Result of FASTA (ccds) for pF1KB8979
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB8979, 374 aa
  1>>>pF1KB8979 374 - 374 aa - 374 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9830+/-0.00125; mu= 12.8946+/- 0.074
 mean_var=139.2533+/-42.712, 0's: 0 Z-trim(102.7): 309  B-trim: 935 in 2/46
 Lambda= 0.108685
 statistics sampled from 6577 (7057) to 6577 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.551), E-opt: 0.2 (0.217), width:  16
 Scan time:  2.120

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS4031.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5           ( 374) 2520 407.7 8.5e-114
CCDS58959.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5          ( 352) 2380 385.7 3.3e-107
CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5           ( 397)  746 129.6 4.8e-30
CCDS12350.1 F2RL3 gene_id:9002|Hs108|chr19         ( 385)  693 121.2 1.5e-27
CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5             ( 425)  671 117.8 1.8e-26
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrY        ( 359)  618 109.4   5e-24
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrX        ( 359)  618 109.4   5e-24
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2           ( 367)  539 97.1 2.7e-20
CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3           ( 373)  522 94.4 1.7e-19
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX          ( 370)  515 93.3 3.7e-19
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13       ( 346)  500 90.9 1.8e-18
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX          ( 365)  496 90.3 2.9e-18
CCDS3157.1 GPR87 gene_id:53836|Hs108|chr3          ( 358)  478 87.5   2e-17
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX       ( 337)  476 87.1 2.4e-17
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2           ( 350)  470 86.2 4.7e-17
CCDS9492.1 GPR183 gene_id:1880|Hs108|chr13         ( 361)  470 86.2 4.8e-17
CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13         ( 337)  469 86.0 5.2e-17
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11           ( 372)  467 85.8 6.8e-17
CCDS9894.2 GPR68 gene_id:8111|Hs108|chr14          ( 365)  465 85.5 8.4e-17
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6            ( 374)  465 85.5 8.5e-17
CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11          ( 377)  462 85.0 1.2e-16
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2           ( 360)  456 84.0 2.2e-16
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3            ( 355)  452 83.4 3.4e-16
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3           ( 376)  452 83.4 3.5e-16
CCDS14258.1 GPR34 gene_id:2857|Hs108|chrX          ( 381)  451 83.3   4e-16
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13         ( 344)  450 83.1 4.1e-16
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3            ( 355)  446 82.5 6.5e-16
CCDS12669.1 GPR4 gene_id:2828|Hs108|chr19          ( 362)  435 80.7 2.2e-15
CCDS2735.1 CXCR6 gene_id:10663|Hs108|chr3          ( 342)  433 80.4 2.6e-15
CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3           ( 360)  431 80.1 3.3e-15
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2            ( 355)  428 79.6 4.6e-15
CCDS3162.1 SUCNR1 gene_id:56670|Hs108|chr3         ( 334)  426 79.3 5.5e-15
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3            ( 359)  415 77.6 1.9e-14
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3           ( 388)  415 77.6   2e-14
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3           ( 394)  415 77.7   2e-14
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX          ( 415)  414 77.5 2.3e-14
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3            ( 360)  412 77.1 2.6e-14
CCDS53842.1 HCAR3 gene_id:8843|Hs108|chr12         ( 387)  412 77.2 2.8e-14
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8           ( 380)  411 77.0 3.1e-14
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX          ( 368)  408 76.5 4.1e-14
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3           ( 357)  407 76.3 4.5e-14
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3           ( 369)  407 76.4 4.6e-14
CCDS12459.1 FFAR3 gene_id:2865|Hs108|chr19         ( 346)  405 76.0 5.5e-14
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2          ( 362)  405 76.0 5.7e-14
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3            ( 355)  404 75.9 6.2e-14
CCDS9235.1 HCAR2 gene_id:338442|Hs108|chr12        ( 363)  400 75.3 9.8e-14
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20         ( 388)  399 75.1 1.1e-13
CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1           ( 361)  396 74.6 1.5e-13
CCDS9997.1 GPR132 gene_id:29933|Hs108|chr14        ( 380)  393 74.2 2.2e-13
CCDS8553.1 LPAR5 gene_id:57121|Hs108|chr12         ( 372)  392 74.0 2.4e-13


