Result of FASTA (omim) for
pF1KB8795
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8795, 331 aa
1>>>pF1KB8795 331 - 331 aa - 331 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6380+/-0.00073; mu= 12.2585+/- 0.045
mean_var=299.8104+/-61.098, 0's: 0 Z-trim(111.9): 2076 B-trim: 106 in 1/51
Lambda= 0.074071
statistics sampled from 18391 (20684) to 18391 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.564), E-opt: 0.2 (0.243), width: 16
Scan time: 6.060
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1348 158.7 2.9e-38
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1348 158.7 2.9e-38
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1348 158.7 3e-38
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1348 158.7 3e-38
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1348 158.7 3e-38
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1348 158.8 3.1e-38
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1348 158.8 3.1e-38
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1348 158.8 3.1e-38
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1348 158.8 3.1e-38
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1348 158.8 3.1e-38
NP_001166303 (OMIM: 612429) zinc finger protein 30 ( 568) 1313 154.9 3.8e-37
NP_443092 (OMIM: 612429) zinc finger protein 300 i ( 604) 1313 154.9 3.9e-37
XP_011536004 (OMIM: 612429) PREDICTED: zinc finger ( 609) 1313 154.9 3.9e-37
NP_001166302 (OMIM: 612429) zinc finger protein 30 ( 620) 1313 155.0 3.9e-37
NP_001291422 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1300 153.5 1e-36
NP_001291423 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1300 153.5 1e-36
NP_666016 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 is ( 643) 1300 153.6 1e-36
NP_001291421 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 643) 1300 153.6 1e-36
NP_694563 (OMIM: 194480) zinc finger protein 3 hom ( 502) 1296 153.0 1.2e-36
XP_011513163 (OMIM: 602277) PREDICTED: zinc finger ( 675) 1292 152.8 1.9e-36
NP_001305822 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 675) 1292 152.8 1.9e-36
NP_001305821 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751) 1292 152.9 2e-36
NP_001305820 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751) 1292 152.9 2e-36
NP_009080 (OMIM: 602277) zinc finger protein 184 i ( 751) 1292 152.9 2e-36
NP_001273627 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 364) 1286 151.7 2.2e-36
NP_001278562 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 665) 1289 152.4 2.4e-36
NP_001265438 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 665) 1289 152.4 2.4e-36
NP_001265437 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 667) 1289 152.5 2.4e-36
NP_001275688 (OMIM: 606740) zinc finger protein 18 ( 691) 1289 152.5 2.5e-36
NP_037388 (OMIM: 606740) zinc finger protein 180 i ( 692) 1289 152.5 2.5e-36
XP_011525582 (OMIM: 606740) PREDICTED: zinc finger ( 734) 1289 152.5 2.5e-36
NP_001273626 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 474) 1286 151.9 2.5e-36
NP_001273625 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 474) 1286 151.9 2.5e-36
NP_001309189 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 474) 1286 151.9 2.5e-36
XP_006717342 (OMIM: 194552) PREDICTED: zinc finger ( 474) 1286 151.9 2.5e-36
NP_009066 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 is ( 498) 1286 151.9 2.6e-36
NP_001265592 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 574) 1284 151.8 3.2e-36
NP_001265607 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 574) 1284 151.8 3.2e-36
XP_011526750 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 574) 1284 151.8 3.2e-36
XP_016883007 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 586) 1284 151.8 3.3e-36
NP_001265593 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 586) 1284 151.8 3.3e-36
XP_016883008 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 586) 1284 151.8 3.3e-36
XP_016883006 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 607) 1284 151.8 3.3e-36
XP_016883005 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 1284 151.9 3.4e-36
XP_016883004 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 1284 151.9 3.4e-36
NP_001265606 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 618) 1284 151.9 3.4e-36
