Result of FASTA (ccds) for
pF1KB9000
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9000, 418 aa
1>>>pF1KB9000 418 - 418 aa - 418 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9988+/-0.000847; mu= 19.4008+/- 0.051
mean_var=167.6911+/-66.045, 0's: 0 Z-trim(108.2): 258 B-trim: 1224 in 2/49
Lambda= 0.099042
statistics sampled from 9516 (10049) to 9516 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.666), E-opt: 0.2 (0.309), width: 16
Scan time: 2.650
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8965.1 AVPR1A gene_id:552|Hs108|chr12 ( 418) 2878 424.1 1.2e-118
CCDS73015.1 AVPR1B gene_id:553|Hs108|chr1 ( 424) 1252 191.8 1.1e-48
CCDS2570.1 OXTR gene_id:5021|Hs108|chr3 ( 389) 1249 191.3 1.4e-48
CCDS55539.1 AVPR2 gene_id:554|Hs108|chrX ( 309) 784 124.7 1.2e-28
CCDS14735.1 AVPR2 gene_id:554|Hs108|chrX ( 371) 784 124.8 1.4e-28
CCDS5444.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 ( 371) 409 71.2 1.8e-12
CCDS5443.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 ( 377) 409 71.2 1.9e-12
CCDS75579.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 ( 390) 409 71.3 1.9e-12
>>CCDS8965.1 AVPR1A gene_id:552|Hs108|chr12 (418 aa)
initn: 2878 init1: 2878 opt: 2878 Z-score: 2243.4 bits: 424.1 E(32554): 1.2e-118
Smith-Waterman score: 2878; 100.0% identity (100.0% similar) in 418 aa overlap (1-418:1-418)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MRLSAGPDAGPSGNSSPWWPLATGAGNTSREAEALGEGNGPPRDVRNEELAKLEIAVLAV
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CCDS89 MRLSAGPDAGPSGNSSPWWPLATGAGNTSREAEALGEGNGPPRDVRNEELAKLEIAVLAV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 TFAVAVLGNSSVLLALHRTPRKTSRMHLFIRHLSLADLAVAFFQVLPQMCWDITYRFRGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 TFAVAVLGNSSVLLALHRTPRKTSRMHLFIRHLSLADLAVAFFQVLPQMCWDITYRFRGP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 DWLCRVVKHLQVFGMFASAYMLVVMTADRYIAVCHPLKTLQQPARRSRLMIAAAWVLSFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 DWLCRVVKHLQVFGMFASAYMLVVMTADRYIAVCHPLKTLQQPARRSRLMIAAAWVLSFV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 LSTPQYFVFSMIEVNNVTKARDCWATFIQPWGSRAYVTWMTGGIFVAPVVILGTCYGFIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 LSTPQYFVFSMIEVNNVTKARDCWATFIQPWGSRAYVTWMTGGIFVAPVVILGTCYGFIC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 YNIWCNVRGKTASRQSKGAEQAGVAFQKGFLLAPCVSSVKSISRAKIRTVKMTFVIVTAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 YNIWCNVRGKTASRQSKGAEQAGVAFQKGFLLAPCVSSVKSISRAKIRTVKMTFVIVTAY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 IVCWAPFFIIQMWSVWDPMSVWTESENPTITITALLGSLNSCCNPWIYMFFSGHLLQDCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 IVCWAPFFIIQMWSVWDPMSVWTESENPTITITALLGSLNSCCNPWIYMFFSGHLLQDCV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB9 QSFPCCQNMKEKFNKEDTDSMSRRQTFYSNNRSPTNSTGMWKDSPKSSKSIKFIPVST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 QSFPCCQNMKEKFNKEDTDSMSRRQTFYSNNRSPTNSTGMWKDSPKSSKSIKFIPVST
370 380 390 400 410
>>CCDS73015.1 AVPR1B gene_id:553|Hs108|chr1 (424 aa)
initn: 1257 init1: 844 opt: 1252 Z-score: 987.7 bits: 191.8 E(32554): 1.1e-48
Smith-Waterman score: 1254; 51.4% identity (75.5% similar) in 383 aa overlap (14-386:2-377)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MRLSAGPDAGPSGNSSPWWPLATGAGNTSREAEALGEGNGPPRDVRNEELAKLEIAVLAV
.:.: : :. : : . . ... : :.:::::.::.:::.
