FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8979, 374 aa
1>>>pF1KB8979 374 - 374 aa - 374 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9830+/-0.00125; mu= 12.8946+/- 0.074
mean_var=139.2533+/-42.712, 0's: 0 Z-trim(102.7): 309 B-trim: 935 in 2/46
Lambda= 0.108685
statistics sampled from 6577 (7057) to 6577 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.551), E-opt: 0.2 (0.217), width: 16
Scan time: 2.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4031.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 374) 2520 407.7 8.5e-114
CCDS58959.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 ( 352) 2380 385.7 3.3e-107
CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5 ( 397) 746 129.6 4.8e-30
CCDS12350.1 F2RL3 gene_id:9002|Hs108|chr19 ( 385) 693 121.2 1.5e-27
CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5 ( 425) 671 117.8 1.8e-26
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrY ( 359) 618 109.4 5e-24
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrX ( 359) 618 109.4 5e-24
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 539 97.1 2.7e-20
CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 ( 373) 522 94.4 1.7e-19
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 515 93.3 3.7e-19
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 500 90.9 1.8e-18
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX ( 365) 496 90.3 2.9e-18
CCDS3157.1 GPR87 gene_id:53836|Hs108|chr3 ( 358) 478 87.5 2e-17
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX ( 337) 476 87.1 2.4e-17
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 470 86.2 4.7e-17
CCDS9492.1 GPR183 gene_id:1880|Hs108|chr13 ( 361) 470 86.2 4.8e-17
CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13 ( 337) 469 86.0 5.2e-17
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 467 85.8 6.8e-17
CCDS9894.2 GPR68 gene_id:8111|Hs108|chr14 ( 365) 465 85.5 8.4e-17
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 465 85.5 8.5e-17
CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11 ( 377) 462 85.0 1.2e-16
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 456 84.0 2.2e-16
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 452 83.4 3.4e-16
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 452 83.4 3.5e-16
CCDS14258.1 GPR34 gene_id:2857|Hs108|chrX ( 381) 451 83.3 4e-16
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 450 83.1 4.1e-16
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 446 82.5 6.5e-16
CCDS12669.1 GPR4 gene_id:2828|Hs108|chr19 ( 362) 435 80.7 2.2e-15
CCDS2735.1 CXCR6 gene_id:10663|Hs108|chr3 ( 342) 433 80.4 2.6e-15
CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3 ( 360) 431 80.1 3.3e-15
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 ( 355) 428 79.6 4.6e-15
CCDS3162.1 SUCNR1 gene_id:56670|Hs108|chr3 ( 334) 426 79.3 5.5e-15
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 415 77.6 1.9e-14
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 415 77.6 2e-14
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 415 77.7 2e-14
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 414 77.5 2.3e-14
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 412 77.1 2.6e-14
CCDS53842.1 HCAR3 gene_id:8843|Hs108|chr12 ( 387) 412 77.2 2.8e-14
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 411 77.0 3.1e-14
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 408 76.5 4.1e-14
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 407 76.3 4.5e-14
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 407 76.4 4.6e-14
CCDS12459.1 FFAR3 gene_id:2865|Hs108|chr19 ( 346) 405 76.0 5.5e-14
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 405 76.0 5.7e-14
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 404 75.9 6.2e-14
CCDS9235.1 HCAR2 gene_id:338442|Hs108|chr12 ( 363) 400 75.3 9.8e-14
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 399 75.1 1.1e-13
CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1 ( 361) 396 74.6 1.5e-13
CCDS9997.1 GPR132 gene_id:29933|Hs108|chr14 ( 380) 393 74.2 2.2e-13
