FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB8844, 522 aa 1>>>pF1KB8844 522 - 522 aa - 522 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4405+/-0.000462; mu= 18.4671+/- 0.028 mean_var=119.7195+/-25.558, 0's: 0 Z-trim(113.3): 430 B-trim: 851 in 1/50 Lambda= 0.117217 statistics sampled from 21976 (22547) to 21976 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.628), E-opt: 0.2 (0.264), width: 16 Scan time: 9.980 The best scores are: opt bits E(85289) XP_016859475 (OMIM: 610867) PREDICTED: leucine-ric ( 522) 3549 612.1 1.3e-174 NP_849161 (OMIM: 610867) leucine-rich repeat trans ( 522) 3549 612.1 1.3e-174 XP_016859476 (OMIM: 610867) PREDICTED: leucine-ric ( 522) 3549 612.1 1.3e-174 NP_056379 (OMIM: 610868) leucine-rich repeat trans ( 516) 1667 293.8 8.1e-79 NP_821079 (OMIM: 610869) leucine-rich repeat trans ( 581) 1647 290.5 9.2e-78 NP_079269 (OMIM: 610870) leucine-rich repeat trans ( 518) 1631 287.7 5.6e-77 NP_001269857 (OMIM: 610870) leucine-rich repeat tr ( 519) 1628 287.2 7.9e-77 NP_001128217 (OMIM: 610870) leucine-rich repeat tr ( 590) 1627 287.1 9.6e-77 NP_001269853 (OMIM: 610870) leucine-rich repeat tr ( 590) 1627 287.1 9.6e-77 NP_001317299 (OMIM: 610870) leucine-rich repeat tr ( 591) 1624 286.6 1.4e-76 NP_612490 (OMIM: 616236) chondroadherin-like prote ( 762) 496 96.0 4.3e-19 XP_005261427 (OMIM: 616236) PREDICTED: chondroadhe ( 771) 496 96.0 4.3e-19 XP_011528236 (OMIM: 616236) PREDICTED: chondroadhe ( 825) 416 82.5 5.3e-15 XP_011528235 (OMIM: 616236) PREDICTED: chondroadhe ( 830) 416 82.5 5.3e-15 XP_011528234 (OMIM: 616236) PREDICTED: chondroadhe ( 839) 416 82.5 5.4e-15 NP_001017403 (OMIM: 606653) leucine-rich repeat-co ( 967) 410 81.6 1.2e-14 NP_055632 (OMIM: 613356) TLR4 interactor with leuc ( 811) 406 80.8 1.7e-14 NP_001264155 (OMIM: 606667) leucine-rich repeat-co ( 883) 403 80.4 2.5e-14 NP_003658 (OMIM: 606667) leucine-rich repeat-conta ( 907) 389 78.0 1.3e-13 NP_612449 (OMIM: 608843) vasorin precursor [Homo s ( 673) 369 74.5 1.2e-12 XP_011530477 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 760) 369 74.5 1.2e-12 XP_016864008 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 703) 362 73.3 2.7e-12 XP_016864009 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 703) 362 73.3 2.7e-12 NP_001240656 (OMIM: 606654) relaxin receptor 1 iso ( 784) 362 73.4 2.9e-12 NP_001073982 (OMIM: 603104) carboxypeptidase N sub ( 545) 358 72.5 3.7e-12 XP_005269337 (OMIM: 603104) PREDICTED: carboxypept ( 545) 358 72.5 3.7e-12 NP_001278917 (OMIM: 