>>CCDS4031.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5                (374 aa)
 initn: 2520 init1: 2520 opt: 2520  Z-score: 2156.4  bits: 407.7 E(32554): 8.5e-114
Smith-Waterman score: 2520; 100.0% identity (100.0% similar) in 374 aa overlap (1-374:1-374)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MKALIFAAAGLLLLLPTFCQSGMENDTNNLAKPTLPIKTFRGAPPNSFEEFPFSALEGWT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 MKALIFAAAGLLLLLPTFCQSGMENDTNNLAKPTLPIKTFRGAPPNSFEEFPFSALEGWT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 GATITVKIKCPEESASHLHVKNATMGYLTSSLSTKLIPAIYLLVFVVGVPANAVTLWMLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 GATITVKIKCPEESASHLHVKNATMGYLTSSLSTKLIPAIYLLVFVVGVPANAVTLWMLF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 FRTRSICTTVFYTNLAIADFLFCVTLPFKIAYHLNGNNWVFGEVLCRATTVIFYGNMYCS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 FRTRSICTTVFYTNLAIADFLFCVTLPFKIAYHLNGNNWVFGEVLCRATTVIFYGNMYCS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 ILLLACISINRYLAIVHPFTYRGLPKHTYALVTCGLVWATVFLYMLPFFILKQEYYLVQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 ILLLACISINRYLAIVHPFTYRGLPKHTYALVTCGLVWATVFLYMLPFFILKQEYYLVQP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 DITTCHDVHNTCESSSPFQLYYFISLAFFGFLIPFVLIIYCYAAIIRTLNAYDHRWLWYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 DITTCHDVHNTCESSSPFQLYYFISLAFFGFLIPFVLIIYCYAAIIRTLNAYDHRWLWYV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 KASLLILVIFTICFAPSNIILIIHHANYYYNNTDGLYFIYLIALCLGSLNSCLDPFLYFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 KASLLILVIFTICFAPSNIILIIHHANYYYNNTDGLYFIYLIALCLGSLNSCLDPFLYFL
              310       320       330       340       350       360

              370    
pF1KB8 MSKTRNHSTAYLTK
       ::::::::::::::
CCDS40 MSKTRNHSTAYLTK
              370    

>>CCDS58959.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5               (352 aa)
 initn: 2380 init1: 2380 opt: 2380  Z-score: 2038.1  bits: 385.7 E(32554): 3.3e-107
Smith-Waterman score: 2380; 100.0% identity (100.0% similar) in 352 aa overlap (23-374:1-352)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB8 MKALIFAAAGLLLLLPTFCQSGMENDTNNLAKPTLPIKTFRGAPPNSFEEFPFSALEGWT
                             ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58                       MENDTNNLAKPTLPIKTFRGAPPNSFEEFPFSALEGWT
                                     10        20        30        

               70        80        90       100       110       120
pF1KB8 GATITVKIKCPEESASHLHVKNATMGYLTSSLSTKLIPAIYLLVFVVGVPANAVTLWMLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GATITVKIKCPEESASHLHVKNATMGYLTSSLSTKLIPAIYLLVFVVGVPANAVTLWMLF
       40        50        60        70        80        90        

              130       140       150       160       170       180
pF1KB8 FRTRSICTTVFYTNLAIADFLFCVTLPFKIAYHLNGNNWVFGEVLCRATTVIFYGNMYCS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FRTRSICTTVFYTNLAIADFLFCVTLPFKIAYHLNGNNWVFGEVLCRATTVIFYGNMYCS
      100       110       120       130       140       150        

              190       200       210       220       230       240
pF1KB8 ILLLACISINRYLAIVHPFTYRGLPKHTYALVTCGLVWATVFLYMLPFFILKQEYYLVQP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ILLLACISINRYLAIVHPFTYRGLPKHTYALVTCGLVWATVFLYMLPFFILKQEYYLVQP
      160       170       180       190       200       210        

              250       260       270       280       290       300
pF1KB8 DITTCHDVHNTCESSSPFQLYYFISLAFFGFLIPFVLIIYCYAAIIRTLNAYDHRWLWYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DITTCHDVHNTCESSSPFQLYYFISLAFFGFLIPFVLIIYCYAAIIRTLNAYDHRWLWYV
      220       230       240       250       260       270        

