FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB9075, 1338 aa 1>>>pF1KB9075 1338 - 1338 aa - 1338 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.6516+/-0.00162; mu= -30.0249+/- 0.091 mean_var=645.4942+/-146.477, 0's: 0 Z-trim(104.9): 391 B-trim: 0 in 0/54 Lambda= 0.050481 statistics sampled from 7805 (8153) to 7805 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.58), E-opt: 0.2 (0.25), width: 16 Scan time: 5.160 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS9330.1 FLT1 gene_id:2321|Hs108|chr13 (1338) 8848 662.0 3.1e-189 CCDS53860.1 FLT1 gene_id:2321|Hs108|chr13 ( 733) 4651 356.1 2e-97 CCDS73556.1 FLT1 gene_id:2321|Hs108|chr13 ( 687) 4308 331.1 6.3e-90 CCDS53861.1 FLT1 gene_id:2321|Hs108|chr13 ( 541) 3427 266.9 1.1e-70 CCDS3497.1 KDR gene_id:3791|Hs108|chr4 (1356) 2483 198.4 1.1e-49 CCDS43412.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5 (1298) 2080 169.1 7.3e-41 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CCDS53 PYLLRNLSDHTVAISSSTTLDCHANGVPEPQITWFKNNHKIQQEPELYTSTSPSSSSSSP 670 680 690 700 710 720 720 730 740 750 760 770 pF1KB9 ERVTEEDEGVYHCKATNQKGSVESSAYLTVQGTSDKSNLELITLTCTCVAATLFWLLLTL CCDS53 LSSSSSSSSSSSS 730 >>CCDS73556.1 FLT1 gene_id:2321|Hs108|chr13 (687 aa) initn: 4308 init1: 4308 opt: 4308 Z-score: 1728.0 bits: 331.1 E(32554): 6.3e-90 Smith-Waterman score: 4308; 99.7% identity (99.8% similar) in 658 aa overlap (1-658:1-658) 10 20 30 40 50 60 pF1KB9 MVSYWDTGVLLCALLSCLLLTGSSSGSKLKDPELSLKGTQHIMQAGQTLHLQCRGEAAHK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 MVSYWDTGVLLCALLSCLLLTGSSSGSKLKDPELSLKGTQHIMQAGQTLHLQCRGEAAHK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB9 WSLPEMVSKESERLSITKSACGRNGKQFCSTLTLNTAQANHTGFYSCKYLAVPTSKKKET :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 WSLPEMVSKESERLSITKSACGRNGKQFCSTLTLNTAQANHTGFYSCKYLAVPTSKKKET 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB9 ESAIYIFISDTGRPFVEMYSEIPEIIHMTEGRELVIPCRVTSPNITVTLKKFPLDTLIPD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 ESAIYIFISDTGRPFVEMYSEIPEIIHMTEGRELVIPCRVTSPNITVTLKKFPLDTLIPD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB9 GKRIIWDSRKGFIISNATYKEIGLLTCEATVNGHLYKTNYLTHRQTNTIIDVQISTPRPV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 GKRIIWDSRKGFIISNATYKEIGLLTCEATVNGHLYKTNYLTHRQTNTIIDVQISTPRPV 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB9 KLLRGHTLVLNCTATTPLNTRVQMTWSYPDEKNKRASVRRRIDQSNSHANIFYSVLTIDK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 KLLRGHTLVLNCTATTPLNTRVQMTWSYPDEKNKRASVRRRIDQSNSHANIFYSVLTIDK 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB9 MQNKDKGLYTCRVRSGPSFKSVNTSVHIYDKAFITVKHRKQQVLETVAGKRSYRLSMKVK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 MQNKDKGLYTCRVRSGPSFKSVNTSVHIYDKAFITVKHRKQQVLETVAGKRSYRLSMKVK 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB9 AFPSPEVVWLKDGLPATEKSARYLTRGYSLIIKDVTEEDAGNYTILLSIKQSNVFKNLTA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 AFPSPEVVWLKDGLPATEKSARYLTRGYSLIIKDVTEEDAGNYTILLSIKQSNVFKNLTA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB9 TLIVNVKPQIYEKAVSSFPDPALYPLGSRQILTCTAYGIPQPTIKWFWHPCNHNHSEARC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 TLIVNVKPQIYEKAVSSFPDPALYPLGSRQILTCTAYGIPQPTIKWFWHPCNHNHSEARC 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB9 DFCSNNEESFILDADSNMGNRIESITQRMAIIEGKNKMASTLVVADSRISGIYICIASNK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 DFCSNNEESFILDADSNMGNRIESITQRMAIIEGKNKMASTLVVADSRISGIYICIASNK 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KB9 VGTVGRNISFYITDVPNGFHVNLEKMPTEGEDLKLSCTVNKFLYRDVTWILLRTVNNRTM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 VGTVGRNISFYITDVPNGFHVNLEKMPTEGEDLKLSCTVNKFLYRDVTWILLRTVNNRTM 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KB9 HYSISKQKMAITKEHSITLNLTIMNVSLQDSGTYACRARNVYTGEEILQKKEITIRDQEA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: . CCDS73 HYSISKQKMAITKEHSITLNLTIMNVSLQDSGTYACRARNVYTGEEILQKKEITIRGEHC 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KB9 PYLLRNLSDHTVAISSSTTLDCHANGVPEPQITWFKNNHKIQQEPGIILGPGSSTLFIER CCDS73 NKKAVFSRISKFKSTRNDCTTQSNVKH 670 680 >>CCDS53861.1 FLT1 gene_id:2321|Hs108|chr13 (541 aa) initn: 3425 init1: 3425 opt: 3427 Z-score: 1382.7 bits: 266.9 E(32554): 1.1e-70 Smith-Waterman score: 3427; 97.0% identity (98.5% similar) in 536 aa overlap (1-533:1-536) 