Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8969
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8969, 359 aa
1>>>pF1KB8969 359 - 359 aa - 359 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4378+/-0.00119; mu= 15.9480+/- 0.070
mean_var=93.2556+/-24.169, 0's: 0 Z-trim(101.8): 125 B-trim: 460 in 1/44
Lambda= 0.132812
statistics sampled from 6540 (6691) to 6540 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.551), E-opt: 0.2 (0.206), width: 16
Scan time: 2.390
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS686.1 PTGFR gene_id:5737|Hs108|chr1 ( 359) 2355 462.1 3.2e-130
CCDS30759.1 PTGFR gene_id:5737|Hs108|chr1 ( 297) 1758 347.7 7.6e-96
CCDS42467.1 TBXA2R gene_id:6915|Hs108|chr19 ( 343) 652 135.8 5.2e-32
CCDS54198.1 TBXA2R gene_id:6915|Hs108|chr19 ( 407) 652 135.9 5.9e-32
CCDS12309.1 PTGER1 gene_id:5731|Hs108|chr19 ( 402) 528 112.1 8.3e-25
CCDS44160.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 365) 457 98.5 9.7e-21
CCDS652.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 374) 457 98.5 9.8e-21
CCDS658.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 388) 457 98.5 1e-20
CCDS656.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 390) 457 98.5 1e-20
CCDS657.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 390) 457 98.5 1e-20
CCDS655.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 ( 418) 457 98.5 1.1e-20
CCDS12686.1 PTGIR gene_id:5739|Hs108|chr19 ( 386) 406 88.7 8.8e-18
>>CCDS686.1 PTGFR gene_id:5737|Hs108|chr1 (359 aa)
initn: 2355 init1: 2355 opt: 2355 Z-score: 2451.4 bits: 462.1 E(32554): 3.2e-130
Smith-Waterman score: 2355; 100.0% identity (100.0% similar) in 359 aa overlap (1-359:1-359)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSMNNSKQLVSPAAALLSNTTCQTENRLSVFFSVIFMTVGILSNSLAIAILMKAYQRFRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 MSMNNSKQLVSPAAALLSNTTCQTENRLSVFFSVIFMTVGILSNSLAIAILMKAYQRFRQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KSKASFLLLASGLVITDFFGHLINGAIAVFVYASDKEWIRFDQSNVLCSIFGICMVFSGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 KSKASFLLLASGLVITDFFGHLINGAIAVFVYASDKEWIRFDQSNVLCSIFGICMVFSGL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 CPLLLGSVMAIERCIGVTKPIFHSTKITSKHVKMMLSGVCLFAVFIALLPILGHRDYKIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 CPLLLGSVMAIERCIGVTKPIFHSTKITSKHVKMMLSGVCLFAVFIALLPILGHRDYKIQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 ASRTWCFYNTEDIKDWEDRFYLLLFSFLGLLALGVSLLCNAITGITLLRVKFKSQQHRQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 ASRTWCFYNTEDIKDWEDRFYLLLFSFLGLLALGVSLLCNAITGITLLRVKFKSQQHRQG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 RSHHLEMVIQLLAIMCVSCICWSPFLVTMANIGINGNHSLETCETTLFALRMATWNQILD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 RSHHLEMVIQLLAIMCVSCICWSPFLVTMANIGINGNHSLETCETTLFALRMATWNQILD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB8 PWVYILLRKAVLKNLYKLASQCCGVHVISLHIWELSSIKNSLKVAAISESPVAEKSAST