NP_001265590 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 618) 1284 151.9 3.4e-36
NP_001265591 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 618) 1284 151.9 3.4e-36
XP_016883003 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 1284 151.9 3.4e-36
XP_011526746 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 1284 151.9 3.4e-36
>>NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 is (616 aa)
initn: 1348 init1: 1348 opt: 1348 Z-score: 807.9 bits: 158.7 E(85289): 2.9e-38
Smith-Waterman score: 1348; 60.9% identity (83.7% similar) in 289 aa overlap (40-328:274-562)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 HKTVKDNKVLTEGSDQESEKDNSQCCDPATNERVQAEKRQYVCTECGKAFSQSANLTVHE
.::... .. : :.:::::: :: .:: :
NP_001 IQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHL
250 260 270 280 290 300
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 RIHTGEKPYKCKECGKAFSHSSNLVVHRRIHTGLKPYTCSECGKSFSGKSHLIRHQGIHS
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NP_001 RIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHT
310 320 330 340 350 360
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 GEKTYECKECGKAFSRSSGLISHHRVHTGEKPYSCIECGKAFSRSSNLTQHQRMHRGKKV
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NP_001 GEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKP
370 380 390 400 410 420
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 YKCKECGKTCGSNTKIMDHQRIHTGEKPYECDECGKTFILRKTLNEHQRLHRREKPYKCN
:.:..:::. ..:.. .:::::::::::::..:::.: ..:..:::.: ::::.::
NP_001 YECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECN
430 440 450 460 470 480
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 ECGKAFTSNRNLVDHQRVHTGEKPYKCNECGKTFRQTSQVILHLRTHTKEKPYKCSECGK
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NP_001 QCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGK
490 500 510 520 530 540
310 320 330
pF1KB8 AYRYSSQLIQHQRKHNEEKETS
.. .::.: ::.: :. ::
NP_001 SFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTH
550 560 570 580 590 600
>--
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Smith-Waterman score: 500; 47.9% identity (74.3% similar) in 144 aa overlap (36-179:130-273)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 RNFKHKTVKDNKVLTEGSDQESEKDNSQCCDPATNERVQAEKRQYVCTECGKAFSQSANL
.: .. .. .:: : .. .. .:
NP_001 SLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDL
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70 80 90 100 110 120
pF1KB8 TVHERIHTGEKPYKCKECGKAFSHSSNLVVHRRIHTGLKPYTCSECGKSFSGKSHLIRHQ
.: .. . ::::::.:::::::::: :. :.: ::: .:: : :: :.: ..: : .::
NP_001 NVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQ
160 170 180 190 200 210
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 GIHSGEKTYECKECGKAFSRSSGLISHHRVHTGEKPYSCIECGKAFSRSSNLTQHQRMHR
::.::: :.: .::..:.. . ::.:.:.::::::: : ::::.:: :...:
NP_001 RIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHT
220 230 240 250 260 270
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 GKKVYKCKECGKTCGSNTKIMDHQRIHTGEKPYECDECGKTFILRKTLNEHQRLHRREKP
NP_001 GEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKP
280 290 300 310 320 330
>>XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro (621 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB8 HKTVKDNKVLTEGSDQESEKDNSQCCDPATNERVQAEKRQYVCTECGKAFSQSANLTVHE
.::... .. : :.:::::: :: .:: :
XP_016 IQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHL
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pF1KB8 RIHTGEKPYKCKECGKAFSHSSNLVVHRRIHTGLKPYTCSECGKSFSGKSHLIRHQGIHS
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XP_016 RIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHT
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130 140 150 160 170 180
pF1KB8 GEKTYECKECGKAFSRSSGLISHHRVHTGEKPYSCIECGKAFSRSSNLTQHQRMHRGKKV
::: ::: :::::::.:. : :.:.:::::::.: ::::.::.::.:.::.: : :.:
XP_016 GEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKP
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190 200 210 220 230 240
pF1KB8 YKCKECGKTCGSNTKIMDHQRIHTGEKPYECDECGKTFILRKTLNEHQRLHRREKPYKCN
:.:..:::. ..:.. .:::::::::::::..:::.: ..:..:::.: ::::.::
XP_016 YECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECN
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250 260 270 280 290 300
