Result of FASTA (omim) for pF1KB8836
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8836, 461 aa
  1>>>pF1KB8836 461 - 461 aa - 461 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0090+/-0.00107; mu= 6.3855+/- 0.066
 mean_var=372.1086+/-78.718, 0's: 0 Z-trim(107.8): 2070  B-trim: 78 in 1/48
 Lambda= 0.066487
 statistics sampled from 13586 (15898) to 13586 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.46), E-opt: 0.2 (0.186), width:  16
 Scan time:  7.130

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
XP_016882569 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 489) 2231 229.7 1.4e-59
NP_067039 (OMIM: 194545) endothelial zinc finger p ( 489) 2231 229.7 1.4e-59
XP_016882568 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 549) 2231 229.7 1.5e-59
XP_011525495 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 549) 2231 229.7 1.5e-59
XP_016882567 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 549) 2231 229.7 1.5e-59
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1938 201.7 4.6e-51
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1938 201.7 4.6e-51
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1938 201.7 4.6e-51
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1938 201.8 4.7e-51
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1938 201.8 4.7e-51
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1938 201.8 4.8e-51
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1938 201.8 4.8e-51
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1938 201.8 4.8e-51
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1938 201.8 4.8e-51
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1938 201.8 4.8e-51
XP_011543981 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1862 194.8 9.6e-49
NP_001304845 (OMIM: 616290) zinc finger protein 65 (1059) 1862 194.8 9.6e-49
XP_005272572 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1862 194.8 9.6e-49
NP_149350 (OMIM: 616290) zinc finger protein 658 [ (1059) 1862 194.8 9.6e-49
XP_016870103 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1862 194.8 9.6e-49
XP_016881868 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1848 193.0 1.7e-48
XP_016881871 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1848 193.0 1.7e-48
XP_016881869 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1848 193.0 1.7e-48
NP_001317411 (OMIM: 613904) zinc finger protein 56 ( 527) 1848 193.0 1.7e-48
XP_016881867 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 650) 1848 193.1 1.9e-48
XP_016881865 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1848 193.2 1.9e-48
XP_016881866 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1848 193.2 1.9e-48
XP_011524841 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1848 193.2 1.9e-48
NP_689697 (OMIM: 613904) zinc finger protein 569 i ( 686) 1848 193.2 1.9e-48
XP_006723111 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1848 193.2   2e-48
XP_011524840 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1848 193.2   2e-48
XP_006723110 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1848 193.2   2e-48
XP_006723109 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1848 193.2   2e-48
NP_008887 (OMIM: 194536) zinc finger protein 12 is ( 659) 1838 192.2 3.7e-48
NP_057349 (OMIM: 194536) zinc finger protein 12 is ( 697) 1838 192.2 3.8e-48
NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1838 192.3   4e-48
NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1838 192.3   4e-48
NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1838 192.3   4e-48
NP_001309059 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1838 192.3 4.1e-48
NP_001309057 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1838 192.3 4.1e-48
NP_001309064 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1838 192.3 4.1e-48
NP_150630 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 1838 192.3 4.1e-48
NP_001096073 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1838 192.3 4.1e-48
NP_942596 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 1838 192.3 4.1e-48
XP_016882935 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 818) 1838 192.3 4.1e-48
NP_001309063 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1838 192.3 4.1e-48
NP_001309060 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1838 192.3 4.1e-48
NP_001309065 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1838 192.3 4.1e-48
NP_001309062 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1838 192.3 4.1e-48
NP_001309058 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1838 192.3 4.1e-48


>>XP_016882569 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial zin  (489 aa)
 initn: 2187 init1: 2187 opt: 2231  Z-score: 1190.6  bits: 229.7 E(85289): 1.4e-59
Smith-Waterman score: 2231; 68.5% identity (84.9% similar) in 451 aa overlap (15-461:39-489)

                               10        20           30        40 
pF1KB8                 MEREGIWHSTLGETWEPNNWLE---GQQDSHLSQVGVTHKETFT
                                     :::..: :   :.  ..   .:. . . . 
XP_016 DISEDKLSVVGEATGGPTRNGARGPGSEGVWEPGSWPERPRGDAGAEWEPLGIPQGNKLL
       10        20        30        40        50        60        

