Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8804
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8804, 350 aa
1>>>pF1KB8804 350 - 350 aa - 350 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2995+/-0.00136; mu= 16.2952+/- 0.080
mean_var=112.7200+/-31.699, 0's: 0 Z-trim(100.9): 290 B-trim: 893 in 2/46
Lambda= 0.120802
statistics sampled from 5863 (6291) to 5863 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.531), E-opt: 0.2 (0.193), width: 16
Scan time: 2.390
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 841 158.5 8.5e-39
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 837 157.8 1.4e-38
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 830 156.5 3.1e-38
CCDS2735.1 CXCR6 gene_id:10663|Hs108|chr3 ( 342) 722 137.7 1.4e-32
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CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 656 126.2 4.1e-29
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CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 655 126.1 5.2e-29
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 653 125.7 5.9e-29
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CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 623 120.4 2.2e-27
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 623 120.5 2.3e-27
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 611 118.4 9.9e-27
CCDS2736.1 XCR1 gene_id:2829|Hs108|chr3 ( 333) 487 96.7 2.9e-20
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 458 91.7 1e-18
CCDS43079.1 CCRL2 gene_id:9034|Hs108|chr3 ( 344) 448 89.9 3.3e-18
CCDS46814.1 CCRL2 gene_id:9034|Hs108|chr3 ( 356) 448 89.9 3.4e-18
CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1 ( 361) 437 88.0 1.3e-17
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 434 87.5 1.9e-17
CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19 ( 350) 433 87.3 2.1e-17
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 430 86.8 3e-17
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 430 86.9 3.2e-17
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 430 86.9 3.2e-17
CCDS8927.1 GPR182 gene_id:11318|Hs108|chr12 ( 404) 418 84.8 1.4e-16
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 416 84.4 1.7e-16
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 409 83.2 3.8e-16
CCDS5322.1 GPER1 gene_id:2852|Hs108|chr7 ( 375) 408 83.0 4.4e-16
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CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 399 81.4 1.3e-15
CCDS58959.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 352) 390 79.8 3.7e-15
CCDS4031.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 374) 390 79.9 3.9e-15
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 389 79.7 4.5e-15
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 388 79.5 4.9e-15
CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8 ( 328) 377 77.5 1.7e-14
CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13 ( 337) 374 77.0 2.5e-14
CCDS9626.1 LTB4R gene_id:1241|Hs108|chr14 ( 352) 374 77.0 2.6e-14
>>CCDS3075.1 ACKR4 gene_id:51554|Hs108|chr3 (350 aa)
initn: 2317 init1: 2317 opt: 2317 Z-score: 2200.6 bits: 415.7 E(32554): 3e-116
Smith-Waterman score: 2317; 100.0% identity (100.0% similar) in 350 aa overlap (1-350:1-350)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MALEQNQSTDYYYEENEMNGTYDYSQYELICIKEDVREFAKVFLPVFLTIVFVIGLAGNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MALEQNQSTDYYYEENEMNGTYDYSQYELICIKEDVREFAKVFLPVFLTIVFVIGLAGNS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 MVVAIYAYYKKQRTKTDVYILNLAVADLLLLFTLPFWAVNAVHGWVLGKIMCKITSALYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MVVAIYAYYKKQRTKTDVYILNLAVADLLLLFTLPFWAVNAVHGWVLGKIMCKITSALYT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 LNFVSGMQFLACISIDRYVAVTKVPSQSGVGKPCWIICFCVWMAAILLSIPQLVFYTVND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LNFVSGMQFLACISIDRYVAVTKVPSQSGVGKPCWIICFCVWMAAILLSIPQLVFYTVND
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 NARCIPIFPRYLGTSMKALIQMLEICIGFVVPFLIMGVCYFITARTLMKMPNIKISRPLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 NARCIPIFPRYLGTSMKALIQMLEICIGFVVPFLIMGVCYFITARTLMKMPNIKISRPLK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 VLLTVVIVFIVTQLPYNIVKFCRAIDIIYSLITSCNMSKRMDIAIQVTESIALFHSCLNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VLLTVVIVFIVTQLPYNIVKFCRAIDIIYSLITSCNMSKRMDIAIQVTESIALFHSCLNP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB8 ILYVFMGASFKNYVMKVAKKYGSWRRQRQSVEEFPFDSEGPTEPTSTFSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ILYVFMGASFKNYVMKVAKKYGSWRRQRQSVEEFPFDSEGPTEPTSTFSI
310 320 330 340 350
>>CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 (372 aa)
initn: 810 init1: 456 opt: 841 Z-score: 810.1 bits: 158.5 E(32554): 8.4e-39
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10 20 30 40
pF1KB8 MALEQNQSTDYYYEENEMNGTYDYSQYELICIKEDVREFAKVFLPV
: :.. :: : .: : ::. .: .: :.:::.: :::.
