Result of FASTA (ccds) for pF1KB8836
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8836, 461 aa
  1>>>pF1KB8836 461 - 461 aa - 461 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3483+/-0.00257; mu= 3.6932+/- 0.150
 mean_var=290.6940+/-59.492, 0's: 0 Z-trim(100.6): 957  B-trim: 0 in 0/48
 Lambda= 0.075224
 statistics sampled from 5178 (6197) to 5178 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.465), E-opt: 0.2 (0.19), width:  16
 Scan time:  2.270

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5           ( 461) 3273 370.2 2.6e-102
CCDS12947.1 ZNF71 gene_id:58491|Hs108|chr19        ( 489) 2231 257.1 2.9e-68
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 616) 1938 225.4 1.3e-58
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 658) 1938 225.5 1.3e-58
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 670) 1938 225.5 1.3e-58
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19        ( 682) 1938 225.5 1.3e-58
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19      ( 580) 1903 221.6 1.7e-57
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19      ( 644) 1903 221.7 1.8e-57
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19       ( 678) 1869 218.0 2.4e-56
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19       ( 839) 1861 217.3   5e-56
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19       ( 840) 1861 217.3   5e-56
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9        (1059) 1862 217.5 5.4e-56
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19      ( 688) 1853 216.3 8.1e-56
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19      ( 527) 1848 215.6   1e-55
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19      ( 686) 1848 215.7 1.2e-55
CCDS47539.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7          ( 659) 1838 214.6 2.4e-55
CCDS47538.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7          ( 697) 1838 214.7 2.5e-55
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19       ( 782) 1838 214.7 2.7e-55
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19       ( 818) 1838 214.7 2.8e-55
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17       ( 865) 1830 213.9 5.3e-55
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5       ( 563) 1819 212.5 9.2e-55
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6          ( 751) 1817 212.4 1.3e-54
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17       ( 761) 1816 212.3 1.4e-54
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3        ( 754) 1812 211.9 1.9e-54
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16         ( 585) 1804 210.9 2.9e-54
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16         ( 643) 1804 210.9 3.1e-54
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10         ( 778) 1804 211.0 3.5e-54
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19       ( 781) 1801 210.7 4.4e-54
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15       ( 614) 1797 210.1 5.1e-54
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19     ( 714) 1796 210.1   6e-54
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8           ( 682) 1795 210.0 6.3e-54
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19     ( 769) 1796 210.2 6.3e-54
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12         ( 738) 1792 209.7 8.3e-54
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19         ( 595) 1790 209.4 8.4e-54
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19      ( 769) 1791 209.6 9.2e-54
CCDS12495.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19      ( 616) 1778 208.1 2.1e-53
CCDS74349.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19      ( 647) 1778 208.1 2.2e-53
CCDS12968.1 ZNF606 gene_id:80095|Hs108|chr19       ( 792) 1778 208.2 2.5e-53
CCDS73089.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10        ( 699) 1776 207.9 2.7e-53
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 665) 1775 207.8 2.8e-53
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 667) 1775 207.8 2.8e-53
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19        ( 692) 1775 207.8 2.9e-53
CCDS31182.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10        ( 810) 1776 208.0 2.9e-53
CCDS44372.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10        ( 811) 1776 208.0 2.9e-53
CCDS60514.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10        ( 817) 1776 208.0   3e-53
CCDS73088.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10        ( 829) 1776 208.0   3e-53
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19       ( 488) 1770 207.1 3.4e-53
CCDS35235.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX         ( 620) 1771 207.3 3.6e-53
CCDS35236.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX         ( 639) 1771 207.3 3.7e-53
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19      (1058) 1772 207.7 4.7e-53