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 PWVYILLRKAVLKNLYKLASQCCGVHVISLHIWELSSIKNSLKVAAISESPVAEKSAST
310 320 330 340 350
>>CCDS30759.1 PTGFR gene_id:5737|Hs108|chr1 (297 aa)
initn: 1755 init1: 1755 opt: 1758 Z-score: 1834.2 bits: 347.7 E(32554): 7.6e-96
Smith-Waterman score: 1758; 92.2% identity (94.6% similar) in 295 aa overlap (1-295:1-293)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSMNNSKQLVSPAAALLSNTTCQTENRLSVFFSVIFMTVGILSNSLAIAILMKAYQRFRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MSMNNSKQLVSPAAALLSNTTCQTENRLSVFFSVIFMTVGILSNSLAIAILMKAYQRFRQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KSKASFLLLASGLVITDFFGHLINGAIAVFVYASDKEWIRFDQSNVLCSIFGICMVFSGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 KSKASFLLLASGLVITDFFGHLINGAIAVFVYASDKEWIRFDQSNVLCSIFGICMVFSGL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 CPLLLGSVMAIERCIGVTKPIFHSTKITSKHVKMMLSGVCLFAVFIALLPILGHRDYKIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 CPLLLGSVMAIERCIGVTKPIFHSTKITSKHVKMMLSGVCLFAVFIALLPILGHRDYKIQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 ASRTWCFYNTEDIKDWEDRFYLLLFSFLGLLALGVSLLCNAITGITLLRVKFKSQQHRQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ASRTWCFYNTEDIKDWEDRFYLLLFSFLGLLALGVSLLCNAITGITLLRVKFKSQQHRQG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 RSHHLEMVIQLLAIMCVSCICWSPFLVTMANIGINGNHSLETCETTLFALRMATWNQILD
:::::::::::::::::::::::::: : .::... .. : :. :
CCDS30 RSHHLEMVIQLLAIMCVSCICWSPFL--GYRIILNGKEKYKVYEEQSDFLHRLQWPTLE
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KB8 PWVYILLRKAVLKNLYKLASQCCGVHVISLHIWELSSIKNSLKVAAISESPVAEKSAST
>>CCDS42467.1 TBXA2R gene_id:6915|Hs108|chr19 (343 aa)
initn: 645 init1: 311 opt: 652 Z-score: 688.1 bits: 135.8 E(32554): 5.2e-32
Smith-Waterman score: 652; 40.2% identity (66.2% similar) in 311 aa overlap (18-315:15-319)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSMNNSKQLVSPAAALLSNTTCQTENRL--SVFFSVIFMTVGILSNSLAIAILMKAYQRF
.: : . : :: : .:.. : .::. :: ::...: : :
CCDS42 MWPNGSSLGPCFRPTNITLE-ERRLIASPWFAASFCVVGLASNLLALSVLAGARQG-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 RQKSKASFLLLASGLVITDFFGHLINGAIAVFVYASDKEWIRFDQSNVLCSIFGICMVFS
.....::: . :::.:::.: :..:.:.: .:. :: : . :: ..:. :.:
CCDS42 GSHTRSSFLTFLCGLVLTDFLGLLVTGTIVVSQHAALFEWHAVDPGCRLCRFMGVVMIFF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 GLCPLLLGSVMAIERCIGVTKPIFHSTKITSKHVKMMLSGVCLFAVF-IALLPILGHRDY
:: :::::..:: :: .:.:.: : ..:.. :. :.. ..:::.:: :
CCDS42 GLSPLLLGAAMASERYLGITRP-FSRPAVASQRRAWATVGLVWAAALALGLLPLLGVGRY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 KIQASRTWCFYNTEDIKDWEDRFYLLLFSFLGLLALGVSLLCNAITGITLLRVKFKSQQH
.: .::: . . : . ::::.:: :..:.:.: :... :: .: ...:.
