FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB8978, 374 aa 1>>>pF1KB8978 374 - 374 aa - 374 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4611+/-0.000945; mu= 15.8682+/- 0.056 mean_var=105.2257+/-28.633, 0's: 0 Z-trim(106.1): 270 B-trim: 1130 in 2/45 Lambda= 0.125030 statistics sampled from 8402 (8800) to 8402 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.631), E-opt: 0.2 (0.27), width: 16 Scan time: 2.420 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 374) 2513 464.4 7.2e-131 CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 360) 2098 389.5 2.4e-108 CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 1569 294.1 1.3e-79 CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 1253 237.1 1.8e-62 CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 1152 218.9 5.5e-57 CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 1152 218.9 5.8e-57 CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 1099 209.3 4.2e-54 CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 958 183.9 1.9e-46 CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 355) 917 176.5 3.2e-44 CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 387) 917 176.5 3.4e-44 CCDS43079.1 CCRL2 gene_id:9034|Hs108|chr3 ( 344) 831 161.0 1.5e-39 CCDS46814.1 CCRL2 gene_id:9034|Hs108|chr3 ( 356) 831 161.0 1.5e-39 CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 ( 384) 782 152.2 7.2e-37 CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 779 151.6 1e-36 CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 779 151.6 1e-36 CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 755 147.3 2e-35 CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 755 147.3 2.1e-35 CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 735 143.7 2.5e-34 CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 352) 710 139.2 5.5e-33 CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 356) 710 139.2 5.6e-33 CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 709 139.0 6.3e-33 CCDS2736.1 XCR1 gene_id:2829|Hs108|chr3 ( 333) 699 137.1 2.1e-32 CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 695 136.4 3.6e-32 CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 694 136.3 4.2e-32 CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 694 136.3 4.6e-32 CCDS2735.1 CXCR6 gene_id:10663|Hs108|chr3 ( 342) 682 134.1 1.8e-31 CCDS3075.1 ACKR4 gene_id:51554|Hs108|chr3 ( 350) 646 127.6 1.6e-29 CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 623 123.5 3e-28 CCDS11435.1 CCR10 gene_id:2826|Hs108|chr17 ( 362) 548 109.9 3.5e-24 CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 536 107.8 1.6e-23 CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 495 100.4 2.7e-21 CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 486 98.8 8.6e-21 CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 468 95.5 7.7e-20 CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 468 95.6 8.1e-20 CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 468 95.6 8.2e-20 CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 457 93.5 3.1e-19 CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 456 93.4 3.5e-19 CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 453 92.8 5.1e-19 CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 452 92.7 5.9e-19 CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 447 91.8 1.1e-18 CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 444 91.2 1.5e-18 CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 439 90.3 3e-18 CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 ( 373) 439 90.3 3e-18 CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 ( 355) 436 89.7 4.2e-18 CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 435 89.6 5.3e-18 CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 432 89.0 