603104) carboxypeptidase N sub ( 545) 358 72.5 3.7e-12 XP_011530481 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 412) 355 71.8 4.3e-12 XP_011530478 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 733) 357 72.5 5e-12 XP_016864006 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 759) 357 72.5 5.1e-12 XP_016885213 (OMIM: 300106,301870) PREDICTED: bigl ( 368) 351 71.1 6.5e-12 NP_001702 (OMIM: 300106,301870) biglycan prepropro ( 368) 351 71.1 6.5e-12 NP_002336 (OMIM: 600616) lumican precursor [Homo s ( 338) 349 70.7 7.7e-12 NP_001240657 (OMIM: 606654) relaxin receptor 1 iso ( 724) 351 71.5 1e-11 XP_016864010 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 676) 350 71.3 1.1e-11 NP_067647 (OMIM: 606654) relaxin receptor 1 isofor ( 757) 350 71.3 1.2e-11 XP_011530476 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 783) 350 71.3 1.2e-11 XP_016864014 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 352) 344 69.9 1.4e-11 NP_963924 (OMIM: 605492) leucine-rich repeat neuro ( 713) 347 70.8 1.6e-11 XP_016855539 (OMIM: 605492) PREDICTED: leucine-ric ( 713) 347 70.8 1.6e-11 XP_005244884 (OMIM: 605492) PREDICTED: leucine-ric ( 713) 347 70.8 1.6e-11 NP_006329 (OMIM: 605492) leucine-rich repeat neuro ( 713) 347 70.8 1.6e-11 XP_011507368 (OMIM: 605492) PREDICTED: leucine-ric ( 713) 347 70.8 1.6e-11 XP_016864012 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 385) 343 69.8 1.7e-11 NP_004961 (OMIM: 601489,615961) insulin-like growt ( 605) 343 70.0 2.3e-11 NP_001139478 (OMIM: 601489,615961) insulin-like gr ( 643) 343 70.0 2.4e-11 NP_060150 (OMIM: 603932,607850,608135) asporin iso ( 379) 340 69.3 2.4e-11 XP_016864013 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 361) 339 69.1 2.6e-11 XP_016864011 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 675) 338 69.2 4.4e-11 XP_016864007 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 756) 338 69.3 4.7e-11 >>XP_016859475 (OMIM: 610867) PREDICTED: leucine-rich re (522 aa) initn: 3549 init1: 3549 opt: 3549 Z-score: 3256.0 bits: 612.1 E(85289): 1.3e-174 Smith-Waterman score: 3549; 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NP_056 MGLHFKWPLGAPMLAAIYAMSMVLKMLPALGMACPPKCRCEKLLFYCDSQGFHSV 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KB8 PHNLS-GLLGLSLRYNSLSELRAGQFTGLMQLTWLYLDHNHICSVQGDAFQKLRRVKELT :. . : ::::::.: ..::. ::... :::::.::::.: .:. :::: : ..::: NP_056 PNATDKGSLGLSLRHNHITELERDQFASFSQLTWLHLDHNQISTVKEDAFQGLYKLKELI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 