Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8918
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8918, 262 aa
1>>>pF1KB8918 262 - 262 aa - 262 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0453+/-0.00159; mu= 8.0046+/- 0.094
mean_var=256.5683+/-53.154, 0's: 0 Z-trim(106.0): 907 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.080071
statistics sampled from 7726 (8731) to 7726 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.605), E-opt: 0.2 (0.268), width: 16
Scan time: 2.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS64660.1 ZNF138 gene_id:7697|Hs108|chr7 ( 319) 1850 227.2 1.1e-59
CCDS64661.1 ZNF138 gene_id:7697|Hs108|chr7 ( 287) 1771 218.0 5.9e-57
CCDS34645.2 ZNF138 gene_id:7697|Hs108|chr7 ( 293) 1771 218.0 6e-57
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 1355 170.4 2.6e-42
CCDS75605.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 852) 1331 167.8 2.2e-41
CCDS43593.1 ZNF117 gene_id:51351|Hs108|chr7 ( 483) 1306 164.6 1.2e-40
CCDS5527.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 783) 1306 164.9 1.5e-40
CCDS34646.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 586) 1301 164.1 1.9e-40
CCDS75606.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 820) 1293 163.4 4.5e-40
CCDS54238.1 ZNF737 gene_id:100129842|Hs108|chr19 ( 536) 1290 162.8 4.5e-40
CCDS32979.1 ZNF431 gene_id:170959|Hs108|chr19 ( 576) 1282 161.9 8.8e-40
CCDS47596.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 517) 1275 161.1 1.5e-39
CCDS42538.1 ZNF100 gene_id:163227|Hs108|chr19 ( 542) 1270 160.5 2.2e-39
CCDS75609.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 510) 1268 160.2 2.5e-39
CCDS75608.1 ZNF92 gene_id:168374|Hs108|chr7 ( 554) 1268 160.3 2.6e-39
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 1259 159.3 5.8e-39
CCDS46032.1 ZNF492 gene_id:57615|Hs108|chr19 ( 531) 1252 158.4 9.3e-39
CCDS32978.1 ZNF430 gene_id:80264|Hs108|chr19 ( 570) 1250 158.2 1.1e-38
CCDS5528.2 ZNF273 gene_id:10793|Hs108|chr7 ( 569) 1243 157.4 2e-38
CCDS46030.1 ZNF257 gene_id:113835|Hs108|chr19 ( 563) 1226 155.4 7.7e-38
CCDS32980.1 ZNF708 gene_id:7562|Hs108|chr19 ( 563) 1224 155.2 9.1e-38
CCDS46031.1 ZNF98 gene_id:148198|Hs108|chr19 ( 572) 1212 153.8 2.4e-37
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1188 151.2 1.8e-36
CCDS42539.1 ZNF676 gene_id:163223|Hs108|chr19 ( 588) 1186 150.9 1.9e-36
CCDS34644.1 ZNF680 gene_id:340252|Hs108|chr7 ( 530) 1182 150.3 2.5e-36
CCDS42535.1 ZNF626 gene_id:199777|Hs108|chr19 ( 528) 1180 150.1 3e-36
CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19 ( 616) 1181 150.3 3e-36
CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 1185 151.2 3.3e-36
CCDS32981.1 ZNF675 gene_id:171392|Hs108|chr19 ( 568) 1175 149.6 4.6e-36
CCDS54239.1 ZNF714 gene_id:148206|Hs108|chr19 ( 555) 1172 149.2 5.8e-36
CCDS42531.1 ZNF506 gene_id:440515|Hs108|chr19 ( 444) 1169 148.7 6.5e-36
CCDS55112.1 ZNF716 gene_id:441234|Hs108|chr7 ( 495) 1167 148.6 8.1e-36
CCDS74324.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 586) 1166 148.5 9.6e-36
CCDS74323.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 618) 1166 148.6 9.9e-36
CCDS32983.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 659) 1166 148.6 1e-35
CCDS59369.1 ZNF99 gene_id:7652|Hs108|chr19 ( 864) 1165 148.7 1.3e-35
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 1161 148.4 2.1e-35
CCDS47592.1 ZNF679 gene_id:168417|Hs108|chr7 ( 411) 1142 145.5 5.4e-35
CCDS78236.1 ZNF735 gene_id:730291|Hs108|chr7 ( 412) 1137 145.0 8e-35
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 1138 145.5 1.1e-34
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 1138 145.5 1.1e-34
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 1138 145.5 1.1e-34
CCDS62623.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 574) 1134 144.8 1.2e-34
CCDS46027.1 ZNF506 gene_id:440515|Hs108|chr19 ( 412) 1126 143.7 1.9e-34
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 1132 145.0 2.2e-34
CCDS42532.1 ZNF253 gene_id:56242|Hs108|chr19 ( 499) 1111 142.1 7.2e-34
CCDS43590.1 ZNF479 gene_id:90827|Hs108|chr7 ( 524) 1107 141.7 1e-33
CCDS46029.1 ZNF486 gene_id:90649|Hs108|chr19 ( 463) 1098 140.5 2e-33
CCDS46028.1 ZNF90 gene_id:7643|Hs108|chr19 ( 601) 1088 139.5 5e-33
CCDS75079.1 ZNF718 gene_id:255403|Hs108|chr4 ( 446) 1063 136.5 3.2e-32
>>CCDS64660.1 ZNF138 gene_id:7697|Hs108|chr7 (319 aa)
initn: 1850 init1: 1850 opt: 1850 Z-score: 1184.9 bits: 227.2 E(32554): 1.1e-59
Smith-Waterman score: 1850; 99.6% identity (100.0% similar) in 262 aa overlap (1-262:58-319)
10 20 30
pF1KB8 MKRHEMVVAKHSALCSRFAQDLWLEQNIKD
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 VYRHVMLENYRNLVFLDLITCLEQGKEPWNMKRHEMVVAKHSALCSRFAQDLWLEQNIKD
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 SFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS64 SFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGFNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKV
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 MHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWS
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 TNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 TNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLT
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260
pF1KB8 RHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 RHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
270 280 290 300 310
>>CCDS64661.1 ZNF138 gene_id:7697|Hs108|chr7 (287 aa)
initn: 1771 init1: 1771 opt: 1771 Z-score: 1136.0 bits: 218.0 E(32554): 5.9e-57
Smith-Waterman score: 1771; 99.6% identity (100.0% similar) in 250 aa overlap (13-262:38-287)
10 20 30 40
pF1KB8 MKRHEMVVAKHSALCSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SLEEWQCLDTAQRNVYRHVMLENYRNLVFLALCSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 YGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKI
::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 YGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGFNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKI
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 RHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 RHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTG
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 EKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 EKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPY
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260
pF1KB8 KCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 KCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
250 260 270 280
>>CCDS34645.2 ZNF138 gene_id:7697|Hs108|chr7 (293 aa)
initn: 1771 init1: 1771 opt: 1771 Z-score: 1135.9 bits: 218.0 E(32554): 6e-57
Smith-Waterman score: 1771; 99.6% identity (100.0% similar) in 250 aa overlap (13-262:44-293)
10 20 30 40
pF1KB8 MKRHEMVVAKHSALCSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SLEEWQCLDTAQRNVYRHVMLENYRNLVFLALCSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGK
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 YGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKI
::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGFNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKI
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 RHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTG
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 EKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPY
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260
pF1KB8 KCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
260 270 280 290
>>CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 (595 aa)
initn: 6594 init1: 1355 opt: 1355 Z-score: 873.1 bits: 170.4 E(32554): 2.6e-42
Smith-Waterman score: 1355; 72.1% identity (88.2% similar) in 262 aa overlap (1-262:65-326)
10 20 30
pF1KB8 MKRHEMVVAKHSALCSRFAQDLWLEQNIKD
:::::..::: ...::.:::::: ::::::
CCDS32 ENYRNLVFLGITVSKPDLITCLEQGKEAWSMKRHEIMVAKPTVMCSHFAQDLWPEQNIKD
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 SFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKV
:::::::.:::: :.:: :::::.:.:::: :.:: ::::::: : ::::::.:::::
CCDS32 SFQKVTLKRYGKCRHENLPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKV
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 MHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWS
:::::::::.::::..: :.: .: ::. :.: ::.:..:::: ::::::::::.::::
CCDS32 AHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWS
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 TNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLT
..:.: :.::::::::::: :::::.::: : ::: :.:::::::: .:::.:.. : ::
CCDS32 STLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLT
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260
pF1KB8 RHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
:::::: ::::::..:::.:..: ::: :. :.:::.:::::::::::. :
CCDS32 THKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKI
280 290 300 310 320 330
CCDS32 IHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTG
340 350 360 370 380 390
>--
initn: 3869 init1: 770 opt: 796 Z-score: 524.1 bits: 105.8 E(32554): 7.1e-23
Smith-Waterman score: 796; 60.8% identity (83.3% similar) in 186 aa overlap (77-262:393-578)
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 NLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTE
: : ..:.. :.... :. ..::: ::
CCDS32 IHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTG
370 380 390 400 410 420
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 NKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPY
.: ..::::.:.. . :.::.:::::: :. :.::.:::.:: :.::.. :: :: ::::
CCDS32 EKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPY
430 440 450 460 470 480
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 KCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQ
::: :::.:. : :: ::::.:::::::: .:::::.:::.::.:: ::: :::: ::.
