FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB9044, 530 aa 1>>>pF1KB9044 530 - 530 aa - 530 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5373+/-0.000924; mu= 14.3120+/- 0.057 mean_var=345.2690+/-71.166, 0's: 0 Z-trim(111.1): 2069 B-trim: 93 in 1/47 Lambda= 0.069023 statistics sampled from 17195 (19577) to 17195 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.556), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16 Scan time: 7.640 The best scores are: opt bits E(85289) XP_016867177 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 569) 2848 299.2 2.2e-80 NP_066971 (OMIM: 604756) zinc finger protein 273 [ ( 569) 2848 299.2 2.2e-80 NP_689839 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 is ( 586) 2669 281.4 5.2e-75 NP_001092096 (OMIM: 603980) zinc finger protein 98 ( 572) 2655 280.0 1.3e-74 NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 is ( 595) 2599 274.4 6.5e-73 XP_016867180 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2597 274.1 6.9e-73 XP_016867183 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2597 274.1 6.9e-73 XP_016867178 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2597 274.1 6.9e-73 XP_016867181 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2597 274.1 6.9e-73 XP_016867187 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2597 274.1 6.9e-73 XP_016867182 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2597 274.1 6.9e-73 XP_016867185 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2597 274.1 6.9e-73 XP_016867184 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2597 274.1 6.9e-73 XP_016867186 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2597 274.1 6.9e-73 XP_016867179 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2597 274.1 6.9e-73 NP_001269288 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 852) 2584 273.2 2.2e-72 NP_258429 (OMIM: 606957) zinc finger protein 257 i ( 563) 2547 269.2 2.3e-71 NP_001152765 (OMIM: 603984) zinc finger protein 73 ( 536) 2525 267.0 1e-70 XP_011525901 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 2525 267.0 1e-70 XP_006722660 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 550) 2525 267.0 1e-70 XP_005259754 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 2525 267.0 1e-70 XP_011525900 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 551) 2525 267.0 1e-70 NP_975011 (OMIM: 604768) zinc finger protein 254 i ( 659) 2514 266.1 2.4e-70 NP_001243582 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 818) 2504 265.2 5.3e-70 NP_003421 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 is (1191) 2489 264.0 1.8e-69 NP_112495 (OMIM: 603975) zinc finger protein 93 [H ( 620) 2469 261.5 5.2e-69 NP_775802 (OMIM: 603982) zinc finger protein 100 [ ( 542) 2463 260.8 7.4e-69 NP_003414 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 is ( 809) 2454 260.2 1.7e-68 XP_011526559 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2413 256.2 2.8e-67 XP_016882705 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2413 256.2 2.8e-67 XP_011526561 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2413 256.2 2.8e-67 