Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8793
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8793, 330 aa
1>>>pF1KB8793 330 - 330 aa - 330 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9585+/-0.000942; mu= 18.5916+/- 0.056
mean_var=116.3099+/-32.831, 0's: 0 Z-trim(106.4): 121 B-trim: 514 in 1/49
Lambda= 0.118923
statistics sampled from 8814 (8956) to 8814 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.623), E-opt: 0.2 (0.275), width: 16
Scan time: 2.650
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7847.1 MRGPRX2 gene_id:117194|Hs108|chr11 ( 330) 2249 397.2 9.8e-111
CCDS7846.1 MRGPRX1 gene_id:259249|Hs108|chr11 ( 322) 1341 241.4 7.6e-64
CCDS7831.1 MRGPRX4 gene_id:117196|Hs108|chr11 ( 322) 1283 231.4 7.5e-61
CCDS7830.1 MRGPRX3 gene_id:117195|Hs108|chr11 ( 322) 1271 229.4 3.1e-60
CCDS31625.1 MRGPRD gene_id:116512|Hs108|chr11 ( 321) 710 133.1 3e-31
CCDS41603.2 MRGPRE gene_id:116534|Hs108|chr11 ( 312) 649 122.6 4.1e-28
CCDS8188.1 MRGPRF gene_id:116535|Hs108|chr11 ( 343) 630 119.4 4.2e-27
CCDS5272.1 MAS1 gene_id:4142|Hs108|chr6 ( 325) 609 115.8 4.9e-26
CCDS44520.1 MRGPRG gene_id:386746|Hs108|chr11 ( 289) 483 94.1 1.5e-19
CCDS4661.1 MAS1L gene_id:116511|Hs108|chr6 ( 378) 426 84.5 1.5e-16
>>CCDS7847.1 MRGPRX2 gene_id:117194|Hs108|chr11 (330 aa)
initn: 2249 init1: 2249 opt: 2249 Z-score: 2101.5 bits: 397.2 E(32554): 9.8e-111
Smith-Waterman score: 2249; 100.0% identity (100.0% similar) in 330 aa overlap (1-330:1-330)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDPTTPAWGTESTTVNGNDQALLLLCGKETLIPVFLILFIALVGLVGNGFVLWLLGFRMR
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CCDS78 MDPTTPAWGTESTTVNGNDQALLLLCGKETLIPVFLILFIALVGLVGNGFVLWLLGFRMR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 RNAFSVYVLSLAGADFLFLCFQIINCLVYLSNFFCSISINFPSFFTTVMTCAYLAGLSML
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CCDS78 RNAFSVYVLSLAGADFLFLCFQIINCLVYLSNFFCSISINFPSFFTTVMTCAYLAGLSML
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 STVSTERCLSVLWPIWYRCRRPRHLSAVVCVLLWALSLLLSILEGKFCGFLFSDGDSGWC
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CCDS78 STVSTERCLSVLWPIWYRCRRPRHLSAVVCVLLWALSLLLSILEGKFCGFLFSDGDSGWC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 QTFDFITAAWLIFLFMVLCGSSLALLVRILCGSRGLPLTRLYLTILLTVLVFLLCGLPFG
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CCDS78 QTFDFITAAWLIFLFMVLCGSSLALLVRILCGSRGLPLTRLYLTILLTVLVFLLCGLPFG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 IQWFLILWIWKDSDVLFCHIHPVSVVLSSLNSSANPIIYFFVGSFRKQWRLQQPILKLAL
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CCDS78 IQWFLILWIWKDSDVLFCHIHPVSVVLSSLNSSANPIIYFFVGSFRKQWRLQQPILKLAL
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KB8 QRALQDIAEVDHSEGCFRQGTPEMSRSSLV
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CCDS78 QRALQDIAEVDHSEGCFRQGTPEMSRSSLV
310 320 330
>>CCDS7846.1 MRGPRX1 gene_id:259249|Hs108|chr11 (322 aa)
initn: 1067 init1: 997 opt: 1341 Z-score: 1259.7 bits: 241.4 E(32554): 7.6e-64
Smith-Waterman score: 1341; 65.3% identity (81.8% similar) in 329 aa overlap (1-329:1-320)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDPTTPAWGTESTTVNGNDQALLLLCGKETLIPVFLILFIALVGLVGNGFVLWLLGFRMR
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CCDS78 MDPTISTLDTELTPINGTEETL---CYKQTLSLTVLTCIVSLVGLTGNAVVLWLLGCRMR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 RNAFSVYVLSLAGADFLFLCFQIINCLVYLSNFFCSISINFPSFFTTVMTCAYLAGLSML