>>CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5                (461 aa)
 initn: 3273 init1: 3273 opt: 3273  Z-score: 1950.4  bits: 370.2 E(32554): 2.6e-102
Smith-Waterman score: 3273; 100.0% identity (100.0% similar) in 461 aa overlap (1-461:1-461)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MEREGIWHSTLGETWEPNNWLEGQQDSHLSQVGVTHKETFTEMRVCGGNEFERCSSQDSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MEREGIWHSTLGETWEPNNWLEGQQDSHLSQVGVTHKETFTEMRVCGGNEFERCSSQDSI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 LDTQQSIPMVKRPHNCNSHGEDATQNSELIKTQRMFVGKKIYECNQCSKTFSQSSSLLKH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LDTQQSIPMVKRPHNCNSHGEDATQNSELIKTQRMFVGKKIYECNQCSKTFSQSSSLLKH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 QRIHTGEKPYKCNVCGKHFIERSSLTVHQRIHTGEKPYKCNECGKAFSQSMNLTVHQRTH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QRIHTGEKPYKCNVCGKHFIERSSLTVHQRIHTGEKPYKCNECGKAFSQSMNLTVHQRTH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 TGEKPYQCKECGKAFHKNSSLIQHERIHTGEKPYKCNECGKAFTQSMNLTVHQRTHTGEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TGEKPYQCKECGKAFHKNSSLIQHERIHTGEKPYKCNECGKAFTQSMNLTVHQRTHTGEK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 PYECNECGKAFSQSMHLIVHQRSHTGEKPYECSQCGKAFSKSSTLTLHQRNHTGEKPYKC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PYECNECGKAFSQSMHLIVHQRSHTGEKPYECSQCGKAFSKSSTLTLHQRNHTGEKPYKC
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 NKCGKSFSQSTYLIEHQRLHSGVKPFECNECGKAFSKNSSLTQHRRIHTGEKPYECMVCG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NKCGKSFSQSTYLIEHQRLHSGVKPFECNECGKAFSKNSSLTQHRRIHTGEKPYECMVCG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB8 KHFTGRSSLTVHQVIHTGEKPYECNECGKAFSQSAYLIEHQRIHTGEKPYECDQCGKAFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KHFTGRSSLTVHQVIHTGEKPYECNECGKAFSQSAYLIEHQRIHTGEKPYECDQCGKAFI
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460 
pF1KB8 KNSSLTVHQRTHTGEKPYQCNECGKAFSRSTNLTRHQRTHT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KNSSLTVHQRTHTGEKPYQCNECGKAFSRSTNLTRHQRTHT
              430       440       450       460 

>>CCDS12947.1 ZNF71 gene_id:58491|Hs108|chr19             (489 aa)
 initn: 2187 init1: 2187 opt: 2231  Z-score: 1339.0  bits: 257.1 E(32554): 2.9e-68
Smith-Waterman score: 2231; 68.5% identity (84.9% similar) in 451 aa overlap (15-461:39-489)

                               10        20           30        40 
pF1KB8                 MEREGIWHSTLGETWEPNNWLE---GQQDSHLSQVGVTHKETFT
                                     :::..: :   :.  ..   .:. . . . 
CCDS12 DISEDKLSVVGEATGGPTRNGARGPGSEGVWEPGSWPERPRGDAGAEWEPLGIPQGNKLL
       10        20        30        40        50        60        

              50        60         70        80        90       100
pF1KB8 EMRVCGGNEFERCSSQDSIL-DTQQSIPMVKRPHNCNSHGEDATQNSELIKTQRMFVGKK
          : . .:..  ..:  .:   . . :  :       .:.. ...:.: :       ::
CCDS12 GGSVPACHELKAFANQGCVLVPPRLDDPTEKGACPPVRRGKNFSSTSDLSKPPMPCEEKK
       70        80        90       100       110       120        

              110       120       130       140       150       160
pF1KB8 IYECNQCSKTFSQSSSLLKHQRIHTGEKPYKCNVCGKHFIERSSLTVHQRIHTGEKPYKC
        :.:..:.:.::.::::.:::::::::::..:..::::::::::::.:::.::::::: :
CCDS12 TYDCSECGKAFSRSSSLIKHQRIHTGEKPFECDTCGKHFIERSSLTIHQRVHTGEKPYAC
      130       140       150       160       170       180        