LSSNQITQLPNTTFRPMPNLRSVDLSYNKLQALAPDLFHGLRKLTTLHMRANAIQFVPVR ::::.: :::::: . ::...:::.:.:..: :.::.::::: :::.:.:... .::: NP_056 LSSNKIFYLPNTTFTQLINLQNLDLSFNQLSSLHPELFYGLRKLQTLHLRSNSLRTIPVR 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 IFQDCRSLKFLDIGYNQLKSLARNSFAGLFKLTELHLEHNDLVKVNFAHFPRLISLHSLC .: :::::.:::.. :.:.:::::.::::.:: :::::::.:.:.::::: :: :::.: NP_056 LFWDCRSLEFLDLSTNRLRSLARNGFAGLIKLRELHLEHNQLTKINFAHFLRLSSLHTLF 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 LRRNKVAIVVSSLDWVWN-LEKMDLSGNEIEYMEPHVFETVPHLQSLQLDSNRLTYIEPR :. ::.. .. ...:.:. :::.::.::::. .. ::::.:.:. : .:.:.:. .. . NP_056 LQWNKISNLTCGMEWTWGTLEKLDLTGNEIKAIDLTVFETMPNLKILLMDNNKLNSLDSK 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 ILNSWKSLTSITLAGNLWDCGRNVCALASWLNNFQGRYDGNLQCASPEYAQGEDVLDAVY :::: .:::.. :.::::.:. .:::::::..::::.. .. : ::...::::.::::. NP_056 ILNSLRSLTTVGLSGNLWECSARICALASWLGSFQGRWEHSILCHSPDHTQGEDILDAVH 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB8 AFHLCEDGAEPTSGHLLSAVTNRSDLGPPASSATTLADGGEGQHDGTFE-PAT--VALPG .:.:: . . .. . :.: :. :.. : ... . : : : :.: .:. NP_056 GFQLCWNLSTTVT---VMATTYRD----PTTEYTKRISSS-SYHVGDKEIPTTAGIAVTT 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KB8 GEH---AENAVQIHKVVTGTMALIFSFLIVVLVLYVSWKCFPASLRQLRQCFVTQRRKQK :: .::. ..:.::::::.:::.........: :: : .::..::: ..: ..: NP_056 EEHFPEPDNAIFTQRVITGTMALLFSFFFIIFIVFISRKCCPPTLRRIRQCSMVQNHRQL 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 pF1KB8 QKQTMHQMAAMSAQEYYVDYKPNHIEGALVIINEYGSCTCHQQPARECEV ..:: .:. :: : : .:.:.: :: ..::: ::.: :.: : .:::: NP_056 RSQTRLHMSNMSDQGPYNEYEPTH-EGPFIIINGYGQCKCQQLPYKECEV 470 480 490 500 510 >>NP_821079 (OMIM: 610869) leucine-rich repeat transmemb (581 aa) initn: 1625 init1: 799 opt: 1647 Z-score: 1517.1 bits: 290.5 E(85289): 9.2e-78 Smith-Waterman score: 1647; 47.4% identity (78.3% similar) in 521 aa overlap (13-522:5-513) 10 20 30 40 50 pF1KB8 MDFLLLGLCLYWLLRRPSGVVLCLLGA---CFQMLPAAPSGCPQLCRCEGRLLYCEALNL ..: :: .. :. : . :: .: :::. :::::...:::. .: NP_821 MGFNVIRLLSGSAVALVIAPTVLLTMLSSAERGCPKGCRCEGKMVYCESQKL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB8 TEAPHNLS-GLLGLSLRYNSLSELRAGQFTGLMQLTWLYLDHNHICSVQGDAFQKLRRVK : : ..: : ::::::::::..:. .:: :: :::::::::::: ... .::. .::.: NP_821 QEIPSSISAGCLGLSLRYNSLQKLKYNQFKGLNQLTWLYLDHNHISNIDENAFNGIRRLK 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 ELTLSSNQITQLPNTTFRPMPNLRSVDLSYNKLQALAPDLFHGLRKLTTLHMRANAIQFV :: ::::.:. . :.::::. :::..:::::.:..:. . :.::::: .::.:.:... . NP_821 ELILSSNRISYFLNNTFRPVTNLRNLDLSYNQLHSLGSEQFRGLRKLLSLHLRSNSLRTI 