Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8829
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8829, 437 aa
1>>>pF1KB8829 437 - 437 aa - 437 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7268+/-0.00171; mu= 11.9926+/- 0.101
mean_var=224.9561+/-46.339, 0's: 0 Z-trim(105.0): 950 B-trim: 4 in 1/47
Lambda= 0.085512
statistics sampled from 7186 (8201) to 7186 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.562), E-opt: 0.2 (0.252), width: 16
Scan time: 2.280
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12267.1 ZNF491 gene_id:126069|Hs108|chr19 ( 437) 3201 408.7 5.6e-114
CCDS32915.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 ( 742) 1998 260.7 3.6e-69
CCDS74289.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 ( 745) 1998 260.7 3.6e-69
CCDS45986.1 ZNF20 gene_id:7568|Hs108|chr19 ( 532) 1962 256.0 6.5e-68
CCDS42504.1 ZNF709 gene_id:163051|Hs108|chr19 ( 641) 1919 250.8 2.9e-66
CCDS12268.1 ZNF439 gene_id:90594|Hs108|chr19 ( 499) 1908 249.3 6.3e-66
CCDS42503.1 ZNF440 gene_id:126070|Hs108|chr19 ( 595) 1901 248.5 1.3e-65
CCDS45981.1 ZNF823 gene_id:55552|Hs108|chr19 ( 610) 1897 248.1 1.8e-65
CCDS77240.1 ZNF433 gene_id:163059|Hs108|chr19 ( 638) 1850 242.3 1e-63
CCDS45983.1 ZNF433 gene_id:163059|Hs108|chr19 ( 673) 1850 242.3 1.1e-63
CCDS32916.1 ZNF136 gene_id:7695|Hs108|chr19 ( 540) 1843 241.3 1.7e-63
CCDS45988.1 ZNF44 gene_id:51710|Hs108|chr19 ( 615) 1824 239.1 9.4e-63
CCDS54223.1 ZNF44 gene_id:51710|Hs108|chr19 ( 663) 1824 239.1 9.8e-63
CCDS82297.1 ZNF799 gene_id:90576|Hs108|chr19 ( 611) 1791 235.0 1.6e-61
CCDS45989.1 ZNF799 gene_id:90576|Hs108|chr19 ( 643) 1791 235.0 1.6e-61
CCDS32918.1 ZNF443 gene_id:10224|Hs108|chr19 ( 671) 1790 234.9 1.8e-61
CCDS12271.1 ZNF442 gene_id:79973|Hs108|chr19 ( 627) 1781 233.8 3.8e-61
CCDS42502.1 ZNF627 gene_id:199692|Hs108|chr19 ( 461) 1775 232.8 5.3e-61
CCDS45984.2 ZNF878 gene_id:729747|Hs108|chr19 ( 531) 1771 232.4 8.1e-61
CCDS42505.1 ZNF564 gene_id:163050|Hs108|chr19 ( 553) 1729 227.3 3e-59
CCDS12409.1 ZNF14 gene_id:7561|Hs108|chr19 ( 642) 1710 225.0 1.7e-58
CCDS12270.1 ZNF563 gene_id:147837|Hs108|chr19 ( 476) 1671 220.0 3.9e-57
CCDS12273.1 ZNF791 gene_id:163049|Hs108|chr19 ( 576) 1601 211.5 1.7e-54
CCDS12272.1 ZNF490 gene_id:57474|Hs108|chr19 ( 529) 1598 211.1 2.1e-54
CCDS12099.1 ZNF77 gene_id:58492|Hs108|chr19 ( 545) 1575 208.3 1.6e-53
CCDS42495.1 ZNF699 gene_id:374879|Hs108|chr19 ( 642) 1536 203.6 4.8e-52
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1512 200.6 3.6e-51
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1512 200.6 3.8e-51
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1512 200.6 3.8e-51
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1512 200.6 3.9e-51
CCDS59329.1 ZNF555 gene_id:148254|Hs108|chr19 ( 627) 1499 199.0 1.1e-50
CCDS12096.1 ZNF555 gene_id:148254|Hs108|chr19 ( 628) 1499 199.0 1.1e-50
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1487 197.5 3e-50
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1487 197.5 3.2e-50
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1475 196.1 9.2e-50
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1470 195.3 1.2e-49
CCDS74387.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 540) 1464 194.6 2e-49
CCDS46097.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 679) 1464 194.7 2.3e-49