              310       320       330       340       350       360
pF1KB8 KASLLILVIFTICFAPSNIILIIHHANYYYNNTDGLYFIYLIALCLGSLNSCLDPFLYFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KASLLILVIFTICFAPSNIILIIHHANYYYNNTDGLYFIYLIALCLGSLNSCLDPFLYFL
      280       290       300       310       320       330        

              370    
pF1KB8 MSKTRNHSTAYLTK
       ::::::::::::::
CCDS58 MSKTRNHSTAYLTK
      340       350  

>>CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5                (397 aa)
 initn: 533 init1: 301 opt: 746  Z-score: 652.8  bits: 129.6 E(32554): 4.8e-30
Smith-Waterman score: 746; 38.4% identity (70.0% similar) in 307 aa overlap (80-372:61-359)

      50        60        70        80        90       100         
pF1KB8 EFPFSALEGWTGATITVKIKCPEESASHLHVKNATMGYLTSSLSTKLIPAIYLLVFVVGV
                                     : . . . ::..:.: ..: .: .:::::.
CCDS40 RSSKGRSLIGKVDGTSHVTGKGVTVETVFSVDEFSASVLTGKLTTVFLPIVYTIVFVVGL
               40        50        60        70        80        90

     110       120       130        140       150       160        
pF1KB8 PANAVTLWMLFFRTRSICTTVFY-TNLAIADFLFCVTLPFKIAYHLNGNNWVFGEVLCRA
       :.:...::...:::..   .:.: .:::.::.:  . .:.:::::..::::..::.:: .
CCDS40 PSNGMALWVFLFRTKKKHPAVIYMANLALADLLSVIWFPLKIAYHIHGNNWIYGEALCNV
              100       110       120       130       140       150

      170       180       190       200       210       220        
pF1KB8 TTVIFYGNMYCSILLLACISINRYLAIVHPFTYRGLPKHTYALVTCGLVWATVFLYMLPF
          .::::::::::...:.:..:: .::.:. . .  : . :.     .:  ..:  .:.
CCDS40 LIGFFYGNMYCSILFMTCLSVQRYWVIVNPMGH-SRKKANIAIGISLAIWLLILLVTIPL
              160       170       180        190       200         

      230       240       250       260             270       280  
pF1KB8 FILKQEYYLVQPDITTCHDVHNTCESSSPFQLY------YFISLAFFGFLIPFVLIIYCY
       ...::  ..   .:::::::        : ::       ::.:::.  ::.:  :    :
CCDS40 YVVKQTIFIPALNITTCHDVL-------PEQLLVGDMFNYFLSLAIGVFLFPAFLTASAY
     210       220       230              240       250       260  

              290           300       310       320       330      
pF1KB8 AAIIRTL--NAYDH----RWLWYVKASLLILVIFTICFAPSNIILIIHHANYYYNNTDGL
       . .:: :  .:.:.    .    .:  . .:... :::.:::..:..:.     .. . .
CCDS40 VLMIRMLRSSAMDENSEKKRKRAIKLIVTVLAMYLICFTPSNLLLVVHYFLIKSQGQSHV
            270       280       290       300       310       320  

        340       350       360        370                         
pF1KB8 YFIYLIALCLGSLNSCLDPFLYFLMSKT-RNHSTAYLTK                     
       : .:..::::..::::.:::.:...:.  :.:.   :                       
CCDS40 YALYIVALCLSTLNSCIDPFVYYFVSHDFRDHAKNALLCRSVRTVKQMQVSLTSKKHSRK
            330       340       350       360       370       380  

CCDS40 SSSYSSSSTTVKTSY
            390       

>>CCDS12350.1 F2RL3 gene_id:9002|Hs108|chr19              (385 aa)
 initn: 676 init1: 467 opt: 693  Z-score: 608.1  bits: 121.2 E(32554): 1.5e-27
Smith-Waterman score: 693; 36.9% identity (69.6% similar) in 293 aa overlap (70-362:54-344)

      40        50        60        70        80        90         
pF1KB8 FRGAPPNSFEEFPFSALEGWTGATITVKIKCPEESASHLHVKNATMGYLTSSLSTKLIPA
                                     : ..: . :.. ... . : . . :.:.::
CCDS12 SVYDESGSTGGGDDSTPSILPAPRGYPGQVCANDSDT-LELPDSSRALLLGWVPTRLVPA
            30        40        50        60         70        80  