7e-18 CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1 ( 361) 430 88.7 9e-18 CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 430 88.7 9.4e-18 CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 430 88.7 9.5e-18 CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 430 88.7 9.6e-18 >>CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 (374 aa) initn: 2513 init1: 2513 opt: 2513 Z-score: 2463.0 bits: 464.4 E(32554): 7.2e-131 Smith-Waterman score: 2513; 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CCDS46 NPIIYAFVGEKFRRYLSVFFRKHITKRFCKQCPVFYRETVDGVTSTNTPSTGEQEVSAGL 310 320 330 340 350 360 >>CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 (352 aa) initn: 1571 init1: 890 opt: 1569 Z-score: 1543.1 bits: 294.1 E(32554): 1.3e-79 Smith-Waterman score: 1569; 75.2% identity (90.4% similar) in 311 aa overlap (21-325:7-317) 10 20 30 40 50 pF1KB8 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDY--GAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFIFGFV . ..: .: . ::.:..::::.:.::::::::::::::: CCDS27 MDYQVSSPIYDINYYTSEPCQKINVKQIAARLLPPLYSLVFIFGFV 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KB8 GNMLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSAANEWVFGNAMCKLFTG :::::.:::::::.:: .:::::::::::::.::.:.:.::: :: .: :::.::.:.:: CCDS27 GNMLVILILINCKRLKSMTDIYLLNLAISDLFFLLTVPFWAHYAAAQWDFGNTMCQLLTG 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 LYHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFASVPGIIF :: ::.:.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::.::::::.::::: CCDS27 LYFIGFFSGIFFIILLTIDRYLAVVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWVVAVFASLPGIIF 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 TKCQKEDSVYVCGPYFPRG----WNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGILKTLLRCRN :. ::: :.:. .:: . :.::.:. :::::::::.::::::::::::::::: CCDS27 TRSQKEGLHYTCSSHFPYSQYQFWKNFQTLKIVILGLVLPLLVMVICYSGILKTLLRCRN 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 EKKRHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQATQVTETLG :::::::::.::::::::::::.:::::.:::::::::::.:: :...:::: ::::::: CCDS27 EKKRHRAVRLIFTIMIVYFLFWAPYNIVLLLNTFQEFFGLNNCSSSNRLDQAMQVTETLG 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 MTHCCINPIIYAFVGEKFRSLFHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGKNVKVTTQGLLDGR :::::::::::::::::::. . . . .:: CCDS27 MTHCCINPIIYAFVGEKFRNYLLVFFQKHIAKRFCKCCSIFQQEAPERASSVYTRSTGEQ 290 300 310 320 330 340 360 370 pF1KB8 GKGKSIGRAPEASLQDKEGA CCDS27 EISVGL 350 >>CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 (355 aa) initn: 1100 init1: 412 opt: 1253 Z-score: 1235.0 bits: 237.1 E(32554): 1.8e-62 Smith-Waterman score: 1253; 57.7% identity (85.0% similar) in 319 aa overlap (12-325:5-321) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFIFGFVGN ::.:. ..:: ::: ..::.: . . .:::::::::::::..:.::: CCDS27 METPNTTED-YDTTTEFDYGDATPCQKVNERAFGAQLLPPLYSLVFVIGLVGN 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KB8 MLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWA-HSAANEWVFGNAMCKLFTGL .::::.:.. :.:: .:.::::::::::::::.:::.: .. ..::::.::::...:. CCDS27 ILVVLVLVQYKRLKNMTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFWIDYKLKDDWVFGDAMCKILSGF 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 YHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFASVPGIIFT :. : .. ::::::::::::::::::::::.::::::::.::.: : .:..::.::. :. CCDS27 YYTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIIIWALAILASMPGLYFS 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 KCQKEDSVYVCGPYFP----RGWNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGILKTLLRCRNE : : : . ..:. .:: : :. :... :..:::::::.:.:::.::.: ::: :: CCDS27 KTQWEFTHHTCSLHFPHESLREWKLFQALKLNLFGLVLPLLVMIICYTGIIKILLRRPNE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 KKRHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQATQVTETLGM :: .:::.::.:::..::::::::..::...::.:. .::.. .:: :.::::.... CCDS27 KKS-KAVRLIFVIMIIFFLFWTPYNLTILISVFQDFLFTHECEQSRHLDLAVQVTEVIAY 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 THCCINPIIYAFVGEKFRSLFHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGKNVKVTTQGLLDGRG ::::.::.:::::::.::. .. . :.: CCDS27 THCCVNPVIYAFVGERFRKYLRQLFHRRVAVHLVKWLPFLSVDRLERVSSTSPSTGEHEL 300 310 320 330 340 350 >>CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 (355 aa) initn: 994 init1: 379 opt: 1152 Z-score: 1136.5 bits: 218.9 E(32554): 5.5e-57 Smith-Waterman score: 1152; 54.2% identity (83.7% similar) in 306 aa overlap (21-317:14-317) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFIFGFVGN :...: : : :.: :.. . ::..:::::::: :..:: CCDS27 MTTSLDTVETFGTTSYYD-DVGLLCEKADTRALMAQFVPPLYSLVFTVGLLGN 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KB8 MLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSA-ANEWVFGNAMCKLFTGL ..::.:::. ..:. .:.::::::::::::::.:::.: : . ...::::..::::..:. CCDS27 VVVVMILIKYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNWVFGHGMCKLLSGF 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 YHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFASVPGIIFT :: : .. ::::::::::::::::::::::.::::::::.::..:: .::.:..: .:: CCDS27 YHTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWGLAVLAALPEFIFY 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 KCQKEDSVYVCGPYFPR----GWNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGILKTLLRCRNE . .. .:. .:. .: .:::. .:. ::::::.:.:::.::.:::::: . CCDS27 ETEELFEETLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGIIKTLLRCPS- 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 KKRHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQATQVTETLGM ::...:.:.::.:: :.:.::::::..:::...: .. ..:: ...:: . :::.... CCDS27 KKKYKAIRLIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFGNDCERSKHLDLVMLVTEVIAY 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 THCCINPIIYAFVGEKFRS----LFHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGKNVKVTTQGLL .:::.::.:::::::.::. .:: CCDS27 SHCCMNPVIYAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGRYIPFLPSEKLERTSSVSPSTAEPEL 300 310 320 330 340 350 >>CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 (376 aa) initn: 994 init1: 379 opt: 1152 Z-score: 1136.2 bits: 218.9 E(32554): 5.8e-57 Smith-Waterman score: 1152; 54.2% identity (83.7% similar) in 306 aa overlap (21-317:35-338) 10 20 30 40 50 pF1KB8 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYS :...: : : :.: :.. . ::..::::: CCDS54 IRMLLRAHKPGSSRRSEMTTSLDTVETFGTTSYYD-DVGLLCEKADTRALMAQFVPPLYS 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KB8 LVFIFGFVGNMLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSA-ANEWVFG ::: :..::..::.:::. ..:. .:.::::::::::::::.:::.: : . ...:::: CCDS54 LVFTVGLLGNVVVVMILIKYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNWVFG 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KB8 NAMCKLFTGLYHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAV ..::::..:.:: : .. ::::::::::::::::::::::.::::::::.::..:: .:: CCDS54 HGMCKLLSGFYHTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWGLAV 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KB8 FASVPGIIFTKCQKEDSVYVCGPYFPR----GWNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGI .:..: .:: . .. .:. .:. .: .:::. .:. ::::::.:.:::.:: CCDS54 LAALPEFIFYETEELFEETLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGI 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KB8 LKTLLRCRNEKKRHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQ .:::::: . ::...:.:.::.:: :.:.::::::..:::...: .. ..:: ...:: CCDS54 IKTLLRCPS-KKKYKAIRLIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFGNDCERSKHLDL 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KB8 ATQVTETLGMTHCCINPIIYAFVGEKFRS----LFHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGK . :::.....:::.::.:::::::.::. .:: CCDS54 VMLVTEVIAYSHCCMNPVIYAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGRYIPFLPSEKLERTSS 310 320 330 340 350 360 350 360 370 pF1KB8 NVKVTTQGLLDGRGKGKSIGRAPEASLQDKEGA CCDS54 VSPSTAEPELSIVF 370 >>CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 (360 aa) initn: 959 init1: 676 opt: 1099 Z-score: 1084.8 bits: 209.3 E(32554): 4.2e-54 Smith-Waterman score: 1099; 50.8% identity (80.1% similar) in 307 aa overlap (31-333:28-333) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFIFGFVGN :: : .: .: .:::::::::.::..:: CCDS26 MNPTDIADTTLDESIYSNYYLYESIPKPCTKEGIKAFGELFLPPLYSLVFVFGLLGN 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 MLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSAANEWVFGNAMCKLFTGLY .:::.:.. :.:. .::.::::::::::::...::.:.. ::..:::: ..::... .: CCDS26 SVVVLVLFKYKRLRSMTDVYLLNLAISDLLFVFSLPFWGYYAADQWVFGLGLCKMISWMY 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 HIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFASVPGIIFTK .:...::::..:..::::::::::::.:.:::.:.::.::. :: ::::::.::..:. CCDS26 LVGFYSGIFFVMLMSIDRYLAIVHAVFSLRARTLTYGVITSLATWSVAVFASLPGFLFST 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KB8 CQKEDSVYVCGPYFPRG---WNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGILKTLLRCRNEKK : : . : . . :. . .. ::::::.:: ::..::: :..:: .:.:::: CCDS26 CYTERNHTYCKTKYSLNSTTWKVLSSLEINILGLVIPLGIMLFCYSMIIRTLQHCKNEKK 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 RHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQATQVTETLGMTH ..::..::....... ::::::::..:.:. :. :..: :: : :.::::...: CCDS26 -NKAVKMIFAVVVLFLGFWTPYNIVLFLETLVELEVLQDCTFERYLDYAIQATETLAFVH 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 CCINPIIYAFVGEKFRS-LFHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGKNVKVTTQGLLDGRGK ::.::::: :.:::::. .... :: . :: CCDS26 CCLNPIIYFFLGEKFRKYILQLFKTCRGLFVLCQYCGLLQIYSADTPSSSYTQSTMDHDL 300 310 320 330 340 350 360 370 pF1KB8 GKSIGRAPEASLQDKEGA CCDS26 HDAL 360 >>CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 (355 aa) initn: 899 init1: 571 opt: 958 Z-score: 947.4 bits: 183.9 E(32554): 1.9e-46 Smith-Waterman score: 958; 43.5% identity (78.4% similar) in 301 aa overlap (20-313:9-308) 10 20 30 40 50 pF1KB8 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDY----GAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFIFG ::: :: : ..:: .. : :: .: :.:.:. CCDS26 MDYTLDLSVTTVTDYYYPDIFSSPCDAELIQTNGKLLLAVFYCLLFVFS 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KB8 FVGNMLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSAANEWVFGNAMCKLF ..:: ::.:.:. ::::. .::.::::::.:::::....:. .. ..::::..:::. CCDS26 LLGNSLVILVLVVCKKLRSITDVYLLNLALSDLLFVFSFPFQTYYLLDQWVFGTVMCKVV 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 TGLYHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFASVPGI .:.:.::.....::: :...:::::.::::.:::.::. .:.. . .::.:..:..: . CCDS26 SGFYYIGFYSSMFFITLMSVDRYLAVVHAVYALKVRTIRMGTTLCLAVWLTAIMATIPLL 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 IFTKCQKEDSVYVCGPYFPRG---WNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGILKTLLRCR .: . .::.: : .. . :. : .. :::::..:. :...:: ::. : ::. CCDS26 VFYQVASEDGVLQCYSFYNQQTLKWKIFTNFKMNILGLLIPFTIFMFCYIKILHQLKRCQ 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 NEKKRHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQATQVTETL :..: .:.:... ..:. .:::.:.:.:..:.... . :..: ..:: ::.::: . CCDS26 NHNKT-KAIRLVLIVVIASLLFWVPFNVVLFLTSLHSMHILDGCSISQQLTYATHVTEII 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 GMTHCCINPIIYAFVGEKFRSLFHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGKNVKVTTQGLLDG ..::::.::.:::::::::. CCDS26 