FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB8986, 387 aa 1>>>pF1KB8986 387 - 387 aa - 387 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5826+/-0.00126; mu= 15.0345+/- 0.074 mean_var=136.3287+/-42.112, 0's: 0 Z-trim(102.8): 261 B-trim: 938 in 2/48 Lambda= 0.109845 statistics sampled from 6644 (7115) to 6644 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.556), E-opt: 0.2 (0.219), width: 16 Scan time: 2.520 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 387) 2538 414.8 6.8e-116 CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 355) 2335 382.6 3.1e-106 CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 941 161.6 9.9e-40 CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 931 160.1 2.9e-39 CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 360) 921 158.5 8.9e-39 CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 920 158.3 9.9e-39 CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 374) 912 157.1 2.5e-38 CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 902 155.5 7.1e-38 CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 902 155.5 7.4e-38 CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 887 153.1 3.7e-37 CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 ( 384) 728 127.9 1.5e-29 CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 352) 723 127.1 2.5e-29 CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 356) 723 127.1 2.5e-29 CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 698 123.2 4e-28 CCDS2736.1 XCR1 gene_id:2829|Hs108|chr3 ( 333) 688 121.5 1.1e-27 CCDS3075.1 ACKR4 gene_id:51554|Hs108|chr3 ( 350) 682 120.6 2.2e-27 CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 657 116.7 3.6e-26 CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 657 116.7 3.6e-26 CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 631 112.5 6.1e-25 CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 630 112.4 6.8e-25 CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 630 112.4 6.9e-25 CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 617 110.3 2.9e-24 CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 617 110.4 3.1e-24 CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 615 110.0 3.5e-24 CCDS2735.1 CXCR6 gene_id:10663|Hs108|chr3 ( 342) 589 105.8 5.9e-23 CCDS46814.1 CCRL2 gene_id:9034|Hs108|chr3 ( 356) 589 105.9 6.1e-23 CCDS43079.1 CCRL2 gene_id:9034|Hs108|chr3 ( 344) 586 105.4 8.3e-23 CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 557 100.8 2.1e-21 CCDS11435.1 CCR10 gene_id:2826|Hs108|chr17 ( 362) 499 91.6 1.2e-18 CCDS5322.1 GPER1 gene_id:2852|Hs108|chr7 ( 375) 479 88.5 1.1e-17 CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 457 85.0 1.2e-16 CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3 ( 360) 447 83.4 3.6e-16 CCDS9894.2 GPR68 gene_id:8111|Hs108|chr14 ( 365) 439 82.1 8.9e-16 CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1 ( 361) 436 81.6 1.2e-15 CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 430 80.7 2.4e-15 