     100       110       120       130       140       150         
pF1KB8 IYLLVFVVGVPANAVTLWMLFFRTRSICTTVFYTNLAIADFLFCVTLPFKIAYHLNGNNW
       .: ::.:::.:::...::.:  ..  . .:..  ::: ::.:. ..:: .::::: :. :
CCDS12 LYGLVLVVGLPANGLALWVLATQAPRLPSTMLLMNLAAADLLLALALPPRIAYHLRGQRW
             90       100       110       120       130       140  

     160       170       180       190       200       210         
pF1KB8 VFGEVLCRATTVIFYGNMYCSILLLACISINRYLAIVHPFTYRGLPKHTYALVTCGLVWA
        :::. :: .:. .::.:: :.:::: .:..::::.:::.  :.:  .  ::  :  .: 
CCDS12 PFGEAACRLATAALYGHMYGSVLLLAAVSLDRYLALVHPLRARALRGRRLALGLCMAAWL
            150       160       170       180       190       200  

     220       230       240       250       260       270         
pF1KB8 TVFLYMLPFFILKQEYYLVQPDITTCHDVHNTCESSSPFQLYYFISLAFFGFLIPFVLII
        .    ::. . .: . :.. : . :::.     ..: .:   :  ::..: ..:.. ..
CCDS12 MAAALALPLTLQRQTFRLARSDRVLCHDALPLDAQASHWQ-PAFTCLALLGCFLPLLAML
            210       220       230       240        250       260 

     280       290       300       310       320       330         
pF1KB8 YCYAAIIRTLNAYDHRWLWYVKASLLILVIFTICFAPSNIILIIHHANYYYNNTDGLYFI
        ::.: ..:: :  .:.   .. . ..:.  .  :.:::..:..:...   .   .::  
CCDS12 LCYGATLHTLAASGRRYGHALRLTAVVLASAVAFFVPSNLLLLLHYSDPSPSAWGNLYGA
             270       280       290       300       310       320 

     340       350       360       370                             
pF1KB8 YLIALCLGSLNSCLDPFLYFLMSKTRNHSTAYLTK                         
       :. .: :..::::.:::.:. .:                                     
CCDS12 YVPSLALSTLNSCVDPFIYYYVSAEFRDKVRAGLFQRSPGDTVASKASAEGGSRGMGTHS
             330       340       350       360       370       380 

>>CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5                  (425 aa)
 initn: 663 init1: 334 opt: 671  Z-score: 588.9  bits: 117.8 E(32554): 1.8e-26
Smith-Waterman score: 671; 32.1% identity (64.7% similar) in 377 aa overlap (2-362:4-375)

                 10         20        30        40         50      
pF1KB8   MKALIFAAAGLLLLLPTFC-QSGMENDTNNLAKPTLPIKTFRGAPPNS-FEEFPFSAL
          . :...:: . :  : .  ..  .   .. .. ::  ..:    ::. .: :  .  
CCDS40 MGPRRLLLVAACFSLCGPLLSARTRARRPESKATNATLDPRSFLLRNPNDKYEPFWEDEE
               10        20        30        40        50        60

         60            70        80        90       100       110  
pF1KB8 EGWTGAT----ITVKIKCPEESASHLHVKNATMGYLTSSLSTKLIPAIYLLVFVVGVPAN
       .. .: :    .... . : ..     ... . ::::::  : ..:..:  ::::..: :
CCDS40 KNESGLTEYRLVSINKSSPLQKQLPAFISEDASGYLTSSWLTLFVPSVYTGVFVVSLPLN
               70        80        90       100       110       120

              120       130       140       150       160       170
pF1KB8 --AVTLWMLFFRTRSICTTVFYTNLAIADFLFCVTLPFKIAYHLNGNNWVFGEVLCRATT
         :.....: .....  ..:.. .:: :: ::  .:::::.:...:..: ::  ::: .:
CCDS40 IMAIVVFILKMKVKKP-AVVYMLHLATADVLFVSVLPFKISYYFSGSDWQFGSELCRFVT
              130        140       150       160       170         

