Result of FASTA (ccds) for
pF1KB8990
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8990, 391 aa
1>>>pF1KB8990 391 - 391 aa - 391 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6957+/-0.00117; mu= 14.4651+/- 0.069
mean_var=99.5226+/-24.034, 0's: 0 Z-trim(103.1): 289 B-trim: 929 in 2/48
Lambda= 0.128562
statistics sampled from 6933 (7275) to 6933 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.572), E-opt: 0.2 (0.223), width: 16
Scan time: 2.270
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 ( 391) 2616 496.4 1.8e-140
CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14 ( 353) 760 152.2 7.1e-37
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CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 615 125.3 9.6e-29
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 611 124.5 1.5e-28
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 605 123.4 3.2e-28
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 600 122.5 6.1e-28
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 570 116.9 3e-26
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 560 115.1 1e-25
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CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 533 110.1 3.5e-24
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 530 109.5 4.9e-24
CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11 ( 380) 518 107.3 2.4e-23
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 513 106.3 4.4e-23
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 511 106.0 5.9e-23
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 508 105.4 8.6e-23
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 505 104.9 1.4e-22
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 498 103.6 3.1e-22
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 496 103.2 4e-22
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CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 484 101.0 1.9e-21
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 468 98.0 1.5e-20
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 466 97.6 1.9e-20
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 466 97.6 1.9e-20
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 458 96.2 5.8e-20
CCDS9879.1 GPR65 gene_id:8477|Hs108|chr14 ( 337) 450 94.6 1.4e-19
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 446 93.9 2.4e-19
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CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 439 92.6 5.8e-19
CCDS318.1 PTAFR gene_id:5724|Hs108|chr1 ( 342) 436 92.0 8.5e-19
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 434 91.7 1.2e-18
CCDS1124.1 RXFP4 gene_id:339403|Hs108|chr1 ( 374) 433 91.5 1.3e-18
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 426 90.2 3.5e-18
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 426 90.3 4e-18
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2 ( 355) 421 89.3 6e-18
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 420 89.2 7.8e-18
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 419 88.9 8.4e-18
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 419 88.9 8.5e-18
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 419 89.0 8.6e-18
CCDS9235.1 HCAR2 gene_id:338442|Hs108|chr12 ( 363) 418 88.7 9e-18
CCDS3157.1 GPR87 gene_id:53836|Hs108|chr3 ( 358) 417 88.5 1e-17
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 417 88.6 1.1e-17
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 417 88.6 1.1e-17
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 417 88.6 1.1e-17
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 417 88.6 1.2e-17
CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8 ( 328) 415 88.1 1.2e-17
CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5 ( 397) 414 88.0 1.6e-17
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 413 87.8 1.8e-17
>>CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 (391 aa)
initn: 2616 init1: 2616 opt: 2616 Z-score: 2635.4 bits: 496.4 E(32554): 1.8e-140