10 20 30 40 50 60 pF1KB9 MVSYWDTGVLLCALLSCLLLTGSSSGSKLKDPELSLKGTQHIMQAGQTLHLQCRGEAAHK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 MVSYWDTGVLLCALLSCLLLTGSSSGSKLKDPELSLKGTQHIMQAGQTLHLQCRGEAAHK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB9 WSLPEMVSKESERLSITKSACGRNGKQFCSTLTLNTAQANHTGFYSCKYLAVPTSKKKET :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 WSLPEMVSKESERLSITKSACGRNGKQFCSTLTLNTAQANHTGFYSCKYLAVPTSKKKET 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB9 ESAIYIFISDTGRPFVEMYSEIPEIIHMTEGRELVIPCRVTSPNITVTLKKFPLDTLIPD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 ESAIYIFISDTGRPFVEMYSEIPEIIHMTEGRELVIPCRVTSPNITVTLKKFPLDTLIPD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB9 GKRIIWDSRKGFIISNATYKEIGLLTCEATVNGHLYKTNYLTHRQTNTIIDVQISTPRPV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 GKRIIWDSRKGFIISNATYKEIGLLTCEATVNGHLYKTNYLTHRQTNTIIDVQISTPRPV 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB9 KLLRGHTLVLNCTATTPLNTRVQMTWSYPDEKNKRASVRRRIDQSNSHANIFYSVLTIDK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 KLLRGHTLVLNCTATTPLNTRVQMTWSYPDEKNKRASVRRRIDQSNSHANIFYSVLTIDK 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB9 MQNKDKGLYTCRVRSGPSFKSVNTSVHIYDKAFITVKHRKQQVLETVAGKRSYRLSMKVK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 MQNKDKGLYTCRVRSGPSFKSVNTSVHIYDKAFITVKHRKQQVLETVAGKRSYRLSMKVK 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB9 AFPSPEVVWLKDGLPATEKSARYLTRGYSLIIKDVTEEDAGNYTILLSIKQSNVFKNLTA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 AFPSPEVVWLKDGLPATEKSARYLTRGYSLIIKDVTEEDAGNYTILLSIKQSNVFKNLTA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB9 TLIVNVKPQIYEKAVSSFPDPALYPLGSRQILTCTAYGIPQPTIKWFWHPCNHNHSEARC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 TLIVNVKPQIYEKAVSSFPDPALYPLGSRQILTCTAYGIPQPTIKWFWHPCNHNHSEARC 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB9 DFCSNNEESFILDADSNMGNRIESITQRMAIIEGKNKMA---STLVVADSRISGIYICIA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :.... . .:. : CCDS53 DFCSNNEESFILDADSNMGNRIESITQRMAIIEGKNKLPPANSSFMLPPTSFSSNYFHFL 490 500 510 520 530 540 540 550 560 570 580 590 pF1KB9 SNKVGTVGRNISFYITDVPNGFHVNLEKMPTEGEDLKLSCTVNKFLYRDVTWILLRTVNN CCDS53 P >>CCDS3497.1 KDR gene_id:3791|Hs108|chr4 (1356 aa) initn: 2061 init1: 1415 opt: 2483 Z-score: 1005.5 bits: 198.4 E(32554): 1.1e-49 Smith-Waterman score: 3559; 44.8% identity (69.7% similar) in 1346 aa overlap (9-1318:6-1330) 10 20 30 40 50 pF1KB9 MVSYWDTGVLLCALLSCLLLTGSSSG---SKLKDPELSLKGTQHIMQAGQTLHLQCRGEA .: :: :. ..: : .: :.::.. ..:. ::.. :::. CCDS34 MQSKVLLAVALWLCVETRAASVGLPSVSLDLPRLSIQKDILTIKANTTLQITCRGQR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB9 AHKWSLPEMVSKESERLSITKSACGRNGKQFCSTLTLNTAQANHTGFYSCKYLAVPTSKK : :. : .:. .:. . : ::.:::. . .: :: :.: : .. CCDS34 DLDWLWPNNQSGSEQRVEVTECSDG----LFCKTLTIPKVIGNDTGAYKCFY------RE 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB9 KETESAIYIFISDTGRPFVEMYSEIPEIIHMTEGRE--LVIPCRVTSPNITVTL-KKFPL . :.::....: ::. :. ....::... .:::: . :..:.: ..: CCDS34 TDLASVIYVYVQDYRSPFIASVSDQHGVVYITENKNKTVVIPCLGSISNLNVSLCARYPE 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB9 DTLIPDGKRIIWDSRKGFIISNATYKEIGLLTCEATVNGHLYKT-NYLTHRQTNTIIDVQ ..:::.:: :::.::: : . . :.. ::: .: . :.. :.. : :: CCDS34 KRFVPDGNRISWDSKKGFTIPSYMISYAGMVFCEAKINDESYQSIMYIVVVVGYRIYDVV 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB9 ISTPRPVKLLRGHTLVLNCTATTPLNTRVQMTWSYPDEKNKRAS-VRRRID-QSNSHANI .: . ..: :. ::::::: : ::. ....: ::. :... . : : . ::.:. . CCDS34 LSPSHGIELSVGEKLVLNCTARTELNVGIDFNWEYPSSKHQHKKLVNRDLKTQSGSEMKK 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB9 FYSVLTIDKMQNKDKGLYTCRVRSGPSFKSVNTSVHIYDKAFITVKHRKQQVLETVAGKR : :.:::: . .:.::::: . :: :. .: :....: :.. ....:...:.: CCDS34 FLSTLTIDGVTRSDQGLYTCAASSGLMTKKNSTFVRVHEKPFVAFGSGMESLVEATVGER 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KB9 SYRLSMKVKAFPSPEVVWLKDGLPATEKSARYLTRGYSLIIKDVTEEDAGNYTILLSIKQ :. : ..: ::. : :.:.: .: . . :. : : .:.:.:.::::..:. CCDS34 -VRIPAKYLGYPPPEIKWYKNGIPL--ESNHTIKAGHVLTIMEVSERDTGNYTVILTNPI 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 pF1KB9 SNVFKNLTATLIVNVKPQIYEKAVSSFPDPALYPLGSRQILTCTAYGIPQPT-IKWFWH- :. .. ...:.: : ::: ::.. : : : :. : ::::.:.:: : :.:.:. CCDS34 SKEKQSHVVSLVVYVPPQIGEKSLISPVDS--YQYGTTQTLTCTVYAIPPPHHIHWYWQL 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KB9 --PCNHNHSEARCDFCSNNEESFILDADSNMGNRIESITQRMAIIEGKNKMASTLVVADS : .. :.: : . : . ::.:: ...:.:::::: .::::. . CCDS34 EEECANEPSQAVSVTNPYPCEEWRSVEDFQGGNKIEVNKNQFALIEGKNKTVSTLVIQAA 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 pF1KB9 RISGIYICIASNKVGTVGRNISFYITDVPNGFHVNLEKMPTEGEDLKLSCTVNKFLYRDV .:..: : : :::: : :::..: :. . .. . .::: :...: ::... .... CCDS34 NVSALYKCEAVNKVGRGERVISFHVTRGPE-ITLQPDMQPTEQESVSLWCTADRSTFENL 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 pF1KB9 TWILLRT----VNNRTMHYSISKQ-----KMAITKEHSITLNLTIM---NVSLQDSGTYA :: : .. . . :. :. : . : .. :: :.::::.: :. CCDS34 TWYKLGPQPLPIHVGELPTPVCKNLDTLWKLNATMFSNSTNDILIMELKNASLQDQGDYV 590 600 610 620 630 640 640 650 660 670 680 690 pF1KB9 CRARNVYTGEEILQKKEITIRDQEAPYLLRNLSDHTVAISSSTTLDCHANGVPEPQITWF : :.. : .. ...:. .. :: . :: ..:..:. : ..: :.: : ::: :: CCDS34 CLAQDRKTKKRHCVVRQLTVLERVAPTITGNLENQTTSIGESIEVSCTASGNPPPQIMWF 650 660 670 680 690 700 700 710 720 730 740 750 pF1KB9 KNNHKIQQEPGIILGPGSSTLFIERVTEEDEGVYHCKATNQKGSVESSAYLTVQGTSDKS :.:. . .. ::.: :. .: :.:: .::::.: :.: . : .. :.. ..:...:. CCDS34 KDNETLVEDSGIVLKDGNRNLTIRRVRKEDEGLYTCQACSVLGCAKVEAFFIIEGAQEKT 710 720 730 740 750 760 760 770 780 790 800 810 pF1KB9 NLELITLTCTCVAATLFWLLLTLFIRKMKRSSS-EIKTDYLSIIMDPDEVPLDEQCERLP :::.: :. : : : .:::::....: .::... :.:: ::::.:::::.::::.::::: CCDS34 NLEIIILVGTAVIAMFFWLLLVIILRTVKRANGGELKTGYLSIVMDPDELPLDEHCERLP 770 780 790 800 810 820 820 830 840 850 860 870 pF1KB9 YDASKWEFARERLKLGKSLGRGAFGKVVQASAFGIKKSPTCRTVAVKMLKEGATASEYKA :::::::: :.:::::: :::::::.:..:.:::: :. ::::::::::::::: ::..: CCDS34 YDASKWEFPRDRLKLGKPLGRGAFGQVIEADAFGIDKTATCRTVAVKMLKEGATHSEHRA 830 840 850 860 870 880 880 890 900 910 920 930 pF1KB9 LMTELKILTHIGHHLNVVNLLGACTKQGGPLMVIVEYCKYGNLSNYLKSKRDLFFLNKDA ::.::::: ::::::::::::::::: :::::::::.::.::::.::.:::. : : CCDS34 LMSELKILIHIGHHLNVVNLLGACTKPGGPLMVIVEFCKFGNLSTYLRSKRNEFVPYKTK 890 900 910 920 930 940 940 950 960 970 980 990 pF1KB9 ALHMEPKKEKMEPGLEQGKKPRLDSVTSSESFASSGFQEDKSLSDVEEEEDSDGFYKEPI . ... :. . .. : ::::.:::.: ::::: :.:::::::::: . .::. . CCDS34 GARFRQGKDYV-GAIPVDLKRRLDSITSSQSSASSGFVEEKSLSDVEEEEAPEDLYKDFL 950 960 970 980 990 1000 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KB9 TMEDLISYSFQVARGMEFLSSRKCIHRDLAARNILLSENNVVKICDFGLARDIYKNPDYV :.: :: ::::::.:::::.::::::::::::::::::.::::::::::::::::.:::: CCDS34 TLEHLICYSFQVAKGMEFLASRKCIHRDLAARNILLSEKNVVKICDFGLARDIYKDPDYV 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KB9 RKGDTRLPLKWMAPESIFDKIYSTKSDVWSYGVLLWEIFSLGGSPYPGVQMDEDFCSRLR ::::.::::::::::.:::..:. .:::::.:::::::::::.::::::..::.:: ::. CCDS34 RKGDARLPLKWMAPETIFDRVYTIQSDVWSFGVLLWEIFSLGASPYPGVKIDEEFCRRLK 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KB9 EGMRMRAPEYSTPEIYQIMLDCWHRDPKERPRFAELVEKLGDLLQANVQQDGKDYI--PI :: :::::.:.:::.:: :::::: .:..:: :.::::.::.:::::.:::::::: :: CCDS34 EGTRMRAPDYTTPEMYQTMLDCWHGEPSQRPTFSELVEHLGNLLQANAQQDGKDYIVLPI 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KB9 NAILTG--NSGFTYSTPAFSEDFFKESISALKFNSGSSDDV-RYVNAFKFMSLE-RIKTF . :. .::.. : : . .: . ::. .. . .:.. : : .::: CCDS34 SETLSMEEDSGLSLPTSPVSC-MEEEEVCDPKFHYDNTAGISQYLQNSKRKSRPVSVKTF 1190 1200 1210 1220 1230 1230 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KB9 EEL---LPNATSMFDDYQGDSSTLLASPMLKRFTWTDSKPKASLKIDLRVTSKSKESGLS :.. :.. . :: : ::. .::: :: . ... : : .. : :::.:: : CCDS34 EDIPLEEPEVKVIPDDNQTDSGMVLASEELKTL---EDRTKLSPSFGGMVPSKSRESVAS 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KB9 DVSRPSFCHSSCGHVSEGKRR-FTYDHAELERKIACCSPPPDYNSVVLYSTPPI . : . ..: : .. .. ..::: . : CCDS34 EGSNQTSGYQSGYHSDDTDTTVYSSEEAELLKLIEIGVQTGSTAQILQPDSGTTLSSPPV 1300 1310 1320 1330 1340 1350 >>CCDS43412.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5 (1298 aa) initn: 2249 init1: 976 opt: 2080 Z-score: 847.1 bits: 169.1 E(32554): 7.3e-41 Smith-Waterman score: 3190; 40.9% identity (69.2% similar) in 1317 aa overlap (8-1266:4-1292) 10 20 30 40 50 pF1KB9 MVSYWDTGVLLCA-LLSCL-LLTGSSSGSKLKDPELSLKGTQHIMQAGQTLHLQCRGEAA :. :: : :: :: : :: .. : :.. .:....:..: ..:::. CCDS43 MQRGAALCLRLWLCLGLLDGLVSGYSMTPPTLNITEESHVIDTGDSLSISCRGQHP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB9 HKWSLP------EMVSKESERLSITKSACGRNGKQFCSTLTLNTAQANHTGFYSCKYLAV .:. : .:.:: ..... : ... .:..: :. ..:: :: : : : . CCDS43 LEWAWPGAQEAPATGDKDSEDTGVVRDCEGTDARPYCKVLLLHEVHANDTGSYVCYYKYI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB9 