CCDS73 MDSGPLWD----ANPTPRGTLSAPNATTPWLG-RDEELAKVEIGVLAT
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 TFAVAVLGNSSVLLALHRTPRKTSRMHLFIRHLSLADLAVAFFQVLPQMCWDITYRFRGP
....:. :: .:::.: . :: ::::::. ::.:.:::::.::::::. :::::::.::
CCDS73 VLVLATGGNLAVLLTLGQLGRKRSRMHLFVLHLALTDLAVALFQVLPQLLWDITYRFQGP
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 DWLCRVVKHLQVFGMFASAYMLVVMTADRYIAVCHPLKTLQQPARRSRLMIAAAWVLSFV
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CCDS73 DLLCRAVKYLQVLSMFASTYMLLAMTLDRYLAVCHPLRSLQQPGQSTYLLIAAPWLLAAI
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 LSTPQYFVFSMIEVNNVTKARDCWATFIQPWGSRAYVTWMTGGIFVAPVVILGTCYGFIC
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CCDS73 FSLPQVFIFSLREVIQGSGVLDCWADFGFPWGPRAYLTWTTLAIFVLPVTMLTACYSLIC
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290
pF1KB9 YNIWCNVRGKTASRQSKG---------AEQAGVAFQKGFLLAPCVSSVKSISRAKIRTVK
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CCDS73 HEICKNLKVKTQAWRVGGGGWRTWDRPSPSTLAATTRG--LPSRVSSINTISRAKIRTVK
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 MTFVIVTAYIVCWAPFFIIQMWSVWDPMSVWTESENPTITITALLGSLNSCCNPWIYMFF
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CCDS73 MTFVIVLAYIACWAPFFSVQMWSVWDKNAPDEDSTNVAFTISMLLGNLNSCCNPWIYMGF
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 SGHLLQDCVQSFPCCQNMKEKFNKEDTD-SMSRRQTFYSNNRSPTNSTGMWKDSPKSSKS
..::: .. . :: . . .. .. .: :.: :.:
CCDS73 NSHLLPRPLRHLACCGGPQPRMRRRLSDGSLSSRHTTLLTRSSCPATLSLSLSLTLSGRP
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 IKFIPVST
CCDS73 RPEESPRDLELADGEGTAETIIF
410 420
>>CCDS2570.1 OXTR gene_id:5021|Hs108|chr3 (389 aa)
initn: 1060 init1: 504 opt: 1249 Z-score: 985.7 bits: 191.3 E(32554): 1.4e-48
Smith-Waterman score: 1249; 49.7% identity (75.5% similar) in 380 aa overlap (25-398:13-382)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MRLSAGPDAGPSGNSSPWWPLATGAGNTSREAEALGEGN---GPPRDVRNEELAKLEIAV
:.:.: : .::: :::: ::: ::..:.::
CCDS25 MEGALAANWSAEAANAS-AAPPGAEGNRTAGPPR--RNEALARVEVAV
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 LAVTFAVAVLGNSSVLLALHRTPRKTSRMHLFIRHLSLADLAVAFFQVLPQMCWDITYRF
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CCDS25 LCLILLLALSGNACVLLALRTTRQKHSRLFFFMKHLSIADLVVAVFQVLPQLLWDITFRF
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 RGPDWLCRVVKHLQVFGMFASAYMLVVMTADRYIAVCHPLKTLQQPARRSRLMIAAAWVL
::: :::.::.::: :::::.:.:..:. :: .:.:.::..:.. : .:: . :.:.
