FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB8795, 331 aa 1>>>pF1KB8795 331 - 331 aa - 331 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0141+/-0.0017; mu= 9.6317+/- 0.100 mean_var=238.1561+/-48.742, 0's: 0 Z-trim(105.2): 943 B-trim: 108 in 1/48 Lambda= 0.083108 statistics sampled from 7287 (8312) to 7287 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.572), E-opt: 0.2 (0.255), width: 16 Scan time: 2.190 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS2716.1 ZNF660 gene_id:285349|Hs108|chr3 ( 331) 2335 293.5 1.6e-79 CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1363 177.2 2.4e-44 CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1348 175.5 9.7e-44 CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1348 175.5 1e-43 CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1348 175.6 1e-43 CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1348 175.6 1e-43 CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1329 173.4 5.3e-43 CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 1315 171.4 1.3e-42 CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1312 171.0 1.6e-42 CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1313 171.2 1.7e-42 CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 1313 171.3 1.7e-42 CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 1313 171.3 1.8e-42 CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 1313 171.3 1.8e-42 CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 1311 171.0 2e-42 CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1311 171.1 2.2e-42 CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1307 170.7 3.1e-42 CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1309 171.2 3.4e-42 CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1309 171.2 3.5e-42 CCDS32981.1 ZNF675 gene_id:171392|Hs108|chr19 ( 568) 1300 169.7 5e-42 CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1300 169.7 5.1e-42 CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1300 169.8 5.4e-42 CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17 ( 502) 1296 169.1 6.5e-42 CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 1297 169.4 7.1e-42 CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 536) 1292 168.7 9.4e-42 CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 592) 1292 168.8 1e-41 CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1292 168.9 1.1e-41 CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 1286 167.8 1.2e-41 CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 1289 168.5 1.4e-41 CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 1289 168.5 1.4e-41 CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 1289 168.5 1.4e-41 CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 1286 167.9 1.4e-41 CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 1286 167.9 1.5e-41 CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1287 168.2 1.5e-41 CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1287 168.2 1.6e-41 CCDS62623.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 574) 1284 167.8 1.9e-41 CCDS74324.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 586) 1284 167.8 1.9e-41 CCDS74323.