (20-192:660-832)
10 20 30 40
pF1KB8 MQRNAMYLKNVAETACNFQLTQYQISHANQKPYECQICGKPFRKRAHLT
:::.. :...::::: ::: ::.:..:.
CCDS59 LRLTQHQQIHTGEKPYQCQECGKAFVSVSGLTQHHRIHTGEKPYECPDCGKAFRQRTYLN
630 640 650 660 670 680
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pF1KB8 QHNRIHTGGKPYECKECGKVFICCSTLIQHKRTHTSEKPYECLECRKTFRRSAHLIRHQR
:: ::::: :::::::::: : :: ::::...::.::::. :: :.: . ::.::.
CCDS59 QHRRIHTGEKPYECKECGKSFTFCSGLIQHQQNHTDEKPYDGKECGKSFTSHSTLIQHQQ
690 700 710 720 730 740
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pF1KB8 IHTGEKPYKCKQCWKAFASVSDLIDIGKFTLMRDFTNVQNVGRHLTIAQLLFSIREFTLV
:::::::: ::.: :.:.: : ::. .. . . . .. :. .: . :.. . .
CCDS59 IHTGEKPYDCKECGKSFTSHSTLIQHQQIHTGEKLYDCKECGKSFTSHSTLIQHQPLHTG
750 760 770 780 790 800
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 RSPLNVRNVAKHSIIAQHLLNTRELILMRNLMNVRNVKRLLGKVHILLNIKEFILVRNHM
..: . .. .: . . :.. :
CCDS59 EKPYHCKECGKSFTLRSALIQHRPVHTGEKRYSCKECGKSFTSRSTLIEHQRIHTGEKPY
810 820 830 840 850 860
>--
initn: 962 init1: 515 opt: 519 Z-score: 361.6 bits: 76.9 E(32554): 8e-14
Smith-Waterman score: 519; 61.1% identity (81.4% similar) in 113 aa overlap (20-132:940-1052)
10 20 30 40
pF1KB8 MQRNAMYLKNVAETACNFQLTQYQISHANQKPYECQICGKPFRKRAHLT
::... :...:::::. ::: ::.:.:::
CCDS59 SKLTQHQRIHTGEKPYRCHECGKAFVRFSGLTKHHSIHTGEKPYECKTCGKSFRQRTHLT
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pF1KB8 QHNRIHTGGKPYECKECGKVFICCSTLIQHKRTHTSEKPYECLECRKTFRRSAHLIRHQR
:.::::: .::::::::: : : : ::.:.::::.::::.: :: :.:: ..: .:.:
CCDS59 LHQRIHTGDRPYECKECGKSFTCGSELIRHQRTHTGEKPYDCKECGKAFRCPSQLSQHKR
970 980 990 1000 1010 1020
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pF1KB8 IHTGEKPYKCKQCWKAFASVSDLIDIGKFTLMRDFTNVQNVGRHLTIAQLLFSIREFTLV
:::::: :.: .: ::: .: :
CCDS59 IHTGEKTYQCPECGKAFFYASGLSRHQSVHTGEKPYECKTCGKAFKQLTQLTRHQRIHDL
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initn: 919 init1: 494 opt: 494 Z-score: 345.4 bits: 73.9 E(32554): 6.5e-13
Smith-Waterman score: 494; 59.5% identity (80.2% similar) in 111 aa overlap (20-130:548-658)
10 20 30 40
pF1KB8 MQRNAMYLKNVAETACNFQLTQYQISHANQKPYECQICGKPFRKRAHLT
: .: :...:::.:. ::: : .:. :
CCDS59 SALLQHQRIHTGEKPYHCKECGKSFTFRSGLIGHQAVHTGEKPYDCKECGKSFTSRSALI
520 530 540 550 560 570
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 QHNRIHTGGKPYECKECGKVFICCSTLIQHKRTHTSEKPYECLECRKTFRRSAHLIRHQR
::.::::: :::.:::::: : :::.::.. ::.::::.: :: :.:: .: .::.
CCDS59 QHQRIHTGEKPYHCKECGKSFTVGSTLLQHQQIHTGEKPYDCKECGKAFRLRLRLTQHQQ
580 590 600 610 620 630
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 IHTGEKPYKCKQCWKAFASVSDLIDIGKFTLMRDFTNVQNVGRHLTIAQLLFSIREFTLV
::::::::.:..: :::.:::
CCDS59 IHTGEKPYQCQECGKAFVSVSGLTQHHRIHTGEKPYECPDCGKAFRQRTYLNQHRRIHTG
640 650 660 670 680 690
>--
initn: 475 init1: 475 opt: 484 Z-score: 338.9 bits: 72.7 E(32554): 1.5e-12
Smith-Waterman score: 495; 45.7% identity (69.8% similar) in 162 aa overlap (19-180:239-400)
10 20 30 40
pF1KB8 MQRNAMYLKNVAETACNFQLTQYQISHANQKPYECQICGKPFRKRAHL
.: :.: .....:.::: : :: :::
CCDS59 FSYLVKHQRIHTGEKPCACKEYGKAFISGSHLIQHQKMYTDERPHECQESVKAFRPSAHL
210 220 230 240 250 260
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 TQHNRIHTGGKPYECKECGKVFICCSTLIQHKRTHTSEKPYECLECRKTFRRSAHLIRHQ
:: ::::: :::::::::: : ::: ::.. ::.::::.: .: :.: .. :::::
CCDS59 IQHWRIHTGDKPYECKECGKSFTSGSTLNQHQQIHTGEKPYHCKQCGKSFTVGSTLIRHQ
270 280 290 300 310 320
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 RIHTGEKPYKCKQCWKAFASVSDLIDIGKFTLMRDFTNVQNVGRHLTIAQLLFSIREFTL
.:::::::: ::.: :.::: : :: .. . . .. :. .:. . :. ...
CCDS59 QIHTGEKPYDCKECGKSFASGSALIRHQRIHTGEKPYDCKECGKSFTFHSALIRHQRIHT
330 340 350 360 370 380
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 VRSPLNVRNVAKHSIIAQHLLNTRELILMRNLMNVRNVKRLLGKVHILLNIKEFILVRNH
..: . .. .:
CCDS59 GEKPYDCKECGKSFTFRSGLIGHQAIHTGEKPYDCKECGKSFTAGSTLIQHQRIHTGEKP
390 400 410 420 430 440
327 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 15:38:33 2016 done: Fri Nov 4 15:38:33 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]