              170       180       190       200       210       220
pF1KB8 NECGKAFSQSMNLTVHQRTHTGEKPYQCKECGKAFHKNSSLIQHERIHTGEKPYKCNECG
       ..::::::: :::::::::::::::: :  :::::.:.::: :::::::::::: :..::
CCDS12 GDCGKAFSQRMNLTVHQRTHTGEKPYVCDVCGKAFRKTSSLTQHERIHTGEKPYACGDCG
      190       200       210       220       230       240        

              230       240       250       260       270       280
pF1KB8 KAFTQSMNLTVHQRTHTGEKPYECNECGKAFSQSMHLIVHQRSHTGEKPYECSQCGKAFS
       :::.:.:.: :::::::::::: : :::.::::.:::  :::.::::::: :..:::::.
CCDS12 KAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPYVCPECGRAFSQNMHLTEHQRTHTGEKPYACKECGKAFN
      250       260       270       280       290       300        

              290       300       310       320       330       340
pF1KB8 KSSTLTLHQRNHTGEKPYKCNKCGKSFSQSTYLIEHQRLHSGVKPFECNECGKAFSKNSS
       :::.:::::::::::::: :..:::.::::.:::.:::.: :::::::.:::::::::::
CCDS12 KSSSLTLHQRNHTGEKPYVCGECGKAFSQSSYLIQHQRFHIGVKPFECSECGKAFSKNSS
      310       320       330       340       350       360        

              350       360       370       380       390       400
pF1KB8 LTQHRRIHTGEKPYECMVCGKHFTGRSSLTVHQVIHTGEKPYECNECGKAFSQSAYLIEH
       ::::.:::::::::::..: ::::::::: :::..::::::: :.:::::::::::::::
CCDS12 LTQHQRIHTGEKPYECYICKKHFTGRSSLIVHQIVHTGEKPYVCGECGKAFSQSAYLIEH
      370       380       390       400       410       420        

              410       420       430       440       450       460
pF1KB8 QRIHTGEKPYECDQCGKAFIKNSSLTVHQRTHTGEKPYQCNECGKAFSRSTNLTRHQRTH
       ::::::::::.: ::::.:::::::::::: :::::::.:.::::.:::.:::::: : :
CCDS12 QRIHTGEKPYRCGQCGKSFIKNSSLTVHQRIHTGEKPYRCGECGKTFSRNTNLTRHLRIH
      430       440       450       460       470       480        

        
pF1KB8 T
       :
CCDS12 T
        

>>CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (616 aa)
 initn: 1926 init1: 1926 opt: 1938  Z-score: 1166.0  bits: 225.4 E(32554): 1.3e-58
Smith-Waterman score: 1938; 59.2% identity (80.3% similar) in 451 aa overlap (13-461:141-587)

                                 10        20         30        40 
pF1KB8                   MEREGIWHSTLGETWEPNNW-LEGQQDSHLSQVGVTHKETFT
                                     :   :..:  .:....   ...: .:    
CCDS74 KTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREK--PDLNVLQKTCVK
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       :    :  .:  .  :..: :  ..     .::..:.   .   ..: : : ::. .:.:
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        :.:.::..::.: . :..::: :::::::.:. ::: :  :::.. :.: :::::::.:
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       .:::::: ::..:: : : ::::::::: :::::: ..::: .:.:::::::::.:.:::
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       .::.:. :.:.:::::::.:..:::.: :::.: .:::.:.: ::.:::.::::::..::
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CCDS74 TGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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>>CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (658 aa)
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CCDS74 TGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
      630       640       650        

>>CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (670 aa)
 initn: 1926 init1: 1926 opt: 1938  Z-score: 1165.6  bits: 225.5 E(32554): 1.3e-58
Smith-Waterman score: 1938; 59.2% identity (80.3% similar) in 451 aa overlap (13-461:195-641)