CCDS25 YGPDLLCRLVKYLQVVGMFASTYLLLLMSLDRCLAICQPLRSLRR--RTDRLAVLATWLG
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 SFVLSTPQYFVFSMIEVNNVTKARDCWATFIQPWGSRAYVTWMTGGIFVAPVVILGTCYG
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CCDS25 CLVASAPQVHIFSLREVAD--GVFDCWAVFIQPWGPKAYITWITLAVYIVPVIVLAACYG
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 FICYNIWCNVRGKTASRQSKGAEQAGVAFQKGFLLAPCVSSVKSISRAKIRTVKMTFVIV
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CCDS25 LISFKIWQNLRLKTAAAAAAEAPEGAAAGDGGRVALARVSSVKLISKAKIRTVKMTFIIV
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 TAYIVCWAPFFIIQMWSVWDPMSVWTESENPTITITALLGSLNSCCNPWIYMFFSGHLLQ
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CCDS25 LAFIVCWTPFFFVQMWSVWDANA---PKEASAFIIVMLLASLNSCCNPWIYMLFTGHLFH
290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 DCVQSFPCCQNMKEKFNKEDTDSMSRRQ---TFYSNNRSPTNSTGMWKDSPKSSKSIKFI
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CCDS25 ELVQRFLCCSASYLKGRRLGETSASKKSNSSSFVLSHRSSSQRSCSQPSTA
340 350 360 370 380
pF1KB9 PVST
>>CCDS55539.1 AVPR2 gene_id:554|Hs108|chrX (309 aa)
initn: 732 init1: 336 opt: 784 Z-score: 627.5 bits: 124.7 E(32554): 1.2e-28
Smith-Waterman score: 784; 43.1% identity (73.7% similar) in 281 aa overlap (42-318:28-298)
20 30 40 50 60 70
pF1KB9 SGNSSPWWPLATGAGNTSREAEALGEGNGPPRDVRNEELAKLEIAVLAVTFAVAVLGNSS
: :.:. ::. :.:.:...:....:.:.
CCDS55 MLMASTTSAVPGHPSLPSLPSNSSQERPLDTRDPLLARAELALLSIVFVAVALSNGL
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120
pF1KB9 VLLALHRTPRKT--SRMHLFIRHLSLADLAVAFFQVLPQMCWDITYRFRGPDWLCRVVKH
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CCDS55 VLAALARRGRRGHWAPIHVFIGHLCLADLAVALFQVLPQLAWKATDRFRGPDALCRAVKY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LQVFGMFASAYMLVVMTADRYIAVCHPLKTLQQP--ARRSRLMIAAAWVLSFVLSTPQYF
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CCDS55 LQMVGMYASSYMILAMTLDRHRAICRPMLAYRHGSGAHWNR-PVLVAWAFSLLLSLPQLF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 VFSMIEVNNVTKARDCWATFIQPWGSRAYVTWMTGGIFVAPVVILGTCYGFICYNIWCNV
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CCDS55 IFAQRNVEGGSGVTDCWACFAEPWGRRTYVTWIALMVFVAPTLGIAACQVLIFREIHASL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 RGKTASRQSKGAEQAGVAFQKGFLLAPCVSSVKSISRAKIRTVKMTFVIVTAYIVCWAPF
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CCDS55 VPGPSER--PGGRRRG--RRTG---SPGEGA--HVSAAVAKTVRMTLVIVVVYVLCWAPF
240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 FIIQMWSVWDPMSVWTESENPTITITALLGSLNSCCNPWIYMFFSGHLLQDCVQSFPCCQ
:..:.:..:::
CCDS55 FLVQLWAAWDPEAPLEGGCSRG
290 300
>>CCDS14735.1 AVPR2 gene_id:554|Hs108|chrX (371 aa)
initn: 820 init1: 336 opt: 784 Z-score: 626.8 bits: 124.8 E(32554): 1.4e-28
Smith-Waterman score: 882; 42.2% identity (72.6% similar) in 329 aa overlap (42-366:28-342)
20 30 40 50 60 70
pF1KB9 SGNSSPWWPLATGAGNTSREAEALGEGNGPPRDVRNEELAKLEIAVLAVTFAVAVLGNSS
: :.:. ::. :.:.:...:....:.:.