XP_016882703 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2413 256.2 2.8e-67 NP_001243579 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2413 256.2 2.8e-67 XP_016882698 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2413 256.2 2.8e-67 XP_016882697 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2413 256.2 2.8e-67 XP_016882696 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2413 256.2 2.8e-67 NP_001243577 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2413 256.2 2.8e-67 XP_016882701 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2413 256.2 2.8e-67 XP_016882702 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2413 256.2 2.8e-67 XP_016882700 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2413 256.2 2.8e-67 XP_016882704 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2413 256.2 2.8e-67 XP_016882699 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2413 256.2 2.8e-67 NP_001243578 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2413 256.2 2.8e-67 XP_011526007 (OMIM: 603980) PREDICTED: zinc finger ( 531) 2409 255.4 3.1e-67 NP_001073878 (OMIM: 603981) zinc finger protein 99 ( 864) 2412 256.1 3.1e-67 NP_001303925 (OMIM: 606957) zinc finger protein 25 ( 531) 2361 250.7 8.4e-66 XP_011514048 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger ( 537) 2360 250.6 9.1e-66 XP_016882746 (OMIM: 603977) PREDICTED: zinc finger (1168) 2330 248.2 1e-64 XP_016881605 (OMIM: 603984) PREDICTED: zinc finger ( 504) 2324 246.9 1.1e-64 NP_009084 (OMIM: 603977) zinc finger protein 208 i (1280) 2330 248.3 1.1e-64 >>XP_016867177 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger pro (569 aa) initn: 2848 init1: 2848 opt: 2848 Z-score: 1564.2 bits: 299.2 E(85289): 2.2e-80 Smith-Waterman score: 2848; 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XP_016 VFSVLTKHKIIHTGTKPYNCEECGKGFSIFSTLTKHKIIHTGEKPYKCNECGKAFNWSST 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 390 pF1KB9 LTKHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQFANLTRHKKIHTGEKSYKCEECGKAFIQSSNLTEH :::::.::::::::::::::::::: ..::::: .::::: :::::::::: .:..::.: XP_016 LTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTRHKIVHTGEKPYKCEECGKAFKRSTTLTKH 370 380 390 400 410 420 400 410 420 430 440 450 pF1KB9 MRIHTGEKPYKCEECGKAFNGCSSLTRHKRIHTRENTYKCEECGKGFTLFSTLTNHKVIH ::.: :::::::::::::. :.::.:: ::: . :::::::..: :::::.:: .: XP_016 KRIYTKEKPYKCEECGKAFSVFSTLTKHKIIHTGAKPYKCEECGSAFRAFSTLTEHKRVH 430 440 450 460 470 480 460 470 480 490 500 510 pF1KB9 TGEKSYKCDECGNVFNWPATLANHKRIHAREKPYKCEECGKAFNRSSHLTRHKKIHTGEK :::: :::.:::..::: .::..:::::. :::::::::::::::::.:::::::::::: XP_016 TGEKPYKCNECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTRHKKIHTGEK 490 500 510 520 530 540 520 530 pF1KB9 LYKPEKCDNNFDNT :::..::. :::: XP_016 PYKPKRCDSAFDNTPNFSRHKRNHMGEKS 550 560 >>NP_066971 (OMIM: 604756) zinc finger protein 273 [Homo (569 aa) initn: 2848 init1: 2848 opt: 2848 Z-score: 1564.2 bits: 299.2 E(85289): 2.2e-80 Smith-Waterman score: 2848; 76.0% identity (89.0% similar) in 529 aa overlap (2-530:26-554) 10 20 30 pF1KB9 MPGPPGSLEMGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQRN :: ::::::::::::::::::::::::::::.:.: NP_066 MSSAPRGPPSVAPLPAGIGRSTAKTPGLPGSLEMGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTSQQN 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KB9 LYRKVMFENYRNLVFLGIAVSKPHLITCLEQGKEPWNRKRQEMVAKPPVIYSHFTEDLWP :::.::..::::::::::::::: ::::::::::: : ::. :::::::. :::..:::: NP_066 LYRNVMLDNYRNLVFLGIAVSKPDLITCLEQGKEPCNMKRHAMVAKPPVVCSHFAQDLWP 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KB9 EHSIKDSFQKVILRGYGKCGHENLQLRISCKSVDESKVFKEGYNELNQCLRTTQSKIFQC ....:::::::::: ::: :::::::: .:::.:: :: :.::: ::::: ::::::::: NP_066 KQGLKDSFQKVILRRYGKYGHENLQLRKGCKSADEHKVHKRGYNGLNQCLTTTQSKIFQC 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KB9 DKYVKVFHKFSNSNSHKKRNTGKKVFKCKECGKSFCMLSHLTQHIRIHTRENSYKCEECG ::::::.::::::: ::::.:::: ::::::::: :.::.:::: . :: : :::. :: NP_066 DKYVKVLHKFSNSNIHKKRQTGKKPFKCKECGKSCCILSQLTQHKKTATRVNFYKCKTCG 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KB9 KVLNWFSELIKHKGIHMGEKPYKCEECGKAFNQSSTLIKHKKIHIEEKPFKCEECGKAFS :..: ::.: ::: :: .:::::::::::::: :: :::::: ::::.:::.:::.:: NP_066 KAFNQFSNLTKHKIIHPEVNPYKCEECGKAFNQSLTLTKHKKIHTEEKPYKCEDCGKVFS 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KB9 LFSILSKHKIIHTGDKPYKCDECHKAFNWFATLTNHKRIHTGEKPFKCEECGKDFNQFSN .::.:.:::::::: :::.:.:: :.:. :.:::.:: :::::::.::.:::: :: :. NP_066 VFSVLTKHKIIHTGTKPYNCEECGKGFSIFSTLTKHKIIHTGEKPYKCNECGKAFNWSST 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 390 pF1KB9 LTKHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQFANLTRHKKIHTGEKSYKCEECGKAFIQSSNLTEH :::::.::::::::::::::::::: ..::::: .::::: :::::::::: .:..::.: NP_066 LTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTRHKIVHTGEKPYKCEECGKAFKRSTTLTKH 370 380 390 400 410 420 400 410 420 430 440 450 pF1KB9 MRIHTGEKPYKCEECGKAFNGCSSLTRHKRIHTRENTYKCEECGKGFTLFSTLTNHKVIH ::.: :::::::::::::. :.::.:: ::: . :::::::..: :::::.:: .: NP_066 KRIYTKEKPYKCEECGKAFSVFSTLTKHKIIHTGAKPYKCEECGSAFRAFSTLTEHKRVH 430 440 450 460 470 480 460 470 480 490 500 510 pF1KB9 TGEKSYKCDECGNVFNWPATLANHKRIHAREKPYKCEECGKAFNRSSHLTRHKKIHTGEK :::: :::.:::..::: .::..:::::. :::::::::::::::::.:::::::::::: NP_066 TGEKPYKCNECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTRHKKIHTGEK 490 500 510 520 530 540 520 530 pF1KB9 LYKPEKCDNNFDNT :::..::. :::: NP_066 PYKPKRCDSAFDNTPNFSRHKRNHMGEKS 550 560 >>NP_689839 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 isofor (586 aa) initn: 4464 init1: 2669 opt: 2669 Z-score: 1467.7 bits: 281.4 E(85289): 5.2e-75 Smith-Waterman score: 2669; 74.1% identity (85.2% similar) in 521 aa overlap (10-530:1-521) 10 20 30 40 50 60 pF1KB9 MPGPPGSLEMGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNLYRKVMFENYRNLVFLGIAVSKPH ::::::::: :::::::::::::::::::: ::.:::::::::::::::: NP_689 MGPLTFRDVKIEFSLEEWQCLDTAQRNLYRDVMLENYRNLVFLGIAVSKPD 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB9 LITCLEQGKEPWNRKRQEMVAKPPVIYSHFTEDLWPEHSIKDSFQKVILRGYGKCGHENL ::: ::::::::: ::.::: : ::. :::..:.:::::::::::::::: ::: ::::: NP_689 LITWLEQGKEPWNLKRHEMVDKTPVMCSHFAQDVWPEHSIKDSFQKVILRTYGKYGHENL 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB9 QLRISCKSVDESKVFKEGYNELNQCLRTTQSKIFQCDKYVKVFHKFSNSNSHKKRNTGKK ::: . :::: ::.: ::: ::::: ::.:::::::::::::::: : : .: :.:::: NP_689 QLRKDHKSVDACKVYKGGYNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKVFHKFPNVNRNKIRHTGKK 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB9 VFKCKECGKSFCMLSHLTQHIRIHTRENSYKCEECGKVLNWFSELIKHKGIHMGEKPYKC ::::. ::::::::.:::: .::::: :::::::::..:: : : ::: :: ::::::: NP_689 PFKCKNRGKSFCMLSQLTQHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWSSTLTKHKIIHTGEKPYKC 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KB9 EECGKAFNQSSTLIKHKKIHIEEKPFKCEECGKAFSLFSILSKHKIIHTGDKPYKCDECH ::::::::.::.: ::: :: :::.:::::::::. : :.::: ::: .:::::.:: NP_689 EECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKRIHTEEKPYKCEECG 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KB9 KAFNWFATLTNHKRIHTGEKPFKCEECGKDFNQFSNLTKHKKIHTGEKPYKCEECGKAFN :::: :. :..::::: .::.::::::: : :: : ::: :::::::::::::::::: NP_689 KAFNQFSILNKHKRIHMEDKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFN 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KB9 QFANLTRHKKIHTGEKSYKCEECGKAFIQSSNLTEHMRIHTGEKPYKCEECGKAFNGCSS ::.:::.:: :::::: :::.:::::: :::.::.: ::::::::::::::::::. :. NP_689 QFSNLTKHKIIHTGEKPYKCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFKQSST 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 pF1KB9 LTRHKRIHTRENTYKCEECGKGFTLFSTLTNHKVIHTGEKSYKCDECGNVFNWPATLANH ::.:: ::: :. ::::.:::.:. :..:.:: : .: :::.:::..:. .::..: NP_689 LTEHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCEECGKAFSVFSTLTKH 420 430 440 450 460 470 490 500 510 520 530 pF1KB9 KRIHAREKPYKCEECGKAFNRSSHLTRHKKIHTGEKLYKPEKCDNNFDNT : ::.:::::::::::::::.:: .:.:: ::: : :: ::: : :... NP_689 KIIHTREKPYKCEECGKAFNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFNQSSNLTARKIIY 480 490 500 510 520 530 NP_689 TGEKPYKYEECDKAFNKFSTLITHQIIYTGEKPCKHECGRAFNKSSNYTKEKLQT 540 550 560 570 580 >>NP_001092096 (OMIM: 603980) zinc finger protein 98 [Ho (572 aa) initn: 2655 init1: 2655 opt: 2655 Z-score: 1460.3 bits: 280.0 E(85289): 1.3e-74 Smith-Waterman score: 2655; 71.7% identity (85.1% similar) in 530 aa overlap (1-530:1-530) 10 20 30 40 50 60 pF1KB9 MPGPPGSLEMGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNLYRKVMFENYRNLVFLGIAVSKPH :::: :::::: :::::::.::::::::::::::.::::.::.::::::::.:::.::: NP_001 MPGPLGSLEMGVLTFRDVALEFSLEEWQCLDTAQQNLYRNVMLENYRNLVFVGIAASKPD 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB9 LITCLEQGKEPWNRKRQEMVAKPPVIYSHFTEDLWPEHSIKDSFQKVILRGYGKCGHENL ::::::::::::: ::.:::..:::.::.:..::::... :. ::::::: : :::.::: NP_001 LITCLEQGKEPWNVKRHEMVTEPPVVYSYFAQDLWPKQGKKNYFQKVILRTYKKCGRENL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB9 QLRISCKSVDESKVFKEGYNELNQCLRTTQSKIFQCDKYVKVFHKFSNSNSHKKRNTGKK ::: :::.:: :: :: :: ::::: :::.:::: :::::::::::::: :: .:::: NP_001 QLRKYCKSMDECKVHKECYNGLNQCLTTTQNKIFQYDKYVKVFHKFSNSNRHKIGHTGKK 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB9 VFKCKECGKSFCMLSHLTQHIRIHTRENSYKCEECGKVLNWFSELIKHKGIHMGEKPYKC :::::: :::::::::.:: :::. :. :::.::::. : :.: :: :: :.::::: NP_001 SFKCKECEKSFCMLSHLAQHKRIHSGEKPYKCKECGKAYNEASNLSTHKRIHTGKKPYKC 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB9 