Smith-Waterman score: 2616; 100.0% identity (100.0% similar) in 391 aa overlap (1-391:1-391)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MFSPWKISMFLSVREDSVPTTASFSADMLNVTLQGPTLNGTFAQSKCPQVEWLGWLNTIQ
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CCDS99 MFSPWKISMFLSVREDSVPTTASFSADMLNVTLQGPTLNGTFAQSKCPQVEWLGWLNTIQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PPFLWVLFVLATLENIFVLSVFCLHKSSCTVAEIYLGNLAAADLILACGLPFWAITISNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 PPFLWVLFVLATLENIFVLSVFCLHKSSCTVAEIYLGNLAAADLILACGLPFWAITISNN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 FDWLFGETLCRVVNAIISMNLYSSICFLMLVSIDRYLALVKTMSMGRMRGVRWAKLYSLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 FDWLFGETLCRVVNAIISMNLYSSICFLMLVSIDRYLALVKTMSMGRMRGVRWAKLYSLV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 IWGCTLLLSSPMLVFRTMKEYSDEGHNVTACVISYPSLIWEVFTNMLLNVVGFLLPLSVI
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CCDS99 IWGCTLLLSSPMLVFRTMKEYSDEGHNVTACVISYPSLIWEVFTNMLLNVVGFLLPLSVI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 TFCTMQIMQVLRNNEMQKFKEIQTERRATVLVLVVLLLFIICWLPFQISTFLDTLHRLGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 TFCTMQIMQVLRNNEMQKFKEIQTERRATVLVLVVLLLFIICWLPFQISTFLDTLHRLGI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LSSCQDERIIDVITQIASFMAYSNSCLNPLVYVIVGKRFRKKSWEVYQGVCQKGGCRSEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 LSSCQDERIIDVITQIASFMAYSNSCLNPLVYVIVGKRFRKKSWEVYQGVCQKGGCRSEP
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KB8 IQMENSMGTLRTSISVERQIHKLQDWAGSRQ
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CCDS99 IQMENSMGTLRTSISVERQIHKLQDWAGSRQ
370 380 390
>>CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14 (353 aa)
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Smith-Waterman score: 760; 37.7% identity (68.1% similar) in 326 aa overlap (33-353:10-333)
10 20 30 40 50
pF1KB8 SPWKISMFLSVREDSVPTTASFSADMLNVTLQGPTLNGTFAQ--SKCPQV-EWLGWLNTI
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CCDS99 MASSWPPLELQSSNQSQLFPQNATACDNAPEAWDLLHRV
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 QPPFLWVLFVLATLENIFVLSVFCLHKSSCTVAEIYLGNLAAADLILACGLPFWAITISN
: :. . .. : :.::: :: : . . .::::::.::::.::... :::::: .: :
CCDS99 LPTFIISICFFGLLGNLFVLLVFLLPRRQLNVAEIYLANLAASDLVFVLGLPFWAENIWN
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120 130 140 150 160 170
pF1KB8 NFDWLFGETLCRVVNAIISMNLYSSICFLMLVSIDRYLALVKTMSMGRMRGVRWAKLYSL
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CCDS99 QFNWPFGALLCRVINGVIKANLFISIFLVVAISQDRYRVLVHPMASRRQQRRRQARVTCV
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 VIWGCTLLLSSPMLVFRTMKEYSDEGHNVTACVISYPSLIWEVFTNMLLNVVGFLLPLSV
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CCDS99 LIWVVGGLLSIPTFLLRSIQAVPDL--NITACILLLPHEAWHFARIVELNILGFLLPLAA
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 ITFCTMQIMQVLRNNEMQKFKEI--QTERRATVLVLVVLLLFIICWLPFQISTFLDTLHR
:.: ...:. ::. : . . . . ..:.:.:.... :..:: :... .::. : .
CCDS99 IVFFNYHILASLRTREEVSRTRCGGRKDSKTTALILTLVVAFLVCWAPYHFFAFLEFLFQ
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 LGILSSCQDERIIDVITQIASFMAYSNSCLNPLVYVIVGKRFRKKSWEVYQGVCQKGGCR
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CCDS99 VQAVRGCFWEDFIDLGLQLANFFAFTNSSLNPVIYVFVGRLFRTKVWELYKQCTPKSLAP
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360 370 380 390
pF1KB8 SEPIQMENSMGTLRTSISVERQIHKLQDWAGSRQ
CCDS99 ISSSHRKEIFQLFWRN
340 350
>>CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX (363 aa)
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Smith-Waterman score: 658; 33.7% identity (65.3% similar) in 323 aa overlap (47-357:35-350)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 SVPTTASFSADMLNVTLQGPTLNGTFAQSKCPQVEWLGWLNTIQPPFLWVLFVLATLENI
: : :..: : . ...::.. : ::
CCDS14 STLATTSKNITSGLHFGLVNISGNNESTLNCSQKPSDKHLDAI-PILYYIIFVIGFLVNI
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pF1KB8 FVLSVFCLHKSSCTVAEIYLGNLAAADLILACGLPFWAITISNNFDWLFGETLCRVVNAI
:...:: .:. :. ::. :::.:::.: ::.:: : .::::: ..:.: ...