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 PVRIFQDCRSLKFLDIGYNQLKSLARNSFAGLFKLTELHLEHNDLVKVNFAHFPRLISLH :::::::::.:..::.:::...::::: :::...: :::::::.. :.:.: ::::.::. NP_821 PVRIFQDCRNLELLDLGYNRIRSLARNVFAGMIRLKELHLEHNQFSKLNLALFPRLVSLQ 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 SLCLRRNKVAIVVSSLDWVWN-LEKMDLSGNEIE-YMEPHVFETVPHLQSLQLDSNRLTY .: :. ::.... ....:.:. :...:::::::: . : ::. ::.:: :.::::.::. NP_821 NLYLQWNKISVIGQTMSWTWSSLQRLDLSGNEIEAFSGPSVFQCVPNLQRLNLDSNKLTF 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 IEPRILNSWKSLTSITLAGNLWDCGRNVCALASWLNNFQGRYDGNLQCASPEYAQGEDVL : .::.:: ::..:.::::.:.:.::.:.:..::..:.: .... ::::. :: .:. NP_821 IGQEILDSWISLNDISLAGNIWECSRNICSLVNWLKSFKGLRENTIICASPKELQGVNVI 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB8 DAVYAFHLCEDGAEPTSGHLLSAVTNRSDLGPPASSATTLADGGEGQHDGTFE-PATVAL ::: . .: : ...:.: ::. . : . .:.. : ::. NP_821 DAVKNYSIC--G---------KSTTERFDLARALPKPTFKPKLPRPKHESKPPLPPTVGA 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 pF1KB8 --PGGEHAENA--VQIHKVVTGTMALIFSFLIVVLVLYVSWKCFPASLRQLRQCFVTQRR :: : .: ...::...:..::..: :...::.::::: .:::..::.: . .:. NP_821 TEPGPETDADAEHISFHKIIAGSVALFLSVLVILLVIYVSWKRYPASMKQLQQRSLMRRH 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KB8 KQKQKQTMHQMAAMSAQEYYVDYKPNHIEGALVIINEYGSCTCHQQPARECEV ..:..:...::. :.::.::::::.. : . ...: : :: ... .::::. NP_821 RKKKRQSLKQMTP-STQEFYVDYKPTNTETSEMLLNGTGPCTYNKSGSRECEIPLSMNVS 470 480 490 500 510 520 NP_821 TFLAYDQPTISYCGVHHELLSHKSFETNAQEDTMETHLETELDLSTITTAGRISDHKQQL 530 540 550 560 570 580 >>NP_079269 (OMIM: 610870) leucine-rich repeat transmemb (518 aa) initn: 950 init1: 822 opt: 1631 Z-score: 1503.1 bits: 287.7 E(85289): 5.6e-77 Smith-Waterman score: 1631; 46.7% identity (75.7% similar) in 522 aa overlap (6-522:1-518) 10 20 30 40 50 pF1KB8 MDFLLLGLCLYWLLRRPSGVVLCLLGACFQ-MLPAAPSGCPQLCRCEGRLLYCEALNLTE .:. : :. : ::: :: . . :: .: .::. :::.:...:::. ... NP_079 MGFHLITQLKGMS-VVLVLLPTLLLVMLTGAQRACPKNCRCDGKIVYCESHAFAD 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB8 APHNLSG-LLGLSLRYNSLSELRAGQFTGLMQLTWLYLDHNHICSVQGDAFQKLRRVKEL :.:.:: :::::.::...:...::.:: :: :::::::.: ::. :::: .::.::: NP_079 IPENISGGSQGLSLRFNSIQKLKSNQFAGLNQLIWLYLDHNYISSVDEDAFQGIRRLKEL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 TLSSNQITQLPNTTFRPMPNLRSVDLSYNKLQALAPDLFHGLRKLTTLHMRANAIQFVPV ::::.:: : : ::.:.::::..::::::::.: . :.::::: ::.:.:... ::. NP_079 ILSSNKITYLHNKTFHPVPNLRNLDLSYNKLQTLQSEQFKGLRKLIILHLRSNSLKTVPI 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 