CCDS77 MKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNT---TVDYTLFESLCSKKDVRNFKAWFLPI
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 FLTIVFVIGLAGNSMVVAIYAYYKKQRTKTDVYILNLAVADLLLLFTLPFWAVNAVHGWV
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CCDS77 MYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYSAAKSWV
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110 120 130 140 150 160
pF1KB8 LGKIMCKITSALYTLNFVSGMQFLACISIDRYVAVTKVPS----QSGVGKPCWIICFCVW
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CCDS77 FGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIW
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 MAAILLSIPQLVFYTVNDNARCIPIFPRYLGTSMKALI--QMLEICIGFVVPFLIMGVCY
. : .::::.:.. .. .. . . ..:.: :. .. :::.::.: :. ::
CCDS77 ILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRCSLITEHVEAFITIQVAQMVIGFLVPLLAMSFCY
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 FITARTLMKMPNIKISRPLKVLLTVVIVFIVTQLPYNIVKFCRAIDIIYSLITSCNMSKR
.. :::.. :.. .. .::...::.:::: ::::: : . ... . ..:..::.
CCDS77 LVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSTCELSKQ
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KB8 MDIAIQVTESIALFHSCLNPILYVFMGASFKNYVMKVAKKYG--SWRRQRQ--SVEEFPF
..:: .:: :.: . :.::.::.:.:..:.: ..:. : : : .. :: : ...
CCDS77 LNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQLRQWSSCRHIRR
300 310 320 330 340 350
340 350
pF1KB8 DSEG-PTEPTSTFSI
.: . .: :.:::
CCDS77 SSMSVEAETTTTFSP
360 370
>>CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 (378 aa)
initn: 810 init1: 456 opt: 841 Z-score: 810.0 bits: 158.5 E(32554): 8.5e-39
Smith-Waterman score: 845; 39.4% identity (69.8% similar) in 358 aa overlap (3-349:23-377)
10 20 30 40
pF1KB8 MALEQNQSTDYYYEENEMNGTYDYSQYELICIKEDVREFA
: :.. :: : .: : ::. .: .: :.:::.:
CCDS11 MDLGKPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNT---TVDYTLFESLCSKKDVRNFK
10 20 30 40 50
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pF1KB8 KVFLPVFLTIVFVIGLAGNSMVVAIYAYYKKQRTKTDVYILNLAVADLLLLFTLPFWAVN
:::.. .:. .:: ::..:: : :.:. .: ::.:.:::::::.:.:.:::::: .
CCDS11 AWFLPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYS
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110 120 130 140 150
pF1KB8 AVHGWVLGKIMCKITSALYTLNFVSGMQFLACISIDRYVAVTKVPS----QSGVGKPCWI
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CCDS11 AAKSWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKL
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 ICFCVWMAAILLSIPQLVFYTVNDNARCIPIFPRYLGTSMKALI--QMLEICIGFVVPFL
: .:. : .::::.:.. .. .. . . ..:.: :. .. :::.::.:
CCDS11 SCVGIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRCSLITEHVEAFITIQVAQMVIGFLVPLL
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 IMGVCYFITARTLMKMPNIKISRPLKVLLTVVIVFIVTQLPYNIVKFCRAIDIIYSLITS
:. ::.. :::.. :.. .. .::...::.:::: ::::: : . ... . ..
CCDS11 AMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSST
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 CNMSKRMDIAIQVTESIALFHSCLNPILYVFMGASFKNYVMKVAKKYG--SWRRQRQ--S
:..::...:: .:: :.: . :.::.::.:.:..:.: ..:. : : : .. :: :
CCDS11 CELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQLRQWSS
300 310 320 330 340 350
340 350
pF1KB8 VEEFPFDSEG-PTEPTSTFSI
... .: . .: :.:::
CCDS11 CRHIRRSSMSVEAETTTTFSP
360 370
>>CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 (369 aa)
initn: 808 init1: 380 opt: 837 Z-score: 806.3 bits: 157.8 E(32554): 1.4e-38
Smith-Waterman score: 837; 36.6% identity (68.9% similar) in 325 aa overlap (6-322:12-336)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MALEQNQSTDYYYEE-NEMNGTYDYSQYELICIKEDVREFAKVFLPVFLTIVFV
:.. :: : . :. ... .. : :..::.::. ::: . .::.