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1465 195.1 2.8e-49
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1465 195.1 2.8e-49
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9 ( 699) 1438 191.5 2.2e-48
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1435 191.1 2.8e-48
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1433 191.0 3.5e-48
CCDS32440.1 ZNF267 gene_id:10308|Hs108|chr16 ( 743) 1426 190.1 6.3e-48
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1422 189.6 9e-48
CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 623) 1418 189.0 1.1e-47
CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 1418 189.0 1.1e-47
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1415 188.4 1.2e-47
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 1416 188.7 1.3e-47
CCDS12266.2 ZNF441 gene_id:126068|Hs108|chr19 ( 693) 1411 188.2 2.2e-47
>>CCDS12267.1 ZNF491 gene_id:126069|Hs108|chr19 (437 aa)
initn: 3201 init1: 3201 opt: 3201 Z-score: 2159.7 bits: 408.7 E(32554): 5.6e-114
Smith-Waterman score: 3201; 100.0% identity (100.0% similar) in 437 aa overlap (1-437:1-437)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MGERLFESAEGSQCGETFTQVPEDMLNKKTLPGVKSCESGTCGEIFMGYSSFNRNIRTDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MGERLFESAEGSQCGETFTQVPEDMLNKKTLPGVKSCESGTCGEIFMGYSSFNRNIRTDT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 GHQPHKCQKFLEKPYKHKQRRKALSHSHCFRTHERPHTREKPFDCKECEKSFISPASIRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GHQPHKCQKFLEKPYKHKQRRKALSHSHCFRTHERPHTREKPFDCKECEKSFISPASIRR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 YMVTHSGDGPYKCKFCGKALDCLSLYLTHERTHTGEKRYECKQCGKAFSWHSSVRIHERT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YMVTHSGDGPYKCKFCGKALDCLSLYLTHERTHTGEKRYECKQCGKAFSWHSSVRIHERT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 HTGEKPYECKECGKSFNFSSSFRRHERTHTGEKPYKCKECGKAFNCPSSFHRHERTHTGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HTGEKPYECKECGKSFNFSSSFRRHERTHTGEKPYKCKECGKAFNCPSSFHRHERTHTGE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 KPYECKLYGKALSRLISFRRHMRMHTGERPHKCKICGKAFYSPSSFQRHERSHTGEKPYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KPYECKLYGKALSRLISFRRHMRMHTGERPHKCKICGKAFYSPSSFQRHERSHTGEKPYK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 CKQCGKAFTCSTSFQYHERTHTGEKPDGCKQCGKAFRSAKYIRIHGRTHTGEKPYECKQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 CKQCGKAFTCSTSFQYHERTHTGEKPDGCKQCGKAFRSAKYIRIHGRTHTGEKPYECKQC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 GKAFHCVSSFHRHERTHAGEKPYECKHCGKAFTCSIYIRIHERIHTGEKPYQCKECGKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GKAFHCVSSFHRHERTHAGEKPYECKHCGKAFTCSIYIRIHERIHTGEKPYQCKECGKAF
370 380 390 400 410 420
430
pF1KB8 IRSSYCRKHERTHTINI
:::::::::::::::::
CCDS12 IRSSYCRKHERTHTINI
430
>>CCDS32915.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 (742 aa)
initn: 1658 init1: 1658 opt: 1998 Z-score: 1355.2 bits: 260.7 E(32554): 3.6e-69
Smith-Waterman score: 1998; 62.8% identity (81.7% similar) in 443 aa overlap (3-434:89-531)
10 20
pF1KB8 MGERLFESAEGSQCGETFTQVPEDMLN---KK
:.. : : :.:::::::::.: :: ::
CCDS32 NLTSIGKKWSDQNIEYEYQNPRRSFRSLIEEKVNEIKEDSHCGETFTQVPDDRLNFQEKK
60 70 80 90 100 110
30 40 50 60 70 80
pF1KB8 TLPGVKSCESGTCGEIFMGYSSFNRNIRTDTGHQPHKCQKFLEKPYKHKQ--RRKALSHS
. : ::::.: .:.:. .: :::: .:: ::::. .. :.. :::: .: .::. .