CCDS8553.1 LPAR5 gene_id:57121|Hs108|chr12 ( 372) 392 74.0 2.4e-13
>>CCDS4031.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 (374 aa)
initn: 2520 init1: 2520 opt: 2520 Z-score: 2156.4 bits: 407.7 E(32554): 8.5e-114
Smith-Waterman score: 2520; 100.0% identity (100.0% similar) in 374 aa overlap (1-374:1-374)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MKALIFAAAGLLLLLPTFCQSGMENDTNNLAKPTLPIKTFRGAPPNSFEEFPFSALEGWT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 MKALIFAAAGLLLLLPTFCQSGMENDTNNLAKPTLPIKTFRGAPPNSFEEFPFSALEGWT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 GATITVKIKCPEESASHLHVKNATMGYLTSSLSTKLIPAIYLLVFVVGVPANAVTLWMLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 GATITVKIKCPEESASHLHVKNATMGYLTSSLSTKLIPAIYLLVFVVGVPANAVTLWMLF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 FRTRSICTTVFYTNLAIADFLFCVTLPFKIAYHLNGNNWVFGEVLCRATTVIFYGNMYCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 FRTRSICTTVFYTNLAIADFLFCVTLPFKIAYHLNGNNWVFGEVLCRATTVIFYGNMYCS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 ILLLACISINRYLAIVHPFTYRGLPKHTYALVTCGLVWATVFLYMLPFFILKQEYYLVQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 ILLLACISINRYLAIVHPFTYRGLPKHTYALVTCGLVWATVFLYMLPFFILKQEYYLVQP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 DITTCHDVHNTCESSSPFQLYYFISLAFFGFLIPFVLIIYCYAAIIRTLNAYDHRWLWYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 DITTCHDVHNTCESSSPFQLYYFISLAFFGFLIPFVLIIYCYAAIIRTLNAYDHRWLWYV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 KASLLILVIFTICFAPSNIILIIHHANYYYNNTDGLYFIYLIALCLGSLNSCLDPFLYFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS40 KASLLILVIFTICFAPSNIILIIHHANYYYNNTDGLYFIYLIALCLGSLNSCLDPFLYFL
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB8 MSKTRNHSTAYLTK
::::::::::::::
CCDS40 MSKTRNHSTAYLTK
370
>>CCDS58959.1 F2RL2 gene_id:2151|Hs108|chr5 (352 aa)
initn: 2380 init1: 2380 opt: 2380 Z-score: 2038.1 bits: 385.7 E(32554): 3.3e-107
Smith-Waterman score: 2380; 100.0% identity (100.0% similar) in 352 aa overlap (23-374:1-352)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MKALIFAAAGLLLLLPTFCQSGMENDTNNLAKPTLPIKTFRGAPPNSFEEFPFSALEGWT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MENDTNNLAKPTLPIKTFRGAPPNSFEEFPFSALEGWT
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 GATITVKIKCPEESASHLHVKNATMGYLTSSLSTKLIPAIYLLVFVVGVPANAVTLWMLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GATITVKIKCPEESASHLHVKNATMGYLTSSLSTKLIPAIYLLVFVVGVPANAVTLWMLF
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 FRTRSICTTVFYTNLAIADFLFCVTLPFKIAYHLNGNNWVFGEVLCRATTVIFYGNMYCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FRTRSICTTVFYTNLAIADFLFCVTLPFKIAYHLNGNNWVFGEVLCRATTVIFYGNMYCS
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 ILLLACISINRYLAIVHPFTYRGLPKHTYALVTCGLVWATVFLYMLPFFILKQEYYLVQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ILLLACISINRYLAIVHPFTYRGLPKHTYALVTCGLVWATVFLYMLPFFILKQEYYLVQP
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 DITTCHDVHNTCESSSPFQLYYFISLAFFGFLIPFVLIIYCYAAIIRTLNAYDHRWLWYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DITTCHDVHNTCESSSPFQLYYFISLAFFGFLIPFVLIIYCYAAIIRTLNAYDHRWLWYV
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 KASLLILVIFTICFAPSNIILIIHHANYYYNNTDGLYFIYLIALCLGSLNSCLDPFLYFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KASLLILVIFTICFAPSNIILIIHHANYYYNNTDGLYFIYLIALCLGSLNSCLDPFLYFL
280 290 300 310 320 330
370
pF1KB8 MSKTRNHSTAYLTK
::::::::::::::
CCDS58 MSKTRNHSTAYLTK
340 350
>>CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5 (397 aa)
initn: 533 init1: 301 opt: 746 Z-score: 652.8 bits: 129.6 E(32554): 4.8e-30
Smith-Waterman score: 746; 38.4% identity (70.0% similar) in 307 aa overlap (80-372:61-359)
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 EFPFSALEGWTGATITVKIKCPEESASHLHVKNATMGYLTSSLSTKLIPAIYLLVFVVGV
: . . . ::..:.: ..: .: .:::::.
CCDS40 RSSKGRSLIGKVDGTSHVTGKGVTVETVFSVDEFSASVLTGKLTTVFLPIVYTIVFVVGL
40 50 60 70 80 90
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 PANAVTLWMLFFRTRSICTTVFY-TNLAIADFLFCVTLPFKIAYHLNGNNWVFGEVLCRA
:.:...::...:::.. .:.: .:::.::.: . .:.:::::..::::..::.:: .