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pF1KB8                   MEREGIWHSTLGETWEPNNW-LEGQQDSHLSQVGVTHKETFT
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CCDS12 KTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREK--PDLNVLQKTCVK
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pF1KB8 EMRV-CGGNEFERCSSQDSILDTQQSIPMVKRPHNCNSHGEDATQNSELIKTQRMFVGKK
       :    :  .:  .  :..: :  ..     .::..:.   .   ..: : : ::. .:.:
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       .:::::: ::..:: : : ::::::::: :::::: ..::: .:.:::::::::.:.:::
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pF1KB8 QRIHTGEKPYECDQCGKAFIKNSSLTVHQRTHTGEKPYQCNECGKAFSRSTNLTRHQRTH
       ::::: :::: :..:::.: ..:::. :.:::::::::.:..:::.: .::.::.:.: :
CCDS12 QRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIH
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pF1KB8 T                             
       :                             
CCDS12 TGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
              650       660       670

>>CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19             (682 aa)
 initn: 1926 init1: 1926 opt: 1938  Z-score: 1165.5  bits: 225.5 E(32554): 1.3e-58
Smith-Waterman score: 1938; 59.2% identity (80.3% similar) in 451 aa overlap (13-461:207-653)

                                 10        20         30        40 
pF1KB8                   MEREGIWHSTLGETWEPNNW-LEGQQDSHLSQVGVTHKETFT
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CCDS54 KTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREK--PDLNVLQKTCVK
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pF1KB8 EMRV-CGGNEFERCSSQDSILDTQQSIPMVKRPHNCNSHGEDATQNSELIKTQRMFVGKK
       :    :  .:  .  :..: :  ..     .::..:.   .   ..: : : ::. .:.:
CCDS54 EKPYKC--QECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEK
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CCDS54 PYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYEC
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pF1KB8 NECGKAFSQSMNLTVHQRTHTGEKPYQCKECGKAFHKNSSLIQHERIHTGEKPYKCNECG
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pF1KB8 KAFTQSMNLTVHQRTHTGEKPYECNECGKAFSQSMHLIVHQRSHTGEKPYECSQCGKAFS
       :::::   :  :::::::::::::.:::::::::  :  :.: ::::::: :..:::.::
CCDS54 KAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFS
            420       430       440       450       460       470  

              290       300       310       320       330       340
pF1KB8 KSSTLTLHQRNHTGEKPYKCNKCGKSFSQSTYLIEHQRLHSGVKPFECNECGKAFSKNSS
       .::.:. :.:.:::::::.:..:::.: :::.: .:::.:.: ::.:::.::::::..::
CCDS54 HSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSS
            480       490       500       510       520       530  

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pF1KB8 LTQHRRIHTGEKPYECMVCGKHFTGRSSLTVHQVIHTGEKPYECNECGKAFSQSAYLIEH
       ::.:.:::::::::::  ::. :.  . :  :: :::::::::::.::.:::::. ::::
CCDS54 LTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEH
            540       550       560       570       580       590  

              410       420       430       440       450       460
pF1KB8 QRIHTGEKPYECDQCGKAFIKNSSLTVHQRTHTGEKPYQCNECGKAFSRSTNLTRHQRTH
       ::::: :::: :..:::.: ..:::. :.:::::::::.:..:::.: .::.::.:.: :
CCDS54 QRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIH
            600       610       620       630       640       650  

                                     
pF1KB8 T                             
       :                             
CCDS54 TGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
            660       670       680  

>>CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19           (580 aa)
 initn: 1903 init1: 1903 opt: 1903  Z-score: 1145.8  bits: 221.6 E(32554): 1.7e-57
Smith-Waterman score: 1903; 63.0% identity (86.5% similar) in 392 aa overlap (70-461:154-545)