CCDS32 ASPEVKSCDSFVCAEVGIGNSSFNMSIRGDTGHKAYEYQEYGPKPYKCQQPKNKKAFRYR
120 130 140 150 160 170
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 HCFRTHERPHTREKPFDCKECEKSFISPASIRRYMVTHSGDGPYKCKFCGKALDCLSLYL
.::.:: :: :::. :: : :.:: .::::.:: ::::: :::::::::. .::::
CCDS32 PSIRTQERDHTGEKPYACKVCGKTFIFHSSIRRHMVMHSGDGTYKCKFCGKAFHSFSLYL
180 190 200 210 220 230
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 THERTHTGEKRYECKQCGKAFSWHSSVRIHERTHTGEKPYECKECGKSFNFSSSFRRHER
::::::::: ::::::::.:.. ....::::::::::::::..: :.:. :::..::::
CCDS32 IHERTHTGEKPYECKQCGKSFTYSATLQIHERTHTGEKPYECSKCDKAFHSSSSYHRHER
240 250 260 270 280 290
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 THTGEKPYKCKECGKAFNCPSSFHRHERTHTGEKPYECKLYGKALSRLISFRRHMRMHTG
.: :::::.:::::::: ::..::::::.:.:::::: ::..:: ::::. :.::..:
CCDS32 SHMGEKPYQCKECGKAFAYTSSLRRHERTHSGKKPYECKQYGEGLSYLISFQTHIRMNSG
300 310 320 330 340 350
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 ERPHKCKICGKAFYSPSSFQRHERSHTGEKPYKCKQCGKAFTCSTSFQYHERTHTGEKPD
:::.:::::::.::: .::: ::..::::: ::::::::::. :.::.:::: ::::::
CCDS32 ERPYKCKICGKGFYSAKSFQTHEKTHTGEKRYKCKQCGKAFNLSSSFRYHERIHTGEKPY
360 370 380 390 400 410
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 GCKQCGKAFRSAKYIRIHGRTHTGEKPYECKQCGKAFHCVSSFHRHERTHAGEKPYECKH
:::::::::::. .:.:: :::::::::::.:::::. .: .. : :::.::::::::.
CCDS32 ECKQCGKAFRSASQLRVHGGTHTGEKPYECKECGKAFRSTSHLRVHGRTHTGEKPYECKE
420 430 440 450 460 470
390 400 410 420 430
pF1KB8 CGKAFTCSIYIRIHER------IHTGEKPYQCKECGKAFIRSSYCRKHERTHTINI
::::: ...:::: . .::.::.:. : :.: .. . ::.:::
CCDS32 CGKAFRYVKHLQIHERTEKHIRMPSGERPYKCSICEKGFYSAKSFQTHEKTHTGEKPYEC
480 490 500 510 520 530
CCDS32 NQCGKAFRCCNSLRYHERTHTGEKPYECKQCGKAFRSASHLRMHERTHTGEKPYECKQCG
540 550 560 570 580 590
>--
initn: 2031 init1: 1046 opt: 1046 Z-score: 720.5 bits: 143.2 E(32554): 8.2e-34
Smith-Waterman score: 1046; 66.4% identity (81.5% similar) in 211 aa overlap (183-393:532-742)
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 HTGEKRYECKQCGKAFSWHSSVRIHERTHTGEKPYECKECGKSFNFSSSFRRHERTHTGE
:::::::..:::.: .:.: ::::::::
CCDS32 PSGERPYKCSICEKGFYSAKSFQTHEKTHTGEKPYECNQCGKAFRCCNSLRYHERTHTGE
510 520 530 540 550 560
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 KPYKCKECGKAFNCPSSFHRHERTHTGEKPYECKLYGKALSRLISFRRHMRMHTGERPHK
:::.::.::::: : .. :::::::::::::: :::.: ..:.: : ::::.:..
CCDS32 KPYECKQCGKAFRSASHLRMHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCASNLRKHGRTHTGEKPYE
570 580 590 600 610 620
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 CKICGKAFYSPSSFQRHERSHTGEKPYKCKQCGKAFTCSTSFQYHERTHTGEKPDGCKQC
:: ::::: : :..: :::.:::::::.::.: ::: .::: ::: : :::: ::.:
CCDS32 CKQCGKAFRSASNLQMHERTHTGEKPYECKECEKAFCKFSSFQIHERKHRGEKPYECKHC
630 640 650 660 670 680
340 350 360 370 380 390
pF1KB8 GKAFRSAKYIRIHGRTHTGEKPYECKQCGKAFHCVSSFHRHERTHAGEKPYECKHCGKAF
:..: ::: ..::.::: ::: ::::.:::::. ::.: : ::: :::::::: :::::
CCDS32 GNGFTSAKILQIHARTHIGEKHYECKECGKAFNYFSSLHIHARTHMGEKPYECKDCGKAF
690 700 710 720 730 740
400 410 420 430
pF1KB8 TCSIYIRIHERIHTGEKPYQCKECGKAFIRSSYCRKHERTHTINI
.