CCDS8927.1 GPR182 gene_id:11318|Hs108|chr12 ( 404) 427 80.3 3.5e-15 CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 426 80.1 3.8e-15 CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5 ( 425) 425 80.0 4.5e-15 CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 423 79.5 5e-15 CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 415 78.3 1.2e-14 CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 415 78.3 1.3e-14 CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19 ( 350) 405 76.7 3.6e-14 CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 404 76.6 4.3e-14 CCDS1124.1 RXFP4 gene_id:339403|Hs108|chr1 ( 374) 401 76.1 5.8e-14 CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 399 75.7 6.9e-14 CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8 ( 328) 396 75.2 9.3e-14 CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 396 75.3 1e-13 CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 396 75.3 1e-13 CCDS12669.1 GPR4 gene_id:2828|Hs108|chr19 ( 362) 389 74.2 2.1e-13 CCDS9626.1 LTB4R gene_id:1241|Hs108|chr14 ( 352) 386 73.7 2.9e-13 >>CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 (387 aa) initn: 2538 init1: 2538 opt: 2538 Z-score: 2194.2 bits: 414.8 E(32554): 6.8e-116 Smith-Waterman score: 2538; 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CCDS26 PPLYSLVFVFGLLGNSVVVLVLFKYKRLRSMTDVYLLNLAISDLLFVFSLPFWGYYAADQ 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 KGLHNAMCKFTTAFFFIGFFGSIFFITVISIDRYLAIVLAANSMNNRTVQHGVTISLGVW . ..::. . ....::...:::. ..::::::::: :. :. ::. .:: ::..: CCDS26 WVFGLGLCKMISWMYLVGFYSGIFFVMLMSIDRYLAIVHAVFSLRARTLTYGVITSLATW 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KB8 AAAILVAAPQFMF----TKQKENECLGDYPEVLQEIWPVLRNVETNFLGFLLPLLIMSYC ..:.... : :.: :..... : : . . : :: ..: :.::...:: :: .: CCDS26 SVAVFASLPGFLFSTCYTERNHTYCKTKYS-LNSTTWKVLSSLEINILGLVIPLGIMLFC 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KB8 YFRIIQTLFSCKNHKKAKAIKLILLVVIVFFLFWTPYNIMIFLETLKLYDFFPSCDMRKD : ::.:: :::.:: ::.:.:. ::..:. :::::::..::::: . . .: ... CCDS26 YSMIIRTLQHCKNEKKNKAVKMIFAVVVLFLGFWTPYNIVLFLETLVELEVLQDCTFERY 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KB8 LRLALSVTEMVAFSHCCLNPLIYAFAGEKFRRYLYHLYGKC--LAVLCGRSVHVDFSSSE : :...:: .:: ::::::.:: : :::::.:. .:. : : ::: ... :.. CCDS26 LDYAIQATETLAFVHCCLNPIIYFFLGEKFRKYILQLFKTCRGLFVLCQYCGLLQIYSAD 290 300 310 320 330 340 370 380 pF1KB8 SQRSRHGSVLSSNFTYHTSDGDALLLL . ::..: : : : CCDS26 TP--------SSSYTQSTMDHDLHDAL 350 360 >>CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 (355 aa) initn: 863 init1: 466 opt: 931 Z-score: 818.3 bits: 160.1 E(32554): 2.9e-39 Smith-Waterman score: 931; 39.7% identity (75.3% similar) in 348 aa overlap (31-372:3-350) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 MREPLEALKLADLDFRKSSLASGWRMASGAFTMDQFPESVTENFEYDDLAEACYIGDIVV .:.: .::. . : .. : : . CCDS26 MDYTLDLSVTTVTDYYYPDIFSSPCDAELIQT 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 FGTVFLSIFYSVIFAIGLVGNLLVVFALTNSKKPKSVTDIYLLNLALSDLLFVATLPFWT : ..:..:: ..:...:.:: ::...:. :: .:.::.::::::::::::: ..:: : CCDS26 NGKLLLAVFYCLLFVFSLLGNSLVILVLVVCKKLRSITDVYLLNLALSDLLFVFSFPFQT 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 HYLINEKGLHNAMCKFTTAFFFIGFFGSIFFITVISIDRYLAIVLAANSMNNRTVQHGVT .::... . ..::: ...:..:::..:.::::..:.:::::.: :. ... ::.. :.: CCDS26 YYLLDQWVFGTVMCKVVSGFYYIGFYSSMFFITLMSVDRYLAVVHAVYALKVRTIRMGTT 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 pF1KB8 ISLGVWAAAILVAAPQFMFTK-QKENECLGDYPEVLQEI--WPVLRNVETNFLGFLLPLL . :.:: .::... : ..: . .:. : : :. : .. : . :.::.:.:. CCDS26 LCLAVWLTAIMATIPLLVFYQVASEDGVLQCYSFYNQQTLKWKIFTNFKMNILGLLIPFT 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 IMSYCYFRIIQTLFSCKNHKKAKAIKLILLVVIVFFLFWTPYNIMIFLETLKLYDFFPSC :. .::..:.. : :.::.:.:::.:.:.:::. .:::.:.:...:: .:. . .. .: CCDS26 IFMFCYIKILHQLKRCQNHNKTKAIRLVLIVVIASLLFWVPFNVVLFLTSLHSMHILDGC 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 DMRKDLRLALSVTEMVAFSHCCLNPLIYAFAGEKFRRYLYHLYGK-CLAVLC--GRSVHV .. ..: : :::...:.:::.::.::::.::::...: ... : : .. ::.. CCDS26 SISQQLTYATHVTEIISFTHCCVNPVIYAFVGEKFKKHLSEIFQKSCSQIFNYLGRQMPR 280 290 300 310 320 330 360 370 380 pF1KB8 DFSSSESQRSRHGSVLSSNFTYHTSDGDALLLL . . :. ..:.: :: CCDS26 ESCEKSSSCQQHSSRSSSVDYIL 340 350 >>CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 (360 aa) initn: 619 init1: 597 opt: 921 Z-score: 809.6 bits: 158.5 E(32554): 8.9e-39 Smith-Waterman score: 921; 47.2% identity (75.6% similar) in 307 aa overlap (38-342:18-322) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 LKLADLDFRKSSLASGWRMASGAFTMDQFPESVTENFEYDDLAEACYIGDIVVFGTVFLS : :: :.:: : :. :. .:. .: CCDS46 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAP-CHKFDVKQIGAQLLP 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 IFYSVIFAIGLVGNLLVVFALTNSKKPKSVTDIYLLNLALSDLLFVATLPFWTHYLINEK .::..: .:.:::.:::. : : :: : .:::::::::.:::::. :::.:.: :: CCDS46 PLYSLVFIFGFVGNMLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSAANEW 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 GLHNAMCKFTTAFFFIGFFGSIFFITVISIDRYLAIVLAANSMNNRTVQHGVTISLGVWA . :::::. :... ::.::.:::: ...:::::::: :. ... ::: ::. :. .: CCDS46 VFGNAMCKLFTGLYHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWL 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KB8 AAILVAAPQFMFTK-QKENECLGDYPEVLQEIWPVLRNVETNFLGFLLPLLIMSYCYFRI .:.....: ..::: :::. : . . : .... :.::..:::::: :: : CCDS46 VAVFASVPGIIFTKCQKEDSVYVCGP-YFPRGWNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGI 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KB8 IQTLFSCKNHKKA-KAIKLILLVVIVFFLFWTPYNIMIFLETLKLYDFFPSCDMRKDLRL ..::. :.:.:: .:...:. ..::.:::::::::.:.:.:.. . . .:. ..: CCDS46 LKTLLRCRNEKKRHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQ 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KB8 ALSVTEMVAFSHCCLNPLIYAFAGEKFRRYLYHLYGKCLAVLCGRSVHVDFSSSESQRSR : .::: ....:::.::.::::.:::::::: .. : CCDS46 ATQVTETLGMTHCCINPIIYAFVGEKFRRYLSVFFRKHITKRFCKQCPVFYRETVDGVTS 290 300 310 320 330 340 370 380 pF1KB8 HGSVLSSNFTYHTSDGDALLLL