CCDS14 MLMASTTSAVPGHPSLPSLPSNSSQERPLDTRDPLLARAELALLSIVFVAVALSNGL
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120
pF1KB9 VLLALHRTPRKT--SRMHLFIRHLSLADLAVAFFQVLPQMCWDITYRFRGPDWLCRVVKH
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CCDS14 VLAALARRGRRGHWAPIHVFIGHLCLADLAVALFQVLPQLAWKATDRFRGPDALCRAVKY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 LQVFGMFASAYMLVVMTADRYIAVCHPLKTLQQP--ARRSRLMIAAAWVLSFVLSTPQYF
::. ::.::.::...:: ::. :.:.:. . .. :. .: ...: :..:..:: :: :
CCDS14 LQMVGMYASSYMILAMTLDRHRAICRPMLAYRHGSGAHWNRPVLVA-WAFSLLLSLPQLF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 VFSMIEVNNVTKARDCWATFIQPWGSRAYVTWMTGGIFVAPVVILGTCYGFICYNIWCNV
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CCDS14 IFAQRNVEGGSGVTDCWACFAEPWGRRTYVTWIALMVFVAPTLGIAACQVLIFREIHASL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 RGKTASRQSKGAEQAGVAFQKGFLLAPCVSSVKSISRAKIRTVKMTFVIVTAYIVCWAPF
. : :... : . : .: .. .: : .::.::.:::..:..:::::
CCDS14 VPGPSERP--GGRRRG--RRTG---SPGEGA--HVSAAVAKTVRMTLVIVVVYVLCWAPF
240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 FIIQMWSVWDPMSVWTESENPTITITALLGSLNSCCNPWIYMFFSGHLLQDCVQSFPCCQ
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CCDS14 FLVQLWAAWDPEA---PLEGAPFVLLMLLASLNSCTNPWIYASFSSSVSSE-LRSLLCCA
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410
pF1KB9 NMKEKFNKEDTDSMSRRQTFYSNNRSPTNSTGMWKDSPKSSKSIKFIPVST
CCDS14 RGRTPPSLGPQDESCTTASSSLAKDTSS
350 360 370
>>CCDS5444.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 (371 aa)
initn: 521 init1: 238 opt: 409 Z-score: 337.2 bits: 71.2 E(32554): 1.8e-12
Smith-Waterman score: 551; 31.9% identity (62.3% similar) in 313 aa overlap (54-365:52-341)
30 40 50 60 70 80
pF1KB9 GAGNTSREAEALGEGNGPPRDVRNEELAKLEIAVLAVTFAVAVLGNSSVLLALHRTPRKT
.. .: : :. ...::: ::.. : .:
CCDS54 SPVACTETVTFTEVVEGKEWGSFYYSFKTEQLITLWVLFVFTIVGNSVVLFSTWRRKKK-
30 40 50 60 70 80
90 100 110 120 130 140
pF1KB9 SRMHLFIRHLSLADLAVAFFQVLPQMCWDITYRFRGPDWLCRVVKHLQVFGMFASAYMLV
::: .:. .:...: ... ..: .. : .: : .:: .::::..::: ..::.:.::
CCDS54 SRMTFFVTQLAITDSFTGLVNILTDINWRFTGDFTAPDLVCRVVRYLQVVLLYASTYVLV
90 100 110 120 130 140
150 160 170 180 190 200
pF1KB9 VMTADRYIAVCHPLKTLQQPARRSRLMIAAAWVLSFVLSTPQYFVFSMIEVNNVTKARDC
.. ::: :. .:.: :: ...:..:. :: :::..: : ..:. ..: .:
CCDS54 SLSIDRYHAIVYPMKFLQGE-KQARVLIVIAWSLSFLFSIPTLIIFGKRTLSN--GEVQC
150 160 170 180 190
210 220 230 240 250 260
pF1KB9 WATFIQPWGSRAYVTWMTGGIFVAPVVILGTCYGFICYNIWCNVRGKTASRQSKGAEQAG
:: . . :.: .. .. :..:.. ::.. .:: .:: : .