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CCDS78 RNAFSIYILNLAAADFLFLSGRLIYSL--LS--FISIPHTISKILYPVMMFSYFAGLSFL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 STVSTERCLSVLWPIWYRCRRPRHLSAVVCVLLWALSLLLSILEGKFCGFLFSDGDSGWC
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CCDS78 SAVSTERCLSVLWPIWYRCHRPTHLSAVVCVLLWALSLLRSILEWMLCGFLFSGADSAWC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 QTFDFITAAWLIFLFMVLCGSSLALLVRILCGSRGLPLTRLYLTILLTVLVFLLCGLPFG
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CCDS78 QTSDFITVAWLIFLCVVLCGSSLVLLIRILCGSRKIPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 IQWFLILWIWKDSDVLFCHIHPVSVVLSSLNSSANPIIYFFVGSFRKQWRLQQPILKLAL
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CCDS78 IQFFLFLWIHVDREVLFCHVHLVSIFLSALNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQN--LKLVL
240 250 260 270 280 290
310 320 330
pF1KB8 QRALQDIAEVDHSEGCFRQGTPEMSRSSLV
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CCDS78 QRALQDASEVDEGGGQLPEEILELSGSRLEQ
300 310 320
>>CCDS7831.1 MRGPRX4 gene_id:117196|Hs108|chr11 (322 aa)
initn: 1282 init1: 910 opt: 1283 Z-score: 1205.9 bits: 231.4 E(32554): 7.5e-61
Smith-Waterman score: 1283; 62.6% identity (80.9% similar) in 329 aa overlap (1-329:1-320)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDPTTPAWGTESTTVNGNDQALLLLCGKETLIPVFLILFIALVGLVGNGFVLWLLGFRMR
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CCDS78 MDPTVPVFGTKLTPINGREETP---CYNQTLSFTVLTCIISLVGLTGNAVVLWLLGYRMR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 RNAFSVYVLSLAGADFLFLCFQIINCLVYLSNFFCSISINFPSFFTTVMTCAYLAGLSML
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CCDS78 RNAVSIYILNLAAADFLFLSFQIIRLPLRLIN----ISHLIRKILVSVMTFPYFTGLSML
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 STVSTERCLSVLWPIWYRCRRPRHLSAVVCVLLWALSLLLSILEGKFCGFLFSDGDSGWC
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CCDS78 SAISTERCLSVLWPIWYRCRRPTHLSAVVCVLLWGLSLLFSMLEWRFCDFLFSGADSSWC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 QTFDFITAAWLIFLFMVLCGSSLALLVRILCGSRGLPLTRLYLTILLTVLVFLLCGLPFG
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CCDS78 ETSDFIPVAWLIFLCVVLCVSSLVLLVRILCGSRKMPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 IQWFLILWIWKDSDVLFCHIHPVSVVLSSLNSSANPIIYFFVGSFRKQWRLQQPILKLAL
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CCDS78 ILGALIYRMHLNLEVLYCHVYLVCMSLSSLNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQN--LKLVL
240 250 260 270 280 290
310 320 330
pF1KB8 QRALQDIAEVDHSEGCFRQGTPEMSRSSLV
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CCDS78 QRALQDKPEVDKGEGQLPEESLELSGSRLGP
300 310 320
>>CCDS7830.1 MRGPRX3 gene_id:117195|Hs108|chr11 (322 aa)
initn: 1246 init1: 940 opt: 1271 Z-score: 1194.8 bits: 229.4 E(32554): 3.1e-60
Smith-Waterman score: 1271; 62.6% identity (78.7% similar) in 329 aa overlap (1-329:1-320)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDPTTPAWGTESTTVNGNDQALLLLCGKETLIPVFLILFIALVGLVGNGFVLWLLGFRMR
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CCDS78 MDSTIPVLGTELTPINGREETP---CYKQTLSFTGLTCIVSLVALTGNAVVLWLLGCRMR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 RNAFSVYVLSLAGADFLFLCFQIINCLVYLSNFFCSISINFPSFFTTVMTCAYLAGLSML
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CCDS78 RNAVSIYILNLVAADFLFLSGHIICSPLRLINIRHPIS----KILSPVMTFPYFIGLSML
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 STVSTERCLSVLWPIWYRCRRPRHLSAVVCVLLWALSLLLSILEGKFCGFLFSDGDSGWC