CCDS32 S
>>CCDS74289.1 ZNF700 gene_id:90592|Hs108|chr19 (745 aa)
initn: 1658 init1: 1658 opt: 1998 Z-score: 1355.2 bits: 260.7 E(32554): 3.6e-69
Smith-Waterman score: 1998; 62.8% identity (81.7% similar) in 443 aa overlap (3-434:92-534)
10 20
pF1KB8 MGERLFESAEGSQCGETFTQVPEDMLN---KK
:.. : : :.:::::::::.: :: ::
CCDS74 NLTSIGKKWSDQNIEYEYQNPRRSFRSLIEEKVNEIKEDSHCGETFTQVPDDRLNFQEKK
70 80 90 100 110 120
30 40 50 60 70 80
pF1KB8 TLPGVKSCESGTCGEIFMGYSSFNRNIRTDTGHQPHKCQKFLEKPYKHKQ--RRKALSHS
. : ::::.: .:.:. .: :::: .:: ::::. .. :.. :::: .: .::. .
CCDS74 ASPEVKSCDSFVCAEVGIGNSSFNMSIRGDTGHKAYEYQEYGPKPYKCQQPKNKKAFRYR
130 140 150 160 170 180
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 HCFRTHERPHTREKPFDCKECEKSFISPASIRRYMVTHSGDGPYKCKFCGKALDCLSLYL
.::.:: :: :::. :: : :.:: .::::.:: ::::: :::::::::. .::::
CCDS74 PSIRTQERDHTGEKPYACKVCGKTFIFHSSIRRHMVMHSGDGTYKCKFCGKAFHSFSLYL
190 200 210 220 230 240
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 THERTHTGEKRYECKQCGKAFSWHSSVRIHERTHTGEKPYECKECGKSFNFSSSFRRHER
::::::::: ::::::::.:.. ....::::::::::::::..: :.:. :::..::::
CCDS74 IHERTHTGEKPYECKQCGKSFTYSATLQIHERTHTGEKPYECSKCDKAFHSSSSYHRHER
250 260 270 280 290 300
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 THTGEKPYKCKECGKAFNCPSSFHRHERTHTGEKPYECKLYGKALSRLISFRRHMRMHTG
.: :::::.:::::::: ::..::::::.:.:::::: ::..:: ::::. :.::..:
CCDS74 SHMGEKPYQCKECGKAFAYTSSLRRHERTHSGKKPYECKQYGEGLSYLISFQTHIRMNSG
310 320 330 340 350 360
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 ERPHKCKICGKAFYSPSSFQRHERSHTGEKPYKCKQCGKAFTCSTSFQYHERTHTGEKPD
:::.:::::::.::: .::: ::..::::: ::::::::::. :.::.:::: ::::::
CCDS74 ERPYKCKICGKGFYSAKSFQTHEKTHTGEKRYKCKQCGKAFNLSSSFRYHERIHTGEKPY
370 380 390 400 410 420
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 GCKQCGKAFRSAKYIRIHGRTHTGEKPYECKQCGKAFHCVSSFHRHERTHAGEKPYECKH
:::::::::::. .:.:: :::::::::::.:::::. .: .. : :::.::::::::.