CCDS32 KCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEE
490 500 510 520 530 540
230 240 250 260
pF1KB8 CGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
:::.:.:: .::::. :.:::.::::::: :::. :
CCDS32 CGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
550 560 570 580 590
>>CCDS75605.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 (852 aa)
initn: 4879 init1: 1307 opt: 1331 Z-score: 856.5 bits: 167.8 E(32554): 2.2e-41
Smith-Waterman score: 1331; 73.2% identity (87.0% similar) in 261 aa overlap (1-261:65-324)
10 20 30
pF1KB8 MKRHEMVVAKHSALCSRFAQDLWLEQNIKD
.:::::: :: .. .:::::: ::::::
CCDS75 ENYRNLVFLGIAVSKPYLITCLEQKKEPWNIKRHEMV-AKPPVMSFHFAQDLWPEQNIKD
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 SFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKV
::::::: :::: ..::::::::: :::: ::.::.: .:::: : ::::::::::::
CCDS75 SFQKVTLRRYGKCEYENLQLRKGCKHVDECTGHKGGHNTVNQCLTATPSKIFQCNKYVKV
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 MHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWS
. :::::::.: ::: ::::.::::.::.:.::.::::..:::: : ::::::::.:::
CCDS75 FDKFSNSNRYKRRHTGNKHFKCKECSKSFCVLSQLTQHRRIHTRVNSYKCEECGKAFNWF
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 TNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLT
..:.: :.::::::::::: :::::.::: ::.::::.: ::: :: .:::::::.::::
CCDS75 STLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSQLTRHKIIHTEEKPNKCEECGKAFKQASHLT
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260
pF1KB8 RHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
:::::: ::::: :.:::::.:: :: ..:..:::. :::.::::::::
CCDS75 IHKIIHTGEKPYKYEECGKVFSQSSHLTTQKILHTGENLYKCKECGKAFNLFSNLTNHKR
280 290 300 310 320 330
CCDS75 IHAGEKPYKCKECGRAFNISSNLNKQEKIHTGGKLNKCEECDKAFNRSLKLTAHKKILME
340 350 360 370 380 390
>--
initn: 3600 init1: 809 opt: 829 Z-score: 543.1 bits: 109.8 E(32554): 6.2e-24
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20 30 40 50 60 70
pF1KB8 CSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCL
.:. ... : : ...:. . ..: . :
CCDS75 NLTNHKRIHAGEKPYKCKECGRAFNISSNLNKQEKIHTGGK-LNKCEECDKAFN---RSL
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:.:. : ..:.. ::...::. .:::: :: .: ..:::: :.. . : ::.
CCDS75 KLTAHKKILMEEKPYKCEECGKVFNQFSTLTRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNQSSNLTE
390 400 410 420 430 440
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 HKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKII
:::::: :. ::::::::.:: .:: . .::..:::::::: :::::..:: ::.:: :
CCDS75 HKKIHTAEKSYKCEECGKAFNQHSNLINHRKIYSGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTRHKKI
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.:::::::: .: .::.:::.::.:: ::: :::::::.:::.:.. :::::. :.:::
CCDS75 HTGEKPYKCEECDRAFSQSSNLTEHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNRFSTLTKHKRIHTGE
510 520 530 540 550 560
250 260
pF1KB8 EPYKCEECGKAFNLS
.:::::::::::: :
CCDS75 KPYKCEECGKAFNQSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPYK
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>--
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Smith-Waterman score: 754; 51.3% identity (74.1% similar) in 232 aa overlap (40-262:602-829)
10 20 30 40 50 60
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. . .:.... .. : : .:. : :
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.:: ..::.:: .. ... :... ::: . ::: .: .: .:.:: :.
