Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8823
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8823, 404 aa
1>>>pF1KB8823 404 - 404 aa - 404 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9061+/-0.000832; mu= 15.0028+/- 0.050
mean_var=131.2206+/-34.189, 0's: 0 Z-trim(109.9): 227 B-trim: 1265 in 2/50
Lambda= 0.111963
statistics sampled from 10867 (11211) to 10867 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.691), E-opt: 0.2 (0.344), width: 16
Scan time: 2.540
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8927.1 GPR182 gene_id:11318|Hs108|chr12 ( 404) 2785 461.4 6.8e-130
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 695 123.7 2.7e-28
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 ( 384) 592 107.1 2.8e-23
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 526 96.4 4.3e-20
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 521 95.6 7.7e-20
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 521 95.7 8.1e-20
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 521 95.7 8.2e-20
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 489 90.5 2.8e-18
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 479 88.8 8.4e-18
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 478 88.7 9.3e-18
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 471 87.6 2.1e-17
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 470 87.4 2.3e-17
CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 352) 463 86.3 5e-17
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 458 85.5 8.9e-17
CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 356) 457 85.3 9.9e-17
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 456 85.1 1.1e-16
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 450 84.2 2.2e-16
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 442 82.9 5.4e-16
CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14 ( 353) 439 82.4 7.4e-16
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 439 82.4 7.6e-16
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 438 82.2 8.3e-16
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 438 82.3 8.6e-16
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 435 81.8 1.2e-15
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 435 81.8 1.2e-15
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 433 81.4 1.5e-15
CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 355) 429 80.8 2.3e-15
CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 387) 429 80.8 2.4e-15
CCDS8220.1 P2RY6 gene_id:5031|Hs108|chr11 ( 328) 424 79.9 3.8e-15
CCDS3075.1 ACKR4 gene_id:51554|Hs108|chr3 ( 350) 418 79.0 7.7e-15
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 417 78.8 8.8e-15
CCDS14442.1 P2RY10 gene_id:27334|Hs108|chrX ( 339) 415 78.5 1.1e-14
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 415 78.5 1.1e-14
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 415 78.6 1.2e-14
CCDS12669.1 GPR4 gene_id:2828|Hs108|chr19 ( 362) 414 78.4 1.2e-14
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 412 78.0 1.5e-14
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 412 78.0 1.5e-14
CCDS9894.2 GPR68 gene_id:8111|Hs108|chr14 ( 365) 412 78.0 1.5e-14
CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1 ( 361) 403 76.6 4.2e-14
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 399 75.9 6.7e-14
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 398 75.8 7.7e-14
CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 360) 389 74.3 2e-13
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 389 74.3 2e-13
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 ( 391) 389 74.4 2.1e-13
CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3 ( 360) 388 74.2 2.3e-13
CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 374) 388 74.2 2.3e-13
CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8 ( 328) 387 73.9 2.4e-13
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 387 74.0 2.7e-13
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 386 73.9 3.1e-13
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 384 73.5 3.5e-13
CCDS2735.1 CXCR6 gene_id:10663|Hs108|chr3 ( 342) 382 73.2 4.3e-13
>>CCDS8927.1 GPR182 gene_id:11318|Hs108|chr12 (404 aa)
initn: 2785 init1: 2785 opt: 2785 Z-score: 2445.5 bits: 461.4 E(32554): 6.8e-130
Smith-Waterman score: 2785; 100.0% identity (100.0% similar) in 404 aa overlap (1-404:1-404)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSVKPSWGPGPSEGVTAVPTSDLGEIHNWTELLDLFNHTLSECHVELSQSTKRVVLFALY
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CCDS89 MSVKPSWGPGPSEGVTAVPTSDLGEIHNWTELLDLFNHTLSECHVELSQSTKRVVLFALY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 LAMFVVGLVENLLVICVNWRGSGRAGLMNLYILNMAIADLGIVLSLPVWMLEVTLDYTWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 LAMFVVGLVENLLVICVNWRGSGRAGLMNLYILNMAIADLGIVLSLPVWMLEVTLDYTWL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 WGSFSCRFTHYFYFVNMYSSIFFLVCLSVDRYVTLTSASPSWQRYQHRVRRAMCAGIWVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 WGSFSCRFTHYFYFVNMYSSIFFLVCLSVDRYVTLTSASPSWQRYQHRVRRAMCAGIWVL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 SAIIPLPEVVHIQLVEGPEPMCLFMAPFETYSTWALAVALSTTILGFLLPFPLITVFNVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 SAIIPLPEVVHIQLVEGPEPMCLFMAPFETYSTWALAVALSTTILGFLLPFPLITVFNVL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 TACRLRQPGQPKSRRHCLLLCAYVAVFVMCWLPYHVTLLLLTLHGTHISLHCHLVHLLYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 TACRLRQPGQPKSRRHCLLLCAYVAVFVMCWLPYHVTLLLLTLHGTHISLHCHLVHLLYF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 FYDVIDCFSMLHCVINPILYNFLSPHFRGRLLNAVVHYLPKDQTKAGTCASSSSCSTQHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 FYDVIDCFSMLHCVINPILYNFLSPHFRGRLLNAVVHYLPKDQTKAGTCASSSSCSTQHS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KB8 IIITKGDSQPAAAAPHPEPSLSFQAHHLLPNTSPISPTQPLTPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 IIITKGDSQPAAAAPHPEPSLSFQAHHLLPNTSPISPTQPLTPS
370 380 390 400
>>CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 (362 aa)
initn: 636 init1: 362 opt: 695 Z-score: 621.6 bits: 123.7 E(32554): 2.7e-28
Smith-Waterman score: 695; 34.2% identity (68.8% similar) in 292 aa overlap (52-336:40-331)
30 40 50 60 70
pF1KB8 DLGEIHNWTELLDLFNHTLSECHVELSQSTKRVVLFAL---YLAMFVVGLVENLLVICVN
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CCDS25 EPGNFSDISWPCNSSDCIVVDTVMCPNMPNKSVLLYTLSFIYIFIFVIGMIANSVVVWVN
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KB8 WRGSGRAGLMNLYILNMAIADLGIVLSLPVWMLEVTLDYTWLWGSFSCRFTHYFYFVNMY
... . . ::::.::::: .::..:::.. .. : : ..:. :: .. .:..
CCDS25 IQAKTTGYDTHCYILNLAIADLWVVLTIPVWVVSLVQHNQWPMGELTCKVTHLIFSINLF
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KB8 SSIFFLVCLSVDRYVTLTSASPSWQRYQHRVRRAMCAGIWVLSAIIPLPEVVHIQLVEGP
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CCDS25 GSIFFLTCMSVDRYLSITYFTNTPSSRKKMVRRVVCILVWLLAFCVSLPDTYYLKTVTSA
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240 250
pF1KB8 ---EPMCLFMAPFETYSTWALAVALSTTILGFLLPFPLITVFNVLTACRLRQPGQPKSRR
: .: . : .. . : ... : ...::: .:: .:.:: : : . .. ...
CCDS25 SNNETYCRSFYPEHSIKEWLIGMELVSVVLGFAVPFSIIAVFYFLLARAISASSDQEKHS
190 200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 HCLLLCAYVAVFVMCWLPYHVTLLLLTLHGTH-ISLHCHLVHLLYFFYDVIDCFSMLHCV
.. .::.::..:::::::..:: . : : . :.: : :. : .:.:..::
CCDS25 SRKIIFSYVVVFLVCWLPYHVAVLLDIFSILHYIPFTCRLEHALFTALHVTQCLSLVHCC
250 260 270 280 290 300
320 330 340 350 360 370
pF1KB8 INPILYNFLSPHFRGRLLNAVVHYLPKDQTKAGTCASSSSCSTQHSIIITKGDSQPAAAA
.::.::.:.. ..: .:..: .