CCDS14 VVVTLFCCQKGPKKVSSIYIFNLAVADLLLLATLPLWATYYSYRYDWLFGPVMCKVFGSF
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pF1KB8 ISMNLYSSICFLMLVSIDRYLALVKTMSMGRMRGVRWAKLYSLVIWGCTLLLSS-PMLVF
...:...:: :. .:.::: ... . ... :. :. ..: : ::: : . :
CCDS14 LTLNMFASIFFITCMSVDRYQSVIYPF-LSQRRNPWQASYIVPLVW-CMACLSSLPTFYF
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200 210 220 230 240 250
pF1KB8 RTMKEYSDEGHNVTACVISYPS---LIWEVFTNMLLNVVGFLLPLSVITFCTMQIMQ-VL
: .. : :.::....: : . .. :..::..:: :. : . : . .:
CCDS14 RDVRTIEYLG--VNACIMAFPPEKYAQWSAGIALMKNILGFIIPLIFIATCYFGIRKHLL
190 200 210 220 230
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pF1KB8 RNNEMQKFKEIQTERRATVLVLVVLLLFIICWLPFQISTFLDTLHRLGILSSCQDERIID
..: . : . :. .. .. .:.: ::::::::.. ::::.: .:...::. .::
CCDS14 KTNSYGKNR--ITRDQVLKMAAAVVLAFIICWLPFHVLTFLDALAWMGVINSCEVIAVID
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320 330 340 350 360
pF1KB8 VITQIASFMAYSNSCLNPLVYVIVGKRFRKKSWEVY-------QGVCQKGGCRSEPIQME
. .: .....:::.::..: .::.::..: :. :: .. .::
CCDS14 LALPFAILLGFTNSCVNPFLYCFVGNRFQQKLRSVFRVPITWLQGKRESMSCRKSSSLRE
300 310 320 330 340 350
370 380 390
pF1KB8 NSMGTLRTSISVERQIHKLQDWAGSRQ
CCDS14 METFVS
360
>>CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (388 aa)
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Smith-Waterman score: 615; 31.3% identity (64.3% similar) in 367 aa overlap (22-382:21-380)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MFSPWKISMFLSVREDSVPTTASFSADMLNVTLQGPTLNGT-FAQSKCPQVEWLGWLNTI
:. :...... :.. : .: :. ::.. ... ..
CCDS82 MLTFTSECGCTTFGVFDIVFATNSTQVIKMILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVM
10 20 30 40 50
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pF1KB8 QPPFLWVLFVLATLENIFVLSVFCLHKSSCTVAEIYLGNLAAADLILACGLPFWAITISN
: . ..::.. . : .:. :. .. . ::: ..: ::: ::: . ::.::. .
CCDS82 IPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYMKLKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAM
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pF1KB8 NFDWLFGETLCRVVNAIISMNLYSSICFLMLVSIDRYLALVKTMSMGRMRGVRWAKLYSL
.. : ::. ::....: .:.:::.:. .: .:::::::.:. :. : . ::. .
CCDS82 EYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 VIWGCTLLLSSPMLVFRTMKEYSDEGHNVTACVISYPSL--IWEVFTNMLLNVVGFLLPL
.:: . : : : .. :.. . :. :.:.:.. : : . .. :..:::.:.
CCDS82 IIWLLAGLASLPAIIHRNV--FFIENTNITVCAFHYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 SVITFCTMQIMQVLRNN-EMQKFKEIQTERRATVLVLVVLLLFIICWLPFQISTFLDTLH
.: : ..:.. :.:: : . . ......:.:.. :.: :: ::::.:
CCDS82 LIILTSYTLIWKALKKAYEIQKNKPRNDD--IFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 RLGILSSCQDERIIDVITQIASFMAYSNSCLNPLVYVIVGKRFRKKSWEVYQGVCQKGGC
.:::. .:. :.:. :. .:: :.::::: : ..::.:.. .. . . :.