EECGKAFNQSSTLIKHKKIHIEEKPFKCEECGKAFSLFSILSKHKIIHTGDKPYKCDECH ::::::::. : : :: :: .::.:::::::::. . :. :: ::::.:::::.:: NP_001 EECGKAFNRLSHLTTHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNQSANLTTHKRIHTGEKPYKCEECG 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB9 KAFNWFATLTNHKRIHTGEKPFKCEECGKDFNQFSNLTKHKKIHTGEKPYKCEECGKAFN .::. .::: :: ::.::::.::::::: :.: :.:: :: :::::: ::::::::::. NP_001 RAFSQSSTLTAHKIIHAGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHKIIHTGEKFYKCEECGKAFS 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB9 QFANLTRHKKIHTGEKSYKCEECGKAFIQSSNLTEHMRIHTGEKPYKCEECGKAFNGCSS ....:: ::.::.::: :::::::::: :::.:: : :::.::: :::: :.:::. : NP_001 RLSHLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTTHKRIHAGEKFYKCEVCSKAFSRFSH 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB9 LTRHKRIHTRENTYKCEECGKGFTLFSTLTNHKVIHTGEKSYKCDECGNVFNWPATLANH :: :::::: :. ::::::::.:.: : ::.::.:::::: :::.:::..:: .::..: NP_001 LTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSKH 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB9 KRIHAREKPYKCEECGKAFNRSSHLTRHKKIHTGEKLYKPEKCDNNFDNT : ::. ::::::::::::::.::::: :: :::::: :: :.: . :.:. NP_001 KVIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSHLTTHKMIHTGEKPYKCEECGKAFNNSSILNRHKMIH 490 500 510 520 530 540 NP_001 TGEKLYKPESCNNACDNIAKISKYKRNCAGEK 550 560 570 >>NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 isofor (595 aa) initn: 3957 init1: 2200 opt: 2599 Z-score: 1430.0 bits: 274.4 E(85289): 6.5e-73 Smith-Waterman score: 2599; 71.5% identity (84.9% similar) in 522 aa overlap (10-530:1-522) 10 20 30 40 50 60 pF1KB9 MPGPPGSLEMGPLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNLYRKVMFENYRNLVFLGIAVSKPH :::::::::::::::.::::::::::::::.::.:::::::::::.:::: NP_003 MGPLTFRDVAIEFSLKEWQCLDTAQRNLYRNVMLENYRNLVFLGITVSKPD 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KB9 LITCLEQGKEPWNRKRQE-MVAKPPVIYSHFTEDLWPEHSIKDSFQKVILRGYGKCGHEN :::::::::: :. ::.: ::::: :. :::..:::::..:::::::: :. :::: ::: NP_003 LITCLEQGKEAWSMKRHEIMVAKPTVMCSHFAQDLWPEQNIKDSFQKVTLKRYGKCRHEN 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB9 LQLRISCKSVDESKVFKEGYNELNQCLRTTQSKIFQCDKYVKVFHKFSNSNSHKKRNTGK : :: .:.:.:: :. : : : ::::: .:::::::::::::: ::::::: :. :.: : NP_003 LPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHKFSNSNRHEIRHTKK 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB9 KVFKCKECGKSFCMLSHLTQHIRIHTRENSYKCEECGKVLNWFSELIKHKGIHMGEKPYK : ::: .::::: :.: ::.: ::::: : ::::::::..:: : : ::: :: :::::: NP_003 KPFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYK 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB9 CEECGKAFNQSSTLIKHKKIHIEEKPFKCEECGKAFSLFSILSKHKIIHTGDKPYKCDEC ::::::::::::.:::::::: :::.:::::::.:. :: :. :::::::.::::: :: NP_003 CEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLTTHKIIHTGEKPYKCKEC 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB9 HKAFNWFATLTNHKRIHTGEKPFKCEECGKDFNQFSNLTKHKKIHTGEKPYKCEECGKAF :::: .:::.:..:::::::.::::::: :.: :::: :: ::::::::::..::::: NP_003 GKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAF 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB9 