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 618) 1284 167.8 2e-41 CCDS32983.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 659) 1284 167.9 2.1e-41 CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 503) 1280 167.2 2.5e-41 CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1282 167.7 2.5e-41 CCDS58687.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 555) 1280 167.3 2.6e-41 CCDS12957.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 564) 1280 167.3 2.6e-41 CCDS12956.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 577) 1280 167.3 2.7e-41 CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19 ( 616) 1280 167.4 2.8e-41 CCDS74468.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 616) 1280 167.4 2.8e-41 CCDS58686.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 629) 1280 167.4 2.8e-41 CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1277 166.9 3.3e-41 CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1279 167.4 3.5e-41 CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1279 167.4 3.6e-41 CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1277 167.1 3.8e-41 >>CCDS2716.1 ZNF660 gene_id:285349|Hs108|chr3 (331 aa) initn: 2335 init1: 2335 opt: 2335 Z-score: 1541.1 bits: 293.5 E(32554): 1.6e-79 Smith-Waterman score: 2335; 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CCDS12 SVLVRHQRIHTGEKPYECKECGKAFGSGANLAYHQRIHTGEKPFECKECGKAFGSGSNLT 80 90 100 110 120 130 100 110 120 130 140 150 pF1KB8 VHRRIHTGLKPYTCSECGKSFSGKSHLIRHQGIHSGEKTYECKECGKAFSRSSGLISHHR :.::::: ::: :.::::.:: : ::::: :::::: ::::::::.:: :.:: ::: CCDS12 HHQRIHTGEKPYECKECGKAFSFGSGLIRHQIIHSGEKPYECKECGKSFSFESALIRHHR 140 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 210 pF1KB8 VHTGEKPYSCIECGKAFSRSSNLTQHQRMHRGKKVYKCKECGKTCGSNTKIMDHQRIHTG .::::::: ::.:::::. .::::::.:.: :.: :.:: :: . .:.. . ::::::: CCDS12 IHTGEKPYECIDCGKAFGSGSNLTQHRRIHTGEKPYECKACGMAFSSGSALTRHQRIHTG 200 210 220 230 240 250 220 230 240 250 260 270 pF1KB8 EKPYECDECGKTFILRKTLNEHQRLHRREKPYKCNECGKAFTSNRNLVDHQRVHTGEKPY :::: :.::::.: . ..:..:::.: :::: :.::::::.:. .:..:::.::::::: CCDS12 EKPYICNECGKAFSFGSALTRHQRIHTGEKPYVCKECGKAFNSGSDLTQHQRIHTGEKPY 260 270 280 290 300 310 280 290 300 310 320 330 pF1KB8 KCNECGKTFRQTSQVILHLRTHTKEKPYKCSECGKAYRYSSQLIQHQRKHNEEKETS .:.:: :.::. :..: : : :: ::::.:.::::.. .:.: ::.: :. :: CCDS12 ECKECEKAFRSGSKLIQHQRMHTGEKPYECKECGKTFSSGSDLTQHHRIHTGEKPYECKE 320 330 340 350 360 370 CCDS12 CGKAFGSGSKLIQHQLIHTGERPYECKECGKSFSSGSALNRHQRIHTGEKPYECKECGKA 380 390 400 410 420 430 >-- initn: 1391 init1: 524 opt: 524 Z-score: 365.8 bits: 76.6 E(32554): 4.7e-14 Smith-Waterman score: 524; 61.9% identity (83.2% similar) in 113 aa overlap (77-189:369-481) 50 60 70 80 90 100 pF1KB8 KRQYVCTECGKAFSQSANLTVHERIHTGEKPYKCKECGKAFSHSSNLVVHRRIHTGLKPY ::.::::::::. .:.:. :. :::: .:: CCDS12 EKPYECKECGKTFSSGSDLTQHHRIHTGEKPYECKECGKAFGSGSKLIQHQLIHTGERPY 340 350 360 370 380 390 110 120 130 140 150 160 pF1KB8 TCSECGKSFSGKSHLIRHQGIHSGEKTYECKECGKAFSRSSGLISHHRVHTGEKPYSCIE :.:::::::. : : ::: ::.::: :::::::::: .:.: .:.:.::::: : : . 