CCDS27 MTPTDFTSPIPNMADDYGSESTSSMEDYVNFNFTDFYCEKNNVRQFASHFLPPLYWLVFI
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pF1KB8 IGLAGNSMVVAIYAYYKKQRTKTDVYILNLAVADLLLLFTLPFWAVNAVHGWVLGKIMCK
.: :::.:. .: : . .: ::...::::.::::.: ::::::. :. : . .:::
CCDS27 VGALGNSLVILVYWYCTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWAIAAADQWKFQTFMCK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KB8 ITSALYTLNFVSGMQFLACISIDRYVAVTKVPSQSGVGKP----CWIICFCVWMAAILLS
.....: .:: : . .. :::.:::.:.... . ..:: .:. : :
CCDS27 VVNSMYKMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIAQAMRAHTWREKRLLYSKMVCFTIWVLAAALC
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 IPQLVFYTVNDN---ARCIPIFPRYLGTSMKALIQMLEICIGFVVPFLIMGVCYFITART
::.... .... : : ..: .:..:. . :.. .:: .::..:. :: : .:
CCDS27 IPEILYSQIKEESGIAICTMVYPSDESTKLKSAVLTLKVILGFFLPFVVMACCYTIIIHT
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 LMKMPNIKISRPLKVLLTVVIVFIVTQLPYNIVKFCRAIDIIYSLITSCNMSKRMDIAIQ
:.. . . . ::: .::. ::...:.::: . . ..:: .:..: .: .:: .:
CCDS27 LIQAKKSSKHKALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYAMFISNCAVSTNIDICFQ
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 VTESIALFHSCLNPILYVFMGASFKNYVMKVAKKYGSWRRQRQSVEEFPFDSEGPTEPTS
::..::.:::::::.::::.: :. ..:. :. :
CCDS27 VTQTIAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLVKTLKNLGCISQAQWVSFTRREGSLKLSSMLL
310 320 330 340 350 360
350
pF1KB8 TFSI
CCDS27 ETTSGALSL
>>CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 (357 aa)
initn: 808 init1: 380 opt: 830 Z-score: 799.9 bits: 156.5 E(32554): 3.1e-38
Smith-Waterman score: 830; 36.8% identity (68.8% similar) in 321 aa overlap (10-322:4-324)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MALEQNQSTDYYYEE-NEMNGTYDYSQYELICIKEDVREFAKVFLPVFLTIVFVIGLAGN
:: : . :. ... .. : :..::.::. ::: . .::..: ::
CCDS27 MADDYGSESTSSMEDYVNFNFTDFYCEKNNVRQFASHFLPPLYWLVFIVGALGN
10 20 30 40 50
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pF1KB8 SMVVAIYAYYKKQRTKTDVYILNLAVADLLLLFTLPFWAVNAVHGWVLGKIMCKITSALY
:.:. .: : . .: ::...::::.::::.: ::::::. :. : . .:::.....:
CCDS27 SLVILVYWYCTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWAIAAADQWKFQTFMCKVVNSMY
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pF1KB8 TLNFVSGMQFLACISIDRYVAVTKVPSQSGVGKP----CWIICFCVWMAAILLSIPQLVF
.:: : . .. :::.:::.:.... . ..:: .:. : : ::....
CCDS27 KMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIAQAMRAHTWREKRLLYSKMVCFTIWVLAAALCIPEILY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 YTVNDN---ARCIPIFPRYLGTSMKALIQMLEICIGFVVPFLIMGVCYFITARTLMKMPN
.... : : ..: .:..:. . :.. .:: .::..:. :: : .::.. .