CCDS42 TVQYPGSWCFLTLG--AESGDVAFGLLFSMLGGLSVGLSFLLNTVSVATLCHV-YHGQEA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB8 RQGRSH--HLEMVIQLLAIMCVSCICWSPFLVTMAN--------IGINGNHSLETCETTL
: : . ..::. :::.:: :. .:: :.:: .:. .. :. : : . :
CCDS42 AQQRPRDSEVEMMAQLLGIMVVASVCWLPLLVFIAQTVLRNPPAMSPAGQLSRTTEKELL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 FALRMATWNQILDPWVYILLRKAVLKNLYKLASQCCGVHVISLHIWELSSIKNSLKVAAI
. ::.::::::::::::::.:.:::. :
CCDS42 IYLRVATWNQILDPWVYILFRRAVLRRLQPRLSTRPRSLSLQPQLTQRSGLQ
300 310 320 330 340
>>CCDS54198.1 TBXA2R gene_id:6915|Hs108|chr19 (407 aa)
initn: 655 init1: 311 opt: 652 Z-score: 687.2 bits: 135.9 E(32554): 5.9e-32
Smith-Waterman score: 652; 40.2% identity (66.2% similar) in 311 aa overlap (18-315:15-319)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSMNNSKQLVSPAAALLSNTTCQTENRL--SVFFSVIFMTVGILSNSLAIAILMKAYQRF
.: : . : :: : .:.. : .::. :: ::...: : :
CCDS54 MWPNGSSLGPCFRPTNITLE-ERRLIASPWFAASFCVVGLASNLLALSVLAGARQG-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 RQKSKASFLLLASGLVITDFFGHLINGAIAVFVYASDKEWIRFDQSNVLCSIFGICMVFS
.....::: . :::.:::.: :..:.:.: .:. :: : . :: ..:. :.:
CCDS54 GSHTRSSFLTFLCGLVLTDFLGLLVTGTIVVSQHAALFEWHAVDPGCRLCRFMGVVMIFF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 GLCPLLLGSVMAIERCIGVTKPIFHSTKITSKHVKMMLSGVCLFAVF-IALLPILGHRDY
:: :::::..:: :: .:.:.: : ..:.. :. :.. ..:::.:: :
CCDS54 GLSPLLLGAAMASERYLGITRP-FSRPAVASQRRAWATVGLVWAAALALGLLPLLGVGRY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 KIQASRTWCFYNTEDIKDWEDRFYLLLFSFLGLLALGVSLLCNAITGITLLRVKFKSQQH
.: .::: . . : . ::::.:: :..:.:.: :... :: .: ...:.
CCDS54 TVQYPGSWCFLTLG--AESGDVAFGLLFSMLGGLSVGLSFLLNTVSVATLCHV-YHGQEA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB8 RQGRSH--HLEMVIQLLAIMCVSCICWSPFLVTMAN--------IGINGNHSLETCETTL
: : . ..::. :::.:: :. .:: :.:: .:. .. :. : : . :
CCDS54 AQQRPRDSEVEMMAQLLGIMVVASVCWLPLLVFIAQTVLRNPPAMSPAGQLSRTTEKELL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 FALRMATWNQILDPWVYILLRKAVLKNLYKLASQCCGVHVISLHIWELSSIKNSLKVAAI
. ::.::::::::::::::.:.:::. :
CCDS54 IYLRVATWNQILDPWVYILFRRAVLRRLQPRLSTRPRRSLTLWPSLEYSGTISAHCNLRL
300 310 320 330 340 350
>>CCDS12309.1 PTGER1 gene_id:5731|Hs108|chr19 (402 aa)
initn: 785 init1: 369 opt: 528 Z-score: 558.8 bits: 112.1 E(32554): 8.3e-25
Smith-Waterman score: 734; 34.1% identity (62.1% similar) in 393 aa overlap (1-340:7-393)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSMNNSKQLVSPAAALLSNTTCQTENRLSVFFSVIFMTVGILSNSLAIAILMKA
.... . . .. :: . ::. . : . .. ::.: .:: ::.:.: .:
CCDS12 MSPCGPLNLSLAGEATTCAAPWVPNTSAVPPSGASPALPIFSMTLGAVSNLLALALLAQA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 YQRFRQK-SKASFLLLASGLVITDFFGHLINGAIAVFVYASDKEWIRFDQSNVLCSIFGI
:.:.. : :.:::....:. ::. ::.: ::... .:.. . .. : ..:
CCDS12 AGRLRRRRSAATFLLFVASLLATDLAGHVIPGALVLRLYTAGRA-----PAGGACHFLGG
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 CMVFSGLCPLLLGSVMAIERCIGVTKPIFHSTKITSKHVKMMLSGVCLFAVFIALLPILG
:::: :::::::: ::.:::.:::.:..:..... .... :..: :. .::::.