PTSKKKETESAIYIFISDTGRPFVEMYSEIPEIIHMTEGRELVIPCRVTSPNITVTLKKF . . : .. :.:. : .::.. :. . ... . .:: :. :...:::.. CCDS43 KARIEGTTAASSYVFVRDFEQPFINK----PDTLLVNRKDAMWVPCLVSIPGLNVTLRS- 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB9 PLDTLIPDGKRIIWDSRKGFIISNATYKEIGLLTCEATVNGHLYKTN-YLTHRQTNTIID ..: :::....::.:.:...:. .. : ::.: . . . .: .:.: : . : CCDS43 QSSVLWPDGQEVVWDDRRGMLVSTPLLHDALYLQCETTWGDQDFLSNPFLVHITGNELYD 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB9 VQISTPRPVKLLRGHTLVLNCTATTPLNTRVQMTWSYPDEKNKRASV--RRRIDQSNSHA .:. . ..:: :. ::::::. . .:. : . :.:: .. .:.. .:: .:.... CCDS43 IQLLPRKSLELLVGEKLVLNCTVWAEFNSGVTFDWDYPGKQAERGKWVPERRSQQTHTE- 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KB9 NIFYSVLTIDKMQNKDKGLYTCRVRSGPSFKSVNTSVHIYDKAFITVKHRKQQVLETVAG . :.::: .....: : :.:.. .: . .: : .... ::.:. : .::..:: CCDS43 --LSSILTIHNVSQHDLGSYVCKANNGIQRFRESTEVIVHENPFISVEWLKGPILEATAG 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KB9 KRSYRLSMKVKAFPSPEVVWLKDGLPATEKSARYLTRGYSLIIKDVTEEDAGNYTILLSI . .: .:. :.: :: : ::: :.:. ..:..:.::: ..:.::. : CCDS43 DELVKLPVKLAAYPPPEFQWYKDG---KALSGRH--SPHALVLKEVTEASTGTYTLALWN 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KB9 KQSNVFKNLTATLIVNVKPQIYEKAVSSFPDPALYPLGSRQILTCTAYGIPQP-TIKWFW . ... .:.. :.::: :::.:: .:: :..: ::: :::::::.: : .:.: : CCDS43 SAAGLRRNISLELVVNVPPQIHEKEASS---PSIYSRHSRQALTCTAYGVPLPLSIQWHW 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KB9 HPCNHNHSEARCDFCSNNEESFILD-------ADSNMGNRIESITQRMAIIEGKNKMAST .: . . :. .. ...... . . .. : :::. ..::::: .: CCDS43 RPWTPCKMFAQRSLRRRQQQDLMPQCRDWRAVTTQDAVNPIESLDTWTEFVEGKNKTVSK 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 pF1KB9 LVVADSRISGIYICIASNKVGTVGRNISFYITDVPNGFHVNLEKMPTE----GEDLKLSC ::. .. .:..: :..::::: : : ::.: .:.:: . :. :.: :. . ::: CCDS43 LVIQNANVSAMYKCVVSNKVGQDERLIYFYVTTIPDGFTI--ESKPSEELLEGQPVLLSC 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 pF1KB9 TVNKFLYRDVTW--ILLRTVNN----------RTMHY-----SISKQKMAITKEHSITLN .... :. . : . : :... ...: . : ...: .:. ::. CCDS43 QADSYKYEHLRWYRLNLSTLHDAHGNPLLLDCKNVHLFATPLAASLEEVAPGARHA-TLS 580 590 600 610 620 630 630 640 650 660 670 680 pF1KB9 LTIMNVSLQDSGTYACRARNVYTGEEILQKKEITIRDQEAPYLLRNLSDHTVAISSSTTL :.: :. . : :.:.... . .. .:: .... ::: : .::.: : .:.: . CCDS43 LSIPRVAPEHEGHYVCEVQDRRSHDKHCHKKYLSVQALEAPRLTQNLTDLLVNVSDSLEM 640 650 660 670 680 690 690 700 710 720 730 740 pF1KB9 DCHANGVPEPQITWFKNNHKIQQEPGIILGPGSSTLFIERVTEEDEGVYHCKATNQKGSV .: . :. :.:.:.:... .... :. :. ... : :.:: ::: : : :.. : :: : CCDS43 QCLVAGAHAPSIVWYKDERLLEEKSGVDLADSNQKLSIQRVREEDAGRYLCSVCNAKGCV 700 710 720 730 740 750 750 760 770 780 790 pF1KB9 ESSAYLTVQGTSDKSNLELITLTCTCVAATLFWLLLTLFIRKMKRSS-SEIKTDYLSIIM .::: ..:.:. ::...:.. :. : : :..::.:: :.. .:.: . ..::: :::::: CCDS43 NSSASVAVEGSEDKGSMEIVILVGTGVIAVFFWVLLLLIFCNMRRPAHADIKTGYLSIIM 760 770 780 790 800 810 800 810 820 830 840 850 pF1KB9 DPDEVPLDEQCERLPYDASKWEFARERLKLGKSLGRGAFGKVVQASAFGIKKSPTCRTVA :: ::::.:::: : ::::.::: ::::.::. :: :::::::.::::::.:. .: ::: CCDS43 DPGEVPLEEQCEYLSYDASQWEFPRERLHLGRVLGYGAFGKVVEASAFGIHKGSSCDTVA 820 830 840 850 860 870 860 870 880 890 900 910 pF1KB9 VKMLKEGATASEYKALMTELKILTHIGHHLNVVNLLGACTKQGGPLMVIVEYCKYGNLSN ::::::::::::..:::.::::: :::.::::::::::::: ::::::::.:::::::: CCDS43 VKMLKEGATASEHRALMSELKILIHIGNHLNVVNLLGACTKPQGPLMVIVEFCKYGNLSN 880 890 900 910 920 930 920 930 940 950 960 970 pF1KB9 YLKSKRDLFFLNKDAALHMEPKKEKMEPGLEQGKKPRLDSVTSSESFASSGFQEDKSLSD .:..::: : . : . .. ... .: .. : .:.. . . . . . CCDS43 FLRAKRDAF---SPCAEKSPEQRGRFRAMVELARLDRRRPGSSDRVLFARFSKTEGGARR 940 950 960 970 980 990 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KB9 VEEEEDSDGFYKEPITMEDLISYSFQVARGMEFLSSRKCIHRDLAARNILLSENNVVKIC . ..... .. :.:::::. ::::::::::::.::::::::::::::::::..::::: CCDS43 ASPDQEAEDLWLSPLTMEDLVCYSFQVARGMEFLASRKCIHRDLAARNILLSESDVVKIC 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KB9 DFGLARDIYKNPDYVRKGDTRLPLKWMAPESIFDKIYSTKSDVWSYGVLLWEIFSLGGSP ::::::::::.:::::::..:::::::::::::::.:.:.:::::.:::::::::::.:: CCDS43 DFGLARDIYKDPDYVRKGSARLPLKWMAPESIFDKVYTTQSDVWSFGVLLWEIFSLGASP 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KB9 YPGVQMDEDFCSRLREGMRMRAPEYSTPEIYQIMLDCWHRDPKERPRFAELVEKLGDLLQ :::::..:.::.:::.: :::::: .:: : .:::.:: ::: :: :.:::: :::::: CCDS43 