CCDS54 WALWPDDSYWTPYMTIVAFLVYFIPLTIISIMYGIVIRTIWI---------KSKTYETVI
200 210 220 230 240
270 280 290 300 310 320
pF1KB9 VAFQKGFLLAPCVSSVKS-ISRAKIRTVKMTFVIVTAYIVCWAPFFIIQMWSVWDPMSVW
. : : : : .. ::.:::...:....:. :.: ::.:.:.... . .. .
CCDS54 SNCSDGKL---CSSYNRGLISKAKIKAIKYSIIIILAFICCWSPYFLFDILDNFNLLPDT
250 260 270 280 290 300
330 340 350 360 370 380
pF1KB9 TESENPTITITALLGSLNSCCNPWIYMFFSGHLLQDCVQSFPCCQNMKEKFNKEDTDSMS
: .. : : .::: :: :: ::. . ::::
CCDS54 QERFYASVIIQNL-PALNSAINPLIYCVFSSSI------SFPCREQRSQDSRMTFRERTE
310 320 330 340 350
390 400 410
pF1KB9 RRQTFYSNNRSPTNSTGMWKDSPKSSKSIKFIPVST
CCDS54 RHEMQILSKPEFI
360 370
>>CCDS5443.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 (377 aa)
initn: 521 init1: 238 opt: 409 Z-score: 337.1 bits: 71.2 E(32554): 1.9e-12
Smith-Waterman score: 551; 31.9% identity (62.3% similar) in 313 aa overlap (54-365:52-341)
30 40 50 60 70 80
pF1KB9 GAGNTSREAEALGEGNGPPRDVRNEELAKLEIAVLAVTFAVAVLGNSSVLLALHRTPRKT
.. .: : :. ...::: ::.. : .:
CCDS54 SPVACTETVTFTEVVEGKEWGSFYYSFKTEQLITLWVLFVFTIVGNSVVLFSTWRRKKK-
30 40 50 60 70 80
90 100 110 120 130 140
pF1KB9 SRMHLFIRHLSLADLAVAFFQVLPQMCWDITYRFRGPDWLCRVVKHLQVFGMFASAYMLV
::: .:. .:...: ... ..: .. : .: : .:: .::::..::: ..::.:.::
CCDS54 SRMTFFVTQLAITDSFTGLVNILTDINWRFTGDFTAPDLVCRVVRYLQVVLLYASTYVLV
90 100 110 120 130 140
150 160 170 180 190 200
pF1KB9 VMTADRYIAVCHPLKTLQQPARRSRLMIAAAWVLSFVLSTPQYFVFSMIEVNNVTKARDC
.. ::: :. .:.: :: ...:..:. :: :::..: : ..:. ..: .:
CCDS54 SLSIDRYHAIVYPMKFLQGE-KQARVLIVIAWSLSFLFSIPTLIIFGKRTLSN--GEVQC
150 160 170 180 190
210 220 230 240 250 260
pF1KB9 WATFIQPWGSRAYVTWMTGGIFVAPVVILGTCYGFICYNIWCNVRGKTASRQSKGAEQAG
:: . . :.: .. .. :..:.. ::.. .:: .:: : .
CCDS54 WALWPDDSYWTPYMTIVAFLVYFIPLTIISIMYGIVIRTIWI---------KSKTYETVI
200 210 220 230 240
270 280 290 300 310 320
pF1KB9 VAFQKGFLLAPCVSSVKS-ISRAKIRTVKMTFVIVTAYIVCWAPFFIIQMWSVWDPMSVW
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