              50        60         70        80        90       100
pF1KB8 EMRVCGGNEFERCSSQDSIL-DTQQSIPMVKRPHNCNSHGEDATQNSELIKTQRMFVGKK
          : . .:..  ..:  .:   . . :  :       .:.. ...:.: :       ::
XP_016 GGSVPACHELKAFANQGCVLVPPRLDDPTEKGACPPVRRGKNFSSTSDLSKPPMPCEEKK
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              110       120       130       140       150       160
pF1KB8 IYECNQCSKTFSQSSSLLKHQRIHTGEKPYKCNVCGKHFIERSSLTVHQRIHTGEKPYKC
        :.:..:.:.::.::::.:::::::::::..:..::::::::::::.:::.::::::: :
XP_016 TYDCSECGKAFSRSSSLIKHQRIHTGEKPFECDTCGKHFIERSSLTIHQRVHTGEKPYAC
      130       140       150       160       170       180        

              170       180       190       200       210       220
pF1KB8 NECGKAFSQSMNLTVHQRTHTGEKPYQCKECGKAFHKNSSLIQHERIHTGEKPYKCNECG
       ..::::::: :::::::::::::::: :  :::::.:.::: :::::::::::: :..::
XP_016 GDCGKAFSQRMNLTVHQRTHTGEKPYVCDVCGKAFRKTSSLTQHERIHTGEKPYACGDCG
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              230       240       250       260       270       280
pF1KB8 KAFTQSMNLTVHQRTHTGEKPYECNECGKAFSQSMHLIVHQRSHTGEKPYECSQCGKAFS
       :::.:.:.: :::::::::::: : :::.::::.:::  :::.::::::: :..:::::.
XP_016 KAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPYVCPECGRAFSQNMHLTEHQRTHTGEKPYACKECGKAFN
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pF1KB8 KSSTLTLHQRNHTGEKPYKCNKCGKSFSQSTYLIEHQRLHSGVKPFECNECGKAFSKNSS
       :::.:::::::::::::: :..:::.::::.:::.:::.: :::::::.:::::::::::
XP_016 KSSSLTLHQRNHTGEKPYVCGECGKAFSQSSYLIQHQRFHIGVKPFECSECGKAFSKNSS
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              350       360       370       380       390       400
pF1KB8 LTQHRRIHTGEKPYECMVCGKHFTGRSSLTVHQVIHTGEKPYECNECGKAFSQSAYLIEH
       ::::.:::::::::::..: ::::::::: :::..::::::: :.:::::::::::::::
XP_016 LTQHQRIHTGEKPYECYICKKHFTGRSSLIVHQIVHTGEKPYVCGECGKAFSQSAYLIEH
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pF1KB8 QRIHTGEKPYECDQCGKAFIKNSSLTVHQRTHTGEKPYQCNECGKAFSRSTNLTRHQRTH
       ::::::::::.: ::::.:::::::::::: :::::::.:.::::.:::.:::::: : :
XP_016 QRIHTGEKPYRCGQCGKSFIKNSSLTVHQRIHTGEKPYRCGECGKTFSRNTNLTRHLRIH
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pF1KB8 T
       :
XP_016 T
        

>>NP_067039 (OMIM: 194545) endothelial zinc finger prote  (489 aa)
 initn: 2187 init1: 2187 opt: 2231  Z-score: 1190.6  bits: 229.7 E(85289): 1.4e-59
Smith-Waterman score: 2231; 68.5% identity (84.9% similar) in 451 aa overlap (15-461:39-489)

                               10        20           30        40 
pF1KB8                 MEREGIWHSTLGETWEPNNWLE---GQQDSHLSQVGVTHKETFT
                                     :::..: :   :.  ..   .:. . . . 
NP_067 DISEDKLSVVGEATGGPTRNGARGPGSEGVWEPGSWPERPRGDAGAEWEPLGIPQGNKLL
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              50        60         70        80        90       100
pF1KB8 EMRVCGGNEFERCSSQDSIL-DTQQSIPMVKRPHNCNSHGEDATQNSELIKTQRMFVGKK
          : . .:..  ..:  .:   . . :  :       .:.. ...:.: :       ::
NP_067 GGSVPACHELKAFANQGCVLVPPRLDDPTEKGACPPVRRGKNFSSTSDLSKPPMPCEEKK
       70        80        90       100       110       120        

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pF1KB8 IYECNQCSKTFSQSSSLLKHQRIHTGEKPYKCNVCGKHFIERSSLTVHQRIHTGEKPYKC
        :.:..:.:.::.::::.:::::::::::..:..::::::::::::.:::.::::::: :
NP_067 TYDCSECGKAFSRSSSLIKHQRIHTGEKPFECDTCGKHFIERSSLTIHQRVHTGEKPYAC
      130       140       150       160       170       180        