CCDS82 QLGIIRDCRIADIVDTAMPITICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KB8 RSEPIQMENSMGTL--RTSISVERQIHKLQDWAGSRQ
.:. . ..:.:: : : .: . .:
CCDS82 HSN---LSTKMSTLSYRPSDNVSSSTKKPAPCFEVE
360 370 380
>>CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 (394 aa)
initn: 519 init1: 361 opt: 615 Z-score: 629.5 bits: 125.3 E(32554): 9.6e-29
Smith-Waterman score: 615; 31.3% identity (64.3% similar) in 367 aa overlap (22-382:27-386)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MFSPWKISMFLSVREDSVPTTASFSADMLNVTLQGPTLNGT-FAQSKCPQVEWLG
:. :...... :.. : .: :. ::.. .
CCDS82 MKKMNHKSTDSPKAPQLRGGVFDIVFATNSTQVIKMILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHN
10 20 30 40 50 60
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pF1KB8 WLNTIQPPFLWVLFVLATLENIFVLSVFCLHKSSCTVAEIYLGNLAAADLILACGLPFWA
.. .. : . ..::.. . : .:. :. .. . ::: ..: ::: ::: . ::.::
CCDS82 YIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYMKLKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWA
70 80 90 100 110 120
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pF1KB8 ITISNNFDWLFGETLCRVVNAIISMNLYSSICFLMLVSIDRYLALVKTMSMGRMRGVRWA
. . .. : ::. ::....: .:.:::.:. .: .:::::::.:. :. : . :
CCDS82 VYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVA
130 140 150 160 170 180
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pF1KB8 KLYSLVIWGCTLLLSSPMLVFRTMKEYSDEGHNVTACVISYPSL--IWEVFTNMLLNVVG
:. ..:: . : : : .. :.. . :. :.:.:.. : : . .. :..:
CCDS82 KVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNV--FFIENTNITVCAFHYESQNSTLPIGLGLTKNILG
190 200 210 220 230
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pF1KB8 FLLPLSVITFCTMQIMQVLRNN-EMQKFKEIQTERRATVLVLVVLLLFIICWLPFQISTF
::.:. .: : ..:.. :.:: : . . ......:.:.. :.: :: ::
CCDS82 FLFPFLIILTSYTLIWKALKKAYEIQKNKPRNDD--IFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTF
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 LDTLHRLGILSSCQDERIIDVITQIASFMAYSNSCLNPLVYVIVGKRFRKKSWEVYQGVC
::.: .:::. .:. :.:. :. .:: :.::::: : ..::.:.. .. . .
CCDS82 LDVLIQLGIIRDCRIADIVDTAMPITICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIP
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KB8 QKGGCRSEPIQMENSMGTL--RTSISVERQIHKLQDWAGSRQ
:. .:. . ..:.:: : : .: . .:
CCDS82 PKAKSHSN---LSTKMSTLSYRPSDNVSSSTKKPAPCFEVE
360 370 380 390
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40 50 60 70 80 90
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: .:::.. : : .:. :. . :. ...
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pF1KB8 EIYLGNLAAADLILACGLPFWAITISNNFDWLFGETLCRVVNAIISMNLYSSICFLMLVS
..:: ::: .::... ..:: . . .. :.:: ..:.::... ...:::. :. :.:
CCDS26 DVYLLNLALSDLLFVFSFPFQTYYLLDQ--WVFGTVMCKVVSGFYYIGFYSSMFFITLMS
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CCDS26 VDRYLAVVHAVYALKVRTIRMGTTLCLAVWLTAIMATIPLLVFYQVA--SEDG--VLQCY
130 140 150 160 170 180
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: .: :..:::. .:..:.:.:.... :: ..:. :. : .. .: : :.
CCDS26 SFYNQQTLKWKIFTNFKMNILGLLIPFTIFMFCYIKILHQLKRCQNHNKTKAIR------
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270 280 290 300 310 320
pF1KB8 VLVLVVLLLFIICWLPFQISTFLDTLHRLGILSSCQDERIIDVITQIASFMAYSNSCLNP
:::.:.. .. :.::.. :: .:: . ::..:. . . :... ...... :.::
CCDS26 -LVLIVVIASLLFWVPFNVVLFLTSLHSMHILDGCSISQQLTYATHVTEIISFTHCCVNP
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pF1KB8 LVYVIVGKRFRKKSWEVYQGVCQKGGCRSEPIQMENSMGTLRTSISVERQIHKLQDWAGS
..:..::..:.:. :..: :..