CCDS75 --FNQSSNLTTQKIIHTGENLYKFEEHGKAFNLFSNITNHKIIYTGEKPHKCEECGKAYN
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.: :: ::.::: :. :.: ::::.:: :..:.. : ::::::::::. :::::. ::
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:: :: :.:::::::: .:::::.:::.:: :: ::: :::::::.::: :.: .:. :
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250 260
pF1KB8 QIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
.::.:::.:::: . :.:::::
CCDS75 KIIHTGEKPYKCGDYGRAFNLSSNLTTHKKIHTGEKPYKCEYGKT
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::::::: ::: .. ::: :: ::::.:::::::: :: : :..::::::::::: ::
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: :.: :.::::::: : ::::::::::.:.::.:::::::.::::::::.:::: :..:
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:::.:::::.:.:: :::::: :..::::..:.: :.::::::::::. :::::.:.:
CCDS43 MLSHLTQHKRIQTRVNFYKCEAYGRAFNWSSTLNKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFNQTSH
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pF1KB8 LTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKH
: .:: :.: :::::: .:::::.::: :: :.:::: : :::::.: ..:.:. ::.:
CCDS43 LIRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQSSTLTTHNIIHTGEIPYKCEKCVRAFNQASKLTEH
180 190 200 210 220 230
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pF1KB8 QIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
..:.:::. :.::::::::: :
CCDS43 KLIHTGEKRYECEECGKAFNRSSKLTEHKYIHTGEKLYKCEECGKAFNQSSTLTTHKRIH
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>--
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: :...:.. :.... :. . :: :.
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pF1KB8 NKHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPY
.: ..:.:: :.. ..: ::.:::::: :. ::::::::.:: .::.. : ::::::::
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pF1KB8 KCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQ
:: :::::.::: :. ::::.:::.:.:: . ::.:. ::.:. : ::: :: ::::.
CCDS43 KCGECGKAFNQSSALNTHKIIHTGENPHKCRESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGEKLYKCEE
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:::.:..: :: :. :.:::.:::::::::::: :
CCDS43 CGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTTHKIIHTEEKQYKCDECGKA
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CCDS43 ST
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.::: .. .:::::: ::::::::::::: :::: ..::::::::: ::::
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::.::.: .:::: : ::::::::::::. :::::::.: ::: ::::.::::.::.:
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.::.::::..:::: : ::::::::.::: ..:.: :.::::::::::: :::::.:::
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::.::::.: ::: :: .:::::::.:::: :::::: ::::: :.:::::.:: :: .
CCDS55 LTRHKIIHTEEKPNKCEECGKAFKQASHLTIHKIIHTGEKPYKYEECGKVFSQSSHLTTQ
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pF1KB8 QIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
.:..:::. :::.::::::::
CCDS55 KILHTGENLYKCKECGKAFNLFSNLTNHKRIHAGEKPYKCKECGRAFNISSNLNKQEKIH
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>--
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20 30 40 50 60 70
pF1KB8 CSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCL
.:. ... : : ...:. . ..: . :
CCDS55 NLTNHKRIHAGEKPYKCKECGRAFNISSNLNKQEKIHTGGK-LNKCEECDKAFN---RSL
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pF1KB8 KITTSKI-------FQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLSRLTQ
:.:. : ..:.. ::...::. .:::: :: .: ..:::: :.. . : ::.
CCDS55 KLTAHKKILMEEKPYKCEECGKVFNQFSTLTRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNQSSNLTE
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.:::::::: .: .::.:::.::.:: ::: :::::::.:::.:.. :::::. :.:::
CCDS55 HTGEKPYKCEECDRAFSQSSNLTEHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNRFSTLTKHKRIHTGE
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pF1KB8 EPYKCEECGKAFNLS
.:::::::::::: :
CCDS55 KPYKCEECGKAFNQSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPYK
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>--
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. . .:.... .. : : .:. : :
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pF1KB8 NGLNQCLKITTSKI-------FQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLC
.:: ..::.:: .. ... :... ::: . ::: .: .: .:.:: :.