CCDS12 CMVFFGLCPLLLGCGMAVERCVGVTRPLLHAARVSVARARLALAAVAAVALAVALLPLAR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 HRDYKIQASRTWCFYNTEDIKDWEDRFYLLLFSFLGLLALGVSLLCNAITGITLLRVKFK
:..: :::: . :.. . ::. :::.:: ..:.::...:..:::....
CCDS12 VGRYELQYPGTWCFIGLGPPGGWRQALLAGLFASLGLVALLAALVCNTLSGLALLRARWR
180 190 200 210 220 230
240
pF1KB8 ----------------------------------------------SQQHRQGRSHHLEM
: . :..:.: .::
CCDS12 RRSRRPPPASGPDSRRRWGAHGPRSASASSASSIASASTFFGGSRSSGSARRARAHDVEM
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 VIQLLAIMCVSCICWSPFLVTMANIGINGNHSLETCETTLFALRMATWNQILDPWVYILL
: ::..:: ::::::::.:: .: ....: : . ..:.:.:.:::::::::::::
CCDS12 VGQLVGIMVVSCICWSPMLVLVA-LAVGGWSSTSLQRPLFLAVRLASWNQILDPWVYILL
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350
pF1KB8 RKAVLKNLYKLASQCCGVHV------ISLHIWELSSIKNSLKVAAISESPVAEKSAST
:.:::..: .: :.. .. :: ::...
CCDS12 RQAVLRQLLRLLPPRAGAKGGPAGLGLTPSAWEASSLRSSRHSGLSHF
360 370 380 390 400
>>CCDS44160.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 (365 aa)
initn: 633 init1: 386 opt: 457 Z-score: 485.8 bits: 98.5 E(32554): 9.7e-21
Smith-Waterman score: 666; 36.9% identity (67.6% similar) in 309 aa overlap (28-315:50-357)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSMNNSKQLVSPAAALLSNTTCQTENRLSVFFSVIFMTVGILSNSLAIAILMKAYQR
.:: : . .. .:...:.::. .. ..:.:
CCDS44 SYTGMWAPERSAEARGNLTRPPGSGEDCGSVSVAFPITMLLTGFVGNALAMLLVSRSYRR
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 FRQKSKASFLLLASGLVITDFFGHLINGAIAVFVYASDKEWIRFDQSNVLCSIFGICMVF
..: : :::: . :..::. :.:.. ... :: : ..: ..: :. ::..::. :.
CCDS44 RESKRKKSFLLCIGWLALTDLVGQLLTTPVVIVVYLSKQRWEHIDPSGRLCTFFGLTMTV
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 SGLCPLLLGSVMAIERCIGVTKPIFHSTKITSKHVKMMLSGVCLFAVFIALLPILGHRDY
:: :...:.::.:: ... : ...... .. .. .: :: : .. .::::.:: .:
CCDS44 FGLSSLFIASAMAVERALAIRAPHWYASHMKTRATRAVLLGVWLAVLAFALLPVLGVGQY
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220
pF1KB8 KIQASRTWCFYNT-------EDIKDWEDRFYLLLFSFLGLLALGVSLLCNAITGITLL-R
.: :::: .: . ..: . :. :.::::::: :.. :: : .:. :
CCDS44 TVQWPGTWCFISTGRGGNGTSSSHNWGNLFFASAFAFLGLLALTVTFSCNLATIKALVSR
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 VKFK---SQQHRQGRSHHLEMVIQLLAIMCVSCICWSPFLVTMANIGINGNHSLETCETT
. : ::. : : .:::..:::: .::::.:. : .. .: . :.: :.:
CCDS44 CRAKATASQSSAQWGRITTETAIQLMGIMCVLSVCWSPLLIMMLKMIFN-QTSVEHCKTH
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330
pF1KB8 ----------LFALRMATWNQILDPWVYILLRKAVLKNLYKLASQCCGVHVISLHIWELS
:.:.:.:. :::::::::.:::: .:...