CCDS26 VIYAFVGEKFKKHLSEIFQKSCSQIFNYLGRQMPRESCEKSSSCQQHSSRSSSVDYIL
300 310 320 330 340 350
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Smith-Waterman score: 605; 31.6% identity (64.0% similar) in 342 aa overlap (44-382:15-351)
20 30 40 50 60 70
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:. ::.. ... .. : . ..::.. .
CCDS31 MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIF
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80 90 100 110 120 130
pF1KB8 ENIFVLSVFCLHKSSCTVAEIYLGNLAAADLILACGLPFWAITISNNFDWLFGETLCRVV
: .:. :. .. . ::: ..: ::: ::: . ::.::. . .. : ::. ::...
CCDS31 GNSLVVIVIYFYMKLKTVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIA
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pF1KB8 NAIISMNLYSSICFLMLVSIDRYLALVKTMSMGRMRGVRWAKLYSLVIWGCTLLLSSPML
.: .:.:::.:. .: .:::::::.:. :. : . ::. ..:: . : : : .
CCDS31 SASVSFNLYASVFLLTCLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAI
110 120 130 140 150 160
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pF1KB8 VFRTMKEYSDEGHNVTACVISYPSL--IWEVFTNMLLNVVGFLLPLSVITFCTMQIMQVL
. :.. . :. :.:.:.. : : . .. :..:::.:. .: : ..:
CCDS31 IHRNV--FFIENTNITVCAFHYESQNSTLPIGLGLTKNILGFLFPFLIILTSYTLIWKAL
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 RNN-EMQKFKEIQTERRATVLVLVVLLLFIICWLPFQISTFLDTLHRLGILSSCQDERII
.. :.:: : . . ......:.:.. :.: :: ::::.: .:::. .:. :.
CCDS31 KKAYEIQKNKPRNDD--IFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIRDCRIADIV
230 240 250 260 270 280
320 330 340 350 360 370
pF1KB8 DVITQIASFMAYSNSCLNPLVYVIVGKRFRKKSWEVYQGVCQKGGCRSEPIQMENSMGTL
:. :. .:: :.::::: : ..::.:.. .. . . :. .:. .. . : .
CCDS31 DTAMPITICIAYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSHSN-LSTKMSTLSY
290 300 310 320 330
380 390
pF1KB8 RTSISVERQIHKLQDWAGSRQ
: : .: . .:
CCDS31 RPSDNVSSSTKKPAPCFEVE
340 350
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20 30 40 50 60 70
pF1KB8 EDSVPTTASFSADMLNVTLQGPTLNGTFAQSKCPQVEWLGWLNTIQPPFLWVLFVLATLE
. : .:. .. . ::. ..::.. .
CCDS27 METPNTTEDYDTTTEFDYGDATPCQKVNERAFGAQLLPPLYSLVFVIGLVG
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pF1KB8 NIFVLSVFCLHKSSCTVAEIYLGNLAAADLILACGLPFWAITISNNFDWLFGETLCRVVN
::.:. :. .: ... ::: ::: .::.. :::: : . . ::.::...:....
CCDS27 NILVVLVLVQYKRLKNMTSIYLLNLAISDLLFLFTLPFW-IDYKLKDDWVFGDAMCKILS
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pF1KB8 AIISMNLYSSICFLMLVSIDRYLALVKTMSMGRMRGVRWAKLYSLVIWGCTLLLSSPMLV
.. .::: : :..:..::::::.:... : : : .. . :..::. ..: : : :
CCDS27 GFYYTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIIIWALAILASMPGLY
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200 210 220 230 240 250
pF1KB8 F-RTMKEYSDEGHNVTACVISYP--SLI-WEVFTNMLLNVVGFLLPLSVITFCTMQIMQV
: .:. :.. :.. : . .: :: :..: . ::. :..::: :. .: :...