YPGVQINEEFCQRLRDGTRMRAPELATPAIRRIMLNCWSGDPKARPAFSELVEILGDLLQ 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KB9 ANVQQDGKD--YIPINAILTGNSGFTY-STPAF--SEDFFKESISALKFNSGSSDDVRYV . :. .. . : .. . ...:. :: :. .. ..: .:. .: .. :: CCDS43 GRGLQEEEEVCMAPRSSQSSEEGSFSQVSTMALHIAQADAEDSPPSLQRHSLAA---RYY 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KB9 NAFKFMSL----------ERIKTFEE--LLPNATSMFDDYQGDSSTLLASPMLKRFTWTD : .: . :.::::: . :.. . : : ::. .::: ..: . CCDS43 NWVSFPGCLARGAETRGSSRMKTFEEFPMTPTTYKGSVDNQTDSGMVLAS---EEFEQIE 1240 1250 1260 1270 1280 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KB9 SKPKASLKIDLRVTSKSKESGLSDVSRPSFCHSSCGHVSEGKRRFTYDHAELERKIACCS :. . CCDS43 SRHRQESGFR 1290 >>CCDS4457.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5 (1363 aa) initn: 2251 init1: 978 opt: 2080 Z-score: 846.8 bits: 169.1 E(32554): 7.5e-41 Smith-Waterman score: 3190; 40.9% identity (69.2% similar) in 1317 aa overlap (8-1266:4-1292) 10 20 30 40 50 pF1KB9 MVSYWDTGVLLCA-LLSCL-LLTGSSSGSKLKDPELSLKGTQHIMQAGQTLHLQCRGEAA :. :: : :: :: : :: .. : :.. .:....:..: ..:::. CCDS44 MQRGAALCLRLWLCLGLLDGLVSGYSMTPPTLNITEESHVIDTGDSLSISCRGQHP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB9 HKWSLP------EMVSKESERLSITKSACGRNGKQFCSTLTLNTAQANHTGFYSCKYLAV .:. : .:.:: ..... : ... .:..: :. ..:: :: : : : . CCDS44 LEWAWPGAQEAPATGDKDSEDTGVVRDCEGTDARPYCKVLLLHEVHANDTGSYVCYYKYI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB9 PTSKKKETESAIYIFISDTGRPFVEMYSEIPEIIHMTEGRELVIPCRVTSPNITVTLKKF . . : .. :.:. : .::.. :. . ... . .:: :. :...:::.. CCDS44 KARIEGTTAASSYVFVRDFEQPFINK----PDTLLVNRKDAMWVPCLVSIPGLNVTLRS- 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB9 PLDTLIPDGKRIIWDSRKGFIISNATYKEIGLLTCEATVNGHLYKTN-YLTHRQTNTIID ..: :::....::.:.:...:. .. : ::.: . . . .: .:.: : . : CCDS44 QSSVLWPDGQEVVWDDRRGMLVSTPLLHDALYLQCETTWGDQDFLSNPFLVHITGNELYD 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB9 VQISTPRPVKLLRGHTLVLNCTATTPLNTRVQMTWSYPDEKNKRASV--RRRIDQSNSHA .:. . ..:: :. ::::::. . .:. : . :.:: .. .:.. .:: .:.... CCDS44 IQLLPRKSLELLVGEKLVLNCTVWAEFNSGVTFDWDYPGKQAERGKWVPERRSQQTHTE- 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KB9 NIFYSVLTIDKMQNKDKGLYTCRVRSGPSFKSVNTSVHIYDKAFITVKHRKQQVLETVAG . :.::: .....: : :.:.. .: . .: : .... ::.:. : .::..:: CCDS44 --LSSILTIHNVSQHDLGSYVCKANNGIQRFRESTEVIVHENPFISVEWLKGPILEATAG 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KB9 KRSYRLSMKVKAFPSPEVVWLKDGLPATEKSARYLTRGYSLIIKDVTEEDAGNYTILLSI . .: .:. :.: :: : ::: :.:. ..:..:.::: ..:.::. : CCDS44 DELVKLPVKLAAYPPPEFQWYKDG---KALSGRH--SPHALVLKEVTEASTGTYTLALWN 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KB9 KQSNVFKNLTATLIVNVKPQIYEKAVSSFPDPALYPLGSRQILTCTAYGIPQP-TIKWFW . ... .:.. :.::: :::.:: .:: :..: ::: :::::::.: : .:.: : CCDS44 SAAGLRRNISLELVVNVPPQIHEKEASS---PSIYSRHSRQALTCTAYGVPLPLSIQWHW 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KB9 HPCNHNHSEARCDFCSNNEESFILD-------ADSNMGNRIESITQRMAIIEGKNKMAST .: . . :. .. ...... . . .. : :::. ..::::: .: CCDS44 RPWTPCKMFAQRSLRRRQQQDLMPQCRDWRAVTTQDAVNPIESLDTWTEFVEGKNKTVSK 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 pF1KB9 LVVADSRISGIYICIASNKVGTVGRNISFYITDVPNGFHVNLEKMPTE----GEDLKLSC ::. .. .:..: :..::::: : : ::.: .:.:: . :. :.: :. . ::: CCDS44 LVIQNANVSAMYKCVVSNKVGQDERLIYFYVTTIPDGFTI--ESKPSEELLEGQPVLLSC 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 pF1KB9 TVNKFLYRDVTW--ILLRTVNN----------RTMHY-----SISKQKMAITKEHSITLN .... :. . : . : :... ...: . : ...: .:. ::. CCDS44 QADSYKYEHLRWYRLNLSTLHDAHGNPLLLDCKNVHLFATPLAASLEEVAPGARHA-TLS 580 590 600 610 620 630 630 640 650 660 670 680 pF1KB9 LTIMNVSLQDSGTYACRARNVYTGEEILQKKEITIRDQEAPYLLRNLSDHTVAISSSTTL :.: :. . : :.:.... . .. .:: .... ::: : .::.: : .:.: . CCDS44 LSIPRVAPEHEGHYVCEVQDRRSHDKHCHKKYLSVQALEAPRLTQNLTDLLVNVSDSLEM 640 650 660 670 680 690 690 700 710 720 730 740 pF1KB9 DCHANGVPEPQITWFKNNHKIQQEPGIILGPGSSTLFIERVTEEDEGVYHCKATNQKGSV .: . :. :.:.:.:... .... :. :. ... : :.:: ::: : : :.. : :: : CCDS44 QCLVAGAHAPSIVWYKDERLLEEKSGVDLADSNQKLSIQRVREEDAGRYLCSVCNAKGCV 700 710 720 730 740 750 750 760 770 780 790 pF1KB9 ESSAYLTVQGTSDKSNLELITLTCTCVAATLFWLLLTLFIRKMKRSS-SEIKTDYLSIIM .::: ..:.:. ::...:.. :. : : :..::.:: :.. .:.: . ..::: :::::: CCDS44 NSSASVAVEGSEDKGSMEIVILVGTGVIAVFFWVLLLLIFCNMRRPAHADIKTGYLSIIM 760 770 780 790 800 810 800 810 820 830 840 850 pF1KB9 DPDEVPLDEQCERLPYDASKWEFARERLKLGKSLGRGAFGKVVQASAFGIKKSPTCRTVA :: ::::.:::: : ::::.::: ::::.::. :: :::::::.::::::.:. .: ::: CCDS44 DPGEVPLEEQCEYLSYDASQWEFPRERLHLGRVLGYGAFGKVVEASAFGIHKGSSCDTVA 820 830 840 850 860 870 860 870 880 890 900 910 pF1KB9 VKMLKEGATASEYKALMTELKILTHIGHHLNVVNLLGACTKQGGPLMVIVEYCKYGNLSN ::::::::::::..:::.::::: :::.::::::::::::: ::::::::.:::::::: CCDS44 VKMLKEGATASEHRALMSELKILIHIGNHLNVVNLLGACTKPQGPLMVIVEFCKYGNLSN 880 890 900 910 920 930 920 930 940 950 960 970 pF1KB9 YLKSKRDLFFLNKDAALHMEPKKEKMEPGLEQGKKPRLDSVTSSESFASSGFQEDKSLSD .:..::: : . : . .. ... .: .. : .:.. . . . . . CCDS44 FLRAKRDAF---SPCAEKSPEQRGRFRAMVELARLDRRRPGSSDRVLFARFSKTEGGARR 940 950 960 970 980 990 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KB9 VEEEEDSDGFYKEPITMEDLISYSFQVARGMEFLSSRKCIHRDLAARNILLSENNVVKIC . ..... .. :.:::::. ::::::::::::.::::::::::::::::::..::::: CCDS44 ASPDQEAEDLWLSPLTMEDLVCYSFQVARGMEFLASRKCIHRDLAARNILLSESDVVKIC 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KB9 DFGLARDIYKNPDYVRKGDTRLPLKWMAPESIFDKIYSTKSDVWSYGVLLWEIFSLGGSP ::::::::::.:::::::..:::::::::::::::.:.:.:::::.:::::::::::.:: CCDS44 DFGLARDIYKDPDYVRKGSARLPLKWMAPESIFDKVYTTQSDVWSFGVLLWEIFSLGASP 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KB9 YPGVQMDEDFCSRLREGMRMRAPEYSTPEIYQIMLDCWHRDPKERPRFAELVEKLGDLLQ :::::..:.::.:::.: :::::: .:: : .:::.:: ::: :: :.:::: :::::: CCDS44 YPGVQINEEFCQRLRDGTRMRAPELATPAIRRIMLNCWSGDPKARPAFSELVEILGDLLQ 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KB9 ANVQQDGKD--YIPINAILTGNSGFTY-STPAF--SEDFFKESISALKFNSGSSDDVRYV . :. .. . : .. . ...:. :: :. .. ..: .:. .: .. :: CCDS44 GRGLQEEEEVCMAPRSSQSSEEGSFSQVSTMALHIAQADAEDSPPSLQRHSLAA---RYY 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KB9 NAFKFMSL----------ERIKTFEE--LLPNATSMFDDYQGDSSTLLASPMLKRFTWTD : .: . :.::::: . :.. . : : ::. .::: ..: . CCDS44 NWVSFPGCLARGAETRGSSRMKTFEEFPMTPTTYKGSVDNQTDSGMVLAS---EEFEQIE 1240 1250 1260 1270 1280 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KB9 SKPKASLKIDLRVTSKSKESGLSDVSRPSFCHSSCGHVSEGKRRFTYDHAELERKIACCS :. . CCDS44 SRHRQESGFSCKGPGQNVAVTRAHPDSQGRRRRPERGARGGQVFYNSEYGELSEPSEEDH 1290 1300 1310 1320 1330 1340 >>CCDS4302.1 CSF1R gene_id:1436|Hs108|chr5 (972 aa) initn: 973 init1: 636 opt: 1176 Z-score: 493.1 bits: 103.1 E(32554): 3.8e-21 Smith-Waterman score: 1282; 34.9% identity (62.9% similar) in 744 aa overlap (477-1185:218-940) 450 460 470 480 490 500 pF1KB9 GSRQILTCTAYGIPQPTIKWFWHPCNHNHSEARCDFCSNNEESFILDADSNMGNRIESIT :: :: . . .:. . .: .: CCDS43 SISIRLKVQKVIPGPPALTLVPAELVRIRGEAAQIVCSASSVDVNFDVFLQHNNTKLAIP 190 200 210 220 230 240 510 520 530 540 550 560 pF1KB9 QRMAIIEGKNKMASTLVV--ADSRISGIYICIASNKVGTVGRNISFYITDVPN---GFHV :. . ... . . :: . .: . .: : :.::: : . .. : ... . . CCDS43 QQSDFHNNRYQKVLTLNLDQVDFQHAGNYSCVASNVQGKHSTSMFFRVVESAYLNLSSEQ 250 260 270 280 290 300 570 580 590 600 610 620 pF1KB9 NLEKMPTEGEDLKLSCTVNKFL-YRDVTWILLRTVNNRTMHYSISKQKMAITKEHSITLN :: . : :: :.:. :. . . .: : ... . .... : .:..::. CCDS43 NLIQEVTVGEGLNLKVMVEAYPGLQGFNWTYLGPFSDHQPEPKLANATTKDTYRHTFTLS 310 320 330 340 350 360 630 640 650 660 670 680 pF1KB9 LTIMNVSLQDSGTYACRARNVYTGEEILQKKEITIRDQEAPYLLRNLSDHTVAISSSTTL : .. : ..: :. ::: : . : :.:.: .. .. :..: :: CCDS43 LPRLKPS--EAGRYSFLARNP-GGWRALTF-ELTLRYPPEVSVIWTF------INGSGTL 370 380 390 400 410 690 700 710 720 pF1KB9 DCHANGVPEPQITWFK-NNHKIQQEPGIIL----GPGSSTLFIE---RVTE--------- : :.: :.:..::.. ..: . . . .: : .: : .:: CCDS43 LCAASGYPQPNVTWLQCSGHTDRCDEAQVLQVWDDPYPEVLSQEPFHKVTVQSLLTVETL 420 430 440 450 460 470 730 740 750 760 770 pF1KB9 EDEGVYHCKATNQKGSVESSAYLTVQGTS-----DKSNLELITLTCTCVAATLFWLLLTL : . .:.:.: :. :: : :.. ... . :. . ....: . : :. ::: : CCDS43 EHNQTYECRAHNSVGS-GSWAFIPISAGAHTHPPDEFLFTPVVVACMSIMALLLLLLLLL 480 490 500 510 520 530 780 790 800 810 820 830 pF1KB9 FIRKMKRSSSEIKTDYLSIIMDPDEVPLDEQCERLPYDASKWEFARERLKLGKSLGRGAF . . .. . ... . . . .: .:::. :::: :. :..::.:: ::: CCDS43 LYKYKQKPKYQVRWKIIESYEGNSYTFIDPT--QLPYNE-KWEFPRNNLQFGKTLGAGAF 540 550 560 570 580 590 840 850 860 870 880 890 pF1KB9 GKVVQASAFGIKKSPTCRTVAVKMLKEGATASEYKALMTELKILTHIGHHLNVVNLLGAC ::::.:.:::. : . ::::::: : :.: .:::.::::..:.:.: :.::::::: CCDS43 GKVVEATAFGLGKEDAVLKVAVKMLKSTAHADEKEALMSELKIMSHLGQHENIVNLLGAC 600 610 620 630 640 650 900 910 920 930 940 950 pF1KB9 TKQGGPLMVIVEYCKYGNLSNYLKSKRDLFFLNKDAALHMEPKK--EKMEPGLEQGKKPR : .:::..::.::: ::.: :.:. : . . :. . . ..:. . . ::. : : CCDS43 