CCDS44 TEKQKECNFFLIAVRLASLNQILDPWVYLLLRKILLRKFCQEEFWGN
320 330 340 350 360
340 350
pF1KB8 SIKNSLKVAAISESPVAEKSAST
>>CCDS652.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 (374 aa)
initn: 635 init1: 386 opt: 457 Z-score: 485.7 bits: 98.5 E(32554): 9.8e-21
Smith-Waterman score: 668; 36.5% identity (67.6% similar) in 312 aa overlap (28-318:50-360)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSMNNSKQLVSPAAALLSNTTCQTENRLSVFFSVIFMTVGILSNSLAIAILMKAYQR
.:: : . .. .:...:.::. .. ..:.:
CCDS65 SYTGMWAPERSAEARGNLTRPPGSGEDCGSVSVAFPITMLLTGFVGNALAMLLVSRSYRR
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 FRQKSKASFLLLASGLVITDFFGHLINGAIAVFVYASDKEWIRFDQSNVLCSIFGICMVF
..: : :::: . :..::. :.:.. ... :: : ..: ..: :. ::..::. :.
CCDS65 RESKRKKSFLLCIGWLALTDLVGQLLTTPVVIVVYLSKQRWEHIDPSGRLCTFFGLTMTV
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 SGLCPLLLGSVMAIERCIGVTKPIFHSTKITSKHVKMMLSGVCLFAVFIALLPILGHRDY
:: :...:.::.:: ... : ...... .. .. .: :: : .. .::::.:: .:
CCDS65 FGLSSLFIASAMAVERALAIRAPHWYASHMKTRATRAVLLGVWLAVLAFALLPVLGVGQY
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220
pF1KB8 KIQASRTWCFYNT-------EDIKDWEDRFYLLLFSFLGLLALGVSLLCNAITGITLL-R
.: :::: .: . ..: . :. :.::::::: :.. :: : .:. :
CCDS65 TVQWPGTWCFISTGRGGNGTSSSHNWGNLFFASAFAFLGLLALTVTFSCNLATIKALVSR
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 VKFK---SQQHRQGRSHHLEMVIQLLAIMCVSCICWSPFLVTMANIGINGNHSLETCETT
. : ::. : : .:::..:::: .::::.:. : .. .: . :.: :.:
CCDS65 CRAKATASQSSAQWGRITTETAIQLMGIMCVLSVCWSPLLIMMLKMIFN-QTSVEHCKTH
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330
pF1KB8 ----------LFALRMATWNQILDPWVYILLRKAVLKNLYKLASQCCGVHVISLHIWELS
:.:.:.:. :::::::::.:::: .:... ..
CCDS65 TEKQKECNFFLIAVRLASLNQILDPWVYLLLRKILLRKFCQMRKRRLREQEEFWGN
320 330 340 350 360 370
340 350
pF1KB8 SIKNSLKVAAISESPVAEKSAST
>>CCDS658.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 (388 aa)
initn: 639 init1: 386 opt: 457 Z-score: 485.5 bits: 98.5 E(32554): 1e-20
Smith-Waterman score: 673; 36.7% identity (67.4% similar) in 319 aa overlap (28-322:50-367)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSMNNSKQLVSPAAALLSNTTCQTENRLSVFFSVIFMTVGILSNSLAIAILMKAYQR
.:: : . .. .:...:.::. .. ..:.:
CCDS65 SYTGMWAPERSAEARGNLTRPPGSGEDCGSVSVAFPITMLLTGFVGNALAMLLVSRSYRR
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 FRQKSKASFLLLASGLVITDFFGHLINGAIAVFVYASDKEWIRFDQSNVLCSIFGICMVF
..: : :::: . :..::. :.:.. ... :: : ..: ..: :. ::..::. :.