              180       190          200       210       220       
pF1KB8 VIFYGNMYCSILLLACISINRYLAIVHP---FTYRGLPKHTYALVTCGLVWATVFLYMLP
       . :: ::: ::::.. :::.:.::.:.:   ...: : . ..   ::  .:: ..  ..:
CCDS40 AAFYCNMYASILLMTVISIDRFLAVVYPMQSLSWRTLGRASF---TCLAIWALAIAGVVP
     180       190       200       210       220          230      

       230       240       250       260       270       280       
pF1KB8 FFILKQEYYLVQPDITTCHDVHNTCESSSPFQLYYFISLAFFGFLIPFVLIIYCYAAIIR
       ... .:   .   .::::::: :     . .  ::: ...   :..:...   ::..:::
CCDS40 LLLKEQTIQVPGLNITTCHDVLNETLLEG-YYAYYFSAFSAVFFFVPLIISTVCYVSIIR
        240       250       260        270       280       290     

       290           300       310       320       330        340  
pF1KB8 TLN----AYDHRWLWYVKASLLILVIFTICFAPSNIILIIHHANYYYNNT-DGLYFIYLI
        :.    :   .    .  :  .. :: :::.:.:..:: :..   ...: .. :: ::.
CCDS40 CLSSSAVANRSKKSRALFLSAAVFCIFIICFGPTNVLLIAHYSFLSHTSTTEAAYFAYLL
         300       310       320       330       340       350     

            350       360       370                                
pF1KB8 ALCLGSLNSCLDPFLYFLMSKTRNHSTAYLTK                            
        .:..:.. :.::..:.  :                                        
CCDS40 CVCVSSISCCIDPLIYYYASSECQRYVYSILCCKESSDPSSYNSSGQLMASKMDTCSSNL
         360       370       380       390       400       410     

>>CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrY             (359 aa)
 initn: 616 init1: 325 opt: 618  Z-score: 544.9  bits: 109.4 E(32554): 5e-24
Smith-Waterman score: 618; 34.5% identity (66.9% similar) in 290 aa overlap (82-363:11-298)

              60        70        80        90       100       110 
pF1KB8 PFSALEGWTGATITVKIKCPEESASHLHVKNATMGYLTSSLSTKLIPAIYLLVFVVGVPA
                                     :::. .: .   .  .:..: :: .:..:.
CCDS14                     MQVPNSTGPDNATLQMLRNPAIAVALPVVYSLVAAVSIPG
                                   10        20        30        40

             120         130       140       150       160         
pF1KB8 NAVTLWMLFFRT--RSICTTVFYTNLAIADFLFCVTLPFKIAYHLNGNNWVFGEVLCRAT
       :  .::.:  :   ::  ...:. ::...:...  .:::.: :: : ..:::: .:: ..
CCDS14 NLFSLWVLCRRMGPRSP-SVIFMINLSVTDLMLASVLPFQIYYHCNRHHWVFGVLLCNVV
               50         60        70        80        90         

     170       180       190       200       210       220         
pF1KB8 TVIFYGNMYCSILLLACISINRYLAIVHPFTYRGLPKHTYALVTCGLVWATVFLYMLPFF
       :: ::.::: ::: ..:::..:.:....:.. .   .. ::...:. .:  ..  . :. 
CCDS14 TVAFYANMYSSILTMTCISVERFLGVLYPLSSKRWRRRRYAVAACAGTWLLLLTALSPLA
     100       110       120       130       140       150         

     230       240       250        260       270       280        
pF1KB8 ILKQEYYLVQPDITTCHDVHN-TCESSSPFQLYYFISLAFFGFLIPFVLIIYCYAAII--
            : .    : :: :: . :   :  .   ..... .. ::::::. . ::.: :  
CCDS14 RTDLTYPVHALGIITCFDVLKWTMLPSVAMWAVFLFTIFILLFLIPFVITVACYTATILK
     160       170       180       190       200       210         

          290        300       310       320       330       340   
pF1KB8 --RTLNAYDHRWLWY-VKASLLILVIFTICFAPSNIILIIHHANYYYNNTDGLYFIYLIA
         :: .:. ..     :  . ..:. :. ::::.:..:. : ..  . . .  : .: ..
CCDS14 LLRTEEAHGREQRRRAVGLAAVVLLAFVTCFAPNNFVLLAHIVSRLFYGKS-YYHVYKLT
     220       230       240       250       260       270         