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pF1KB8 NECGKAFSQSMNLTVHQRTHTGEKPYQCKECGKAFHKNSSLIQHERIHTGEKPYKCNECG
       ..::::::: :::::::::::::::: :  :::::.:.::: :::::::::::: :..::
NP_067 GDCGKAFSQRMNLTVHQRTHTGEKPYVCDVCGKAFRKTSSLTQHERIHTGEKPYACGDCG
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pF1KB8 KAFTQSMNLTVHQRTHTGEKPYECNECGKAFSQSMHLIVHQRSHTGEKPYECSQCGKAFS
       :::.:.:.: :::::::::::: : :::.::::.:::  :::.::::::: :..:::::.
NP_067 KAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPYVCPECGRAFSQNMHLTEHQRTHTGEKPYACKECGKAFN
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pF1KB8 KSSTLTLHQRNHTGEKPYKCNKCGKSFSQSTYLIEHQRLHSGVKPFECNECGKAFSKNSS
       :::.:::::::::::::: :..:::.::::.:::.:::.: :::::::.:::::::::::
NP_067 KSSSLTLHQRNHTGEKPYVCGECGKAFSQSSYLIQHQRFHIGVKPFECSECGKAFSKNSS
      310       320       330       340       350       360        

              350       360       370       380       390       400
pF1KB8 LTQHRRIHTGEKPYECMVCGKHFTGRSSLTVHQVIHTGEKPYECNECGKAFSQSAYLIEH
       ::::.:::::::::::..: ::::::::: :::..::::::: :.:::::::::::::::
NP_067 LTQHQRIHTGEKPYECYICKKHFTGRSSLIVHQIVHTGEKPYVCGECGKAFSQSAYLIEH
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pF1KB8 QRIHTGEKPYECDQCGKAFIKNSSLTVHQRTHTGEKPYQCNECGKAFSRSTNLTRHQRTH
       ::::::::::.: ::::.:::::::::::: :::::::.:.::::.:::.:::::: : :
NP_067 QRIHTGEKPYRCGQCGKSFIKNSSLTVHQRIHTGEKPYRCGECGKTFSRNTNLTRHLRIH
      430       440       450       460       470       480        

        
pF1KB8 T
       :
NP_067 T
        

>>XP_016882568 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial zin  (549 aa)
 initn: 2187 init1: 2187 opt: 2231  Z-score: 1190.1  bits: 229.7 E(85289): 1.5e-59
Smith-Waterman score: 2231; 68.5% identity (84.9% similar) in 451 aa overlap (15-461:99-549)

                               10        20           30        40 
pF1KB8                 MEREGIWHSTLGETWEPNNWLE---GQQDSHLSQVGVTHKETFT
                                     :::..: :   :.  ..   .:. . . . 
XP_016 DISEDKLSVVGEATGGPTRNGARGPGSEGVWEPGSWPERPRGDAGAEWEPLGIPQGNKLL
       70        80        90       100       110       120        

              50        60         70        80        90       100
pF1KB8 EMRVCGGNEFERCSSQDSIL-DTQQSIPMVKRPHNCNSHGEDATQNSELIKTQRMFVGKK
          : . .:..  ..:  .:   . . :  :       .:.. ...:.: :       ::
XP_016 GGSVPACHELKAFANQGCVLVPPRLDDPTEKGACPPVRRGKNFSSTSDLSKPPMPCEEKK
      130       140       150       160       170       180        