RIFQDCRSLKFLDIGYNQLKSLARNSFAGLFKLTELHLEHNDLVKVNFAHFPRLISLHSL :.:::::.: :::.:::.:.::.::.::::.:: :::::::.. :.::::::::..:.:. NP_079 RVFQDCRNLDFLDLGYNRLRSLSRNAFAGLLKLKELHLEHNQFSKINFAHFPRLFNLRSI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 CLRRNKVAIVVSSLDWVWN-LEKMDLSGNEIEYMEPHVFETVPHLQSLQLDSNRLTYIEP :. :.. . ..: :.:. :...:::::.:. .:: .:. .:.::.:.::::.:: : NP_079 YLQWNRIRSISQGLTWTWSSLHNLDLSGNDIQGIEPGTFKCLPNLQKLNLDSNKLTNISQ 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 RILNSWKSLTSITLAGNLWDCGRNVCALASWLNNFQGRYDGNLQCASPEYAQGEDVLDAV . .:.: :: ::::.::.:.:.:..: : ::.::.: .... ::.:.. ::: : ::: NP_079 ETVNAWISLISITLSGNMWECSRSICPLFYWLKNFKGNKESTMICAGPKHIQGEKVSDAV 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB8 YAFHLCEDG--AEPTSGHLLSAVTNRSDLGPPASSATTLADGGEGQHDGTFEPATVALPG ....: . .. .::. . .. . : . : .. . .:: NP_079 ETYNICSEVQVVNTERSHLVPQTPQKPLIIPRPT--IFKPDVTQSTFETPSPSPGFQIPG 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB8 GEHAENAVQIHKVVTGTMALIFSFLIVVLVLYVSWKCFPASLRQLRQCFVTQRRKQKQKQ .:. . :..::...:..::..: ...::.::::: .:::..::.: . .::..: .. NP_079 AEQEYEHVSFHKIIAGSVALFLSVAMILLVIYVSWKRYPASMKQLQQHSLMKRRRKKARE 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KB8 TMHQMAAMSAQEYYVDYKPNHIEGALVIINEYGSCTCHQQPARECEV . .:: . :::::::::.. : . .: : :: . .::::: NP_079 SERQMNS-PLQEYYVDYKPTNSETMDISVNGSGPCTYTISGSRECEV 480 490 500 510 >>NP_001269857 (OMIM: 610870) leucine-rich repeat transm (519 aa) initn: 950 init1: 822 opt: 1628 Z-score: 1500.3 bits: 287.2 E(85289): 7.9e-77 Smith-Waterman score: 1628; 47.2% identity (76.4% similar) in 508 aa overlap (20-522:15-519) 10 20 30 40 50 pF1KB8 MDFLLLGLCLYWLLRRPSGVVLCLLGACFQ-MLPAAPSGCPQLCRCEGRLLYCEALNLTE ::: :: . . :: .: .::. :::.:...:::. ... NP_001 MPGFHLITQLKGMSVVLVLLPTLLLVMLTGAQRACPKNCRCDGKIVYCESHAFAD 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB8 APHNLSG-LLGLSLRYNSLSELRAGQFTGLMQLTWLYLDHNHICSVQGDAFQKLRRVKEL :.:.:: :::::.::...:...::.:: :: :::::::.: ::. :::: .::.::: NP_001 IPENISGGSQGLSLRFNSIQKLKSNQFAGLNQLIWLYLDHNYISSVDEDAFQGIRRLKEL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 TLSSNQITQLPNTTFRPMPNLRSVDLSYNKLQALAPDLFHGLRKLTTLHMRANAIQFVPV ::::.:: : : ::.:.::::..::::::::.: . :.::::: ::.:.:... ::. NP_001 ILSSNKITYLHNKTFHPVPNLRNLDLSYNKLQTLQSEQFKGLRKLIILHLRSNSLKTVPI 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 RIFQDCRSLKFLDIGYNQLKSLARNSFAGLFKLTELHLEHNDLVKVNFAHFPRLISLHSL :.:::::.: :::.:::.:.::.::.::::.:: :::::::.. :.::::::::..:.:. NP_001 