           350       360       370                                 
pF1KB8 LCLGSLNSCLDPFLYFLMSKTRNHSTAYLTK                             
       :::. ::.:::::.:.. :.                                        
CCDS14 LCLSCLNNCLDPFVYYFASREFQLRLREYLGCRRVPRDTLDTRRESLFSARTTSVRSEAG
      280       290       300       310       320       330        

>>CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrX             (359 aa)
 initn: 616 init1: 325 opt: 618  Z-score: 544.9  bits: 109.4 E(32554): 5e-24
Smith-Waterman score: 618; 34.5% identity (66.9% similar) in 290 aa overlap (82-363:11-298)

              60        70        80        90       100       110 
pF1KB8 PFSALEGWTGATITVKIKCPEESASHLHVKNATMGYLTSSLSTKLIPAIYLLVFVVGVPA
                                     :::. .: .   .  .:..: :: .:..:.
CCDS14                     MQVPNSTGPDNATLQMLRNPAIAVALPVVYSLVAAVSIPG
                                   10        20        30        40

             120         130       140       150       160         
pF1KB8 NAVTLWMLFFRT--RSICTTVFYTNLAIADFLFCVTLPFKIAYHLNGNNWVFGEVLCRAT
       :  .::.:  :   ::  ...:. ::...:...  .:::.: :: : ..:::: .:: ..
CCDS14 NLFSLWVLCRRMGPRSP-SVIFMINLSVTDLMLASVLPFQIYYHCNRHHWVFGVLLCNVV
               50         60        70        80        90         

     170       180       190       200       210       220         
pF1KB8 TVIFYGNMYCSILLLACISINRYLAIVHPFTYRGLPKHTYALVTCGLVWATVFLYMLPFF
       :: ::.::: ::: ..:::..:.:....:.. .   .. ::...:. .:  ..  . :. 
CCDS14 TVAFYANMYSSILTMTCISVERFLGVLYPLSSKRWRRRRYAVAACAGTWLLLLTALSPLA
     100       110       120       130       140       150         

     230       240       250        260       270       280        
pF1KB8 ILKQEYYLVQPDITTCHDVHN-TCESSSPFQLYYFISLAFFGFLIPFVLIIYCYAAII--
            : .    : :: :: . :   :  .   ..... .. ::::::. . ::.: :  
CCDS14 RTDLTYPVHALGIITCFDVLKWTMLPSVAMWAVFLFTIFILLFLIPFVITVACYTATILK
     160       170       180       190       200       210         

          290        300       310       320       330       340   
pF1KB8 --RTLNAYDHRWLWY-VKASLLILVIFTICFAPSNIILIIHHANYYYNNTDGLYFIYLIA
         :: .:. ..     :  . ..:. :. ::::.:..:. : ..  . . .  : .: ..
CCDS14 LLRTEEAHGREQRRRAVGLAAVVLLAFVTCFAPNNFVLLAHIVSRLFYGKS-YYHVYKLT
     220       230       240       250       260       270         

           350       360       370                                 
pF1KB8 LCLGSLNSCLDPFLYFLMSKTRNHSTAYLTK                             
       :::. ::.:::::.:.. :.                                        
CCDS14 LCLSCLNNCLDPFVYYFASREFQLRLREYLGCRRVPRDTLDTRRESLFSARTTSVRSEAG
      280       290       300       310       320       330        

>>CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2                (367 aa)
 initn: 530 init1: 329 opt: 539  Z-score: 477.8  bits: 97.1 E(32554): 2.7e-20
Smith-Waterman score: 539; 35.1% identity (63.9% similar) in 296 aa overlap (90-372:55-339)

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB8 TGATITVKIKCPEESASHLHVKNATMGYLTSSLSTKLIPAIYLLVFVVGVPANAVTLWML
                                     . : . :. ..::: :.... .:...:: :
CCDS21 SSQSMNGLEVAPPGLITNFSLATAEQCGQETPLENMLFASFYLLDFILALVGNTLALW-L
           30        40        50        60        70        80    