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CCDS78 SAISTERCLSILWPIWYHCRRPRYLSSVMCVLLWALSLLRSILEWMFCDFLFSGANSVWC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 QTFDFITAAWLIFLFMVLCGSSLALLVRILCGSRGLPLTRLYLTILLTVLVFLLCGLPFG
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CCDS78 ETSDFITIAWLVFLCVVLCGSSLVLLVRILCGSRKMPLTRLYVTILLTVLVFLLCGLPFG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 IQWFLILWIWKDSDVLFCHIHPVSVVLSSLNSSANPIIYFFVGSFRKQWRLQQPILKLAL
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CCDS78 IQWALFSRIHLDWKVLFCHVHLVSIFLSALNSSANPIIYFFVGSFRQRQNRQN--LKLVL
240 250 260 270 280 290
310 320 330
pF1KB8 QRALQDIAEVDHSEGCFRQGTPEMSRSSLV
:::::: :::.. : . : : :.: : :
CCDS78 QRALQDTPEVDEGGGWLPQETLELSGSRLEQ
300 310 320
>>CCDS31625.1 MRGPRD gene_id:116512|Hs108|chr11 (321 aa)
initn: 621 init1: 299 opt: 710 Z-score: 674.6 bits: 133.1 E(32554): 3e-31
Smith-Waterman score: 710; 43.1% identity (70.5% similar) in 295 aa overlap (36-324:33-319)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 PAWGTESTTVNGNDQALLLLCGKETLIPVFLILFIALVGLVGNGFVLWLLGFRMRRNAFS
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CCDS31 QTLNSSGTVESALNYSRGSTVHTAYLVLSSLAMFTCLCGMAGNSMVIWLLGFRMHRNPFC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 VYVLSLAGADFLFLCFQIINCLVYLSNFFCSISINFPSFFTTVMTCAYLAGLSMLSTVST
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CCDS31 IYILNLAAADLLFL-FSMASTLSLETQPLVNTTDKVHELMKRLMYFAYTVGLSLLTAIST
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 ERCLSVLWPIWYRCRRPRHLSAVVCVLLWALSLLLSILEGKFCG-FLFSDGDSGWCQTFD
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CCDS31 QRCLSVLFPIWFKCHRPRHLSAWVCGLLWTLCLLMNGLTSSFCSKFLKFNEDR--CFRVD
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 FITAAWLI-FLFMVLCGSSLALLVRILCGS---RGLPLTRLYLTILLTVLVFLLCGLPFG
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CCDS31 MVQAALIMGVLTPVMTLSSLTLFVWVRRSSQQWRRQP-TRLFVVVLASVLVFLICSLPLS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KB8 IQWFLILWIWKDSDV-LFCHIHPVSVVLSSLNSSANPIIYFFVGSFRKQWRLQQPILKLA
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CCDS31 IYWFVLYWLSLPPEMQVLC--FSLSRLSSSVSSSANPVIYFLVGS-RRSHRLPTRSLGTV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KB8 LQRALQDIAEVDHSEGCFRQGTPEMSRSSLV
::.::.. :.. .: :: ::
CCDS31 LQQALREEPELEGGE-TPTVGTNEMGA
300 310 320
>>CCDS41603.2 MRGPRE gene_id:116534|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 664 init1: 548 opt: 649 Z-score: 618.2 bits: 122.6 E(32554): 4.1e-28
Smith-Waterman score: 649; 39.2% identity (67.1% similar) in 301 aa overlap (31-325:25-311)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MDPTTPAWGTESTTVNGNDQALLLLCGKETLIPVFLILFIALVGLVGNGFVLWLLGFRMR
:: . : ..: ::.::: :::::. .
CCDS41 MMEPREAGQHVGAANGAQEDVAFNLIILSLTEGLGLGGLLGNGAVLWLLSSNVY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB8 RNAFSVYVLSLAGADFLFLCFQIINC-LVYLSNFFCSISINFPSFFTTVMT-----CAYL
:: :..:.:..: ::..:: .: .: . . . ..::.: : .. : :.
CCDS41 RNPFAIYLLDVACADLIFL-----GCHMVAIVPDLLQGRLDFPGFVQTSLATLRFFC-YI
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 AGLSMLSTVSTERCLSVLWPIWYRCRRPRHLSAVVCVLLWALSLLLSILEGKFCGFLFSD
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CCDS41 VGLSLLAAVSVEQCLAALFPAWYSCRRPRHLTTCVCALTWALCLLLHLLLSGACTQFFGE
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 GDSGWCQTFDFITAAWLIFLFMVLCGSSLALLVRILCGSRGLPLTRLYLTILLTVLVFLL
. :.:. ...:. : .: ..::.:: ::.:. : . : . ::::::.::.