CCDS25 VNPVLYSFINRNYRYELMKAFIFKYSAKTGLTKLIDASRVSETEYSALEQSTK
310 320 330 340 350 360
>>CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 (384 aa)
initn: 471 init1: 235 opt: 592 Z-score: 531.3 bits: 107.1 E(32554): 2.8e-23
Smith-Waterman score: 592; 32.7% identity (63.9% similar) in 330 aa overlap (43-361:36-359)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 EGVTAVPTSDLGEIHNWTELLDLFNHTLSECHVELSQSTKRVVLFALYLAMFVVGLVENL
:. . : .: : ..: .::.:: ::
CCDS27 SPQPLATEDADSENSSFYYYDYLDEVAFMLCRKDAVVSFGKVFLPVFYSLIFVLGLSGNL
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KB8 LVICVNWRGSGRAGLMNLYILNMAIADLGIVLSLPVWMLEVTLDYTWLWGSFSCRFTHYF
:.. : : : ....:.::.::..: ....:: : . :. . :..::: :... .
CCDS27 LLLMVLLRYVPRRRMVEIYLLNLAISNLLFLVTLPFWGISVA--WHWVFGSFLCKMVSTL
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KB8 YFVNMYSSIFFLVCLSVDRYVTLTSASPSWQRYQHRVRRAMCAGI-WVLSAIIPLPEVVH
: .:.::.:::. :.:.:.:. .. :.: ..: . :.. . : : :..: . .:..:
CCDS27 YTINFYSGIFFISCMSLDKYLEIVHAQP-YHRLRTRAKSLLLATIVWAVSLAVSIPDMVF
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240
pF1KB8 IQLVEGPEPMCLFMAPFETYST-WALAVALSTTILGFLLPFPLITVFNVLTAC---RLRQ
.: :.:. . : : ..: : : . .. ..::::::. . : .: :::
CCDS27 VQTHENPKGVWNCHADFGGHGTIWKLFLRFQQNLLGFLLPLLAMIFFYSRIGCVLVRLRP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 PGQPKSRRHCLLLCAYVAVFVMCWLPYHVTLLLLTLHGTHISLHCHLVHLLYFFYDVIDC
:: .. . . : :..: . :.::..::.: :: .. .:.. . : . .: .
CCDS27 AGQGRALK---IAAALVVAFFVLWFPYNLTLFLHTLLDLQVFGNCEVSQHLDYALQVTES
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 FSMLHCVINPILYNFLSPHFRGRL---LNAVV--HYLPKD-QTKAGTCASSSSCSTQHSI
...::: ..:::: : : .:: : : ::. : : :.. ..:. :: ..:. .
CCDS27 IAFLHCCFSPILYAFSSHRFRQYLKAFLAAVLGWHLAPGTAQASLSSCSESSILTAQEEM
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400
pF1KB8 IITKGDSQPAAAAPHPEPSLSFQAHHLLPNTSPISPTQPLTPS
CCDS27 TGMNDLGERQSENYPNKEDVGNKSA
360 370 380
>>CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 (355 aa)
initn: 436 init1: 335 opt: 526 Z-score: 474.1 bits: 96.4 E(32554): 4.3e-20
Smith-Waterman score: 526; 28.1% identity (62.1% similar) in 335 aa overlap (34-360:19-345)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 KPSWGPGPSEGVTAVPTSDLGEIHNWTELLDLFNHTLSECHVELSQSTKRVVLFALYLAM
:.:. : : .:: :.. ...: ..: .
CCDS26 MDYTLDLSVTTVTDYYYPDIFS---SPCDAELIQTNGKLLLAVFYCLL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 FVVGLVENLLVICVNWRGSGRAGLMNLYILNMAIADLGIVLSLPVWMLEVTLDYTWLWGS
:: .:. : ::: : . .. ..:.::.:..:: .:.:.: .. :: :..:.
CCDS26 FVFSLLGNSLVILVLVVCKKLRSITDVYLLNLALSDLLFVFSFP-FQTYYLLDQ-WVFGT
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 FSCRFTHYFYFVNMYSSIFFLVCLSVDRYVTLTSASPSWQRYQHRVRRAMCAGIWVLSAI
:. . ::....:::.::.. .:::::.... : . . :. ..: ..:. . .