NQFANLTRHKKIHTGEKSYKCEECGKAFIQSSNLTEHMRIHTGEKPYKCEECGKAFNGCS :: :.:: :. :::::: ::::.::::: . :.:: : ::::::::::.::::::. : NP_003 NQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSS 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB9 SLTRHKRIHTRENTYKCEECGKGFTLFSTLTNHKVIHTGEKSYKCDECGNVFNWPATLAN .::.:: ::: :. :::.:: :.:. : ::.:: :::::: :.:..::..:: ..:. NP_003 TLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTR 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB9 HKRIHAREKPYKCEECGKAFNRSSHLTRHKKIHTGEKLYKPEKCDNNFDNT ::. :..:::::::::::.:. : :: :: :::::: :: :.: . :... NP_003 HKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKI 480 490 500 510 520 530 NP_003 HTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGE 540 550 560 570 580 590 >-- initn: 383 init1: 383 opt: 383 Z-score: 237.4 bits: 53.8 E(85289): 1.7e-06 Smith-Waterman score: 383; 80.0% identity (87.1% similar) in 70 aa overlap (335-404:523-592) 310 320 330 340 350 360 pF1KB9 WFATLTNHKRIHTGEKPFKCEECGKDFNQFSNLTKHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQFAN :.:::::::::::::: :::::::::: .: NP_003 WPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSN 500 510 520 530 540 550 370 380 390 400 410 420 pF1KB9 LTRHKKIHTGEKSYKCEECGKAFIQSSNLTEHMRIHTGEKPYKCEECGKAFNGCSSLTRH ::.::.:::::: :::::: ::: :: ::.: :::::: NP_003 LTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI 560 570 580 590 430 440 450 460 470 480 pF1KB9 KRIHTRENTYKCEECGKGFTLFSTLTNHKVIHTGEKSYKCDECGNVFNWPATLANHKRIH >>XP_016867180 (OMIM: 604756) PREDICTED: zinc finger pro (504 aa) initn: 2597 init1: 2597 opt: 2597 Z-score: 1429.5 bits: 274.1 E(85289): 6.9e-73 Smith-Waterman score: 2597; 74.8% identity (88.3% similar) in 489 aa overlap (42-530:1-489) 20 30 40 50 60 70 pF1KB9 PLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQRNLYRKVMFENYRNLVFLGIAVSKPHLITCLEQGKEP :..::::::::::::::: ::::::::::: XP_016 MLDNYRNLVFLGIAVSKPDLITCLEQGKEP 10 20 30 80 90 100 110 120 130 pF1KB9 WNRKRQEMVAKPPVIYSHFTEDLWPEHSIKDSFQKVILRGYGKCGHENLQLRISCKSVDE : ::. :::::::. :::..::::....:::::::::: ::: :::::::: .:::.:: XP_016 CNMKRHAMVAKPPVVCSHFAQDLWPKQGLKDSFQKVILRRYGKYGHENLQLRKGCKSADE 40 50 60 70 80 90 140 150 160 170 180 190 pF1KB9 SKVFKEGYNELNQCLRTTQSKIFQCDKYVKVFHKFSNSNSHKKRNTGKKVFKCKECGKSF :: :.::: ::::: :::::::::::::::.::::::: ::::.:::: ::::::::: XP_016 HKVHKRGYNGLNQCLTTTQSKIFQCDKYVKVLHKFSNSNIHKKRQTGKKPFKCKECGKSC 100 110 120 130 140 150 200 210 220 230 240 250 pF1KB9 CMLSHLTQHIRIHTRENSYKCEECGKVLNWFSELIKHKGIHMGEKPYKCEECGKAFNQSS :.::.:::: . :: : :::. :::..: ::.: ::: :: .:::::::::::::: XP_016 CILSQLTQHKKTATRVNFYKCKTCGKAFNQFSNLTKHKIIHPEVNPYKCEECGKAFNQSL 160 170 180 190 200 210 260 270 280 290 300 310 pF1KB9 TLIKHKKIHIEEKPFKCEECGKAFSLFSILSKHKIIHTGDKPYKCDECHKAFNWFATLTN :: :::::: ::::.:::.:::.::.::.:.:::::::: :::.:.:: :.:. :.:::. XP_016 TLTKHKKIHTEEKPYKCEDCGKVFSVFSVLTKHKIIHTGTKPYNCEECGKGFSIFSTLTK 220 230 240 250 260 270 320 330 340 350 360 370 pF1KB9 HKRIHTGEKPFKCEECGKDFNQFSNLTKHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQFANLTRHKKI :: :::::::.::.:::: :: :.:::::.::::::::::::::::::: ..::::: . 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