     120         130       140        150       160       170      
pF1KB8 FFRTRSICT--TVFYTNLAIADFLFCV-TLPFKIAYHLNGNNWVFGEVLCRATTVIFYGN
       :.: ..  :  .::  .::.:: : :: .:: ...::..::.: :::. :: :  .:: :
CCDS21 FIRDHKSGTPANVFLMHLAVAD-LSCVLVLPTRLVYHFSGNHWPFGEIACRLTGFLFYLN
            90       100        110       120       130       140  

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB8 MYCSILLLACISINRYLAIVHPFTYRGLPKHTYALVTCGLVWATVFLYMLPFFILKQEYY
       :: :: .:.::: .:.::::::     : .  :: ..:...:..: . : :...  :   
CCDS21 MYASIYFLTCISADRFLAIVHPVKSLKLRRPLYAHLACAFLWVVVAVAMAPLLVSPQT--
            150       160       170       180       190       200  

        240        250       260       270       280       290     
pF1KB8 LVQPDITT-CHDVHNTCESSSPFQLYYFISLAFFGFLIPFVLIIYCYAAIIRTLNA---Y
        :: . :. : ...   :..:   :   .:::  .: .::.  . ::  :::.:      
CCDS21 -VQTNHTVVCLQLYR--EKASHHAL---VSLAV-AFTFPFITTVTCYLLIIRSLRQGLRV
               210         220           230       240       250   

             300       310          320       330         340      
pF1KB8 DHRW-LWYVKASLLILVIFTICFAPSNI---ILIIHHANYYYNNTDG--LYFIYLIALCL
       ..:     :.   ..:.:: .::.: ..   . ..:. ..  . .    : .   :. ::
CCDS21 EKRLKTKAVRMIAIVLAIFLVCFVPYHVNRSVYVLHYRSHGASCATQRILALANRITSCL
           260       270       280       290       300       310   

        350       360       370                              
pF1KB8 GSLNSCLDPFLYFLMSKTRNHSTAYLTK                          
        :::. :::..::....   :.   :                            
CCDS21 TSLNGALDPIMYFFVAEKFRHALCNLLCGKRLKGPPPSFEGKTNESSLSAKSEL
           320       330       340       350       360       

>>CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3                (373 aa)
 initn: 495 init1: 280 opt: 522  Z-score: 463.3  bits: 94.4 E(32554): 1.7e-19
Smith-Waterman score: 522; 34.5% identity (63.3% similar) in 281 aa overlap (97-364:54-330)

         70        80        90       100       110       120      
pF1KB8 KIKCPEESASHLHVKNATMGYLTSSLSTKLIPAIYLLVFVVGVPANAVTLWMLFFRTRSI
                                     .::.:.:::..:  .:.:..::. :. .  
CCDS31 SWGNSTVASTAAVSSSFKCALTKTGFQFYYLPAVYILVFIIGFLGNSVAIWMFVFHMKPW
            30        40        50        60        70        80   

         130       140       150       160       170       180     
pF1KB8 C-TTVFYTNLAIADFLFCVTLPFKIAYHLNGNNWVFGEVLCRATTVIFYGNMYCSILLLA
          .:.. :::.::::. .:::  : :..: ..:.::...:.    ::. :.: :::.:.
CCDS31 SGISVYMFNLALADFLYVLTLPALIFYYFNKTDWIFGDAMCKLQRFIFHVNLYGSILFLT
            90       100       110       120       130       140   

         190       200       210       220       230       240     
pF1KB8 CISINRYLAIVHPFTYRGLPKHTYALVTCGLVWATVFLYMLPFFILKQEYYLVQPDIT-T
       ::: .:: ..:.:.   :  :.  :.    :::  : . . :  ::      :. . : :
CCDS31 CISAHRYSGVVYPLKSLGRLKKKNAICISVLVWLIVVVAISP--ILFYSGTGVRKNKTIT
           150       160       170       180         190       200 

          250       260       270       280         290       300  
pF1KB8 CHDVHNTCESSSPFQLYYFISLAFFGFLIPFVLIIYCYAAIIRTL--NAYDHRWLWYVKA
       :.:. .     : :   .  ..:.:   .:.:::. ::. :.:.:  .  :.  :   . 
CCDS31 CYDTTSDEYLRSYFIYSMCTTVAMF--CVPLVLILGCYGLIVRALIYKDLDNSPLRRKSI
             210       220         230       240       250         