RVFQDCRNLDFLDLGYNRLRSLSRNAFAGLLKLKELHLEHNQFSKINFAHFPRLFNLRSI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 CLRRNKVAIVVSSLDWVWN-LEKMDLSGNEIEYMEPHVFETVPHLQSLQLDSNRLTYIEP :. :.. . ..: :.:. :...:::::.:. .:: .:. .:.::.:.::::.:: : NP_001 YLQWNRIRSISQGLTWTWSSLHNLDLSGNDIQGIEPGTFKCLPNLQKLNLDSNKLTNISQ 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 RILNSWKSLTSITLAGNLWDCGRNVCALASWLNNFQGRYDGNLQCASPEYAQGEDVLDAV . .:.: :: ::::.::.:.:.:..: : ::.::.: .... ::.:.. ::: : ::: NP_001 ETVNAWISLISITLSGNMWECSRSICPLFYWLKNFKGNKESTMICAGPKHIQGEKVSDAV 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB8 YAFHLCEDG--AEPTSGHLLSAVTNRSDLGPPASSATTLADGGEGQHDGTFEPATVALPG ....: . .. .::. . .. . : . : .. . .:: NP_001 ETYNICSEVQVVNTERSHLVPQTPQKPLIIP--RPTIFKPDVTQSTFETPSPSPGFQIPG 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB8 GEHAENAVQIHKVVTGTMALIFSFLIVVLVLYVSWKCFPASLRQLRQCFVTQRRKQKQKQ .:. . :..::...:..::..: ...::.::::: .:::..::.: . .::..: .. NP_001 AEQEYEHVSFHKIIAGSVALFLSVAMILLVIYVSWKRYPASMKQLQQHSLMKRRRKKARE 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KB8 TMHQMAAMSAQEYYVDYKPNHIEGALVIINEYGSCTCHQQPARECEV . .:: . :::::::::.. : . .: : :: . .::::: NP_001 SERQMNS-PLQEYYVDYKPTNSETMDISVNGSGPCTYTISGSRECEV 480 490 500 510 >>NP_001128217 (OMIM: 610870) leucine-rich repeat transm (590 aa) initn: 950 init1: 822 opt: 1627 Z-score: 1498.8 bits: 287.1 E(85289): 9.6e-77 Smith-Waterman score: 1627; 46.6% identity (75.7% similar) in 522 aa overlap (6-522:1-518) 10 20 30 40 50 pF1KB8 MDFLLLGLCLYWLLRRPSGVVLCLLGACFQ-MLPAAPSGCPQLCRCEGRLLYCEALNLTE .:. : :. : ::: :: . . :: .: .::. :::.:...:::. ... NP_001 MGFHLITQLKGMS-VVLVLLPTLLLVMLTGAQRACPKNCRCDGKIVYCESHAFAD 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB8 APHNLSG-LLGLSLRYNSLSELRAGQFTGLMQLTWLYLDHNHICSVQGDAFQKLRRVKEL :.:.:: :::::.::...:...::.:: :: :::::::.: ::. :::: .::.::: NP_001 IPENISGGSQGLSLRFNSIQKLKSNQFAGLNQLIWLYLDHNYISSVDEDAFQGIRRLKEL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 TLSSNQITQLPNTTFRPMPNLRSVDLSYNKLQALAPDLFHGLRKLTTLHMRANAIQFVPV ::::.:: : : ::.:.::::..::::::::.: . :.::::: ::.:.:... ::. NP_001 ILSSNKITYLHNKTFHPVPNLRNLDLSYNKLQTLQSEQFKGLRKLIILHLRSNSLKTVPI 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 RIFQDCRSLKFLDIGYNQLKSLARNSFAGLFKLTELHLEHNDLVKVNFAHFPRLISLHSL :.:::::.: :::.:::.:.::.::.::::.:: :::::::.. :.::::::::..:.:. NP_001 RVFQDCRNLDFLDLGYNRLRSLSRNAFAGLLKLKELHLEHNQFSKINFAHFPRLFNLRSI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 CLRRNKVAIVVSSLDWVWN-LEKMDLSGNEIEYMEPHVFETVPHLQSLQLDSNRLTYIEP :. :.. . ..: :.:. :...:::::.:. .:: .:. .:.::.:.::::.:: : NP_001 