SFTHCCVNPVIYAFVGEKFKKHLSEIFQKSCSQIFNYLGRQMPRESCEKSSSCQQHSSRS 290 300 310 320 330 340 >>CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 (355 aa) initn: 862 init1: 597 opt: 917 Z-score: 907.4 bits: 176.5 E(32554): 3.2e-44 Smith-Waterman score: 917; 46.6% identity (75.2% similar) in 311 aa overlap (18-322:6-311) 10 20 30 40 50 pF1KB8 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAP-CHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVFIFGFVG : :: :.:: : :. :. .:. .: .::..: .:.:: CCDS43 MDQFPESVTENFEYDDLAEACYIGDIVVFGTVFLSIFYSVIFAIGLVG 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KB8 NMLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSAANEWVFGNAMCKLFTGL :.:::. : : :: : .:::::::::.:::::. :::.:.: :: . :::::. :.. CCDS43 NLLVVFALTNSKKPKSVTDIYLLNLALSDLLFVATLPFWTHYLINEKGLHNAMCKFTTAF 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 YHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFASVPGIIFT . ::.::.:::: ...:::::::: :. ... ::: ::. :. .: .:.....: ..:: CCDS43 FFIGFFGSIFFITVISIDRYLAIVLAANSMNNRTVQHGVTISLGVWAAAILVAAPQFMFT 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 KCQKEDSVYVCGPYFPRGWNNFHTIMRNI----LGLVLPLLIMVICYSGILKTLLRCRNE : :::. : .:. ... ..::. ::..:::::: :: :..::. :.:. CCDS43 K-QKENE---CLGDYPEVLQEIWPVLRNVETNFLGFLLPLLIMSYCYFRIIQTLFSCKNH 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 KKRHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQATQVTETLGM :: .:...:. ..::.::::::::..:.:.:.. . . .:. ..: : .::::... CCDS43 KKA-KAIKLILLVVIVFFLFWTPYNVMIFLETLKLYDFFPSCDMRKDLRLALSVTETVAF 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 THCCINPIIYAFVGEKFRS-LFHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGKNVKVTTQGLLDGR .:::.::.::::.::::: :.:. : CCDS43 SHCCLNPLIYAFAGEKFRRYLYHLYGKCLAVLCGRSVHVDFSSSESQRSRHGSVLSSNFT 290 300 310 320 330 340 >>CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 (387 aa) initn: 862 init1: 597 opt: 917 Z-score: 906.9 bits: 176.5 E(32554): 3.4e-44 Smith-Waterman score: 917; 46.6% identity (75.2% similar) in 311 aa overlap (18-322:38-343) 10 20 30 40 pF1KB8 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAP-CHKFDVKQIGAQLLP : :: :.:: : :. :. .:. .: CCDS54 FKLADLDFRKSSLASGWRMASGAFTMDQFPESVTENFEYDDLAEACYIGDIVVFGTVFLS 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KB8 PLYSLVFIFGFVGNMLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSAANEW .::..: .:.:::.:::. : : :: : .:::::::::.:::::. :::.:.: :: CCDS54 IFYSVIFAIGLVGNLLVVFALTNSKKPKSVTDIYLLNLALSDLLFVATLPFWTHYLINEK 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KB8 VFGNAMCKLFTGLYHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWL . :::::. :... ::.::.:::: ...:::::::: :. ... ::: ::. :. .: CCDS54 GLHNAMCKFTTAFFFIGFFGSIFFITVISIDRYLAIVLAANSMNNRTVQHGVTISLGVWA 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KB8 VAVFASVPGIIFTKCQKEDSVYVCGPYFPRGWNNFHTIMRNI----LGLVLPLLIMVICY .:.....: ..::: :::. : .:. ... ..::. ::..:::::: :: CCDS54 AAILVAAPQFMFTK-QKENE---CLGDYPEVLQEIWPVLRNVETNFLGFLLPLLIMSYCY 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KB8 SGILKTLLRCRNEKKRHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQ :..::. :.:.:: .:...:. ..::.::::::::..:.:.:.. . . .:. .. CCDS54 FRIIQTLFSCKNHKKA-KAIKLILLVVIVFFLFWTPYNVMIFLETLKLYDFFPSCDMRKD 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KB8 LDQATQVTETLGMTHCCINPIIYAFVGEKFRS-LFHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGK : : .::::....:::.::.::::.::::: :.:. : CCDS54 LRLALSVTETVAFSHCCLNPLIYAFAGEKFRRYLYHLYGKCLAVLCGRSVHVDFSSSESQ 310 320 330 340 350 360 350 360 370 pF1KB8 NVKVTTQGLLDGRGKGKSIGRAPEASLQDKEGA CCDS54 RSRHGSVLSSNFTYHTSDGDALLLL 370 380 374 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Fri Nov 4 16:47:48 2016 done: Fri Nov 4 16:47:49 2016 Total Scan time: 2.420 Total Display time: 0.020 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]