CCDS40 PSNGMALWVFLFRTKKKHPAVIYMANLALADLLSVIWFPLKIAYHIHGNNWIYGEALCNV
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KB8 TTVIFYGNMYCSILLLACISINRYLAIVHPFTYRGLPKHTYALVTCGLVWATVFLYMLPF
.::::::::::...:.:..:: .::.:. . . : . :. .: ..: .:.
CCDS40 LIGFFYGNMYCSILFMTCLSVQRYWVIVNPMGH-SRKKANIAIGISLAIWLLILLVTIPL
160 170 180 190 200
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 FILKQEYYLVQPDITTCHDVHNTCESSSPFQLY------YFISLAFFGFLIPFVLIIYCY
...:: .. .::::::: : :: ::.:::. ::.: : :
CCDS40 YVVKQTIFIPALNITTCHDVL-------PEQLLVGDMFNYFLSLAIGVFLFPAFLTASAY
210 220 230 240 250 260
290 300 310 320 330
pF1KB8 AAIIRTL--NAYDH----RWLWYVKASLLILVIFTICFAPSNIILIIHHANYYYNNTDGL
. .:: : .:.:. . .: . .:... :::.:::..:..:. .. . .
CCDS40 VLMIRMLRSSAMDENSEKKRKRAIKLIVTVLAMYLICFTPSNLLLVVHYFLIKSQGQSHV
270 280 290 300 310 320
340 350 360 370
pF1KB8 YFIYLIALCLGSLNSCLDPFLYFLMSKT-RNHSTAYLTK
: .:..::::..::::.:::.:...:. :.:. :
CCDS40 YALYIVALCLSTLNSCIDPFVYYFVSHDFRDHAKNALLCRSVRTVKQMQVSLTSKKHSRK
330 340 350 360 370 380
CCDS40 SSSYSSSSTTVKTSY
390
>>CCDS12350.1 F2RL3 gene_id:9002|Hs108|chr19 (385 aa)
initn: 676 init1: 467 opt: 693 Z-score: 608.1 bits: 121.2 E(32554): 1.5e-27
Smith-Waterman score: 693; 36.9% identity (69.6% similar) in 293 aa overlap (70-362:54-344)
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 FRGAPPNSFEEFPFSALEGWTGATITVKIKCPEESASHLHVKNATMGYLTSSLSTKLIPA
: ..: . :.. ... . : . . :.:.::
CCDS12 SVYDESGSTGGGDDSTPSILPAPRGYPGQVCANDSDT-LELPDSSRALLLGWVPTRLVPA
30 40 50 60 70 80
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 IYLLVFVVGVPANAVTLWMLFFRTRSICTTVFYTNLAIADFLFCVTLPFKIAYHLNGNNW
.: ::.:::.:::...::.: .. . .:.. ::: ::.:. ..:: .::::: :. :
CCDS12 LYGLVLVVGLPANGLALWVLATQAPRLPSTMLLMNLAAADLLLALALPPRIAYHLRGQRW
90 100 110 120 130 140
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 VFGEVLCRATTVIFYGNMYCSILLLACISINRYLAIVHPFTYRGLPKHTYALVTCGLVWA
:::. :: .:. .::.:: :.:::: .:..::::.:::. :.: . :: : .:
CCDS12 PFGEAACRLATAALYGHMYGSVLLLAAVSLDRYLALVHPLRARALRGRRLALGLCMAAWL
150 160 170 180 190 200
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 TVFLYMLPFFILKQEYYLVQPDITTCHDVHNTCESSSPFQLYYFISLAFFGFLIPFVLII
. ::. . .: . :.. : . :::. ..: .: : ::..: ..:.. ..
CCDS12 MAAALALPLTLQRQTFRLARSDRVLCHDALPLDAQASHWQ-PAFTCLALLGCFLPLLAML
210 220 230 240 250 260
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 YCYAAIIRTLNAYDHRWLWYVKASLLILVIFTICFAPSNIILIIHHANYYYNNTDGLYFI
::.: ..:: : .:. .. . ..:. . :.:::..:..:... . .::
CCDS12 LCYGATLHTLAASGRRYGHALRLTAVVLASAVAFFVPSNLLLLLHYSDPSPSAWGNLYGA
270 280 290 300 310 320
340 350 360 370
pF1KB8 YLIALCLGSLNSCLDPFLYFLMSKTRNHSTAYLTK
:. .: :..::::.:::.:. .:
CCDS12 YVPSLALSTLNSCVDPFIYYYVSAEFRDKVRAGLFQRSPGDTVASKASAEGGSRGMGTHS
330 340 350 360 370 380
>>CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5 (425 aa)
initn: 663 init1: 334 opt: 671 Z-score: 588.9 bits: 117.8 E(32554): 1.8e-26
Smith-Waterman score: 671; 32.1% identity (64.7% similar) in 377 aa overlap (2-362:4-375)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MKALIFAAAGLLLLLPTFC-QSGMENDTNNLAKPTLPIKTFRGAPPNS-FEEFPFSAL
. :...:: . : : . .. . .. .. :: ..: ::. .: : .