CCDS41 PSRHLCRTLWLVAAVLLALLCCTMCGASLMLLLRVERGPQRPPPRGFPGLILLTVLLFLF
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 CGLPFGIQWFLILWIWKDSDVLFCHIHPVSVVLSSLNSSANPIIYFFVGSFRKQWRLQQP
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CCDS41 CGLPFGIYWLSRNLLWYIPHYFY-HF---SFLMAAVHCAAKPVVYFCLGSAQGR-RL--P
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330
pF1KB8 ILKLALQRALQDIAEVDHSEGCFRQGTPEMSRSSLV
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CCDS41 -LRLVLQRALGDEAELGAVRETSRRGLVDIAA
290 300 310
>>CCDS8188.1 MRGPRF gene_id:116535|Hs108|chr11 (343 aa)
initn: 580 init1: 442 opt: 630 Z-score: 600.1 bits: 119.4 E(32554): 4.2e-27
Smith-Waterman score: 630; 37.8% identity (69.6% similar) in 286 aa overlap (35-315:49-325)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 TPAWGTESTTVNGNDQALLLLCGKETLIPVFLILFIALVGLVGNGFVLWLLGFRMRRNAF
...:.. : ::::::.:::..:: ..:: :
CCDS81 PGLSEAPELYSRGFLTIEQIAMLPPPAVMNYIFLLLCLCGLVGNGLVLWFFGFSIKRNPF
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 SVYVLSLAGADFLFLCFQIINCLVYLSNFFCSISINFPSFFTTVMTCAYLAGLSMLSTVS
:.: : ::.:: .: . . .. ..:. ... . : .. : .:.:.:.: .::
CCDS81 SIYFLHLASADVGYLFSKAVFSILNTGGFLGTFADYIRSVCRVLGLCMFLTGVSLLPAVS
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 TERCLSVLWPIWYRCRRPRHLSAVVCVLLWALSLLLSILEGKFCGFLFSDGDSGWCQTFD
.::: ::..: :: :::..::::::.:::.::::.. :.. :: :: . .. :. .:
CCDS81 AERCASVIFPAWYWRRRPKRLSAVVCALLWVLSLLVTCLHNYFCVFLGRGAPGAACRHMD
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230
pF1KB8 FITAAWLIFLFMVLCG----SSLALLVRILCGSRGLPLT-RLYLTILLTVLVFLLCGLPF
.. . :.::.. : :::.... : .: . .: .:: : :::. .. .
CCDS81 IFLG---ILLFLLCCPLMVLPCLALILHVECRARRRQRSAKLNHVILAMVSVFLVSSIYL
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 GIQWFLILWIWKDSDVLFCHIHPVSVVLSSLNSSANPIIYFFVGSFRKQWRLQQPILKLA
::.::: .:... . .. . . . ::::.::.::..: ..: :: .: :...
CCDS81 GIDWFL-FWVFQIPAPFPEYVTDLCICI---NSSAKPIVYFLAGRDKSQ-RLWEP-LRVV
260 270 280 290 300
300 310 320 330
pF1KB8 LQRALQDIAEVDHSEGCFRQGTPEMSRSSLV
.::::.: ::. .. :
CCDS81 FQRALRDGAELGEAGGSTPNTVTMEMQCPPGNAS
310 320 330 340
>>CCDS5272.1 MAS1 gene_id:4142|Hs108|chr6 (325 aa)
initn: 531 init1: 250 opt: 609 Z-score: 580.9 bits: 115.8 E(32554): 4.9e-26
Smith-Waterman score: 609; 38.5% identity (73.1% similar) in 283 aa overlap (32-306:32-305)
10 20 30 40 50
pF1KB8 DPTTPAWGTESTTVNGNDQALLLLCGKETLIPV--FLILFIALVGLVGNGFVLWLLGFRM
::. ..:. :. ::.: ::..::.: :::
CCDS52 DGSNVTSFVVEEPTNISTGRNASVGNAHRQIPIVHWVIMSISPVGFVENGILLWFLCFRM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 RRNAFSVYVLSLAGADF-LFLCFQIINCLVYLSNFFCSISINFPSFFTTVMTC--AYLAG
::: :.::. :. ::. :..:. :.. . : .. : : .. .. : .: .: .:
CCDS52 RRNPFTVYITHLSIADISLLFCIFILS-IDYALDYELS-SGHYYTIVTLSVTFLFGYNTG
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 LSMLSTVSTERCLSVLWPIWYRCRRPRHLSAVVCVLLWALSLLLSILEGKFCGFLFSDGD
: .:...:.:::::::.::::::.::.. ::.::.:::::: :.. .: .: ..
CCDS52 LYLLTAISVERCLSVLYPIWYRCHRPKYQSALVCALLWALSCLVTTMEYVMCIDREEESH
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]