CCDS27 SQIKEESGIAICTMVYPSDESTKLKSAVLTLKVILGFFLPFVVMACCYTIIIHTLIQAKK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 IKISRPLKVLLTVVIVFIVTQLPYNIVKFCRAIDIIYSLITSCNMSKRMDIAIQVTESIA
. . ::: .::. ::...:.::: . . ..:: .:..: .: .:: .:::..::
CCDS27 SSKHKALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYAMFISNCAVSTNIDICFQVTQTIA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 LFHSCLNPILYVFMGASFKNYVMKVAKKYGSWRRQRQSVEEFPFDSEGPTEPTSTFSI
.:::::::.::::.: :. ..:. :. :
CCDS27 FFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLVKTLKNLGCISQAQWVSFTRREGSLKLSSMLLETTSGA
300 310 320 330 340 350
>>CCDS2735.1 CXCR6 gene_id:10663|Hs108|chr3 (342 aa)
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10 20 30 40 50 60
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:.:. ... : :: : ..: .:.::::: . .::: ::.:::
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10 20 30 40 50
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.:: ..: .:.::..::...:.:. . .. . . : . . .:. ..:.:.::...
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180 190 200 210 220 230
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.: . . : : ...... .. .:: .:.: : ::: . .::.. ...
CCDS27 NVFNLDKLIC---GYHDEAISTVVLATQMTLGFFLPLLTMIVCYSVIIKTLLHAGGFQKH
180 190 200 210 220
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: ::... :. ::..::.:.:..:: :. : .:: ... :.:::.:: ...
CCDS27 RSLKIIFLVMAVFLLTQMPFNLMKFIRSTHWEYYAMTSFHYT------IMVTEAIAYLRA
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::::.::.:.. .:.. :..: : .: .: :. :.. .: :: :.
CCDS27 CLNPVLYAFVSLKFRKNFWKLVKDIGCLPYLGVSHQWKSSEDNSKTFSASHNVEATSMFQ
290 300 310 320 330 340
350
pF1KB8 I
.
CCDS27 L
>>CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 (360 aa)
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10 20 30 40 50 60
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: .:. ... : : . : :: .. :...::: . ..:::.:: :::
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pF1KB8 MVVAIYAYYKKQRTKTDVYILNLAVADLLLLFTLPFWAVNAVHGWVLGKIMCKITSALYT
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CCDS26 VGFYSGIFFVMLMSIDRYLAIVHAVFSLRARTLTYGVITSLATWSVAVFASLPGFLFSTC
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:: ... : . :... ... ::: : :.:.:. :: :: . :::.. : :
CCDS26 YTERNHTYCKTKYS--LNSTTWKVLSSLEINILGLVIPLGIMLFCYSMIIRTLQHCKNEK
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.. .:....::..:. ::::: : ... . .. .:.. . .: :::.::..:.
CCDS26 KNKAVKMIFAVVVLFLGFWTPYNIVLFLETL-VELEVLQDCTFERYLDYAIQATETLAFV
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pF1KB8 HSCLNPILYVFMGASFKNYVMKVAKKYGSWRRQRQSVEEFPFDSEGPTEPTSTFSI
: :::::.: :.: .:..:.... :
CCDS26 HCCLNPIIYFFLGEKFRKYILQLFKTCRGLFVLCQYCGLLQIYSADTPSSSYTQSTMDHD
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>>CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 (360 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB8 MALEQNQSTDYYYEENEMNGTYDYSQYELI-----CIKEDVREFAKVFLPVFLTIVF
.:... :.. :. : .:. . .. : :.. :. : :. .. ..::
CCDS24 MEDFNMESDSFEDFWKGEDLSNYSYSSTLPPFLLDAAPCEPESL-EINKYFVVIIYALVF
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pF1KB8 VIGLAGNSMVVAIYAYYKKQRTKTDVYILNLAVADLLLLFTLPFWAVNAVHGWVLGKIMC
...: :::.:. . : . :. ::::.::::.::::. .:::.::.. :.::..: ..:
CCDS24 LLSLLGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNGWIFGTFLC
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pF1KB8 KITSALYTLNFVSGMQFLACISIDRYVAVTKVPSQSGVGKPCWI--ICFCVWMAAILLSI
:..: : .:: ::. .:::::.:::.:.... ... . : . ::. .: ..::..
CCDS24 KVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHA-TRTLTQKRYLVKFICLSIWGLSLLLAL
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pF1KB8 PQLVFYTVNDNARCIPIFPRYLGTSM---KALIQMLEICIGFVVPFLIMGVCYFITARTL
: :.: . .. : . .:.. . :...: .::.::.::: :: .: :::
CCDS24 PVLLFRRTVYSSNVSPACYEDMGNNTANWRMLLRILPQSFGFIVPLLIMLFCYGFTLRTL
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.: . : ..:...::..:.. ::::.: . .. . .:. ...: :...