CCDS65 RESKRKKSFLLCIGWLALTDLVGQLLTTPVVIVVYLSKQRWEHIDPSGRLCTFFGLTMTV
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 SGLCPLLLGSVMAIERCIGVTKPIFHSTKITSKHVKMMLSGVCLFAVFIALLPILGHRDY
:: :...:.::.:: ... : ...... .. .. .: :: : .. .::::.:: .:
CCDS65 FGLSSLFIASAMAVERALAIRAPHWYASHMKTRATRAVLLGVWLAVLAFALLPVLGVGQY
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220
pF1KB8 KIQASRTWCFYNT-------EDIKDWEDRFYLLLFSFLGLLALGVSLLCNAITGITLL-R
.: :::: .: . ..: . :. :.::::::: :.. :: : .:. :
CCDS65 TVQWPGTWCFISTGRGGNGTSSSHNWGNLFFASAFAFLGLLALTVTFSCNLATIKALVSR
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 VKFK---SQQHRQGRSHHLEMVIQLLAIMCVSCICWSPFLVTMANIGINGNHSLETCETT
. : ::. : : .:::..:::: .::::.:. : .. .: . :.: :.:
CCDS65 CRAKATASQSSAQWGRITTETAIQLMGIMCVLSVCWSPLLIMMLKMIFNQT-SVEHCKTH
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330
pF1KB8 ----------LFALRMATWNQILDPWVYILLRKAVLKNLYKLA---SQCCGVHVISLHIW
:.:.:.:. :::::::::.:::: .:... ..: :.:
CCDS65 TEKQKECNFFLIAVRLASLNQILDPWVYLLLRKILLRKFCQVANAVSSCSNDGQKGQPIS
320 330 340 350 360 370
340 350
pF1KB8 ELSSIKNSLKVAAISESPVAEKSAST
CCDS65 LSNEIIQTEA
380
>>CCDS656.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 (390 aa)
initn: 634 init1: 386 opt: 457 Z-score: 485.5 bits: 98.5 E(32554): 1e-20
Smith-Waterman score: 667; 36.5% identity (67.6% similar) in 312 aa overlap (28-318:50-360)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSMNNSKQLVSPAAALLSNTTCQTENRLSVFFSVIFMTVGILSNSLAIAILMKAYQR
.:: : . .. .:...:.::. .. ..:.:
CCDS65 SYTGMWAPERSAEARGNLTRPPGSGEDCGSVSVAFPITMLLTGFVGNALAMLLVSRSYRR
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 FRQKSKASFLLLASGLVITDFFGHLINGAIAVFVYASDKEWIRFDQSNVLCSIFGICMVF
..: : :::: . :..::. :.:.. ... :: : ..: ..: :. ::..::. :.
CCDS65 RESKRKKSFLLCIGWLALTDLVGQLLTTPVVIVVYLSKQRWEHIDPSGRLCTFFGLTMTV
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 SGLCPLLLGSVMAIERCIGVTKPIFHSTKITSKHVKMMLSGVCLFAVFIALLPILGHRDY
:: :...:.::.:: ... : ...... .. .. .: :: : .. .::::.:: .:
CCDS65 FGLSSLFIASAMAVERALAIRAPHWYASHMKTRATRAVLLGVWLAVLAFALLPVLGVGQY
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220
pF1KB8 KIQASRTWCFYNT-------EDIKDWEDRFYLLLFSFLGLLALGVSLLCNAITGITLL-R
.: :::: .: . ..: . :. :.::::::: :.. :: : .:. :
CCDS65 TVQWPGTWCFISTGRGGNGTSSSHNWGNLFFASAFAFLGLLALTVTFSCNLATIKALVSR
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 VKFK---SQQHRQGRSHHLEMVIQLLAIMCVSCICWSPFLVTMANIGINGNHSLETCETT
. : ::. : : .:::..:::: .::::.:. : .. .: . :.: :.:
CCDS65 CRAKATASQSSAQWGRITTETAIQLMGIMCVLSVCWSPLLIMMLKMIFN-QTSVEHCKTH
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330
pF1KB8 ----------LFALRMATWNQILDPWVYILLRKAVLKNLYKLASQCCGVHVISLHIWELS
:.:.:.:. :::::::::.:::: .:... ..