CCDS26 VMCKVVSGFYYIGFYSSMFFITLMSVDRYLAVVHAVYALKVRTIRMGTTLCLAVWLTAIM
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 IPLPEVVHIQLV-EGPEPMCLFMAPFETYSTWALAVALSTTILGFLLPFPLITVFNVLTA
.: .: :.. : .: . .: . : . . .. .:::.:.:: .. .
CCDS26 ATIPLLVFYQVASEDGVLQCYSFYNQQTLK-WKIFTNFKMNILGLLIPFTIFMFCYIKIL
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 CRLRQPGQPKSRRHCLLLCAYVAVFVMCWLPYHVTLLLLTLHGTHISLHCHLVHLLYFFY
.:.. . .. . :. : . .. :.:..:.:.: .::. :: : . . : .
CCDS26 HQLKRCQNHNKTKAIRLVLIVVIASLLFWVPFNVVLFLTSLHSMHILDGCSISQQLTYAT
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350
pF1KB8 DVIDCFSMLHCVINPILYNFLSPHFRGRL-------LNAVVHYLPKDQTKAGTCASSSSC
: . .:. :: .::..: :.. .:. .: . . .:: ... . .: .::::
CCDS26 HVTEIISFTHCCVNPVIYAFVGEKFKKHLSEIFQKSCSQIFNYLGRQMPRE-SCEKSSSC
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KB8 STQHSIIITKGDSQPAAAAPHPEPSLSFQAHHLLPNTSPISPTQPLTPS
. :::
CCDS26 Q-QHSSRSSSVDYIL
350
>>CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (359 aa)
initn: 471 init1: 327 opt: 521 Z-score: 469.7 bits: 95.6 E(32554): 7.7e-20
Smith-Waterman score: 521; 27.2% identity (63.0% similar) in 327 aa overlap (54-371:29-353)
30 40 50 60 70 80
pF1KB8 GEIHNWTELLDLFNHTLSECHVELSQSTKRVVLFALYLAMFVVGLVENLLVICVNWRGSG
:.. .:: .::::. : ::. : .
CCDS31 MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYMK
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 RAGLMNLYILNMAIADLGIVLSLPVWMLEVTLDYTWLWGSFSCRFTHYFYFVNMYSSIFF
. ....::.:.::: ..:.::.: . ....: : .:.. :... :.:.:.:.
CCDS31 LKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVFL
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 LVCLSVDRYVTLTSASPSWQRYQHRVRRAMCAGIWVLSAIIPLPEVVH--IQLVEGPE-P
:.:::.:::.... : : : .. : ::.:... :: ..: . ..:. .
CCDS31 LTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENTNIT
120 130 140 150 160 170
210 220 230 240 250
pF1KB8 MCLFMAPFETY-STWALAVALSTTILGFLLPFPLITVFNVLTACRLR-----QPGQPKSR
.: : .:. :: ....:. .:::::.:: .: . .: :. : ..:..
CCDS31 VCAFH--YESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALKKAYEIQKNKPRND
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 RHCLLLCAYVAVFVMCWLPYHVTLLLLTLHGTHISLHCHLVHLLYFFYDVIDCFSMLHCV
.. : : : . :.:... .: .: : :... .. . . :.....
CCDS31 DIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIRDCRIADIVDTAMPITICIAYFNNC
240 250 260 270 280 290
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pF1KB8 INPILYNFLSPHFRGRLLNAVVHYLPKDQTKAGTCASSSSCSTQHSIIITKGDSQPAAAA
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CCDS82 EVE
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CCDS82 VCAFH--YESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKALKKAYEIQKNKPRND
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260 270 280 290 300 310
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CCDS82 DIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIRDCRIADIVDTAMPITICIAYFNNC
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CCDS82 EVE
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CCDS27 LLETTSGALSL
350
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]