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CCDS54 RIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHT 370 380 390 400 410 420 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 GEKTYECKECGKAFSRSSGLISHHRVHTGEKPYSCIECGKAFSRSSNLTQHQRMHRGKKV ::: ::: :::::::.:. : :.:.:::::::.: ::::.::.::.:.::.: : :.: CCDS54 GEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKP 430 440 450 460 470 480 190 200 210 220 230 240 pF1KB8 YKCKECGKTCGSNTKIMDHQRIHTGEKPYECDECGKTFILRKTLNEHQRLHRREKPYKCN :.:..:::. ..:.. .:::::::::::::..:::.: ..:..:::.: ::::.:: CCDS54 YECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECN 490 500 510 520 530 540 250 260 270 280 290 300 pF1KB8 ECGKAFTSNRNLVDHQRVHTGEKPYKCNECGKTFRQTSQVILHLRTHTKEKPYKCSECGK .::.::.. :..:::.:::::::.::.::..: :.: .: : : ::::::: :.:::: CCDS54 QCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGK 550 560 570 580 590 600 310 320 330 pF1KB8 AYRYSSQLIQHQRKHNEEKETS .. .::.: ::.: :. :: CCDS54 SFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTH 610 620 630 640 650 660 >-- initn: 1291 init1: 495 opt: 500 Z-score: 348.7 bits: 73.9 E(32554): 4.2e-13 Smith-Waterman score: 500; 47.9% identity (74.3% similar) in 144 aa overlap (36-179:196-339) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 RNFKHKTVKDNKVLTEGSDQESEKDNSQCCDPATNERVQAEKRQYVCTECGKAFSQSANL .: .. .. .:: : .. .. .: CCDS54 SLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDL 170 180 190 200 210 220 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 TVHERIHTGEKPYKCKECGKAFSHSSNLVVHRRIHTGLKPYTCSECGKSFSGKSHLIRHQ .: .. . ::::::.:::::::::: :. :.: ::: .:: : :: :.: ..: : .:: CCDS54 NVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQ 230 240 250 260 270 280 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 GIHSGEKTYECKECGKAFSRSSGLISHHRVHTGEKPYSCIECGKAFSRSSNLTQHQRMHR ::.::: :.: .::..:.. . ::.:.:.::::::: : ::::.:: :...: CCDS54 RIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHT 290 300 310 320 330 340 190 200 210 220 230 240 pF1KB8 GKKVYKCKECGKTCGSNTKIMDHQRIHTGEKPYECDECGKTFILRKTLNEHQRLHRREKP CCDS54 GEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKP 350 360 370 380 390 400 >>CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 (754 aa) initn: 2569 init1: 1329 opt: 1329 Z-score: 885.5 bits: 173.4 E(32554): 5.3e-43 Smith-Waterman score: 1329; 59.9% identity (84.3% similar) in 287 aa overlap (42-328:431-717) 20 30 40 50 60 70 pF1KB8 TVKDNKVLTEGSDQESEKDNSQCCDPATNERVQAEKRQYVCTECGKAFSQSANLTVHERI :... .. : :.:::::. .:..: :.:. CCDS27 HQRIHTGEKPYECNECGKTFRQTSQLIVHLRTHTGEKPYECSECGKAYRHSSHLIQHQRL 410 420 430 440 450 460 80 90 100 110 120 130 pF1KB8 HTGEKPYKCKECGKAFSHSSNLVVHRRIHTGLKPYTCSECGKSFSGKSHLIRHQGIHSGE :.:::::::.::.:::..:: :. :.: ::: ::: :.:::..: .. : ::: .:.:. CCDS27 HNGEKPYKCNECAKAFTQSSRLTDHQRTHTGEKPYECNECGEAFIRSKSLARHQVLHTGK 470 480 490 500 510 520 140 150 160 170 180 190 pF1KB8 KTYECKECGKAFSRSSGLISHHRVHTGEKPYSCIECGKAFSRSSNLTQHQRMHRGKKVYK : :.:.:::.:: . .::.:.:.::::::: : :::::::::. : .:: .: :.: :: CCDS27 KPYKCNECGRAFCSNRNLIDHQRIHTGEKPYECSECGKAFSRSKCLIRHQSLHTGEKPYK 530 540 550 560 570 580 200 210 220 230 240 250 pF1KB8 CKECGKTCGSNTKIMDHQRIHTGEKPYECDECGKTFILRKTLNEHQRLHRREKPYKCNEC :.::::. ..:.....:.::::::::.::.::::.: : : : .::::: ::::::::: CCDS27 CSECGKAFNQNSQLIEHERIHTGEKPFECSECGKAFGLSKCLIRHQRLHTGEKPYKCNEC 