      40        50        60        70        80        90         
pF1KB8 FTEMRVCGGNEFERCSSQDSILDTQQSIPMVKRPHNCNSHGEDATQNSELIKTQRMFVGK
                                     :  : .::. :.: ... .::. .:. .:.
CCDS56 NLDLLRYEKGCVREKQSNEFGKPFYHCASYVVTPFKCNQCGQDFSHKFDLIRHERIHAGE
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     100       110       120       130       140       150         
pF1KB8 KIYECNQCSKTFSQSSSLLKHQRIHTGEKPYKCNVCGKHFIERSSLTVHQRIHTGEKPYK
       : :::..:.:.::.. .:. ::.::::::::::: ::: ::. :.:  :.::::::::: 
CCDS56 KPYECKECGKAFSRKENLITHQKIHTGEKPYKCNECGKAFIQMSNLIRHHRIHTGEKPYA
           190       200       210       220       230       240   

     160       170       180       190       200       210         
pF1KB8 CNECGKAFSQSMNLTVHQRTHTGEKPYQCKECGKAFHKNSSLIQHERIHTGEKPYKCNEC
       :..: :::::. ::  :.: :::::::.::::::.: ....::.::.:::::::: ::::
CCDS56 CKDCWKAFSQKSNLIEHERIHTGEKPYECKECGKSFSQKQNLIEHEKIHTGEKPYACNEC
           250       260       270       280       290       300   

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pF1KB8 GKAFTQSMNLTVHQRTHTGEKPYECNECGKAFSQSMHLIVHQRSHTGEKPYECSQCGKAF
       :.::..  ..:.:.:.:::::::.::.:::::::   .:.:.::::::::: ::.:::::
CCDS56 GRAFSRMSSVTLHMRSHTGEKPYKCNKCGKAFSQCSVFIIHMRSHTGEKPYVCSECGKAF
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     280       290       300       310       320       330         
pF1KB8 SKSSTLTLHQRNHTGEKPYKCNKCGKSFSQSTYLIEHQRLHSGVKPFECNECGKAFSKNS
       :.::.::.:.::::.::::.:..:::.::..  :: ::..:.: ::.::.:::::: . :
CCDS56 SQSSSLTVHMRNHTAEKPYECKECGKAFSRKENLITHQKIHTGEKPYECSECGKAFIQMS
           370       380       390       400       410       420   

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pF1KB8 SLTQHRRIHTGEKPYECMVCGKHFTGRSSLTVHQVIHTGEKPYECNECGKAFSQSAYLIE
       .: .:.::::::::: : :::: :. .:.:: :. ::::::::.::.:::::::   :.:
CCDS56 NLIRHQRIHTGEKPYACTVCGKAFSQKSNLTEHEKIHTGEKPYHCNQCGKAFSQRQNLLE
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pF1KB8 HQRIHTGEKPYECDQCGKAFIKNSSLTVHQRTHTGEKPYQCNECGKAFSRSTNLTRHQRT
       :..:::::::..:..::::: . ::::.: :.:::::::.::.::::::. . :  :.:.
CCDS56 HEKIHTGEKPFKCNECGKAFSRISSLTLHVRSHTGEKPYECNKCGKAFSQCSLLIIHMRS
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pF1KB8 HT                                   
       ::                                   
CCDS56 HTGEKPFECNECGKAFSQRASLSIHKRGHTGERHQVY
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>>CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19           (644 aa)
 initn: 1903 init1: 1903 opt: 1903  Z-score: 1145.2  bits: 221.7 E(32554): 1.8e-57
Smith-Waterman score: 1903; 63.0% identity (86.5% similar) in 392 aa overlap (70-461:218-609)

      40        50        60        70        80        90         
pF1KB8 FTEMRVCGGNEFERCSSQDSILDTQQSIPMVKRPHNCNSHGEDATQNSELIKTQRMFVGK
                                     :  : .::. :.: ... .::. .:. .:.
CCDS42 NLDLLRYEKGCVREKQSNEFGKPFYHCASYVVTPFKCNQCGQDFSHKFDLIRHERIHAGE
       190       200       210       220       230       240       