CCDS74 ECKQCGKAFRSASQLRVHGGTHTGEKPYECKECGKAFRSTSHLRVHGRTHTGEKPYECKE
430 440 450 460 470 480
390 400 410 420 430
pF1KB8 CGKAFTCSIYIRIHER------IHTGEKPYQCKECGKAFIRSSYCRKHERTHTINI
::::: ...:::: . .::.::.:. : :.: .. . ::.:::
CCDS74 CGKAFRYVKHLQIHERTEKHIRMPSGERPYKCSICEKGFYSAKSFQTHEKTHTGEKPYEC
490 500 510 520 530 540
CCDS74 NQCGKAFRCCNSLRYHERTHTGEKPYECKQCGKAFRSASHLRMHERTHTGEKPYECKQCG
550 560 570 580 590 600
>--
initn: 2031 init1: 1046 opt: 1046 Z-score: 720.5 bits: 143.2 E(32554): 8.2e-34
Smith-Waterman score: 1046; 66.4% identity (81.5% similar) in 211 aa overlap (183-393:535-745)
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 HTGEKRYECKQCGKAFSWHSSVRIHERTHTGEKPYECKECGKSFNFSSSFRRHERTHTGE
:::::::..:::.: .:.: ::::::::
CCDS74 PSGERPYKCSICEKGFYSAKSFQTHEKTHTGEKPYECNQCGKAFRCCNSLRYHERTHTGE
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220 230 240 250 260 270
pF1KB8 KPYKCKECGKAFNCPSSFHRHERTHTGEKPYECKLYGKALSRLISFRRHMRMHTGERPHK
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CCDS74 KPYECKQCGKAFRSASHLRMHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCASNLRKHGRTHTGEKPYE
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pF1KB8 CKICGKAFYSPSSFQRHERSHTGEKPYKCKQCGKAFTCSTSFQYHERTHTGEKPDGCKQC
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CCDS74 CKQCGKAFRSASNLQMHERTHTGEKPYECKECEKAFCKFSSFQIHERKHRGEKPYECKHC
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340 350 360 370 380 390
pF1KB8 GKAFRSAKYIRIHGRTHTGEKPYECKQCGKAFHCVSSFHRHERTHAGEKPYECKHCGKAF
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CCDS74 GNGFTSAKILQIHARTHIGEKHYECKECGKAFNYFSSLHIHARTHMGEKPYECKDCGKAF
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400 410 420 430
pF1KB8 TCSIYIRIHERIHTGEKPYQCKECGKAFIRSSYCRKHERTHTINI
.
CCDS74 S
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10 20 30
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40 50 60 70 80 90
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:::. :::..:::. :.::.: .::.::::. . :.. :.::..:. .::.:. :
CCDS45 LPGITPCESSVCGEVGTGHSSLNTHIRADTGHKSSEYQEYGENPYRNKECKKAFSYLDSF
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100 110 120 130 140 150
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CCDS45 QSHDKACTKEKPYDGKECTETFISHSCIQRHRVMHSGDGPYKCKFCGKAFYFLNLCLIHE
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160 170 180 190 200 210
pF1KB8 RTHTGEKRYECKQCGKAFSWHSSVRIHERTHTGEKPYECKECGKSFNFSSSFRRHERTHT
: ::: : :.::::::::. ... .::::::: . ::::::..:.: : .:::.:.::
CCDS45 RIHTGVKPYKCKQCGKAFTRSTTLPVHERTHTGVNADECKECGNAFSFPSEIRRHKRSHT
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
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CCDS45 GEKPYECKQCGKVFISFSSIQYHKMTHTGEKPYECKQCGKAFRCGSHLQKHGRTHTGEKP
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280 290 300 310 320 330
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..:. ::::: :..::::..:: .::: ::::::.: :....: :::::.:::: ::
CCDS45 YECRQCGKAFRCTSDLQRHEKTHTEDKPYGCKQCGKGFRCASQLQIHERTHSGEKPHECK
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340 350 360 370 380 390
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.:::.:. . .::: ::::::::.:::::::::. ::.: :::::.:.:::::: :::
CCDS45 ECGKVFKYFSSLRIHERTHTGEKPHECKQCGKAFRYFSSLHIHERTHTGDKPYECKVCGK
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400 410 420 430
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::::: :: ::: :::::::.::.:::::: :.: : ::::::
CCDS45 AFTCSSSIRYHERTHTGEKPYECKHCGKAFI-SNYIRYHERTHTGEKPYQCKQCGKAFIR