YLQWNRIRSISQGLTWTWSSLHNLDLSGNDIQGIEPGTFKCLPNLQKLNLDSNKLTNISQ 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 RILNSWKSLTSITLAGNLWDCGRNVCALASWLNNFQGRYDGNLQCASPEYAQGEDVLDAV . .:.: :: ::::.::.:.:.:..: : ::.::.: .... ::.:.. ::: : ::: NP_001 ETVNAWISLISITLSGNMWECSRSICPLFYWLKNFKGNKESTMICAGPKHIQGEKVSDAV 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB8 YAFHLCEDG--AEPTSGHLLSAVTNRSDLGPPASSATTLADGGEGQHDGTFEPATVALPG ....: . .. .::. . .. . : . : .. . .:: NP_001 ETYNICSEVQVVNTERSHLVPQTPQKPLIIPRPT--IFKPDVTQSTFETPSPSPGFQIPG 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB8 GEHAENAVQIHKVVTGTMALIFSFLIVVLVLYVSWKCFPASLRQLRQCFVTQRRKQKQKQ .:. . :..::...:..::..: ...::.::::: .:::..::.: . .::..: .. NP_001 AEQEYEHVSFHKIIAGSVALFLSVAMILLVIYVSWKRYPASMKQLQQHSLMKRRRKKARE 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KB8 TMHQMAAMSAQEYYVDYKPNHIEGALVIINEYGSCTCHQQPARECEV . .:: . :::::::::.. : . .: : :: . .::::. NP_001 SERQMNS-PLQEYYVDYKPTNSETMDISVNGSGPCTYTISGSRECEMPHHMKPLPYYSYD 480 490 500 510 520 530 NP_001 QPVIGYCQAHQPLHVTKGYETVSPEQDESPGLELGRDHSFIATIARSAAPAIYLERIAN 540 550 560 570 580 590 >>NP_001269853 (OMIM: 610870) leucine-rich repeat transm (590 aa) initn: 950 init1: 822 opt: 1627 Z-score: 1498.8 bits: 287.1 E(85289): 9.6e-77 Smith-Waterman score: 1627; 46.6% identity (75.7% similar) in 522 aa overlap (6-522:1-518) 10 20 30 40 50 pF1KB8 MDFLLLGLCLYWLLRRPSGVVLCLLGACFQ-MLPAAPSGCPQLCRCEGRLLYCEALNLTE .:. : :. : ::: :: . . :: .: .::. :::.:...:::. ... 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NP_001 RVFQDCRNLDFLDLGYNRLRSLSRNAFAGLLKLKELHLEHNQFSKINFAHFPRLFNLRSI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 CLRRNKVAIVVSSLDWVWN-LEKMDLSGNEIEYMEPHVFETVPHLQSLQLDSNRLTYIEP :. :.. . ..: :.:. :...:::::.:. .:: .:. .:.::.:.::::.:: : NP_001 YLQWNRIRSISQGLTWTWSSLHNLDLSGNDIQGIEPGTFKCLPNLQKLNLDSNKLTNISQ 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 RILNSWKSLTSITLAGNLWDCGRNVCALASWLNNFQGRYDGNLQCASPEYAQGEDVLDAV . .:.: :: ::::.::.:.:.:..: : ::.::.: .... ::.:.. ::: : ::: NP_001 ETVNAWISLISITLSGNMWECSRSICPLFYWLKNFKGNKESTMICAGPKHIQGEKVSDAV 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB8 YAFHLCEDG--AEPTSGHLLSAVTNRSDLGPPASSATTLADGGEGQHDGTFEPATVALPG ....: . .. .::. . .. . : . : .. . .:: NP_001 ETYNICSEVQVVNTERSHLVPQTPQKPLIIPRPT--IFKPDVTQSTFETPSPSPGFQIPG 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB8 GEHAENAVQIHKVVTGTMALIFSFLIVVLVLYVSWKCFPASLRQLRQCFVTQRRKQKQKQ .:. . :..::...:..::..: ...::.::::: .:::..::.: . .::..: .. 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