              110       120       130       140       150       160
pF1KB8 IYECNQCSKTFSQSSSLLKHQRIHTGEKPYKCNVCGKHFIERSSLTVHQRIHTGEKPYKC
        :.:..:.:.::.::::.:::::::::::..:..::::::::::::.:::.::::::: :
XP_016 TYDCSECGKAFSRSSSLIKHQRIHTGEKPFECDTCGKHFIERSSLTIHQRVHTGEKPYAC
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pF1KB8 NECGKAFSQSMNLTVHQRTHTGEKPYQCKECGKAFHKNSSLIQHERIHTGEKPYKCNECG
       ..::::::: :::::::::::::::: :  :::::.:.::: :::::::::::: :..::
XP_016 GDCGKAFSQRMNLTVHQRTHTGEKPYVCDVCGKAFRKTSSLTQHERIHTGEKPYACGDCG
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pF1KB8 KAFTQSMNLTVHQRTHTGEKPYECNECGKAFSQSMHLIVHQRSHTGEKPYECSQCGKAFS
       :::.:.:.: :::::::::::: : :::.::::.:::  :::.::::::: :..:::::.
XP_016 KAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPYVCPECGRAFSQNMHLTEHQRTHTGEKPYACKECGKAFN
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pF1KB8 KSSTLTLHQRNHTGEKPYKCNKCGKSFSQSTYLIEHQRLHSGVKPFECNECGKAFSKNSS
       :::.:::::::::::::: :..:::.::::.:::.:::.: :::::::.:::::::::::
XP_016 KSSSLTLHQRNHTGEKPYVCGECGKAFSQSSYLIQHQRFHIGVKPFECSECGKAFSKNSS
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pF1KB8 LTQHRRIHTGEKPYECMVCGKHFTGRSSLTVHQVIHTGEKPYECNECGKAFSQSAYLIEH
       ::::.:::::::::::..: ::::::::: :::..::::::: :.:::::::::::::::
XP_016 LTQHQRIHTGEKPYECYICKKHFTGRSSLIVHQIVHTGEKPYVCGECGKAFSQSAYLIEH
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pF1KB8 QRIHTGEKPYECDQCGKAFIKNSSLTVHQRTHTGEKPYQCNECGKAFSRSTNLTRHQRTH
       ::::::::::.: ::::.:::::::::::: :::::::.:.::::.:::.:::::: : :
XP_016 QRIHTGEKPYRCGQCGKSFIKNSSLTVHQRIHTGEKPYRCGECGKTFSRNTNLTRHLRIH
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pF1KB8 T
       :
XP_016 T
        

>>XP_011525495 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial zin  (549 aa)
 initn: 2187 init1: 2187 opt: 2231  Z-score: 1190.1  bits: 229.7 E(85289): 1.5e-59
Smith-Waterman score: 2231; 68.5% identity (84.9% similar) in 451 aa overlap (15-461:99-549)

                               10        20           30        40 
pF1KB8                 MEREGIWHSTLGETWEPNNWLE---GQQDSHLSQVGVTHKETFT
                                     :::..: :   :.  ..   .:. . . . 
XP_011 DISEDKLSVVGEATGGPTRNGARGPGSEGVWEPGSWPERPRGDAGAEWEPLGIPQGNKLL
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pF1KB8 EMRVCGGNEFERCSSQDSIL-DTQQSIPMVKRPHNCNSHGEDATQNSELIKTQRMFVGKK
          : . .:..  ..:  .:   . . :  :       .:.. ...:.: :       ::
XP_011 GGSVPACHELKAFANQGCVLVPPRLDDPTEKGACPPVRRGKNFSSTSDLSKPPMPCEEKK
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pF1KB8 IYECNQCSKTFSQSSSLLKHQRIHTGEKPYKCNVCGKHFIERSSLTVHQRIHTGEKPYKC
        :.:..:.:.::.::::.:::::::::::..:..::::::::::::.:::.::::::: :
XP_011 TYDCSECGKAFSRSSSLIKHQRIHTGEKPFECDTCGKHFIERSSLTIHQRVHTGEKPYAC
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pF1KB8 NECGKAFSQSMNLTVHQRTHTGEKPYQCKECGKAFHKNSSLIQHERIHTGEKPYKCNECG
       ..::::::: :::::::::::::::: :  :::::.:.::: :::::::::::: :..::
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pF1KB8 KAFTQSMNLTVHQRTHTGEKPYECNECGKAFSQSMHLIVHQRSHTGEKPYECSQCGKAFS
       :::.:.:.: :::::::::::: : :::.::::.:::  :::.::::::: :..:::::.
XP_011 KAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPYVCPECGRAFSQNMHLTEHQRTHTGEKPYACKECGKAFN
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pF1KB8 KSSTLTLHQRNHTGEKPYKCNKCGKSFSQSTYLIEHQRLHSGVKPFECNECGKAFSKNSS
       :::.:::::::::::::: :..:::.::::.:::.:::.: :::::::.:::::::::::
XP_011 KSSSLTLHQRNHTGEKPYVCGECGKAFSQSSYLIQHQRFHIGVKPFECSECGKAFSKNSS
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pF1KB8 LTQHRRIHTGEKPYECMVCGKHFTGRSSLTVHQVIHTGEKPYECNECGKAFSQSAYLIEH
       ::::.:::::::::::..: ::::::::: :::..::::::: :.:::::::::::::::
XP_011 LTQHQRIHTGEKPYECYICKKHFTGRSSLIVHQIVHTGEKPYVCGECGKAFSQSAYLIEH
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pF1KB8 QRIHTGEKPYECDQCGKAFIKNSSLTVHQRTHTGEKPYQCNECGKAFSRSTNLTRHQRTH
       ::::::::::.: ::::.:::::::::::: :::::::.:.::::.:::.:::::: : :
XP_011 QRIHTGEKPYRCGQCGKSFIKNSSLTVHQRIHTGEKPYRCGECGKTFSRNTNLTRHLRIH
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pF1KB8 T
       :
XP_011 T
        