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CCDS45 ASSCREHERTHTINR
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10 20 30
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40 50 60 70
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CCDS42 FTRVKPYECSVCGKDYMCHSSLNRHMRSHTEHRSYEYHKYGEKSYECKECGKRFSFRSSF
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::::: :: ::.: :. ::: :: :::..:::: :.:: ...: .:
CCDS42 RIHERTHTGEKPYKCKQCGKAFSWPSSFQIHERTHTGEKPYECKECGKAFIYHTTFRGHM
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CCDS42 RMHTGEKPYKCKECGKTFSHPSSFRNHERTHSGEKPYECKQCGKAFRYYQTFQIHERTHT
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CCDS42 GEKPYQCKQCGKALSCPTSFRSHERIHTGEKPYKCKKCGKAFSFPSSFRKHERIHTGEKP
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CCDS42 YDCKECGKAFISLPSYRRHMIMHTGNGPYKCKECGKAFDCPSSFQIHERTHTGEKPYECK
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CCDS42 QCGKAFSCSSSFRMHERTHTGEKPHECKQCGKAFSCSSSVRIHERTHTGEKPYECKQCGK
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CCDS42 AFSCSSSFRMHERIHTGEKPYECKQCGKAFSFSSSFRMHERTHTGEKPYECKQCGKAFSC
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pF1KB8 SSYCRKHERTHTINI
:: : ::::::
CCDS42 SSSFRMHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCSSSIRIHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCSSSV
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>--
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CCDS42 HTGEKPYECKQCGKAFSCSSSFRMHERTHTGEKPYECKQCGKAFSCSSSIRIHERTHTGE
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:: :::::::: .. .:.: ::::: :::::::: ::: : ::. :::::.:::::
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CCDS42 CQQCGKAFKCSRSFRIHERVHSGE
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10 20
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CCDS12 NLTSIGKKWKDQNIEYEYQNPRRNFRSVTEEKVNEIKEDSHCGETFTPVPDDRLNFQKKK
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CCDS12 LRTQERDHTGKKPYACKECGKNIIYHSSIQRHMVVHSGDGPYKCKFCGKAFHCLSLYLIH
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:::::::: ::::::::.::. .. ::::::: :::::::.::::.:. : .::::.:
CCDS12 ERTHTGEKPYECKQCGKSFSYSATHRIHERTHIGEKPYECQECGKAFHSPRSCHRHERSH
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pF1KB8 TGEKPYKCKECGKAFNCPSSFHRHERTHTGEKPYECKLYGKALSRLISFRRHMRMHTGER
::: :.:::::::: :: .::::::. .: :::: ::::: : ::. :.:::.:::
CCDS12 MGEKAYQCKECGKAFMCPRYVRRHERTHSRKKLYECKQCGKALSSLTSFQTHIRMHSGER
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pF1KB8 PHKCKICGKAFYSPSSFQRHERSHTGEKPYKCKQCGKAFTCSTSFQYHERTHTGEKPDGC
:..:: :::.::: .::::::..:.::::::::::::::: : ::.::::::::::: :
CCDS12 PYECKTCGKGFYSAKSFQRHEKTHSGEKPYKCKQCGKAFTRSGSFRYHERTHTGEKPYEC
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pF1KB8 KQCGKAFRSAKYIRIHGRTHTGEKPYECKQCGKAFHCVSSFHRHERTHAGEKPYECKHCG
:::::::::: ...:::::::::::.::.:::::. .:... :.: :.::::::::.::
CCDS12 KQCGKAFRSAPNLQLHGRTHTGEKPYQCKECGKAFRSASQLRIHRRIHTGEKPYECKKCG
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pF1KB8 KAFTCSIYIRIHERIHTGEKPYQCKECGKAFIRSSYCRKHERTHTINI
::: .:.::: .:
CCDS12 KAFRYVQNFRFHERTQTHKNALWRKTL
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10 20
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CCDS42 NLTSLGKRWKDQNIEYEHQNPRRNFRSLIEEKVNEIKDDSHCGETFTPVPDDRLNFQEKK
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pF1KB8 TLPGVKSCESGTCGEIFMGYSSFNRNIRTDTGHQPHKCQKFLEKPYKHKQRRKALSHSHC
. : :::::: .:::. .: :::: ::: : ::. .. :.. :: : .: .::. .