CCDS24 FKAHMGQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQETCERRNHIDRALDA
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:: ....::::::..:.:.: .:.. ..:. .: .. ..: : .: : :
CCDS24 TEILGILHSCLNPLIYAFIGQKFRHGLLKILAIHGLISKDSLPKDSRPSFVGSSSGHTST
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350
pF1KB8 TSTFSI
:
CCDS24 TL
360
>>CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 (387 aa)
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pF1KB8 MALEQNQSTDYYYEENEMNGTYDYSQYELICIKEDVR
. : . : : ..:.. : :.
CCDS54 REPLEAFKLADLDFRKSSLASGWRMASGAFTMDQFPESVTEN--FEYDDLAEACYIGDIV
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CCDS54 VFGTVFLSIFYSVIFAIGLVGNLLVVFALTNSKKPKSVTDIYLLNLALSDLLFVATLPFW
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. .. : . :::.:.:.. ..: ... :.. ::::::.:.. . ..: ..
CCDS54 THYLINEKGLHNAMCKFTTAFFFIGFFGSIFFITVISIDRYLAIV-LAANSMNNRTVQHG
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pF1KB8 -IICFCVWMAAILLSIPQLVFYTVNDNARCIPIFPRYLGTSMKALIQMLEICIGFVVPFL
: . :: ::::.. ::..: ..: .:. .:. : .: .. .::..:.:
CCDS54 VTISLGVWAAAILVAAPQFMFTKQKEN-ECLGDYPEVLQEIWPVLRNVETNFLGFLLPLL
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pF1KB8 IMGVCYFITARTLMKMPNIKISRPLKVLLTVVIVFIVTQLPYNIVKFCRAIDIIYSLITS
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CCDS54 IMSYCYFRIIQTLFSCKNHKKAKAIKLILLVVIVFFLFWTPYNVMIFLETLKL-YDFFPS
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pF1KB8 CNMSKRMDIAIQVTESIALFHSCLNPILYVFMGASFKNYVMKVAKKYGSWRRQRQSVEEF
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CCDS54 CDMRKDLRLALSVTETVAFSHCCLNPLIYAFAGEKFRRYLYHLYGKCLAVLCGRSVHVDF
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340 350
pF1KB8 PFDSEGPTEPTSTFSI
CCDS54 SSSESQRSRHGSVLSSNFTYHTSDGDALLLL
360 370 380
>>CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 (355 aa)
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Smith-Waterman score: 684; 36.1% identity (69.2% similar) in 302 aa overlap (22-320:12-310)
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pF1KB8 MALEQNQSTDYYYEENEMNGTYDYSQYELICIKEDVREFAKVFLPVFLTIVFVIGLAGNS
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CCDS43 MDQFPESVTENFEYDDLAEACYIGDIVVFGTVFLSIFYSVIFAIGLVGNL
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CCDS43 LVVFALTNSKKPKSVTDIYLLNLALSDLLFVATLPFWTHYLINEKGLHNAMCKFTTAFFF
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pF1KB8 LNFVSGMQFLACISIDRYVAVTKVPSQSGVGKPCW---IICFCVWMAAILLSIPQLVFYT
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CCDS43 IGFFGSIFFITVISIDRYLAIV-LAANSMNNRTVQHGVTISLGVWAAAILVAAPQFMFTK
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pF1KB8 VNDNARCIPIFPRYLGTSMKALIQMLEICIGFVVPFLIMGVCYFITARTLMKMPNIKISR
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CCDS43 QKEN-ECLGDYPEVLQEIWPVLRNVETNFLGFLLPLLIMSYCYFRIIQTLFSCKNHKKAK
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pF1KB8 PLKVLLTVVIVFIVTQLPYNIVKFCRAIDIIYSLITSCNMSKRMDIAIQVTESIALFHSC
.:..: :::::.. :::.. : ... . :... ::.: : . .:..:::..:. : :
CCDS43 AIKLILLVVIVFFLFWTPYNVMIFLETLKL-YDFFPSCDMRKDLRLALSVTETVAFSHCC
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pF1KB8 LNPILYVFMGASFKNYVMKVAKKYGSWRRQRQSVEEFPFDSEGPTEPTSTFSI
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CCDS43 LNPLIYAFAGEKFRRYLYHLYGKCLAVLCGRSVHVDFSSSESQRSRHGSVLSSNFTYHTS
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]