CCDS40 MGPRRLLLVAACFSLCGPLLSARTRARRPESKATNATLDPRSFLLRNPNDKYEPFWEDEE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 EGWTGAT----ITVKIKCPEESASHLHVKNATMGYLTSSLSTKLIPAIYLLVFVVGVPAN
.. .: : .... . : .. ... . :::::: : ..:..: ::::..: :
CCDS40 KNESGLTEYRLVSINKSSPLQKQLPAFISEDASGYLTSSWLTLFVPSVYTGVFVVSLPLN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 --AVTLWMLFFRTRSICTTVFYTNLAIADFLFCVTLPFKIAYHLNGNNWVFGEVLCRATT
:.....: ..... ..:.. .:: :: :: .:::::.:...:..: :: ::: .:
CCDS40 IMAIVVFILKMKVKKP-AVVYMLHLATADVLFVSVLPFKISYYFSGSDWQFGSELCRFVT
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB8 VIFYGNMYCSILLLACISINRYLAIVHP---FTYRGLPKHTYALVTCGLVWATVFLYMLP
. :: ::: ::::.. :::.:.::.:.: ...: : . .. :: .:: .. ..:
CCDS40 AAFYCNMYASILLMTVISIDRFLAVVYPMQSLSWRTLGRASF---TCLAIWALAIAGVVP
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 FFILKQEYYLVQPDITTCHDVHNTCESSSPFQLYYFISLAFFGFLIPFVLIIYCYAAIIR
... .: . .::::::: : . . ::: ... :..:... ::..:::
CCDS40 LLLKEQTIQVPGLNITTCHDVLNETLLEG-YYAYYFSAFSAVFFFVPLIISTVCYVSIIR
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 TLN----AYDHRWLWYVKASLLILVIFTICFAPSNIILIIHHANYYYNNT-DGLYFIYLI
:. : . . : .. :: :::.:.:..:: :.. ...: .. :: ::.
CCDS40 CLSSSAVANRSKKSRALFLSAAVFCIFIICFGPTNVLLIAHYSFLSHTSTTEAAYFAYLL
300 310 320 330 340 350
350 360 370
pF1KB8 ALCLGSLNSCLDPFLYFLMSKTRNHSTAYLTK
.:..:.. :.::..:. :
CCDS40 CVCVSSISCCIDPLIYYYASSECQRYVYSILCCKESSDPSSYNSSGQLMASKMDTCSSNL
360 370 380 390 400 410
>>CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrY (359 aa)
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Smith-Waterman score: 618; 34.5% identity (66.9% similar) in 290 aa overlap (82-363:11-298)
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CCDS21 FIRDHKSGTPANVFLMHLAVAD-LSCVLVLPTRLVYHFSGNHWPFGEIACRLTGFLFYLN
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CCDS21 MYASIYFLTCISADRFLAIVHPVKSLKLRRPLYAHLACAFLWVVVAVAMAPLLVSPQT--
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CCDS21 -VQTNHTVVCLQLYR--EKASHHAL---VSLAV-AFTFPFITTVTCYLLIIRSLRQGLRV
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CCDS21 EKRLKTKAVRMIAIVLAIFLVCFVPYHVNRSVYVLHYRSHGASCATQRILALANRITSCL
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CCDS21 TSLNGALDPIMYFFVAEKFRHALCNLLCGKRLKGPPPSFEGKTNESSLSAKSEL
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CCDS31 SWGNSTVASTAAVSSSFKCALTKTGFQFYYLPAVYILVFIIGFLGNSVAIWMFVFHMKPW
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CCDS31 SGISVYMFNLALADFLYVLTLPALIFYYFNKTDWIFGDAMCKLQRFIFHVNLYGSILFLT
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CCDS14 MGDRRFIDFQFQDSNSSLRPRLGNATANNTCIVDDSFKYNL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]