CCDS46 TNTPSTGEQEVSAGL 350 360 >>CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 (355 aa) initn: 892 init1: 451 opt: 920 Z-score: 808.8 bits: 158.3 E(32554): 9.9e-39 Smith-Waterman score: 920; 44.9% identity (76.0% similar) in 312 aa overlap (41-346:13-322) 20 30 40 50 60 70 pF1KB8 ADLDFRKSSLASGWRMASGAFTMDQFPESVTENFEYDDLAEACYIGDIVVFGTVFLSIFY : .:.: : : : . .::. .: .: CCDS27 METPNTTEDYDTTTEFDYGD-ATPCQKVNERAFGAQLLPPLY 10 20 30 40 80 90 100 110 120 pF1KB8 SVIFAIGLVGNLLVVFALTNSKKPKSVTDIYLLNLALSDLLFVATLPFWTHY-LINEKGL :..:.::::::.:::..:.. :. :..:.:::::::.:::::. ::::: : : .. . CCDS27 SLVFVIGLVGNILVVLVLVQYKRLKNMTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFWIDYKLKDDWVF 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 HNAMCKFTTAFFFIGFFGSIFFITVISIDRYLAIVLAANSMNNRTVQHGVTISLGVWAAA .::::. ..:.. :... :::: ...:::::::: :. .. ::: :: :. .:: : CCDS27 GDAMCKILSGFYYTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIIIWALA 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KB8 ILVAAPQFMFTKQK----ENECLGDYP-EVLQEIWPVLRNVETNFLGFLLPLLIMSYCYF ::.. : ..:.: . .. : .: : :.: : ... .. :..:..::::.: :: CCDS27 ILASMPGLYFSKTQWEFTHHTCSLHFPHESLRE-WKLFQALKLNLFGLVLPLLVMIICYT 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KB8 RIIQTLFSCKNHKKAKAIKLILLVVIVFFLFWTPYNIMIFLETLKLYDFFPSCDMRKDLR ::. :. :.::.::..::....:.:::::::::. :.. ... . : :.. . : CCDS27 GIIKILLRRPNEKKSKAVRLIFVIMIIFFLFWTPYNLTILISVFQDFLFTHECEQSRHLD 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KB8 LALSVTEMVAFSHCCLNPLIYAFAGEKFRRYLYHLYGKCLAVLCGRSVHVDFSSSESQRS ::..:::..:..:::.::.::::.::.::.:: .:. . .:: CCDS27 LAVQVTEVIAYTHCCVNPVIYAFVGERFRKYLRQLFHRRVAVHLVKWLPFLSVDRLERVS 290 300 310 320 330 340 370 380 pF1KB8 RHGSVLSSNFTYHTSDGDALLLL CCDS27 STSPSTGEHELSAGF 350 >>CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 (374 aa) initn: 857 init1: 597 opt: 912 Z-score: 801.7 bits: 157.1 E(32554): 2.5e-38 Smith-Waterman score: 912; 46.8% identity (75.0% similar) in 308 aa overlap (38-343:18-322) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 LKLADLDFRKSSLASGWRMASGAFTMDQFPESVTENFEYDDLAEACYIGDIVVFGTVFLS : :: :.:: : :. :. .:. .: CCDS43 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAP-CHKFDVKQIGAQLLP 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 IFYSVIFAIGLVGNLLVVFALTNSKKPKSVTDIYLLNLALSDLLFVATLPFWTHYLINEK .::..: .:.:::.:::. : : :: : .:::::::::.:::::. :::.:.: :: CCDS43 PLYSLVFIFGFVGNMLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSAANEW 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 GLHNAMCKFTTAFFFIGFFGSIFFITVISIDRYLAIVLAANSMNNRTVQHGVTISLGVWA . :::::. :... ::.::.:::: ...:::::::: :. ... ::: ::. :. .: CCDS43 VFGNAMCKLFTGLYHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWL 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KB8 AAILVAAPQFMFTK-QKENECLGDYPEVLQEIWPVLRNVETNFLGFLLPLLIMSYCYFRI .:.....: ..::: :::. : . . : .... :.::..:::::: :: : CCDS43 VAVFASVPGIIFTKCQKEDSVYVCGP-YFPRGWNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGI 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KB8 IQTLFSCKNHKKA-KAIKLILLVVIVFFLFWTPYNIMIFLETLKLYDFFPSCDMRKDLRL ..::. :.:.:: .:...:. ..::.:::::::::.:.:.:.. . . .:. ..: CCDS43 LKTLLRCRNEKKRHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQ 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KB8 ALSVTEMVAFSHCCLNPLIYAFAGEKFRRYLYHLYGKCLAVLCGRSVHVDFSSSESQRSR : .::: ....:::.::.::::.::::: :.:. : CCDS43 ATQVTETLGMTHCCINPIIYAFVGEKFRS-LFHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGKNVK 290 300 310 320 330 340 370 380 pF1KB8 HGSVLSSNFTYHTSDGDALLLL CCDS43 VTTQGLLDGRGKGKSIGRAPEASLQDKEGA 350 360 370 >>CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 (355 aa) initn: 901 init1: 457 opt: 902 Z-score: 793.4 bits: 155.5 E(32554): 7.1e-38 Smith-Waterman score: 902; 41.9% identity (72.6% similar) in 332 aa overlap (46-372:17-345) 20 30 40 50 60 70 pF1KB8 RKSSLASGWRMASGAFTMDQFPESVTENFEYDDLAEACYIGDIVVFGTVFLSIFYSVIFA :::.. : .: .. . :. .::..:. CCDS27 MTTSLDTVETFGTTSYYDDVGLLCEKADTRALMAQFVPPLYSLVFT 10 20 30 40 80 90 100 110 120 130 pF1KB8 IGLVGNLLVVFALTNSKKPKSVTDIYLLNLALSDLLFVATLPFWTHYLINEKGLH-NAMC .::.::..::. : . .. . .:.:::::::.:::::..::::: ::. ... . ..:: CCDS27 VGLLGNVVVVMILIKYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNWVFGHGMC 50 60 70 80 90 100 140 150 160 170 180 190 pF1KB8 KFTTAFFFIGFFGSIFFITVISIDRYLAIVLAANSMNNRTVQHGVTISLGVWAAAILVAA :. ..:. :... :::: ...:::::::: :. .. ::: :: :. .:. :.:.: CCDS27 KLLSGFYHTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWGLAVLAAL 110 120 130 140 150 160 200 210 220 230 240 250 pF1KB8 PQFMFTKQKE----NECLGDYPEVLQEIWPVLRNVETNFLGFLLPLLIMSYCYFRIIQTL :.:.: . .: . : . ::: : ..... ... ..::::.:. :: ::.:: CCDS27 PEFIFYETEELFEETLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGIIKTL 170 180 190 200 210 220 260 270 280 290 300 310 pF1KB8 FSCKNHKKAKAIKLILLVVIVFFLFWTPYNIMIFLETLKLYDFFPSCDMRKDLRLALSVT . : ..:: :::.::.... :::.::::::. :.: . . : .:. : : :.. :: CCDS27 LRCPSKKKYKAIRLIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFGNDCERSKHLDLVMLVT 230 240 250 260 270 280 320 330 340 350 360 370 pF1KB8 EMVAFSHCCLNPLIYAFAGEKFRRYLYHLYGKCLAVLCGRSVHVDFSSSESQRSRHGSVL :..:.::::.::.::::.::.::.:: :.. . : . :: .. : :: . : .:: CCDS27 EVIAYSHCCMNPVIYAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGR--YIPFLPSE-KLERTSSVS 290 300 310 320 330 340 380 pF1KB8 SSNFTYHTSDGDALLLL : CCDS27 PSTAEPELSIVF 350 >>CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 (376 aa) initn: 901 init1: 457 opt: 902 Z-score: 793.2 bits: 155.5 E(32554): 7.4e-38 Smith-Waterman score: 902; 41.9% identity (72.6% similar) in 332 aa overlap (46-372:38-366) 20 30 40 50 60 70 pF1KB8 RKSSLASGWRMASGAFTMDQFPESVTENFEYDDLAEACYIGDIVVFGTVFLSIFYSVIFA :::.. : .: .. . :. .::..:. CCDS54 LLRAHKPGSSRRSEMTTSLDTVETFGTTSYYDDVGLLCEKADTRALMAQFVPPLYSLVFT 10 20 30 40 50 60 80 90 100 110 120 130 pF1KB8 IGLVGNLLVVFALTNSKKPKSVTDIYLLNLALSDLLFVATLPFWTHYLINEKGLH-NAMC .::.::..::. : . .. . .:.:::::::.:::::..::::: ::. ... . ..:: CCDS54 VGLLGNVVVVMILIKYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNWVFGHGMC 70 80 90 100 110 120 140 150 160 170 180 190 pF1KB8 KFTTAFFFIGFFGSIFFITVISIDRYLAIVLAANSMNNRTVQHGVTISLGVWAAAILVAA :. ..:. :... :::: ...:::::::: :. .. ::: :: :. .:. :.:.: CCDS54 KLLSGFYHTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWGLAVLAAL 130 140 150 160 170 180 200 210 220 230 240 250 pF1KB8 PQFMFTKQKE----NECLGDYPEVLQEIWPVLRNVETNFLGFLLPLLIMSYCYFRIIQTL :.:.: . .: . : . ::: : ..... ... ..::::.:. :: ::.:: CCDS54 PEFIFYETEELFEETLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGIIKTL 190 200 210 220 230 240 260 270 280 290 300 310 pF1KB8 FSCKNHKKAKAIKLILLVVIVFFLFWTPYNIMIFLETLKLYDFFPSCDMRKDLRLALSVT . : ..:: :::.::.... :::.::::::. :.: . . : .:. : : :.. :: CCDS54 LRCPSKKKYKAIRLIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFGNDCERSKHLDLVMLVT 250 260 270 280 290 300 320 330 340 350 360 370 pF1KB8 EMVAFSHCCLNPLIYAFAGEKFRRYLYHLYGKCLAVLCGRSVHVDFSSSESQRSRHGSVL :..:.::::.::.::::.::.::.:: :.. . : . :: .. : :: . : .:: CCDS54 EVIAYSHCCMNPVIYAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGR--YIPFLPSE-KLERTSSVS 310 320 330 340 350 360 380 pF1KB8 SSNFTYHTSDGDALLLL : CCDS54 PSTAEPELSIVF 370 >>CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 (352 aa) initn: 742 init1: 465 opt: 887 Z-score: 780.6 bits: 153.1 E(32554): 3.7e-37 Smith-Waterman score: 887; 42.9% identity (76.7% similar) in 301 aa overlap (50-345:17-317) 20 30 40 50 60 70 pF1KB8 LASGWRMASGAFTMDQFPESVTENFEYDDLAEACYIGDIVVFGTVFLSIFYSVIFAIGLV .: : .. ... .: .::..: .:.: CCDS27 MDYQVSSPIYDINYYTSEPCQKINVKQIAARLLPPLYSLVFIFGFV 10 20 30 40 80 90 100 110 120 130 pF1KB8 GNLLVVFALTNSKKPKSVTDIYLLNLALSDLLFVATLPFWTHYLINEKGLHNAMCKFTTA ::.::.. : : :. ::.:::::::::.:::.:. :.:::.:: . . :.::.. :. CCDS27 GNMLVILILINCKRLKSMTDIYLLNLAISDLFFLLTVPFWAHYAAAQWDFGNTMCQLLTG 50 60 70 80 90 100 140 150 160 170 180 190 pF1KB8 FFFIGFFGSIFFITVISIDRYLAIVLAANSMNNRTVQHGVTISLGVWAAAILVAAPQFMF ..:::::..:::: ...::::::.: :. ... ::: ::. :. .:..:.... : ..: CCDS27 LYFIGFFSGIFFIILLTIDRYLAVVHAVFALKARTVTFGVVTSVITWVVAVFASLPGIIF 110 120 130 140 150 160 200 210 220 230 240 250 pF1KB8 TK-QKEN---ECLGDYPEVLQEIWPVLRNVETNFLGFLLPLLIMSYCYFRIIQTLFSCKN :. :::. : . .: ..: ..... .::..::::.: :: :..::. :.: CCDS27 TRSQKEGLHYTCSSHFPYSQYQFWKNFQTLKIVILGLVLPLLVMVICYSGILKTLLRCRN 170 180 190 200 210 220 260 270 280 290 300 310 pF1KB8 HKKA-KAIKLILLVVIVFFLFWTPYNIMIFLETLKLYDFFPSCDMRKDLRLALSVTEMVA .:: .:..::. ..::.::::.::::...:.:.. . . .:. . : :..::: .. CCDS27 EKKRHRAVRLIFTIMIVYFLFWAPYNIVLLLNTFQEFFGLNNCSSSNRLDQAMQVTETLG 230 240 250 260 270 280 320 330 340 350 360 370 pF1KB8 FSHCCLNPLIYAFAGEKFRRYLYHLYGKCLAVLCGRSVHVDFSSSESQRSRHGSVLSSNF ..:::.::.::::.::::: :: .. : .: CCDS27 MTHCCINPIIYAFVGEKFRNYLLVFFQKHIAKRFCKCCSIFQQEAPERASSVYTRSTGEQ 290 300 310 320 330 340 380 pF1KB8 TYHTSDGDALLLL CCDS27 EISVGL 350 387 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 01:39:10 2016 done: Sat Nov 5 01:39:11 2016 Total Scan time: 2.520 Total Display time: 0.020 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]