590 600 610 620 630 640 260 270 280 290 300 310 pF1KB8 GKAFTSNRNLVDHQRVHTGEKPYKCNECGKTFRQTSQVILHLRTHTKEKPYKCSECGKAY ::.:..: .:. :::.:::::::.::::::.: .:....: :::: ::::::..::::. CCDS27 GKSFNQNSHLIIHQRIHTGEKPYECNECGKVFSYSSSLMVHQRTHTGEKPYKCNDCGKAF 650 660 670 680 690 700 320 330 pF1KB8 RYSSQLIQHQRKHNEEKETS ::::: ::: :. :: CCDS27 SDSSQLIVHQRVHTGEKPYECSECGKAFSQRSTFNHHQRTHTGEKSSGLAWSVS 710 720 730 740 750 >>CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 (475 aa) initn: 1310 init1: 1310 opt: 1315 Z-score: 878.5 bits: 171.4 E(32554): 1.3e-42 Smith-Waterman score: 1315; 59.8% identity (81.1% similar) in 296 aa overlap (32-327:180-475) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 RRKTRNFKHKTVKDNKVLTEGSDQESEKDNSQCCDPATNERVQAEKRQYVCTECGKAFSQ :: . ..:.. ...: : :::: :: CCDS12 TFIQQTFLTLHQIINNEDRPYECKKCGKAFSQNSQFIQHQRIHIGEKSYECKECGKFFSC 150 160 170 180 190 200 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 SANLTVHERIHTGEKPYKCKECGKAFSHSSNLVVHRRIHTGLKPYTCSECGKSFSGKSHL ....: : .:::::::..::::::::: :: : :.::::: ::: :.::::.:: :.: CCDS12 GSHVTRHLKIHTGEKPFECKECGKAFSCSSYLSQHQRIHTGKKPYECKECGKAFSYCSNL 210 220 230 240 250 260 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 IRHQGIHSGEKTYECKECGKAFSRSSGLISHHRVHTGEKPYSCIECGKAFSRSSNLTQHQ : :: ::.::: :::: :::::..:: :..: :.::::::: : ::::::..::.:.::: CCDS12 IDHQRIHTGEKPYECKVCGKAFTKSSQLFQHARIHTGEKPYECKECGKAFTQSSKLVQHQ 270 280 290 300 310 320 190 200 210 220 230 240 pF1KB8 RMHRGKKVYKCKECGKTCGSNTKIMDHQRIHTGEKPYECDECGKTFILRKTLNEHQRLHR :.: :.: :.::::::. .:.. . .:::::::::::.: ::::.: . : .:::.: CCDS12 RIHTGEKPYECKECGKAFSSGSALTNHQRIHTGEKPYDCKECGKAFTQSSQLRQHQRIHA 330 340 350 360 370 380 250 260 270 280 290 300 pF1KB8 REKPYKCNECGKAFTSNRNLVDHQRVHTGEKPYKCNECGKTFRQTSQVILHLRTHTKEKP :::..: :::::::.: .: .:::.:: ::::.::::::.: . :.. ::: :: ::: CCDS12 GEKPFECLECGKAFTQNSQLFQHQRIHTDEKPYECNECGKAFNKCSNLTRHLRIHTGEKP 390 400 410 420 430 440 310 320 330 pF1KB8 YKCSECGKAYRYSSQLIQHQRKHNEEKETS :.:.:::::. .:.::.:: :... CCDS12 YNCKECGKAFSSGSDLIRHQGIHTNK 450 460 470 >>CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 (461 aa) initn: 1310 init1: 1310 opt: 1312 Z-score: 876.7 bits: 171.0 E(32554): 1.6e-42 Smith-Waterman score: 1312; 57.9% identity (81.6% similar) in 299 aa overlap (26-324:162-460) 10 20 30 40 50 pF1KB8 MRRKTRNFKHKTVKDNKVLTEGSDQESEKDNSQCCDPATNERVQAEKRQYVCTEC : : :: . ....:... .. : : :: CCDS44 CNVCGKHFIERSSLTVHQRIHTGEKPYKCNECGKAFSQSMNLTVHQRTHTGEKPYQCKEC 140 150 160 170 180 190 60 70 80 90 100 110 pF1KB8 GKAFSQSANLTVHERIHTGEKPYKCKECGKAFSHSSNLVVHRRIHTGLKPYTCSECGKSF :::: ....: :::::::::::::.::::::..: ::.::.: ::: ::: :.::::.: CCDS44 GKAFHKNSSLIQHERIHTGEKPYKCNECGKAFTQSMNLTVHQRTHTGEKPYECNECGKAF 200 210 220 230 240 250 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 SGKSHLIRHQGIHSGEKTYECKECGKAFSRSSGLISHHRVHTGEKPYSCIECGKAFSRSS : . ::: :: :.::: :::..::::::.:: : :.: :::::::.: .:::.::.:. CCDS44 SQSMHLIVHQRSHTGEKPYECSQCGKAFSKSSTLTLHQRNHTGEKPYKCNKCGKSFSQST 260 270 280 290 300 310 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 NLTQHQRMHRGKKVYKCKECGKTCGSNTKIMDHQRIHTGEKPYECDECGKTFILRKTLNE : .:::.: : : ..:.::::. ..:... .:.::::::::::: ::: : :..:. CCDS44 