CCDS65 TEKQKECNFFLIAVRLASLNQILDPWVYLLLRKILLRKFCQIRYHTNNYASSSTSLPCQC
320 330 340 350 360 370
340 350
pF1KB8 SIKNSLKVAAISESPVAEKSAST
CCDS65 SSTLMWSDHLER
380 390
>>CCDS657.1 PTGER3 gene_id:5733|Hs108|chr1 (390 aa)
initn: 634 init1: 386 opt: 457 Z-score: 485.5 bits: 98.5 E(32554): 1e-20
Smith-Waterman score: 667; 36.5% identity (67.6% similar) in 312 aa overlap (28-318:50-360)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSMNNSKQLVSPAAALLSNTTCQTENRLSVFFSVIFMTVGILSNSLAIAILMKAYQR
.:: : . .. .:...:.::. .. ..:.:
CCDS65 SYTGMWAPERSAEARGNLTRPPGSGEDCGSVSVAFPITMLLTGFVGNALAMLLVSRSYRR
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 FRQKSKASFLLLASGLVITDFFGHLINGAIAVFVYASDKEWIRFDQSNVLCSIFGICMVF
..: : :::: . :..::. :.:.. ... :: : ..: ..: :. ::..::. :.
CCDS65 RESKRKKSFLLCIGWLALTDLVGQLLTTPVVIVVYLSKQRWEHIDPSGRLCTFFGLTMTV
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 SGLCPLLLGSVMAIERCIGVTKPIFHSTKITSKHVKMMLSGVCLFAVFIALLPILGHRDY
:: :...:.::.:: ... : ...... .. .. .: :: : .. .::::.:: .:
CCDS65 FGLSSLFIASAMAVERALAIRAPHWYASHMKTRATRAVLLGVWLAVLAFALLPVLGVGQY
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220
pF1KB8 KIQASRTWCFYNT-------EDIKDWEDRFYLLLFSFLGLLALGVSLLCNAITGITLL-R
.: :::: .: . ..: . :. :.::::::: :.. :: : .:. :
CCDS65 TVQWPGTWCFISTGRGGNGTSSSHNWGNLFFASAFAFLGLLALTVTFSCNLATIKALVSR
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 VKFK---SQQHRQGRSHHLEMVIQLLAIMCVSCICWSPFLVTMANIGINGNHSLETCETT
. : ::. : : .:::..:::: .::::.:. : .. .: . :.: :.:
CCDS65 CRAKATASQSSAQWGRITTETAIQLMGIMCVLSVCWSPLLIMMLKMIFN-QTSVEHCKTH
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330
pF1KB8 ----------LFALRMATWNQILDPWVYILLRKAVLKNLYKLASQCCGVHVISLHIWELS
:.:.:.:. :::::::::.:::: .:... ..
CCDS65 TEKQKECNFFLIAVRLASLNQILDPWVYLLLRKILLRKFCQIRYHTNNYASSSTSLPCQC
320 330 340 350 360 370
340 350
pF1KB8 SIKNSLKVAAISESPVAEKSAST
CCDS65 SSTLMWSDHLER
380 390
359 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 16:44:49 2016 done: Fri Nov 4 16:44:49 2016
Total Scan time: 2.390 Total Display time: 0.010
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]