pF1KB8 ECGKAFTSNRNLVDHQRVHTGEKPYKCNECGKTFRQTSQVILHLRTHTKEKPYKCSECGK
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XP_016 QCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGK
490 500 510 520 530 540
310 320 330
pF1KB8 AYRYSSQLIQHQRKHNEEKETS
.. .::.: ::.: :. ::
XP_016 SFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTH
550 560 570 580 590 600
>--
initn: 1291 init1: 495 opt: 500 Z-score: 318.1 bits: 68.1 E(85289): 5.6e-11
Smith-Waterman score: 500; 47.9% identity (74.3% similar) in 144 aa overlap (36-179:135-278)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 RNFKHKTVKDNKVLTEGSDQESEKDNSQCCDPATNERVQAEKRQYVCTECGKAFSQSANL
.: .. .. .:: : .. .. .:
XP_016 SLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDL
110 120 130 140 150 160
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 TVHERIHTGEKPYKCKECGKAFSHSSNLVVHRRIHTGLKPYTCSECGKSFSGKSHLIRHQ
.: .. . ::::::.:::::::::: :. :.: ::: .:: : :: :.: ..: : .::
XP_016 NVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQ
170 180 190 200 210 220
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 GIHSGEKTYECKECGKAFSRSSGLISHHRVHTGEKPYSCIECGKAFSRSSNLTQHQRMHR
::.::: :.: .::..:.. . ::.:.:.::::::: : ::::.:: :...:
XP_016 RIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHT
230 240 250 260 270 280
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 GKKVYKCKECGKTCGSNTKIMDHQRIHTGEKPYECDECGKTFILRKTLNEHQRLHRREKP
XP_016 GEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKP
290 300 310 320 330 340
>>XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro (628 aa)
initn: 1348 init1: 1348 opt: 1348 Z-score: 807.8 bits: 158.7 E(85289): 3e-38
Smith-Waterman score: 1348; 60.9% identity (83.7% similar) in 289 aa overlap (40-328:286-574)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 HKTVKDNKVLTEGSDQESEKDNSQCCDPATNERVQAEKRQYVCTECGKAFSQSANLTVHE
.::... .. : :.:::::: :: .:: :
XP_016 IQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHL
260 270 280 290 300 310
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 RIHTGEKPYKCKECGKAFSHSSNLVVHRRIHTGLKPYTCSECGKSFSGKSHLIRHQGIHS
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XP_016 RIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRTHT
320 330 340 350 360 370
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 GEKTYECKECGKAFSRSSGLISHHRVHTGEKPYSCIECGKAFSRSSNLTQHQRMHRGKKV
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XP_016 GEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKP
380 390 400 410 420 430
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 YKCKECGKTCGSNTKIMDHQRIHTGEKPYECDECGKTFILRKTLNEHQRLHRREKPYKCN
:.:..:::. ..:.. .:::::::::::::..:::.: ..:..:::.: ::::.::
XP_016 YECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECN
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XP_016 QCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGK
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pF1KB8 AYRYSSQLIQHQRKHNEEKETS
.. .::.: ::.: :. ::
XP_016 SFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTH
560 570 580 590 600 610
>--
initn: 1352 init1: 495 opt: 500 Z-score: 318.0 bits: 68.1 E(85289): 5.6e-11
Smith-Waterman score: 500; 47.9% identity (74.3% similar) in 144 aa overlap (36-179:142-285)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 RNFKHKTVKDNKVLTEGSDQESEKDNSQCCDPATNERVQAEKRQYVCTECGKAFSQSANL
.: .. .. .:: : .. .. .:
XP_016 SLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDL
120 130 140 150 160 170
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 TVHERIHTGEKPYKCKECGKAFSHSSNLVVHRRIHTGLKPYTCSECGKSFSGKSHLIRHQ
.: .. . ::::::.:::::::::: :. :.: ::: .:: : :: :.: ..: : .::
XP_016 NVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQ
180 190 200 210 220 230
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 GIHSGEKTYECKECGKAFSRSSGLISHHRVHTGEKPYSCIECGKAFSRSSNLTQHQRMHR
::.::: :.: .::..:.. . ::.:.:.::::::: : ::::.:: :...:
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pF1KB8 YKCKECGKTCGSNTKIMDHQRIHTGEKPYECDECGKTFILRKTLNEHQRLHRREKPYKCN
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NP_003 SFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTH
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pF1KB8 RNFKHKTVKDNKVLTEGSDQESEKDNSQCCDPATNERVQAEKRQYVCTECGKAFSQSANL
.: .. .. .:: : .. .. .:
NP_003 SLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDL
160 170 180 190 200 210
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 TVHERIHTGEKPYKCKECGKAFSHSSNLVVHRRIHTGLKPYTCSECGKSFSGKSHLIRHQ
.: .. . ::::::.:::::::::: :. :.: ::: .:: : :: :.: ..: : .::
NP_003 NVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQ
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pF1KB8 GIHSGEKTYECKECGKAFSRSSGLISHHRVHTGEKPYSCIECGKAFSRSSNLTQHQRMHR
::.::: :.: .::..:.. . ::.:.:.::::::: : ::::.:: :...:
NP_003 RIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHT
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NP_003 GEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKP
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10 20 30 40 50 60
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.::... .. : :.:::::: :: .:: :
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::: ::: :::::::.:. : :.:.:::::::.: ::::.::.::.:.::.: : :.:
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pF1KB8 AYRYSSQLIQHQRKHNEEKETS
.. .::.: ::.: :. ::
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>--
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Smith-Waterman score: 500; 47.9% identity (74.3% similar) in 144 aa overlap (36-179:184-327)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 RNFKHKTVKDNKVLTEGSDQESEKDNSQCCDPATNERVQAEKRQYVCTECGKAFSQSANL
.: .. .. .:: : .. .. .:
XP_006 SLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDL
160 170 180 190 200 210
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 TVHERIHTGEKPYKCKECGKAFSHSSNLVVHRRIHTGLKPYTCSECGKSFSGKSHLIRHQ
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XP_006 NVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQ
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pF1KB8 GIHSGEKTYECKECGKAFSRSSGLISHHRVHTGEKPYSCIECGKAFSRSSNLTQHQRMHR
::.::: :.: .::..:.. . ::.:.:.::::::: : ::::.:: :...:
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pF1KB8 GKKVYKCKECGKTCGSNTKIMDHQRIHTGEKPYECDECGKTFILRKTLNEHQRLHRREKP
XP_006 GEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKP
340 350 360 370 380 390
>>NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 isofo (682 aa)
initn: 1348 init1: 1348 opt: 1348 Z-score: 807.5 bits: 158.8 E(85289): 3.1e-38
Smith-Waterman score: 1348; 60.9% identity (83.7% similar) in 289 aa overlap (40-328:340-628)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 HKTVKDNKVLTEGSDQESEKDNSQCCDPATNERVQAEKRQYVCTECGKAFSQSANLTVHE
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NP_009 IQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHL
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::: ::: :::::::.:. : :.:.:::::::.: ::::.::.::.:.::.: : :.:
NP_009 GEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGEKP
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pF1KB8 YKCKECGKTCGSNTKIMDHQRIHTGEKPYECDECGKTFILRKTLNEHQRLHRREKPYKCN
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pF1KB8 ECGKAFTSNRNLVDHQRVHTGEKPYKCNECGKTFRQTSQVILHLRTHTKEKPYKCSECGK
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NP_009 QCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGK
550 560 570 580 590 600
310 320 330
pF1KB8 AYRYSSQLIQHQRKHNEEKETS
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NP_009 SFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTH
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>--
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pF1KB8 RNFKHKTVKDNKVLTEGSDQESEKDNSQCCDPATNERVQAEKRQYVCTECGKAFSQSANL
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NP_009 SLAVPVAFTPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDL
170 180 190 200 210 220
70 80 90 100 110 120
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NP_009 NVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQ
230 240 250 260 270 280
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 GIHSGEKTYECKECGKAFSRSSGLISHHRVHTGEKPYSCIECGKAFSRSSNLTQHQRMHR
::.::: :.: .::..:.. . ::.:.:.::::::: : ::::.:: :...:
NP_009 RIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHT
290 300 310 320 330 340
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 GKKVYKCKECGKTCGSNTKIMDHQRIHTGEKPYECDECGKTFILRKTLNEHQRLHRREKP
NP_009 GEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKP
350 360 370 380 390 400
331 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]