CCDS55 --FNQSSNLTTQKIIHTGENLYKFEEHGKAFNLFSNITNHKIIYTGEKPHKCEECGKAYN
570 580 590 600 610
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.: :: ::.::: :. :.: ::::.:: :..:.. : ::::::::::. :::::. ::
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:: :: :.:::::::: .:::::.:::.:: :: ::: :::::::.::: :.: .:. :
CCDS55 LTAHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLTTHKKIHTSEKPYKCEECGKSFNQFSSLNIH
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pF1KB8 QIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
.::.:::.:::: . :.:::::
CCDS55 KIIHTGEKPYKCGDYGRAFNLSSNLTTHKKIHTGEKPYKCEYGKT
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Smith-Waterman score: 1301; 71.8% identity (86.1% similar) in 259 aa overlap (1-259:65-322)
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.:::::: : ..::.::::.: :..:::
CCDS34 ENYRNLVFLGIAVSKPDLITWLEQGKEPWNLKRHEMV-DKTPVMCSHFAQDVWPEHSIKD
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40 50 60 70 80 90
pF1KB8 SFQKVTLSRYGKYGHKNLQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKV
::::: : ::::::.:::::: :::: :: ..:::::::::: : ::::::.:::::
CCDS34 SFQKVILRTYGKYGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGGYNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKV
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.::: : ::.::::: .: :.::. ::.::::.::::::::::: ::::::::.::::
CCDS34 FHKFPNVNRNKIRHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLTQHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWS
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160 170 180 190 200 210
pF1KB8 TNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLT
..:.: : ::::::::::: :::::..:: :::::::.:::::::: .:::::..:: ::
CCDS34 STLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLT
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220 230 240 250 260
pF1KB8 RHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
.:: :::::::::::.:::.:.: :.::. :. ..:::::::::::
CCDS34 KHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQFSILNKHKRIHMEDKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKI
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initn: 1504 init1: 788 opt: 788 Z-score: 519.2 bits: 104.9 E(32554): 1.3e-22
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pF1KB8 QGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTENKHFRCKECDKSLCMLS
:: ..::: :: .: ..:.:: :.. ..:
CCDS34 NQFSILNKHKRIHMEDKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQFS
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pF1KB8 RLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYKCEVCGKAFHQSSILTK
::.:: ::: :. :::.::::.:: :..:.: :.::::::::::: :::::.::: ::.
CCDS34 NLTKHKIIHTGEKPYKCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTE
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pF1KB8 HKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQCGKVFKQSPTLTKHQII
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CCDS34 HKIIHTGEKPYKCEKCGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCEECGKAFSVFSTLTKHKII
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pF1KB8 YTGEEPYKCEECGKAFNLS
.: :.:::::::::::: :
CCDS34 HTREKPYKCEECGKAFNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFNQSSNLTARKIIYTGE
480 490 500 510 520 530
>>CCDS75606.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 (820 aa)
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10 20 30 40
pF1KB8 MKRHEMVVAKHSALCSRFAQDLWLEQNIKDSFQKVTLSRYGKYGHKN
:::::: ::::::::::::: :::: ..:
CCDS75 QCLDTAQRDLYRNVLLENYRNLVFLVMSFHFAQDLWPEQNIKDSFQKVTLRRYGKCEYEN
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pF1KB8 LQLRKGCKSVDECKGHQGGYNGLNQCLKITTSKIFQCNKYVKVMHKFSNSNRHKIRHTEN
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CCDS75 LQLRKGCKHVDECTGHKGGHNTVNQCLTATPSKIFQCNKYVKVFDKFSNSNRYKRRHTGN
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pF1KB8 KHFRCKECDKSLCMLSRLTQHKKIHTRENFYKCEECGKTFNWSTNLSKPKKIHTGEKPYK
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CCDS75 KHFKCKECSKSFCVLSQLTQHRRIHTRVNSYKCEECGKAFNWFSTLTKHKRIHTGEKPYK
140 150 160 170 180 190
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pF1KB8 CEVCGKAFHQSSILTKHKIIRTGEKPYKCAHCGKAFKQSSHLTRHKIIHTEEKPYKCEQC
:: :::::.::: ::.::::.: ::: :: .:::::::.:::: :::::: ::::: :.:
CCDS75 CEECGKAFNQSSQLTRHKIIHTEEKPNKCEECGKAFKQASHLTIHKIIHTGEKPYKYEEC
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pF1KB8 GKVFKQSPTLTKHQIIYTGEEPYKCEECGKAFNLS
::::.:: :: ..:..:::. :::.::::::::
CCDS75 GKVFSQSSHLTTQKILHTGENLYKCKECGKAFNLFSNLTNHKRIHAGEKPYKCKECGRAF
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CCDS75 NISSNLNKQEKIHTGGKLNKCEECDKAFNRSLKLTAHKKILMEEKPYKCEECGKVFNQFS
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Smith-Waterman score: 829; 55.1% identity (79.1% similar) in 225 aa overlap (45-262:325-545)
20 30 40 50 60 70
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CCDS54 CGKAFKRSFILTRHKRIHTGEKPYKCEECGKGFKCPSTLTTHKVIHTGEKL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]