     100       110       120       130       140       150         
pF1KB8 KIYECNQCSKTFSQSSSLLKHQRIHTGEKPYKCNVCGKHFIERSSLTVHQRIHTGEKPYK
       : :::..:.:.::.. .:. ::.::::::::::: ::: ::. :.:  :.::::::::: 
CCDS42 KPYECKECGKAFSRKENLITHQKIHTGEKPYKCNECGKAFIQMSNLIRHHRIHTGEKPYA
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pF1KB8 CNECGKAFSQSMNLTVHQRTHTGEKPYQCKECGKAFHKNSSLIQHERIHTGEKPYKCNEC
       :..: :::::. ::  :.: :::::::.::::::.: ....::.::.:::::::: ::::
CCDS42 CKDCWKAFSQKSNLIEHERIHTGEKPYECKECGKSFSQKQNLIEHEKIHTGEKPYACNEC
       310       320       330       340       350       360       

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pF1KB8 GKAFTQSMNLTVHQRTHTGEKPYECNECGKAFSQSMHLIVHQRSHTGEKPYECSQCGKAF
       :.::..  ..:.:.:.:::::::.::.:::::::   .:.:.::::::::: ::.:::::
CCDS42 GRAFSRMSSVTLHMRSHTGEKPYKCNKCGKAFSQCSVFIIHMRSHTGEKPYVCSECGKAF
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pF1KB8 SKSSTLTLHQRNHTGEKPYKCNKCGKSFSQSTYLIEHQRLHSGVKPFECNECGKAFSKNS
       :.::.::.:.::::.::::.:..:::.::..  :: ::..:.: ::.::.:::::: . :
CCDS42 SQSSSLTVHMRNHTAEKPYECKECGKAFSRKENLITHQKIHTGEKPYECSECGKAFIQMS
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pF1KB8 SLTQHRRIHTGEKPYECMVCGKHFTGRSSLTVHQVIHTGEKPYECNECGKAFSQSAYLIE
       .: .:.::::::::: : :::: :. .:.:: :. ::::::::.::.:::::::   :.:
CCDS42 NLIRHQRIHTGEKPYACTVCGKAFSQKSNLTEHEKIHTGEKPYHCNQCGKAFSQRQNLLE
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pF1KB8 HQRIHTGEKPYECDQCGKAFIKNSSLTVHQRTHTGEKPYQCNECGKAFSRSTNLTRHQRT
       :..:::::::..:..::::: . ::::.: :.:::::::.::.::::::. . :  :.:.
CCDS42 HEKIHTGEKPFKCNECGKAFSRISSLTLHVRSHTGEKPYECNKCGKAFSQCSLLIIHMRS
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pF1KB8 HT                                   
       ::                                   
CCDS42 HTGEKPFECNECGKAFSQRASLSIHKRGHTGERHQVY
       610       620       630       640    

>>CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19            (678 aa)
 initn: 1850 init1: 1850 opt: 1869  Z-score: 1125.1  bits: 218.0 E(32554): 2.4e-56
Smith-Waterman score: 1869; 58.4% identity (79.4% similar) in 437 aa overlap (25-461:189-621)

                     10        20        30        40        50    
pF1KB8       MEREGIWHSTLGETWEPNNWLEGQQDSHLSQVGVTHKETFTEMRVCGGNEFERC
                                     :.:.:.    .::.  :  .    :.  . 
CCDS46 GKIYEYNQVEKSPNNRGKHYKCDECGKVFSQNSRLT----SHKRIHTGEKPYQCNKCGKA
      160       170       180       190           200       210    