>>XP_016882567 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial zin  (549 aa)
 initn: 2187 init1: 2187 opt: 2231  Z-score: 1190.1  bits: 229.7 E(85289): 1.5e-59
Smith-Waterman score: 2231; 68.5% identity (84.9% similar) in 451 aa overlap (15-461:99-549)

                               10        20           30        40 
pF1KB8                 MEREGIWHSTLGETWEPNNWLE---GQQDSHLSQVGVTHKETFT
                                     :::..: :   :.  ..   .:. . . . 
XP_016 DISEDKLSVVGEATGGPTRNGARGPGSEGVWEPGSWPERPRGDAGAEWEPLGIPQGNKLL
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pF1KB8 EMRVCGGNEFERCSSQDSIL-DTQQSIPMVKRPHNCNSHGEDATQNSELIKTQRMFVGKK
          : . .:..  ..:  .:   . . :  :       .:.. ...:.: :       ::
XP_016 GGSVPACHELKAFANQGCVLVPPRLDDPTEKGACPPVRRGKNFSSTSDLSKPPMPCEEKK
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pF1KB8 IYECNQCSKTFSQSSSLLKHQRIHTGEKPYKCNVCGKHFIERSSLTVHQRIHTGEKPYKC
        :.:..:.:.::.::::.:::::::::::..:..::::::::::::.:::.::::::: :
XP_016 TYDCSECGKAFSRSSSLIKHQRIHTGEKPFECDTCGKHFIERSSLTIHQRVHTGEKPYAC
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pF1KB8 NECGKAFSQSMNLTVHQRTHTGEKPYQCKECGKAFHKNSSLIQHERIHTGEKPYKCNECG
       ..::::::: :::::::::::::::: :  :::::.:.::: :::::::::::: :..::
XP_016 GDCGKAFSQRMNLTVHQRTHTGEKPYVCDVCGKAFRKTSSLTQHERIHTGEKPYACGDCG
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pF1KB8 KAFTQSMNLTVHQRTHTGEKPYECNECGKAFSQSMHLIVHQRSHTGEKPYECSQCGKAFS
       :::.:.:.: :::::::::::: : :::.::::.:::  :::.::::::: :..:::::.
XP_016 KAFSQNMHLIVHQRTHTGEKPYVCPECGRAFSQNMHLTEHQRTHTGEKPYACKECGKAFN
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pF1KB8 KSSTLTLHQRNHTGEKPYKCNKCGKSFSQSTYLIEHQRLHSGVKPFECNECGKAFSKNSS
       :::.:::::::::::::: :..:::.::::.:::.:::.: :::::::.:::::::::::
XP_016 KSSSLTLHQRNHTGEKPYVCGECGKAFSQSSYLIQHQRFHIGVKPFECSECGKAFSKNSS
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pF1KB8 LTQHRRIHTGEKPYECMVCGKHFTGRSSLTVHQVIHTGEKPYECNECGKAFSQSAYLIEH
       ::::.:::::::::::..: ::::::::: :::..::::::: :.:::::::::::::::
XP_016 LTQHQRIHTGEKPYECYICKKHFTGRSSLIVHQIVHTGEKPYVCGECGKAFSQSAYLIEH
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pF1KB8 QRIHTGEKPYECDQCGKAFIKNSSLTVHQRTHTGEKPYQCNECGKAFSRSTNLTRHQRTH
       ::::::::::.: ::::.:::::::::::: :::::::.:.::::.:::.:::::: : :
XP_016 QRIHTGEKPYRCGQCGKSFIKNSSLTVHQRIHTGEKPYRCGECGKTFSRNTNLTRHLRIH
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pF1KB8 T
       :
XP_016 T
        

>>NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 is  (616 aa)
 initn: 1926 init1: 1926 opt: 1938  Z-score: 1037.8  bits: 201.7 E(85289): 4.6e-51
Smith-Waterman score: 1938; 59.2% identity (80.3% similar) in 451 aa overlap (13-461:141-587)