YLIEHQRLHSGVKPFECNECGKAFSKNSSLTQHRRIHTGEKPYECMVCGKHFTGRSSLTV 320 330 340 350 360 370 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 HQRLHRREKPYKCNECGKAFTSNRNLVDHQRVHTGEKPYKCNECGKTFRQTSQVILHLRT :: .: ::::.::::::::... :..:::.:::::::.:..:::.: ..:.. .: :: CCDS44 HQVIHTGEKPYECNECGKAFSQSAYLIEHQRIHTGEKPYECDQCGKAFIKNSSLTVHQRT 380 390 400 410 420 430 300 310 320 330 pF1KB8 HTKEKPYKCSECGKAYRYSSQLIQHQRKHNEEKETS :: ::::.:.:::::. :..: .::: : CCDS44 HTGEKPYQCNECGKAFSRSTNLTRHQRTHT 440 450 460 >>CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 (544 aa) initn: 1298 init1: 1298 opt: 1313 Z-score: 876.6 bits: 171.2 E(32554): 1.7e-42 Smith-Waterman score: 1313; 55.6% identity (79.7% similar) in 315 aa overlap (17-328:119-433) 10 20 30 40 pF1KB8 MRRKTRNFKHKTVKDNKVLTEGSDQESEKDNSQCCDPATNERVQA- .: :: : .. : .: : : . . . . CCDS27 IHKEAPPEIISQGYNFEKSLLLTSSLVTRLRVSTEESLHQWETSNIQTNDISDQSKCPTL 90 100 110 120 130 140 50 60 70 80 90 100 pF1KB8 --EKRQYVCTECGKAFSQSANLTVHERIHTGEKPYKCKECGKAFSHSSNLVVHRRIHTGL .:... :.::::.:.::..:: :.: ::::.:: :.:::::::.:: :: :.:::::. CCDS27 CTQKKSWKCNECGKTFTQSSSLTQHQRTHTGERPYTCEECGKAFSRSSFLVQHQRIHTGV 150 160 170 180 190 200 110 120 130 140 150 160 pF1KB8 KPYTCSECGKSFSGKSHLIRHQGIHSGEKTYECKECGKAFSRSSGLISHHRVHTGEKPYS ::: : .:::.: .: : .:: ::.::: :.:.:::..: : : :.:.:::::::. CCDS27 KPYGCEQCGKTFRCRSFLTQHQRIHTGEKPYKCNECGNSFRNHSHLTEHQRIHTGEKPYK 210 220 230 240 250 260 170 180 190 200 210 220 pF1KB8 CIECGKAFSRSSNLTQHQRMHRGKKVYKCKECGKTCGSNTKIMDHQRIHTGEKPYECDEC : .:::::.....: .:::.: :.: : :.:::.. ..... .::::::::::..:::: CCDS27 CNRCGKAFNQNTHLIHHQRIHTGEKPYICSECGSSFRKHSNLTQHQRIHTGEKPHKCDEC 270 280 290 300 310 320 230 240 250 260 270 280 pF1KB8 GKTFILRKTLNEHQRLHRREKPYKCNECGKAFTSNRNLVDHQRVHTGEKPYKCNECGKTF :::: . .:..:::.: ::::::.:::::: .. .:. :::.:::::::::.::::.: CCDS27 GKTFQTKANLSQHQRIHSGEKPYKCKECGKAFCQSPSLIKHQRIHTGEKPYKCKECGKAF 330 340 350 360 370 380 290 300 310 320 330 pF1KB8 RQTSQVILHLRTHTKEKPYKCSECGKAYRYSSQLIQHQRKHNEEKETS :.. . : : :: :.::::::::::. : ::.:::.:. :: CCDS27 TQSTPLTKHQRIHTGERPYKCSECGKAFIQSICLIRHQRSHTGEKPYKCNECGKGFNQNT 390 400 410 420 430 440 CCDS27 CLTQHMRIHTGEKPYKCKECGKAFAHSSSLTEHHRTHTGEKLYKCSECEKTFRKYAHLSE 450 460 470 480 490 500 >-- initn: 923 init1: 479 opt: 479 Z-score: 336.2 bits: 71.2 E(32554): 2.1e-12 Smith-Waterman score: 494; 61.8% identity (80.0% similar) in 110 aa overlap (50-159:435-544) 20 30 40 50 60 70 pF1KB8 TEGSDQESEKDNSQCCDPATNERVQAEKRQYVCTECGKAFSQSANLTVHERIHTGEKPYK : :.::::.:.:.. :: : :::::::::: CCDS27 RPYKCSECGKAFIQSICLIRHQRSHTGEKPYKCNECGKGFNQNTCLTQHMRIHTGEKPYK 410 420 430 440 450 460 80 90 100 110 120 130 pF1KB8 CKECGKAFSHSSNLVVHRRIHTGLKPYTCSECGKSFSGKSHLIRHQGIHSGEKTYECKEC ::::::::.:::.:. :.: ::: : : :::: :.: .:: .: ::.::: ::: :: CCDS27 CKECGKAFAHSSSLTEHHRTHTGEKLYKCSECEKTFRKYAHLSEHYRIHTGEKPYECIEC 470 480 490 500 510 520 140 150 160 170 180 190 pF1KB8 GKAFSRSSGLISHHRVHTGEKPYSCIECGKAFSRSSNLTQHQRMHRGKKVYKCKECGKTC :: : .:: :. :...:.:. CCDS27 GKFFRHSSVLFRHQKLHSGD 530 540 331 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 09:39:55 2016 done: Sat Nov 5 09:39:55 2016 Total Scan time: 2.190 Total Display time: 0.040 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]