           60        70        80        90       100       110    
pF1KB8 SSQDSILDTQQSIPMVKRPHNCNSHGEDATQNSELIKTQRMFVGKKIYECNQCSKTFSQS
        .  : :  .: :   ..:..::  :.  .: :.:   ::. .:.: :.::.:.:.:   
CCDS46 FTVRSNLTIHQVIHTGEKPYKCNECGKVFSQPSNLAGHQRIHTGEKPYKCNECGKAFRAH
          220       230       240       250       260       270    

          120       130       140       150       160       170    
pF1KB8 SSLLKHQRIHTGEKPYKCNVCGKHFIERSSLTVHQRIHTGEKPYKCNECGKAFSQSMNLT
       :.:  :: ::::::::::. ::: : . : :. :.:::::::::::::::::::   .::
CCDS46 SKLTTHQVIHTGEKPYKCKECGKCFTQNSHLASHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLT
          280       290       300       310       320       330    

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pF1KB8 VHQRTHTGEKPYQCKECGKAFHKNSSLIQHERIHTGEKPYKCNECGKAFTQSMNLTVHQR
       .::  :::::::.:.::::.:..:: : .:.::::::::::::::::::..  ::: :: 
CCDS46 THQTIHTGEKPYKCNECGKVFRHNSYLAKHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTKHQI
          340       350       360       370       380       390    

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pF1KB8 THTGEKPYECNECGKAFSQSMHLIVHQRSHTGEKPYECSQCGKAFSKSSTLTLHQRNHTG
        ::::::..:::: :.:.:  ::  :.: :::::::.:..::::::  :.:: ::  :::
CCDS46 IHTGEKPFKCNECVKVFTQYSHLANHRRIHTGEKPYRCDECGKAFSVRSSLTTHQAIHTG
          400       410       420       430       440       450    

          300       310       320       330       340       350    
pF1KB8 EKPYKCNKCGKSFSQSTYLIEHQRLHSGVKPFECNECGKAFSKNSSLTQHRRIHTGEKPY
       ::::::: ::: :.:...:  :. .::: ::..:.:::::::..:.:..: :.:::::::
CCDS46 EKPYKCNDCGKVFTQNSHLASHRGIHSGEKPYKCDECGKAFSQTSQLARHWRVHTGEKPY
          460       470       480       490       500       510    

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pF1KB8 ECMVCGKHFTGRSSLTVHQVIHTGEKPYECNECGKAFSQSAYLIEHQRIHTGEKPYECDQ
       .:  ::: :. .::::.::.::::.:::.::.:::.: ...::  :::::::::::.:..
CCDS46 KCNECGKAFSVHSSLTIHQTIHTGQKPYKCNDCGKVFRHNSYLAIHQRIHTGEKPYKCNE
          520       530       540       550       560       570    

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pF1KB8 CGKAFIKNSSLTVHQRTHTGEKPYQCNECGKAFSRSTNLTRHQRTHT             
       :::::  .:.:..::  :::::::.::::::.:.....:. :.: ::             
CCDS46 CGKAFSVHSNLATHQVIHTGEKPYKCNECGKVFTQNSHLANHRRIHTGEKPYRCNECGKA
          580       590       600       610       620       630    

CCDS46 FSVRSTLTTHMAVHTGDKPYKCNQCGKVFTQNSNLAKHRRIHSG
          640       650       660       670        

>>CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19            (839 aa)
 initn: 1861 init1: 1861 opt: 1861  Z-score: 1119.3  bits: 217.3 E(32554): 5e-56
Smith-Waterman score: 1861; 59.3% identity (79.6% similar) in 427 aa overlap (35-461:306-732)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KB8 GIWHSTLGETWEPNNWLEGQQDSHLSQVGVTHKETFTEMRVCGGNEFERCSSQDSILDTQ
                                     ::.   :  .    ::  .  :..: :. .
CCDS33 LASHQRSHTKEKPYKCYECGKAFRTRSNLTTHQVIHTGEKRYKCNECGKVFSRNSQLSQH
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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