                                 10        20         30        40 
pF1KB8                   MEREGIWHSTLGETWEPNNW-LEGQQDSHLSQVGVTHKETFT
                                     :   :..:  .:....   ...: .:    
NP_001 KTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREK--PDLNVLQKTCVK
              120       130       140       150         160        

               50        60        70        80        90       100
pF1KB8 EMRV-CGGNEFERCSSQDSILDTQQSIPMVKRPHNCNSHGEDATQNSELIKTQRMFVGKK
       :    :  .:  .  :..: :  ..     .::..:.   .   ..: : : ::. .:.:
NP_001 EKPYKC--QECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNSSALTKHQRIHTGEK
      170         180       190       200       210       220      

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pF1KB8 IYECNQCSKTFSQSSSLLKHQRIHTGEKPYKCNVCGKHFIERSSLTVHQRIHTGEKPYKC
        :.:.::..::.: . :..::: :::::::.:. ::: :  :::.. :.: :::::::.:
NP_001 PYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYEC
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pF1KB8 NECGKAFSQSMNLTVHQRTHTGEKPYQCKECGKAFHKNSSLIQHERIHTGEKPYKCNECG
       .:::::: ::..:: : : ::::::::: :::::: ..::: .:.:::::::::.:.:::
NP_001 SECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECG
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pF1KB8 KAFTQSMNLTVHQRTHTGEKPYECNECGKAFSQSMHLIVHQRSHTGEKPYECSQCGKAFS
       :::::   :  :::::::::::::.:::::::::  :  :.: ::::::: :..:::.::
NP_001 KAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFS
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pF1KB8 KSSTLTLHQRNHTGEKPYKCNKCGKSFSQSTYLIEHQRLHSGVKPFECNECGKAFSKNSS
       .::.:. :.:.:::::::.:..:::.: :::.: .:::.:.: ::.:::.::::::..::
NP_001 HSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSS
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pF1KB8 LTQHRRIHTGEKPYECMVCGKHFTGRSSLTVHQVIHTGEKPYECNECGKAFSQSAYLIEH
       ::.:.:::::::::::  ::. :.  . :  :: :::::::::::.::.:::::. ::::
NP_001 LTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEH
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       ::::: :::: :..:::.: ..:::. :.:::::::::.:..:::.: .::.::.:.: :
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pF1KB8 T                             
       :                             
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       .:::::: ::..:: : : ::::::::: :::::: ..::: .:.:::::::::.:.:::
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       :::::   :  :::::::::::::.:::::::::  :  :.: ::::::: :..:::.::
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       ::.:.:::::::::::  ::. :.  . :  :: :::::::::::.::.:::::. ::::
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       ::::: :::: :..:::.: ..:::. :.:::::::::.:..:::.: .::.::.:.: :
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pF1KB8 T                             
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       .:::::: ::..:: : : ::::::::: :::::: ..::: .:.:::::::::.:.:::
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       :::::   :  :::::::::::::.:::::::::  :  :.: ::::::: :..:::.::
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       ::.:.:::::::::::  ::. :.  . :  :: :::::::::::.::.:::::. ::::
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       ::::: :::: :..:::.: ..:::. :.:::::::::.:..:::.: .::.::.:.: :
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pF1KB8 T                             
       :                             
XP_016 TGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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pF1KB8 NECGKAFSQSMNLTVHQRTHTGEKPYQCKECGKAFHKNSSLIQHERIHTGEKPYKCNECG
       .:::::: ::..:: : : ::::::::: :::::: ..::: .:.:::::::::.:.:::
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       :::::   :  :::::::::::::.:::::::::  :  :.: ::::::: :..:::.::
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pF1KB8 QRIHTGEKPYECDQCGKAFIKNSSLTVHQRTHTGEKPYQCNECGKAFSRSTNLTRHQRTH
       ::::: :::: :..:::.: ..:::. :.:::::::::.:..:::.: .::.::.:.: :
XP_016 QRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIH
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pF1KB8 T                             
       :                             
XP_016 TGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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>>NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 is  (658 aa)
 initn: 1926 init1: 1926 opt: 1938  Z-score: 1037.5  bits: 201.8 E(85289): 4.7e-51
Smith-Waterman score: 1938; 59.2% identity (80.3% similar) in 451 aa overlap (13-461:183-629)

                                 10        20         30        40 
pF1KB8                   MEREGIWHSTLGETWEPNNW-LEGQQDSHLSQVGVTHKETFT
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NP_001 KTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREK--PDLNVLQKTCVK
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