T-HGGPVLVITEYCCYGDLLNFLRRKAEAM-LGPSLSPGQDPEGGVDYKNIHLEK-KYVR 660 670 680 690 700 710 960 970 980 990 1000 1010 pF1KB9 LDSVTSSESFASSGFQEDKSLS--DVEEEEDSDGFYKEPITMEDLISYSFQVARGMEFLS :: ::.. . .. : : : :.: : .:. ..::. .: :::.:: ::. CCDS43 RDSGFSSQGVDTYVEMRPVSTSSNDSFSEQDLDKEDGRPLELRDLLHFSSQVAQGMAFLA 720 730 740 750 760 770 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KB9 SRKCIHRDLAARNILLSENNVVKICDFGLARDIYKNPDYVRKGDTRLPLKWMAPESIFDK :..:::::.::::.::....:.:: ::::::::... .:. ::..:::.:::::::::: CCDS43 SKNCIHRDVAARNVLLTNGHVAKIGDFGLARDIMNDSNYIVKGNARLPVKWMAPESIFDC 780 790 800 810 820 830 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KB9 IYSTKSDVWSYGVLLWEIFSLGGSPYPGVQMDEDFCSRLREGMRMRAPEYSTPEIYQIML .:...:::::::.::::::::: .::::. .. : . ...:..: : .. .::.:: CCDS43 VYTVQSDVWSYGILLWEIFSLGLNPYPGILVNSKFYKLVKDGYQMAQPAFAPKNIYSIMQ 840 850 860 870 880 890 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KB9 DCWHRDPKERPRFAELVEKLGDLLQANVQQDGK--DYIPI-NAILTGNSGFTYSTPAFSE :: .: .:: : ... ..:: ..:.: . :: . .. .:.:: . : CCDS43 ACWALEPTHRPTF----QQICSFLQEQAQEDRRERDYTNLPSSSRSGGSGSSSSELEEES 900 910 920 930 940 1200 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KB9 DFFKESISALKFNSGSSDDVRYVNAFKFMSLERIKTFEELLPNATSMFDDYQGDSSTLLA CCDS43 SSEHLTCCEQGDIAQPLLQPNNYQFC 950 960 970 >>CCDS31953.1 FLT3 gene_id:2322|Hs108|chr13 (993 aa) initn: 1063 init1: 695 opt: 1166 Z-score: 489.0 bits: 102.4 E(32554): 6.4e-21 Smith-Waterman score: 1204; 31.5% identity (59.0% similar) in 871 aa overlap (386-1167:123-961) 360 370 380 390 400 410 pF1KB9 SMKVKAFPSPEVVWLKDGLPATEKSARYLTRGY-SLIIKDVTEEDAGNYTILLSIKQSNV :: :..: .:: .::.: ... ::.. CCDS31 VLVDAPGNISCLWVFKHSSLNCQPHFDLQNRGVVSMVILKMTETQAGEYLLFI---QSEA 100 110 120 130 140 420 430 440 450 460 470 pF1KB9 FKNLTATLIVNVKPQIYEKAVSSFPDPALYPLGSRQILTCTAYGIPQPTIKWFWHPCNHN : : . :... . . .. : . . ... :.: . ..:.: ..: :. . CCDS31 -TNYTILFTVSIRNTL----LYTLRRPYFRKMENQDALVCISESVPEPIVEWVL--CD-S 150 160 170 180 190 200 480 490 500 510 520 530 pF1KB9 HSEARCDFCSNNEESFILDADSNMGNRIESITQRMAIIEGKNKMASTLVVAD-SRISGIY ..:. :.. : .. . .. ... . : . .. . : . : .. CCDS31 QGES----CKE-ESPAVVKKEEKVLHELFGTDIRCCARNELGRECTRLFTIDLNQTPQTT 210 220 230 240 250 540 550 560 570 580 pF1KB9 ICIASNKVGTVGRNISFYITDVPNGFHVNLE---KMPTEGEDLKLSC-TVNKFLYRDVTW . ::: : . : .:: .. : : ::. ...: ..:. . : . CCDS31 LPQLFLKVGE-PLWIRCKAVHVNHGFGLTWELENKALEEGNYFEMSTYSTNRTMIRILFA 260 270 280 290 300 310 590 600 610 620 630 pF1KB9 ILLRTVNNRTMHYSISKQKMAITKEHSITLNLTIMNV--SLQD----------------- .. .. : : .:. :..: . .. ..:. : .: CCDS31 FVSSVARNDTGYYTCSSSKHPSQSALVTIVEKGFINATNSSEDYEIDQYEEFCFSVRFKA 320 330 340 350 360 370 640 650 660 pF1KB9 -----------SGTYACRARNVYTGEEILQKKEITIRDQEAPYLLRNLSD---------- .. :. ... .: : .: . . : . :... .: CCDS31 YPQIRCTWTFSRKSFPCEQKGLDNGYSI--SKFCNHKHQPGEYIFHAENDDAQFTKMFTL 380 390 400 410 420 430 670 680 690 700 710 pF1KB9 ------HTVAISSSTTLDCHANGVPEPQITWFKNNHKIQQ-----EPGI--------ILG ...: .:.. .: ..: : :. :: : . : . :. ..: CCDS31 NIRRKPQVLAEASASQASCFSDGYPLPSWTWKKCSDKSPNCTEEITEGVWNRKANRKVFG 440 450 460 470 480 490 720 730 740 750 760 pF1KB9 P--GSSTLFIERVTEEDEG-VYHCKATNQKGSVESSAYLTVQGTSD--KSNLELITLTCT .:::: ..: .: . .: : :. :. . :. : ..:. . . . CCDS31 QWVSSSTL---NMSEAIKGFLVKCCAYNSLGTSCETILLNSPGPFPFIQDNISFYATIGV 500 510 520 530 540 550 770 780 790 800 810 820 pF1KB9 CVAATLFWLLLTLFI-RKMKRS-SSEIKTDYLSIIMDPDEVPLDEQCERLPYDASKWEFA :. :: ..:::.: .:.:.. : . ..... . :. . . .. :: :::: CCDS31 CL---LFIVVLTLLICHKYKKQFRYESQLQMVQVTGSSDNEYFYVDFREYEYDL-KWEFP 560 570 580 590 600 830 840 850 860 870 880 pF1KB9 RERLKLGKSLGRGAFGKVVQASAFGIKKSPTCRTVAVKMLKEGATASEYKALMTELKILT :: :..:: :: ::::::..:.:.::.:. . :::::::: : .:: .:::.:::..: CCDS31 RENLEFGKVLGSGAFGKVMNATAYGISKTGVSIQVAVKMLKEKADSSEREALMSELKMMT 610 620 630 640 650 660 890 900 910 920 930 pF1KB9 HIGHHLNVVNLLGACTKQGGPLMVIVEYCKYGNLSNYLKSKRDLFF-----LNKDAALHM ..: : :.:::::::: .::...: ::: ::.: :::.:::. : . :. . . CCDS31 QLGSHENIVNLLGACT-LSGPIYLIFEYCCYGDLLNYLRSKREKFHRTWTEIFKEHNFSF 670 680 690 700 710 720 940 950 960 970 980 990 pF1KB9 EPKKEKME----PGLEQGK-KPRLDSVTS--SESFASSGFQEDKSLSDVEEEEDSDGFYK : .. :: .. . .: :.... ..:: : : .. . .::::: . CCDS31 YPTFQSHPNSSMPGSREVQIHPDSDQISGLHGNSFHSEDEIEYENQKRLEEEEDLN---- 730 740 750 760 770 780 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KB9 EPITMEDLISYSFQVARGMEFLSSRKCIHRDLAARNILLSENNVVKICDFGLARDIYKNP .:.:::. ...:::.::::: ..:.::::::::.:.....:::::::::::::... CCDS31 -VLTFEDLLCFAYQVAKGMEFLEFKSCVHRDLAARNVLVTHGKVVKICDFGLARDIMSDS 790 800 810 820 830 840 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KB9 DYVRKGDTRLPLKWMAPESIFDKIYSTKSDVWSYGVLLWEIFSLGGSPYPGVQMDEDFCS .:: .:..:::.:::::::.:. ::. ::::::::.::::::::: .::::. .: .: . CCDS31 NYVVRGNARLPVKWMAPESLFEGIYTIKSDVWSYGILLWEIFSLGVNPYPGIPVDANFYK 850 860 870 880 890 900 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KB9 RLREGMRMRAPEYSTPEIYQIMLDCWHRDPKERPRFAELVEKLG----DLLQANVQQ-DG ...:..: : :.: ::: :: .:: : ..:: : .:. :: : .: :. :: CCDS31 LIQNGFKMDQPFYATEEIYIIMQSCWAFDSRKRPSFPNLTSFLGCQLADAEEAMYQNVDG 910 920 930 940 950 960 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KB9 KDYIPINAILTGNSGFTYSTPAFSEDFFKESISALKFNSGSSDDVRYVNAFKFMSLERIK . CCDS31 RVSECPHTYQNRRPFSREMDLGLLSPQAQVEDS 970 980 990 >>CCDS47058.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4 (972 aa) initn: 1243 init1: 705 opt: 1081 Z-score: 455.7 bits: 96.2 E(32554): 4.6e-19 Smith-Waterman score: 1304; 36.8% identity (63.1% similar) in 677 aa overlap (520-1152:273-918) 490 500 510 520 530 540 pF1KB9 FILDADSNMGNRIESITQRMAIIEGKNKMASTLVVADSRI--SGIYICIASNKVGTVGRN .::.....:. ::...: :.: :.. : CCDS47 YSTWKRENSQTKLQEKYNSWHHGDFNYERQATLTISSARVNDSGVFMCYANNTFGSA--N 250 260 270 280 290 300 550 560 570 580 590 600 pF1KB9 ISFYITDVPNGF-----HVNLEKMPTEGEDLKLSCTVNKFLYRD-VTWILL-RTVNNRTM .. . : .:: .: . ..::.. : . : . :: . :: ... CCDS47 VTTTLEVVDKGFINIFPMINTTVFVNDGENVDLIVEYEAFPKPEHQQWIYMNRTFTDKWE 310 320 330 340 350 360 610 620 630 640 650 660 pF1KB9 HYSISKQKMAITKEHSITLNLTIMNVSLQDSGTYACRARNVYTGEEILQKKEITIRDQEA : :... : .. :.:: .. . ..:::. . : .. : ... . CCDS47 DYPKSENESNI--RYVSELHLTRLKGT--EGGTYTFLVSNSDVNAAI----AFNVYVNTK 370 380 390 400 410 670 680 690 700 710 pF1KB9 PYLLRNLSDHTVAISSSTTLDCHANGVPEPQITWFKNNHKIQQEPGIIL----------G : .: :. : . :.: : : ::: : :. :. . .: : CCDS47 PEILT--YDRLV----NGMLQCVAAGFPEPTIDWYFCPGTEQRCSASVLPVDVQTLNSSG 420 430 440 450 460 720 730 740 750 760 pF1KB9 PGSSTLFIERVTE----EDEGVYHCKATNQKGSVESSAYLTVQGTSDKSNLELIT---LT : . : .. . . .:. .::: :. : ..:::.. . :.: . CCDS47 PPFGKLVVQSSIDSSAFKHNGTVECKAYNDVG--KTSAYFNFAFKEQIHPHTLFTPLLIG 470 480 490 500 510 520 770 780 790 800 810 820 pF1KB9 CTCVAATLFWLLLTLFIRKMKRSSSEIKTDYLSIIMDPDEVPLDEQCERLPYDASKWEFA . ::. . ... : . ... :.. . : . : .: .:::: :::: CCDS47 FVIVAGMMCIIVMILTYKYLQKPMYEVQWKVVEEINGNNYVYIDP--TQLPYD-HKWEFP 530 540 550 560 570 580 830 840 850 860 870 880 pF1KB9 RERLKLGKSLGRGAFGKVVQASAFGIKKSPTCRTVAVKMLKEGATASEYKALMTELKILT :.::..::.:: :::::::.:.:.:. :: . :::::::: .: .: .:::.:::.:. CCDS47 RNRLSFGKTLGAGAFGKVVEATAYGLIKSDAAMTVAVKMLKPSAHLTEREALMSELKVLS 590 600 610 620 630 640 890 900 910 920 930 pF1KB9 HIGHHLNVVNLLGACTKQGGPLMVIVEYCKYGNLSNYLKSKRDLFFLNK-----DAALH- ..:.:.:.:::::::: ::: .::.::: ::.: :.:. ::: :. .: .:::. CCDS47 YLGNHMNIVNLLGACTI-GGPTLVITEYCCYGDLLNFLRRKRDSFICSKQEDHAEAALYK 650 660 670 680 690 700 940 950 960 970 980 pF1KB9 -MEPKKEK-----------MEPGLEQGKKPRLDSVTSSESFASSGFQEDKSLSDVEEEED . .::. :.::. . :. : . .: ...: . . .:..: CCDS47 NLLHSKESSCSDSTNEYMDMKPGVSYVVPTKADKRRSVR--IGSYIERDVTPAIMEDDEL 710 720 730 740 750 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KB9 SDGFYKEPITMEDLISYSFQVARGMEFLSSRKCIHRDLAARNILLSENNVVKICDFGLAR . . .:::.:.:.:::.:: ::.:..:::::::::::::... ..::::::::: CCDS47 A-------LDLEDLLSFSYQVAKGMAFLASKNCIHRDLAARNILLTHGRITKICDFGLAR 760 770 780 790 800 810 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KB9 DIYKNPDYVRKGDTRLPLKWMAPESIFDKIYSTKSDVWSYGVLLWEIFSLGGSPYPGVQM :: .. .:: ::..:::.:::::::::. .:. .:::::::..:::.::::.:::::. . CCDS47 DIKNDSNYVVKGNARLPVKWMAPESIFNCVYTFESDVWSYGIFLWELFSLGSSPYPGMPV 820 830 840 850 860 870 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KB9 DEDFCSRLREGMRMRAPEYSTPEIYQIMLDCWHRDPKERPRFAELVEKLGDLLQANVQQD : : . ..::.:: .::.. :.:.:: :: :: .:: : ..:. CCDS47 DSKFYKMIKEGFRMLSPEHAPAEMYDIMKTCWDADPLKRPTFKQIVQLIEKQISESTNHI 880 890 900 910 920 930 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KB9 GKDYIPINAILTGNSGFTYSTPAFSEDFFKESISALKFNSGSSDDVRYVNAFKFMSLERI CCDS47 YSNLANCSPNRQKPVVDHSVRINSVGSTASSSQPLLVHDDV 940 950 960 970 1338 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 23:00:45 2016 done: Thu Nov 3 23:00:46 2016 Total Scan time: 5.160 Total Display time: 0.500 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]