CCDS42 ASPEVKSCESFVCGEVGLGNSSFNMNIRGDIGHKAYEYQEYGPKPCKCQQPKKAFRYRPS
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:::.:: :: ::: :: : :.::: .:.::.:: :::::::::::::::. :: ::: :
CCDS42 FRTQERDHTGEKPNACKVCGKTFISHSSVRRHMVMHSGDGPYKCKFCGKAFHCLRLYLIH
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pF1KB8 ERTHTGEKRYECKQCGKAFSWHSSVRIHERTHTGEKPYECKECGKSFNFSSSFRRHERTH
:: ::::: :::::::.::. .. :::.:::::::::: .::::.:. :.::::: :
CCDS42 ERIHTGEKPCECKQCGKSFSYSATHRIHKRTHTGEKPYEYQECGKAFHSPRSYRRHERIH
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CCDS42 MGEKAYQCKECGKAFTCPRYVRIHERTHSRKNLYECKQCGKALSSLTSFQTHVRLHSGER
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CCDS42 PYECKICGKDFCSVNSFQRHEKIHSGEKPYKCKQCGKAFPHSSSLRYHERTHTGEKPYEC
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pF1KB8 KQCGKAFRSAKYIRIHGRTHTGEKPYECKQCGKAFHCVSSFHRHERT------HAGEKPY
::::::::::...:.::::::::::::::.:::::. :.... :::: :.::. :
CCDS42 KQCGKAFRSASHLRVHGRTHTGEKPYECKECGKAFRYVNNLQSHERTQTHIRIHSGERRY
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pF1KB8 ECKHCGKAFTCSIYIRIHERIHTGEKPYQCKECGKAFIRSSYCRKHERTHTINI
.:: :::.: : .. ::. ::::: :.::.
CCDS42 KCKICGKGFYCPKSFQRHEKTHTGEKLYECKQRSVVPSVVPVPFDIMKGLTLERSPINAS
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10 20 30
pF1KB8 MGERLFESAEGSQCGETFTQVPEDMLNKKTLPGVKS
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CCDS45 NLDCIEMKWEDQNIGDQCQNAKRNLRSHTCEIKDDSQCGETFGQIPDSIVNKNT-PRVNP
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CCDS45 CDSGECGEVVLGHSSLNCNIRVDTGHKSCEHQEYGEKPYTHKQRGKAISHQHSFQTHERP
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CCDS45 PTGKKPFDCKECAKTFSSLGNLRRHMAAHHGDGPYKCKLCGKAFVWPSLFHLHERTHTGE
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CCDS45 KPYECKQCSKAFPFYSSYLRHERIHTGEKAYECKQCSKAFPDYSTYLRHERTHTGEKPYK
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CCDS45 CTQCGKAFSCYYYTRLHERTHTGEQPYACKQCGKTFYHHTSFRRHMIRHTGDGPHKCKIC
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340 350 360 370 380 390
pF1KB8 RSAKYIRIHGRTHTGEKPYECKQCGKAFHCVSSFHRHERTHAGEKPYECKHCGKAFTCSI
. .. : :::::::::.:::::::: ..:..::: ::.: :::.:. :::::.
CCDS45 GCPSLFQRHERTHTGEKPYQCKQCGKAFSLAGSLRRHEATHTGVKPYKCQ-CGKAFSDLS
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400 410 420 430
pF1KB8 YIRIHERIHTGEKPYQCKECGKAFIRSSYCRKHERTHTINI
.. :: :::::::.:::::::: .: .:.::::.
CCDS45 SFQNHETTHTGEKPYECKECGKAFSCFKYLSQHKRTHTVEKPYECKTCRKAFSHFSNLKV
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pF1KB8 EKPFDCKECEKSFISPASIRRYMVTHSGDGPYKCKFCGKALDCLSLYLTHERTHTGEKRY
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CCDS45 EKPYECKECGKAFSCFKYLSQHKRTHTVEKPYECKTCRKAFSHFSNLKVHERIHSGEKPY
470 480 490 500 510 520
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pF1KB8 ECKQCGKAFSWHSSVRIHERTHTGEKPYECKECGKSFNFSSSFRRHERTHTGEKPYKCKE
:::.::::::: . . ::: ::::::::: .:::.:. : .: ::.:::::: :.:::
CCDS45 ECKECGKAFSWLTCLLRHERIHTGEKPYECLQCGKAFTRSRFLRGHEKTHTGEKLYECKE
530 540 550 560 570 580
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CCDS45 CGKALSSLRSLHRHKRTHWKDTL
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250 260 270 280 290 300
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370 380 390 400 410 420
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CCDS45 CKQCGKAFGCPSNLRRHGRTHTGEKPYKCNQCGKVFRCSSQLQVHGRAHCIDTP
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pF1KB8 GKAFIRSSYCRKHERTHTINI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]