FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB8836, 461 aa 1>>>pF1KB8836 461 - 461 aa - 461 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0090+/-0.00107; mu= 6.3855+/- 0.066 mean_var=372.1086+/-78.718, 0's: 0 Z-trim(107.8): 2070 B-trim: 78 in 1/48 Lambda= 0.066487 statistics sampled from 13586 (15898) to 13586 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.46), E-opt: 0.2 (0.186), width: 16 Scan time: 7.130 The best scores are: opt bits E(85289) XP_016882569 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 489) 2231 229.7 1.4e-59 NP_067039 (OMIM: 194545) endothelial zinc finger p ( 489) 2231 229.7 1.4e-59 XP_016882568 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 549) 2231 229.7 1.5e-59 XP_011525495 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 549) 2231 229.7 1.5e-59 XP_016882567 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial ( 549) 2231 229.7 1.5e-59 NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1938 201.7 4.6e-51 XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1938 201.7 4.6e-51 XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1938 201.7 4.6e-51 XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1938 201.8 4.7e-51 NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1938 201.8 4.7e-51 XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1938 201.8 4.8e-51 XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1938 201.8 4.8e-51 XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1938 201.8 4.8e-51 NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1938 201.8 4.8e-51 NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1938 201.8 4.8e-51 XP_011543981 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1862 194.8 9.6e-49 NP_001304845 (OMIM: 616290) zinc finger protein 65 (1059) 1862 194.8 9.6e-49 XP_005272572 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1862 194.8 9.6e-49 NP_149350 (OMIM: 616290) zinc finger protein 658 [ (1059) 1862 194.8 9.6e-49 XP_016870103 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1862 194.8 9.6e-49 XP_016881868 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1848 193.0 1.7e-48 XP_016881871 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1848 193.0 1.7e-48 XP_016881869 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 527) 1848 193.0 1.7e-48 NP_001317411 (OMIM: 613904) zinc finger protein 56 ( 527) 1848 193.0 1.7e-48 XP_016881867 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 650) 1848 193.1 1.9e-48 XP_016881865 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1848 193.2 1.9e-48 XP_016881866 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1848 193.2 1.9e-48 XP_011524841 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 1848 193.2 1.9e-48 NP_689697 (OMIM: 613904) zinc finger protein 569 i ( 686) 1848 193.2 1.9e-48 XP_006723111 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1848 193.2 2e-48 XP_011524840 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1848 193.2 2e-48 XP_006723110 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1848 193.2 2e-48 XP_006723109 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 1848 193.2 2e-48 NP_008887 (OMIM: 194536) zinc finger protein 12 is ( 659) 1838 192.2 3.7e-48 NP_057349 (OMIM: 194536) zinc finger protein 12 is ( 697) 1838 192.2 3.8e-48 NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1838 192.3 4e-48 NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1838 192.3 4e-48 NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 1838 192.3 4e-48 NP_001309059 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1838 192.3 4.1e-48 NP_001309057 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1838 192.3 4.1e-48 NP_001309064 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1838 192.3 4.1e-48 NP_150630 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 1838 192.3 4.1e-48 NP_001096073 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1838 192.3 4.1e-48 NP_942596 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 1838 192.3 4.1e-48 XP_016882935 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 818) 1838 192.3 4.1e-48 NP_001309063 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1838 192.3 4.1e-48 NP_001309060 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1838 192.3 4.1e-48 NP_001309065 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1838 192.3 4.1e-48 NP_001309062 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1838 192.3 4.1e-48 NP_001309058 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 1838 192.3 4.1e-48 >>XP_016882569 (OMIM: 194545) PREDICTED: endothelial zin (489 aa) initn: 2187 init1: 2187 opt: 2231 Z-score: 1190.6 bits: 229.7 E(85289): 1.4e-59 Smith-Waterman score: 2231; 68.5% identity (84.9% similar) in 451 aa overlap (15-461:39-489) 10 20 30 40 pF1KB8 MEREGIWHSTLGETWEPNNWLE---GQQDSHLSQVGVTHKETFT :::..: : :. .. .:. . . . 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