              310       320        330             340       350   
pF1KB8 SLLILV--IFTICFAPSNIILIIH-HANYYYNN------TDGLYFIYLIALCLGSLNSCL
        :.:.:  .:.. . : ...  .. .:   ...      .: .:  : ..  :.:::::.
CCDS31 YLVIIVLTVFAVSYIPFHVMKTMNLRARLDFQTPAMCAFNDRVYATYQVTRGLASLNSCV
     260       270       280       290       300       310         

           360       370                                     
pF1KB8 DPFLYFLMSKTRNHSTAYLTK                                 
       ::.:::: . :                                           
CCDS31 DPILYFLAGDTFRRRLSRATRKASRRSEANLQSKSEDMTLNILPEFKQNGDTSL
     320       330       340       350       360       370   

>>CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX               (370 aa)
 initn: 395 init1: 253 opt: 515  Z-score: 457.4  bits: 93.3 E(32554): 3.7e-19
Smith-Waterman score: 515; 31.1% identity (62.9% similar) in 315 aa overlap (72-368:12-321)

              50        60        70        80             90      
pF1KB8 GAPPNSFEEFPFSALEGWTGATITVKIKCPEESASHLHVK--NATMG---YLTSSLSTKL
                                     ..: : :. .  ::: .    . .:.. .:
CCDS14                    MGDRRFIDFQFQDSNSSLRPRLGNATANNTCIVDDSFKYNL
                                  10        20        30        40 

        100       110       120        130       140       150     
pF1KB8 IPAIYLLVFVVGVPANAVTLWMLFFRTRSIC-TTVFYTNLAIADFLFCVTLPFKIAYHLN
         :.: .::..:. .:.:.:... :: .    :..: ::::..:.::  :::::: :..:
CCDS14 NGAVYSVVFILGLITNSVSLFVFCFRMKMRSETAIFITNLAVSDLLFVCTLPFKIFYNFN
              50        60        70        80        90       100 

         160       170       180       190       200       210     
pF1KB8 GNNWVFGEVLCRATTVIFYGNMYCSILLLACISINRYLAIVHPFTYRGLPKHTYALVTCG
         .: ::..::. . . :  :.: :.:.:.:::..:.::::.::  : .  .  . ..:.
CCDS14 -RHWPFGDTLCKISGTAFLTNIYGSMLFLTCISVDRFLAIVYPFRSRTIRTRRNSAIVCA
              110       120       130       140       150       160

         220       230       240        250       260       270    
pF1KB8 LVWATVFLYMLPFFILKQEYYLVQPDITTCHD-VHNTCESSSPFQLYYFISLAFFGFLIP
        ::  :.   .   ...     :.   ::: .   .   ..   ..  :: ..  ::.::
CCDS14 GVWILVLSGGISASLFSTTN--VNNATTTCFEGFSKRVWKTYLSKITIFIEVV--GFIIP
              170       180         190       200       210        

          280        290       300            310       320        
pF1KB8 FVLIIYCYAAIIRTL-NAYDHRWLWYVKASLLILV-----IFTICFAPSNIILIIHHANY
       ..: . : ....::: .      .   : ..: ..     .:..::.: : .:...    
CCDS14 LILNVSCSSVVLRTLRKPATLSQIGTNKKKVLKMITVHMAVFVVCFVPYNSVLFLYALVR
        220       230       240       250       260       270      

      330            340       350       360       370             
pF1KB8 YYNNTDGLY-----FIYLIALCLGSLNSCLDPFLYFLMSKTRNHSTAYLTK         
           :. .      ..: :.:::..:: :.:::.:..  .. ..:               
CCDS14 SQAITNCFLERFAKIMYPITLCLATLNCCFDPFIYYFTLESFQKSFYINAHIRMESLFKT
        280       290       300       310       320       330      

CCDS14 ETPLTTKPSLPAIQEEVSDQTTNNGGELMLESTF
        340       350       360       370




374 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 16:48:57 2016 done: Fri Nov  4 16:48:58 2016
 Total Scan time:  2.120 Total Display time:  0.020

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com