CCDS27 FSKTQWEFT---HHT--CSLHFPHESLREWKLFQALKLNLFGLVLPLLVMIICYTGIIKI
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: ... .: .. .:. :..:....:.. : :.... ...... . . :.. : .
CCDS27 L----LRRPNEKKS--KAVRLIFVIMIIFFLFWTPYNLTILISVFQDFLFTHECEQSRHL
230 240 250 260 270
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CCDS27 DLAVQVTEVIAYTHCCVNPVIYAFVGERFRKYLRQLFHRRVAVHLVKWLPFLSVDRLERV
280 290 300 310 320 330
380 390
pF1KB8 RTSISVERQIHKLQDWAGSRQ
CCDS27 SSTSPSTGEHELSAGF
340 350
>>CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 (376 aa)
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pF1KB8 MFSPWKISMFLSVREDSVPTTASFSADMLNVTLQGPTLNGTFAQSKCPQVEWLGWLNTIQ
:. : :.: ... . . ..... .: : : . : ... . . .
CCDS54 MPFGIRMLLRAHKPGSSRRSEMTTSLDTVETFGTTSYYDDVGLLCEKADTRALMAQFV
10 20 30 40 50
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pF1KB8 PPFLWVLFVLATLENIFVLSVFCLHKSSCTVAEIYLGNLAAADLILACGLPFWAITISNN
::. ..:... : :. :. .. .. ...::: ::: .::.. :::: : .
CCDS54 PPLYSLVFTVGLLGNVVVVMILIKYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFW-IHYVRG
60 70 80 90 100 110
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pF1KB8 FDWLFGETLCRVVNAIISMNLYSSICFLMLVSIDRYLALVKTMSMGRMRGVRWAKLYSLV
.:.::. .:...... .::: : :..:..::::::.:... : : : .. . :.:
CCDS54 HNWVFGHGMCKLLSGFYHTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIV
120 130 140 150 160 170
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pF1KB8 IWGCTLLLSSPMLVFRTMKEYSDEGHNVTACVISYPS---LIWEVFTNMLLNVVGFLLPL
:: ..: . : ..: .: .: : : :: :. : .. ... ..:::
CCDS54 TWGLAVLAALPEFIFYETEELFEE----TLCSALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPL
180 190 200 210 220 230
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pF1KB8 SVITFCTMQIMQ-VLRNNEMQKFKEIQTERRATVLVLVVLLLFIICWLPFQISTFLDTLH
:...: :.. .:: .:.: :. :..:.. .:.: : :.... .:.. .
CCDS54 LVMAICYTGIIKTLLRCPSKKKYKAIR-------LIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQ
240 250 260 270 280
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pF1KB8 RLGILSSCQDERIIDVITQIASFMAYSNSCLNPLVYVIVGKRFRKKSWEVYQGVCQKGGC
. . ..:. . .:.. .. .:::. :.::..:..::.::::
CCDS54 SILFGNDCERSKHLDLVMLVTEVIAYSHCCMNPVIYAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLG
290 300 310 320 330 340
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pF1KB8 RSEPIQMENSMGTLRTSISVERQIHKLQDWAGSRQ
CCDS54 RYIPFLPSEKLERTSSVSPSTAEPELSIVF
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20 30 40 50 60 70
pF1KB8 SVPTTASFSADMLNVTLQGPTLNGTFAQSKCPQVEWLGWLNTIQPPFLWVLFVLATLENI
: ... . . . ::. ..:... : :.
CCDS27 MTTSLDTVETFGTTSYYDDVGLLCEKADTRALMAQFVPPLYSLVFTVGLLGNV
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pF1KB8 FVLSVFCLHKSSCTVAEIYLGNLAAADLILACGLPFWAITISNNFDWLFGETLCRVVNAI
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CCDS27 VVVMILIKYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFW-IHYVRGHNWVFGHGMCKLLSGF
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CCDS27 YHTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHAVFALRARTVTFGVITSIVTWGLAVLAALPEFIFY
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CCDS27 CPSKKKYKAIR-------LIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFGNDCERSKHLDL
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391 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]